#NEXUS
[!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file.


Generated on April 21, 2026; 13:38 GMT

TreeBASE (cc) 1994-2008

Study reference:
Tennessen J.A., Govindarajulu R., Ashman T., & Liston A. 2014. Evolutionary origins
and dynamics of octoploid strawberry subgenomes revealed by dense targeted capture
linkage maps. TBD, .

TreeBASE Study URI:  http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S15849]

[ The following blocks are input data for analysis step 13790 ]
BEGIN TAXA;
        TITLE  TaxaForAnalysisStep13790;
        DIMENSIONS NTAX=26;
        TAXLABELS
            Fchil_I_Av_m
            Fchil_I_Av_p
            Fchil_I_B1_m
            Fchil_I_B1_p
            Fchil_I_B2_m
            Fchil_I_B2_p
            Fchil_I_Bi_m
            Fchil_I_Bi_p
            Fragaria_bucharica
            Fragaria_iinumae
            Fragaria_mandshurica
            Fragaria_nipponica
            Fragaria_vesca_ssp_vesca
            Fragaria_viridis
            Fvb_m
            Fvb_p
            Fvb_s
            Fvirg_I_Av_m
            Fvirg_I_Av_p
            Fvirg_I_B1_m
            Fvirg_I_B1_p
            Fvirg_I_B2_m
            Fvirg_I_B2_p
            Fvirg_I_Bi_m
            Fvirg_I_Bi_p
            Rubus_coreanus
            ;
END;

BEGIN CHARACTERS;
[! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M22328]

	TITLE Octoploid_Strawberry_Subgenomes_LG1;
	LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep13790;
	DIMENSIONS NCHAR=540;
	FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=N GAP= -;

MATRIX
[                                    10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220       230       240       250       260       270       280       290       300       310       320       330       340       350       360       370       380       390       400       410       420       430       440       450       460       470       480       490       500       510       520       530       540]
[                                     .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .]
Fchil_I_Av_m                 NTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTNTNNNTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCNNNNNCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Fchil_I_Av_p                 NNNNNNNNNTTANNNNNNNNNNNNNNGNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACTNNNNNNNNNNNCCNANNNNNNNNNNNNNTTCGTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNANNNNNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNNCNNNNNATTNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGANNNNNANNNNNNNNNNNNNNAGANNNNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACNNNNNNACNNNNNNNNNNNTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGNNNNNCAATNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Fchil_I_B1_m                 