#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on November 11, 2026; 6:40 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Ruane S., Bryson R., Pyron R.A., & Burbrink F. 2013. Coalescent Species Delimitation in Milksnakes (genus Lampropeltis) and Impacts on Phylogenetic Comparative Analyses. Systematic Biology, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S14354] [ The following blocks are input data for analysis step 12824 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep12824; DIMENSIONS NTAX=23; TAXLABELS Arizona_elegans Cemophora_coccinea Lampropeltis_alterna Lampropeltis_californiae Lampropeltis_calligaster Lampropeltis_elapsoides Lampropeltis_extenuata Lampropeltis_getula Lampropeltis_holbrooki Lampropeltis_knoblochi Lampropeltis_mexicana Lampropeltis_nigra Lampropeltis_pyromelana Lampropeltis_ruthveni Lampropeltis_splendida Lampropeltis_triangulum_CA Lampropeltis_triangulum_Eastern Lampropeltis_triangulum_MX Lampropeltis_triangulum_SA Lampropeltis_triangulum_Tamaulipas Lampropeltis_triangulum_Western Lampropeltis_webbi Lampropeltis_zonata ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M20124] TITLE 1_vim56; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep12824; DIMENSIONS NCHAR=584; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Arizona_elegans AAGTGGATGCTCTTAAAGGAACTGTAAGTGAAAGATGTTGCAAGAAAGTGATGACTTTTGTTGACCTTCAGGTTTTGTCTCTTGTTATTTATTATTAAAATCCAGCTATATTGTTTGGCTATTTGGCCAACCAGCCAAGCCATCAGTCTCTCTCAACCAAGCTGCTTCACAGGATTGTGGTTGTGGGCAAAATAGGAGGAGGAAGGTGTGTTGGATATGTTTGCAACCTTCAGTTATTTGTAAAAAATAATAAAGGTGGAATATAAACAAATAATCAGCAAC-TGAACTATTGTGA-AGCATTTATGAAGTAGGTTTTTAAAATATTGATGTGTTACAATAAAGAAAAGGAAATGGGTGAAGAGACTTTTT------AAAATCTGAGCAAAGGTGAGCT-----------GAATATATTGTGACTTT-----AAAAAAAAAAATCTTTTTTTCAGAATGAGTCTTTGGAACGGCAGATGCGCGAGATGGAAGATGCCTTTGGAGCTGAAGCTGCCAACTACCAAGACAGCATTGCTAGACTTCAGGAGGAAATCCAGAACATGAAGGAAGAAATGGCTCGCCAC Cemophora_coccinea AAGTGGATGCTCTTAAAGGAACTGTAAGTGAAAGATGTTGCAAGAAAGTGATGACTTTTGTTGACCTTCAGGTTTTGTCTCTTGTTATTTATTGTTAAAGTCCAGCTATATTGTTTGGCTATTTGGCCAACCAGCCAAGCCATCAGTCTCTCTCAACCAAGCTGCTTCACAGGATTGTGGTTGTGGGCAAAATAGGAGGAGGAAGGTGTGTTGGATATGTTTGCAACCTTCAGTTATTTGTAAAAAATAATAAAGGTGGAATATAAACAAATAATCAGCAAC-TGAACTATTGTGA-AGCATTTATGAAGTAGGTTTTTAAAATATTGATGTGTTACAATAAAGAAAAGGAAATGGGTGAAGGGACTTTTTAAATTTAAAATCTGAGCAAAGGTGAGCTTGCCAGCGGCTGAATATATTGTGACTTTTTT----AAAAAAAATTCTTTTTTTCAGAATGAGTCTTTGGAACGCCAGATGCGCGAGATGGAAGATGCCTTTGGAGTTGAAGCTGCCAACTACCAAGACAGCATTGCTAGACTTCAGGAGGAAATCCAGAACATGAAGGAAGAAATGGCTCGCCAC Lampropeltis_alterna AAGTGGATGCTCTTAAAGGAACTGTAAGTGAAAGATGTTGCAAGAAAGTGATGACTTTTGTTGACCTTCAGGTTTTGTCTCTTGTTATTTAATGTTAAAATCCAGCTATATTGTTTGGCTATTTGGCCAACCAGCCAAGCCATCAGTCTCTCTCAACCAAGCTGCTTCACAGGATTGTGGTTGTGGGCAAAATAGGAAGAGGAAGGTGTGTTGGATATGTCTGCAACCTTCAGTTATTTGTAAAAAATAATAAAGGTGGAATATAAACAAATAATCAGCAAC-TGAACTATTGTGA-AGCATTTATGAAGTAGATTTTTAAAATATTGATGTGTTACAATAAAGAAAAGGAAATGGGTGAAGGGACTTTTTAAATTTAAAATCTGAGCAAAGATGAGCTTGCCAGCGGCTGAATATATTGTGACTTTTTTT----AAAAAAATTCATTTTTTCAGAATGAGTCTTTGGAACGCCAAATGCGCGAGATGGAAGATGCCTTTGGAGTTGAAGCTGCCAACTACCAAGACAGCATTGCTAGACTTCAGGAGGAAATCCAGAACATGAAGGAAGAAATGGCTCGCCAC Lampropeltis_californiae AAGTGGATGCTCTTAAAGGAACTGTAAGTGAAAGATGTTGCAAGAAAGTGATGATTTTTGTTGACCTTCAGGTTTTGTCTCTTGTTATTTATTGTTAAAATCCAGCTATATTGTTTGGCTATTTGGCCAACCAGCCAAGCCATCAGTCTCTCTCAACCAAGCTGCTTCACAGGATTGTGGTTGTGGGCAAAATAGGAGGAGGAAGGTGTGTTGGATATGTTTGCAACCTTCAGTTATTTGTAAAAAATAATAAAGGTGGAATATAAACAAATAATCAGCAAC-TGAACTATTGTGA-AGCATTTATGAAGTAGATTTTTAAAATATTGATGTGTTACAATAAAGAAAAGCAAATGGGTGAAGGGACTTTTTAAATTTAAAATCTGAGCAAAGGTGAGCTTGCCAGCGGCTGAATATATTGTGCCTTTTT----AAAAAAAAATTCTTTTTTTTAGAATGAGTCTTTGGAACGCCAGATGCGCGAGATGGAAGATGCCTTTGGAGTTGAAGCTGCCAACTACCAAGACAGCATTGCTAGACTTCAGGATGAAATCCAGAACATGAAGGAAGAAATGGCTCGCCAC Lampropeltis_calligaster AAGTGGATGCTCTTAAAGGAACTGTAAGTGAAAGATGTTGCAAGAAAGTGATGATTTTTGTTGACCTTCAGGTTTTGTCTCTTGTTATTTATTGTTAAAATCCAGCTATATTGTTTGGCTATTTGGCCAACCAGCCAAGCCATCAGTCTCTCTCAACCAAGCTGCTTCACAGGATTGTGGTTGTGGGCAAAATAGGAGGAGGAAGGTGTGTTGGATATGTTTGCAACCTTCAGTTATTTGTAAAAAATAATAAAGGTGGAATATAAACAAATAATCAGCAAC-TGAACTATTGTGA-AGCATTTATGAAGTAGATTTTTAAAATATTGATGTGTTACAATAAAGAAAAGGAAATGGGTGAAGGGACTTTTTAAATTTAAAATCTGAGCAAAGGTGAGCTTGCCAGCGGCTGAATATATTGTGACTTTTT----AAAAAAAAATTCTTTTTTTCAGAATGAGTCTTTGGAACGCCAGATGCGCGAGATGGAAGATGCCTTTGGAGTTGAAGCTGCCAACTACCAAGACAGCATTGCTAGACTTCAGGATGAAATCCAGAACATGAAGGAAGAAATGGCTCG---- Lampropeltis_elapsoides AAGTGGATGCTCTTAAAGGAACTGTAAGTGAAAGATGTTGCAAGAAAGTGATGATTTTTGTTGACCTTCAGGTTTTGTCTCTTGTTATTTATTGTTAAAATCCAGCTATATTGTTTGGCTATTTGGCCAACCAGCCAAGCCATCAGTCTTTCTCAACCAAGCTGCTTCACAGGATTGTGGTTGTGGGCAAAATAGGAGGAGGAAGGTGTGTTGGATATGTTTGCAACCTTCAGTTATTTGTAAAAAATAATAAAGGTGGAATATAAACAAATAATCAGCAAC-TGAACTATTGTGA-AGCATTTATGAAGTAGATTTTTAAAATATTGATGTGTTAAAATAAAGAAAAGGAAATGGGTGAAGGGACTTTTTAAATTTAAAATCTGAGCAAAGGTGAGCTTGCCAGCGGCTGAATGTATTGTGACTTTTT----AAAAAAAAATTCTTTTTTTCAGAATGAGTCTTTGGAACGCCAGATGCGCGAGATGGAAGATGCCTTTGGAGTTGAAGCTGCCAACTACCAAGACAGCATTGCTAGACTTCAGGATGAAATCCAGAACATGAAGGAAGAAATGGCTCGCCAC Lampropeltis_extenuata ------------------------------------------------------------TTGACCTTCAGGTTTTGTCTCTTGTTATTTATTGTTAAAATCCAGATATATTGTTTGGCTATTTGGCCAACCAGCCAAGCCATCAGTCTCTCTCAACCAAGCTGCTTCACAGGATTGTGGCTGTGGGCAAAATAGGAGGAGGAAGGTG--TTGGATA-----------TTCAGTTATTTGTAAAAAATAATAAAGGTGGAATATAAACAAATAATCAGCAAC-TGAACTATTGTGA-AGCATTTATGAAGTAGATTTTTAAAATATTGATGTGTTACAATAAAGAAAAGGAAATGAGTGAAGGGACTTTTTAAATTTAAAATCTGAGCAAAGGTGAGCTTGCCAGCAGCTGAATATATGGTGACTTTTTT----AAAAAAAAATCTTTTTTTCAGAATGAGTCTTTGGAACGCCAGATGCGCGAGATGGAAGATGCCTTTGGAGTTGAAGCTGCCAACTACCAAGACAGCATTGCTAGACTTCAGGATGAAATCCAGAACATGAAGGAAGAAATGGCTCGCCAC Lampropeltis_getula AAGTGGATGCTCTTAAAGGAACTGTAAGTGAAAGATGTTGCAAGAAAGTGATGATTTTTGTTGACCTTCAGGTTTTGTCTCTTGTTATTTATTGTTAAAATCCAGCTATATTGTTTGGCTATTTGGCCAACCAGCCAAGCCATCAGTCTCTCTCAACCAAGCTGCTTCACAGGATTGTGGTTGTGGGCAAAATAGGAGGAGGAAGGTGTGTTGGATATGTTTGCAACCTTCAGTTATTTGTAAAAAATAATAAAGGTGGAATATAAACAAATAATCAGCAAC-TGAACTATTGTGA-AGCATTTATGAAGTAGATTTTTAAAATATTGATGTGTTACAATAAAGAAAAGGAAATGGGTGAAGGGACTTTTTAAATTTAAAATCTGAGCAAAGGTGAGCTTGCCAGCGGCTGAATATATTGTGACTTTTTT----AAAAAAAATTCTTTTTTTTAGAATGAGTCTTTGGAACGCCAGATGCGCGAGATGGAAGATGCCTTTGGAGTTGAAGCTGCCAACTACCAAGACAGCATTGCTAGACTTCAGGATGAAATCCAGAACATGAAGGAAGAAATGGCTCGCCAC Lampropeltis_holbrooki AAGTGGATGCTCTTAAAGGAACTGTAAGTGAAAGATGTTGCAAGAAAGTGATGATTTTTGTTGACCTTCAGGTTTTATCTCTTGTTATTTATTGTTAAAATCCAGCTATATTGTTTGGCTATTTGGCCAACCAGCCAAGCCATTAGTCTCTCTCAACCAAGCTGCTTCACAGGATTGTGGTTATGGGCAAAATAGGAGGAGGAAGGTGTGTTGGATATGTTTGCAACCTTCAGTTATTTGTAAAAAATAATAAAGGTGGAATATAAACAAATAATCAGCAAC-TGAACTATTGTGA-AGCATTTATGAAGTAGATTTTTAAAATATTGATGTGTTACAATAAAGAAAAGCAAATGGGTGAAGGGACTTTTTAAATTTAAAATCTGAGCAAAGGTGAGCTTGCCAGCGGCTGAATATATTGTGACTTTTTT----AAAAAAAATTCTTTTTTTTAGAATGAGTCTTTGGAACGCCAGATGCGCGAGATGGAAGATGCCTTTGGAGTTGAAGCTGCCAACTACCAAGACAGCATTGCTAGACTTCAGGATGAAATCCAGAACATGAAGGAAGAAATGGCTCGCCAC Lampropeltis_knoblochi AAGTGGATGCTCTTAAAGGAACTGTAAGTGAAAGATGTTGCAAGAAAGTGATGACTTTTGTTGACCTTCAGGTTTTGTCTCTTGTTATTTATTGTTAAAATCCAGCTATATTGTTTGGCTATTTGGCCAACCAGCCAAGCCATCAGTCTCTCTCAACCAAGCTGCTTCACAGGATTGTGGTTGTGGGCAAAATAGGAAGAGGAAGGTGTGTTGGATATGTCTGCAACCTTCAGTTATTTGTAAAAAATAATAAAGGTGGAATATAAACAAATAATCAGCAAC-TGAACTATTGTGA-AGCATTTATGAAGTAGATTTTTAAAATATTGATGTGTTACAATAAAGAAAAGGAAATGGGTGAAGGGACTTTTTAAATTTAAAATCTGAGCAAAGGTGAGCTTGCCAGCGGCTGAATATATTGTGACTTTTTTTT----AAAAAATTCTTTTTTTCAGAATGAGTCTTTGGAACGCCAAATGCGCGAGATGGAAGATGCCTTTGGAGTTGAAGCTGCCAACTACCAAGACAGCATTGCTAGACTTCAGGAGGAAATCCAGAACATGAAGGAAGAAATGGCTCG---- Lampropeltis_mexicana AAGTGGATGCTCTTAAAGGAACTGTAAGTGAAAGATGTTGCAAGAAAGTGATGACTTTTGTTGACCTTCAGGTTTTGTCTCTTGTTATTTATTGTTAAAATCCAGCTATATTGTTTGGCTATTTGGCCAACCAGCCAAGCCATCAGTCTCTCTCAACCAAGCTGCTTCACAGGATTGTGGTTGTGGGCAAAATAGGAAGAGGAAGGTGTGTTGGATATGTCTGCAACCTTCAGTTATTTGTAAAAAATAATAAAGGTGGAATATAAACAAATAATCAGCAAC-TGAACTATTGTGA-AGCATTTATGAAGTAGATTTTTAAAATATTGATGTGTTACAATAAAGAAAAGGAAATGGGTGAAGGGACTTTTTAAATTTAAAATCTGAGCAAAGGTGAGCTTGCCAGCGGCTGAATATATTGTGACTTTTT----AAAAAAAAATTCTTTTTTTCAGAATGAGTCTTTGGAACGCCAAATGCGCGAGATGGAAGATGCCTTTGGAGTTGAAGCTGCCAACTACCAAGACAGCATTGCTAGACTTCAGGAGGAAATCCAGAACATGAAGGAAGAAATGGCTCGCCAC Lampropeltis_nigra AAGTGGATGCTCTTAAAGGAACTGTAAGTGAAAGATGTTGCAAGAAAGTGATGATTTTTGTTGACCTTCAGGTTTTGTCTCTTGTTATTTATTGTTAAAATCCAGCTATATTGTTTGGCTATTTGGCCAACCAGCCAAGCCATCAGTCTCTCTCAACCAAGCTGCTTCACAGGATTGTGGTTGTGGGCAAAATAGGAGGAGGAAGGTGTGTTGGATATGTTTGCAACCTTCAGTTATTTGTAAAAAATAATAAAGGTGGAATATAAACAAATAATCAGCAAC-TGAACTATTGTGA-AGCATTTATGAAGTAGATTTTTAAAATATTGATGTGTTACAATAAAGAAAAGCAAATGGGTGAAGGGACTTTTTAAATTTAAAATCTGAGCAAAGGTGAGCTTGCCAGCGGCTGAATATATTGTGACTTTTT----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Lampropeltis_pyromelana AAGTGGATGCTCTTAAAGGAACTGTAAGTGAAAGATGTTGCAAGAAAGTGATGACTTTTGTTGACCTTCAGGTTTTGTCTCTTGTTATTTATTGTTAAAATCCAGCTATATTGTTTGGCTATTTGGCCAACCAGCCAAGCCATCAGTCTCTCTCAACCAAGCTGCTTCACAGGATTGTGGTTGTGGGCAAAATAGGAAGAGGAAGGTGTGTTGGATATGTCTGCAACCTTCAGTTATTTGTAAAAAATAATAAAGGTGGAATATAAACAAATAATCAGCAAC-TGAACTATTGTGA-AGCATTTATGAAGTAGATTTTTAAAATATTGATGTGTTACAATAAAGAAAAGGAAATGGGTGAAGGGACTTTTTAAATTTAAAATCTGAGCAAAGGTGAGCTTGCCAGCGGCTGAATATATTGTGACTTTTTTTT----AAAAAATTCTTTTTTTCAGAATGAGTCTTTGGAACGCCAAATGCGCGAGATGGAAGATGCCTTTGGAGTTGAAGCTGCCAACTACCAAGACAGCATTGCTAGACTTCAGGAGGAAATCCAGAACATGAAGGAAGAAATGGCTCG---- Lampropeltis_ruthveni AAGTGGATGCTCTTAAAGGAACTGTAAGTGAAAGATGTTGCAAGAAAGTGATGACTTTTGTTGACCTTCAGGTTTTGTCTCTTGTTATTTATTGTTAAAATCCAGCTATATTGTTTGGCTATTTGGCCAACCAGCCAAGCCATCAGTCTCTCTCAACCAAGCTGCTTCACAGGATTGTGGTTGTGGGCAAAATAGGAAGAGGAAGGTGTGTTGGATATGTCTGCAACCTTCAGTTATTTGTAAAAAATAATAAAGGTGGAATATAAACAAATAATCAGCAAC-TGAACTATTGTGA-AGCATTTATGAAGTAGATTTTTAAAATATTGATGTGTTACAATAAAGAAAAGGAAATGGGTGAAGGGACTTTTTAAATTTAAAATCTGAGCAAAGGTGAGCTTGCCAGCGGCTGAATATATTGTGACTTTTT----AAAAAAAAATTCTTTTTTTCAGAATGAGTCTTTGGAACGCCAAATGCGCGAGATGGAAGATGCCTTTGGAGTTGAAGCTGCCAACTACCAAGACAGCATTGCTAGACTTCAGGAGGAAATCCAGAACATGAAGGAAGAAATGGCTCGCCAC Lampropeltis_splendida AAGTGGATGCTCTTAAAGGAACTGTAAGTGAAAGATGTTGCAAGAAAGTGATGATTTTTGTTGACCTTCAGGTTTTATCTCTTGTTATTTATTGTTAAAATCCAGCTATATTGTTTGGCTATTTGGCCAACCAGCCAAGCCATTAGTCTCTCTCAACCAAGCTGCTTCACAGGATTGTGGTTGTGGGCAAAATAGGAGGAGGAAGGTGTGTTGGATATGTTTGCAACCTTCAGTTATTTGTAAAAAATAATAAAGGTGGAATATAAACAAATAATCAGCAAC-TGAACTATTGTGA-AGCATTTATGAAGTAGATTTTTAAAATATTGATGTGTTACAATAAAGAAAAGCAAATGGGTGAAGGGACTTTTTAAATTTAAAATCTGAGCAAAGGTGAGCTTGCCAGCGGCTGAATATATTGTGACTTTTTTT--AAAAAAAAATTCTTTTTTTTAGAATGAGTCTTTGGAACGCCAGATGCGCGAGATGGAAGATGCCTTTGGAGTTGAAGCTGCCAACTACCAAGACAGCATTGCTAGACTTCAGGATGAAATCCAGAACATGAAGGAAGAAATGGCTCGCCAC Lampropeltis_triangulum_CA AAGTGGATGCTCTTAAAGGAACTGTAAGTGAAAGATGTTGCAAGAAAGTGATGAC-TTTGTTGACCTTCAGGTTTTGTCTCTTGTTATTTATTGTTAAAATCCAGCTATATTGTTTGGCTATTTGGCCAACCAGCCAAGCCATCAGTCTCTCTCAACCAAGCTGATTCACAGGATTGTGGTTGTGGGCAAAATAGGAAGAGGAAGGTGTGTTGGATATGTTTGCAACCTTCAGTTATTTGTAAAAAATAATAAAGGTGGAATATAAACAAATAATCAGCAAC-TGAACTATTGTGA-AGCATTTATGAAGTAGATTTTTAAAATATTGATGTGTTACAATAAAGAAAAGGAAATGGGTGAAGGGACTTTTTAAATTTAAAATCTGAGCAAAGGTGAGCTTGCCAGCGGCTGAATATATTGTGACTTTTTT----AAAAAAAAATCTTTTTTTCAGAATGAGTCTTTGGAACGCCAAATGCGCGAGATGGAAGATGCCTTTGGAGTTGAAGCTGCCAACTACCAAGACAGCATTGCTAGACTTCAGGAGGAAATCCAGAACATGAAGGAAGAAATGGCTCGCCAC Lampropeltis_triangulum_Eastern AAGTGGATGCTCTTAAAGGAACTGTAAGTGAAAGATGTTGCAAGAAAGTGATGATTTTTGTTGACCTTCAGGTTTTGTCTCTTGTTATTTATTGTTAAAATCCAGCTATATTGTTTGGCTATTTGGCCAACCAGCCAAGCCATCAGTCT--CTCAACCAAGCTGCTTCACAGGATTGTGGTTGTGGGCAAAAGAGGAGGAGGAAGGTGTGTTGGATATGTTTGCAACCTTCAGTTATTTGTAAAAAATAATAAAGGTGGAATATAAACAAATAATCAGCAAC-TGAACTATTGTGA-AGCATTTATGAAGTAGATTTTTAAAATATTGATGTGTTACAATAAAGAAAAGGAAATGGGTGAAGGGACTTTTTAAATTTAAAATCTGAGCAAAGGTGAGCTTGCCAGCGGCTGAATATATTGTGACTTTTTT----AAAAAAAAATCTTTTTTTCAGAATGAGTCTTTGGAACGCCAGATGCGCGAGATGGAAGATGCCTTTGGAGTTGAAGCTGCCAACTACCAAGACAGCATTGCTAGACTTCAGGATGAAATCCAGAACATGAAGGAAGAAATGGCTCGCCAC Lampropeltis_triangulum_MX AAGTGGATGCTCTTAAAGGAACTGTAAGTGAAAGATGTTGCAAGAAAGTGATGAC-TTTGTTGACCTTCAGGTTTTGTCTCTTGTTATTTATTGTTAAAATCCAGCTATATTGTTTGGCTATTTGGCCAACCAGCCAAGCCATCAGTCTCTCTCAACCAAGCTGCTTCACAGGATTGTGGTTGTGGGCAAAATAGGAAGAGGAAGGTGTGTTGGATATGTTTGCAACCTTCAGTTATTTGTAAAAAATAATAAAGGTGGAATATAAACAAATAATCAGCAAC-TGAACTATTGTGA-AGCATTTATGAAGTAGATTTTTAAAATATTGATGTGTTACAATAAAGAAAAGGAAATGGGTGAAGGGACTTTTTAAATTTAAAATCTGAGCAAAGGTGAGCTTGCCAGCGGCTGAATATATTGTGACTTTTTT----AAAAAAAATTCTTTTTTTCAGAATGAGTCTTTGGAACGCCAAATGCGCGAGATGGAAGATGCCTTTGGAGTTGAAGCTGCCAACTACCAAGACAGCATTGCTAGACTTCAGGAGGAAATCCAGAACATGAAGGAAGAAATGGCTCGCCAC Lampropeltis_triangulum_SA AAGTGGATGCTCTTAAAGGAACTGTAAGTGAAAGATGTTGCAAGAAAGTGATGAC-TTTGTTGACCTTCAGGTTTTGTCTCTTGTTATTTATTGTTAAAATCCAGCTATATTGTTTGGCTATTTGGCCAACCAGCCAAGCCATCAGTCTCTCTCAACCAAGCTGCTTCACAGGATTGTGGTTGTGGGCAAAATAGGAAGAGGAAGGTGTGTTGGATATGTTTGCAACCTTCAGTTATTTGTAAAAAATAATAAAGGTGGAATATAAACAAATAATCAGCAAC-TGAACTATTGTGA-AGCATTTATGAAGTAGATTTTTAAAATATTGATGTGTTACAATAAAGAAAAGGAAATGGGTGAAGGGACTTTTTAAATTTAAAATCTGAGCAAAGGTGAGCTTGCCAGCGGCTGAATATATTGTGACTTTTT----AAAAAAAAATTCTTTTTTTCAGAATGAGTCTTTGGAACGCCAAATGCGCGAGATGGAAGATGCCTTTGGAGTTGAAGCTGCCAACTACCAAGACAGCATTGCTAGACTTCAGGAGGAAATCCAGAACATGAAGGAAGAAATGGCTCGCCAC Lampropeltis_triangulum_Tamaulipas AAGTGGATGCTCTTAAAGGAACTGTAAGTGAAAGTTGTTGCAAGAAAGTGATGATTTTTGTTGACCTTCAGGTTTTGTCTCTTGTTATTTATTGTTAAAATCCAGCTAT-TTGTTTGGCTATTTGGCCAACCAGCCAAGCCATCAGTCTCTCTCAACCAAGCTGCTTCACAGGATTGTGGTTGTGGGCAAAATAGGAGGAGGAAGGTGTGTTGGATATGTTTGCAACCTTCAGTTATTTGTAAAAAATAATAAAGGTGGAATATAAACAAATAATCAGCAAC-TGAACTATTGTGA-AGCATTTATGAAGTAGATTTTTAAAATATTGATGTGTTACAATAAAGAAAAGGAAATGGGTGAAGGGACTTTTTAAATTTAAAATCTGAGCAAAGGTGAGCTTGCCAGCGGCTGAATATATTGTGACTTTTT----AAAAAAAAATTCTTTTTTTCAGAATGAGTCTTTGGAACGCCAGATGCGCGAGATGGAAGATGCCTTTGGAGTTGAAGCTGCCAACTACCAAGACAGCATTGCTAGACTTCAGGATGAAATCCAGAACATGAAGGAAGAAATGGCTCGCCAC Lampropeltis_triangulum_Western AAGTGGATGCTCTTAAAGGAACTGTAAGTGAAAGATGTTGCAAGAAAGTGATGATTTTTGTTGACCTTCAGGTTTTGTCTCTTGTTATTTATTGTTAAAATCCAGCTATATTGTTTGGCTATTTGGCCAACCAGCCAAGCCATCAGTCTCTCTCAACCAAGCTGCTTCACAGGATTGTGGTTGTGGGCAAAATAGGAGGAGGAAGGTGTGTTGGATATGTTTGCAACCTTCAGTTATTTGTAAAAAATAATAAAGGTGGAATATAAACAAATAATCAGCAAC-TGAACTATTGTGA-AGCATTTATGAAGTAGATTTTTAAAATATTGATGTGTTACAATAAAGAAAAGGAAATGGGTGAAGGGACTTTTTAAATTTAAAATCTGAGCAAAGGTGAGCTTGCCAGCGGCTGAATATATTGTGACTTTTTTT----AAAAAAATTCTTTTTTTCAGAATGAGTCTTTGGAACGCCAGATGCGCGAGATGGAAGATGCCTTTGGAGTTGAAGCTGCCAACTACCAAGACAGCATTGCTAGACTTCAGGATGAAATCCAGAACATGAAGGAAGAAATGGCTCGCCAC Lampropeltis_webbi AAGTGGATGCTCTTAAAGGAACTGTAAGTGAAAGATGTTGCAAGAAAGTGATGACTTTTGTTGACCTTCAGGTTTTGTCTCTTGTTATTTATTGTTAAAATCCAGCTATATTGTTTGGCTATTTGGCCAACCAGCCAAGCCATCAGTCTCTCTCAACCAAGCTGCTTCACAGGATTGTGGTTGTGGGCAAAATAGGAAGAGGAAGGTGTGTTGGATATGTCTGCAACCTTCAGTTATTTGTAAAAAATAATAAAGGTGGAATATAAACAAATAATCAGCAAC-TGAACTATTGTGA-AGCATTTATGAAGTAGATTTTTAAAATATTGATGTGTTACAATAAAGAAAAGGAAATGGGTGAAGGGACTTTTTAAATTTAAAATCTGAGCAAAGGTGAGCTTGCCAGCGGCTGAATATATTGTGACTTTTT----AAAAAAAAATTCTTTTTTTCAGAATGAGTCTTTGGAACGCCAAATGCGCGAGATGGAAGATGCCTTTGGAGTTGAAGCTGCCAACTACCAAGACAGCATTGCTAGACTTCAGGAGGAAATCCAGAACATGAAGGAAGAAATGGCTCGCCAC Lampropeltis_zonata AAGTGGATGCTCTTAAAGGAACTGTAAGTGAAAGATGTTGCAAGAAAGTGATGACTTTTGTTGACCTTCAGGTTTTGTCTCTTGTTATTTATTGTTAAAATCCAGCTATATTGTTTGGCTATTTGGCCAACCAGCCAAGCCATCAGTCTCTCTCAACCAAGCTGCTTCACAGGATTGTGGTTGTGGGCAAAATAGGAAGAGGAAGGTGTGTTGGATATGTCTGCAACCTTCAGTTATTTGTAAAAAATAATAAAGGTGGAATATAAACAAATAATCAGCAAC-TGAACTATTGTGA-AGCATTTATGAAGTAGATTTTTAAAATATTGATGTGTTACAATAAAGAAAAGGAAATGGGTGAAGGGACTTTTTAAATTTAAAATCTGAGCAAAGGTGAGCTTGCCAGCGGCTGAATATATTGTGACTTTTTT----AAAAAAAATTCTTTTTTTCAGAATGAGTCTTTGGAACGCCAAATGCGCGAGATGGAAGATGCCTTTGGAGTTGAAGCTGCCAACTACCAAGACAGCATTGCTAGACTTCAGGAGGAAATCCAGAACATGAAGGAAGAAATGGCTCG---- ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M20126] TITLE 1_cl4; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep12824; DIMENSIONS NCHAR=373; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Arizona_elegans GATGGACAAAGCAATCAAAAGGATGCCTGGTTATTTACTTTCTCACAACTCCACCCCATCCCCCCATCCCGCTGCAATATTTATTAAAATCTGTAGTGTAGCACATGTGTGTTTTTCATTAACTTGATGTTTCTTTGGGCAATAAAGCTTCTATTGTTCAACCCTTCAGCTGTCTGTTGGTTGTACCTCATCATGTTCCCTTTAAAAGACCAACCATATTCTGCAGGGAAACAGCAAAATCTGGAAAACCTGTTTTGTTTGATGTATCCCTTAATTTGTTTTAATTAGCAGAGTTAAGAGTTGGATTGTAAGTATCAGGAAATGATAATGCCTGGCTGATGCTAATATAGCTTTTTTT--GGGGGGGG----- Cemophora_coccinea GATGGACAAAGCAATCAAAAGGATACCTGGTTATTTACTTTCTCACAACTCCACCCCGTCCCCCCGTCCCACTGCAATATTTATTAAAATCTGTAGTGTAGCACATGTGTTTTTTTCATTAACTTGATGTTTCTTTGGGCAATAAATCTTCTATTGTTCAACCCTTCAGCTGTCTGTTGGTTGTACCTCATCATGTTCCCTTTAAAAGACCAACCATATTCTGCAGGGAAACAGCAAAATCTGGAAAAGCTGTTTTGTTTGATGTATCCCTTAATTTGTTTTAATTAGCAGAGTTAAGAGTTGGATTGTAAGTGTCAGGAAATGATAATGCCTGGCTGATGCTAATATAGCTTTTTTTT-GGGGGGG------ Lampropeltis_alterna GATGGACAAAGCAATCAAAAGGATACCTGGTTATTTACTTTCTCACAACTCCACCCCGTCCCCCCATCCCGCTGCAATATTTACTAAAATCTGTAGTGTAGCACATGTGTTTTTTTCATTAACTTGATGTTTCTTTGGGCAATAAATCTTCTATTGTTCAACCCTTCAGCTGTCTGTTGGTTGTACCTCATCATGTTCCCTTTAAAAGACCAACCATATTCTGCAGGGAAACAGCAAAATCTGGAAAAGCTGTTTTGTTTGATGTATCCCTTAATTTGTTTTAATTAGCAGAGTTAAGAGTTGGATTGTAAGTGTCAGGAAATGATAATGCCTGGCTGATGCTAATATAGCTTTTTTTTTGGGGGGGGGGG-C Lampropeltis_californiae GATGGACAAAGCAATCAAAAGGATGCCTGGTTATTTACTTTCTCACAACTCCACCCGGTCCCCTCATCCCGCTGCAATATTTATTAAAATCTGTAGTGTAGCACATGTGTTTTTTTCATTAACTTGATGTTTCTTTGGGCAATAAATCTTCTATTGTTCAACCCTTCAGCTGTCTGTTGGTTGTACCTCATCATGTTCCCTTTAAAAGACCAACCATATTCTGCAGGGAAACAGCAAAATCTGGAAAAGCTGTTTTGTTTGATATAACCCTTAATTTGTTTTAATTAGCAGAGTTAAGAGTTGGATTGTAAGTGTCAGGAAATGATAATGCCTGGCTGATGCTAATATAGCTTTTTTT--GGTGGGGGGG--C