#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 23, 2026; 13:36 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Tennessen J.A., Govindarajulu R., Ashman T., & Liston A. 2014. Evolutionary origins and dynamics of octoploid strawberry subgenomes revealed by dense targeted capture linkage maps. TBD, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S15849] [ The following blocks are input data for analysis step 13792 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep13792; DIMENSIONS NTAX=26; TAXLABELS Fchil_III_Av_m Fchil_III_Av_p Fchil_III_B1_m Fchil_III_B1_p Fchil_III_B2_m Fchil_III_B2_p Fchil_III_Bi_m Fchil_III_Bi_p Fragaria_bucharica Fragaria_iinumae Fragaria_mandshurica Fragaria_nipponica Fragaria_vesca_ssp_vesca Fragaria_viridis Fvb_m Fvb_p Fvb_s Fvirg_III_Av_m Fvirg_III_Av_p Fvirg_III_B1_m Fvirg_III_B1_p Fvirg_III_B2_m Fvirg_III_B2_p Fvirg_III_Bi_m Fvirg_III_Bi_p Rubus_coreanus ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M22332] TITLE Octoploid_Strawberry_Subgenomes_LG3; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep13792; DIMENSIONS NCHAR=627; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=N GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Fchil_III_Av_m NNNNNNNNNNNNNCNNNNNNNNNNNGNNNNNNGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGANNNNNNNNNTAACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNGANNNNAGCAATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGCCNNAANNNNNNNNNNNNNNNTANNNNTCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTNNNNNNGTANNNNCNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACGANNNNNNNNNTCGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN Fchil_III_Av_p NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTNNCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCNNNNNNNNNNNNNNNNTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCCCGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTNNNNNNNNNNNNNNNNNCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTAAAGGNNNNNNNNNNNNNNNGGTTNNNATCTTGACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGNNNNNNNNNNNNANNNNNNNNNNNTATNNNNNNNNNNNNNNNGTNNNNNT Fchil_III_B1_m NNNNNANNNNNNNCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATGCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAANNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTGTTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNCGNNNNNNNNNNNNNNNNNGCCGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCANNCACACNNNNNNCNNNNCTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGANNTTTCNNNNCAANNNNNNNACTATTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTANNNNNNNNNNNNNNNNGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNCACCTGANNNNNNNNNNNNNGGNNNNNNNNNNNNNNCGGTNNNNNNNN Fchil_III_B1_p NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTNNNNNNNNNNNNNNNAANNNNNNNNNNCGTNNNNNNNNNNCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACNNGCGAACCCNNNNNNNNNNNNNNNAGNCATCNNCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCGANNNNNNNNNCGATGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCANNNNNNNNNNNNNNNNTTNNNTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTANNAATTTCNNNTCAACNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNNTNNACNNNNNNNNTCNNNNNATGNNNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTANNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGTNNNNNNNN