#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on July 12, 2025; 11:19 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Wong S., Meerow A., & Croat T.B. 2015. Resurrection and New Species of the Neotropical Genus Adelonema (Araceae). Systematic Botany, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S16371] [ The following blocks are input data for analysis step 14640 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep14640; DIMENSIONS NTAX=116; TAXLABELS Adelonema_crinipes_DQ866878 Adelonema_crinipes_M519 Adelonema_crinipes_M526 Adelonema_erythropus_DQ866879 Adelonema_erythropus_M510 Adelonema_hammelii_M531 Adelonema_panamensis_DQ866880 Adelonema_panamensis_M520 Adelonema_peltata_M513 Adelonema_peltata_M521 Adelonema_peltata_M522 Adelonema_picturata_DQ866882 Adelonema_picturata_M511 Adelonema_picturata_M512 Adelonema_picturata_M528 Adelonema_sp._M533 Adelonema_speariae_M524 Adelonema_wallisii_Ar3603 Adelonema_wendlandii_DQ866883 Adelonema_wendlandii_M529 Adelonema_wendlandii_M532 Adelonema_wendlandii_M580 Furtadoa_mixta_Ar4781 Furtadoa_sumatrensis_Ar4045 Homalomena_asmae_Ar2597 Homalomena_atrox_Ar2389 Homalomena_baangongensis_Ar2574 Homalomena_borneensis_Ar227 Homalomena_borneensis_Ar2559 Homalomena_chartacea_Ar2414 Homalomena_clandestina_Ar2385 Homalomena_clandestina_Ar3007 Homalomena_cochinchinensis_DQ866877 Homalomena_curvata_Ar3052 Homalomena_curvata_Ar3053 Homalomena_debilicrista_Ar3057 Homalomena_expedita_Ar2357 Homalomena_gastrofructa_Ar2575 Homalomena_giamensis_Ar1691 Homalomena_hanneae_Ar2382 Homalomena_hanneae_Ar3005 Homalomena_hanneae_Ar3010 Homalomena_havilandii_Ar2451 Homalomena_humilis_Ar2371 Homalomena_insignis_Ar2066 Homalomena_insignis_Ar2111 Homalomena_josefii_Ar2380 Homalomena_matangae_Ar230 Homalomena_ovata_Ar2361 Homalomena_philippinensis_DQ866881 Homalomena_punctulata_Ar2424 Homalomena_pygmaea_M525 Homalomena_rostrata_Ar2532 Homalomena_rubescens_M527 Homalomena_sengkenyang_Ar2362 Homalomena_sengkenyang_Ar2387 Homalomena_sengkenyang_Ar2388 Homalomena_sengkenyang_Ar3004 Homalomena_sengkenyang_Ar3034 Homalomena_sp._Ar3033 Homalomena_sp._Ar3047 Homalomena_sp._Ar3051 Homalomena_sp._Ar3065 Homalomena_sp._Ar4054 Homalomena_sp._Ar4759 Homalomena_sp._Ar4763 Homalomena_sp._Ar4764 Homalomena_stella_Ar2390 Homalomena_stella_Ar3011 Homalomena_symplocarpifolia_Ar2411 Homalomena_tonkinensis_Ar4302 Homalomena_vivens_Ar2363 Homalomena_vivens_Ar3006 Homalomena_zippelianum_M514 Lasia_spinosa_B1812 Philodendron_angustisectum_DQ866884 Philodendron_anisotomum_DQ866885 Philodendron_barrosoanum_DQ866886 Philodendron_brevispathum_DQ866887 Philodendron_distantilobum_DQ866889 Philodendron_ecordatum_DQ866890 Philodendron_findens_DQ866892 Philodendron_fragrantissimum_DQ866893 Philodendron_glaziovii_DQ866894 Philodendron_goeldii_DQ866895 Philodendron_grandipes_DQ866896 Philodendron_heleniae_DQ866897 Philodendron_hylaeae_DQ866898 Philodendron_insigne_DQ866899 Philodendron_insigne_M596 Philodendron_lindenii_DQ866900 Philodendron_linnaei_DQ866901 Philodendron_longistilum_DQ866902 Philodendron_lundii_DQ866903 