Lampropeltis_calligaster GATGGACAAAGCAATCAAAAGGATGCCTGGTTATTTACTTTCTCACAACTCCACCCGGTCCCCTCATCCCGCTGCAATATTTATTAAAATCTGTAGTGTAGCACATGTGTTTTTTTCATTAACTTGATGTTTCTTTGGGCAATAAATCTTCTATTGTTCAACCCTTCAGCTGTCTGTTGGTTGTACCTCATCATGTTCCCTTTAAAAGACCAACCATATTCTGCAGGGAAACAGCAAAATCTGGAAAAGCTGTTTTGTTTGATGTATCCCTTAATTTGTTTTAATTAGCAGAGTTAAGAGTTGGATTGTAAGTGTCAGGAAATGATAATGCCTGGCTGATGCTAATATAGCTTTTTTT--GGTGGGGGGG--- Lampropeltis_elapsoides GATGGACAAAGCAATCAAAAGGATGCCTGGTTATTTACTTTCTCACAACTCCACCCCGTCCCCCCATCCTGCTGCAATATTTATTAAAATCTGTAGTGTAGCACATGTGTGTTTTTCATTAACTTGATGTTTCTTTGGGCAATAAATCTTCTATTGTTTAACCCTTCAGCTGTCTGCTGGTTGTACCTCATCATGTTCCCTTTAAAAGACCAACCATATTCTGCAGGGAAACAGCAAAATCTGGAAAAGCTGTTTTGTTTGATGTATCCCTTAAGTTGTTTTAATTAGCAGAGTTAAGAGTTGGATTGTAAGTGTCAGGAAATGATAATGCCTGGCTGATGCTAATATAGCTTTTTT---GGGGGCGGG---- Lampropeltis_extenuata GATGGACAAAGCAATCAAAAGGATACCTGGTTATTTACTTTCTCACAACTCCACCCGGTCCCCTCATCCCGCTGCAATATTTATTAAAATCTGTAGTGTAGCACATGTGTTTTTTTCATTAACTTGATGTTTCTTTGGGCAATAAATCTTCTATTGTTCAACCCTTCAGCTGTCTGTTGGTTGTACCTCATCATGTTCCCTTTAAAAGACCAACCATATTCTG--------CAGCAAAATCTGGAAAAGCTGTTTTGTTTGATGTAACCCTTAATTTGTTTTAATTAGCAGAGTTAAGAGTTGGATTGTAAGTGTCAGGAAATGATAATGCCTGGCTGATGCTAATATAGCTTTTTTT--GGTGGGGGG---- Lampropeltis_getula GATGGACAAAGCAATCAAAAGGATGCCTGGTTATTTACTTTCTCACAACTCCACCCGGTCCCCCCATCCCGCTGCAATATTTATTAAAATCTGTAGTGTAGCACATGTGTGTTTTTCATTAACTTGATGTTTCTTTGGGCAATAAATCTTCTATTGTTCAACCCTTCAGCTGTCTGTTGGTTGTACCTCATCATGTTCCCTTTAAAAGACCAACCATATTCTGCAGGGAAACAGCAAAATCTGGAAAAGCTGTTTTGTTTGATGTAACCCTTAATTTGTTTTAATTAGCAGAGTTAAGAGTTGGATTGTAAGTGTCAGGAAATGATAATGCCTGGCTGATGCTAATATAGCTTTTTTT--GGTGGGGGG---- Lampropeltis_holbrooki ------------------------GCCTGGTTATTTACTTTCTCACAACTCCACCCGGTCCCCCCATCCCGCTGCAATATTTATTAAAATCTGTAGTGTAGCACATGTGTGTTTTTCATTAACTTGATGTTTCTTTGGGCAATAAATCTTCTATTGTTCAACCCTTCAGCTGTCTGTTGGTTGTACCTCATCATGTTCCCTTTAAAAGACCAACCATATTCTGCAGGGAAACAGCAAAATCTGGAAAAGCTGTTTTGTTTGATGTAACCCTTAATTTGTTTTAATTAGCAGAGTTAAGAGTTGGATTGTAAGTGTCAGGAAATGATAATGCCTGGCTGATGCTAATATAGCTTTTTTT--GGTGGGGGGG--C Lampropeltis_knoblochi GATGGACAAAGCAATCAAAAGGATACCTGGTTATTTACTTTCTCACAACTCCACCCCGTCCCCCCATCCCGCTGCAATATTTATTAAAATCTGTAGTGTAGCACATGTGTTTTTTTCATTAACTTGATGTTTCTTTGGGCAATAAATCTTCTATTGTTCAACCCTTCAGCTGTCTGTTGGTTGTACCTCATCATGTTCCCTTTAAAAGACCAACCATATTCTGCAGGGAAACAGCAAAATCTGGAAAAGCTGTTTTGTTTGATGTATCCCTTAATTTGTTTTAATTAGCAGAGTTAAGAGTTGGATTGTAAGTGTCAGGAAATGATAATGCCTGGCTGATGCTAATATAGCTTTTTTT--GGGGGGGGGG--C Lampropeltis_mexicana GATGGACAAAGCAATCAAAAGGATACCTGGTTATTTACTTTCTCACAACTCCACCCCGTCCCCCCATCCCGCTGCAATATTTATTAAAATCTGTAGTGTAGCACATGTGTTTTTTTCATTAACTTGATGTTTCTTTGGGCAATAAATCTTCTATTGTTCAACCCTTCAGCTGTCTGTTGGTTGTACCTCATCATGTTCCCTTTAAAAGACCAACCATATTCTGCAGGGAAACAGCAAAATCTGGAAAAGCTGTTTTGTTTGATGTATCCCTTAATTTGTTTTAATTAGCAGAGTTAAGAGTTGGATTGTAAGTGTCAGGAAATGATAATGCCTGGCTGATGCTAATATAGCTTTTTTT--GGGGGGGGG---- Lampropeltis_nigra GATGGACAAAGCAATCAAAAGGATGCCTGGTTATTTACTTTCTCACAACTCCACCCGGTCCCCTCATCCCGCTGCAATATTTATTAAAATCTGTAGTGTAGCACATGTGTGTTTTTCATTAACTTGATGTTTCTTTGGGCAATAAATCTTCTATTGTTCAACCCTTCAGCTGTCTGTTGGTTGTACCTCATCATGTTCCCTTTAAAAGACCAACCATATTCTGCAGGGAAACAGCAAAATCTGGAAAAGCTGTTTTGTTTGATGTAACCCTTAATTTGTTTTAATTAGCAGAGTTAAGAGTTGGATTGTAAGTGTCAGGAAATGATAATGCCTGGCTGATGCTAATATAGCTTTTTTT--GGTGGGGGG---- Lampropeltis_pyromelana GATGGACAAAGCAATCAAAAGGATACCTGGTTATTTACTTTCTCACAACTCCACCCCATCCCCCCATCCCGCTGCAATATTTATTAAAATCTGTAGTGTAGCACATGTGTTTTTTTCATTAACTTGATGTTTCTTTGGGCAATAAATCTTCTATTGTTCAACCCTTCAGCTGTCTGTTGGTTGTACCTCATCATGTTCCCTTTAAAAGACCAACCATATTCTGCAGGGAAACAGCAAAATCTGGAAAAGCTGTTTTGTTTGATGTATCCCTTAATTTGTTTTAATTAGCAGAGTTAAGAGTTGGATTGTAAGTGTCAGGAAATGATAATGCCTGGCTGATGCTAATATAGCTTTTTT---GGGGGGGGGG--C Lampropeltis_ruthveni -----ACAAAGCAATCAAAAGGATACCTGGTTATTTACTTTCTCACAACTCCACCCCGTCCCCCCATCCCGCTGCAATATTTATTAAAATCTGTAGTGTAGCACATGTGTTTTTTTCATTAACTTGATGTTTCTTTGGGCAATAAATCTTCTATTGTTCAACCCTTCAGCTGTCTGTTGGTTGTACCTCATCATGTTCCCTTTAAAAGACCAACCATATTCTGCAGGGAAACAGCAAAATCTGGAAAAGCTGTTTTGTTTGATGTATCCCTTAATTTGTTTTAATTAGCAGAGTTAAGAGTTGGATTGTAAGTGTCAGGAAATGATAATGCCTGGCTGATGCTAATATAGCTTTTTTT--GGGGGGGGG---- Lampropeltis_splendida GATGGACAAAGCAATCAAAAGGATACCTGGTTATTTACTTTCTCACAACTCCACCCGGTCCCCCCATCCCGCTGCAATATTTATTAAAATCTGTAGTGTAGCACATGTGTGTTTTTCATTAACTTGATGTTTCTTTGGGCAATAAATCTTCTATTGTTCAACCCTTCAGCTGTCTGTTGGTTGTACCTCATCATGTTCCCTTTAAAAGACCAACCATATTCTGCAGGGAAACAGCAAAATCTGGAAAAGCTGTTTTGTTTGATGTAACCCTTAATTTGTTTTAATTAGCAGAGTTAAGAGTTGGATTGTAAGTGTCAGGAAATGATAATGCCTGGCTGATGCTAATATAGCTTTTTTT--GGTGGGGGG---- Lampropeltis_triangulum_CA GATGGACAAAGCAATCAAAAGGATGCCTGGTTATTTACTTTCTCACAACTTCACCCCGTCCCCCCATCCCGCTGCAATATTTATTAAAATCTGTAGTGTAGCACATGTGTGTTTTTCATTAACTTGATGTTTCTTTGGGCAATAAATCTTCTATTGTTTAACCCTTCAGCTGTCTGTTGGTTGTACCTCATCATGTTCCCTTTAAAAGACCAACCATATTCTGCAGGGAAACAGCAAAATCTGGAAAAGCTGTTTTGTTTGATGTATCCCTTAATTTGTTTTAATTAGCAGAGTTAAGAGTTGGATTGTAAGTGTCAGGAAATGATAATGCCTGGCTGATGCTAATATAGCTTTTTTT--GGGGGGGGGG--C Lampropeltis_triangulum_Eastern GATGGACAAAGCAATCAAAAGGATGCCTGGTTATTTACTTTCTCACAACTTCACCCCGTCCCCCCATCCCGCTGCAATATTTATTAAAATCTGTAGTGTAGCACATGTGTGTTTTTCATTAACTTGATGTTTCTTTGGGCAATAAATCTTCTATTGTTTAACCCTTCAGCTGTCTGTTGGTTGTACCTCATCATGTTCCCTTTAAAAGACCAACCATATTCTGCAGGGAAACAGCAAAATCTGGAAAAGCTGTTTTGTTTGATGTATCCCTTAATTTGTTTTAATTAGCAGAGTTAAGAGTTGGATTGTAAGTGTCAGGAAATGATAATGCCTGGCTGATGCTAATATAGCTTTTTTTT-GGGGGGGGG---- Lampropeltis_triangulum_MX GATGGACAAAGCAATCAAAAGGATGCCTGGTTATTTACTTTCTCACAACTTCACCCCGTCCCCCCATCCCGCTGCAATATTTATTAAAATCTGTAGTGTAGCACATGTGTGTTTTTCATTAACTTGATGTTTCTTTGGGCAATAAATCTTCTATTGTTTAACCCTTCAGCTGTCTGTTGGTTGTACCTCATCGTGTTCCCTTTAAAAGACCAACCATATTCTGCAGGGAAACAGCAAAATCTGGAAAAGCTGTTTTGTTTGATGTATCCCTTAATTTGTTTTAATTAGCAGAGTTAAGAGTTGGATTGTAAGTGTCAGGAAATGATAATGCCTGGCTGATGCTAATATAGCTTTTTTTT-GGGGGGGGGGG-C Lampropeltis_triangulum_SA GATGGACAAAGCAATCAAAAGGATGCCTGGTTATTTACTTTCTCACAACTTCACCCCGTCCCCCCATCCCGCTGCAATATTTATTAAAATCTGTAGTGTAGCACATGTGTGTTTTTCATTAACTTGATGTTTCTTTGGGCAATAAATCTTCTATTGTTTAACCCTTCAGCTGTCTGTTGGTTGTACCTCATCATGTTCCCTTTAAAAGACCAACCATATTCTGCAGGGAAACAGCAAAATCTGGAAAAGCTGTTTTGTTTGATGTATCCCTTAATTTGTTTTAATTAGCAGAGTTAAGAGTTGGATTGTAAGTGTCAGGAAATGATAATGCCTGGCTGATGCTAATATAGCTTTTTTTT-GGGGGGGGG---- Lampropeltis_triangulum_Tamaulipas GATGGACAAAGCAATCAAAAGGATGCCTGGTTATTTACTTTCTCACAACTCCACCCCGTCCCCCCATCCTGCTGCAATATTTATTAAAATCTGTAGTGTAGCACATGTGTTTTTTTCATTAACTTGATGTTTCTTTGGGCAATAAATCTTCTATTGTTCAACCCTTCAGCTGTCTGTTGGTTGTACCTCATCATGTTCCCTTTAAAAGACCAACCATATTCTGCAGGGAAACAGCAAAATCTGGAAAAGCTGTTTTGTTTGATGTATCCCTTAATTTGTTTTAATTAGCAGAGTTAAGAGTTGGATTGTAAGTGTCAGGAAATGATAATGCCTGGCTGATGCTAATATAGCTTTTTTTT-GGGGGGGGG---C Lampropeltis_triangulum_Western GATGGACAAAGCAATCAAAAGGATGCCTGGTTATTTACTTTCTCACAACCTCACCCCGTCCCCCCATCCCGCTGCAATATTTATTAAAATCTGTAGTGTAGCACATGTGTGTTTTTCATTAACTTGATGTTTCTTTGGGCAATAAATCTTCTATTGTTTAACCCTTCAGCTGTCTGTTGGTTGTACCTCATCATGTTCCCTTTAAAAGACCAACCATATTCTGCAGGGAAACAGCAAAATCTGGAAAAGCTGTTTTGTTTGATGTATCCCTTAATTTGTTTTAATTAGCAGAGTTAAGAGTTGGATTGTAAGTGTCAGGAAATGATAATGCCTGGCTGAT--------------------------------- Lampropeltis_webbi GATGGACAAAGCAATCAAAAGGATACCTGGTTATTTACTTTCTCACAACTCCACCCCGTCCCCCCATCCCGCTGCAATATTTATTAAAATCTGTAGTGTAGCACATGTGTTTTTTTCATTAACTTGATGTTTCTTTGGGCAATAAATCTTCTATTGTTCAACCCTTCAGCTGTCTGTTGGTTGTACCTCATCATGTTCCCTTTAAAAGACCAACCATATTCTGCAGGGAAACAGCAAAATCTGGAAAAGCTGTTTTGTTTGATGTATCCCTTAATTTGTTTTAATTAGCAGAGTTAAGAGTTGGATTGTAAGTGTCAGGAAATGATAATGCCTGGCTGATGCTAATATAGCTTTTTT---GGGGGGGGG---- Lampropeltis_zonata GATGGACAAAGCAATCAAAAGGATACCTGGTTATTTACTTTCTCACAACTCCACCCCGTCCCCCCATCCCGCTGCAATATTTATTAAAATCTGTAGTGTAGCACATGTGTTTTTTTCATTAACTTGATGTTTCTTTGGGCAATAAATCTTCTATTGTTCAACCCTTCAGCTGTCTGTTGGTTGTACCTCATCATGTTCCCTTTAAAAGACCAACCATATTCTGCAGGGAAACAGCAAAATCTGGAAAAGCTGTTTTGTTTGATGTATCCCTTAATTTGTTTTAATTAGCAGAGTTAAGAGTTGGATTGTAAGTGTCAGGAAATGATAATGCCTGGCTGATGCTAATATAGCTTTTTTT--GGGGGGGGG---- ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M20123] TITLE 1_prlr; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep12824; DIMENSIONS NCHAR=552; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Arizona_elegans AATCATGGAAAGAGTCACCCCAATAAACATGTAAGGCTAGCCCACCAGGAAATAGACTCCGATTCAGGAAGGGGAAGCTGTGAGAGTCCATCTCTACTGCAAGAGAAATATAAGGAAGCCAGAAAACTGCTCCCTACAGTAGAAGTACCAGATCCTGAGGAGGTTCAAAGGAACACTGATAGAAAAAATCTCTCAGAAACATTAAAACTAGAGCCTGAACGGCATCTCCCATGGTTGACCAGTAGTAACCCAAAATCATCGACATGGCCTGGAGACCAGCCAGGGCACTCTCTCACACCAAGGTATTCCTCTCATGATGCCATAGAGATCTGCAAAAGGATACTCAAAGCCACACATGTAAAAAGGTCACCCATTTTGGGGAGAAGGGAAGGAAAGCATTGTTCTCAGCTTCCCAAACCCATTGAGACGATCAGTAAAGTAAAAATGGGCCAACTGGAGGATGAAGCCAATATAACTCTAAACTCTCAGCGTAATCAAGAC-CATTCTGGTTAGCTTCTCCAGAGCAGTTGCCTTTCACCTCTACGAAGCCA Cemophora_coccinea AATCATGGAAAGAGTCACCCCAATAAACATGTAAGGCTAGCCCACCAGGAAATAGACTCCGATTCAGGAAGGGGAAGCTGTGAGAGTCCATCTCTACTGCAAGAGAAATATAGGGAAGCCAGAAAACTGCCCCCTACAGTAGAAGTACCAGATCCTGAGGAGGTTCAAAGGAACACTGATAGAAAAAATCTCTCAGAAACATTAAAACTAGAGCCTGAACGGCATCTCCCACGGTTGACCAGTAGTAACCCAAAATCATCGACATGGCCTGGAGATCAGCCAGGGCACTCTCTCACGCCAAGGTATTCCTCTCATGATGCCATAGAGATCTGCAAAAGGATACTCAAAGCCACACATGTAAAAAGGTCACCCATTTTGGGGAGAAGGGAAGGAAAGCATTGTTCTCAGCTTCCCGAACCCATTGAGACGATCAGTAAAGTAAAAACGGGCCAACTGGAGGATGAAGCCAATATAACTCTAAACTCTCAGCGTAATCAAGACACATTCTGGTTAGCTTCTCCAGAGCAGTTGCCTTTCACCTCTACGAAGCCA Lampropeltis_alterna AATCATGGAAAGAGTCACCCCAATAAACATGTAAGACTAGCCCACCAGGAAATAGACTCCGATTCAGGAAGGGGAAGCTGTGAGAGTCCATCTCTACTGCAAGAGAAATATAAGGAAGCCAGAAAACTGCCCCCTACAGTAGAAGTACCAGATCCTGAGGAGGTTCAAAGGAACACTGATAGAAAAAATCTCTCAGAAACATTAAAACTAGAGCCTGAACGGCATCTCCCACGGTTGACCAGTAGTAACCCAAAATCATCGACATGGCCTGGAGACCAGCCAGGGCACTCTCTCACGCCAAGGTATTCCTCTCATGATGCCATAGAGATCTGCAAAAGGATACTCAAAGCCACACATGTAAAAAGGTCACCCATTTTGGGGAGAAGGGAAGGAAAGCATTGTTCTCAGCTTCCCGAACCCATTGAGACGATCAGTAAAGTAAAAATGGGCCAACTGGAGGATGAAGCCAATATAACTCTAAACTCTCAGCGTAATCAAGACACATTCTGGTTAGCTTCTCCAGAGCAGTTGCCTTTCACCTCTACGAAGCCA Lampropeltis_californiae ---------------------------------------------CAGGAAATAGACTCCGATTCAGGAAGGGGAAGCTGTGAGAGTCCATCTCTACTGCAAGAGAAATATAAGGAAGCCAGAAAACTGCCTCCTACAGTAGAAGTACCAGATCCTGAGGAGGTTCAAAGGAACACTGATAGAAAAAATCTCTCAGAAACATTAAAACTAGAGCCTGAACGGCATCTCCCACGGTTGACCAGTAGTAACCCAAAATCATCGACATGGCCTGGAGACCAGCCAGGGCACTCTCTCACGCCAAGGTATTCCTCTCATGATGCCATAGAGATCTGCAAAAGGATACTCAAAGCCACACATGTAAAAAGGTCACCCGTTTTGGGGAGAAGGGAAGGAAAGCATTGTTCTCAGCTTCCCGAACCCATTGAGACGATCAGTAAAGTAAAAACGGGCCAACTGGAGGATGAAGCCAATATAACTCTAAACTCTCAGCATAATCAAGACACATTCTGGTTAGCTTCTCCAGAGCAGTTGCCTTTCACCTCTATGAAGCCA Lampropeltis_calligaster AATCATGGAAAGAGTCACCCCAATAAACATGTAAGGCTAGCCCACCAGGAAATAGACTCCGATTCAGGAAGGGGAAGCTGTGAGAGTCCATCTCTACTGCAAGAGAAATATAAGGAAGCCAGAAAACTGCCCCCTACAGTAGAAGTACCAGATCCTGAGGAGGTTCAAAGGAACACTGATAGAAAAAATCTCTCAGAAACATTAAAACTAGAGCCTGAACGGCATCTCCCACGGTTGACCAGTAGTAACCCAAAATCATCGACATGGCCTGGAGACCAG-CAGGGCACTCTCTCACGCCAAAGTATTCCTCTCATGATGCCATAGAGATCTGCAAAAGGATACTCAAAGCCACACATGTAAAAAGGTCACCCATTTTGGGGAGAAGGGAAGGAAAGCATTGTTCTCAGCTTCCCGAACCCATTGAGACGATCAGTAAAGTAAAAACGGGCCAACTGGAGGATGAAGCCAATATAACTCTAAACTCTCAGCGTAATCAAGACACATTCTGGTTAGCTTCTCCAGAGCAGTTGCCTTTCACCTCTATGAAGCCA Lampropeltis_elapsoides AATCATGGAAAGAGTCACCCCAATAAACATGTAAGGCTAGCCCACCAGGAAATAGACTCCGATTCAGGAAGGGGAAGCTGTGAGAGTCCATCTCTACTGCAAGAGAAATATAAGGAAGCCAGAAAACTGCCCCCTACAGTAGAAGTACCAGATCCTGAGGAGGTTCAAAGGAACACTGATAGAAAAAATCTCTCAGAAACATTAAAACTAGAGCCTGAACGGCATCTCCCACGGTTGACCAGTAGTAACCCAAAATCATCGACATGGCCTGGAGACCAGCCAGGGCACTCTCTCACGCCAAGGTATTCCTCTCATGATGCCATAGAGATCTGCAAAAGGATACTCAAAGCCACACATGTTAAAAGGTCACCCATTTTGGGGAGAAGGGAAGGAAAGCATTGTTCTCAGCTTCCCGAACCCATTGAGACGATCAGTAAAGTAAAAACGGGCCAACTGGAGGATGAAGCCAATATAACTCTAAACTCTCAGCGTAATCAAGACACATTCTGGTTAGCTTCTCCAGAGCAGTTGCCTTTCACCTCTACGAAGCCA Lampropeltis_extenuata AATCATGGAAAGAGTCACCCCAATAAACATGTAAGGCTAGCCCACCAGGAAATAGACTCCGATTCAGGAAGGGGAAGCTGTGAGAGTCCATCTCTACTGCAAGAGAAATATAAGGAAGCCAGAAAACTGCCCCCTACAGTAGAAGTACCAGATCCTGAGGAGGTTCAAAGGAACACTGATAGAAAAAATCTCTCAGAAACATTAAAACTAGAGCCTGAACGGCATCTCCCACGGTTGACCAGTAGTAACCCAAAATCATCGACATGGCCTGGAGACCAGCCAGGGCACTCTCTCACGCCAAGGTATTCCTCTCATGATGCCATAGAGATCTGCAAAAGGATACTCAAAGCCACACATGTAAAAAGGTCACCCATTTTGGGGAGAAGGGAAGGAAAGCATTGTTCTCAGCTTCCCGAACCCATTGAGACGATCAGTAAAGTAAAAATGGGCCAACTGGAGGATGAAGCCAATATAACTCTAAACTCTCAGCATAATCAAGACACATTCTGGTTAGCTTCTCCAGAGCAGTTGCCTTTCACCTCTACGAAGCCA Lampropeltis_getula ---------------------------------------------CAGGAAATAGACTCCGATTCAGGAAGGGGAAGCTGTGAGAGTCCATCTCTACTGCAAGAGAAATATAAGGAAGCCAGAAAACTGCCCCCTACAGTAGAAGTACCAGATCCTGAGGAGGTTCAAAGGAACACTGATAGAAAAAATCTCTCAGAAACATTAAAACTAGAGCCTGAACGGCATCTCCCACGGTTGACCAGTAGTAACCCAAAATCATCGACATGGCCTGGAGACCAGCCAGGGCACTCTCTCATGCCAAGGTATTCCTCTCATGATGCCATAGAGATCTGCAAAAGGATACTCAAAGCCACACATGTAAAAAGGTCACCCATTTTGGGGAGAAGGGAAGGAAAGCATTGTTCTCAGCTTCCCGAACCCATTGAGACGATCAGTAAAGTAAAAACGGGCCAACTGGAGGATGAAGCCAATATAACTCTAAACTCTCAGCGTAATCAAGACACATTCTGGTTAGCTTCTCCAGAGCAGTTGCCTTTCACCTCTATGAAGCCA Lampropeltis_holbrooki ------------------------------GTAAGGCTAGCCCACCAGGAAATAGACTCCGATTCAGGAAGGGGAAGCTGTGAGAGTCCATCTCTACTGCAAGAGAAATATAAGGAAGCCAGAAAACTGCCCCCTACAGTAGAAGTACCAGATCCTGAGGAGGTTCAAAGGAACACTGATAGAAAAAATCTCTCAGAAACATTAAAACTAGAGCCTGAACGGCATCTCCCACGGTTGACCAGTAGTAACCCAAAATCATCGACATGGCCTGGAGACCAGCCAGGGCACTCTCTCACGCCAAGGTATTCCTCTCATGATGCCATAGAGATCTGCAAAAGGATACTCAAAACCACACATGTAAAAAGGTCACCCGTTTTGGGGAGAAGGGAAGGAAAGCATTGTTCTCAGCTTCCCGAACCCATTGAGACGATCAGTAAAGTAAAAACGGGCCAACTGGAGGATGAAGCCAATATAACTCTAAACTCTCAGCATAATCAAGACACATTCTGGTTAGCTTCTCCAGAGCAGTTGCCTTTCACCTCTATGAAGCCA Lampropeltis_knoblochi AATCATGGAAAGAGTCACCCCAATAAACATGTAAGACTAGCCCACCAGGAAATAGACTCCGATTCAGGAAGGGGAAGCTGTGAGAGTCCATCTCTACTGCAAGAGAAATATAAGGAAGCCAGAAAACTGCCCCCTACAGTAGAAGTACCAGATCCTGAGGAGGTTCAAAGGAACACTGATAGAAAAAATCTCTCAGAAACATTAAAACTAGAGCCTGAACGGCATCTCCCACGGTTGACCAGTAGTAACCCAAAATCATCGACATGGCCTGGAGACCAGCCAGGGCACTCTCTCACGCCAAGGTATTCCTCTCATGATGCCATAGAGATCTGCAAAAGGATACCCAAAGCCACACATGTAAAAAGGTCACCCATTTTGGGGAGAAGGGAAGGAAAGCATTGTTCTCAGCTTCCCGAACCCATTGAGACGATCAGTAAAGTAAAAATGGGCCAACTGGAGGATGAAGCCAATATAACTCTAAACTCTCAGCGTAATCAAGACACATTCTGGTTAGCTTCTCCAGAGCAGTTGCCTTTCACCTCTAC------- Lampropeltis_mexicana AATCATGGAAAGAGTCACCCCAATAAACATGTAAGGCTAGCCCACCAGGAAATAGACTCCGATTCAGGAAGGGGAAGCTGTGAGAGTCCATCTCTACTGCAAGAGAAATATAAGGAAGCCAGAAAACTGCCCCCTACAGTAGAAGTACCAGATCCTGAGGAGGTTCAAAGGAACACTGATAGAAAAAATCTCTCAGAAACATTAAAACTAGAGCCTGAACGGCATCTCCCACGGTTGACCAGTAGTAACCCAAAATCATCGACATGGCCTGGAGACCAGCCAGGGCACTCTCTCACGCCAAGGTATTCCTCTCATGATGCCATAGAGATCTGCAAAAGGATACTCAAAGCCACACATGTAAAAAGGTCACCCATTTTGGGGAGAAGGGAAGGAAAGCATTGTTCTCAGCTTCCCGAACCCATTGAGACGATCAGTAAAGTAAAAATGGGCCAACTGGAGGATGAAGCCAATATAACTCTAAACTCTCAGCGTAATCAAGACGCATTCTGGTTAGCTTC---------------------------------- Lampropeltis_nigra AATCATGGAAAGAGTCACCCCAATAAACATGTAAGGCTAGCCCACCAGGAAATAGACTCCGATTCAGGAAGGGGAAGCTGTGAGAGTCCATCTCTACTGCAAGAGAAATATAAGGAAGCCAGAAAACTGCCCCCTACAGTAGAAGTACCAGATCCTGAGGAGGTTCAAAGGAACACTGATAGAAAAAATCTCTCAGAAACATTAAAACTAGAGCCTGAACGGCATCTCCCACGGTTGACCAGTAGTAACCCAAAATCATCGACATGGCCTGGAGACCAGCCAGGGCACTCTCTCACGCCAAGGTATTCCTCTCATGATGCCATAGAGATCTGCAAAAGGATACTCAAAGCCACACATGTAAAAAGGTCACCCATTTTGGGGAGAAGGGAAGGAAAGCATTGTTCTCAGCTTCCCGAACCCATTGAGACGATCAGTAAAGTAAAAACGGGCCAACTGGAGGATGAAGCCAATATAACTCTAAACTCTCAGCGTAATCAAGACACATTCTGGTTAGCT------------------------------------ Lampropeltis_pyromelana ----------------------------ATGTAAGGCTAGCCCACCAGGAAATAGACTCCGATTCAGGAAGGGGAAGCTGTGAGAGTCCATCTCTACTGCAAGAGAAATATAAGGAAGCCAGAAAACTGCCCCCTACAGTAGAAGTACCAGATCCTGAGGAGGTTCAAAGGAACACTGATAGAAAAAATCTCTCAGAAACATTAAAACTAGAGCCTGAACGGCATCTCCCACGGTTGACCAGTAGTAACCCAAAATCATCGACATGGCCTGGAGACCAGCCAGGGCATTCTCACACGCCAAGGTATTCCTCTCATGATGCCATAGAGATCTGCAAAAGGATGCTCAAAGCCACACATGTAAAAAGGTCACCCATTTTGGGGAGAAGGGAAGGAAAGCATTGTTCTCAGCTTCCCGAACCCATTGAGACGATCAGTAAAGTAAAAACGGGCCAACTGGAGGATGAAGCCAATATAACTCTAAACTCTCAGCGTAATCAAGACACATTCTGGTTAGCTTCTCCAGAGCAGTTGCCTTTCACCTCTACGAAGCCA Lampropeltis_ruthveni ------------------------------GTAAGACTAGCCCACCAGGAAATAGACTCCGATTCAGGAAGGGGAAGCTGTGAGAGTCCATCTCTACTGCAAGAGAAATATAAGGAAGCCAGAAAACTGCCCCCTACAGTAGAAGTACCAGATCCTGAGGAGGTTCAAAGGAACACTGATACAAAAAATCTCTCAGAAACATTAAAACTAGAGCCTGAACGGCATCTCCCACGGTTGACCAGTAGTAACCCAAAATCATCGACATGGCCTGGAGACCAGCCAGGGCACTCTCTCACGCCAAGGTATTCCTCTCATGATGCCATAGAGATCTGCAAAAGGATACTCAAAGCCACACATGTAAAAAGGTCACCCATTTTGGGGAGAAGGGAAGGAAAGCATTGTTCTCAGCTTCCCGAACCCATTGAGACGATCAGTAAAGTAAAAATGGGCCAACTGGAGGATGAAGCCAATATAACTCTAAACTCTCAGCGTAATCAAGACACATTCTGGTTAGCTTCTCCAGAGCAGTTGCCTTTCACCTCTACGAAGCCA Lampropeltis_splendida ------------------------------GTAAGGCTAGCCCACCAGGAAATAGACTCCGATTCAGGAAGGGGAAGCTGTGAGAGTCCATCTCTACTGCAAGAGAAATATAAGGAAGCCAGAAAACTGCCTCCTACAGTAGAAGTACCAGATCCTGAGGAGGTTCAAAGGAACACTGATAGAAAAAATCTCTCAGAAACATTAAAACTAGAGCCTGAACGGCATCTCCCACGGTTGACCAGTAGTAACCCAAAATCATCGACATGGCCTGGAGACCAGCCAGGGCACTCTCTCACGCCAAGGTATTCCTCTCATGATGCCATAGAGATCTGCAAAAGGATACTCAAAACCACACATGTAAAAAGGTCACCCGTTTTGGGGAGAAGGGAAGGAAAGCATTGTTCTCAGCTTCCCGAACCCATTGAGACGATCAGTAAAGTAAAAACGGGCCAACTGGAGGATGAAGCCAATATAACTCTAAACTCTCAGCATAATCAAGACACATTCTGGTTAGCTTCTCCAGAGCAGTTGCCTTTCACCTCTATGAAGCCA Lampropeltis_triangulum_CA -ATCATGGAAAGAGTCACCCCAATAAACATGTAAGACTAGCCCACCAGGAAATAGACTCCGATTCAGGAAGGGGAAGCTGTGAGAGTCCATCTCTACTGCAAGAGAAATATAAGGAAGCCAGAAAACTGCCCCCTACAGTAGAAGTACCAGATCCTGAGGAGGTTCAAAGGAACACTGATAGAAAAAATCTCTCAGAAACATTAAAACTAGAGCCTGAATGGCATCTCCCACGGTTGACCAGTAGTAACCCAAAATCATCGACATGGCCTGGAGACCAGCCAGGGCACTCTCTCACGCCAAGGTATTCCTCTCATGATGCCATAGAGATCTGCAAAAGGATACTCAAAGCCACACATGTAAAAAGGTCACCCATTTTGGGGAGAAGGGAAGGAAAGCATTGTTCTCAGCTTCCCGAACCCATTGAGACGATCAGTAAAGTAAAAATGGGCCAACTGGAGGATGAAGCCAATATAACTCTAAACTCTCAGCGTAATCAAGACACATTCTGGTTAGCTTCTCCAGAGCAGTTGCCTTTCACCTCT--------- Lampropeltis_triangulum_Eastern