#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on June 13, 2026; 15:50 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Matos-maraví P., Núñez águila R., Peña C., Miller J., Sourakov A., & Wahlberg N. 2014. Causes of endemic radiation in the Caribbean: evidence from the historical biogeography and diversification of the butterfly genus Calisto (Nymphalidae: Satyrinae: Satyrini). BMC Evolutionary Biology, 14: 199. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S16186] [ The following blocks are input data for analysis step 14274 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep14274; DIMENSIONS NTAX=124; TAXLABELS Amphidecta_calliomma_NW126_21 Apexacuta_astoreth_CP09_78 Aphantopus_hyperantus_EW2_1 Arethusana_arethusa_CP11_06 Argyrophorus_CP_C04 Auca_barrosi_RV_03_V39 Auca_coctei_RV_03_V13 Berberia_lambessanus_EW26_29 Brintesia_circe_CP_B01 Caeruleuptychia_lobelia_CP01_67 Calisto_apollinis_RN02_25 Calisto_aquilum_PM20_03 Calisto_arcas_NW149_16 Calisto_archebates_RN02_14 Calisto_batesi_RN03_02 Calisto_bradleyi_PM07_26 Calisto_brochei_PM07_03 Calisto_bruneri_PM07_21 Calisto_chrysaoros_RN04_01 Calisto_clenchi_RN06_01 Calisto_clydoniata_RN02_16 Calisto_confusa_DR016 Calisto_crypta_CP20_02 Calisto_debarriera_DR019 Calisto_dissimulatum_PM07_20 Calisto_eleleus_RN03_01 Calisto_franciscoi_CP19_14 Calisto_galii_DR017 Calisto_grannus_RN06_02 Calisto_herophile_PM07_22 Calisto_hysius_RN04_02 Calisto_israeli_PM07_02 Calisto_loxias_RN02_18 Calisto_lyceius_DR075 Calisto_muripetens_RN01_05 Calisto_nubila_CP19_10 Calisto_obscura_DR080 Calisto_occulta_PM07_18 Calisto_pulchella_DR003 Calisto_raburni_CAL_Sat102 Calisto_schwartzi_DR063 Calisto_sibylla_RN02_22 Calisto_smintheus_PM07_05 Calisto_tasajera_CP20_08 Calisto_torrei_PM07_11 Calisto_zangis_RN02_12 Callerebia_polyphemus_CP16_19 Cassionympha_cassius_NW144_2 Cepheuptychia_spn_CP01_31 Cercyonis_meadii_CP15_09 Chazara_briseis_EW26_19 Cheimas_opalinus_CP17_06 Chillanella_stelligera_4A_1 Chloreuptychia_herseis_CP01_72 Cissia_myncea_NW108_6 Corades_enyo_CP04_06 Cyllopsis_pertepida_NW165_3 Daedalma_CP13_05 Diaphanos_curvignathos_CP17_03 Erebia_oeme_EW24_7 Erebia_palarica_EW9_4 Eretris_CP04_62 Eretris_CP06_65 Eretris_SnPe08 Eretris_sp._n._8_CP08_04 Erichthodes_antonina_CP02_24 Etcheverrius_chiliensis_CH_30_4 Eteona_tisiphone_NW127_21 Euptychia_cesarense_CP04_55 Foetterleia_schreineri_NW127_19 Forsterinaria_boliviana_CP04_88 Harjesia_blanda_CP01_13 Haywardella_edmondsii_CP14_04 Hermeuptychia_hermes_CP01_07 Hipparchia_fatua_EW25_24 Hyponephele_cadusia_CP10_07 Junea_dorinda_CP06_94 Karanasa_bolorica_NW166_10 Lasiophila_cirta_CP04_36 Loxerebia_saxicola_CP16_06 Lymanopoda_caudalis_CP04_22 Magneuptychia_spn4_CP01_91 Manerebia_lisa_CP04_23 Maniola_jurtina_EW4_5 Megisto_cymela_CP21_04 Melanargia_galathea_EW24_17 Melanargia_hylata_CP10_10 Mygona_irmina_CP17_04 Nelia_nemyroides_2 Neocoenyra_petersi_NW91_5 Neominois_ridingsii_CD_1_1 Oeneis_jutta_EW4_1 Oxeoschistus_leucospilos_CP04_67 Pampasatyrus_glaucope_NW149_7 Panyapedaliodes_drymaea_CP09_53 Paralasa_jordana_23_35 Paralasa_styx_CP11_05 Paramacera_xicaque_CP15_08 Parapedaliodes_parepa_CP07_51 Parataygetis_albinotata_CP04_53 Pareuptychia_hesionides_CP01_66 Pedaliodes_phrasiclea_CP03_35 Pindis_squamistriga_NW165_5 Posttaygetis_penelea_NW126_13 Proboscis_propylea_CP07_15 Pronophila_thelebe_CP03_70 Proterebia_afra_NW143_7 Pseudochazara_mamurra_CP10_11 Pseudomaniola_phaselis_CP04_01 Pseudonympha_magus_NW144_1 Punapedaliodes_flavopunctata_CP07_87 Punargentus_sp._CP08_51 Pyronia_cecilia_EW4_2 Redonda_empetrus_CP17_02 Satyrus_actaea_EW20_12 Splendeuptychia_itonis_CP02_44 Steremnia_umbracina_CP07_89 Steromapedaliodes_albonotata_CP17_01 Stygionympha_vigilans_NW144_5 Taygetis_virgilia_NW108_3 Thiemeia_phoronea_CP13_08 Yphthimoides_cipoensis_CP10_02 Ypthima_baldus_NW98_5 Ypthimomorpha_itonia_NW117_23 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! 