Philodendron_mamei_DQ866904 Philodendron_martianum_DQ866888 Philodendron_ornatum_DQ866891 Philodendron_panamense_DQ866905 Philodendron_pedatum_DQ866906 Philodendron_pterotum_DQ866907 Philodendron_radiatum_Ar4339 Philodendron_radiatum_DQ866908 Philodendron_sagittifolium_DQ866909 Philodendron_selloum_Ar4340 Philodendron_serpens_DQ866911 Philodendron_smithii_DQ866912 Philodendron_sodiroi_DQ866913 Philodendron_solimoense_DQ866914 Philodendron_solimoense_M599 Philodendron_sp._DQ866910 Philodendron_sp._DQ866915 Philodendron_sp._DQ866917 Philodendron_squamiferum_DQ866916 Philodendron_surinamense_DQ866918 Philodendron_undulatum_DQ866919 Philodendron_xanadu_DQ866920 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! 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Adelonema_wendlandii_M580 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Homalomena_asmae_Ar2597 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Homalomena_giamensis_Ar1691 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Homalomena_rostrata_Ar2532 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Homalomena_sp._Ar4764 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Philodendron_findens_DQ866892 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Philodendron_fragrantissimum_DQ866893 -------------CGCGGCGATGCGGGCGGTCCGCCGCTCGCGACGACGCGAGAAGTCCACTGAACC--TTATCATTTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGT----------------GAACCTGCGG-AAGGATCAT--TG----------TCGCA-----------------TCTCTGC-CTCTG-ATGGCTC-------GACCCACTTGCAAA-CGGTTGA--CCCCGACCC----TTCTCTTAAA-----CTC-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCCCCTCCC---CA-CGCGT----CGCCCCTTCTCGGTGGCCGC--GG--GGTGGCGGGACAACG-A----ACCTCCGGGCGCGGCCTGCGCCAAGGATCAGTGAAT-GGGGATT---GCCCGCACACGC-----GC--------CT-TGC-TCCGA----GCGAG-CAGAGGT---ACGT-AGTGTCGGTTGCCCCG---------AACGAG----TCTCC-GAACGACTCTTGGCAACGGATATCTAGGCTCTCGCATCGATGAAG-AACGTAGCGAAATGCGATACGTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGCGAACCATCGAATCTTCGAACGCAAG-TTGCGCCCGAG-GCCATCGGGCCGAGGGTACGCCTGCCTGGGCGTCATGC--TCCGTCGTCGCTCCCCA----CCCCC----CGCCCGTACT--GTCTCTACTTGCACCGTGC---GGCGGCTGATGTC----G-----AGGATGCGGACATTGACCTGCCGT----GCT-CC----CGCACGGCGGGTTGAAGGACCT---C-GGCCC---TCTC--GC-AGGGCGAG-CACGGCAAGCGGTGGAC-GA-----------ATTCG----GCGCTGCGGGCAC-------------------AATGCGCTCATCGTCGTC---GTG-CTCGCCCC-----CGTCCGA----------TGGAATC---------------GAATGGA-----ATAGAGT---GCCG----CTTACT-------CGTCTTAGAGGC---------------------------------------GGAAGG-----AACCCA---TCCG---CGAGCCGACGC---ACGTCGTCGC-----TCAG-ATCGC-GACCCCAGGT-C------------------------------------------------------------------------------- Philodendron_glaziovii_DQ866894 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Philodendron_goeldii_DQ866895 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Philodendron_grandipes_DQ866896 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Philodendron_heleniae_DQ866897 -------------------------------------------------------------------------------------------------------TTTCCGTAGGT----------------GAACCTGCGG-AAGGATCAT--TG----------TCGCA-------TCTCCGT-----------CTCAG-ACGGCCC-------GACCCACCCGCGAA-CGGTTGA-CCCCCCACAC----TTCTCTTAAA--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTCC--------CCCACTTCCC---CG-CGCGT----CGCC-CTCGCCGGCGGCCGCGGGG--GGCGGCGGGACGACG-A----ACCTCCGGGCGCGGCCTGCGCCAAGGATTACCGAAC-GGGGACC---GCCCGCGCACGC-----GC--------CT-CGC-TCCGA----GCGGG---GAGCGCT-ACGC-GGTCTCGGTCGCCCCAG--------AACGAG----TCTCC-GGACGACTCCCGGCAACGGATATCTAGGCTCTCGCATCGATGAAG-AACGTAGCGAAATGCGATACGTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGCGAACCATCGAATCTTCGAACGCAAG-TTGCGCCCGAG-GCCATCGGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACGCC-CCCC-CGTCGCTCCCCG----CCCCC---------------------------CGCCGCGC---GGCGGCCGATGATGGCGG-----AGGACGCGGACGTTGGCCTCCCGT----GCT-CC----CGCACGGCGGGCTGAAGGACCT---C-GGCCC---TCTC--GC-GGGGCGAG-CACGGCCAGCGGTGGAC-GA-----------ATTCG----GCGCTGCA------------------------CACGCGCCCGTCGCCGTC---GTG-CTCGCCGC-----CGTCCCG-----A----CGGAACG---------------GAACGGA-----TCAGAGC---GCCGCTCACTCACT-------CGCCGTCACGGC---------------------------------------GGAAGG-----AACCCA---TCCG---CGAGCCGACGC---GCGTCGTCGC-----TCGG-ATCGC-GACCCCAGGT-CAGGCGGGGCCACC------------------------------------------------------------------ Philodendron_hylaeae_DQ866898 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AT--TG--------------T-------C---CGC--ATCTCCGT-CTCGG-ACGG{AT}{CT}CC-GA-----CCCACCCGCGAA-CGGTTGA--CCCCC{AG}CAC----{CT}TCTCTTAAA-----GTC-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCCCCCCTCCC---CG-CGCGT----CGCC-CTCGCCGGCGGCCGC--GG--GGCGGCGGGACGACG-A----ACCTCCGGGCGCGGCCTGCGCCAAGGATCACCGAAC-GGGGACC---GCCCGCGC{AG}C-------GCGCCTC-GCCC-CGC-TCCGAGCGGGCGGG---GAGTGCT-ACGC-GGTCTCGGTCGCCCCGAACG-----AACGAG----TCTCC-GGACGACTCCCGGCAACGGATAT{CT}TAGGCTCTCGCATCGATGAAG-AACGTAGCGAAATGCGATACGTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGCGAACCATCGAATCTTCGAACGCAAG-TTGCGCCCGAG-GCCATCGGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACGCC-CCCT-CGTCGCTCCCCG-CCCCCCCC----CGCCCGTAGT-GTCTC-TGCTCGCACCGCGCGGCGGCGGC{CT}G{AG}TGGC----G-----AGGACGCGGACGTTGGCCTGCCGT----G{CT}{CT}-{AC}CACGACGCACGGCGGGC{CT}GAAGGACCT---C-GGCCC---TCTC--GC-GGGGCGAG-CACGGCCAGCGGTGGAC-GA-----------ATTCG----GCGCCATGC--------------------------GCGCTCGTCGCCGTC---GTG-CTCGCCGC-----CGT-CCG-----A----CGGAACGGAACGGATCGGATC{AG}GATC--------A--GAGC---GCCG----CTTACT-------CGCCGTGG-GC{AG}----------ACGAGAGTCGCTCACGGCGGAA-------GGAAGG-----AACCCA---TCCG---CGAGCCGACGC---GCGTCGTCGTCGC--TCAG-ATCGCGGACCCCAGGT-CAGGCGGGGCCACCCG---------------------------------------------------------------- Philodendron_insigne_DQ866899 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Philodendron_insigne_M596 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Philodendron_lindenii_DQ866900 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Philodendron_linnaei_DQ866901 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Philodendron_ornatum_DQ866891 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Philodendron_panamense_DQ866905 