AATCATGGAAAGAGTCACCCCAATAAACATGTAAGGCTAGCCCACCAGGAAATAGACTCCGATTCAGGAAGGGGAAGCTGTGAGAGTCCATCTCTACTGCAAGAGAAATATAAGGAAGCCAGAAAACTGCCCCCTACAGTAGAAGTACCAGATCCTGAGGAGGTTCAAAGGAACACTGATAGAAAAAATCTCTCAGAAACATTAAAACTAGAGCCTGAACGGCATCTCCCACGGTTGACCAGTAGTAACCCAAAATCATCGACATGGCCTGGAGACCAGCCAGGGCACTCTCTCACGCCAAGGTATTCCTCTCATGATGCCATAGAGATCTGCAAAAGGATACTCAAAGCCACACATGTAAAAAGGTCACCCATTTTGGGGAGAAGGGAAGGAAAGCATTGTTCTCAGCTTCCCGAACCCATTGAGACGATCAGTAAAGTAAAAACGGGCCAACTGGAGGATGAAGCCAATATAACTCTAAACTCTCAGCGTAATCAAGACGCATTCTGGTTAGCTTCTCCAGAGCAGTTGCCTTTCACCTCTACGAAGCCA Lampropeltis_triangulum_MX AATCATGGAAAGAGTCACCCCAATAAACATGTAAGACTAGCCCACCAGGAAATAGACTCCGATTCAGGAAGGGGAAGCTGTGAGAGTCCATCTCTACTGCAAGAGAAATATAAGGAAGCCAGAAAACTGCCCCCTACAGTAGAAGTACCAGATCCTGAGGAGGTTCAAAGGAACACTGATAGAAAAAATCTCTCAGAAACATTAAAACTAGAGCCTGAACGGCATCTCCCACGGTTGACCAGTAGTAACCCAAAATCATCGACATGGCCTGGAGACCAGCCAGGGCACTCTCTCACGCCAAGGTATTCCTCTCATGATGCCATAGAGATCTGCAAAAGGATACTCAAAGCCACACATGTAAAAAGGTCACCCATTTTGGGGAGAAGGGAAGGAAAGCATTGTTCTCAGCTTCCCGAACCCATTGAGACGATCAGTAAAGTAAAAATGGGCCAACTGGAGGATGAAGCCAATATAACTCTAAACTCTCAGCGTAATCAAGACACATTCTGGTTAGCTTCTCCAGAGCAGTTGCCTTTCACCTCTACGAAGCCA Lampropeltis_triangulum_SA AATCATGGAAAGAGTCACCCCAATAAACATGTAAGACTAGCCCACCAGGAAATAGACTCCGATTCAGGAAGGGGAAGCTGTGAGAGTCCATCTCTACTGCAAGAGAAATATAAGGAAGCCAGAAAACTGCCCCCTACAGTAGAAGTACCAGATCCTGAGGAGGTTCAAAGGAACACTGATAGAAAAAATCTCTCAGACACATTAAAACTAGAGCCTGAACGGCATCTCCCACGGTTGACCAGTAGTAACCCAAAATCATCGACATGGCCTGGAGACCAGCCAGGGCACTCTCTCACGCCAAGGTATTCCTCTCATGATGCCATAGAGATCTGCAAAAGGATACTCAAAGCCACACATGTAAAAAGGTCACCCATTTTGGGGAGAAGGGAAGGAAAGCATTGTTCTCAGCTTCCCGAACCCATTGAGACGATCAGTAAAGTAAAAATGGGCCAACTGGAGGATGAAGCCAATATAACTCTAAACTCTCAGCGTAATCAAGACACATTCTGGTTAGCTTCTCCAGAGCAGTTGCCTTTCACCTCTACGAAGCCA Lampropeltis_triangulum_Tamaulipas AATCATGGAAAGAGTCACCCCAATAAACATGTAAGACTAGCCCACCAAGAAATAGACTCCGATTCAGGAAGGGGAAGCTGTGAGAGTCCATCTCTACTGCAAGAGAAATATAAGGAAGCCAGAAAACTGCCCCCTACAGTAGAAGTACCAGATCCTGAGGAGGTTCAAAGGAACACTGATAGAAAAAATCTCTCAGAAACATTAAAACTAGAGCCTGAACGGCATCTCCCACGGTTGACCAGTAGTAACCCAAAATCATCGACATGGCCTGGAGACCAGCCAGGGCATTCTCACACGCCAAGGTATTCCTCTCATGATGCCATAGAGATCTGCAAAAGGATACTCAAAGCCACACATGTAAAAAGGTCACCCATTTTGGGGAGAAGGGAAGGAAAGCATTGTTCTCAGCTCCCCGAACCCATTGAGACGATCAGTAAAGTAAAAACGGGCCAACTGGAGGATGAAGCCAATATAACTCTAAACTCTCAGCGTAATCAAGACACATTCTGGTTAGCTTCTCCAGAGCAGTTGCCTTTCACCTCTACGAAGCCA Lampropeltis_triangulum_Western -----------------CCCCAATAAACATGTAAGACTAGCCCACCAGGAAATAGACTCCGATTCAGGAAGGGGAAGCTGTGAGAGTCCATCTCTACTGCAAGAGAAATATAAGGAAGCCAGAAAACTGCCCCCTACAGTAGAAGTACCAGATCCTGAGGAGGTTCAAAGGAACACTGATAGAAAAAATCTCTCAGAAACATTAAAACTAGAGCCTGAACGGCATCTCCCACAGTTGACCAGTAGTAACCCAAAATCATCGACATGGCCTGGAGACCAGCCAGGGCACTCTCTCACGCCAAGGTATTCCTCTCATGATGCCATAGAGATCTGCAAAAGGATACTCAAAGCCACACATGTAAAAAGGTCACCCATTTTGGGGAGAAGGGAAGGAAAGCATTGTTCTCAGCTTCCCGAACCCATTGAGACGATCAGTAAAGTAAAAACGGGCCAACTGGAGGATGAAGCCAATATAACTCTAAACTCTCAGCGTAATCAAGACGCATTCTGGTTAGCTTCTCCAGATCAGTTGCCTTTCACCTCTACGAAGCCA Lampropeltis_webbi AATCATGGAAAGAGTCACCCCAATAAACATGTAAGACTAGCCCACCAGGAAATAGACTCCGATTCAGGAAGGGGAAGCTGTGAGAGTCCATCTCTACTGCAAGAGAAATATAAGGAAGCCAGAAAACTGCCCCCTACAGTAGAAGTACCAGATCCTGAGGAGGTTCAAAGGAACACTGATAGAAAAAATCTCTCAGAAACATTAAAACTAGAGCCTGAACGGCATCTCCCACGGTTGACCAGTAGTAACCCAAAATCATCGACATGGCCTGGAGACCAGCCAGGGCACTCTCTCACGCCAAGGTATTCCTCTCATGATGCCATAGAGATCTGCAAAAGGATACTCAAAGCCACACATGTAAAAAGGTCACCCATTTTGGGGAGAAGGGAAGGAAAGCATTGTTCTCAGCTTCCCGAACCCATTGAGACGATCAGTAAAGTAAAAATGGGCCAACTGGAGGATGAAGCCAATATAACTCTAAACTCTCAGCGTAATCAAGACACATTCTGGTTAGCTTCTCCAGAGCAGTTGCCTTTCACCTCTACGAAGCCA Lampropeltis_zonata AATCATGGAAAGAGTCACCCCAATAAACATGTAAGACTAGCCCACCAGGAAATAGACTCCGATTCAGGAAGGGGAAGCTGTGAGAGTCCATCTCTACTGCAAGAGAAATATAAGGAAGCCAGAAAACTGCCCCCTACAGTAGAAGTACCAGATCCTGAGGAGGTTCAAAGGAACACTGATAGAAAAAATCTCTCAGAAACATTAAAACTAGAGCCTGAACGGCATCTCCCACGGTTGACCAGTAGTAACCCAAAATCATCGACATGGCCTGGAGACCAGCCAGGGCACTCTCTCACGCCAAGGTATTCCTCTCATGATGCCATAGAGATCTGCAAAAGGATACTCAAAGCCACACATGTAAAAAGGTCACCCATTTTGGGGAGAAGGGAAGGAAAGCATTGTTCTCAGCTTCCCGAACCCATTGAGACGATCAGTAAAGTAAAAAGGGGCCAACTGGAGGATGAAGCCAATATAACTCTAAACTCTCAGCGTAATCAAGACACATTCTGGTTAGCT------------------------------------ ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M20120] TITLE 1_nt3; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep12824; DIMENSIONS NCHAR=481; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Arizona_elegans ATAAAAATATTGTTTGACCGGAGATGGGCCCATTCGGATTTCACCCAGGACAGTCACCTGGTGTCCTCGGATGTCCACAGCGGATGTTTTGTCCGTGACCCATCGGCTCTCGCTGTCGCACACGGAATATTCCCCGCGGTGGGTTTTCCCTTCGGTATACCGCTTCCGGCGAGATGTTCGGTTCAGCACCATGGGCTCCTCCATCAGATACAAGGGAGGGGGTTCCAGGGGGGTATTTTCACTCAGGAGGACCCGGGGAGAACTGAACCGTCTCTGCTGCCTCAGTAATTCAGCATCCAACGAAACGACAGGCTGGAAACCCAATCTAATATCTTGGCTGGTAGTCAACTCTGGTTCCACCTCGGTTTTCTCCACGGTGGTTGGCACGCCGTCCTTAGTTCTGGCCGTCTGTTTGGGGATCTTGTTTTTCCAAATGCCAGCTTGAATCAGTGTTTTAAGGAAAGAATTCATGGAATCTTCT Cemophora_coccinea ATAAAAATATTGTTTGACCGGAGATGGGCCCATTCGGATTTCACCCAGGACAGTCACCTGGTGTCCTCGGATGTCCACAGCGGATGTTTTGTCCGTGACCCATCGGCTCTCGCTGTCGCACACGGAATATTCCCCGCGGTGGATTTTCCCTTCGGTATACCTCTTCCGGCGAGACGTTCGGTTCAGCACCATGGGCTCCTCCATCAGATACAAGGGAGGGGGTTCCAGGGGGGTATTTTCACTCAGGAGGACCCGGGGAGAACTGAACCGTCTCTGCTGCCTCAGTAATTCAGCATCCAACGAAACGACGGGCTGGAAACCCAATCTAATATCTTGGCTGGTGGTCAACTCTGGTTCCACCTCGCTTTTCTTCACGGTGGTTGGCACGCCGTCCTTAGTTCTGGCCGTCTGTTTGGGGATCTTGTTTTTCCAAATGCCAGCTTGAATCAGTGTTTTAAGGAAAGAATTCATGGAATCTTCT Lampropeltis_alterna ATAAAAATATTGTTTGACCGGAGATGGGCCCATTCGGATTTCACCCAGGACAGTCACCTGGTGTCCTCGGATGTCCACAGCGGATGTTTTGTCCGTGACCCATCGGCTCTCGCTGTCGCACACGGAATATTCCCCGCGATGGGTTTTCCCTTCGGTATACCTCTTCCGGCGAGACGTTCGGTTCAGCACCATGGGCTCCTCCATCAGATACAAGGGAGGGGGTTCCAGGGGGGTATTTTCACTCAGGAGGACCCGGGGAGAACTGAACCGTCTCTGCTGCCTCAGTAATTCAGCATCCAACGAAACGACGGGCTGGAAACCCAATCTAATATCTTGGCTGGTGGTCAACTCTGGTTCCACCTCGCTTTTCTTCACTGTGGTTGGCACGCCGTCCTTAGTTCTGGCCGTCTGTTTGGGGATCTTGTTTTTCCAAATGCCAGCTTGAATCAGTGTTTTAAGGAAAGAATTCATGGAATCTTCT Lampropeltis_californiae ATAAAAATATTGTTTGACCGGAGATGGGCCCATTCGGATTTCACCCAGGACAGTCACCTGGTGTCCTCGGATGTCCACAGCGGATGTTTTGTCCGTGACCCATCGGCTCTCGCTGTCGCACACGGAATATTCCCCGCGGTGGGTTTTCCCTTCGGTATACCTCTTCCGGCGAGACGTTCGGTTCAGCACCATGGGCTCCTCCATCAGATACAAGGGAGGGGGTTCCAGGGGGGTATTTTCACTCAGGAGGACCCGGGGAGAACTGAACCGTCTGTGCTGCCTCAGTAATTCAGCATCCAACGAAACGACGGGCTGGAAACCCAATCTAATATCTTGGCTGGTGGTCAACTCTGGTTCCACCTCGCTTTTCTTCACTGTGGTTGGCACGCCGTCCTTAGTTCTGGCCGTCTGTTTGGGGATCTTGTTTTTCCAAATGCCAGCTTGAATCAGTGTTTTAAGGAAAGAATTCATGGAATCTTCT Lampropeltis_calligaster ATAAAAATATTGTTTGACCGGAGATGGGCCCATTCGGATTTCACCCAGGACAGTCACCTGGTGTCCTCGGACGTCCACAGCGGATGTTTTGTCCGTGACCCATCGGCTCTCGCTGTCGCACACGGAATATTCCCCGCGGTGGGTTTTCCCTTCGGTATACCTCTTCCGGCGAGACGTTCGGTTCAGCACCATGGGCTCCTCCATCAGATACAAGGGAGGGGGTTCCAGGGGGGTATTTTCACTCAGGAGGACCCGGGGAGAACTGAACCGTCTCTGCTGCCTCAGTAATTCAGCATCCAACGAAACGACGGGCTGGAAACCCAATCTAATATCTTGGCTGGTGGTCAACTCTGGTTCCACCTCGCTTTTCTTCACTGTGGTTGGCACGCCGTCCTTAGTTCTGGCCGTCTGTTTGGGGATCTTGTTTTTCCAAATGCCAGCTTGAATCAGTGTTTTAAGGAAAGAATTCATGGAATCTTCT Lampropeltis_elapsoides ATAAAAATATTGTTTGACCGGAGATGGGCCCATTCGGATTTCACCCAGGACAGTCACCTGGTGTCCTCGGATGTCCACAGCGGATGTTTTGTCCGTGACCCATCGGCTCTCGCTGTCGCACACGGAATATTCCCCGCGATGGGTTTTCCCTTCGGTATACCTCTTCCGGCGAGACGTTCGGTTCAGCACCATGGGCTCCTCCATCAGATACAAGGGAGGGGGTTCCAGGGGGGTATTTTCACTCAGGAGGACCCGGGGAGAACTGAACCGTCTCTGCTGCCTCAGTAATTCAGCATCCAACGAAACGACGGGCTGGAAACCCAATCTAATATCTTGGCTGGTGGTCAACTCTGGTTCCACCTCGCTTTTCTTCACGGTGGTTGGCACGCCGTCCTTAGTTCTGGCCGTCTGTTTGGGGATCTTGTTTTTCCAAATGCCAGCTTGAATCAGTGTTTTAAGGAAAGAATTCATGGAATCTTCT Lampropeltis_extenuata ATAAAAATATTGTTTGACCGGAGATGGGCCCATTCGGATTTCACCCAGGACAGTCACCTGGTGTCCTCGGATGTCCACAGCGGATGTTTTGTCCGTGACCCATCGGCTCTCGCTGTCGCACACGGAATATTCCCCGCGGTGGGTTTTCCCTTCGGTATACCTCTTCCGGCGAGACGTTCGGTTCAGCACCATGGGCTCCTCCATCAGATACAAGGGAGGGGGTTCCAGGGGGGTATTTTCACTCAGGAGGACCCGGGGAGAGCTGAACCGTCTCTGCTGCCTCAGTAATTCAGCATCCAACGAAACGACGGGCTGGAAACCCAATCTAATATCTTGGCTGGTGGTCAACTCTGGTTCCACCTCGCTTTTCTTCACTGTGGTTGGCACGCCGTCCTTAGTTCTGGCCGTCTGTTTGGGGATCTTGTTTTTCCAAATGCCAGCTTGAATCAGTGTTTTAAGGAAAGAATTCATGGAATCTTCT Lampropeltis_getula ATAAAAATATTGTTTGACCGGAGATGGGCCCATTCGGATTTCACCCAGGACAGTCACCTGGTGTCCTCGGATGTCCACAGCGGATGTTTTGTCCGTGACCCATCGGCTCTCGCTGTCGCACACGGAATATTCCCCGCGGTGGGTTTTCCCTTCGGTATACCTCTTCCGGCGAGACGTTCGGTTCAGCACCATGGGCTCCTCCATCAGATACAAGGGAGGGGGTTCCAGGGGGGTATTTTCACTCAGGAGGACCCGGGGAGAACTGAACCGTCTCTGCTGCCTCAGTAATTCAGCATCCAACGAAACGACGGGCTGGAAACCCAATCTAATATCTTGGCTGGTGGTCAACTCTGGTTCCACCGCGCTTTTCTTCACTGTGGTTGGCACGCCGTCCTTAGTTCTGGCCGTCTGTTTGGGGATCTTGTTTTTCCAAATGCCAGCTTGAATCAGTGTTTTAAGGAAAGAATTCATGGAATCTTCT Lampropeltis_holbrooki ATAAAAATATTGTTTGACCGGAGATGGGCCCATTCGGATTTCACCCAGGACAGTCACCTGGTGTCCTCGGATGTCCACAGCGGATGTTTTGTCCGTGACCCATCGGCTCTCGCTGTCGCACACGGAATATTCCCCGCGGTGGGTTTTCCCTTCGGTATACCTCTTCCGGCGAGACGTTCGGTTCAGCACCATGGGCTCCTCCATCAGATACAAGGGAGGGGGTTCCAGGGGGGTATTTTCACTCAGGAGGACCCGGGGAGAACTGAACCGTCTGTGCTGCCTCAGTAATTCAGCATCCAACGAAACGACGGGCTGGAAACCCAATCTAATATCTTGGCTGGTGGTCAACTCTGGTTCCACC{GT}CGCTTTTCTTCACTGTGGTTGGCACGCCATCCTTAGTTCTGGCCGTCTGTTTGGGGATCTTGTTTTTCCAAATGCCAGCTTGAATCAGTGTTTTAAGGAAAG----------------- Lampropeltis_knoblochi ATAAAAATATTGTTTGACCGGAGATGGGCCCATTCGGATTTCACCCAGGACAGTCACCTGGTGTCCTCGGACGTCCACAGCGGATGTTTTGTCCGTGACCCATCGGCTCTCGCTGTCGCACACGGAATATTCCCCGCGATGGGTTTTCCCTTCGGTATACCTCTTCCGGCGAGACGTTCGGTTCAGCACCATGGGCTCCTCCATCAGATACAAGGGAGGGGGTTCCAGGGGGGTATTTTCACTCAGGAGGACCCGGGGAGAACTGAACCGTCTCTGCTGCCTCAGTAATTCAGCATCCAACGAAACGACGGGCTGGAAACCCAATCTAATATCTTGGCTGGTGGTCAACTCTGGTTCCACCTCGCTTTTCTTCACTGTGGTTGGCACGCCGTCCTTAGTTCTGGCCGTCTGTTTGGGGATCTTGTTTTTCCAAATGCCAGCTTGAATCAGTGTTTTAAGGAAAGAATTCATGGAATCTTCT Lampropeltis_mexicana ATAAAAATATTGTTTGACCGGAGATGGGCCCATTCGGATTTCACCCAGGACAGTCACCTGGTGTCCTCGGATGTCCACAGCGGATGTTTTGTCCGTGACCCATCGGCTCTCGCTGTCGCACACGGAATATTCCCCGCGATGGGTTTTCCCTTCGGTATACCTCTTCCGGCGAGACGTTCGGTTCAGCACCATGGGCTCCTCCATCAGATACAAGGGAGGGGGTTCCAGGGGGGTATTTTCACTCAGGAGGACCCGGGGAGAACTGAACCGTCTCTGCTGCCTCAGTAATTCAGCATCCAACGAAACGACGGGCTGGAAACCCAATCTAATATCTTGGCTGGTGGTCAACTCTGGTTCCACCTCGCTTTTCTTCACGGTGGTTGGCACGCCGTCCTTAGTTCTGGCCGTCTGTTTGGGGATCTTGTTTTTCCAAATGCCAGCTTGAATCAGCGTTTTAAGGAAAGAATTCATGGAATCTTCT Lampropeltis_nigra ATAAAAATATTGTTTGACCGGAGATGGGCCCATTCGGATTTCACCCAGGACAGTCACCTGGTGTCCTCGGATGTCCACAGCGGATGTTTTGTCCGTGACCCATCGGCTCTCGCTGTCGCACACGGAATATTCCCCGCGGTGGGTTTTCCCTTCGGTATACCTCTTCCGGCGAGACGTTCGGTTCAGCACCATGGGCTCCTCCATCAGATACAAGGGAGGGGGTTCCAGGGGGGTATTTTCACTCAGGAGGACCCGGGGAGAACTGAACCGTCTCTGCTGCCTCAGTAATTCAGCATCCAACGAAACGACGGGCTGGAAACCCAATCTAATATCTTGGCTGGTGGTCAACTCTGGTTCCACCGCGCTTTTCTTCACTGTGGTTGGCACGCCGTCCTTAGTTCTGGCCGTCTGTTTGGGGATCTTGTTTTTCCAAATGCCAGCTTGAATCAGTGTTTTAAGGAAAGAATTCATGGAATCTTCT Lampropeltis_pyromelana ATAAAAATATTGTTTGACCGGAGATGGGCCCATTCGGATTTCACCCAGGACAGTCACCTGGTGTCCTCGGACGTCCACAGCGGATGTTTTGTCCGTGACCCATCGGCTCTCGCTGTCGCACACGGAATATTCCCCGCGATGGGTTTTCCCTTCGGTATACCTCTTCCGGCGAGACGTTCGGTTCAGCACCATGGGCTCCTCCATCAGATACAAGGGAGGGGGTTCCAGGGGGGTATTTTCACTCAGGAGGACCCGGGGAGAACTGAACCGTCTCTGCTGCCTCAGTAATTCAGCATCCAACGAAACGACGGGCTGGAAACCCAATCTAATATCTTGGCTGGTGGTCAACTCTGGTTCCACCTCGCTTTTCTTCACTGTGGTTGGCACGCCGTCCTTAGTTCTGGCCGTCTGTTTGGGGATCTTGTTTTTCCAAATGCCAGCTTGAATCAGTGTTTTAAGGAAAGAATTCATGGAATCTTCT Lampropeltis_ruthveni ATAAAAATATTGTTTGACCGGAGATGGGCCCATTCGGATTTCACCCAGGACAGTCACCTGGTGTCCTCGGATGTCCACAGCGGATGTTTTGTCCGTGACCCATCGGCTCTCGCTGTCGCACACGGAATATTCCCCGCGGTGGGTTTTACCTTCGGTATACCTCTTCCGGCGAGACGTTCGGTTCAGCACCATGGGCTCCTCCATCAGATACAAGGGAGGGGGTTCCAGGGGGGTATTTTCACTCAGGAGGACCCGGGGAGAACTGAACCGTCTCTGCTGCCTCAGTAATTCAGCATCCAACGAAACGACGGGCTGGAAACCCAATCTAATATCTTGGCTGGTGGTCAACTCTGGTTCCACCTCGGTTTTCTTCACTGTGGTTGGCACGCCGTCCTTAGTTCTGGCCGTCTGTTTGGGGATCTTGTTTTTCCAAATGCCAGCTTGAATCAGTGTTTTAAGGAAAG----------------- Lampropeltis_splendida ATAAAAATATTGTTTGACCGGAGATGGGCCCATTCGGATTTCACCCAGGACAGTCACCTGGTGTCCTCGGATGTCCACAGCGGATGTTTTGTCCGTGACCCATCGGCTCTCGCTGTCGCACACGGAATATTCCCCGCGGTGGGTTTTCCCTTCGGTATACCTCTTCCGGCGAGACGTTCGGTTCAGCACCATGGGCTCCTCCATCAGATACAAGGGAGGGGGTTCCAGGGGGGTATTTTCACTCAGGAGGACCCGGGGAGAACTGAACCGTCTGTGCTGCCTCAGTAATTCAGCATCCAACGAAACGACGGGCTGGAAACCCAATCTAATATCTTGGCTGGTGGTCAACTCTGGTTCTACCTCGCTTTTCTTCACTGTGGTTGGCACGCCATCCTTAGTTCTGGCCGTCTGTTTGGGGATCTTGTTTTTCCAAATGCCAGCTTGAATCAGTGTTTTAAGGAAAGAATTCATGGAATCTTCT Lampropeltis_triangulum_CA ATAAAAATATTGTTTGACCGGAGATGGGCCCATTCGGATTTCACCCAGGACAGTCACCTGGTGTCCTCGGATGTCCACAGCGGATGTTTTGTCCGTGACCCATCGGCTCTCGCTGTCGCACACGGAATATTCCCCGCGGTGGGTTTTGCCTTCGGTATACCTCTTCTGGCGAGATGTTCGGTTCAGCACCATGGGCTCCTCCATCAGATACAAGGGAGGGGGGTCCAGGGGGGTATTTTCACTCAGGAGGACCCGGGGAGAACTGAACCGTCTCTGCTGCCTCAGTAATTCAGCATCCAACGAAACGACAGGCTGGAAACCCAATCTAATATCTTGGCTGGTAGTCAACTCTAGTTCCACCTCGCTTTTCTTCACTGTGGTTGGCACGCCGTCCTTATTTCTGGCCGTCTGTTTGGGGATCTTGTTTTTCCAAATGCCAGCTTGAATCAGTGTTTTAAGGAAAGAATTCATGGAATCTTCT Lampropeltis_triangulum_Eastern ATAAAAATATTGTTTGACCGGAGATGGGCCCATTCGGATTTCACCCAGGACAGTCACCTGGTGTCCTCGGATGTCCACAGCGGATGTTTTGTCCGTGACCCATCGGCTCTCGCTGTCGCACACGGAATATTCCCCGCGATGGGTTTTCCCTTCGGTATACCTCTTCCGGCGAGACGTTCGGTTCAGCACCATGGGCTCCTCCATCAGATACAAGGGAGGGGGTTCCAGGGGGGTATTTTCACTCAGGAGGACCCGGGGAGAACTGAACCGTCTCTGCTGCCTCAGTAATTCAGCATCCAACGAAACGACGGGCTGGAAACCCAATCGAATATCTTGGCTGGTGGTCAACTCTGGTTCCACCTCGCTTTTCTTCACTGTGGTTGGCACGCCGTCCTTAGTTCTGGCCGTCTGTTTGGGGATCTTGTTTTTCCAAATGCCAGCTTGAATCAGCGTTTTAAGGAAAGAATTCATGGAATCTTCT Lampropeltis_triangulum_MX ATAAAAATATTGTTTGACCGGAGATGGGCCCATTCGGATTTCACCCAGGACAGTCACCTGGTGTCCTCGGACGTCCACAGCGGATGTTTTGTCCGTGACCCATCGGCTCTCGCTGTCGCACACGGAATATTCCCCGCGGTGGGTTTTCCCTTCGGTATACCTCTTCTGGCGAGATGTTCGGTTCAGCACCATGGGCTCCTCCATCAGATACAAGGGAGGGGGGTCCAGGGGGGTATTTTCACTCAGGAGGACCCGGGGAGAACTGAACCGTCTCTGCTGCCTCAGTAATTCAGCATCCAACGAAACGACAGGCTGGAAACCCAATCTAATATCTTGGCTGGTAGTCAACTCTAGTTCCACCTCGCTTTTCTTCACTGTGGTTGGCACGCCGTCCTTAGTTCTGGCCGTCTGTTTGGGGATCTTGTTTTTCCAAATGCCAGCTTGAATCAGTGTTTTAAGGAAAGAATTCATGGAATCTTCT Lampropeltis_triangulum_SA ATAAAAATATTGTTTGACCGGAGATGGGCCCATTCGGATTTCACCCAGGACAGTCACCTGGTGTCCTCGGATGTCCACAGCGGATGTTTTGTCCGTGACCCATCGGCTCTCGCTGTCGCACACGGAATATTCCCCGCGGTGGGTTTTCCCTTCGGTATACCTCTTCTGGCGAGATGTTCGGTTCAGCACCATGGGCTCCTCCATCAGATACAAGGGAGGGGGGTCCAGGGGGGTATTTTCACTCAGGAGGACCCGGGGAGAACTGAACCGTCTCTGCTGCCTCAGTAATTCAGCATCCAACGAAACGACAGGCTGGAAACCCAATCTAATATCTTGGCTGGTAGTCAACTCTAGTTCCACCTCGCTTTTCTTCACTGTGGTTGGCACGCCATCCTTAGTTCTGGCCGTCTGTTTGGGGATCTTGTTTTTCCAAATGCCAGCTTGAATCAGTGTTTTAAGGAAAGAATTCATGGAATCTTCT Lampropeltis_triangulum_Tamaulipas ATAAAAATATTGTTTGACCGGAGATGGGCCCATTCGGATTTCACCCAGGACAGTCACCTGGTGTCCTCGGACGTCCACAGCGGATGTTTTGTCCGCGACCCATCGGCTCTCGCTGTCGCACACGGAATATTCCCCGCGATGGGTTTTCCCTTCGGTATACCTCTTCCGGCGAGACGTTCGGTTCAGCACCATGGGCTCCTCCATCAGATACAAGGGAGGGGGTTCCAGGGGGGTATTTTCACTCAGGAGGACCCGGGGAGAACTGAACCGTCTCTGCTGCCTCAGTAATTCAGCATCCAACGAAACGACGGGCTGGAAACCCAATCTAATATCTTGGCTGGTGGTCAACTCTGGTTCCACCTCGCTTTTCTTCACGGTGGTTGGCACGCCGTCCTTAGTTCTGGCCGTCTGTTTGGGGATCTTGTTTTTCCAAATGCCAGCTTGAATCAGTGTTTTAAGGAAAGAATTCATGGAATCTTCT Lampropeltis_triangulum_Western ATAAAAATATTGTTTGACCGGAGATGGGCCCATTCGGATTTCACCCAGGACAGTCACCTGGTGTCCTCGGATGTCCACAGCGGATGTTTTGTCCGTGACCCATCGGCTCTCGCTGTCGCACACGGAATATTCCCCGCGATGGGTTTTCCCTTCGGTATACCTCTTCCGGCGAGACGTTCGGTTCAGCACCATGGGCTCCTCCATCAGATACAAGGGAGGGGGTTCCAGGGGGGTATTTTCACTCAGGAGGACCCGGGGAGAACTGAACCGTCTCTGCTGCCTCAGTAATTCAGCATCCAACGAAACGACGGGCTGGAAACCCAATCTAATATCTTGGCTGGTGGTCAACTCTGGTTCCACCTCGCTTTTCTTCACTGTGGTTGGCACGCCGTCCTTAGTTCTGGCCGTCTGTTTGGGGATCTTGTTTTTCCAAATGCCAGCTTGAATCAGTGTTTTAAGGAAAGAATTCATGGAATCTTCT Lampropeltis_webbi ---AAAATATTGTTTGACCGGAGATGGGCCCATTCGGATTTCACCCAGGACAGTCACCTGGTGTCCTCGGACGTCCACAGCGGATGTTTTGTCCGTGACCCATCGGCTCTCGCTGTCGCACACGGAATATTCCCCGCGATGGGTTTTCCCTTCGGTATACCTCTTCCGGCGAGACGTCCGGTTCAGCACCATGGGCTCCTCCATCAGATACAAGGGAGGGGGTTCCAGGGGGGTATTTTCACTCAGGAGGACCCGGGGAGAACTGAACCGTCTCTGCTGCCTCAGTAATTCAGCATCCAACGAAACGACGGGCTGGAAACCCAATCTAATATCTTGGCTGGTGGTCAACTCTGGTTCCACCTCGCTTTTCTTCACTGTGGTTGGCACGCCGTCCTTAGTTCTGGCCGTCTGTTTGGGGATCTTGTTTTTCCAAATGCCAGCTTGAATCAGTGTTTTAAGGAAAGAATTCATGGAATCTTCT Lampropeltis_zonata ATAAAAATATTGTTTGACCGGAGATGGGCCCATTCGGATTTCACCCAGGACAGTCACCTGGTGTCCTCGGATGTCCACAGCGGATGTTTTGTCCGTGACCCATCGGCTCTCGCTGTCGCACACGGAATATTCCCCGCGGTGGGTTTTCCCTTCGGTATACCTCTTCCGGCGAGACGTTCGGTTCAGCACCATGGGCTCCTCCATCAGATACAAGGGAGGGGGTTCCAGGGGGGTATTTTCACTCAGGAGGACCCGGGGAGAACTGAACCGTCTCTGCTGCCTCAGTAATTCAGCATCCAACGAAACGACGGGCTGGAAACCCAATCTAATATCTTGGCTGGTGGTCAACTCTGCTTCCACCTCGCTTTTCTTCACTGTGGTTGGCACGCCGTCCTTAGTTCTGGCCGTCTGTTTGGGGATCTTGTTTTTCCAAATGCCAGCTTGAATCAGTGTTTTAAGGAAAGAATTCATGGAATCTTCT ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M20125] TITLE 1_2cl8; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep12824; DIMENSIONS NCHAR=466; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Arizona_elegans GGGTTGCCCCCGGTTCGCACCGGTATTATAGAACTGGTAGTAAAACCGGTGGGAGGCTCCACCCACCAACCCCGATGTCATCAAAATGCTTCTGCGCATGCTCAGAAGCTTCTGCACATGCATGCGGGCCCGTTGAGAACTGGTAATAAAGGTAAGTAGAAACAACCCCTGATCGAGCCCCCTTTGTACATTCTGGCCACTAGCAGTGTCTCCTTGGGGTTGCATGCAGAAGCTTTCCCCCATCAACTGCCCTTAACCTTTTTGTCCAGGTGTGTGCAGGGTTTGATCCAGGGGTGA------------------------------GTAGGTAGTGATGGCGGCGGGCAGTTCGGAGAACCGGTAGCAAAAATCCCTGCCCCCGCCCTCCATGCCCAGCTAAACCTCGCGATCATCAGAGCCTTTTTTT--CCTTTTAAATGGCTCTGACCAGCCAAGCTCTGAC Cemophora_coccinea --------------------------------------------------GGGAGGCTCCACCCACCAACCCCTATGTCATCAAAATGCTTCTGCGCATGCTCAGAAGCTTCTGCACATGCACGTGGCCCCGTTGAGAACTGGTAGTAAAGGTAAGTAGAAACAACCCCTGATCGAGCCCCCTTTGTACATTCTGGCCACTAGCAGTGTCTCCTTGGGGTTGCATGCAGAAGCTTTCCCCCATCAACTGCCCTTAATCTTTTTGTCCAGGTGTGTGCAGGGTTTGATCCAGGGGTGAAATGCTCCCGGTTCGGACTGGCTCGGGCGAGTAGGTAGTGATGGTGGCGGGTAGTTCGGAGAACGGGTAGCAAAAATCCCTGCCCCCGCCCCCCATGCCCAGCTGAACCTCGTGATCATC------------------------------------------------- Lampropeltis_alterna ------CCCCCGGTTCGCACCGGTATTATAGAACTGGTAGTAAAACTGGCGGGAGGCTCCACCCACCAAACCCGATGTCATCAAAATGCTTCTGCGCATGCTCAGAAGCTTCTGCACATGCACGCGGCCCCGTTGAGAACTGGTA-TTAAGATAAGTAGAAACAACCCCTGATCGAGCCCCCTTTGTACATTCTGGCCACTAGCAGTGTCTCCTTGGGGTTGCATGCAGAAGCTTTCCCCCATTATCTGCCCTTAACCTTTTTGTCCAGGTGTGTGCAGGGTTTGATCCAGGGGTGAAATGCTCCCGGTTCGGACTGGCTCGGGAGAGTAGGTAGTGATGGCGGCGGGCAGTTTGGAGAACCGGTAGCAAAAATCCCTGCCCCCGCCCCCCATGCCCAGCTGAACCTCGCGATCATCAGAGCCTTTTTTT--CCTTTTAAATGGCTCTGACCAGCCAAGCTCTGAC Lampropeltis_californiae --------------------------AATAGAACTGGTAGTAAAACCGGCGGGAGGCTCCACCCACCAACCCCTATGTCATCAAAATGCTTCTGCGCATGCTCAGAAGCTTCTGCACATGCACGCGGCCCCGTTGAGAACTGGTAGTAAAGGTAAGTAGAAACAACCCCTGATCGAGCCCCCTTTGTACATTCTGGCCACTAGCAGTGTCTCCTTGGGGTTGCATGCAGAAGCTTTCCCGCATCAACTGCCCTTAACCTTTTTGTCCAGGTGTGTGCAGGGTTTGATCCAGGGATGAAATGCTCCCGGTTTGGACTGGCTCGGGTGAGTAGGTAGCGATGGTGGCGGGCAGTTCGGAGAACCGGTAGCAAAAATCCCTGCCCCTGCCCCCCATGCCCAGCTGAACCTCGCGATCATCAGAGCCTTTTTTT--CCTTTTAAATGGCTCTGACCAGCCAAGCTCTGAC Lampropeltis_calligaster ------------GTTCGCACCGGTATTATAGAACTGGTAGTAAAACCGGCGGGAGGCTCCACCCACCAACCCCTATGTCATCAAAATGCTTCTGCGCATGCTCAGAAGCTTCTGCACATGCACGCGGCCCCGTTGAGAACTGGTAGTAAAGGTAAGTAGAAACAACCCCTGATCGAGCCCCCTTTGTACATTCTGGCCACTAGCAGTGTCTCCTTGGGGTTGCATGCAGAAGCTTTCCCCCATCAACTGCCCTTAACCTTTTTGTCCAGGTGTGTGCAGGGTTTGATCCAGGGGTGAAATGCTCCCGGTTCGGACTGGCTCAGGCGAGTAGGTAGTGATGGCGGCGGGCAGTTCGGAGAA-----------AATCCCTGCCCCCGCCCCCCATGCCCAGCTGAACCTCGCGATCATCAGAGCCTTTTTTT--CCATTTAAATGGCTCTGACCAGCCAAGCTCTGAC Lampropeltis_elapsoides GGGTTGCCCCCGGTTCGCACCGGTATTATAGAACTGGTAGTAAAACCGGCGGGAGGCTCCACCCACCAACCCCTATGTCATCAAAATGCTTCTGCGCATGCTCAGAAGCTTCTGCACATGCACACGGCCCCGTTGAGAACTGGTAGTAAAGGTAAGTAGAAACAACCCCTGATCGAGCCCCCTTTGTACATTCTGGCCACTAGCAGTGTCTCCTTGGGGTTGCATGCAGAAGCTTTCCCCCATCAACTGCCCTTAACCTTTTTGTCCAGGTGTGTGCAGGGTTTGATCCAGGGGTGAAATGCTCCCGGTTCGGACTGGCTCGGGCGAGTAGGTAGTGATGGCGGCGGGCAGTTCGGAGAACCGGTAGCAAAAATCCCTGCCCCTGCCCCCCATGCCCAGCTGAACCTCGCAATCATCAGAGCCTTTTTTTTTCCTTTTAAATGGCTCTGACCAGCCAAGCTCTGAC Lampropeltis_extenuata -----GCCCCCGGTTCACACCGGTATTATAGAACTGGTAGTAAAACCGGCGGGAGGCTCCACCCACCAACCCCGATGTCATCAAAATGCTTCTGCGCATGCTCAGAAGCTTCTGCACATGCACGCGGCCCCGTTGAGAACTGGTAGTAAAGGTAAGTAGAAACAACCCCTGATCGAGCCCCCTTTGTACATTCTGGCCACTAGCAGTGTCTCCTTGGGGTTGCATGCAGAAGCTTTCCCGCATCAACTGCCCTTAACCTTTTTGTCCAGGTGTGTGCAGGGTTTGATCCAGGGATGAAATGCTCCCGGTTTGGACTGGCTCGGGTGAGTAGGTAGCGATGGTGGCGGGCAGTTCAGAGAACCGGTAGCAAAAATCCCTGCCCCTGCCCCCCATGCCCAGCTGAACCTCGCGATCATCAGAGCCTTTTTTT--CCATTTAAATGGC--------------------- Lampropeltis_getula ------------------------------------------AAACCGGCGGGAGGCTCCACCCACCAACCCCTATGTCATCAAAATGCTTCTGCGCATGCTCAGAAGCTTCTGCACATGCACGTGGCCCCGTTGAGAACTGGTAGTAAAGGTAAGTAGAAACAACCCCTGATCGAGACCCCTTTGTACATTCTGGCCACTAGCAGTGTCTCCTTGGGGTTGCATGCAGAAGCTTTCCCCCATCAACTGCCCTTAACCTTTTTGTCCAGGTGTGTGCAGGGTTTGATCCAGGGGTGAAATGCTCCCGGTTCGGACTGGCTCGGGCGAGTAGGTAGTGATGGCGGTGGGCAGTTCGGAGAACCGGTAGCAAAAATCCCTGCCCCCGCCCCCCATGCCCAGCTGAACCTCGCGATCATCAGAGCCTTTTTT--CCCGTTTAAATGGCTCTGACCAGCCAAGCTCTGAC Lampropeltis_holbrooki -----------------------------------GGTAGTAAAACCAGCGGGAGGCTCCACCCACCAACCCCTATGTCATCAAAATGCTTCTGCGCATGCTCAGAAGCTTCTGCACATGCACGCGGCCCCGTTGAGAACTGGTAGTAAAGGTAAGTAGAAACAACCCCTGATCGAGACCCCTTTGTACATTCTGGCCACTAGCAGTGTCTCCTTGGGGTTGCATGCAGAAGCTTTCCCCCATCAACTGCCCTTAACCTTTTTGTCCAGGTGTGTGCAGGGTTTGATCCAGGGGTGAAATGCTCCCGGTTCGGACTGGCTCGGGCGAGTAGGTAGTGATGGCGGTGGGCAGTTCGGAGAACCGGTAGCAAAAATCCCTGCCCCCGCCCCCCATGCCCAGCTGAACCTCGCGATCATCAGAGCCTTTTTT--CCCGTTTAAATGGCTCTGACCAGCCAAGCTCTGAC Lampropeltis_knoblochi GGGTTGCCCCCGGTTCGCACCGGTATTATAGAACTGGTAGTAAAACTGGCGGGAGGCTCCACCCACCAAACCCGATGTCATCAAAATGCTTCTGCGCATGCTCAGAAGCTTCTGCACATGCACGCGGCCCCGTTGAGAACTGGTA-TTAAGATAAGTAGAAACAACCCCTGATCGAGCCCCCTTTGTACATTCTGGCCACTAGCAGTGTCTCCTTGGGGTTGCATGCAGAAGCTTTCCCCCATCATCTGCCCTTAACCTTTTTGTCCAGGTGTGTGCAGGGTTTGATCCAGGGGTGAAATGCTCCCGGTTCGGACTGGCTCGGGAGAGTAGGTAGTGATGGCGGCGGGCAGTTTGGAGAACCGGTAGCAAAAATCCCTGCCCCCGCCCCCCATGCCCAGCTGAACCTCGCGATCATCA{AG}AGCCTTTTTTT--CCTTTTAAATGGCTCTGACCAGCCAAGCTCTGAC Lampropeltis_mexicana GGGTTGCCCCCGGTTCGCACCGGTATTATAGAACTGGTAGTAAAACTGGCGGGAGGCTCCACCCACCAAACCCGATGTCATCAAAATGCTTCTGCGCATGCTCAGAAGCTTCTGCACATGCACGCGGCCCCGTTGAGAACTGGTA-TTAAGATAAGTAGAAACAACCCCTGATCGAGCCCCCTTTGTACATTCTGGCCACTAGCAGTGTCTCCTTGGGGTTGCATGCAGAAGCTTTCCCCCATTA----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Lampropeltis_nigra --------------------------AATAGAACTGGTAGTAAAACCGGCGGGAGGCTCCACCCACCAACCCCTATGTCATCAAAATGCTTCTGCGCATGCTCAGAAGCTTCTGCACATGCACGCGGCCCCGTTGAGAACTGGTAGTAAAGGTAAGTAGAAACAACCCCTGATCGAGCCCCCTTTGTACATTCTGGCCACTAGCAGTGTCTCCTTGGGGTTGCATGCAGAAGCTTTCCCCCATCAACTGCCCTTAACCTTTTTGTCCAGGTGTGTGCAGGGTTTGATCCAGGGATGAAATGCTCCCGGTTCGGACTGGCTCGGGTGAGTAGGTAGCGATGGTGGCGGGCAGTTCGGAGAACCGGTAGCAAAAATCCCTGCCCCCGCCCCCCATGCCCAGCTGAACCTCGCGATCATCAGAGCCTTTTTT--CCCATTTAAATGGCTCTGACCAGCCAAGCTCTGAC Lampropeltis_pyromelana GGGTTGCCCCCGGTTCGCACCGGTATTATAGAACTGGTAGTAAAACTGGCGGGAGGCTCCACCCACCAAACCCGATGTCATCAAAATGCTTCTGCGCATGCTCAGAAGCTTCTGCACATGCACGCGGCCCCGTTGAGAACTGGTA-TTAAGATAAGTAGAAACAACCCCTGATCGAGCCCCCTTTGTACATTCTGGCCACTAGCAGTGTCTCCTTGGGGTTGCATGCAGAAGCTTTCCCCCATCAACTGCCCTTAACCTTTTTGTCCAGGTGTGTGCAGGGTTTGATCCAGGGGTGAAATGCTCCCGGTTCGGACCGGCTCGGTAGAGTAGGTAGTGATGGCGGCGGGCAGTTTGGAGAACCGGTAGCAAAAATCCCTGCCCCCGCCCCCCATGCCCAGCTGAACCTCGCGATCATCAGAGCCTTTTTTT--CCTTTTAAATGGCTCTGACCAGCCAAGCTCTGAC Lampropeltis_ruthveni -----------------------------AGAACTGGTAGTAAAACTGGCGGGAGGCTCCACCCACCAAACCCGATGTCATCAAAATGCTTCTGCGCATGCTCAGAAGCTTCTGCACATGCACGCGGCCCCGTTGAGAACTGGTA-TTAAGATAAGTAGAAACAACCCCTGATCGAGCCCCCTTTGTACATTCTGGCCACTAGCAGTGTCTCCTTGGGGTTGCATGCAGAAGCTTTCCCCCATCAACTGCCCTTAACCTTTTTGTCCAGGTGTGTGCAGGGTTTGATCCAGGGGTGAAATGCTCCCGGTTCGGACTGGCTCGGGAGAGTAGGTAGTGATGGCGGCGGGCAGTTTGGAGAACCGGTAGCAAAAATCCCTGCCCCCGCCCCCCATGCCCAGCTGAACCTCGCGATCATCAGAGCCTTTTTTT--CCTTTTAAATGGCTCTGACCAGCCAAGCTCTGAC Lampropeltis_splendida -------------------------------------------AACCGGCGGGAGGCTCCACCCACCAACCCCGATGTCATCAAAATGCTTCTGCGCATGCTCAGAAGCTTCTGCACATGCACGCGGCCCCGTTGAGAACTGGTAGTAAAGGTAAGTAGAAACAACCCCTGATCGAGCCCCCTTTGTACATTCTGGCCACTAGCAGTGTCTCCTTGGGGTTGCATGCAGAAGCTTTCCCGCATCAACTGCCCTTAACCTTTTTGTCCAGGTGTGTGCAGGGTTTGATCCAGGGATGAAATGCTCCTGGTTTGGACTGGCTCGGGTGAGTAGGTAGCGATGGTGGCGGGCAGTTCGGAGAACCGGTAGCAAAAATCCCTGCCCCTGCCCCCCATGCCCAGCTGAACCTCGCGATCATCAGAGCCTTTTTTT--CCTTTTAAATGGCTCTGACCAGCCAAGCTCTGAC Lampropeltis_triangulum_CA GGGTTGCCCCCGGTTCGCACCGGTATTATAGAACTGGTAGTAAAACCGGCGGGAGGGTCCACCCACCAACCCCTATGTCATCAAAATGCTTCTGCGCATGCTCAGAAGCTTCTGCACATGCACGCGACCCCATTGAGAACTGGTAGTAAAGGTAAGTAGAAACAACCCCTGATCGAGCCCCCTTTGTACATTCTGGCCACTAGCAGTGTCTCCTTGAGGTTGCATGCAGAAACTTTCCCCCATCAACTGCCCTTAACCTTTTTGTCCAGGTGTGTGCAGGGTTTGATCCAGGGGTGAAATGCTCCCGGTTCGGACTGGCTCGGGCGAGTAGGTAGTGATGGCGGTGGGCAGTTCGGAGAACCGGTAGCAAAAATCCCTGCCCCCGCCCCCCATGCCCAGCTGAACCTCGCGATCATCAGAGCCTTTTTTT--CCTTTTAAATGGCTCTGACCAGCCAAGCTCTGAC Lampropeltis_triangulum_Eastern GGGTTGCCCCCGGTTCGCACCGGTATTATAGAACTGGTAGTAAAACCGGCGGGAGGCTCCACCCACCAACCCCGATGTCATCAAAATGCTTCTGCGCATGCTCAGAAGCTTCTGCACATGCACATGGCCCCATTGAGAACTGGTAGTAAAGGTAAGTAGAAACAACCCCTGATCGAGCCCCCTTTGTACATTCTGGCCACTAGCAGTGTCTCCTTGGGGTTGCATGCAGAAGCTTTCCCCCATCAACTGCCCTTAACCTTTTTGTCCAGGTGTGTGCACGGTTTGATCCAGGGATGAAATGCTCCCAGTTCGGACCGGCTCGGGCGAGTAGGTAGTGATGGCGGCGGGCAGTTCGGAGAACCGGTAGCAAAAATCCCTGCCCCCGCCCCCCATGCCCAG----------------------CCTTTTTTT--CCTTTTAAATGGCTCTGACCAGCCAAGCTCTGAC Lampropeltis_triangulum_MX GGGTTGCCCCCGGTTCGCACCGGTATTATAGAACTGGTAGTAAAACCGGCGGGAGGCTCCACCCACCAACCCCTATGTCATCAAAATGCTTCTGCGCATGCTCAGAAGCTTCTGCACATGCACGCGACCCCATTGAGAACTGGTAGTAAAGGTAAGTAGAAACAACCCCTGATCGAGCCCCCTTTGTACATTCTGGCCACTAGCAGTGTCTCCTTGAGGTTGCATGCAGAAACTTTCCCCCATCAACTGCCCTTAACCTTTTTGTCCAGGTGTGTGCAGGGTTTGATCCAGGGGTGAAATGCTCCCGGTTCAGACTGGCTCGGGCGAGTAGGTAGTGATGGCGGTGGGCAGTTCGGAGAACCGGTAGCAAAAATCCCTGCCCCCGCCCCCCATGCCCAGCTGAACCTCGCGATCATCAGAGCCTTTTTTT--CCTTTTAAATGGCTCTGACCAGCCAAGCTCTGAC Lampropeltis_triangulum_SA GGGTTGCCCCCGGTTCGCACCGGTATTATAGAACTGGTAGTAAAACCGGCAGGAGGCTCCACCCATCAACCCCTATGTCATCAAAATGCTTCTGCGCATGCTCAGAAGCTTCTGCACATGCACGCGACCCCATTGAGAACTGGTAGTAAAGGTAAGTAGAAACAACCCCTGATCGAGCCCCCTTTGTACATTCTGGCCACTAGCAGTGTCTCCTTGAGGTTGCATGCAGAAACTTTCCCCCATCAACTGCCCTTAACCTTTTTGTCCAGGTGTGTGCAGGGTTTGATCCAGGGGTGAAATGCTCCCGGTTCGGACTGGCTCGGGCGAGTAGGTAGTGATGGTGGTGGGCAGTTCGGAGAACCGGTAGCAAAAATCCCTGCCCCCGCCCCCCATGCCCAGCTGAACCTCGCGATCATCAGAGCCTTTTTTT--CCTTTTAAATGGCTCTGACCAGCCAAGCTCTGAC Lampropeltis_triangulum_Tamaulipas GGGTTGCCCCCGGTTCGCACCAGTATTATAGAACTGGTAGTAAAACCGGCGGGAGGCTCCACCCACCAACCCCAATGTCATCAAAATGCTTCTGTGCATGCTCAGAAGCTTCTGCACATGCACGCGGCCCCGTTGAGAACTGGTAGTAAAGGTAAGTAGAAACAACCCCTGATCGAGCCCCCTTTGTACATTCTGGCCACTAGCAGTGTCTCCTTGGG-TTGCATGCAGAAGCTTTCCCCCATCAACTGCCCTTAACCTTTTTGTCCAGGTGTGTGCAGGGTTTGATCCAGGGGTGAAATGCTCCCCAGTCGGACTGGCTCGGGCGAGTAGGTAGTGATGGCGACGGGCAGTTCGGAGAACCGGTAGCAAAAATCCCTGCCCCCGCCCCCCATGCCCAGCTGAACCTCGCGATCATCAGAGCCTTTTTTT--CCTTTTAAATGGCTCTGACCAGCCAAGCTCTGAC Lampropeltis_triangulum_Western GGGTTGCCCCCGGTTCGCACTGGTATTATAGAACTGGTAGTAAAACCGGCGGGAGGCTCCACCCACCAACCCCGATGTCATCAAAATGCTTCTGCGCATGCTCAGAAGCTTCTGCACATGCACATGGCCCCGTTGAGAACTGGTAGTAAAGGTAAGTAGAAACAACCCCTGATCGAGCCCCCTTTGTACATTCTAGCCACTAGCAGTGTCTCCTTGGGGTTGCATGCAGAAGCTTTCCCCCATCAACTGCCCTTAACCTTTTTGTCCAGGTGTGTGCACGGTTTGATCCAGGGATGAAATGCTCCCGGTTCGGACCGGCTCGGGCGAGTAGGTAGTGATGGCGGAGGGCAGTTCGGAGAACCGGTAGCAAAAATCCCTGCCCCCACCCCCCATGCCCAG----------------------CCTTTTTTT--CCTTTTAAATGGCTCTGACCAGCCAAGCTCTGAC Lampropeltis_webbi GGGTTGCCCCCGGTTCGCACCGGTATTATAGAACTGGTAGTAAAACTGGCGGGAGGCTCCACCCACCAAACCCGATGTCATCAAAATGCTTCTGCGCATGCTCAGAAGCTTCTGCACATGCACGCGGCCCCGTTGAGAACTGGTA-TTAAGATAAGTAGAAACAACCCCTGATCGAGCCCCCTTTGTACATTCTGGCCACTAGCAGTGTCTCCTTGGGGTTGCATGCAGAAGCTTTCCCCCATCAACTGCCCTTAACCTTTTTGTCCAGGTGTGTGCAGGGTTTGATCCAGGGGTGAAATGCTCCCGGTTCGGACTGGCTCGGGAGAGTAGGTAGTGATGGCGGCGGGCAGTTTGGAGAACCGGTAGCAAAAATCCCTGCCCCCGCCCCCCATGCCCAGCTGAACCTCGCGATCATCAGAGCCTTTTTTT--CCTTTTAAATGGCTCTGACCAGCCAAGCTCTGAC Lampropeltis_zonata GGGTTGCCCCCGGTTCGCACCGGTATTATAGAACTGGTAGTAAAACCGGCGGGAGGCTCCACCCATCAACCCCAATGTCATCAAAATGCTTCTGCGCATGCTCAGAAGCTTCTGCACATGCACGCGGCCCCGTTGAGAACTGGTAGTAAAGGTAAGTAGAAACAACCCCTGATCGAGCCCCCTTTGTACATTCTGGCCACTAGCAGTGTCTCCTTGGGGTTGCATGCAGAAGCTTTCCCCCATCAACTGCCCTTAACCTTTTTGTCCAGGTGTGTGCAGGGTTTGATCCAGGGGTGAAATGCTCCCGGTTCGGACTGGCTCGGGCGAGTAGGTAGTGATGGCGGCGGGCAGTTCGGAGAACCAGTAGCAAAAATCCCTGCCCCCGCCCCCCATGCCCAGCTGAACCTCACGATCATCAGAGCCTTTTTTT--CCTTTTAAATGGCTCTGACCAGCCAAGCTCTGAC ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M20121] TITLE 1_latcl; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep12824; DIMENSIONS NCHAR=705; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Arizona_elegans GGAGCGGTGCAAACGATGAGAAAATATGGAAAGCATATTGGTTCCCATCACTGTTCTCTTCATTAAAGTCCATTCCTTTCCCTTCTCCAAGAAGATATTGGGAATGCTTGGTTGCCTAATTGAGGAAGTACATTAGCAGCAATAGAAAACTTCATTTTGATAGGAAAAAAAAAGAGAAAAACTATTGAGAAGGCCTAATATCTGAAACCATTCTTGCTCACTCTTGCTTCATTTCTTTCTCTCTGTTCCTTTAGGTACAATGGACCCAACCTGGTGCTGAAGTACGACAAGGCACGGGGCCGGCTGTTAAATCTTGCAGTGGATGAACACAGCTCCCCCTACTATGCACTGAGGGATCGCCAGGGCAATGCAATTGGTGTGACAGCCTGTGACATTGATGGAGATGGATGGGAGGAAATTTACTTCCTAAACACCAATAATGCCTTTTCTGGTGTGTGTCAAAGTCATCCATCCCTGGCATTTAACTTACCATTGATAACCAAATT-AACGCATCAAACCTTTTGAATGTTCTTTGCATTTCCCTTCATTCTTTGATATCCATCCAACTATGATATACAACACACTATATGCCTGGAAATCATCCCATTGTAGCAGATTAACCAGTGCTGACTAGTTCTAGAATCCATTTAATCTGCCCAAAAGCGGTGACAGAAACTAGAAGTGATTATCAGAGGGGACACATA Cemophora_coccinea -GAGCGGTGCAAATGATGAGAAAATATGGAAAGCATATT-GTTCCCACCACTGTTCTCTTCATTAAAGTCCATTCCTTTCCCTTCTCCAAGAAGATATTGGGAATGCTTGGTTGCCTAATTGAGGAACTACATTAGCAGCAATAGAAAACTTCACTTTGATAGGAAAAAAAGAGAGAAAAACTATTGAGAAGGCCTAATATCTGAAACCATTCTTGCTCACTCTTGCTTCATTTCTTACTCTCTGTTCCTTTAGGTACAATGGACCCAACCTGGTGCTGAAGTACGACAAGGCACGGGGCCGGCTGTTAAATCTTGCAGTGGATGAACACAGCTCCCCCTACTATGCACTGAGGGATCGCCAGGGCAATGCAATTGGTGTGACAGCCTGTGACATTGATGGAGATGGATGGGAGGAAATTTACTTCCTAAACACCAATAATGCCTTTTCTGGTGTGTGTCAAAGTCATCCATCCCTGGCATTTAACTTACCATTGATAACCAAATTTAACGCATCAAATCTTTTGAATGTTCTTTGCATTTGCCTTCATCTTCTGATATCCATCCAACTATGATATACAACATACTATCTGCCTGGAAATCATCCCATTGTAGCAGATTAACCAGTGCTGACTAGTTCCAGGATCCATTTAACCTGCCCAAAAGAGGTGACAGAAACTAGAAGTGATT----------------- Lampropeltis_alterna GGAGCGGTGCAAACGATGAGAAAATATGGAAAGCATATTGGTTCCCATCACTGTTCTCTTCATTAAAGTCCATTCCTTTCCCTTCTCCAAGAAGATATTGGGAATGCTTGGTTGCCTAATTGAGGAAGCACATTAGCAGCAATAGAAAACTTCATTTTGATAGGAAAAAAAGAGAGAAAAACTATTGAGAAGGCCTAATATCTGAAACCATTCTTGCTCACTCTTGCTTCATTTCTTACTCTCTGTTCCTTTAGGTACAATGGACCCAACCTGGTGCTGAAGTACGACAAGGCACGGGGCCGGCTGTTAAATCTTGCAGTGGATGAACACAGCTCCCCCTACTATGCACTGAGGGATCGCCAGGGCAATGCAATTGGTGTGACAGCCTGTGACATTGATGGAGATGGATGGGAGGAAATTTACTTCCTAAACACCAATAATGCCTTTTCTGGTGTGTGTCAAAGTCATCCATCCCTGGCATTTAACTTACCATTGATAACCAAATT-AATGCATCAAACCTTTTGAATGTTCTTTGCATTTCCCTTCATTCTTTGATATCCATCCAACTATGATATACAACACACTATATGCCTGGAAATCATCCCATTGTAGCAGATTAACCAGTGCTGACTAGTTCCAGAATCCATTTAATCTGCCCAAAAGCGGTGACAGAAACTAGAAGTGATTATCAGAGGGGACACATA Lampropeltis_californiae GGAGCGGTGCAAACGATGAGAAAATATGGAAAGCATATTGGTTCCCATCACTGTTCTCTTCATTAAAGTCCATTCCTTTCCCTTCTCCAAGAAGATATTGGGAATGCTTGGTTGCCTAATTGAGGAAGCACATTAGCAGCAATAGAAAACTTCATTTTGATAGGAAAAAAAAAGAGAAAAACTATTGAGAAGGCCTAATATCTGAAACCATTCTTGCTCACTCTTGCTTCATTTCTTACTCTCTGTTCCTTTAGGTACAATGGACCCAACCTGGTGCTGAAGTACGACAAGGCACGGGGCCGGCTGTTAAATCTTGCAGTGGATGAACACAGCTCCCCCTACTATGCACTGAGGGATCGCCAGGGCAATGCAATTGGTGTGACAGCCTGTGACATTGATGGAGATGGATGGGAGGAAATTTACTTCCTAAACACCAATAATGCCTTTTCTGGTGTGTGTCAAAGTCATCCATCCCTGGCATTTAACTTACCATTGATAACCAAATT-AATGCATCAAACCTTTTGAATGTTCTTTGCATTTCCCTTCATTCTTTGATAT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Lampropeltis_calligaster GGAGCGGTGCAAACGATGAGAAAATATGGAAAGCATATTGGTTCCCATCACTGTTCTCTTCATTAAAGTCCATTCCTTTCCCTTCTCCAAGAAGATATTGGGAATGCTTGGTTGCCTAATTGAGGAAGCACATTAGCAGCAATAGAAAACTTCATTTTGATAGGAAAAAAAAAGAGAAAAACTATTGAGAAGGCCTAATATCTGAAACCATTCTTGCTCACTCTTGCTTCATTTCTTACTCTCTGTTCCTTTAGGTACAATGGACCCAACCTGGTGCTGAAGTATGACAAGGCACGGGGCCGGCTGTTAAATCTTGCAGTGGATGAACACAGCTCCCCCTATTATGCACTGAGGGATCGCCAGGGCAATGCAATTGGTGTGACAGCCTGTGACATTGATGGAGATGGATGGGAGGAAATTTACTTCCTAAACACCAATAATGCCTTTTCTGGTGTGTGTCAAAGTCATCCATCCCTGGCATTTAACTTACCATTGATAACCAAATT-AATGCATCAAACCTTTTGAATGTTCTTTGCATTTCCCTTCATTCTTTGATATTCATCCAACTATGATATACAATGCACTATATGCCTGGAAATCATCCCGTTGTAGCAGATTAACCAGTGCTGACTAGTTCCAGAATCCATTTAATCTGCCCAAAAGCGGTGACAGAAACTAGAAGTGATTAT--------------- Lampropeltis_elapsoides GGAGCGGTGCAAACGATGAGAAAATATGGAAAGCATATTGGTTCCCATCACTGTTCTCTTCATTAAAATCCATTCCTTTCCCTTCTCCAAGAAGATATTGGGAATGCTTGGTTGCCTAATTGAGGAAGCACATTAGCAGCAATAGAAAACTTCATTTTGATAGGGAAAAAAAAGAGAAAAACTATTGAGAAGGCCTAATATCTGAAACCATTCTTGCTCACTCTTGCTTCATTTCTTACTCTCTGTTCCTTTAGGTACAATGGACCCAACCTGGTGCTGAAGTACGACAAGGCACGGGGCCGGCTGTTAAATCTTGCAGTGGATGAACACAGCTCCCCCTACTATGCACTGAGGGATCGCCAGGGCAATGCAATTGGTGTGACAGCCTGTGATATTGATGGAGATGGATGGGAGGAAATTTACTTCCTAAACACCAATAATGCCTTTTCTGGTGTGTGTCAAAGTCATCCATCCCTGGCATTTAACTTACCATTGATAACCAAATT-AATGCATCAAACCTTTTGAATGTTCTTTGCATTTCCCTTCATTCTTTGATATCCATCCAACTATGATATACAACACACTATATGCCTGGAAATCATCCCATTGTAGCAGATTAACCAGTGCTGACTAGTTCCAGAATCCATTTAATCTGCCCAAAAGCGGTGACAGAAACTAGAAGTGATTATCAGAGGGGACACATA Lampropeltis_extenuata GGAGCGGTGCAAACGATGAGAAAATATGGAAAGCATATTGGTTCCCATCACTGTTCTCTTCATTAAAGTCTATTCCTTTCCCTTCTCCAAGAAGATATTGGGAATGCTTGGTTGCCTAATTGAGGAAGCACATTAGCAGCAATAGAAAACTTCATTTTGATAGGGAAAAAAAAGAGAAAAACTATTGAGAAGGCCTAATATCTGAAACCATTCTTGCTCACTCTTGCTTCATTTCTTACTCTCTGTTCCTTTAGGTACAATGGACCCAACCTGGTGCTGAAGTACGACAAGGCACGGGGCCGGCTGTTAAATCTTGCAGTGGATGAACACAGCTCCCCCTACTATGCACTGAGGGATCGCCAGGGCAATGCAATTGGTGTGACAGCCTGTGACATTGATGGAGATGGATGGGAGGAAATTTACTTCCTAAACACCAATAATGCCTTTTCTGGTGTGTGTCAAAGTCATCCATCCCTGGCATTTAACTTACCATTGATAACCAAATT-AATGCATCAAACCTTTTGAATGTTCTTTGCATTTCCCTTCATTCTTTGATATCCATCCAACTATGATATACAACGCACTATATGCCTGGAAATCATCCCGTTGTAGCAGATTAACCAGTGCTGACTAGTTCCAGAATCCATTTAATCTGCCCAAAAGCGGTGACAGAAACTAGAAGTGATTATCAGAGGGGACACAT- Lampropeltis_getula GGAGCGGTGCAAACGATGAGAAAATATGGAAAGCATATTGGTTCCCATCACTGTTCTCTTCATTAAAGTCCATTCCTTTCCCTTCTCCAAGAAGATATTGGGAATGCTTGGTTGCCTAATTGAGGAAGCACATTAGCAGCAATAGAAAACTTCATTTTGATAGGAAAAAAAAAGAGAAAAACTATTGAGAAGGCCTAATATCTGAAACCATTCTTGCTCACTCTTGCTTCATTTCTTACTCTCTGTTCCTTTAGGTACAATGGACCCAACCTGGTGCTGAAGTACGACAAGGCACGGGGCCGGCTGTTAAATCTTGCAGTGGATGAACACAGCTCCCCCTACTATGCACTGAGGGATCGCCAGGGCAATGCAATTGGTGTGACAGCCTGTGACATTGATGGAGATGGATGGGAGGAAATTTACTTCCTAAACACCAATAATGCCTTTTCTGGTGTGTGTCAAAGTCATCCATCCCTGGCATTTAACTTACCATTGATAACCAAATT-AATGCATCAAACCTTTTGAATGTTCTTTGCATTTCCCTTCATTCTTTGATATCCATCCAACTATGATATACAACGCACTATATGCCTGGAAATCATCCCGTTGTAGCAGATTAACCAGTGCTGACTAGTTCCAGAATCCATTTAATCTGCCCAAAAGCGGTGACAGAAACTAGAAGTGATTATCAGAGGGGACACATA Lampropeltis_holbrooki GGAGCGGTGCAAACGATGAGAAAATATGGAAAGCATATTGGTTCCCATCACTGTTCTCTTCATTAAAGTCCATTCCTTTCCCTTCTCCAAGAAGATATTGGGAATGCTTGGTTGCCTAATTGAGGAAGCACATTAGCAGCAATAGAAAACTTCATTTTGATAGGAAAAAAAAAGAGAAAAACTATTGAGAAGGCCTAATATCTGAAACCATTCTTGCTCACTCTTGCTTCATTTCTTACTCTCTGTTCCTTTAGGTACAATGGACCCAACCTGGTGCTGAAGTACGACAAGGCACGGGGCCGGCTGTTAAATCTTGCAGTGGATGAACACAGCTCCCCCTACTATGCACTGAGGGATCGCCAGGGCAATGCAATTGGTGTGACAGCCTGTGACATTGATGGAGATGGATGGGAGGAAATTTACTTCCTAAACACCAATAATGCCTTTTCTGGTGTGTGTCAAAGTCATCCATCCCTGGCATTTAACTTACCATTGATAACCAAATT-AATGCATCAAACCTTTTGAATGTTCTTTGCATTTCCCTTCATTCTTTGATATCCATCCAACTATGATATACAACGCACTATATGCCTGGAAATCATCCC--------------------------------------------------------------------------------------------------- Lampropeltis_knoblochi