Fchil_III_B2_m NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGANNNNNNNNNNNNNNTCACGANNNNNNNNNNNNNNNNNAAANNNNNNNNNNNNGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGCTGNNNNNNNNGTTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGCGNNNNNNNNNAGCGNNNNNNNNNNNNNNNAAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCTNNNNNNNNNNNNNNNNAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNTCGCTNNNNNNTTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNAGCTCNNNNNNNNNNNNNNACAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN Fchil_III_B2_p NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGNNNCGTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAACTNNNNNNNNNNNNNNNGAACTCNNNNNAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATNNNNNNNNNNNNNNTGNNNNAGNNNNNNNNNATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATTNNNATTTCNNNNCAACNNNNNNNNNNNNNNNNTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN Fchil_III_Bi_m NNAGGNNNNNNNNNNNNNGCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNCANNNNNNNNNNNGTCNGAAAAANNNNNNNNNNNGNNNNNNNATNNNNNNNNNNNNNNNNCNNNNNNNTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNNNATAGGACCNNNNNNNNNCACNNNNNNNNNNTNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTNGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAAGANNNNNNNNNNNNNNNNCNAGNNNNNNNNNNNNNNNAGCAANNNGCNNNATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGNNNNNNNNNNNNNTCGCNNGCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCANNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN Fchil_III_Bi_p NNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAACATNNNNNNGCNNNNNNNCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCAGNCAGATNTGNNNNNNNNNNNNNNCGNNNNNNNNNNNNNNNGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNGAGCCTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGCATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGGNAACTAGGGNNNNNNNNNNNNNNNAGTGNNNNNAGTATGGCCGGNNAAANNNNNNNNNGGGNNNNNNNNNNNNNNNNATTNNNNNCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCNCNNNNNTGTCNGTCTGNNNNACANNNNNNCANNNNNNNNNNNNNNNNGATNNNNNNNNNTGCNNNNNNNNNTGAGNNNNNNNNNNNNNN Fragaria_bucharica TAAACGCCTAGGTTTGCCNGNNNNNGGACTGAGCCGATTACGAACCTTGACGCCCGGATGTATTACATTTGGTTNNNTTGTGTNGNTTAAATGAAANTGCAATTGCTACTANNNNGTCCAGCATAAGNCANNNNNNTATAAAGTGNCTCCAGTAAGCGCAAACAATAACACTCCCGTGAAGNNAACAGNCCCAGCTCAGTAGGAGCCATTGNTCTCGAGCCTATCATCNNNNNNAGCGTTTATGNTTGCGAACCTCTGGATGACCATGAGGNNCATCCACAGNGTAATAACTTAACGTCACCGAGGCTTGCGTCGANAAAGGTTGCTCCNGCCGAAGTTGAAAATGATGCAATCAGCGGATCGTCCACCAGAACCTGTTTCGACTGCCAGTNTAGTCTNGTGTCTNGCTTGAGCCGGAGGNNNCTGTTCGGACCGNTAAGAGTTATTAANANAATANGGAACGGCTTGATTAANNTCCTGACTAAACTNNNNTNNNGCTTTTACTGTTACCCCGCACCAGGCCTNTCGAGATGGGCCGCTTACNTGTTNNNNNCTAACGAAGATGGCAACCAAGGGAGATGCTTGATAGGTCAAACGTNCGNGGCGACNTGGGNNNNNNGNCTCCCC Fragaria_iinumae