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNCANNNACGNNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNGCTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNCTATTCATGANNNNNNNNNNNNNTNNNNNNCTNNNNNNNNCNNNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNCACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNACNCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCACNNGAATCTANNNNNNNNNNNNNNNNNTCTNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNGCCGCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNTANNNNGCTCNNNNNNNNNNNNATNGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Fchil_I_B1_p                 NNNACCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTTNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCGGCNNNNTANNCGTTAGGAGGTGGNNCCTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNNANNNNNNNNAGNNNNNNNNNTTAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGNNNNACCCNNNNNNNNNNNNNCGNCCTANNNNANNNNNNNNNNANNNTNNNNNATNNCANNNNNNNNTAANNNAATNCCTNNNNNNNNNNNNTGCACNNNNNNNNNCGCNNACTTANNNNNNNNNNNNNNCTAANNNNNNNNNNNNNNNNCGCCGCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATANNNNNNNNNNNNNNCCAATNNNNNNNNNCGTNNNNGGNGNNNNAANNNNNNCT
Fchil_I_B2_m                 NNNNNNNTTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNANNNNNNNGACNNNNNNNACCNNNNNNATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTANNNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTGCNNCATNNNNNNNNNNNNNNNNACNNNNNNNNCATNNNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTANTGGNNNNNNNNGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCTNTCNNNNNNNNNNNNTCATNTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGNACNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGGTNNNNNNNTNN
Fchil_I_B2_p                 NNNNNNNNNNNNNNGTNNNNNNNNGTNNAATCNNNNNNNANGNNNNNNTTAANNNNGANNNNNNNNNNNNNNATTTNNGGGNNNNCTGAGNNNNNNNNNNNNNNNNNTANNNNNNNGNNNNNNNGNNNNNNGTCNNNNCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCNNNCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATNNNNTTACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGNNNTNNNNNNANNNGTNNNNNNNNTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Fchil_I_Bi_m                 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNATANAGNNNCTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNNNNNCGNNNNNANNNNNNNNTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCANNNNNNNNNNTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCACNNNNNNNNNNNNGCNNNNNNNNNNNNNNNNCGNNNNNGGACTNNNNNTCNNNNNNNNNNNNNNNNGTGNNNNNNCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGTNNNNNNNNNNNNNNN
Fchil_I_Bi_p                 NNNNNNNTNNNGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTANNNNNNNNNNNNNNNCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGNNNNNNNNNNATNNNNNNNNNNNNNNNTTGGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATANNNNNNNNNNNNNNNGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCNNNNNNNNNNNNNNGGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAATNNNNNNNNNNNGTNNNNNTGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCATACACNNNNNACCACAAGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCNNN
Fragaria_bucharica           ANGAAACCCTCACAGCAGTCCAGTACATAGCTAGGGATTGNACCAATGTCAANGACGAGTATGANGCAAGCTNNNNCAACTGCAGTCATGCGTCAANNTTAAGTTAGCNAACGTTAGCAAAAGAANNAGGNCGTNNNNACGTTATTACAGTGAGCTAGTCGTCACTTTACTTCGAATGTACTATGTTTGGTNNTNGGTGCNGTTGACTAGCGTCGTCTCGGTCGTGGTCACTGATCCTCACATTAGCAGAACNNCNATGAGGCAGGAGGGGTATAACCTCGATCAGACAAACTGTTCTNTAGGNNNNGTGCATAATGCGGTNANGTTAGAAGNGCACTGTCGGTTAATTCGGGTTAAGTTTTCTTGTTCCGGANTANNNCAGTTAACGCTCGAAGTCATCCTNTTCNCTCGNGAATTGACTGTGGTAGTGTNNNCGCGTGTTGTGAANTATTTACTCAGCATATCATCCGTCTCCCTTNGACAGATTTATGATACCTAGANCTGGCGGTGATGAACGTCAGTANNGAANNAGTACGCCCC
Fragaria_iinumae             NCAANNGTTGNGAAACGACTTGCAGTNTAATCNGACCTTNTGNCGNTGTTAANGACGANTNNNNCNNGCTTCNCNNNTGNGGTTNCTANAGGTTNATTTNNGCTAATNNAAANNNANGGGNNNGNCCNNATNNCCGTTCCNNNGNCNNTNAAANATNGCCNGTGTCCCGCCNNGGAATATCNNNNCGTGGNAGATNNNGAAAACNGATCACTCANTCNTAAANATTANTACTNCCCNNNANAANGACANNACNNACGGAAANTGANTANGGTACANNATGGAAGTNCTGATNGCNCNNATAGACGTGGTNGGAAANNCAACNGATTCCNANGCGCATNNATAGNNNNNCTGGNNCTTNTTTNTNNACCNNNNNCNNCGNCAACNTATCTNNNNNNNTGCNCNANGTGCTCATGNACNNCNCACCACNAGATCCTTNNAGCANNGNGANACGTNNATNNGTNAGGGACTTTTTGTNCGNCGGCAGNNTNATGGNNNNNNNGNCNNNNGATGGCAAANGNNNGCNGTGNGGTANTATGCCNN
Fragaria_mandshurica         ATNNNNNCCTNACNGAAGNCAAGTACNNAGCTAANNACCNCANCANCNGCNTCNNNNNGTNNNCGGNAAGCTNCNNNAANTGCANTCATGNTCNNAAACNAAGGTGGNGAACGNANNNAAAANANGTNNNCNNNCATTACGNNACTANANTGGACNAGTCGTCACTCCACTNNNAACGTGTNNNNTTAATCNNNNGGNGCGGTTGACNNGCNTCNNNTCGGTNGTGGNCAACNANNNNNANGNNGNNNNNNGGGANNTGNGNCANATGNAGGGTGNNCCCGTTCACACAAANNNNTNNTCAGGAACCTCNCATTGNATGGTNAGGNTAGTGCNGNNNTNTCGGTNNATTCGTNNTAACGTGCCNTGTTCCNNNACCTCNNGGTNNNCGCNCGANNNNATNNNNNTCTNTCGTGAGTTAACTGTGGTNGTGTTTGCNCGTGTTNTNACNTATNNNNGNNNCATNTCATCCGTCTNNANGGTACGTTCTTNNNANNNNNNNAGTNGGNGGTGATGCTTNNNNNTAANGNAGAANCGNNCCTC
Fragaria_nipponica           ACAACCGTCACGCNACGACTTACAGANTATTCAGACATTGCACCGGTGTCAATGACTAGTATGCCCCGCTCCCCCACAGCNGCGGCTGAGGGTTNATTTTAGCTAATNNTTCGTANAAAAAAGAANNATATCGCTGTTCCGCTATTCAAGTGAGATGGTCGTCACCCNACTTTGGANNNATNANNNGTGNTNGACTGTGAAANNNGATCNCTTAGNCTCNNNNATTATTACTNCCCCTTACATTGGCGGAACCNNAATAAAATAGGAGGGGTACAACCTCGAAGAACTGATTGCCCCTNTGNGAGCGGTGCNTAATACGGTNNNTTTAGNNNCNNATTATTGGATATCCTGTGTNNNNTTTTTTCACTTCGAACTNCNNCNANNNNCCCTCAAAGTCACCCTATGCNCTCGTGCATCGCTCACCACAAGATCTTCGTGGGTTGGGAACTATTTAAGAAGTGAGGCACTCGTCNTCNGTCGGTAGATTTATGGTACTTAGNCCTAACGATGNCAATNGCCAGCANTTAANTAANNTGCTCC
Fragaria_vesca_ssp_vesca     GTGGAACTCTCACGGAAGTCAAGTACACAGCTGAGGACTGCACTAGCAGCGTCAGTTGGCCCACGGCAAGCTCCCATAACTGCATTCATGTTCCAAAACTAAGGTGGCGTTCGTATGCAAAAGAAGTAGGCCGTCAAAACGTCATTACAGTGGACCAATTTTCACTTTACTTCGAACGTGTTGTGTTAATCCATCGCTGCGGTTAACAAACGTCTGTCCGGTCGCGGCCAACAATCCTAACGTTAGTCGAGGGAACGTGAGGCAGATGGAGGGTGACCCCATTCACACAAACTATTCTTCAAGAACCTCGCATTGTATGGTTAGGTTAGTGCTGGGCCGTCAGTTAATTCATACTAACGTGCCTTGTTCCGGAACCTCATGGTTAGCGCTCGAAGACATTTTCTTCTTCTGCAAGTTAACTGTGGTAGTGCTTGCGCGTGTTGTGACCTATGGACGAAACATATCGTCCGACTCCATGGTACGTTCTCCAAGTATCTAGAGTTGGCGGTAATGCTTGCCAATAAGGAAGAAGCGCTCCTT
Fragaria_viridis             NNAANNCNCNNNNNNAANNNNACAGCNTNNCTAGNNNNCNCANNANNNNCAANNNNTAGTNNNNNGNNNNCNNCNNNNGNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNACNNNNNNNNAANNNNNNNNNNNCTGTTCCNNNNNCNNNNTGNNNNANNNNNNNNNCCNNTNNNNANNNNNNNNNTTNNNNNNNCTGNGNNNNNNNNNCACNTNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNNNTNNNANNANNNNNNNANNNNNNNNNNNNANNNANNGNNNANNCNNGTNNNNCNNNANNNNNNNNNNNNANNNNNANNNNNNACNNNNNNNTNNNANNNGCANNNNTNGNNNNNNNGTGNNNNNTTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNCNNNNNTGNNNNNGNNNNNNCNNNNGTNGTATNTNNNNGGGNNNNNNNNTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCNCNNGNNGACNNNNNTNNNNNNNNNNNNGCNGNNNNNNNCANNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNTNNCNN
Fvb_m                        GTGGNNCCCTNACGGAAGTCAAGTACNCGGCTGGGGACCNCANTANCAGCGTCANTTGGNCCACGGAAAGCTNNNNTAANTACATTCNTGTTCCNNAACNAAGGTGGNGTTCGNATNCAAAANANGTNGGNNGTCAAAAGANNANCACANTGGACCAATTTTCACTCCATTNNAANCGTGTNGNNTTAATCCATCGCNCCGGTTAACAAATGTCNGTCCGGTNGCGGNCGACNATTNNAGNGTNAGTCGNGGGAACGTGCGNCAGATGNAAGGTGNNCCCATTCACACAGANTANTNNTCNAGAACCTCACATTGNATGGTTAGGCTAGTGCTAGGCNNTCAATNNATTCGTACTAACGTGCCNTGTTCCNNNACCTCNTGGTNAGCGCNCGANNNCATTTNCNTCTTCTGCGAGTTAACTGTGGNNGTGCTTGCNCGTGTTNTNACNTATGGNCGNNACATATCGTCCGNCTCNATGGTATGTTCCCCAAGNNTNNNNAGTNGGNAGCAATGCTTTCNNATAAGGNAANGNCGTTGCNN
Fvb_p                        GTGGNNCCCTNACGGAAGTCAAGTACNCGGCTGGGGACCNCANTANCAGCGTCAATTGGCCCACGGAAAGCTNCNNTAANTACATTCATGTTCCNCAACNAAGGTGGNGTTCGNATNCAAAANANGTNGGTNGTCAAAAGANNACCACANTGGACCAATTTTCACTCCATTNNAAGCGTGTNGNNTTAATCCATCGCNCCGGNNAACAAATGTCNGTCCGGTNGCGGNCGACNATTNNAGNGTNAGTCGNGGGAACGTGCGNCAGATGNAAGGTGNNCCCATTCACACAGANTANTNNTCNAGAACCTCACATTGNATGGTTAGGCTAGTGCTAGGCCNTCAATNNATTCGTACTAACGCGCCNTGTTCCNNNACCTCNTGGTNAGCGCNCGANNNCATTTNCNTCTTCTGCGAGTTAACTGTGGTNGTGCTTGCNCGTGTTNTNACNTATGGNCGNNACATATCGTCCGNCTCNATGGTATGTTCCCCAAGNNTNNNNAGTNGGNAGCAATGCTTTCNNATAAGGNAANGNCGTTGCNN
Fvb_s                        GTGGNNCCCTNACGGAAGTCAAGTACNCGGCTGGGGACCNCANTANNAGCGTCAGTTGGTCCACGGCAAGCTNCNNTAANTGCATTCATGTTCCNCAACNAAGGTGGNGTTCGNATNCAAAANANGTNGGCNGTCAAAACGNNATCACANTGGACCAATTTTCACTCCATTNNAAGCGTGTNGNNTTAATCCATCGCNGCGGNNAACAAATGTCNGTCCGGTNGCGGNCAACNATTNNAGNGTNAGTCGNGGGGCAATGNGNCAGACGNAAGGTGNNCCCATTCACACANANTANTNNTCAAGAACCTCACATTGNATGGTTAGGCTAGTGCTGGGCCNTCAGTNNATTCGTACTAACGCGCCNTGTTCCNNNACCTCNTGGTNAGCGCNCGANNNCATTTNCNTCTTCTGCGAGTTAACTGTGGTNGTGCTTGCNCGTGTTNTNACNTATGGNCGNNACATATCGTCCGACTCNATGGTACGTTCCCCAAGNNTNNNNAGTNGGNGGTAATGCTTGCNNATAAGGNAGAANCGNTNGCN
Fvirg_I_Av_m                 NNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTNNNNGCGTNNNNNNNNNNNNNNCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACTNNNNNNNNNNAAANNNNNNAAAGNNGTNNNNNNNNNNNNNNTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNATNNNNNNCTGNNNTTNNNNNNNNNNNGTNNGGTCNNNGNNAANANNTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCNNNNNNNNNNTGACCCCNNTCNNNNNNNCNNNNNNNNNNNAACNNNNNNNNNNNNGGTNNNNNNNNNGCTGGGCNNNNNNTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNGTTAANNNNNNNNNNNNTTNNNNNTGNNNNNNNNNNNNNNNGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Fvirg_I_Av_p                 GNNNNNNNCTTACGNAANNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNCNNNNNNAGCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCACNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNGCTNNNNNNNNNNNACNNNNNNNCNNNNNNNNNNNNNNNNTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGNNNNNNNNNNNTGACCCNNNNNACANNGNCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGGNNNNTNNNNNNNNNNNAGTTNNNNNNNNNNNNNNTCCNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTNNNNNNNNNNNNGAGTTAACTGTGGTNNNNNTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNCCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Fvirg_I_B1_m                 