GGAGCGGTGCAAACGATGAGAAAATATGGAAAGCATATTGGTTCCCATCACTGTTCTCTTCATTAAAGTCCATTCCTTTCCCTTCTCCAAGAAGATATTGGGAATGCTTGGTTGCCTAATTGAGGAAGCACATTAGCAGCAATAGAAAACTTCATTTTGATAGGAAAAAAAGAGAGAAAAACTATTGAGAAGGCCTAATATCTGAAACCATTCTTGCTCACTCTTGCTTCATTTCTTACTCTCTGTTCCTTTAGGTACAATGGACCCAACCTGGTGCTGAAGTACGACAAGGCACGGGGCCGGCTGTTAAATCTTGCAGTGGATGAACACAGCTCCCCCTACTATGCACTGAGGGATCGCCAGGGCAATGCAATTGGTGTGACAGCCTGTGACATTGATGGAGATGGATGGGAGGAAATTTACTTCCTAAACACCAATAATGCCTTTTCTGGTGTGTGTCAAAGTCATCCATCCCTGGCATTTAACTTACCATTGATAACCAAATT-AATGCATCAAACCTTTTGAATGTTCTTTGCATTTCCCTTCATTCTTTGATATCCATCCAACTATGATATACAACACACTATATGCCTGGAAATCATCCCATTGTAGCAGATTAACCAGTGCTGACTAGTTCCA----------------------------------------------------------------- Lampropeltis_mexicana GGAGCGGTGCAAACGATGAGAAAATATGGAAAGCATATTGGTTCCCATCACTGTTCTCTTCATTAAAGTCCATTCCTTTCCCTTCTCCAAGAAGATATTGGGAATGCTTGGTTGCCTAATTGAGGAAGCACATTAGCAGCAATAGAAAACTTCATTTTGATAGGAAAAAAAGAGAGAAAAACTATTGAGAAGGCCTAATATCTGAAACCATTCTTGCTCACTCTTGCTTCATTTCTTACTCTCTGTTCCTTTAGGTACAATGGACCCAACCTGGTGCTGAAGTACGACAAGGCACGGGGCCGGCTGTTAAATCTTGCAGTGGATGAACACAGCTCCCCCTACTATGCACTGAGGGATCGCCAGGGCAATGCAATTGGTGTGACAGCCTGTGACATTGATGGAGATGGATGGGAGGAAATTTACTTCCTAAACACCAATAATGCCTTTTCTGGTGTGTGTCAAAGTCATCCATCCCTGGCATTTAACTTACCATTGATAACCAAATT-AATGCATCAAACCTTTTGAATGTTCTTTGCATTTCCCTTCATTCTTTGATATCCATCCAACTATGATATACAACACACTATATGCCTGGAAATCATCCCATTGTAGCAGATTAACCAGTGCTGACTAGTTCCAGAATCCATTTAATCTGCCCAAAAGCGGTGACAGAAACTAGAAGTGATTATCAGAGGGGACACATA Lampropeltis_nigra GGAGCGGTGCAAACGATGAGAAAATATGGAAAGCATATTGGTTCCCATCACTGTTCTCTTCATTAAAGTCCATTCCTTTCCCTTCTCCAAGAAGATATTGGGAATGCTTGGTTGCCTAATTGAGGAAGCACATTAGCAGCAATAGAAAACTTCATTTTGATAGGGAAAAAAAAGAGAAAAACTATTGAGAAGGCCTAATATCTGAAACCATTCTTGCTCACTCTTGCTTCATTTCTTACTCTCTGTTCCTTTAGGTACAATGGACCCAACCTGGTGCTGAAGTACGACAAGGCACGGGGCCGGCTGTTAAATCTTGCAGTGGATGAACACAGCTCCCCCTACTATGCACTGAGGGATCGCCAGGGCAATGCAATTGGTGTGACAGCCTGTGACATTGATGGAGATGGATGGGAGGAAATTTACTTCCTAAACACCAATAATGCCTTTTCTGGTGTGTGTCAAAGTCATCCATCCTTGGCATTTAACTTACCATTGATAACCAAATT-AATGCATCAAACCTTTTGAATGTTCTTTGCATTTCCCTTCATTCTTTGATATCCATCCAACTATGATATACAACGCACTATATGCCTGGAAATCATCCCGTTGTAGCAGATTAACCAGTGCTGACTAGTTCCAGAATCCATTTAATCTGCCCAAAAGCGGTGACAGAAACTAGAAGTGATTATCAGAGGGGACACATA Lampropeltis_pyromelana GGAGCGGTGCAAACGATGAGAAAATATGGAAAGCATATTGGTTCCCATCACTGTTCTCTTCATTAAAGTCCATTCCTTTCCCTTCTCCAAGAAGATATTGGGAATGCTTGGTTGCCTAATTGAGGAAGCACATTAGCAGCAATAGAAAACTTCATTTTGATAGGAAAAAAAGAGAGAAAAACTATTGAGAAGGCCTAATATCTGAAACCATTCTTGCTCACTCTTGCTTCATTTCTTACTCTCTGTTCCTTTAGGTACAATGGACCCAACCTGGTGCTGAAGTACGACAAGGCACGGGGCCGGCTGTTAAATCTTGCAGTGGATGAACACAGCTCCCCCTACTATGCACTGAGGGATCGCCAGGGCAATGCAATTGGTGTGACAGCCTGTGACATTGATGGAGATGGATGGGAGGAAATTTACTTCCTAAACACCAATAATGCCTTTTCTGGTGTGTGTCAAAGTCATCCATCCCTGGCATTTAACTTACCATTGATAACCAAATT-AATGCATCAAACCTTTTGAATGTTCTTTGCATTTCCCTTCATTCTTTGATATCCATCCAACTATGATATACAACACACTATATGCCTGGAAATCATCCCATTGTAGCAGATTAACCAGTGCTGACTAGTTCCAGAATCCATTTAATCTGCCCAAAAGCGGTGACAGAAACTAGAACTGATTATCAGAGGGGACACAT- Lampropeltis_ruthveni GGAGCGGTGCAAACGATGAGAAAATATGGAAAGCATATTGGTTCCCATCACTGTTCTCTTCATTAAAGTCCATTCCTTTCCCTTCTCCAAGAAGATATTGGGAATGCTTGGTTGCCTAATTGAGGAAGCACATTAGCAGCAATAGAAAACTTCATTTTGATAGGAAAAAAAGAGAGAAAAACTATTGAGAAGGCCTAATATCTGAAACCATTCTTGCTCACTCTTGCTTCATTTCTTACTCTCTGTTCCTTTAGGTACAATGGACCCAACCTGGTGCTGAAGTACGACAAGGCACGGGGCCGGCTGTTAAATCTTGCAGTGGATGAACACAGCTCCCCCTACTATGCACTGAGGGATCGCCAGGGCAATGCAATTGGTGTGACAGCCTGTGACATCGATGGAGATGGATGGGAGGAAATTTACTTCCTAAACACCAATAATGCCTTTTCTGGTGTGTGTCAAAGTCATCCATCCCTGGCATTTAACTTACCATTGATAACCAAATT-AATGCATCAAACCTTTTGAATGTTCTTTGCATTTCCCTTCATTCTTTGATATCCATCCAACTATGATATACAACACACTATATGCCTGGAAATCATCCCATTGTAGCAGATTAACCAGTGCTGACTAGTTCCAGAATCCATTTAATCTGCCCAAAAGCGGTGAC---------------------------------- Lampropeltis_splendida GGAGCGGTGCAAACGATGAGAAAATATGGAAAGCATATTGGTTCCCATCACTGTTCTCTTCATTAAAGTCCATTCCTTTCCCTTCTCCAAGAAGATATTGGGAATGCTTGGTTGCCTAATTGAGGAAGCACATTAGCAGCAATAGAAAACTTCATTTTGATAGGAAAAAAAAAGAGAAAAACTATTGAGAAGGCCTAATATCTGAAACCATTCTTGCTCACTCTTGCTTCATTTCTTACTCTCTGTTCCTTTAGGTACAATGGACCCAACCTGGTGCTGAAGTACGACAAGGCACGGGGCCGGCTGTTAAATCTTGCAGTGGATGAACACAGCTCCCCCTACTATGCACTGAGGGATCGCCAGGGCAATGCAATTGGTGTGACAGCCTGTGACATTGATGGAGATGGATGGGAGGAAATTTACTTCCTAAACACCAATAATGCCTTTTCTGGTGTGTGTCAAAGTCATCCATCCCTGGCATTTAACTTACCATTGATAACCAAATT-AATGGATCAAACCTTTTGAATGTTCTTTGCATTTCCCTTCATTCTTTGATATCCATCCAACTATGATATACAAGGCACTATATGCCTG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Lampropeltis_triangulum_CA GGAGCGGTGCAAACGATGAGAAAATATGGAAAGCATATTGGTTCCCATCACTGTTCTCTTCATTAAAGTCCATTCCTTTCCCTTCTCCAAGAAGATATTGGGAATGCTTGGTTGCCTAATTGAGGAAGCACATTAGCAGCAATAGAAAACTTCATTTTGATAGGAAAAAAAGAGAGAAAAACTATTGAGAAGGCCTAATATCTGAAACCATTCTTGCTCACTCTTGCTTCATTTCTTACTCTCTGTTCCTTTAGGTACAATGGACCCAACCTGGTGCTGAAGTACGACAAGGCACGGGGCCGGCTGTTAAATCTTGCAGTGGATGAACACAGCTCCCCCTACTATGCACTGAGGGATCGCCAGGGCAATGCAATTGGTGTGACAGCCTGTGACATTGATGGAGATGGATGGGAGGAAATTTACTTCCTAAACACCAATAATGCCTTTTCTGGTGTGTGTCAAAGTCATCCATCCCTGGCATTTAACTTACCATTGATAACCAAATT-AATGCATCAAACCTTTTGAATGTTCTTTGCATTTCCCTTCATTCTTTGATATCCATCCAACTATGATATACAACACACTATATGCCTGGAAATCATCCCATTGTAGCAGATTAACCAGTGCTGACTAGTTCCAGAATCCATTTAATCTGCCCAAAAGCGGTGACAGAAACTAGAAGTGATTATCAGAGGGGACACATA Lampropeltis_triangulum_Eastern GGAGCGGTGCAAACGATGAGAAAATATGGAAAGCATATTGGTTCCCATCACTGTTCTCTTCATTAAAGTCCATTCCTTTCCCTTCTCCAAGAAGATATTGGGAATGCTTGGTTGCCTAATTGAGGAAGCACATTAGCAGCAATAGAAAACTTCACTTTGATAGGGAAAAAAAAGAGAAAAACTATTGAGAAGGCCTAATATCTGAAACCATTCTTGCTCACTCTTGCTTCATTTCTTACTCTCTGTTCCTTTAGGTACAATGGACCCAACCTGGTGCTGAAGTACGACAAGGCACGGGGCCGGCTGTTAAATCTTGCAGTGGATGAACACAGCTCCCCCTACTATGCACTGAGGGATCGCCAGGGCAATGCAATTGGTGTGACAGCCTGTGACATTGATGGAGATGGATGGGAGGAAATTTACTTCCTAAACACCAATAATGCCTTTTCTGGTGTGTGTCAAAGTCATCCATCCCTGGCATTTAACTTACCATTGATAACCAAATT-AACGCATCAAATCTTTTGAATGTTCTTTGCATTTGCCTTCATCTTCTGATATCCATCCAACTATGATATACAACATACTATATGCCTGGAAATCATCCCATTGTAGCAGATTAACCAGTGCTGACTAGTTCCAGGATCCATTTAACCTGCCCAAAAGAGGTGACAGAAACTAGAAGTGATTATCAGAGGGGACACATA Lampropeltis_triangulum_MX GGAGCGGTGCAAACGATGAGAAAATATGGAAAGCATATTGGTTCCCATCACTGTTCTCTTCATTAAAGTCCATTCCTTTCCCTTCTCCAAGAAGATATTGGGAATGCTTGGTTGCCTAATTGAGGAAGCACATTAGCAGCAATAGAAAACTTCATTTTGATAGGAAAAAAAGAGAGAAAAACTATTGAGAAGGCCTAATATCTGAAACCATTCTTGCTCACTCTTGCTTCATTTCTTACTCTCTGTTCCTTTAGGTACAATGGACCCAACCTGGTGCTGAAGTACGACAAGGCACGGGGCCGGCTGTTAAATCTTGCAGTGGATGAACACAGCTCCCCCTACTATGCACTGAGGGATCGCCAGGGCAATGCAATTGGTGTGACAGCCTGTGACATTGATGGAGATGGATGGGAGGAAATTTACTTCCTAAACACCAATAATGCCTTTTCTGGTGTGTGTCAAAGTCATCCATTCCTGGCATTTAACTTACCATTGATAACCAAATT-AATGCATCAAACCTTTTGAATGTTCTTTGCATTTCCCTTCATTCTTTGATATCCATCCAACTATGATATACAACACACTATATGCCTGGAAATCATCCCATTGTAGCAGATTAACCAGTGCTGACTAGTTCCAGAATCCATTTAATCTGCCCAAAAGCGGTGACAGAAACTAGAAGTGATTATCAGAGGGGACACATA Lampropeltis_triangulum_SA GGAGCGGTGCAAACGATGAGAAAATATGGAAAGCATATTGGTTCCCATCACTGTTCTCTTCATTAAAGTCCATTCCTTTCCCTTCTCCAAGAAGATATTGGGAATGCTTGGTTGCCTAATTGAGGAAGCACATTAGCAGCAATAGAAAACTTCATTTTGATAGGAAAAAAAGAGAGAAAAACTATTGAGAAGGCCTAATATCTGAAACCATTCTTGCTCACTCTTGCTTCATTTCTTACTCTCTGTTCCTTTAGGTACAATGGACCCAACCTGGTGCTGAAGTACGACAAGGCACGGGGCCGGCTGTTAAATCTTGCAGTGGATGAACACAGCTCCCCCTACTATGCACTGAGGGATCGCCAGGGCAATGCAATTGGTGTGACAGCCTGTGACATTGATGGAGATGGATGGGAGGAAATTTACTTCCTAAACACCAATAATGCCTTTTCTGGTGTGTGTCAAAGTCATCCATCCCTGGCATTTAACTTACCATTGATAACCAAATT-AATGCATCAAACCTTTTGAATGTTCTTTGCATTTCCCTTCATTCTTTGATATCCATCCAACTATGATATACAACACACTATATGCCTGGAAATCATCCCATTGTAGCAGATTAACCAGTGCTGACTAGTTCCAGAATCCATTTAATCTGCCCAAAAGCGGTGACAGAAACTAGAAGTGATTATCAGAGGGGACACATA Lampropeltis_triangulum_Tamaulipas GGAGCGGTGCAAACGATGAGAAAATATGGAAAGCATATTGGTTCCCATCACTGTTCTCTTCATTAAAGTCCATTCCTTTCCCTTCTCCAAGAAGATATTGGGAATGCTTGGTTGCCTAATTGAGGAAGCACATTAGCAGCAATAGAAAACTTCACTTTGATAGGGAAAAAAAAGAGAAAAACTATTGAGAAGGCCTAATATCTGAAACCATTCTTGCTCACTCTTGCTTCATTTCTTACTCTCTGTTCCTTTAGGTACAATGGACCCAACCTGGTGCTGAAGTACGACAAGGCACGGGGCCGGCTGTTAAATCTTGCAGTGGATGAACACAGCTCCCCCTACTATGCACTGAGGGATCGCCAGGGCAATGCAATTGGTGTGACAGCCTGTGACATTGATGGAGATGGATGGGAGGAAATTTACTTCCTAAACACCAATAATGCCTTTTCTGGTGTGTGTCAAAGTCATCCATCCCTGGCATTTAACTTACCATTGATAACCAAATT-AATGCATCAAACCTTTTGAATGTTCTTTGCATTTCCCTTCATTCTTTGATATCCATCCAACTATGATATACAACACACTATATGCCTGGAAATCATCCCATTGTAGCAGATTAACCAGTGCTGACTAGTTCCAGAATCCATTTAATCTGCCCAAAAGCGGTGACAGAAACTAGAAGTGATTATCAGAGGGGACACA-- Lampropeltis_triangulum_Western GGAGCGGTGCAAACGATGAGAAAATATGGAAAGCATATTGGTTCCCATCACTGTTCTCTTCATTAAAGTCCATTCCTTTCCCTTCTCCAAGAAGATATTGGGAATGCTTGGTTGCCTAATTGAGGAAGCACATTAGCAGCAATAGAAAACTTCACTTTGATAGGGAAAAAAAAGAGAAAAACTATTGAGAAGGCCTAATATCTGAAACCATTCTTGCTCACTCTTGCTTCATTTCTTACTCTCTGTTCCTTTAGGTACAATGGACCCAACCTGGTGCTGAAGTACGACAAGGCACGGGGCCGGCTGTTAAATCTTGCAGTGGATGAACACAGCTCCCCCTACTATGCACTGAGGGATCGCCAGGGCAATGCAATTGGTGTGACAGCCTGTGACATTGATGGAGATGGATGGGAGGAAATTTACTTCCTAAACACCAATAATGCCTTTTCTGGTGTGTGTCAAAGTCATCCATCCCTGGCATTTAACTTACCATTGATAACCAAATT-AATGCATCAAACCTTTTGAATGTTCTTTGCATTTCCCTTCATTCTTTGATATCCATCCAACTATGATATACAACACACTATATGCCTGGAAATCATCCCATTGTAGCAGATTAACCAGTGCTGACTAGTTCCAGAATCCATTTAATCTGCCCAAAAGCGGTGACAGAAACTAGAAGTGATTATCAGAGGGGACACATA Lampropeltis_webbi ------------------AGAAAATATGGAAAGCATATTGGTTCCCATCACTGTTCTCTTCATTAAAGTCCATTCCTTTCCCTTCTCCAAGAAGATATTGGGAATGCTTGGTTGCCTAATTGAGGAAGCACATTAGCAGCAATAGAAAACTTCATTTTGATAGGAAAAAAAGAGAGAAAAACTATTGAGAAGGCCTAATATCTGAAACCATTCTTGCTCACTCTTGCTTCATTTCTTACTCTCTGTTCCTTTAGGTACAATGGACCCAACCTGGTGCTGAAGTACGACAAGGCACGGGGCCGGCTGTTAAATCTTGCAGTGGATGAACACAGCTCCCCCTACTATGCACTGAGGGATCGCCAGGGCAATGCAATTGGTGTGACAGCCTGTGACATTGATGGAGATGGATGGGAGGAAATTTACTTCCTAAACACCAATAATGCCTTTTCTGGTGTGTGTCAAAGTCATCCATCCCTGGCATTTAACTTACCATTGATAACCAAATT-AATGCATCAAACCTTTTGAATGTTCTTTGCATTTCCCTTCATTCTTTGATATCCATCCAACTATGATATACAACACACTATATGCCTGGAAATCATCCCATTGTAGCAGATTAACCAGTGCTGACTAGTTCCAGAATCCATTTAATCTGCCCAAAAGCGGTGACAGAAACTAGAAGTGATTATCAGAGGGGACACATA Lampropeltis_zonata GGAGCGGTGCAAACGATGAGAAAATATGGAAAGCATATTGGTTCCCATCACTGTTCTCTTCATTAAAGTCCATTCCTTTCCCTTCTCCAAGAAGATATTGGGAATGCTTGGTTGCCTAATTGAGGAAGCACATTAGCAGCAATAGAAAACTTCATTTTGATAGGAAAAAAAGAGAGAAAAACTATTGAGAAGGCCTAATATCTGAAACCATTCTTGCTCACTCTTGCTTCATTTCTTACTCTCTGTTCCTTTAGGTACAATGGACCCAACCTGGTGCTGAAGTACGACAAGGCACGGGGCCGGCTGTTAAATCTTGCAGTGGATGAACACAGCTCCCCCTACTATGCACTGAGGGATCGCCAGGGCAATGCAATTGGTGTGACAGCCTGTGACATTGATGGAGATGGATGGGAGGAAATTTACTTCCTAAACACCAATAATGCCTTTTCTGGTGTGTGTCAAAGTCATCCATCCCTGGCATTTAACTTACCATTGATAACCAAATT-AATGCATCAAACCTTTTGAATGTTCTTTGCATTTCCCTTCATTCTTTGATATCCATCCAACTATGATATACAACACACTATATGCCTGGAAATCATCCCATTGTAGCAGATTAACCAGTGCTGACTAGTTCCAGAATCCATTTAATCTGCCCAAAAGCGGTGACAGAAACTAGAAGTGATTATCAGAGGGGACACATA ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M20119] TITLE 1_2cl4; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep12824; DIMENSIONS NCHAR=376; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Arizona_elegans GGAGCCTTTGCAGGCAGTTGCTTCCACGACAAA-CGGAAGTAGCTATACTAATCTCCCTTTATTTCTTTGTCAGTAAATTTAAATTTAACGCAAAATAGTTTATTGTAACCTTCTTATTCTTTTGACTGTGTTGCTGGCTGATAAAAGCGGCTCAGCCTATAAAACAATGATTTACTTTAAACTGAACCATTTCCATAACCTATCCAAAGAGGCCTTCGGGGATTGGCAGCCAATAAG---AGCACTGGAGTGTGAGAATCAAATTCTGACTATTCAAGGTGCCCTCACAAATATATGCCCTAAAATAATGGGTTCAGCTTAGTACTATTCCCAGACCGGTGGAAGCCTTCAAATTGACTATTTCTCAGTGGCCTT Cemophora_coccinea GGAGCCTTTGCAGGCAGTTGCTTCCGCGACAAA-CGGAAGTAGCTATACTAATCTCCCTTTATTTCTTTGTCGGTAAATTTAAATTTAACACAAAATAGTTTATTGTAACCTTCTTATTCTTTTGACTGTGTTGCTGGCTGATAAAAGCGGCTCAGCCTATAAAATAATGATTTACTTTAAACTGAACCATTTCCATAACCTATCCAAAGAGGCCTTCGGGGATTGGCAGCCAATAAG---AGCACTGGAGTGTGAGAATCAAATTCTGACTATTCAAGGTGCCCTCACAAATATATGCCCTACAATAATGGGTTCAGCTTGGTACTATTCCCAGACGGGTGGAAGCCTTCAAACTGACTATTTCTCAGTGGCCTT Lampropeltis_alterna GGAGCCTTTGCAGGCAGTTGCTTCCGCGACAAA-CGGAAGTAGCTATACTAATCTCCCTTTATTTCTTTGTCGGTAAATTTAAATTTAACACAAAATAGTTTATTGTAACCTTCTTATTCTTTTGACTGTGTTGCTGGCTGATAAAAGCGGCTCAGCCTATAAAATAATGATTTACTTTAAACTGAACCATTTCCATAACCTATCCAAAGAGGCCTTCGGGGATTGACAGCCAATAAG---AGCACTGGAGTGTGAGAATCAACTTCTGACTATTCAAGGTGCCCTCACAAATATATGCCCTACAATAATGGGTTCAGCTTGGTACTATTCCCAGACCGGTGGAAGCCTTCAAATTGACTATTTCTCAGTGGCCTT Lampropeltis_californiae GGAGCCTTTGCAGGCAGTTGCTTCCGCGACAAA-CGGAAGTAGCTATACTAATCTCCCTTTATTTCTTTGTCGGTAAATTTAAATTTAACACAAAATAGTTTATTGTAACCTTCTTATTCTTTTGACTGTGTTG-TGGCTGATAAAAGCGGCTCAGCCTATAAAATAATGATTTACTTTAAACTGAACCATTTCCATAACCTATCCAAAGAGGCCTTCGGGGATTGGCAGCCAATAAG---AGCACTGGAGTGTGAGAATCAAATTCTGACTACTCAAGGTGCCCTCACAAATATATGCCCTACAATAATGGGTTCAGCTTGGTACTATTCCCAGACCGGTGGAAGCCTTCAAATTGACTATTTCTCAGTGGCCTT Lampropeltis_calligaster GGAGCCTTTGCAGGCAGTTGCTTCCGCGACAAA-CGGAAGTAGCTATACTAATCTCCCTTTATTTCTTTGTCGGTAAATTTAAATTTAACACAAAATAGTTTATTGTAACCTTCTTATTCTTTTGACTGTGTTGCTGGCTGATAAAAGCGGCTCAGCCTATAAAATAATGATTTACTTTAAACTGAACCATTTCCATAACCTATCCAAAGAGGCCTTCGGGGATTGGCAGCCAATAAG---AGCACTGGAGTGTGAGAATCAACTTCTGACTATTCAAGGTGCCCTCACAAATATATGCCCTACAATAATGGATTCAGCTTGGTACTATTCCCAGACCGGTGGAAGCCTTCAAACTGACTATTTCTCAGTGGCCTT Lampropeltis_elapsoides GGAGCCTTTGCAGGCAGTTGCTTCCGCGACAAA-CGGAAGTAGCTATACTAATCTCCCTTTATTTCTTTGTCGGTAAATTTAAATTTAACACAAAATAGTTTATTGTAACCTTCTTATTCTTTTGACTGTGTTGCTGGCTGATAAAAGCGGCTCAGCCTATAAAATAATGATTTACTTTAAACTGAACCATTTCCATAACCTATCCAAAGAGGCCTTCGGGGATTGGCAGCCAATAAG---AGCACTGGAGTGTGAGAATCAAATTCTGACTACTCAAGGTGCCCTCACAAATATATGCCCTACAATAATGGGTTCAGCTTGGTACTATTCCCAGACCGGTGGAAGCCTTCAAATTGACTATTTCTCAGTGGCCTT Lampropeltis_extenuata GGAGCCTTTGCAGGCAGTTGCTTCCGCGACAAA-CGGAAGTAGCTATACTAATCTCCCTTTATTTCTTTGTCGGTAAATTTAAATTTAACACAAAATAGTTTATTGTAACCTTCTTATTCTTTTGACTGTGTTGCTGGCTGATAAAAGCAGCTCAG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Lampropeltis_getula GGAGCCTTTGCAGGCAGTTGCTTCCGCGACAAA-CGGAAGTAGCTATACTAATCTCCCTTTATTTCTTTGTCGGTAAATTTAAATTTAACACAAAATAGTTTATTGTAACCTTCTTATTCTTTTGACTGTGTTG-TGGCTGATAAAAGCGGCTCAGCCTATAAAATAATGATTTACTTTAAACTGAACCATTTCCATAACCTATCCAAAGAGGCCTTCGGGGATTGGCAGCCAATAAG---AGCACTGGAGTGTGAGAATCAAATTCTGACTACTCAAGGTGCCCTCACAAATATATGCCCTACAATAATGGGTTCAGCTTGGTACTATTCCCAGACCGGTGGAAGCCTTCAAATTGACTATTTCTCAGTGGCCTT Lampropeltis_holbrooki GGAGCCTTTGCAGGCAGTTGCTTCCGCGACAAA-CGGAAGTAGCTATACTAATCTCCCTTTATTTCTTTGTCGGTAAATTTAAATTTAACACAAAATAGTTTATTGTAACCTTCTTATTCTTTTGACTGTGTTGTTGGCTGATAAAAGCGGCTCAGCCTATAAAATAATGATTTACTTTAAACTGAACCATTTCCATAACCTATCCAAAGAGGCCTTCGGGGATTGGCAGCCAATAAG---AGCACTGGAGTGTGAGAATCAAATTCTGACTACTCAAGGTGCCCTCACAAATATATGCCCTACAATAATGGGTTCAGCTTGGTACTATTCCCAGACCGGTGGAAGCCTTCAAACTGACTATTTCTCAGTGGCCTT Lampropeltis_knoblochi GGAGCCTTTGCAGGCAGTTGCTTCCGCGACAAA-CGGAAGTAGCTATACTAATCTCTCTTTATTACTTTGTCGGTAAATTTAAATTTAACACAAAATAGTTTATTGTAACCTTCTTATTCTTTTGACTGTGTTGCTGGCTGATAAAAGCGGCTCAGCCTATAAAATAATGATTTACTTTAAACTGAACCATTTCCATAACCTATCCAAAGAGGCCTTCGGGGATTGGCAGCCAATAAA---AGCACTGGAGTGTGAGAATCAAATTCTGACTACTCAAGGTGCCCTCACAAATATATGCCCTACAATAATGGGTTCAGCTTGGTACTATTCCCAGACCGGTGGAAGCCTTCAAACTGACTATTTCTCAGTGGCCT- Lampropeltis_mexicana GGAGCCTTTGCAGGCAGTTGCTTCCACGAAAAAACGGAAGTAGCTATACTAATCTCCCTTTATTTCTTTGTCGGTAAATTTAAATTTAACACAAAATAGTTTATTGTAACCTTCTTATTCTTTTGACTGTGTTGCTGGCTGATAAAAGCGGCTCAGCCTATAAAATAATGATTTACTTTAAACTGAACCATTTCCATAACCTATCCAAAGAGGCCTTCGGGGATTGGCAGCCAATAAG---AGCACTGGAGTGTGAGAATCAAATTCTGACTATTCAAGGTGCCCTCACAAATATATGCCCTACAATAATGGGTTCAGCTTGGTACTATTCCCAGATCGGTGGAAGCCTTCAAACTGACTATTTCTCAGTGGCCTT Lampropeltis_nigra GGAGCCTTTGCAGGCAGTTGCTTCCGCGACAAA-CGGAAGTAGCTATACTAATCTCCCTTTATTTCTTTGTCGGTAAATTTAAATTTAACACAAAATAGTTTATTGTAACCTTCTTATTCTTTTGACTGTGTTGCTGACTGATAAAAGCGGCTCAGCCTATAAAATAATGATTTACTTTAAACTGAACCATTTCCATAACCTATCCAAAGAGGCCTTCGGGGATTGGCAGCCAATAAG---AGCACTGGAGTGTGAGAATCAAATTCTGACTACTCAAGGTGCCCTCACAAATATATGCCCTACAATAATGGGTTCAGCTTGGTACTATTCCCAGACCGGTGGAAGCCTTCAAATTGACTATTTCTCAGTGGCCTT Lampropeltis_pyromelana GGAGCCTTTGCAGGCAGTTGCTTCCGCGACAAA-CGGAAGTAGCTATACTAATCTCTCTTTATTACTTTGTCGGTAAATTTAAATTTAACACAAAATAGTTTATTGTAACCTTCTTATTCTTTTGACTGTGTTGCTGGCTGATAAAAGCGGCTCAGCCTATAAAATAATGATTTACTTTAAACTGAACCATTTCCATAACCTATCCAAAGAGGCCTTCGGGGATTGGCAGCCAATAAA---AGCACTGGAGTGTGAGAATCAAATTCTGACTACTCAAGGTGCCCTCACAAATATATGCCCTACAATAATGGGTTCAGCTTGGTACTATTCCCAGACCGGTGGAAGCCTTCAAACTGACTATTTCTCAGTGGCCTT Lampropeltis_ruthveni GGAGCCTTTGCAGGCAGTTGCTTCCACGAAAAAACGGAAGTAGCTATACTAATCTCCCTTTATTTCTTTGTCGGTAAATTTAAATTTAACACAAGATAGTTTATTGTAACCTTCTTATTCTTTTGACTGTGTTGCTGGCTGATAAAAGCGGCTCAGCCTATAAAATAATGATTTACTTTAAACTGAACCATTTCCATAACCTATCCAAAGAGGCCTTCGGGGATTGGCAGCCAATAAG---AG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Lampropeltis_splendida GGAGCCTTTGCAGGCAGTTGCTTCCGCGACAAA-CGGAAGTAGCTATACTAATCTCCCTTTATTTCTTTGTCGGTAAATTTAAATTTAACACAAAATAGTTTATTGTAACCTTCTTATTCTTTTGACTGTGTTGCTGGCTGATAAAAACGGCTCAGCCTATAAAATAATGATTTACTTTAAACTGAACCATTTCCATAACCTATCCAAAGAGGCCTTCGGGGATTGGCAGCCAATAAG---AGCACTGGAGTGTGAGAATCAAATTCTGACTACTCAAGGTGCCCTCACAAATATATGCCCTACAATAATGGGTTCAGCTTGGTACTATTCCCAGACCGGTGGAAGCCTTCAAACTGACTATTTCTCAGTGGCCT- Lampropeltis_triangulum_CA GGAGCCTTTGCAGGCAGTTGCTTCCACGAAAAAACGGAAGTAGCTATACTAATCTCCCTTTATTTCTTTGTCGGTAAATTTAAATTTAACACAAAATAGTTTATTGTAACCTTCTTATTCTTTTGACTGTGTTGCTGGCTGATAAAAGCGGCTCAGCCTATAAAATAATGATTTACTTTAAACTGAACCATTTCCATAACCTATCCAAAGAGGCCTTCGGGGATTGGCAGCCAATAAG---AGCACTGGAGTGTGAGAATCAAATTCTGACTACTCAAGGTGCCCTCACAAATATATGCCCTACAATAATGGGTTCAGCTTGGTACTATTCCCAGACCGGTGGAAGCCTTCAAATTGACTATTTCTCAGTGGCCTT Lampropeltis_triangulum_Eastern GGAGCCTTTGCAGGCAGTTGCTTCCGCGACAAA-CGGAAGTAGCTATACTAATCTCCCTTTATTTCTTTGTCGGTAAATTTAAATTTAACACAAAATAGTTTATTGTAACCTTCTTATTCTTTTGACTGTGTTGCTGGCTGATAAAAGCGGCTCAGCCTATAAAATAATGATTTACTTTAAACTGAACCATTTCCATAACCTATCCAAAGAGGCCTTCG------GGCAGCCAATAAG---AGCACTGGAGTGTGAGAATCAAATTCTGACTATTCAAGGTGCCCTCACAAATATATGCCCTACAATAATGGGTTCAGCTTGGTACTATTCCC------------------------------------------- Lampropeltis_triangulum_MX