TGAGGANCCCGANCTGNCGCCNNGGCGTTATNACNNCNTNNCNGNGCNGNNTNNNAGNNNNNCTGTTATGGGAGTGTGTATATAGACCAGCCNNANNTCCAAGANCATNNTCANGGTNTNNCGAAAGGNGGATGCGCGCTNAAAATTTGCCAAAAGGACGGGNAANNNNNCTCCNATTATGGCNGNNNNCNTAGTCNANNGGCGTNCGCTGGCCCCGNNNNTGNCATCATCACCATTACCTACACTNGNAGNNNCCGGCATNACTGCATGNNCCATCTATAAGTTAATAGCGGNNCGTCACCGGAGNTANNNNANNTNNNNANNGCTCGCGCNCGTNNTGAANNCNNTNNNGCNGGCGAANCGTCCGNNNNGGCCTGNTCNAGTCCTTAATTNNACCCCAAGNNCCNCTNANACNANNGACNNTCCTTNGGACNGANNNGNNCTGCGGAGNAAGTAGNNANTCNCAAGATNGAAGTTTNCTTCCAACNNGTTCACTATTNNCATANGGNCTCAACACCAGGCNTCTTATCGCGNGTCGCNNCTCNGTCTNNCTGTAGNNNNNANAACNACNATTGNAGNTANNTNANANACTTAGNNTGNNCNGCACCCTGNNGCNGGTCTTNACNN Fragaria_mandshurica AGGACGCNNNGGNCTGNCTGTNANAGGANNNNGNCNANTNNGGANCTTGNTGCNNNAACNTATTNCATCTAGTTNGATNANGCGANTTCAATNNCNACGTNANNACTANTANANGGGACANCATNNNNCAAACGCCTANAATNTGTCNNNAGTANNCGCAAANNANNNNNTGTCCGNGNANNNGANAGCNCCTACTCGACAGGAGNCNNNNTCGNNGNNNNTANNNCCACATCAAGCGTTTATGTCNNNNNNNNTNTGGGAAGCCATNNGNATCANNCNCAACNTAAAGACTTANCGACGTGGAGGCNNNNNNNNATNANNGNNANNNCCGNNGAAGNNNANNATNNTNNNGTCAGCGGNNCNAGCANNNANNGTTCNATNAANTGCCNGTATAGTCTAGTGTNTNNTANGNGCNGNNGGTNNCCCNNNNGACCGNNNGTNGTNATTAAAGGAAATTNNANCGGCTTGGTNAANGTCCNGACTNAACNCGTTTNNNNNTNNTACTGGNNNNCNGGACCAGGCGNCNTNACATNANCTGNNNGNCAGATTNNNNCNNANNNNNNNGNNNGNNAANGNNANTGTNANNANGGTCAGACNTANGNNNNNACGTNAANNTANCGTNTCCCN Fragaria_nipponica TGAACACTCCAGTCTGACGGCCNNNCATCGGGGCCGATTACGAGCCCCGACTGTCGAACGTACCGCATTGGGAGTGTGTNNGCAGACCAACCGAAAGTGCAATTGNNNNCTCACGGTATCGCATNNNGGGAANNNNCGCTGAGTGTCTCCCAANAGGACGGGCAATAACGCTCCCATTATGGCNGCAGACCCAGTCAAATGGCGTCCGCTCCCNNNNNNNNNNNCATCATAACANNTGNTCCTGCTCGCGAACTTNTGCAANNCCACATGGACTACTTACNNGTTGANANCGGAACATCACCGGGNNTTGCGNCGATANNGNNNNCTCGCGCCCATATNNNAGATGATGCAGCTGATGAAATNTCCGCCAGAGGTNGCTTCAGTCCTTANNNATACCTAAANNCACGTTTNNNTCANCAGNTGTTNTTCAGNNNNNCAGGATCTGCGGANAAAGTGGGGNACGGCAAGATTAAAGTCCTGACCCNNNTCGCTNTGAGCTTTCATAGGTTNTCANCACCGGAANTCTTGNNATGNGCCGNTNNCCTATTNCNNNNNNGCGAAGACGGCAACCANNANAATTGCTTGATAGACTTAGCGTGGGCNGCACTCTGGGGCCGNTCNCCACCC Fragaria_vesca_ssp_vesca AGGACGTCTAGGTCCACCTGCAAAAGGACTGAGTCGATAACGGATCTTGGTGCCTGACCGTGTTACATCTAATGAGATACCGCGATTTCAATGACAATGTAATTACTACTAGGACCGCCAGTATGGAACAAGCAGCTATAATGTGTCGCTAGTCGACGCAAATGATAACATGTTTGTGGAATAGGCATCCACTGCTCGACAAGAGCAATTTTTCTTTAGCCCGTTCCCACATCAGGCGTTTATGTCCGCGAACCTTTGGGAAGTCATGAAGATTTCTCGCGCCTTATAGATGGGTTAATGTGGAGGCTAGCGTCGACGAATGTTATCCCCATCGAAGTCTGGAATGACGCAATCAGCGGCTTAAGCACCAAAAGTCCCTTCGACTGCCGGAATAGTCTAGTGCCTTGTATGAGTCGGCAGTTGCTGCCCATTTCTCTAGTAGTTATTAAAGGAATATGGAACGGCTTGGTTAGGATCTTGACTAAACCCGTTTTGAGCTGTTGCTGTTTCCAAGGGTAGGAAGCTCCAAGATAAACTGCTTGCTAGATCCCGCCGTACGAGAGCGAAAGTCGTTAAGAATGTTAAGATAGTCAGATATACATATGGACGCTAAATTAGCGTCTCAAT Fragaria_viridis TANNNNNNNNNNNCNNNNGNTNGANGNNNNGNGNANANNNNNNNNCNNNNNNCNCAAACNTANCGNNNNNNGNGNGATAANGNNNNNNNNNCNNNNGTGNAATTNCNNNTACACNNNATCNCANNNNGCNNNNNNNNNTNAANNGTCNCCCNNNNNCGNGGGCNANNNNNCTNNCGTNNNNNNNNNNNNCNCAGNCNNNNNNNNNNNNNTNTNGNCTNNNNNGNNANNNNNNNNNGNNCTCCTNNNNNNGANNNNNNNNNNNNCNNNNNNNNNCNNNNNCGCNNTNANNNCGGNNNNNNNNCGGGATTTNNNNCNNNNGNNANNGNCTNNNNNGNNNNNGNNAATNNNNNNATCAGCGNNNCGNNTGNNNNNNNNTNNNNNANNNNNNNNTNNTANNNNNNNNNTTNNNNNNNNNGNNGNCNNNNNCCNNGACCGANNNNNNNNNNNNANAAAGNNNNNNNNGNNNNGNTNNNAACNNNNNNCCNNNNTACCNNGAGNNNNNANNGGNNCNNCNNANNNGACCNNNTNACATNGGCNGNNNGCCTANNNNNNNNTANNNNNNNCNNANGNNNTTGGGNNTGNNNNNTNNNNNNNNCGNNNNTGGNNNCCNNNNGCNNNNCTNCCNNN