NNNNNNNNNNNNNGNNNGTNNNNNNNNNNNNNNNGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGNNNNTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTGNNNNNNNCNCATNNNNNNNNNNNNNANNNNNNNNNNCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNCANNNNNNNNNNNNACNNNNNNNNAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGNCGCGNNNNNNNNCNNNNNNNNNNNNNNAGCNNNNNNNNNNAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTNNNNNNNNNNNCCTNNTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGANNCCAATNNNNNNNNNNNNNAGCNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Fvirg_I_B1_p                 NNGGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACGGCNNNNNNNNNNNNCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGGCCNNNNNNNNNNNCTGNNNNNNNNNCATNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCNNNNNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNANNGCAGANNNNNNNNNNNNNNNNNANGGTNNACCCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNGNNNNNNGNAACCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAGTCTNNNNCTAANNNCTCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCNNNNNNNNNNNNNNNTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCNNCGNNNNNNNNNNNNNNNTCGAGNCCAANGANNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Fvirg_I_B2_m                 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNCTCTNNNNNNNNTCNNNNNTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTGNNNNNGTNNNNNNNNNNGNNNNNNGTCCGTTNNNNNNNNNNTGAANNNTNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATNNNNNNGCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTANNNNNNNNNNNNNNNNANTNNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNAGGCNNNNNNNNNNNNNTNNNGGNNNNNNNNNNTTCACNNNNNNNNNNNANNACCTANNCCNNNNNNNNNNCCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGNNNNNNNNNNNNNNGANNNNNNNNNNNTTNNNNNNNNNNNNNNNNGCACTTANNNNNNNNNNNGNNNNNNNNGGGNGGTNNNNNNNNNNNNNNN
Fvirg_I_B2_p                 NNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNGCAGTNNNNNNNNNNCTTANNACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGNNNNNNNNNNNNTTTTNNNNNNNNNNNNNTATNNNNNNNNNCTCTNNNNNNNNNNNACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCNNNNTGCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCNNNNNNNNANNNNNNNNNNGCNNNNNNNNGAGANTGGNNNNNNNNNNNNNTACNANTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCNNNNNNNNNNNNNNNNATTNNNNNNNNNNNNNNNNTTCNNNNGAATCTNNGANNACNNNNNNCTAGNNNTGCNCCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCNNNNNCTGTGNNACGTTNNNCANNNNNNNNNNNNNNGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGNNNNNN
Fvirg_I_Bi_m                 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTANNNGGTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCANNNNNNNNNNNNNNNNCGNNTTGGNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNCNNNNNCCCCTNNNNNNNACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAGATGGNNNNNNNNNTNNNCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCNNNNNCTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCNNNNNNNNNNNNNNNACCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Fvirg_I_Bi_p                 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNAAAGNNANNGGTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCANNNNNNNNNNGTGTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGNNNNACACNNNNNNNNNCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGNTACTNNCAACGNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATNNNNNNNNNNNNNGGNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Rubus_coreanus               NNANNNNNCACANANTAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCANCANNNGNANCNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNANNNNNNNNNNNNGNNNNNNNACGNNAGGNNNNNNNNNNNNTNNNGNNNNNNNNNNNNNNTNNNNGNNNNNNNNNNNNANANGANNNGTGCNNNNNNNNNNNNGAANNTNNNTANCNNNNNNTCAANTNNNTNNNNNNNNNNTNNNNANNNTNGCACNNCAANNNNNNNCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNANNNNNNNNCTNTANNNNTGNNNNNNTNNNANNNCNNTTCNNANNNNNNNNNNNNNNNNNCTCAGNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGANNNCNNNNNNNNNNNTTNNNNNNTANCANNNGNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNTNNNNNNNCNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNCNGNATANNNNNNTACTNN
;
END;

[ The following blocks are output data for analysis step 13790 ]
BEGIN TREES;
      TITLE Octoploid_Strawberry_Subgenomes_LG1;
      LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep13790;
      TREE LG1_tree = [&R] ((((((Fchil_I_B2_p:1.31877602799661E-6,(Fvirg_I_B2_m:1.31877602799661E-6,Fvirg_I_B2_p:1.31877602799661E-6)73:2.5578030862001E-6)59:0.05376991194705736,Fchil_I_B2_m:0.042762358653966465)68:0.041265473994598754,((Fchil_I_B1_m:1.31877602799661E-6,(Fvirg_I_B1_m:1.31877602799661E-6,Fvirg_I_B1_p:1.31877602799661E-6)37:1.31877602799661E-6)75:0.06120979983901156,Fchil_I_B1_p:0.02179952193355141)98:0.14265059102524658)74:0.08342954407053109,(Fragaria_iinumae:1.31877602799661E-6,((Fchil_I_Bi_p:1.31877602799661E-6,(Fchil_I_Bi_m:0.03767603716531588,Fvirg_I_Bi_p:0.054521491996383245)61:0.005168252478546314)41:0.011528276079595882,Fvirg_I_Bi_m:1.31877602799661E-6)96:0.1694258346829606)83:0.04123352457417049)100:0.2019500852576384,((Fragaria_viridis:0.06604784240139848,(Fragaria_bucharica:1.31877602799661E-6,(Fragaria_mandshurica:1.31877602799661E-6,((Fchil_I_Av_m:1.31877602799661E-6,Fragaria_vesca_ssp_vesca:0.013512764306485013)62:1.5725854039711087E-4,((Fvirg_I_Av_m:0.0058656106443723596,Fvirg_I_Av_p:1.31877602799661E-6)35:0.029138943979736452,((Fvb_s:0.014907338047303815,(Fvb_p:1.31877602799661E-6,Fvb_m:0.00226660955076054)89:0.044753291757813354)53:0.021426988365992022,Fchil_I_Av_p:1.31877602799661E-6)15:1.31877602799661E-6)59:0.02449239594055814)99:0.09963797032460976)100:0.32070249885927804)100:0.2983098044655219)59:0.270933166153036,Fragaria_nipponica:1.31877602799661E-6)3:0.17168154201720742):0.19830423853789828,Rubus_coreanus:0.19830423853789828);
[!  TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr75175]


END;