GGAGCCTTTGCAGGCAGTTGCTTCCACGAAAAAACGGAAGTAGCTATACTAATCTCCCTTTATTTCTTTGTCGGTAAATTTAAATTTAACACAAAATAGTTTATTGTAACCTTCTTATTCTTTTGACTGTGTTGCTGGCTGATAAAAGCGGCTCAGCCTATAAAATAATGATTTACTTTAAACTGAACCATTTCCATAACCTATCCAAAGAGGCCTTCGGGGATTGGCAGCCAATAAG---AGCACTGGAGTGTGAGAATCAAATTCTGACTATTCAAGGTGCCCTCACAAATATATGCCCTACAATAATGGGTTCAGCTTGGTACTATTCCCAGACCGGTGGAAGCCTTCAAACTGACTATTTCTCAGTGGCCTT Lampropeltis_triangulum_SA GGAGCCTTTGCAGGCAGTTGCTTCCACGAAAAAACGGAAGTAGCTATACTAATCTCCCTTTATTTCTTTGTCGGTAAATTTAAATTTAACACAAAATAGTTTATTGTAACCTTCTTATTCTTTTGACTGTGTTGCTGGCTGATAAAAGCGGCTCAGCCTATAAAATAATGATTTACTTTAAACTGAACCATTTCCATAACCTATCCAAAGAGGCCTTCGGGGATTGGCAGCCAATAAG---AGCACTGGAGTGTGAGAATCAAATTCTGACTACTCAAGGTGCCCTCACAAATATATGCCCTACAATAATGGGTTCAGCTTGGTACTATTCCCAGACCGGTGGAAGCCTTCAAATTGACTATTTCTCAGTGGCCTT Lampropeltis_triangulum_Tamaulipas GGAGCCTTTGCAGGCAGTTGCTTCCGCGACAAA-CGGAAGTAGCTATACTAATCTCCCTTTATTTCTTTGTCGGTAAATTTAAATTTAACACAAAATAGTTTATTGTAACCTTCTTATTCTTTTGACTGTGTTGCTGGCTGATAAAAGCGGCTCAGCCTATAAAATAATGATTTACTTTAAACTGAACCATTTCCATAACCTATCCAAAGAGGCCTTCAGGGATTGGCAGCCAATAAG---AGCACTGGAGTGTGAGAATCAAATTCTGACTACTCAAGGTGCCCTCACAAATATATGCCCTACAATAATGGGTTCAGCTTGGTACTATTCCCAGACCGGTGGAAGCCTTCAAATTGACTATTTCTCAGTGGCCTT Lampropeltis_triangulum_Western GGAGCCTTTGCAGGCAGTTGCTTCCGCGACAAA-CGGAAGTAGCTATACTAATCTCCCTTTATTTCTTTGTCGGTAAATTTAAATTTAACACAAAATAGTTTATTGTAACCTTCTTATTCTTTTGACTGTGTTGCTGGCTGATAAAAGCGGCTCAGCCTATAAAATAATGATTTACTTTAAACTGAACCATTTCCATAACCTATCCAAAGAGGCCTTCGGGGATTGGCAGCCAATAAG---AGCACTGGAGTGTGAGAATCAAATTCTGACTATTCAAGGTGCCCTCACAAATATATGCCCTACAATAATGGGTTCAGCTTGGTACTATTCCCAGACCGGTGGAAGCCTTCAAATTGACTATTTCTCAGTGGCCTT Lampropeltis_webbi GGAGCCTTTGCAGGCAGTTGCTTCCACGAAAAAACGGAAGTAGCTATACTAATCTCCCTTTATTTCTTTGTCGGTAAATTTAAATTTAACACAAAATAGTTTATTGTAACCTTCTTATTCTTTTGACTGTGTTGCTGGC-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTGACTACTCAAGGTGCCCTCACAAATATATGCCCTACAATAATGGGTTCAGCTTGGTACTATTCCCAGACCGGTGGAAGCCTTCAAATTGACTATTTCTCAGTGGCCTT Lampropeltis_zonata GGAGCCTTTGCAGGCAGTTGCTTCCGCGACAAA-CGGAAGTAGCTATACTAATCTCTCTTTATTACTTTGTCGGTAAATTTAAATTTAACACAAAATAGTTTATTGTAACCTTCTTATTCTTTTGACTGTGTTGCTGGCTGATAAAAGCGGCTCAGCCTATAAAATAATGATTTACTTTAAACTGAACCATTTCCATAACCTATCCAAAGAGGCCTTCGGGGATTGGCAGCCAATAAG---AGCACTGGAGTGTGAGAATCAAATTCTGACTACTCAAGGTGCCCTCACAAATATATGCCCTACAATAATGGGTTCAGCTTGGTACTATTCCCAGACCGGTGGAAGCCTTCAAACTGACTATTTCTCAGTGGCCTT ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M20122] TITLE 1_sptbn1; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep12824; DIMENSIONS NCHAR=840; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Arizona_elegans GATGCCAGTTGTAACCCCATACACGTTAGGTGTTCAAAGAGATAGAAGATACTAATTATTAGTTTATTGTAACCACCCAAAGTCACATTTTGTGAGCCACATAAATTAGACCAGTGAGTACATAAAAGTATATTGTCAAGTGGAAGGGAACATGCACACACCCAGATTCTCTGGACATGCCTATTCTAGCATCATATACCTGTGCTTCGAGCACAATATTTAAATAAGATGTTCATTTGTAGAAACAACACATGTAGATAAGAAGTGTACAGATTTAATAATTACGGTGACCCAGCCCCAGTTCCAGCATTTTTCACGAATTTTCCTTTCCATTCCTTCTTTCTGGCTTAATGTAGCCATTATTCCAGATGTTAAAAACAAAAAGCCAGCCAAATCTGGTCACAGGATGTGATGGGTTTATATAAGAAAAATCTGTTGAGGATAATTATGTACACTACCTGGGGTTTCTTCAGAATTTCCTACAGTTTGCTGATGTTATTTCATCACATCACAGAAGGAAATTTTAAAGGATCTTTTAGAAGAACAGATTATTTTACTCCCTGTATTGCAAAGATTTTGGATGCATAGAACTTGGGCTGTCTGTTTGCATCTTGGGAAGTGGTAGTGGAGGAATGAAGAGTGAT-TCTGAAGTTCCACCAGAGAGTTGCTTTAACTTGTGCTAGGAGATGTCTCTGAAGTTTGCATGTATTAAATTGAAATCATTTTGATTGAAAAATCTATGACCATATTTTAAGGAACTAGCATTCTCTATGACTGTTGGTGTATAATGTAATATTCTCTTGCGATTAATTTTTCATGTCCTCTTTCTGCCTGTGGA- Cemophora_coccinea GATGCCAGTTGTAACCCCATGTACGTTAGGTGTTCAAAGAGATAGAAGATACTAATTATTAGTTTATTGTAACTACCCAAAGTCACCTTTTGTGAGCCACATAAATTAGACCAGTGAGTACATAAAAGTAAACTGTCAAGTGGAAGGGAACATGCACACACCCAGATTCTCTGGACATGCCTATTC---CATCATATACCTGTGCTTCGAGCACAATATTTAAATAAGATGTTCATTTGTAGAAACAACACATGTAGATAAGAAGTGTACAGATTTAATAATTACGGTGACCCAGCCCCAGTTCCAGCATTTTTCACGAATTTTCCTTTCCATTCCTTCTTTCTGGCTTAATGTAGCCATTATTCCAGATGTTAAAAACAAAAAGCCAGCCAAATCTGGTCACAGGATGTGATGGGTTTATATAAGAAAAATCTGTTGAGGATAATTATGTACTCTACCTGGGGTTTCTTCAGAATTTCCTACAGTTTGCTGATGTTATTTCATCACATCACAGAAGGAAATTTTAAAGGACCTTTTAGAAGAACAGATTATTTTACTCCCTGTATTGCAAAGATTTTGGATGCATAGAACTTGGGCTGTCTGTTTGCATCTTGGGAAGTGGTAGTGGAGGAATGAAGAGTGATGTCTGAAGTTCCACCAGAGAGTTGCTTTAACTTGTGCTAGGAGATGTCTCTGAAGTTTGCATGTATTAAATTGAAATCATTTAGATTGAAAAATCTATGACCATATTTTAAGGAACTAGCATTCTCTATGTCTGTTGGTGTATAATGTAATATTCTCTTGCGATTAATTTTTCATGTCCTCTTTCTGCCTGTGGA- Lampropeltis_alterna GATGCCAGTTGTAACCCCATGTACGTTAGGTGTTCAAAGAGATAGAAGATACTAATTATTAGTTTATTGTAACCACCCAAAGTCACCTTTTGTGAGCCACATAAATTAGACCAGTGAGTACATAAAAGTAAACTGTCAAGTGGAAGGAAACATGCACATACCCAGATTCTCTGGACATGCCTATTC---CATCATATACCTGTGCTTCGAGCACAATATTTAAATAAGATGTTCATTTGTAGAAACAACACATGTAGATAAGAAGTGTACAGATTTAATCATTACGGTGACCCAGCCCCAGTTCCAGCATTTTTCACGAATTTTCCTTTCCATTCCTTCTTTTTGGCTTAATGTAGCCATTATTCCAGATGTTAAAAACAAAAAGCCAGCCAAATCTGGTCACAGGATGTGATGGGTTTATATAAGAAAAATCTGTTGAGGATAATTATGTACTCTACCTGGGGTTTCTTCAGAATTTCCTACAGTTTGCTGATGTTATTTCATCACATCACAGAAGGAAATTTTAAAGGACCTTTTAGAAGAACAGATTATTTTACTCCCTGTATTGCAAAGATTTTGGATGCATAGAACTTGGGCTGTCTGTTTGCATCTTGGGAAGTGGTAGTGGAGGAATGAAGAGTGATGTCTGAAGTTCCACCAGAGAGTTGCTTTAACTTGTGCTAGGAGATGTCTCTGAAGTTTGCATGTATTAAATTGAAATCATTTAGATTGAAAAATCTATGACCATATTTTAAGGAACTAGCATTCTCTATGTCTGTTGGTGTATAATGTAATATTCTCTTGCGATTAATTTTTCATGTCCTCTTTCTGCCTGTGGA- Lampropeltis_californiae GATGCCAGTTGTAACCCCATGTACGTTAGGTGTTCAAAGAGATAGAAGATACTAATTATTAGTTTATTGTAACCACCCAAAGTCACCTTTTGTGAGCCACATAAATTAGACCAGTGAGTACATAAAAGTAAACTGTCAAGTGGAAGGGAACATGCACATACCCAGATTCTCTGGACATGCCTATTC---CATCATATACCTGTGCTTCGAGCACAGTATTTAAATAAGATGTTCATTTGTAGAAACAACACATGTAGATAAGAAGTGTACAGATTTAATAATTACGGTGACCCAGCCCCAGTTCCAGCATTTTTCACGAATTTTCCTTTCCATTCCTTCTTTCTGGCTTAATGTAGCCATTATTCCAGATGTTAAAAACAAAAAGCCAGCCAAATCTGGTCACAGGATGTGATGGGTTTATATAAGAAAAATCTGTTGAGGATAATTATGTACTCTACCTGGGGTTTCTTCAGAATTTCCTACAGTTTGCTGATGTTATTTCATCACATCACAGAAGGAAATTTTAAAGGACCTTTTAGAAGAACAGATTATTTTACTCCCTGTATTGCAAAGATTTTGGATGCATAGAACTTGGGCTGTCTGTTTGCATCTTGGGAAGTGGTAGTGGAGGAATGAAGAGTGATGTCTGAAGTTCCACCAGAGAGTTGCTTTAACTTGTGTTAGGAGATGTCTCTGAAGTTTGCATGTATTAAATTGAAATCATTTAGATTGAAAAATCTATGACCATATTTTAAGGAACTAGCATTCTTTATGTCTATTGGTGTATAATGTAATATTCTCTTGCGATTAATTTTTCATGTCCCCTTTCTGCCTGTGGA- Lampropeltis_calligaster -----------------------------------------ATAGAAGATACTAATTATTAGTTTATTGTAACTACCCAAAGTCACCTTTTGTGAGCCACATAAATTAGACCAGTGAGTACATAAAAGTAAACTGTCAAGTGGAAGGGAACATGCACACACCCAGATTCTCTGGACATGCCTATTC---CATCATATACCTGTGCTTCGAGCACAATATTTAAATAAGATGTTCATTTGTAGAAACAACACATGTAGATAAGAAGTGTACAGATTTAATAATTACGGTGACCCAGCCCCAGTTCCAGCATTTTTCACGAATTTTCCTTTCCATTCCTTCTTTCTGGCTTAATGTAGCCATTATTCCAGATGTTAAAAACAAAAAGCCAGCCAAATCTGGTCACAGGATGTGATGGGTTTATATAAGAAAAATCTGTTGAGGATAATTATGTACTCTACCTGGGGTTTCTTCAGAATTTCCTACAGTTTGCTGATGTTATTTCATCACATCACAGAAGGAAATTTTAAAGGACCTTTTAGAAGAACAGATTATTTTACTCCCTGTATTGCAAAGATTTTGGATGCATAGAACTTGGGCTGTCTGTTTGCATCTTGGGAAGTGGTAGTGGAGGAATGAAGAGTGATGTCTGAAGTTCCACCAGAGAGTTGCTTTAACTTGTGCTAGGAGATGTCTCTGAAGTTTGCATGTATTAAATTGAAATCATTTAGATTGAAAAATCTATGACCATATTTTAAGGAACTAGCATTCTCTATGTCTATTGGTGTATAATGTAATATTCTCTTGCGATTAATTTTTCATGTCCCCTTTCTGCCTGTGGA- Lampropeltis_elapsoides GATGCCAGTTGTAACCCCATGTATGTTAGGTGTTCAAAGAGATAGAAGATACTAATTATTAGTTTATTGTAACCACCCAAAGTCACCTTTTGTGAGCCACATAAATTAGACCAGTGAGTACATAAAAGTAAACTGTCAAGTGGAAGGGAACATGCACATACCCAGATTCTCTGGACATGCCTATTC---CATCATATACCTGTGCTTCGAGCACAATATTTAAATAAGATGTTCATTTGTAGAAACAACACATGTAGATAAGAAGTGTACAGATTTAATCATTACGGTGACCCAGCCCCAGTTCCAGCATTTTTCACGAATTTTCCTTTCCATTCCTTCTTTTTGGCTTAATGTAGCCATTATTCCAGATGTTAAAAACAAAAAGCCAGCCAAATCTGGTCACAGGATGTGATGGGTTTATATAAGAAAAATCTGTTGAGGATAATTATGTACTCTACCTGGGGTTTCTTCAGAATTTCCTACAGTTTGCTGATGTTATTTCATCACATCACAGAAGGAAATTTTAAAGGACCTTTTAGAAGAACAGATTATTTTACTCCCTGTATTGCAAAGATTTTGGATGCATAGAACTTGGGCTGTCTGTTTGCATCTTGGGAAGTGGTAGTGGAGGAATGAAGAGTGATGTCTGAAGTTCCACCAGAGAGTTGCTTTAACTTGTGCTAGGAGATGTCTCTGAAGTTTGCATGTATTAAATTGAAATCATTTAGATTGAAAAATCTATGACCATATTTTAAGGAACTAGCATTCTCTATGTCTGTTGGTGTATAATGTGATATTCTCTTGCGATTAATTTTTCATGTCCTCTTTCTGCCTGTGGA- Lampropeltis_extenuata GATGCCAGTTGTAACCCCATGTACGTTAGGTGTTCAAAGAGATAGAAGATACTAATTATCAGTTTATTGTAACCACCCAAAGTCACCTTTTGTGAGCCACATAAATTAGACCAGTGAGTACATAAAAGTAAACTGTCAAGTGGAAGGGAACATGCACATACCCAGATTCTCTGGACATGCCTATTC---CATCATATACCTGTGCTTCGAGCACAATATTTAAATAAGATGTTCATTTGTAGAAACAACACATGTAGATAAGAAGTGTACAGATTTAATAATTACAGTGACCCAGCCCCAGTTCCAGCATTTTTCACGAATTTTCCTTTCCATTCCTTCTTTCTGGCTTAATGTAGCCATTATTCCAGATGTTAAAAACAAAAAGCCAGCCAAATCTGGTCACTGGATGTGATGGGTTTATATAAGAAAAATCTGTTGAGGATAATTATGTACTCTACCTGGGGTTTCTTCAGAATTTCCTACAGTTTGCTGATGTTATTTCATCACATCACAGAAGGAAATTTTAAAGGACCTTTTAGAAGAACAGATTATTTTACTCCCTGTATTGCAAAGATTTTGGATGCATAGAACTTGGGCTGTCTGTTTGCATCTTGGGAAGTGGTAGTGGAGGAATGAAGAGTGATGTCTGAAGTTCCACCAGAGAGTTGCTTTAACTTATGCTAGGAGATGTCTCTGAAGTTTGCATGTATTAAATTGAAATCATTTAGATTGAAAAATCTATGACCATATTTTAAGGAACTAGCATTCTCTATGTCTATTGGTGTATAATGTAATATTCTCTTGCGATTAATTTTTCATGTCCCCTTTC----------- Lampropeltis_getula GATACCAGTTGTAACCCCATGTACGTTAGGTGTTCAAAGAGATAGAAGATACTAATTATTAGTTTATTGTAACCACCCAAAGTCACCTTTTGTGAGCCACATAAATTAGACCAGTGAGTACATAAAAGTAAACTGTCAAGTGGAAGGGAACATGCACATACCCAGATTCTCTGGACATGCCTATTC---CATCATATACCTGTGCTTCGAGCACAATATTTAAATAAGATGTTCATTTGTAGAAACAACACATGTAGATAAGAAGTGTACAGATTTAATAATTACGGTGACCCAGCCCCAGTTCCAGCATTTTTCACGAATTTTCCTTTCCATTCCTTCTTTCTGGCTTAATGTAGCCATTATTCCAGATGTTAAAAACAAAAAGCCAGCCAAATCTGGTCACAGGATGTGATGGGTTTATATAAGAAAAATCTGTTGAGGATAATTATGTACTCTACCTGGGGTTTCTTCTGAATTTCCTACAGTTTGCTGATGTTATTTCATCACATCACAGAAGGAAATTTTAAAGGACCTTTTAGAAGAACAGATTATTTTACTCCCTGTATTGCAAAGATTTTGGATGCATAGAACTTGGGCTGTCTGTTTGCATCTTGGGAAGTGGTAGTGGAGGAATGAAGAGTGATGTCTGAAGTTCCACCAGAGAGTTGCTTTAACTTGTGCTAGGAGATGTCTCTGAAGTTTGCATGTATTAAATTGAAATCATTTAGATTGAAAAATCTATGACCATATTTTAAGGAACTAGCATTCTCTATGTCTATTGGTGTATAATGTAATATTCTCTTGCGATTAATTTTTCATGTCCCCTTTCTGCCTGTGGA- Lampropeltis_holbrooki GATGCCAGTTGTAACCCCATGTACGTTAGGTGTTCAAAGAGATAGAAGATACTAATTATTAGTTTATTGTAACCACCCAAAGTCACCTTTTGTGAGCCACATAAATTAGACCAGTGAGTACATAAAAGTAAACTGTCAAGTGGAAGGGAACATGCACATACCCAGATTCTCTGGACATGCCTATTC---CATCGTATACCTGTGCTTCGAGCACAATATTTAAATAAGATGTTCATTTGTAGAAACAACACATGTAGATAAGAAGTGTACAGATTTAATAATTACGGTGACCCAGCCCCAGTTCCAGCATTTTTCACGAATTTTCCTTTCCATTCCTTCTTTCTGGCTTAATGTAGCCATTATTCCAGATGTTAAAAACAAAAAGCCAGCCAAATCTGGTCACAGGATGTGATGGGTTTATATAAGAAAAATCTGTTGAGGATAATTATGTACTCTACCTGGGGTTTCTTCAGAATTTCCTACAGTTTGCTGATGTTATTTCATCACATCACAGAAGGAAATTTTAAAGGACCTTTTAGAAGAACAGATTATTTTACTCCCTGTATTGCAAAGATTTTGGATGCATAGAACTTGGGCTGTCTGTTTGCATCTTGGGAAGTGGTAGTGGAGGAATGAAGAGTGATGTCTGAAGTTCCACCAGAGAGTTGCTTTAACTTGTGCTAGGAGATGTCTCTGAAGTTTGCATGTATTAAATTGAAATCATTTAGATTGAAAAATCTATGACCATATTTTAAGGAACTAGCATTCTCTATGTCTATTGGTGTATAATGTAATATTCTCTTGCGATTAATTTTTCATGTCCCCTTTCTGCCTGTGGA- Lampropeltis_knoblochi -----------------------------------------ATAGAAGATACTAATTATTAGTTTATTGTAACCACCCAAAGTCACCTTTTGTGAGCCACATAAATTAGACCAGTGAATACATAAAAGTAAACTGTCAAGTGGAAGGAAACATGCACATACCCAGATTCTCTGGACATGCCTATTC---CATCATATACCTGTGCTTCGAGCACAATATTTAAATAAGATGTTCATTTGTAGAAACAACACATGTAGATAAGAAGTGTACAGATTTAATCATTACGGTGACCCAGCCCCAGTTCCAGCATTTTTCACGAATTTTCCTTTCCATTCCTTCTTTTTGGCTTAATGTAGCCATTATTCCAGATGTTAAAAACAAAAAGCCAGCCAAATCTGGTCACAGGATGTGATGGGTTTATATAAGAAAAATCTGTTGAGGATAATTATGTACTCTACCTGGGGTTTCTTCAGAATTTCCTACAGTTTGCTGATGTTATTTCATCACATCACAGAAGGAAATTTTAAAGGACCTTTTAGAAGAACAGATTATTTTACTCCCTGTATTGCAAAGATTTTGGATGCATAGAACTTGGGCTGTCTGTTTGCATCTTGGGAAGTGGTAGTGGAGGAATGAAGAGTGATGTCTGAAGTTCCACCAGAGAGTTGCTTTAACTTGTGCTAGGAGATGTCTCTGAAGTTTGCATGTATTAAATTGAAATCATTTAGATTGAAAAATCTATGACCATATTTTAAGGAACTAGCATTCTCTATGTCTGTTGGTGTATAATGTAATATTCTCTTGCGATTAATTTTTCATGTCCTCTTTCTGCCTGTGGA- Lampropeltis_mexicana GATGCCAGTTGTAACCCCATGTACGTTAGGTGTTCAAAGAGATAGAAGATACTAATTATTAGTTTATTGTAACCACCCAAAGTCACCTTTTGTGAGCCACATAAATTAGACCAGTGAGTACATAAAAGTAAACTGTCAAGTGGAAGGAAACATGCACATACCCAGATTCTCTGGACATGCCTATTC---CATCATATACCTGTGCTTCGAGCACAATATTTAAATAAGATGTTCATTTGTAGAAACAACACATGTAGATAAGAAGTGTACAGATTTAATCATTACGGTGACCCAGCCCCAGTTCCAGCATTTTTCACGAATTTTCCTTTCCATTCCTTCTTTTTGGCTTAATGTAGCCATTATTCCAGATGTTAAAAACAAAAAGCCAGCCAAATCTGGTCACAGGATGTGATGGGTTTATATAAGAAAAATCTGTTGAGGATAATTATGTACTCTACCTGGGGTTTCTTCAGAATTTCCTACAGTTTGCTGATGTTATTTCATCACATCACAGAAGGAAATTTTAAAGGACCTTTTAGAAGAACAGATTATTTTACTCCCTGTATTGCAAAGATTTTGGATGCATAGAACTTGGGCTGTCTGTTTGCATCTTGGGAAGTGGTAGTGGAGGAATGAAGAGTGATGTCTGAAGTTCCACCAGAGAGTTGCTTTAACTTGTGCTAGGAGATGTCTCTGAAGTTTGCATGTATTAAATTGAAATCATTTAGATTGAAAAATCTATGACCATATTTTAAGGAACTAGCATTTTCTATGTCTGTTGGTGTATAATGTAATATTCTCTTGCGATTAATTTTTCATGTCCTCTTTCTGCCTGTGGA- Lampropeltis_nigra GATGCCAGTTGTAACCCCATGTACGTTAGGTGTTCAAAGAGATAGAAGATACTAATTATTAGTTTATTGTAACCACCCAAAGTCACCTTTTGTGAGCCACATAAATTAGACCAGTGAGTACATAAAAGTAAACTGTCAAGTGGAAGGGAACATGCACATACCCAGATTCTCTGGACATGCCTATTC---CATCATATACCTGTGCTTCGAGCACAATATTTAAATAAGATGTTCATTTGTAGAAACAACACATGTAGATAAGAAGTGTACAGATTTAATAATTACGGTGACCCAGCCCCAGTTCCAGCATTTTTCACGAATTTTCCTTTCCATTCCTTCTTTCTGGCTCAATGTAGCCATTATTCCAGATGTTAAAAACAAAAAGCCAGCCAAATCTGGTCACAGGATGTGATGGGTTTATATAAGAAAAATCTGTTGAGGATAATTATGTACTCTACCTGGGGTTTCTTCAGAATTTCCTACAGTTTGCTGATGTTATTTCATCACATCACAGAAGGAAATTTTAAAGGACCTTTTAGAAGAACAGATTATTTTACTCCCTGTATTGCAAAGATTTTGGATGCATAGAACTTGGGCTGTCTGTTTGCATCTTGGGAAGTGGTAGTGGAGGAATGAAGAGTGATGACTGAAGTTCCACCAGAGAGTTGCTTTAACTTGTGCTAGGAGATGTCTCTGAAGTTTGCATGTATTAAATTGAAATCATTTAGATTGAAAAATCTATGACCATATTTTAAGGAACTAGCATTCTCTATGTCTATTGGTGTATAATGTAATATTCTCTTGCGATTAATTTTTCATGTCCCCTTTCTGCCTGTGGA- Lampropeltis_pyromelana -----------------------------------------ATAGAAGATACTAATTATTAGTTTATTGTAACCACCCAAAGTCACCTTTTGTGAGCCACATAAATTAGACCAGTGAATACATAAAAGTAAACTGTCAAGTGGAAGGAAACATGCACATACCCAGATTCTCTGGACATGCCTGTTC---CATCATATACCTGTGCTTCGAGCACAATATTTAAATAAGATGTTCATTTGTAGAAACAACACATGTAGATAAGAAGTGTACAGATTTAATCATTACGGTGACCCAGCCCCAGTTCCAGCATTTTTCACGAATTTTCCTTTCCATTCCTTCTTTTTGGCTTAATGTAGCCATTATTCCAGATGTTAAAAACAAAAAGCCAGCCAAATCTGGTCACAGGATGTGATGGGTTTATATAAGAAAAATCTGTTGAGGATAATTATGTACTCTACCTGGGGTTTCTTCAGAATTTCCTACAGTTTGCTGATGTTATTTCATCACATCACAGAAGGAAATTTTAAAGGACCTTTTAGAAGAACAGATTATTTTACTCCCTGTATTGCAAAGATTTTGGATGCATAGAACTTGGGCTGTCTGTTTGCATCTTGGGAAGTGGTAGTGGAGGAATGAAGAGTGATGTCTGAAGTTCCACCAGAGAGTTGCTTTAACTTGTGCTAGGAGATGTCTCTGAAGTTTGCATGTATTAAATTGAAATCATTTAGATTGAAAAATCTATGACCATATTTTAAGGAACTAGCATTCTCTATGTCTGTTGGTGTATAATGTAATATTCTCTTGCGATTAATTTTTCATGTCCTCTTTCTGCCTGTGGA- Lampropeltis_ruthveni GATGCCAGTTGTAACCCCATGTACGTTAGGTGTTCAAAGAGATAGAAGATACTAATTATTAGTTTATTGTAACCACCCAAAGTCACCTTTTGTGAGCCACATAAATTAGACCAGTGAGTACATAAAAGTAAACTGTCAAGTGGAAGGAAACATGCACATACCCAGATTCTCTGGACATGCCTATTC---CATCATATACCTGTGCTTCGAGCACAATATTTAAATAAGATGTTCATTTGTAGAAACAACACATGTAGATAAGAAGTGTACAGATTTAATCATTACGGTGACCCAGCCCCAGTTCCAGCATTTTTCACGAATTTTCCTTTCCATTCCTTCTTTTTGGCTTAATGTAGCCATTATTCCAGATGTTAAAAACAAAAAGCCAGCCAAATCTGGTCACAGGATGTGATGGGTTTATATAAGAAAAATCTGTTGAGGATAATTATGTACTCTACCTGGGGTTTCTTCAGAATTTCCTACAGTTTGCTGATGTTATTTCATCACATCACAGAAGGAAATTTTAAAGGACCTTTTAGAAGAACAGATTATTTTACTCCCTGTATT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Lampropeltis_splendida GATGCCAGTTGTAACCCCATGTACGTTAGGTGTTCAAAGAGATAGAAGATACTAATTATTAGTTTATTGTAACCACCCAAAGTCACCTTTTGTGAGCCACATAAATTAGACCAGTGAGTACATAAAAGTAAACTGTCAAGTGGAAGGGAACATGCACATACCCAGATTCTCTGGACATGCCTATTC---CATCATATACCTGTGCTTCGAGCACAGTATTTAAATAAGATGTTCATTTGTAGAAACAACACATGTAGATAAGAAGTGTACAGATTTAATAATTACGGTGACCCAGCCCCAGTTCCAGCATTTTTCACGAATTTTCCTTTCCATTCCTTCTTTCTGGCTTAATGTAGCCATTATTCCAGATGTTAAAAACAAAAAGCCAGCCAAATCTGGTCACAGGATGTGATGGGTTTATATAAGAAAAATCTGTTGAGGATAATTATGTACTCTACCTGGGGTTTCTTCAGAATTTCCTACAGTTTGCTGATGTTATTTCATCACATCACAGAAGGAAATTTTAAAGGACCTTTTAGAAGAACAGATTATTTTACTCCCTGTATTGCAAAGATTTTGGATGCATAGAACTTGGGCTGTCTGTTTGCATCTTGGGAAATGGTAGTGGAGGAATGAAGAGTGATGTCTGAAGTTCCACCAGAGAGTTGCTTTAACTTGTGCTAGGAGATGTCTCTGAAGTTTGCATGTATTAAATTGAAATCATTTAGATTGAAAAATCTATGACCATATTTTAAGGAACTAGCATTCTTTATGTCTATTGGTGTATAATGTAATATTCTCTTGCGATTAATTTTTCATGTCCCCTTTCTGCCTGTGGA- Lampropeltis_triangulum_CA GATGCCAGTTGTAACCCCATGTACGTTAGGTGTTCAAAGAGATAGAAGATACTAATTATTAGTTTATTGTAACCACCCAAAGTCACCTTTTGTGAGCCACATAAATTAGACCAGTGAGTACATAAAAGTAAACTGTCAAGTGGAAGGGAACATGCACATACCCAGATTCTCTGGACATGCCTATTC---CATCATATACCTGTGCTTCGAGCACAATATTTAAATAAGATGTTCATTTGTAGAAACAACACATGTAGATAAGAAGTGTACAGATTTAATCATTACGGTGACCCAGCCCCAGTTCCAGCATTTTTCACGAATTTTCTTTTCCATTCCTTCTTTTTGGCTTAATGTAGCCATTATTCCAGATGTTAAAAACAAAAAGCCAGCCAAATCTGGTCACAGGATGTGATGGGTTTATATAAGAAAAATCTGTTGAGGATAATTATGTACTCTACCTGGGATTTCTTCAGAATTTCCTACAGTTTGCTGATGTTATTTCATCACATCACAGAAGGAAATTTTAAAGGGCCTTTTAGAAGAACAGATTATTTTACTCCCTGTATTGCAAAGATTTTGGATGCATAGAACTTGGGCTGTCTGTTTGCATCTTGGGAAGTGGTAGTGGAGGAATGAAGAGTGATGTCTGAAGTTCCACCAGAGAGTTGCTTTAACTTGTGCTAGGAGATGTCTCTGAAGTTTGCATGTATTAAATTGAAATCATTTAGTTTGAAAAATCTATGACCATATTTTAAGGAACTAGCATTCTCTATGTCTGTTGGTGTATAATGTAATATTCTCTTGCGATTAATTTTTCATGTCCTCTTTCTGCCTGTGGA- Lampropeltis_triangulum_Eastern GATGCCAGTTGTAACCCCATGTACGTTAGGTGTTCAAAGAGATAGAAGATACTAATTATTAGTTTATTGTAACCACCCAAAGTCACCTTTTGTGAGCCACATAAATTAGACCAGTGAGTACATAAAAGTAAACTGTCAAGTGGAAGGGAACATGCACACACCCAGATTCTCTGGACATGCCTATTC---CATCATATACCTGTGCTTCGAGCACAGTATTTAAATAAGATGTTCATTTGTAGAAACAACACATGTAGATAAGAAGTGTACAGATTTAATAATTACGGTGACCCAGCCCCAGTTCCAGCATTTTTCACGAATTTTCCTTTCCATTCCTTCTTTCTGGCTTAATGTAGCCATTATTCCAGATGTTAAAAACAAAAAGCCAGCCAAATCTGGTCACAGGATGTGATGGGTTTATATAAGAAAAATCTGTTGAGGATAATTATGTACTCTACCTGGGGTTTCTTCAGAATTTCCTACAGTTTGCTGATGTTATTTCATCACATCACAGAAGGAAATTTTAAAGGACCTTTTAGAAGAACAGATTATTTTACTCCCTGTATTGCAAAGATTTTGGATGCATAGAACTTGGGCTGTCTGTTTGCATCTTGAGAAGTGGTAGTGGAGGAATGAAGAGTGATGTCTGAAGTTCCACCAGAGAGTTGCTTTAACTTGTGCTAGGAGATGTCTCTGAAGTTTGCATGTATTAAATTGAAATCATTTAGATTGAAAAATCTATGACCATATTTTAAGGAACTAGCATTCTCTATGTCTGTTGGTGTATAATGTAATATTCTCTTGCGATTAATTTTTCATGTCCTCTTTCTGCCTGTGGA{AC} Lampropeltis_triangulum_MX