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Apexacuta_astoreth_CP09_78 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Calisto_bruneri_PM07_21 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Calisto_clenchi_RN06_01 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Calisto_clydoniata_RN02_16 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Calisto_dissimulatum_PM07_20 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Calisto_eleleus_RN03_01 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Calisto_franciscoi_CP19_14 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Calisto_galii_DR017 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Calisto_herophile_PM07_22 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Calisto_lyceius_DR075 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Calisto_muripetens_RN01_05 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Calisto_nubila_CP19_10 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Callerebia_polyphemus_CP16_19 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Cercyonis_meadii_CP15_09 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Chazara_briseis_EW26_19 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Forsterinaria_boliviana_CP04_88 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Haywardella_edmondsii_CP14_04 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Hipparchia_fatua_EW25_24 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Hyponephele_cadusia_CP10_07 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Karanasa_bolorica_NW166_10 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Oeneis_jutta_EW4_1 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Punapedaliodes_flavopunctata_CP07_87 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Pyronia_cecilia_EW4_2 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Redonda_empetrus_CP17_02 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Ypthima_baldus_NW98_5 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Ypthimomorpha_itonia_NW117_23 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; END; BEGIN SETS; CHARSET EF1a (CHARACTERS = Calisto_BEAST_no_Euptychia) = 2326-3565; CHARSET COI (CHARACTERS = Calisto_BEAST_no_Euptychia) = 851-1519; CHARSET COI (CHARACTERS = Calisto_BEAST_no_Euptychia) = 1520-2325; CHARSET CAD (CHARACTERS = Calisto_BEAST_no_Euptychia) = 1-850; CHARSET GAPDH (CHARACTERS = Calisto_BEAST_no_Euptychia) = 3566-4256; CHARSET wingless (CHARACTERS = Calisto_BEAST_no_Euptychia) = 4874-5273; CHARSET RpS5 (CHARACTERS = Calisto_BEAST_no_Euptychia) = 4257-4873; END; [ The following blocks are output data for analysis step 14274 ] BEGIN TREES; TITLE Calisto_BEAST_no_Euptychia; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep14274; TREE TREE1 = [&R] ((((Loxerebia_saxicola_CP16_06:26.186748315107373,(Callerebia_polyphemus_CP16_19:19.58166575624905,Proterebia_afra_NW143_7:19.58166575624905):6.605082558858278):15.156411382172212,((((Paralasa_jordana_23_35:3.8538958074247223,Paralasa_styx_CP11_05:3.8538958074247223):33.03682909554389,((Melanargia_galathea_EW24_17:5.040157281819827,Melanargia_hylata_CP10_10:5.040157281819827):26.41237636774552,((((Neominois_ridingsii_CD_1_1:11.810478248667144,Oeneis_jutta_EW4_1:11.810478248667144):3.9895001356490134,Karanasa_bolorica_NW166_10:15.799978384316166):1.9892052726740648,((Arethusana_arethusa_CP11_06:13.330593948365166,Brintesia_circe_CP_B01:13.330593948365166):2.6838289124