Fvb_m AGGACGTCTAAGNNCANNTGTAAAAGNACTGAGTCNANANNGGATCTTANTGCNTGACCNTGTTACATCTAATGACATANCGCGATTTCAATNNCNATGTCATTACTANTAGGACCGCCANCATGGAACAAGCAGCTATAAAGTGACGCTAGTCGACGGAAATGANNNNNTGTTTGAGGAATANGNATCTACTACTCGACAAGAGNAATATTTGTTTNNNNCGNTACAGCATTAGGCGTTTATGTCNGNGANNNTTTAGGAAGTCATGAANATTTCTCGCGCCTCGTAGATGGGTTAATGTGTAGGCGANNNNCNACGANTGNNATCTGGATNGAAGNCTGGAATNNCNNNGCTGNTAGCNTAAGCANNNAAAGTNCNATNGACTGCCGGNATAGTTTAGTTCNTTNTANGNGTNGNNGNTNNCCGCCNATTTCTCNNGTNGTCATTAGAGGCGATTNNTNCGATTTAGCNAGGACCNNGACTCGGTCTACCTTGAGCCGNTACTGGTTTCAAGGATAGAACCCTCCAAGATAAATTTTNNGCTAGATNNCGCCGTANNNGAGCGAANGTNGTTGAGANCGTNANGATAGTCAGANAGANATATGGACCCTAAATTATCGCCTCAAC Fvb_p AGGACGTNTANGNTCANATGTAAAAGGACTGAGTCNANANNGGATCTTNNTGCNTGACCNTGTTACATCTAATGACATAACGCGATTTCAATNNCNATGTCATTACTANTAGGACCGCCANNATGGAACAAGCAGCTATAAAGTGACGCTAGTCGACGGAAATGANNNNNTGTTTGAGGAATAAGNATCTACTACTCGACAAGAGNAATATTTGTTTNNNNCGNTNCAGCATTAGGCGTTTATGTCNNNGANNNTTTAGGAAGTCATGAANATTTCTCGCGCCTCGTAGATGGGTTAATGTGTAGGCGANNNNCNACGANTGNNATCTGGATNGAAGNCTGGAATNNCNNNGCTGATAGCNTAAGCANNNAAAGTCCNATNGACTGCCGGTATAGTTTAGTTCNTTNTANGNGTNGNNGATNNCCGCCNATTTCTCNNGTNGTCATTAGAGGCGATTNNTNCGATTTAGCNAGGACCNNGACTCGGTCTACCTTGAGCCGNTACTGGTTTCAAGGNTAGNACNCTCCAAGATAAANTTNNNGCTAGATNNCGCCGTANNNGAGCGAANGTNGTTGAGANNGTNANGATAGTCAGANAGANATATGGACCCTAAATTATCGCCTCAAC Fvb_s AGGACGTCTAGGNCCANCTGTAAAAGGACTGAGTCNANANNGGATCTTGNTGCNTGACCNTGTTACATCTAATGACATAACGCGATTTCAATNNCNATGTACTTATTANTAGGACCGCCANCATGGAACAAGCAGCTATAAAGTGACGCTAGTCAACGCAAATGCNNNNNTGTTTGAGGAATAGGNATCCACTACTCGACAAGAGNAATTTTTGTTTNNNNCGNTCCAACATCANGCGTTTATGTCNGNGANNNTTTAGGAAGTCATGAANATTTCTCGCGCCGTAAAAATGGGTTAATGTGGAGGCTANNNNCNACGANTGNNATCTCCATNGAAGNCTGGAATNNCNNNGCTGATAGCNTAAGCANNNAAAGTCCNATNGACTGCCGGTATAGTCTAGTGCNTTNTANGNGTNGNNGGTNNCCGCCNATTTCTCNNGTNGTCATTAGAGGANATTNNANCGNNTTGGTNAAGATCTNGACTNGGTCTACCTTGAGCTGNTACTGGTTCCAAGGACCGAACCCTCNNAGATAAACTGTNNGCTAGATCNCGCCGTANNNGAGCGAANGTNGTTGAGANTGTNANGATAGTCAGATATANATATGGATCCTAAATTATCGTCTCAAC Fvirg_III_Av_m NNNNNNNNNNNNNNNNNNTGNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGAANNNNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNNNNNNNNTTNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTNNCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATNNNNACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCCGNNNNNNNNCGANNNNNNNNNNNNATNCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN Fvirg_III_Av_p NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNGCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNGNNNANNNGANNNNNNNNNNNANNNACTTNTTNNNNNNNNNNNNNGTATNNNNNNAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTANNNNNNNNCNNNNNNNNNAGAGCANNNNNNNNNTAGCCCGTTNNNNNNNNNNNCNNNNNNNNNCGNNNNNNNNTAGGNNNNCATNNNNNNNNNNNNNGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCNNNNNNNNNNNNNGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTTNNNNNNNNANNNNNNNACGACNNGGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGAGCGANNNNNNNNNNNNNNNNNAAGNNNNNNNNNNNNNNNNATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN Fvirg_III_B1_m NNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGGNNNACANNCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGTNNTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNNNNNNCNNNGCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNTNNCCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNCCGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCNNNNNNNTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCNCCNNNNNNNNNNNNTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCACNN Fvirg_III_B1_p NNNNNNNTTGNAGNNACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGNNNGTTNNNNNNNNNNNNNNNNGANNNNNNCNNNGANNNAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTNACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCNNNNNNNNNNNNNTNNNCCNNNNNNNNNNNNNATANNNNNNNCCTACNNNNNNNNNNNNNTANNNNNNNNNNNNAGCNNNNNANNNNNNNNNNNTGGGTNNNNNNNNNGNNNNCCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGNTAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTNANNNNNGNNNNNNNCNNNNNNGTCANNCACACCAGAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCCNNNNNNNNNNNNNNNNCTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGANNNNNNNNNNNNNNNNNCNNNCNNNNNNNNNNCTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN Fvirg_III_B2_m NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNCANNNNNNACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGTTNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGNNNNNNNNNNNNNNNNAGCGNNNNCNCTGNNNNNNAAGTNNNNNNNGCCGGCGNNNNNTCNNATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCANNTTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCCNNNNNGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCNANNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATGGNNGNNNNNNNNNNGANNNNNNNNNNNNNNNNNNCNNNNNNNNNNNNNNNNNN Fvirg_III_B2_p NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNGCNNNANNNGTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAANNNNNNGTCNNNNNNNNNNNNCANNNNNNNNNNNNAGNNNNNNNNNNNNTGNNNNNNNNNCNNNNNNNNNNNNNNTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGANCGNNNNCGGANCTNNNNNNNNNNNNNNNNNCNNNNNNNNNNATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGNNNCCTGNNNNAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACNNNTNNNNNNNNNNNNNNNTTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNATNNNNNNNNNNNCGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGACNNNNNNNNNNNNNTNNNNN Fvirg_III_Bi_m NNNNNNNNNNNAGNTGANNNNNNNNNNNNNNNNNAANATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTNTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANTAATGNNNNNNNNNNNNNNGAGGANNNNNNNNAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCACCNNTANNNNNNNNNATAGGACNNGGNNNNNNCACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNGNNNNNNNNNNNNNGGTNNNNNNNNNNNNNNCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACGGACTNNNNNNNNNNNNNNANNNGCANGTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCNNNNNNNNNNNNNGTNNNNNNNNNNNNNNNTTNNNNNNNNNNNNNNNGCNNNNNNNGTCTNNNNNNNNNNTAACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN Fvirg_III_Bi_p TGNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNNNGTTATGNNNNNNNCANNNNNNNNNNNNNNNGAAAAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAGATNNNNNNGAGNNNNNNNNNNGTANNNNNNNAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGNNNNNNNNNNGGGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGGANNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCNNNNNNATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNNNNNGAANNNNNNNNNNNNNAGGGNNNNNNNNNNNNNNTCNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAANNNNNNNNNNNNNNACGGNNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCNNNNNGATCNNNNNTTTNNTNNNNNNCGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNCANNNNNAGGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNACNNNNNNNNNNAN Rubus_coreanus TGNNNNNCCNATNNNNNNNGNNNGGGNNNNNNNNNNANNNNNNNNNNCGNNNNNNNNNNNNNTTANNTNNNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNATGNNNGCNTNNNNNNNTCNNNNNNNNCNNAANNNNNAGNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNCNANNNNNNNNNNCANCANNNNNNNNNNNNNGNNNACANNNNNNNTNNGNNGNNGNTNGTNNTNNNNAAGNNNGTNATNNNNNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNCNNNNTGNNNNATGCGNNNNNNNNANGNNNNNCGNNNCNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNCTAGNNNNNNNNNNGNNNNNGCCAGCGNNNNNNNNNCNNNANNNNNTTCTNNNNNNNGGTNNNNNNNNGTNNCNNNNTNAGATCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAGGNNNNNNNNAGANNNNNGNNNANNNNNNNGNNTAAGCGTTNNNNNNNNNNNNNNAGANNNNNNGNCANNNCNNNNNNNNAGACNNNNNANNNNNNGCNNNTNNNNNNNNTNNNNNNNNTNNNNNCAACNNNNNNNGNNNTNGNTTAATANNNNNNANNNGTGNNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNANNN ; END; [ The following blocks are output data for analysis step 13792 ] BEGIN TREES; TITLE Octoploid_Strawberry_Subgenomes_LG3; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep13792; TREE LG3_tree = [&R] ((((((((Fvirg_III_B1_p:0.0717838055575137,Fvirg_III_B1_m:1.96006049987786E-6)87:1.96006049987786E-6,Fchil_III_B1_m:1.96006049987786E-6)22:1.96006049987786E-6,Fchil_III_B1_p:1.96006049987786E-6)100:0.259114256713547,(Fvirg_III_B2_p:0.06521753524201725,(Fchil_III_B2_p:1.96006049987786E-6,Fvirg_III_B2_m:1.96006049987786E-6)31:0.012128865466350015)29:0.08130762002543629)33:0.047101920531234125,(Fchil_III_B2_m:1.96006049987786E-6,(Fragaria_iinumae:1.96006049987786E-6,((Fvirg_III_Bi_p:0.0241099424226842,(Fchil_III_Bi_m:1.96006049987786E-6,Fvirg_III_Bi_m:1.96006049987786E-6)79:0.03349443907293145)67:0.002804560518995758,Fchil_III_Bi_p:1.96006049987786E-6)100:0.13665940112793742)98:0.08617727772549441)43:0.05658929794671007)97:0.22001950804320788,Fragaria_nipponica:0.05067765263919206)84:0.1124319628782362,((Fragaria_bucharica:0.02696833400494291,((((Fchil_III_Av_p:0.05559096498437684,((Fchil_III_Av_m:1.96006049987786E-6,(Fvb_s:0.0138216700783657,(Fvb_m:1.96006049987786E-6,Fvb_p:1.96006049987786E-6)100:0.07737814888907421)48:0.043278491291014715)6:1.96006049987786E-6,Fvirg_III_Av_p:0.011337534072283646)6:0.012807911064189999)6:0.017693314790056702,Fragaria_vesca_ssp_vesca:0.023378630548968802)14:0.02006805228263282,Fvirg_III_Av_m:0.065590562978075)99:0.23532263449926594,Fragaria_mandshurica:1.96006049987786E-6)100:0.271722510540237)100:0.27267605281438645,Fragaria_viridis:0.10116795403262663)94:0.07490487162777691):0.1795220686956024,Rubus_coreanus:0.1795220686956024); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr75177] END;