GATGCCAATTGTAACCCCATGTACGTTAGGTGTTCAAAGAGATAGAAGATACTAATTATTAGTTTATTGTAACCACCCAAAGTCACCTTTTGTGAGCCACATAAATTAGACCAGTGAGTACATAAAAGTAAACTGTCAAGTGGAAGGGAACATGCACATACCCAGATTCTCTGGACATGCCTATTC---CATCATATACCTGTGCTTCGAGCACAATATTTAAATAAGATGTTCATTTGTAGAAACAACACATGTAGATAAGAAGTGTACAGATTTAATCATTACGGTGACCCAGCCCCAGTTCCAGCATTTTTCACGAATTTTCCTTTCCATTCCTTCTTTTTGGCTTAATGTAGCCATTATTCCAGATGTTAAAAACAAAAAGCCAGCCAAATCTGGTCACAGGATGTGATGGGTTTATATAAGAAAAATCTGTTGAGGATAATTATGTACTCTACCTGGGATTTCTTCAGAATTTCCTACAGTTTGCTGATGTTATTTCATCACATCACAGAAGGAAATTTTAAAGGACCTTTTAGAAGAACAGATTATTTTACTCCCTGTATTGCAAAGATTTTGGATGCATAGAACTTGGGCTGTCTGTTTGCATCTTGGGAAGTGGTAGTGGAGGAATGAAGAGTGATGTCTGAAGTTCCACCAGAGAGTTGCTTTAACTTGTGCTAGGAGATGTCTCTGAAGTTTGCATGTATTAAATTGAAATCATTTAGATTGAAAAATCTATGACCATATTTTAAGGAACTAGCATTCTCTATGTCTGTTGGTGTATAATGTAATATTCTCTTGCGATTAATTTTTCATGTCCTCTTTCTGCCTGTGGA- Lampropeltis_triangulum_SA GATGCCAGTTGTAACCCCATGTACGTTAGGTGTTCAAAGAGATAGAAGATACTAATTATTAGTTTATTGTAACCACCCAAAGTCACCTTTTGTGAGCCACATAAATTAGACCAGTGAGTACATAAAAGTAAACTGTCAAGTGGAAGGGAACATGCACATACCCAGATTCTCTGGACATGCCTATTC---CATCATATACCTGTGCTTCGAGCACAATATTTAAATAAGATGTTCATTTGTAGAAACAACACATGTAGATAAGAAGTGTACAGATTTAATCATTACGGTGACCCAGCCCCAGTTCCAGCATTTTTCACGAATTTTCCTTTCCATTCCTTCTTTTTGGCTTAATGTAGCCATTATTCCAGATGTTAAAAACAAAAAGCCAGCCAAATCTGGTCACAGGATGTGATGGGTTTATATAAGAAAAATCTGTTGAGGATAATTATGTACTCTACCTGGGATTTCTTCAGAATTTCCTACAGTTTGCTGATGTTATTTCATCACATCACAGAAGGAAATTTTAAAGGACCTTTTAGAAGAACAGATTATTTTACTCCCTGTATTGCAAAGATTTTGGATGCATAGAACTTGGGCTGTCTGTTTGCATCTTGGGAAGTGGTAGTGGAGGAATGAAGAGTGATGTCTGAAGTTCCACCAGAGAGTTGCTTTAACTTGTGCTAGGAGATGTCTCTGAAGTTTGCATGTATTAAATTGAAATCATTTAGTTTGAAAAATCTATGACCATATTTTAAGGAACTAGCATTCTCTATGTCTGTTGGTGTATAATGTAATATTCTCTTGCGATTAATTTTTCATGTCCTCTTTCTGCCTGTGGA- Lampropeltis_triangulum_Tamaulipas GATGCCAGTTGTAACCTCATGTACATTAGGTGTTCAAAGAGATAGAAGATACTAATTATTAGTTTATTGTAACCACCCAAAGTCACCTTTTGTGAGCCACATAAATTAGACCAGTGAGTACATAAAAGTAAACTGTCAAGTGGAAGGGAACATGCACATACCCAGATTCTCTGGACATGCCTATTC---CATCATATACCTGTGCTTCGAGCACAATATTTAAATAAGATGTTCATTTGTAGAAACAACATATGTAGATAAGAAGTGTACAGATTTAATAATTACGGTGACCCAGCCCCAGTTCCAGCATTTTTCACGAATTTTCCTTTCCATTCCTTCTTTCTGGCTTAATGTAGCCATTATTCCAGATGTTAAAAACAAAAAGCCAGTCAAATCTGGTCACAGGATGTGATGGGTTTATATAAGAAAAATCTGTTGAGGATAATTATGTACTCTACCTGGGGTTTCTTCAGAATTTCCTACAGTTTGCTGATGTTATTTCATCACATCACAGAAGGAAATTTTAAAGGACCTTTTAGAAGAACAGATTATTTTACTCCCTGTATTGCAAAGATTTTGGATGCATAGAACTTGGGCTGTCTGTTTGCATCTTGGGAAGTGGTAGTGGAGGAATGAAGAGTGATGTCTGAAGTTCCACCAGAGAGTTGCTTTAACTTGTGCTAGGAGATGTCTCTGAAGTTTGCATGTATTAAATTTAAATCATTTAGATTGAAAAATCTATGACCATATTTTAAGGAACTAGCATTCTCTATGTCTGTTGGTGTATAATGTGATATTCTCTTGCGATTAATTTTTCATGTCCTCTTTCTGCCTGTGGA- Lampropeltis_triangulum_Western GATGCCAGTTGTAACCCCATGTACGTTAGGTGTTCAAAGAGATAGAAGATACTAATTATTAGTTTATTGTAACCACCCAAAGTCACCTTTTGTGAGCCACATAAATTAGACCAGTGAGTACATAAAAGTAAACTGTCAAGTGGAAGGGAACATGCACACACCCAGATTCTCTGGACATGCCTATTC---CATCATATACCTGTGCTTCGAGCACAGTATTTAAATAAGATGTTCATTTGTAGAAACAACACATGTAGATAAGAAGTGTACAGATTTAATAATTACGGTGACCCAGCCCCAGTTCCAGCATTTTTCACGAATTTTCCTTTCCATTCCTTCTTTCTGGCTTAATGTAGCCATTATTCCAGATGTTAAAAACAAAAAGCCAGCCAAATCTGGTCACAGGATGTGATGGGTTTATATAAGAAAAATCTGTTGAGGATAATTATGTACTCTACCTGGGGTTTCTTCAGAATTTCCTACAGTTTGCTGATGTTATTTCATCACATCACAGAAGGAAATTTTAAAGGACCTTTTAGAAGAACAGATTATTTTACTCCCTGTATTGCAAAGATTTTGGATGCATAGAACTTGGGCTGTCTGTTTGCATCTTGAGAAGTGGTAGTGGAGGAATGAAGAGTGATGTCTGAAGTTCCACCAGAGAGTTGCTTTAACTTGTGCTAGGAGATGTCTCTGAAGTTTGCATGTATTAAATTGAAATCATTTAGATTGAAAAATCTATGACCATATTTTAAGGAACTAGCATTCTCTATGTCTGTTGGTGTATAATGTGATATTCTCTTGCGATTAATTTTTCATGTCCTCTTTCTGCCTGTGGA- Lampropeltis_webbi GATGCCAGTTGTAACCCCATGTACGTTAGGTGTTCAAAGAGATAGAAGATACTAATTATTAGTTTATTGTAACCACCCAAAGTCACCTTTTGTGAGCCACATAAATTAGACCAGTGAGTACATAAAAGTAAACTGTCAAGTGGAAGGAAACATGCACATACCCAGATTCTCTGGACATGCCTATTC---CATCATATACCTGTGCTTCGAGCACAATATTTAAATAAGATGTTCATTTGTAGAAACAACACATGTAGATAAGAAGTGTACAGATTTAATCATTACGGTGACCCAGCCCCAGTTCCAGCATTTTTCACGAATTTTCCTTTCCATTCCTTCTTTTTGGCTTAATGTAGCCATTATTCCAGATGTTAAAAACAAAAAGCCAGCCAAATCTGGTCACAGGATGTGATGGGTTTATATAAGAAAAATCTGTTGAGGATAATTATGTACTCTACCTGGGGTTTCTTCAGAATTTCCTACAGTTTGCTGATGTTATTTCATCACATCACAGAAGGAAATTTTAAAGGACCTTTTAGAAGAACAGATTATTTTACTCCCTGTATTGCAAAGATTTTGGATGCATAGAACTTGGGCTGTCTGTTTGCATCTTGGGAAGTGGTAGTGGAGGAATGAAGAGTGATGTCTGAAGTTCCACCAGAGAGTTGCTTTAACTTGTGCTAGGAGATGTCTCTGAAGTTTGCATGTATTAAATTGAAATCATTTAGATTGAAAAATCTATGACCATATTTTAAGGAACTAGCATTCTCTATGTCTGTTGGTGTATAATGTAATATTCTCTTGCGATTAATTTTTCATGTCCTCTTTCTGCCTGTGGA- Lampropeltis_zonata GATGCCAGTTGTAACCCCATGTACGTTAGGTGTTCAAAGAGATAGAAGATACTAATTATTAGTTTATTGTAACCACCCAAAGTCACCTTTTGTGAGCCACATAAATTAGACCAGTGAGTACATAAAAGTAAACTGTCAAGTGGAAGGGAACATGCACATACCCAGATTCTCTGGACATGCCTATTC---CATCATATACCTGTGCTTCGAGCACAATATTTAAATAAGATGTTCATTTGTAGAAACAACACATGTAGATAAGAAGTGTACAGATTTAATCATTACGGTGACCCAGCCCCAGTTCCAGCATTTTTCACGAATTTTCCTTTCCATTCCTTCTTTTTGGCTTAATGTAGCCATTATTCCAGATGTTAAAAACAAAAAGCCAGCCAAATCTGGTCACAGGATGTGATGGGTTTATATAAGAAAAATCTGTTGAGGATAATTATGTACTCTACCTGGGATTTCTTCAGAATTTCCTACAGTTTGCTGATGTTATTTCATCACATCACAGAAGGAAATTTTAAAGGACCTTTTAGAAGAACAGATTATTTTACTCCCTGTATTGCAAAGATTTTGGATGCATAGAACTTGGGCTGTCTGTTTGCATCTTGGGAAGTGGTAGTGGAGGAATGAAGAGTGATGTCTGAAGTTCCACCAGAGAGTTGCTTTAACTTGTGCTAGGAGATGTCTCTGAAGTTTGCATGTATTAAATTGAAATCATTTAGATTGAAAAATCTATGACCATATTTTAAGGAACTAGCATTCTCTATGTCTGTTGGTGTATAATGTAATATTCTCTTGCGATTAATTTTTCATGTCCTCTTTCTGCCTGTGGA- ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M20118] TITLE 1_gad_15; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep12824; DIMENSIONS NCHAR=541; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Arizona_elegans CTGGTACTTCTTCCACAGATGTTTGGCCTAAAATTCCTCAGTCCTGACCATTGAATAATTAAATTGAGGTTAATGGGAGGTAAAACTCTCTAGAGGACACAATATTTCCTATCTTTGTGTAGATGCTACTGAAGCAAAGTCACATGTTTTGGTGAACAATATAGAGCAGAAATTAGGAACTTTATGATCAAAGATCTTGGTGAACTTTGAAAACTATGTTAAAATACTTTGACATCTCACATGAAAATTCTGAAACTTCATGAAAGTTTTTTCAAATGATGTGAAATTTTACCCAAATTTTCTGAAATCTCACAGAAATGTTGGCAGTCTTCAGATCATTAACATTAACATTCAGATCTGATGGAATTGTGGTGTCCAGGATTATGCAAGATTGCCAATTTATGTACTAAATTTTAGACTATTGCAGGAGGAGGTCGTTTGGACTTGGTGAGTTTCCAGAAATGGATTGCCATGATATGGTAACTT----------ATTCATCTCAAAAACCAGGCTGAATGAATTTGAAGAGCTCCTCAT Cemophora_coccinea CTGGTACTTCTTCCACAGATGTTTGGCCTAAAATTCCTCAGTCCTGACCATTGAATAATTAAATTGAGGTTAATGGGAGGTAAAACTCTCTAGAGGACACAATATTTCCTATCTTTGTGTAGATGCTACTGAAGCAAAGTCACATGTTTTGGTGAACAATATAGAGCAGAAATTAAGAACTTTATGATCAAAGATCTTGGTGAACTTTGAAAACTATGTTAAAATACTTTGACATCTCACATGAAAATTCTGAAACTTCATGAAAGTTTTTTCAAATGATGTGAAATTTTACCCAAATTTTCTGAAATCTCACAGAAATGTTGGCAGTCTTCAGATCATTAACATTAACATTCAGATCTGATGGAATTGTGGTGTCCAGGATTATGCAAGATTGCCAATTTATGTACTAAATTTTAGACTATTGCAGGAGGAGGTCTTTTGGACTTGGTGAGTTTCCAGAAATGGGTTGCCATGATATGGTAACTTCTATTAATTTATTCATCTCAAAAACCAGGCTGAATGAATTTGAAGAGCTCCTCAT Lampropeltis_alterna CTGGTACTTCTTCCACAGATGTTTGGCCTAAAATTCCTCAGTCCTGACCATTGAATAATTAAATTGAGGTTAATGGGAGGTAAAACTCTCTAGAGGACACAATATTTCCTATCTTTGTGTAGATGCTACTGAAGCAAAGTCACATGTTTTGGTGAACAATATAGAGCAGAAATTAGGAACTTTATGATCAAAGATCTTGGCGAACTTTGAAAACTATGTTAAAATACTTTGACATCTCACATGAAAATTCTGAAACTTCATGAAAGTTTTTTCAAATGATGTGAAATTTTACCCAAATTTTCTGAAATCTCACAGAAATGTTGGCAGTCTTCAGATCATTAACATTAACATTCAGATCTGATGGAATTGTGGTGTCCAGGATTATGCAAGATTGCCAATTTATGTACTAAATTTTAGACTATTGCAGGAGGAGGTCTTTTGGACTTGGTGAGTTTCCAGAAATGGGTTGCCATGATATGGTAACTTCTATTAATTTATTCATCTCAAAAACCAGGCTGAATGAATTTGAAGAGCTCCTCAT Lampropeltis_californiae CTGGTACTTCTTCCACAGATGTTTAGCCTAAAATTCCTCAGTCCTGACCATTGAATAATTAAATTGAGGTTAATGGGAGGTAAAACTCTCTAGAGGACACAATATTTCCTATCTTTGTGTAGATGCTAC-GAAGCAAAGTCACATGTTTTGGTGAACAATATAGAGCAGAAATTAGGAACTTTATGATCAAAGATCTTGGTGAACTTTGAAAACTATGTTAAAATACTTTGACATCTCACATGAAAATTCTGAAACTTCATGAAAGTTTTTTCAAATGATGTGAAATTTTACCCAAATTTTCTGAAATCTCACAGAAATGTTGGCAGTCTTCAGATCATTAACATTAACATTCAGGTCTGATGGAATTATGGTGTCCAGGATTATGCAAGATTGCCAATTTATGTACTAAATTTTAGACTATTGCTGGAGGAGGTCTTTTGGACTTGGTGAGTTTCCAGAAATGGGTTGCCATGATATGGTAACTTCTATTAATTTATTCATCTCAAAAACCAGGCTGAATGAATTTGAAGAGCTCCTCAT Lampropeltis_calligaster CTGGTACTTCTTCCACAGATGTTTAGCCTAAAATTCCTCAGTCCTGACCATTGAATAATTAAATTGAGGTTAATGGGAGGTAAAACTCTCTAGAGGACACAATATTTCCTATCTTTGTGTAGATGCTACTGAAGCAAAGTCACATGTTTTGGTGAACAATATAGAGCAGAAATTAGGAACTTTATGATCAAAGATCTTGGCGAACTTTGAAAACTATGTTAAAATACTTTGACATCTCACATGAAAATTCTGAAACTTCATGAAAGTTTTTTCAAATGATGTGAAATTTTACCCAAATTTTCTAAAATCTCACAGAAATGTTGGCAGTCTTCAGATCATTAACATTAACATTCAGATCTGATGGAATTGTGGTGTCCAGGATTATGCAAGATTGCCAATTTATGTACTAAATTTTAGACTATTGCAGGAGGAGGTCTTTTGGACTTGGTGAGTTTCCAGAAATGGGTTGCCATGATATGGTAACTTCTATTAATTTATTCATCTCAAAAACCAGGCTGAATGAATTTGAAGAGCTCCTCAT Lampropeltis_elapsoides CTGGTACTTCTTCCACAGATGTTTGGCCTAAAATTCCTCAGTCCTGACCATTGAATAATTAAATTGAGGTTAATGGGAGGTAAAACTCTCTAGAGGACACAATATTTCCTATCTTTGTGTAGATGCTACTGAAGCAAAGTCACATGTTTTGGTGAACAATATAGAGCAGAAATTAGGAACTTTATGATCAAAGATCTTGGCGAACTTTGAAAACTATGTTAAAATACTTTGACATCTCACATGAAAATTCTGAAACTTCATGAAAGTTTTTTCAAATGATGTGAAATTTTACCCAAATTTTCTGAAATCTCACAGAAATGTTGGCAGTCTTCAGATCATTAACATTAACATTCAGATCTGATGGAACTGTGGTGTCCAGGATTATGTAAGATTGCCAATTTATGTACTAAATTTTAGACTATTGCAGGAGGAGGTCTTTTGGACTTGGTGAGTTTCCAGAAATGGGTTGCCATAATATGGTAACTTCTATTAATTTATTCATCTCAAAAACCAGGCTGAATGAATTTGAAGAGCTCCTCAT Lampropeltis_extenuata CTGGTACTTCTTCCACAGATGTTTAGCCTAACATTCCTCAGTCCTGACCATTGAATAATTAAATTGAGGTTAATGGGAGGTAAAACTCTCTAGAGGACACAATATTTCCTATCTTTGTGTAGATGCTACTGAAGCAAAGTCACATGTTTTGGTGAACAATATAGAGCAGAAATTAGGAATTTTATGATCAAAGATCTTGGTGAACTTTGAAAACTATGTTAAAATACTTTGACATCTCACATGAAAATTCTGAAACTTCATGAAAGTTTTTTCAAATGATGTGAAATTTTACCCAAATTTTCTGAAATCTCACAGAAATGTTGGCAGTCTTCAGATCATTAACATTAACATTCAGATCTGATGGAATTGTGGTGTCCAGGATTATGCAAGATTGCCAATTTATGTACTAAATTTTAGACTATTGCAGGAGGAGGTCTTTTGGACTTGGTGAGTTTCCAGAAATGGGTTGCCATGATATGGTAACTTCTATTAATTTATTCATCTCAAAAACCAGGCTGAATGAATTTGAAGAGCTCCTCAT Lampropeltis_getula CCGGTACTTCTTCCACAGATGTTTAGCCTAAAATTCCTCAGTCCTGACCATTGGATAATTAAATTGAGGTTAATGGGAGGTAAAACTCTCTAGAGGACACACTATTTCCTATCTTTGTGTAGATGCTACTGAAGCAAAGTCACATGTTTTGGTGAACAATATAGAGCAGAAATTAGGAACTTTATGATCAAAGATCTTGGTGAACTTTGAAAACTATGTTAAAATACTTTGACATCTCACATGAAAATTCTGAAACTTCATGAAAGTTTTTTCAAATGATGTGAAATTTTACCCAAATTTTCTGAAATCTCACAGAAATGTTGGCAGTCTTCAGATCATTAACATTAACATTCAGGTCTGATGGAATTATGGTGTCCAGGATTATGCAAGATTGCCAATTTATGTACTAAATTTTAGACTATTGCAGGAGGAGGTCTTTTGGACTTGGTGAGTTTCCAGAAATGGGTTGCCATGATATGGTAACTTCTATTAATTTATTCATCTCAAAAACCAGGCTGAATGAATTTGAAGAGCTCCTCAT Lampropeltis_holbrooki CTGGTACTTCTTCCACAGATGTTTAGCCTAAAATTCCTCAGTCCTGACCATTGAATAATTAAATTGAGGTTAATGGGAGGTAAAACTCTCTAGAGGACACAATATTTCCTATCTTTGTGTAGATGCTACTGAAGCAAAGTCACATGTTTTGGTGAACAATATAGAGCAGAAATTAGGAACTTTATGATCAAAGATCTTGGTGAACTTTGAAAACTATGTTAAAATACTTTGACATCTCACATGAAAATTCTGAAACTTCATGAAAGTTTTTTCAAATGATGTGAAATTTTACCCAAATTTTCTGAAATCTCACAGAAATGTTGGCAGTCTTCAGATCATTAACATTAACATTCAGGTCTGATGGAATTATGGTGTCCAGGATTATGCAAGATTGCCAATTTATGTACTAAATTTTAGACTATTGCAGGAGGAGGTCTTTTGGACTTGGTGAGTTTCCAGAAATGGGTTGCCATGATATGGTAACTTCTATTAATTTATTCATCTCAAAAACCAGGCTGAATGAATTTGAAGAGCTCCTCAT Lampropeltis_knoblochi CTGGTACTTCTTCCACAGATGTTTGGCCTAAAATTCCTCAGTCCTGACCATTGAATAATTAAATTGAGGTTAATGGGAGGTAAAACTCTCTAGAGGACACAATATTTCCTATCTTTGTGTAGATGCTACTGAAGCAAAGTCACATGTTTTGGTGAACAATATAGAGCAGAAATTAGGAACTTTATGATCAAAGATCTTGGCGAACTTTGAAAACTATGTTAAAATACTTTGACATCTCACATGAAAATTCTGAAACTTCATGAAAGTTTTTTCAAATGATGTGAAATTTTACCCAAATTTTCTGAAATCTCACAGAAATGTTGGCAGTCTTCAGATCATTAACATTAACATTCAGATCTGATGGAATTGTGGTGTCCAGGATTATGCAAGATTGCCAATTTATGTACTAAATTTTAGACTATTGCAGGAGGAGGTCTTTTGGACTTGGTGAGTTTCCAGAAATGGGTTGCCATGATATGGTAACTTCTATTAATTTATTCATCTCAAAAACCAGGCTGAATGAATTTGAAGAGCTCCTCAT Lampropeltis_mexicana CTGGTACTTCTTCCACAGATGTTTGGCCTAAAATTCCTCAGTCCTGACCATTGAATAATTAAATTGAGGTTAATGGGAGGTAAAACTCTCTAGAGGACACAATATTTCCTATCTTTGTGTAGATGCTACTGAAGCAAAGTCACATGTTTTGGTGAACAATATAGAGCAGAAATTAGGAACTTTATGATCAAAGATCTTGGCGAACTTTGAAAACTATGTTAAAATACTTTGACATCTCACATGAAAATTCTGAAACTTCATGAAAGTTTTTTCAAATGATGTGAAATTTTACCCAAATTTTCTGAAATCTCACAGAAATGTTGGCAGTCTTCAGATCATTAACATTAACATTCAGATCTGATGGAATTGTGGTGTCCAGGATTATGCAAGATTGCCAATTTATGTACTAAATTTTAGACTATTGCAGGAGGAGGTCTTTTGGACTTGGTGAGTTTCCAGAAATGGGTTGCCATGATATGGTAACTTCTATTAATTTATTCATCTCAAAAACCAGGCTGAATGAATTTGAAGAGCTCCTCAT Lampropeltis_nigra CTGGTACTTCTTCCACAGATGTTTAGCCTAAAATTCCTCAGTCCTGACCATTGAATAATTAAATTGAGGTTAATGGGAGGTAAAACTCTCTAGAGGACACAATATTTCCTATCTTTGTGTAGATGCTACTGAAGCAAAGTCACATGTTTTGGTGAACAATATAGAGCAGAAATTAGGAACTTTATGATCAAAGATCTTGGTGAACTTTGAAAACTATGTTAAAATACTTTGACATCTCACATGAAAATTCTGAAACTTCATGAAAGTTTTTTCAAATGATGTGAAATTTTACCCAAATTTTCTGAAATCTCACAGAAATGTTGGCAGTCTTCAGATCATTAACATTAACATTCAGGTCTGATGGAATTATGGTGTCCAGGATTATGCAAGATTGCCAATTTATGTACTAAATTTTAGACTATTGCTGGAGGAGGTCTTTTGGACTTGGTGAGTTTCCAGAAATGGGTTGCCATGATATGGTAACTTCTATTAATTTATTCATCTCAAAAACCAGGCTGAATGAATTTGAAGAGCTCCTCAT Lampropeltis_pyromelana CTGGTACTTCTTCCACAGATGTTTGGCCTAAAATTCCTCAGTCCTGACCATTGAATAATTAAATTGAGGTTAATGGGAGGTAAAACTCTCTAGAGGACACAATATTTCCTATCTTTGTGTAGATGCTACTGAAGCAAAGTCACATGTTTTGGTGAACAATATAGAGCAGAAATTAGGAACTTTATGATCAAAGATCTTGGCGAACTTTGAAAACTATGTTAAAATACTTTGACATCTCACATGAAAATTCTGAAACTTCATGAAAGTTTTTTCAAATGATGTGAAATTTTACCCAAATTTTCTGAAATCTCACAGAAATGTTGGCAGTCTTCAGATCATTAACATTAACATTCAGATCTGATGGAATTGTGGTGTCCAGGATTATGCAAGATTGCCAATTTATGTACTAAATTTTAGACTATTGCAGGAGGAGGTCTTTTGGACTTGGTGAGTTTCCAGAAATGGGTTGCCATGATATGGTAACTTCTATTAATTTATTCATCTCAAAAACCAGGCTGAATGAATTTGAAGAGCTCCTCAT Lampropeltis_ruthveni CTGGTACTTCTTCCACAGATGTTTGGCCTAAAATTCCTCAGTCCTGACCATTGAATAATTAAATTGAGGTTAATGGGAGGTAAAACTCTCTAGAGGACACAATATTTCCTATCTTTGTGTAGATGCTACTGAAGCAAAGTCACATGTTTTGGTGAACAATATAGAGCAGAAATTAGGAACTTTATGATCAAAGATCTTGGCGAACTTTGAAAACTATGTTAAAATACTTCGACATCTCACATGAAAATTCTGAAACTTCATGAAAGTTTTTTCAAATGATGTGAAATTTTACCCAAATTTTCTGAAATCTCACAGAAATGTTGGCAGTCTTCAGATCATTAACATTAACATTCAGATATGATGGAATTGTGGTGTCCAGGATTATGCAAGATTGCCAATTTATGTACTAAATTTTAGACTATTGCAGGAGGAGGTCTTTTGGACTTGGTGAGTTTCCAGAAATGGGTTGCCATGATATGGTAACTTCTATTAATTTATTCATCTCAAAAACCAGGCTGAATGAATTTGAAGAGCTCCTCAT Lampropeltis_splendida CTGGTACTTCTTCCACAGATGTTTAGCCTAAAATTCCTCAGTCCTGACCATTGAATAATTAAATTGAGGTTAATGGGAGGTAAAACTCTCTAGAGGACACAATATTTCCTATCTTTGTGTAGATGCTACTGAAGCAAAGTCACATGTTTTGGTGAACAATATAGAGCAGAAATTAGGAACTTTATGATCAAAGATCTTGGTGAACTTTGAAAACTATGTTAAAATACTTTGACATCTCACATGAAAATTCTGAAACTTCATGAAAGTTTTTTCAAATGATGTGAAATTTTACCCAAATTTTCTGAAATCTCACAGAAATGTTGGCAGTCTTCAGATCATTAACATTAACATTCAGGTCTGATGGAATTATGGTGTCCAGGATTATGCAAGATTGCCAATTTATGTACTAAATTTTAGACTATTGCTGGAGGAGGTCTTTTGGACTTGGTGAGTTTCCAGAAATGGGTTGCCATGATATGGTAACTTCTATTAATTTATTCATCTCAAAAACCAGGCTGAATGAATTTGAAGAGCTCCTCAT Lampropeltis_triangulum_CA CTGGTACTTCTTCCACAGATGTTTGGCCTAAAATTCCTCAGTCCTGACCATTGAATAATTAAATTGAGGTTAATGGGAGGTAAAACTCTCTAGAGGTCACAATATTTCCTATCTTTGTGTAGATGCTACTGAAGCAAAGTCACATGTTTTGGTGAACAATATAGAGCAGAAATTAGGAACTTTATGATCAAAGATCTTGGCGAACTTTGAAAACTATGTTAAAATACTTTGACATCTCACATGAAAATTCTGAAACTTCATGAAAGTTTTTTCAAATGATGTGAAATTTTACCCAAATTTTCTGAAATCTCACAGAAATGTTGGCAGTCTTCAGATCATTAACATTAACATTCAGATCTGATGGAATTGTGGTGTCCAGGATTATGCAAGATTGCCAATTTATGTACTAAATTTTAGACTATTGCAGGAGGAGGTCTTTTGGACTTGGTGAGTTTCCAGAAATGGGTTGCCATGATATGGTAACTTCTATTAATTTATTCATCTCAAAAACCAGGCTGAATGAATTTGAAGAGCTCCTCAT Lampropeltis_triangulum_Eastern CTGGTACTTCTTCCACAGATGTTTGGCCTAACATTCCTCAGTCCTGACCATTGAATAATTAAATTGAGGTTAATGGGAGGTAAAACTCTCTAGAGGACACAATATTTCCTATCTTTGTGTAGATGCTACTGAAGCAAAGTCACATGTTTTGGTGAACAATATAGAGCAGAAATTAGGAACTTTATGATCAAAGATCTTGGCGAACTTTGAAAACTATGTTAAAATACTTTGACATCTCACATGAAAATTCTGAAACTTCATGAAAGTTTTTTCAAATGATGTGAAATTTTACCCAAATTTTCTGAAATCTCACAGAAATGTTGGCAGTCTTCAGATCATTAACATTAACATTCAGATCTGATGGAATTGTGGTGTCCAGGATTATGCAAGATTGCCAATTTATGTACTAAATTTTAGACTATTGCAGGAGGAGGTCTTTTGGACTTGGTGAGTTTCCAGAAATGGGTTGCCATGATATGGTAACTTCTATTAATTTATTCATCTCAAAAACCAGGCTGAATGAATTTGAAGAGCTCCTCAT Lampropeltis_triangulum_MX CTGGTACTTCTTCCACAGATGTTTGGCCTAAAATTCCTCAGTCCTGACCATTGAATAATTAAATTGAGGTTAATGGGAGGTAAAACTCTCTAGAGGTCACAATATTTCCTATCTTTGTGTAGATGCTACTGAAGCAAAGTCACATGTTTTGGTGAACAATATAGAGCAGAAATTAGGAACTTTATGATCAAAGATCTTGGCGAACTTTGAAAACTATGTTAAAATACTTTGACATCTCACATGAAAATTCTGAAACTTCATGAAAGTTTTTTCAAATGATATGAAATTTTACCCAAATTTTCTGAAATCTCACAGAAATGTTGGCAGTCTTCAGATCATTAACATTAACATTCAGATCTGATGGAATTGTGGTGTCCAGGATTATGCAAGATTGCCAATTTATGTACTAAATTTTAGACTATTGCAGGAGGAGGTCTTTTGGACTTGGTGAGTTTCCAGAAATGGGTTGCCATGATATGGTAACTTCTATTAATTTATTCATCTCAAAAACCAGGCTGAATGAATTTGAAGAGCTCCTCAT Lampropeltis_triangulum_SA CTGGTACTTCTTCCACAGATGTTTGGCCTAAAATTCCTCAGTCCTGACCATTGAATAATTAAATTGAGGTTAATGGGAGGTAAAACTCTCTAGAGGTCACAATATTTCCTATCTTTGTGTAGATGCTACTGAAGCAAAGTCACATGTTTTGGTGAACAATATAGAGCAGAAATTAGGAACTTTATGATCAAAGATCTTGGCGAACTTTGAAAACTATGTTAAAATACTTTGACATCTCACATGAAAATTCTGAAACTTCATGAAAGTTTTTTCAAATGATGTGAAATTTTACCCAAATTTTCTGAAATCTCACAGAAATGTTGGCAGTCTTCAGATCATTAACATTAACATTCAGATCTGATGGAATTGTGGTGTCCAGGATTATGCAAGATTGCCAATTTATGTACTAAATTTTAGACTATTGCAGGAGGAGGTCTTTTGGACTTGGTGAGTTTCCAGAAATGGGTTGCCATGATATGGTAACTTCTATTAATTTATTCATCTCAAAAACCAGGCTGAATGAATTTGAAGAGCTCCTCAT Lampropeltis_triangulum_Tamaulipas CTGGTACTTCTTCCACAGATGTTTGGCCTAAAATTCCTCAGTCCTGACCATTGAATAATTAAATTGAGGTTAATGGGAGGTAAAATTCTCTAGAGGACACAATATTTCCTATCTTTGTGTAGATGCTACTGAAGCAAAGTCACATGTTTTGGTGAACAATATAGAGCAGAAATTAGGAACTTTATGATCAAAGATCTTGGCGAACTTTGAAAACTATGTTAAAATACTTTGACATCTCACATGAAAATTCTGAAACTTCATGAAAGTTTTTTCAAATGATGTGAAATTTTACCCAAATTTTCTGAAATCTCACAGAAATGTTGGCAGTCTTCAGATCATTAACATTAACATTCAGATCTGATGGAATTGTGGTGTCCAGGATTATGCAAGATTGCCAATTTATGTACTAAATTTTAGACTATTGCAGGAGGAGGTCTTTTGGACTTGGTGAGTTTCCAGAAATGGGTTGCCATGATATGGTAACTTCTATTAATTTATTCATCTCAAAAACCAGGCTGAATGAATTTGAAGAGCTCCTCAT Lampropeltis_triangulum_Western