766828,((Chazara_briseis_EW26_19:11.204283889410059,Pseudochazara_mamurra_CP10_11:11.204283889410059):2.445461337762694,Satyrus_actaea_EW20_12:13.64974522717269):2.364677633669146):1.7747607961484135):4.206095164381232,(Hipparchia_fatua_EW25_24:17.086817865636,Berberia_lambessanus_EW26_29:17.086817865636):4.9084609557354355):9.457254828193893):5.438191253403261):1.595071212930499,(((Erebia_palarica_EW9_4:13.399522631421107,Erebia_oeme_EW24_7:13.399522631421107):20.622360248406018,((Cercyonis_meadii_CP15_09:18.081929840702884,Hyponephele_cadusia_CP10_07:18.081929840702884):14.020390885309766,(Maniola_jurtina_EW4_5:20.247142124609468,(Pyronia_cecilia_EW4_2:17.948779770960936,Aphantopus_hyperantus_EW2_1:17.948779770960947):2.298362353648507):11.855178601403168):1.9195621538145105):2.813789201838894,(((((((Eretris_sp._n._8_CP08_04:9.1636659379875,Eretris_CP04_62:9.163665937987501):1.6278501052217518,Eretris_CP06_65:10.791516043209255):3.4558015973262464,Eretris_SnPe08:14.247317640535465):14.072964956426292,Nelia_nemyroides_2:28.320282596961714):2.062298720420234,(((Pampasatyrus_glaucope_NW149_7:14.210159511245191,Haywardella_edmondsii_CP14_04:14.210159511245191):4.20244136643122,(Etcheverrius_chiliensis_CH_30_4:13.206393258617785,(Punargentus_sp._CP08_51:7.221575774028609,Argyrophorus_CP_C04:7.221575774028609):5.984817484589151):5.206207619058658):2.944941590496626,((Auca_coctei_RV_03_V13:9.257316884550804,Auca_barrosi_RV_03_V39:9.257316884550805):2.340851987382207,Chillanella_stelligera_4A_1:11.59816887193302):9.75937359624004):9.025038849208961):2.304837636541393,(Steremnia_umbracina_CP07_89:29.797655185931344,(Manerebia_lisa_CP04_23:26.048522529015585,(Diaphanos_curvignathos_CP17_03:22.01169428021428,Lymanopoda_caudalis_CP04_22:22.01169428021428):4.036828248801264):3.749132656915748):2.889763767992097):2.492834969789861,(((Cheimas_opalinus_CP17_06:19.778673687904483,(Daedalma_CP13_05:17.72871669765188,Corades_enyo_CP04_06:17.728716697651898):2.0499569902526176):1.7327852954110625,((((Apexacuta_astoreth_CP09_78:12.379625318893915,Pseudomaniola_phaselis_CP04_01:12.379625318893913):2.5520458066205887,Thiemeia_phoronea_CP13_08:14.931671125514573):2.3462833695126566,((Mygona_irmina_CP17_04:9.936865929228945,Proboscis_propylea_CP07_15:9.936865929228945):5.828746817565893,(Oxeoschistus_leucospilos_CP04_67:14.677886207870273,Lasiophila_cirta_CP04_36:14.6778862078703):1.0877265389245956):1.512341748232343):3.297296416064494,((Pronophila_thelebe_CP03_70:16.035288783459155,Junea_dorinda_CP06_94:16.035288783459155):3.2885650263635533,(Eteona_tisiphone_NW127_21:15.619214726821543,Foetterleia_schreineri_NW127_19:15.619214726821543):3.7046390830011937):1.2513971012689993):0.9362080722238559):6.398383997844807,((Pedaliodes_phrasiclea_CP03_35:19.626987815957126,(Punapedaliodes_flavopunctata_CP07_87:14.0626925839381,Parapedaliodes_parepa_CP07_51:14.0626925839381):5.564295232019049):2.2258946375651014,((Redonda_empetrus_CP17_02:6.473836080310666,Steromapedaliodes_albonotata_CP17_01:6.473836080310666):13.287570747252897,Panyapedaliodes_drymaea_CP09_53:19.761406827563547):2.0914756259586476):6.056960527638143):7.270410942552896):1.655418157952738):1.650124034233123):0.750009579909225,((Ypthimomorpha_itonia_NW117_23:13.656834631459754,Ypthima_baldus_NW98_5:13.656834631459754):20.685997756379898,(Stygionympha_vigilans_NW144_5:26.524397169341224,(Cassionympha_cassius_NW144_2:22.595644493367576,(Neocoenyra_petersi_NW91_5:19.163955691263407,Pseudonympha_magus_NW144_1:19.163955691263407):3.431688802104155):3.9287526759736657):7.81843521849839):4.892973307968738):2.1073540014711725):2.5504058315130322,(Calisto_nubila_CP19_10:30.845031069406897,(