CTGGTACTTCTTCCACAGATGTTTGGCCTAAAATTCCTCAGTCCTGACCATTGAATAATTAAATTGAGGTTAATGGGAGGTAAAACTCTCTAGAGGACACAATATTTCCTATCTTTGTGTAGATGCTACTGAAGCAAAGTCACATGTTTTGGTGAACAATATAGAGCAGAAATTAGGAACTTTATGATCAAAGATCTTGGCGAACTTTGAAAACTATGTTAAAATACTTTGACATCTCACATGAAAATTCTGAAACTTCATGAAAGTTTTTTCAAATGATGTGAAATTTTACCCAAATTTTCTGAAATCTCACAGAAATGTTGGCAGTCTTCAGATCATTAACATTAACATTCAGATCTGATGGAATTGTGGTGTCCAGGATTATGCAAGATTGCCAATTTATGTACTAAATTTTAGACTATTGCAGGAGGAGGTCTTTTGGACTTGGTGAGTTTCCAGAAATGGGTTGCCATGATATGGTAACTTCTATTAATTTATTCATCTCAAAAACCAGGCTGAATGAATTTGAAGAGCTCCTCAT Lampropeltis_webbi CTGGTACTTCTTCCACAGATGTTTGGCCTAAAATTCCTCAGTCCTGACCATTGAATAATTAAATTGAGGTTAATGGGAGGTAAAACTCTCTAGAGGACACAATATTTCCTATCTTTGTGTAGATGCTACTGAAGCAAAGTCACATGTTTTGGTGAACAATATAGAGCAGAAATTAGGAACTTTATGATCAAAGATCTTGGCGAACTTTGAAAACTATGTTAAAATACTTTGACATCTCACATGAAAATTCTGAAACTTCATGAAAGTTTTTTCAAATGATGTGAAATTTTACCCAAATTTTCTGAAATCTCACAGAAATGTTGGCAGTCTTCAGATCATTAACATTAACATTCAGATCTGATGGAATTGTGGTGTCCAGGATTATGCAAGATTGCCAATTTATGTACTAAATTTTAGACTATTGCAGGAGGAGGTCTTTTGGACTTGGTGAGTTTCCAGAAATGGGTTGCCATGATATGGTAACTTCTATTAATTTATTCATCTCAAAAACCAGGCTGAATGAATTTGAAGAGCTCCTCAT Lampropeltis_zonata CTGGTACTTCTTCCACAGATGTTTGGCCTAAAATTCCTCAGTCCTGACCATTGAATAATTAAATTGAGGTTAATGGGAGGTAAAACTCTCTAGAGGACACAATATTTCCTATCTTTGTGTAGATGCTACTGAAGCAAAGTCACATGTTTTGGTGAACAATATAGAGCAGAAATTAGGAACTTTATGATCAAAGATCTTGGCGAACTTTGAAAACTATGTTAAAATACTTTGACATCTCACATGAAAATTCTGAAACTTCATGAAAGTTTTTTCAAATGATGTGAAATTTTACCCAAATTTTCTGAAATCTCACAGAAATGTTGGCAGTCTTCAGATCATTAACATTAACATTCAGATCTGATGGAATTGTGGTGTCCAGGATTATGCAAGATTGCCAATTTATGTACTAAATTTTAGACTATTGCAGGAGGAGGTCTTTTGGACTTGGTGAGTTTCCAGAAATGGGTTGCCATGATATGGTAACTTCTATTAATTTATTCATCTCAAAAACCAGGCTGAATGAATTTGAAGAGCTCCTCAT ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M20117] TITLE 1_nav56; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep12824; DIMENSIONS NCHAR=561; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Arizona_elegans --GCTAAAAACTATCACTGTCATTCCAGGTACATAATGGGGATGGCAAAGCTAAAGATGGTTTTAGGGATTATGCTTTTTTATACAAATCAACTAGGCTAGTAGAAAACTGAGGTAGGTGTACCTCTTTACTGGACCAG-AAATCTATAATTAATATGATAGTAAAAAGAAGAATTTTGGTTGCTTTTCTTAAAAAAAA---TATATAATTACGGTACTGAAGGCAAATTCTATATAGTCATCATCTGGAATTATGAGAATTAAATGAATTTAGAGCACAGCAAAAATGACTTGATATGGTTTAT-TAACTAGCATTTCAATTCTTTTCAAAATATTTTTT-CTTGAAATATTCCTGCTAACAAATATAATCCATAAAAGATTTCTTTAAAAAAAAAA--TGAAATTGGAAGTTCTATTTTATTGCCTAAACAAATGGAAATTTCTCTTCTCTCTCTTCTCTGACTCCTCCCCCCAAAAGGTCTAAAAACAATTGTGGGAGCTTTGATCCAGTCTGTGAAGAAGCTTGCTGATGTGATGATCCTCACTGTGTTCTGTTTGG Cemophora_coccinea ----------CTATCACTGTCATTCCAGGTACATAATGGGGATGGCAAAGCTAAAGATGGTTTTAGGGATTTTGCTTTTTTATACAAATCAACTAGGCTAGTAGAAAACTGAGGTAGGTGTACCTCTTTACTGGACCAGGAAATCTATAATTAATATGATAGTAAAAAGAAGAATTTTGGTTGCTTTTCTTAAAAAAAA---TATATAATTATGGTATTGAAGGCAAATTCTATATAGTCATCATCTGGAATTATGAGAATTAAATGAATTTAGAGCACAGCAAAAATGACTTGATATAGTTTATGTAACTAGCATTTCAATTCTTTTCAAAATATTTTTT-CTTGAAATATTCCTGCTAACAAATATAATCCATAAAAGATTTCTTTTAAAAAAA----TGAAATTGGAAGTTCTATTTTATTGCCTAAACAAATGGAAATTTCTCTTCTCTCTCTTCTCTGACTCCTCCCCCCAAAAGGTCTAAAAACAATTGTGGGAGCTTTGATCCAATCTGTGAAGAAGCTCGCTGATGTGATGATCCTCACTGTGTTCTGTTTGG Lampropeltis_alterna ----TAAAAACTATCACTGTCATTCCAGGTACATAATGGGGATGGCAAAGCTAAAGATGGTTTTAGGGATTTTGCTTTTTTATACAAATCAACTAGGCTAGTAGAAAACTGAGGTAGGTGTACCTCTTTACTGGACCAGGAAATCTATAATTAATATGATAGTAAAAAGAAGAATTTTGGTTGCTTTTCTTAAAAAAAA---TATATAATTATGGTACTGAAGGCAAATTCTATATAGTCATCATCTGGAATTATGAGAATTAAATGAATTTAGAGCACAGCAAAAATGACTTGATATAGTTTATGTAACTAGCATTTCAATTCTTTTCAAAATATTTTTT-CTTGAAATATTCCTGCTAACAAATATAATCCATAAAAGATTTCTTTAAAAAAAAA---TGAAATTGGAAGTTCTATTTTATTGCCTAAACAAATGGAAATTTCTCTTCTCTCTCTTCTCTGACTCCTCCCCCCAAAAGGTCTAAAAACAATTGTGGGAGCTTTGATCCAGTCTGTGAAGAAGCTCGCTGATGTGATGATCCTCACTGTGTTCTGTTTGG Lampropeltis_californiae GCGCTAAAAACTATCACTGTCATTCCAGGTACATAATGGGGATGGCAAAGCTAAAGATGGTTTTAGGGATTTTGCTTTTTTATACAAATCAACTAGGCTAGTAGAAAACTGAGGTAGGTGTACCTCTTTACTGGACCAGGAAATCTATAATTAATATGATAGTAAAAAGAAGAATTTTGGTTGCTTTTCTTAAAAAAA--TATATATAATTATGGTACTGAAGGCAAATTCTATATAGTCATCATCTGGAATTATGAGAATTAAATGAATTTAGAGCACAGCAAAAATGACTTGATATAGTTTATGTAACTAGCATTTCAATTCTTTTCAAAATATTTTTT-CTTGAAATATTCCTGCTAACAAATATAATCCATAAAAGATTTCTTTAAAAAAAAA---TGAAATTGGAAGTTCTATTTTATTGCCTAAACAAATGGAAATTTCTCTTCTCTCTCTTCTCTGACTCCTCCCCCCAAAAGGTCTAAAAACAATTGTGGGAGCTTTGATCCAGTCTGTGAAGAAGCTCGCTGATGTGATGATCCTCACTGTGTTCTGTTTGG Lampropeltis_calligaster ------AAAACTATCACTGTCATTCCAGGTACATAATGGGGATGGCAAAGCTAAAGATGGTTTTAGGGATTTTGCTTTTTTATACAAATCAACTAGGCTAGTAGAAAACTGAGGTAGCTGTACCTCTTTACTGGACCAGGAAATCTATAATTAATATGATAGTAAAAAGAAGAATTTTGGTTGCTTTTCTTAAAAAAAA---TATATAATTATGGTACTGAAGGCAAATTCTATATAGTCATCATCTGGAATTATGAGAATTAAATGAATTTAGAGCACAGCAAAAATGACTTGATATAGTTTATGTAACTAGCATTTCAATTCTTTTCAAAATATTTTTT-CTTGAAATATTCCTGCTAACAAATATAATCCATAAAAGATTTCTTTTAAAAAAAA---TGAAATTGGAAGTTCTATTTTATTGCCTAAACAAATGGAAATTTCTCTTCTCTCTCTTCTCTGACTCCTCCCCCCAAAAGGTCTAAAAACAATTGTGGGAGCTTTGATCCAGTCTGTGAAGAAGCTCGCTGATGTGATGATCCTCACTGTGTTCTGTTTGG Lampropeltis_elapsoides -CGCTAAAAACTATCACTGTCATTCCAGGTACATAATGGGGATGGCAAAGCTAAAGATGGTTTTAGGGATTATGCTTTTTTATACAAATCAACTAGGCTAGTAGAAAACTGAGGTAGGTGTACCTCTTTACTGGACCAGGAAATCTATAATTAATATGATAGTAAAAAGAAGAATTTTGGTTGCTTTTCTTAAAAAAA--TATATATAATTATGGTACTGAAGGCAAATTCTATATAGTCATCATCTGGAATTATGAGAATTAAATGAATTTAGAGCACAGCAAAAATGACTTGATATAGTTTATGTAACTAGCATTTCAATTCTTTTCAAAATATTTTTT-CTTGAAATATTCCTGCTAACAAATATAATCCATAAAAGATTTCTTTAAAAAAAA----TGAAATTGGAAGTTCTATTTTATTGCCTAAACAAATGGAAATTTCTCTTCTCTCTCTTCTCTGACTCCTCCCCCCAAAAGGTCTAAAAACAATTGTGGGAGCTTTGATCCAGTCTGTGAAGAAGCTCGCTGATGTGATGATCCTCACTGTGTTCTGTTTGG Lampropeltis_extenuata -CGCTAAAAACTATCACTGTCATTCCAGGTACATAATGGGGATGGCAAAGCTAAAGATGGTTTTAGGGATTTTGCTTTTTTATACAAATCAACTAGGCTAGTAGAAAACTGAGGTAGGTGTACCTCTTTACTGGACCAGGAAATCTATAATTAATATGATAGTAAAAAGAAGAATTTTGGTTGCTTTTCTTAAAAAAAA---TATATAATTATGGTACTGAAGGCAAATTCTATATAGTCATCATCTGGAATTATGAGAATTAAATGAATTTAGAGCACAGCAAAAATGACTTGATATAGTTTATGTAACTAGCATTTCAATTCTTTTCAAAATATTTTTT-CTTGAAATATTCCTGCTAACAAATATAATCCATAAAAGATTTCTTTAAAAAAAA----TGAAATTGGAAGTTCTATTTTATTGCCTAAACAAATGGAAATTTCTCTTCTCTCTCTTCTCTGACTCCTCCCCCCAAAAGGTCTAAAAACAATTGTGGGAGCTTTGATCCAGTCTGTGAAGAAGCTCGCTGATGTGATGATCCTCACTGTGTTCTGTTTGG Lampropeltis_getula --------------------CATTCCAGGTACATAATGGGGATGGCAAAGCTAAAGATGGTTTTAGGGATTTTGCTTTTTTATACAAATCAACTAGGCTAGTAGAAAACTGAGGTAGGTGTACCTCTTTACTGGACCAGGAAATCTATAATTAATATGATAGTAAAAAGAAGAATTTTGGTTGCTTTTCTTAAAAAAAA---TATATAATTATGGTACTGAAGGCAAATTCTATATAGTCATCATCTGGAATTATGAGAATTAAATGAATTTAGAGCACAGCAAAAATGACTTGATATAGTTTATGTAACTAACATTTCAATTCTTTTCAAAATATTTTTT-CTTGAAATATTCCTGCTAACAAATATAATCCATAAAAGATTTCTTTAAAAAAAAAA--TGAAATTGGAAGTTCTATTTTATTGCCTAAACAAATGGAAATTTCTCTTCTCTCTCTTCTCTGACTCCTCCCCCCAAAAGGTCTAAAAACAATTGTGGGAGCTTTGATCCAGTCTGTGAAGAAGCTCGCTGATGTGATGATCCTCACTGTGTTC------- Lampropeltis_holbrooki -------AAACTATCACTGTCATTCCAGGTACATAATGGGGATGGCAAAGCTAAAGATGGTTTTAGGGATTATGCTTTTTTATACAAATCAACTAGGCTAGTAGAAAACTGAGGTAGGTGTACCTCTTTACTGGACCAGGAAATCTATAATTAATATGATAGTAAAAAGAAGAATTTTGGTTGCTTTTCTTAAAAAAAAA----TATAATTATGGTACTGAAGGCAAATTCTATATAGTCATCATCTGGAATTATGAGAATTAAATGAATTTAGAGCACAGCAAAAATGACTTGATATAGTTTATGTAACTAGCATTTCAATTCTTTTCAAAATATTTTTT-CTTGAAATATTCCTGCTAACAAATATAATCCATAAAAGATTTCTTTAAAAAAAAA---TGAAATTGGAAGTTCTATTTTATTGCCTAAACAAATGGAAATTTCTCTTCTCTCTCTTCTCTGACTCCTCCCCCCAAAAGGTCTAAAAACAATTGTGGGAGCTTTGATCCAGTCTGTGAAGAAGCTCGCTGATGTGATGATCCTCACTGTGTTCTGTTTGG Lampropeltis_knoblochi ----------CTATCACTGTCATTCCAGGTACATAATGGGGATGGCAAAGCTAAAGATGGTTTTAGGGATTTTGCTTTTTTATACAAATCAACTAGGCTAGTAGAAAACTGAGGTAGGTGTACCTCTTTACTGGACCAGGAAATCTATAATTAATATGATAGTAAAAAGAAGAATTTTGGTTGCTTTTCTTAAAAAAAAA---ATATAATTATGGTACTGAAGGCAAATTCTATATAGTCATCATCTGGAATTATGAGAATTAAATGAATTTAGAGCACAGCAAAAATGACTTGATATAGTTTATGTAACTAGCATTTCAATTCTTTTCAAAATATTTTTT-CTTGAAATATTCCTGCTAACAAATATAATCCATAAAAGATTTCTTTAAAAAAAAA---TGAAATTGGAAGTTCTATTTTATTGCCTAAACAAATGGAAATTTCTCTTCTCTCTCTTCTCTGACTCCTCCCCCCAAAAGGTCTAAAAACAATTGTGGGAGCTTTGATCCAGTCTGTGAAGAAGCTCGCTGATGTGATGATCCTCACTGTGTTCTGTTTGG Lampropeltis_mexicana -CGCTAAAAACTATCACTGTCATTCCAGGTACATAATGGGGATGGCAAAGCTAAAGATGGTTTTAGGGATTTTGCTTTTTTATACAAATCAACTAGGCTAGTAGAAAACTGAGGTAGGTGTACCTCTTTACTGGACCAGGAAATCTATAATTAATATGATAGTAAAAAGAAGAATTTTGGTTGCTTTTCTTAAAAAAAA---TATATAATTATGGTACTGAAGGCAAATTCTATATAGTCATCATCTGGAATTATGAGAATTAAATGAATTTAGAGCACAGCAAAAATGACTTGATATAGTTTATGTAACTAGCATTTCAATTCTTTTCAAAATATTTTTT-CTTGAAATATTCCTGCTAACAAATATAATCCATAAAAGATTTCTTTAAAAAAAAA---TGAAATTGGAAGTTCTATTTTATTGCCTAAACAAATGGAAATTTCTCTTCTCTCTCTTCTCTGACTCCTCCCCCCAAAAGGTCTAAAAACAATTGTGGGAGCTTTGATCCAGTCTGTGAAGAAGCTCGCTGATGTGATGATCCTCACTGTGTTCTGTTTGG Lampropeltis_nigra -------AAACTATCACTGTCATTCCAGGTACATAATGGGGATGGCAAAGCTAAAGATGGTTTTAGGGATTTTGCTTTTTTATACAAATCAACTAGGCTAGTAGAAAACTGAGGTAGGTGTACCTCTTTACTGGACCAGGAAATCTATAATTAATATGATAGTAAAAAGAAGAATTTTGGTTGCTTTTCTTAAAAAAAAA----TATAATTATGGTACTGAAGGCAAATTCTATATAGTCATCATCTGGAATTATGAGAATTAAATGAATTTAGAGCACAGCAAAAATGACTTGATATAGTTTATGTAACTAGCATTTCAATTCTTTTCAAAATATTTTTT-CTTGAAATATTCCTGCTAACAAATATAATCCATAAAAGATTTCTTTTAAAAAAAA---TGAAATTGGAAGTTCTATTTTATTGCCTAAACAAATGGAAATTTCTCTTCTCTCTCTTCTCTGACTCCTCCCCCCAAAAGGTCTAAAAACAATTGTGGGAGCTTTGATCCAGTCTGTGAAGAAGCTCGCTGATGTGATGATCCTCACTGTGTTCTGTTTGG Lampropeltis_pyromelana -------AAACTATCACTGTCATTCCAGGTACATAATGGGGATGGCAAAGCTAAAGATGGTTTTAGGGATTTTGCTTTTTTATACAAATCAACTAGGCTAGTAGAAAACTGAGGTAGGTGTGCCTCTTTACTGGACCAGGAAATCTATAATTAATATGATAGTAAAAAGAAGAATTTTGGTTGCTTTTCTTAAAAAAAA---TATATAATTATGGTACTGAAGGCAAATTCTATATAGTCATCATCTGGAATTATGAGAACTAAATGAATTTAGAGCACAGCAAAAATGACTTGATATAGTTTATGTAACTAGCATTTCAATTCTTTTCAAAATATATTTT-CTTGAAATATTCCTGCTAACAAATATAATCCATAAAAGA-------------------------------------------GCCTAAACAAA--GAAATTTCTCTTCTCTCTCTTCTCTGACTCCTCCCCCCAAAAGGTCTAAAAACAATTGTGGGAGCTTTGATCCAGTCTGTGAAGAAGCTCGCTGATGTGA------------------------ Lampropeltis_ruthveni -CGCTAAAAACTATCACTGTCATTCCAGGTACATAATGGGGATGGCAAAGCTAAAGATGGTTTTAGGGATTTTGCTTTTTTATACAAATCAACTAGGCTAGTAGAAAACTGAGGTAGGTGTACCTCTTTACTGGACCAGGAAATCTATAATTAATATGATAGTAAAAAGAAGAATTTTGGTTGCTTTTCTTAAAAAAAA---TATATAATTATGGTACTGAAGGCAAATTCTATATAGTCATCATCTGGAATTATGAGAATTAAATGAATTTAGAGCACAGCAAAAATGACTTGATATAGTTTATGTAACTAGCATTTCAATTCTTTTCAAAATATTTTTT-CTTGAAATATTCCTGCTAACAAATATAATCCATAAAAGATT-----------------------------TTCTATTTTATTGCCTAAACAAATGGAAATTTCTCTTCTCTCTCTTCTCTGACTCCTCCCCCCAAAAGGTCTAAAAACAATTGTGGGAGCTTTGATCCAGTCTGTGAAGAAGCTCGCTGATGTGATGATCCTCACTGTGTTCTGTTTGG Lampropeltis_splendida GCGCTAAAAACTATCACTGTCATTCCAGGTACATAATGGGGATGGCAAAGCTAAAGATGGTTTTAGGGATTTTGATTTTTTATACAAATCAACTAGGCTAGTAGAAAACTGAGGTAGGTGTACCTCTTTACTGGACCAGGAAATCTATAATTAATATGATAGTAAAAAGAAGAATTTTGGTTGCTTTTCTTAAAAAAAA---TATATAATTATGGTACTGAAGGCAAATTCTATATAGTCATCATCTGGAATTATGAGAATTAAATGAATTTAGAGCACAGCAAAAATGACTTGATATAGTTTATGTAACTAGCATTTCAATTCTTTTCAAAATATTTTTT-CTTGAAATATTCCTGCTAACAAATATAATCCATAAAAGATTTCTTTAAAAAAAAA---TGAAATTGGAAGTTCTATTTTATTGCCTAAACAAATGGAAATTTCTCTTCTCTCTCTTCTCTGACTCCTCCCCCCAAAAGGTCTAAAAACAATTGTGGGAGCTTTGATCCAGTCTGTGAAGAAGCTCGCTGATGTGATGATCCTCACTGTGTTCTGTTTGG Lampropeltis_triangulum_CA ----------CTATCACTGTCATTCCAGGTACATAATGGGGATGGCAAAGCTAAAGATGGTTTTAGGGATTTTGCTTTTTTATACAAATCAACTAGGCTAGTAGAAAACTGAGGTAGGTGTACCTCTTTACTGGACCAGGAAATCTATAATTAATATGATAGTAAAAAGAAGAATTTTGGTTGCTTTTCTTAAAAAAAA---TATATAATTATGGTACTGAAGGCAAATTCTATATAGTCATCATCTGGAATTATGAGAATTAAATGAATTTAGAGCACAGCAAAAATGACTTGATATAGTTTATGTAACTAGCATTTCAATTCTTTTCAAAATATTTTTT-CTTGAAATATTCCTGCTAACAAATATAATCCATAAAAGATTTCTTTAAAAAAAA----TGAAATTGGAAGTTCTATTTTATTGCCTAAACAAATGGAAATTTCTCTTCTCTCTCTTCTCTGACTCCTCCCCCCAAAAGGTCTAAAAACAATTGTGGGAGCTTTGATCCAGTCTGTGAAGAAGCTCGCTGATGTGATGATCCTCACTGTGTTCTGTTTGG Lampropeltis_triangulum_Eastern GCGCTAAAAACTATCACTGTCATTCCAGGTACATAATGGGGATGGCAAAGCTAAAGATGGTTTTAGGGATTTTGCTTTTTTATACAAATCAACTAGGCTAGTAGAAAACTGAGGTAGGTGTACCTCTTTACTGGACCAGGAAATCTATAATTAATATGATAGTAAAAAGAAGAATTTTGGTTGCTTTTCTTAAAAAAA--TATATATAATTATGGTACTGAAGGCAAATTCTATATAGTCATCATCTGGAATTATGAGAATTAAATGAATTTAGAGCACAGCAAAAATGACTTGATATAGTTTATGTAACTAGCATTTCAATTCTTTTCAAAATATTTTTT-CTTGAAATATTCCTGCTAACAAATATAATCCATAAAAGATTTCTTTAAAAAAAA----TGAAATTGGAAGTTCTATTTTATTGCCTAAACAAATGGAAATTTCTCTTCTCTCTCTTCTCTGACTCCTCCCCCCAAAAGGTCTAAAAACAATTGTGGGAGCTTTGATCCAGTCTGTGAAGAAGCTCGCTGATGTGATGATCCTCACTGTGTTCTGTTTGG Lampropeltis_triangulum_MX GCGCTAAAAACTATCACTGTCATTCCAGGTACATAATGGGGATGGCAAAGCTAAAGATGGTTTTAGGGATTTTGCTTTTTTATACAAATCAACTAGGCTAGTAGAAAACTGAGGTAGGTGTACCTCTTTACTGGACCAGGAAATCTATAATTAATATGATAGTAAAAAGAAGAATTTTGGTTGCTTTTCTTAAAAAAAA---TATATAATTATGGTACTGAAGGCAAATTCTATATAGTCATCATCTGGAATTATGAGAATTAAATGAATTTAGAGCACAGCAAAAATGACTTGATATAGTTTATGTAACTAGCATTTCAATTCTTTTCAAAATATTTTTT-CTTGAAATATTCCTGCTAACAAATATAATCCATAAAAGATTTCTTTAAAAAAAA----TTAAATTGGAAGTTCTATTTTATTGCCTAAACAAATGGAAATTTCTCTTCTCTCTCTTCTCT?ACTCCTCCCCCCAAAAGGTCTAAAAACAATTGTGGGAGCTTTGATCCAGTCTGTGAAGAAGCTCGCTGATGTGATGATCCTCACTGTGTTCTGTTTGG Lampropeltis_triangulum_SA ----------CTATCACTGTCATTCCAGGTACATAATGGGGATGGCAAAGCTAAAGATGGTTTTAGGGATTTTGCTTTTTTATACAAATCAACTAGGCTAGTAGAAAACTGAGGTAGGTGTACCTCTTTACTGGACCAGGAAATCTATAATTAATATGATAGTAAAAAGAAGAATTTTGGTTGCTTTTCTTAAAAAAAA---TATATAATTATGGTACTGAAGGCAAATTCTATATAGTCATCATCTGGAATTATGAGAATTAAATGAATTTAGAGCACAGCAAAAATGACTTGATATAGTTTATGTAACTAGCATTTCAATTCTTTTCAAAATATTTTTT-CTTGAAATATTCCTGCTAACAAATATAATCCATAAAAGATTTCTTTAAAAAAAAA---TGAAATTGGAAGTTCTATTTTATTGCCTAAACAAATGGAAATTTCTCTTCTCTCTCTTCTCTGACTCCTCCCCCCAAAAGGTCTAAAAACAATTGTGGGAGCTTTGATCCAGTCTGTGAAGAAGCTCGCTGATGTGATGATCCTCACTGTGTTCTGTTTGG Lampropeltis_triangulum_Tamaulipas ----------CTATCACTGTCATTCCAGGTACATAATGGGGATGGCAAAGCTAAAGATGGTTTTAGGGATTTTGCTTTTTTATACAAATCAACTAAGCTAGTAGAAAACTGAGGTAGGTGTACCTCTTTACTGGACCAGGAAATCTATAATTAATATGATAGTAAAAAGAAGAATTTTGGTTGCTTTTCTTAAAAAAA--TATATATAATTATGGTACTGAAGGCAAATTCTATATAGTCATCATCTGGAATTATGAGAATTAAATGAATTTAGAGCACAGCAAAAATGACTTGATATAGTTTATGTAACTAGCATTTCAATTCTTTTTAAAATATTTTTT-CTTGAAATATTCCTGCTAACAAATATAATCCATAAAAGATTTCTTTAAAAAAAA----TGAAATTGGAAGTTCTATTTTATTGCCTAAACAAATGGAAATTTCTCTTCTCTCTCTTCTCTGACTCCTCCCCACAAAAGGTCTAAAAACAATTGTGGGAGCTTTGATCCAGTCTGTGAAGAAGCTCGCTGATGTGATGATCCTCACTGTGTTCTGTTTGG Lampropeltis_triangulum_Western -CGCTAAAAACTATCACTGTCATTCCAGGTACATAATGGGGATGGCAAAGCTAAAGATGGTTTTAGGGATTTTGCTTTTTTATACAAATCAACTAGGCTAGTAGAAAACTGAGGTAGGTGTACCTCTTTACTGGACCAGGAAATCTATAATTAATATGATAGTAAAAAGAAGAATTTTGGTTGCTTTTCTTAAAAAAA--TATATATAATTATGGTACTGAAGGCAAATTCTATATAGTCATCATCTGGAATTATGAGAATTAAATGAATTTAGAGCACAGCAAAAATGACTTGATATAGTTTATGTAACTAGCATTTCAATTCTTTTCAAAATATTTTTT-CTTGAAATATTCCTGCTAACAAATATAATCCATAAAAGATTTCTTTAAAAAAAA----TGAAATTGGAAGTTCTATTTTATTGCCTAAACAAATGGAAATTTCTCTTCTCTCTCTTCTCTGACTCCTCCCCCCAAAAGGTCTAAAAACAATTGTGGGAGCTTTGATCCAGTCTGTGAAGAAGCTCGCTGATGTGATGATCCTCACTGTGTTCTGTTTGG Lampropeltis_webbi ----TAAAAACTATCACTGTCATTCCAGGTACATAATGGGGATGGCAAAGCTAAAGATGGTTTTAGGGATTTTGCTTTTTTATACAAATCAACTAGGCTAGTAGAAAACTGAGGTAGGTGTACCTCTTTACTGGACCAGGAAATCTATAATTAATATGATAGTAAAAAGAAGAATTTTGGTTGCTTTTCTTAAAAAAAA---TATATAATTATGGTACTGAAGGCAAATTCTATATAGTCATCATCTGGAATTATGAGAATTAAATGAATTTAGAGCACAGCAAAAATGACTTGATATAGTTTATGTAACTAGCATTTCAATTCTTTTCAAAATATTTTTT-CTTGAAATATTCCTGCTAACAAATATAATCCATAAAAGATTTCTTTAAAAAAAAA---TGAAATTGGAAGTTCTATTTTATTGCCTAAACAAATGGAAATTTCTCTTCTCTCTCTTCTCTGACTCCTCCCCCCAAAAGGTCTAAAAACAATTGTGGGAGCTTTGATCCAGTCTGTGAAGAAGCTCGCTGATGTGATGATCCTCACTGTGTTCTGTTTGG Lampropeltis_zonata ----------CTATCACTGTCATTCCAGGTACATAATGGGGATGGCAAAGCTAAAGATGGTTTTAGGGATTTTGCTTTTTTATACAAATCAACTAGGCTAGTAGAAAACTGAGGTAGGTGTACCTCTTTACTGGACCAGGAAATCTATAATTAATATGATAGTAAAAAGAAGAATTTTGGTTGCTTTTCTTAAAAAAAA---TATATAATTATGGTACTGAAGGCAAATTCTATATAGTCATCATCTGGAATTATGAGAATTAAATGAATTTAGAGCACAGCAAAAATGACTTGATATAGTTTATGTAACTAGCATTTCAATTCTTTTCAAAATATTTTTT-CTTGAAATATTCCTGCTAACAAATATAATCCATAAAAGATTTCTTTAAAAAAAAA---TGAAATTGGAAGTTCTATTTTATTGCCTAAACAAATGGAAATTTCTCTTCTCTCTCTTCTCTGACTCCTCCCCCCAAAAGGTCTAAAAACAATTGTGGGAGCTTTGATCCAGTCTGTGAAGAAGCTCGCTGATGTGATGATCCTCACTGTGTTCTGTTTGG ; END; [ The following blocks are output data for analysis step 12824 ] BEGIN TREES; TITLE concatenated_gene_tree; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep12824; TREE TREE1 = [&R] (Arizona_elegans:11.301608487446218,(Cemophora_coccinea:9.131521401278997,(((Lampropeltis_triangulum_MX:1.9325284089340764,(Lampropeltis_triangulum_CA:1.4085758888421207,Lampropeltis_triangulum_SA:1.4085758888421207):0.5239525200919566):3.540645231903696,(Lampropeltis_zonata:4.177619026315392,((Lampropeltis_knoblochi:1.4512979251940834,Lampropeltis_pyromelana:1.4512979251940834):1.2207323272186485,(Lampropeltis_alterna:2.388339969544813,(Lampropeltis_mexicana:1.815089156482557,(Lampropeltis_ruthveni:1.5326788041679382,Lampropeltis_webbi:1.5326788041679382):0.28241035231461886):0.573250813062256):0.28369028286791886):1.5055887739026605):1.2955546145223806):2.2662952850281552,((Lampropeltis_triangulum_Tamaulipas:6.065711121423957,(Lampropeltis_elapsoides:5.028641891297922,(Lampropeltis_triangulum_Eastern:2.259579570821309,Lampropeltis_triangulum_Western:2.259579570821309):2.769062320476615):1.0370692301260354):1.1628677818502204,(Lampropeltis_calligaster:5.63824275465496,(Lampropeltis_extenuata:5.187634941084902,((Lampropeltis_getula:2.853059054565959,Lampropeltis_holbrooki:2.853059054565959):1.1785315798329137,(Lampropeltis_nigra:3.0392517578297387,(Lampropeltis_californiae:1.6141166252857637,Lampropeltis_splendida:1.6141166252857637):1.425135132543975):0.9923388765691339):1.1560443066860309):0.4506078135700582):1.590336148619218):0.5108900225917488):1.3920524754130703):2.1700870861672215); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr69421] END;