((((Calisto_raburni_CAL_Sat102:14.482976367203385,Calisto_zangis_RN02_12:14.482976367203394):2.4699561415541353,Calisto_pulchella_DR003:16.95293250875757):4.878902091040896,(Calisto_tasajera_CP20_08:12.079812906362822,((Calisto_lyceius_DR075:6.049966527973471,(Calisto_franciscoi_CP19_14:5.114843252108077,Calisto_crypta_CP20_02:5.114843252108076):0.9351232758653927):3.4748145833643713,Calisto_schwartzi_DR063:9.52478111133783):2.555031795025002):9.75202169343558):3.262724845198523,(((Calisto_arcas_NW149_16:21.044731852143205,(((Calisto_bruneri_PM07_21:8.840262702279931,Calisto_sibylla_RN02_22:8.840262702279931):1.6999573985200982,(((Calisto_muripetens_RN01_05:4.191009565972769,Calisto_occulta_PM07_18:4.191009565972769):0.9045162637262676,Calisto_brochei_PM07_03:5.095525829699033):3.8157586415766804,((Calisto_torrei_PM07_11:6.047875770597576,Calisto_bradleyi_PM07_26:6.047875770597576):1.6020935547044521,(Calisto_herophile_PM07_22:3.4692600645329428,Calisto_apollinis_RN02_25:3.4692600645329428):4.18070926076908):1.261315145973687):1.628935629524289):3.1188868885963803,(Calisto_israeli_PM07_02:11.971302851459635,(Calisto_smintheus_PM07_05:7.712744317326534,(Calisto_dissimulatum_PM07_20:4.0664142884211,Calisto_aquilum_PM20_03:4.0664142884211):3.646330028905445):4.258558534133111):1.6878041379367303):7.385624862746779):1.1338513485422475,(((Calisto_clenchi_RN06_01:4.11177594510937,Calisto_galii_DR017:4.111775945109367):1.0066064437658158,Calisto_chrysaoros_RN04_01:5.118382388875185):7.74921300968629,Calisto_clydoniata_RN02_16:12.867595398561418):9.310987802123924):1.7539634052664255,(Calisto_archebates_RN02_14:23.14277316491218,((((Calisto_batesi_RN03_02:10.322357618270688,Calisto_loxias_RN02_18:10.32235761827068):2.489863167206682,Calisto_hysius_RN04_02:12.81222078547735):5.995398819202613,(Calisto_grannus_RN06_02:12.01570446187199,Calisto_obscura_DR080:12.01570446187199):6.791915142807991):2.783704122492182,(Calisto_confusa_DR016:7.922352147019026,Calisto_debarriera_DR019:7.922352147019026):13.668971580153176):1.5514494377400432):0.7897734410396104):1.1620128390451292):1.4678893807618394,Calisto_eleleus_RN03_01:26.562448825758775):4.282582243648136):13.048534459385579):4.317921359921996,((Cyllopsis_pertepida_NW165_3:33.76045524278104,Paramacera_xicaque_CP15_08:33.76045524278104):11.351193467864476,(((((((((Magneuptychia_spn4_CP01_91:13.046152772887682,Caeruleuptychia_lobelia_CP01_67:13.046152772887682):4.287564283362327,Cissia_myncea_NW108_6:17.333717056249967):3.0270263091885212,Cepheuptychia_spn_CP01_31:20.360743365438463):4.189865168243717,Chloreuptychia_herseis_CP01_72:24.550608533682258):1.384910140709831,(Pareuptychia_hesionides_CP01_66:17.706183381678184,Erichthodes_antonina_CP02_24:17.706183381678184):8.229335292713877):1.4850758635056458,(Taygetis_virgilia_NW108_3:20.392256207687787,((Parataygetis_albinotata_CP04_53:15.874775635411707,Posttaygetis_penelea_NW126_13:15.874775635411707):3.7368181532626235,(Harjesia_blanda_CP01_13:17.938589312469038,Forsterinaria_boliviana_CP04_88:17.938589312469052):1.673004476205307):0.7806624190134102):7.028338330209923):3.858959313369354,(Amphidecta_calliomma_NW126_21:28.140484627942225,Splendeuptychia_itonis_CP02_44:28.14048462794223):3.1390692233248068):2.113926256409716,(Hermeuptychia_hermes_CP01_07:30.90527714303163,Pindis_squamistriga_NW165_5:30.905277143031615):2.488202964645186):2.801878425710264,((Euptychia_cesarense_CP04_55:24.705054499194404,Yphthimoides_cipoensis_CP10_02:24.705054499194404):5.760232958532928,Megisto_cymela_CP21_04:30.4652874577273):5.730071075659723):8.916290177258496):3.0998381780690067); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr76970] END;