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGA{GT}{AC}{ACT}{CGT}{CG}T{GT}{GT}{CT}{CT}GCATCT{CT}--{CT}G----------TCT{CT}A-------------------------GACGG-----------T{CT}C{AC}GACCCACC{CT}GCGAA-CGGTTGA--CCC{CT}{AC}ACAC----TCCTCTTAAA-----CTC------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCCCCCTCC{AC}---{CT}AGCGCGT----CGCC-CTCGCC{AG}GCGGCCGC--{AGT}G--{AG}GCGGCG{AT}GA{CT}GA{CT}G-A----ACCT{CT}C{AG}{AG}G{CT}{AG}{CT}GG{AT}CTG{CT}GCCAAGGATTA{CT}TGAA{CT}-GGGGAC{CT}---GCCCGCGCACG----------------CA-CGC-TCCCA----GCG{AG}G---GAG{CT}GCT-AC{AG}C-GGTCT{CT}{AG}GTCGCCCCG---------AACGAG----TCT{CT}C-GAACGA{CT}TC{CT}TGG{AC}AA{CT}GGATAT{CT}TAGGCTCTC{AT}CATCGATGAAG-AACGTAGCGAAATGC{AG}ATA{CT}GTGGTGTGAATTGCAGAAT{CT}CCGC{AG}AAC{CT}ATCGAATCTTCGAACGC{AC}{CG}G-{GT}T{GT}CGC{AC}CGAG-GCCGC{CT}A{GT}GCC{GT}AGGG{CT}ACGCCTGC{CT}T{AG}GGC{AG}TCAC{GT}C--CCCCCCGTCG{CT}TCCCC{AT}----TCCCC---{CT}CGCCC{AG}{CT}{AG}GT--G{CT}C{CT}CTGC{CT}{CT}GC{AG}C{AT}GCG{CT}GG{CT}GGTGGC{AG}G{CT}TGAT{AG}G{AT}-G-----AGGA{CT}G{CT}GGACATTG{AG}CCT{AG}CCGT----{AG}C{CT}-CC----{CT}GCACGG{CT}{AGT}{AT}G{CT}TGAAGGACCT---{CT}-GGCCC---TCT{CT}--G{CT}-{GT}GGGCGAG-CA{CT}GGCCAGCG{GT}TGGAC-GA-----------ATTCG----{AG}C{AG}CTG{CT}GGGCGG----------------C{CG}CTATGC{AG}{AC}CCAT{CT}GTC{AG}TC---GTG-CTCG{CT}CG{AT}-----{AC}GTCCGA----------CGGAA{CT}{AG}---------------GAACGG{AC}-----{CG}C{AC}{GT}{AC}G{CGT}---{AT}C{AT}{GT}----CTTACT-------{CT}{AG}CC{AG}TGG--------------GT{AG}AGA{CT}A{CT}GG{CT}{AG}-----------------GAAGG-----AACTCA---{GT}CCG---CGAGG{CT}GACG{CT}---GC{AG}TCGTCGC-----TCGG-ATCGCGGACCC{AC}AG{GT}{CT}-{AC}{AC}{AG}GCGGGGCCACCCA---------------------------------------------------------------- Philodendron_pedatum_DQ866906 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Philodendron_pterotum_DQ866907 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Philodendron_radiatum_Ar4339 -------------------------------------------------------------------------------------------------------CTTCCGTAGG-----------------GAACCTGCGG-AAGGATCAT--TG----------TCGCA-------TCTCCGT-----------CTCAG-ACGGCCC-------GACCCACCCGCGAA-CGGTTGA--CCCCCACAC----TTCTCTGAAA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTCCCCCCCTCCC---CG-CGCGT----CGCC-CTCCCCGGCGGCCGC--GG--GGCGGCGGGACGACG-A----ACCTCCGGGCGCGGCCTGCGCCAAGGATTACCGAAC-GGGGACC---GTCCGCGCACGCGCCTCGC--------CT-CGC-TCCGA----GCGGGCGGGGAGTGCTACGC-GGTCTCGGTCGCCCCG---------AACGAACGAGTCTCC-GGACGACTCCCGGCAACGGATATCTAGGCTCTCGCATCGATGAG--AACGCAGCGAAATGCGATACGTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGCGAACCATCGAATCTTCGAACGCAAG-TTGCGCCCGAG-GCCATCGGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACGC--CCCCCCGTCGCTCCCCG----CCCCC----CGCCCGCAGT--GTCTCTGCTCGCACCGCGCGGCGGCGGCTGATGGC----G-----AGGACGCGGACGTTGGCCTGCCGT----GCT-CC----CGTACGGCGGGCTGAAGGACCT---C-GGCCC---TCTC--GC-GGGGCGAG-CACGGCCAGCGGTGGAC-GA-----------ATTCG----GCGCTGCGGTAGC------------------------GCTCGTCGCCGTC---GTG-CTCGCCGC-----CGTCCGA----------CGGAACG--------------GGATCGGA-----TCAGAGC---GCCG----CTTACT-------CGCCGTGG-------------------------GCGAGAGTCACTCACGGCGGAAGG-----AACCCA---TCCG---CGAGCCGACGC---GCGTCGTCGCGGC--TCGG-ATCGC-GACCCCAGGT-CAGGCGGGGCCACCCCCTGAGTTTAA------------------------------------------------------ Philodendron_radiatum_DQ866908 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Philodendron_selloum_Ar4340 --------------------------------------------------------------------------------------------------------TTCCGTAGGT----------------GAACCTGCGG-AAGGATCAT--TG----------TCGCA-------TCTCCGT-----------CTCGG-ACGACTC-------GATGCACCCGCGAA-CGGTTGA--CCC---TTC----TCCTTCTAAATCGTCCCCGCCG-GCCGGGGCGGAGGT-----------------------------------------GAGATCGATCGGTTTCT---------------CGGCTCTGGCCG--------------------------------------CGT-CCGTCGTGCCGCCTCCGCCC-------------------CTCCA---CA-CGCGT--------------CGGCGGCCTCGTCGGCGGCGGCGGGACGACGCAACCCACCTCCCGGCGCGGCATGCGCCAAGGATCAGTGAAT--GGGGAC---GTCCGCACGCGC-----GC--------CC-CGC-TCCGA----GCGGG---GAG-----GCGC-------GGTCGCCCCCAACGGAACGAACGAG----TCTCT-GAACGACTCCCGGCAACGGATATCTAGGCTCTCGCATCGATGAAG-AACGCAGCAAAATGCGATAGGTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAATCTTCGAACGCAAG-TTGCGCCCGAG-GCCATCGGGTCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACGC--CCCG-CGTCGCTCCCCG----CCCCC------------------------CCCCCCCCTGT---------CGAGGGT----G-----AGGATGCGGAGATTGGCCCGCCGT----GCT-CC----GGCGCGGCGGGCTGAAGGACCT---C-GGCCG---TCTC--GT-GGGGCGAG-CACGGCGAGCGGTGGAC-GA-----------ATTCAGTCGGCGCTGCGGGCGCCGCTATGCGGG-----TCGTACGCGCTCATCGTCGTC---GTG-----CCGC---------CGG----------CGAGGCG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------GAAGG-----AACCCA---CCCG---CGAGCCGACGC---ACGTCGTCGC-----TCGG-ACCGC-GACCCCAGGT-CAGGAAGAGGCGGA------------------------------------------------------------------ Philodendron_serpens_DQ866911 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Philodendron_smithii_DQ866912 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------TCCGTAGGT----------------GAACCTGCGGTAAGGATCAT--TG----------TCGCA-------TCTCCGT-----------CTCGG-ACGGCCC-------GACCCACCCGCGAA-CGGTTGA--CCCCCACAC----TTCTCTTAAA-----CTC------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCCCACTCCC---CG-CGCGT----CGCC-CTCGCCGGCGGCCGC--GG--GGCGGCGGGACGACG-A----ACCTCCGGGCGCGGCCTGCGCCAAGGATTACGGAAC-GGGGACC---GCCCGCGCACGC----------------------TCCGA----GCGGG---GAGTGCT-GCGC-GGTCTCGGTCGCCCCAG--------AACGAGTCT-TCTCC-GGACGACTCCCGGCAACGGATATCTAGGCTCTCGCATCGATGAAG-AACGTAGCGAAATGCGATACGTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGCGAACCATCGAATCTTCGAACGCAAG-TTGCGCCCGAG-GCCATCGGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACGC--CCCCCCGTCGCTCCCCG----CCCCC----CGCC-GCAGC------------------------GGCGGCTGACGGC----G-----AGGACGCGGACGTTGGCCTCCCGT----GCT-CC----CGCACGGCGGGCTGAAGGACCT---C-GGCCC---TCTC--GC-GGGGCGAG-CGCGGCCAGCGGTGGAC-GA-----------ATTCG----GCGCTGCA------------------------CATGCGCCCGTCGCCGTC---GTG-CTCGCCGC-----CGTCCGACAGGAA----CGGAACG---------------GATCAGA--------GAGC---GCCG----CTCACT-------CGCCGTGG--------------GTGAGTCACGGCGGAAG-------------GAAGG-----AACCCA---TCCG---CGAGCCGACGC---GCGTCGTCGC-----TCGG-ATCGC-GACCCCAGGT-CAGGCGGGGCCACCCGCTGAGTTTAAC----------------------------------------------------- Philodendron_sodiroi_DQ866913 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ACGGACCGA------------------------------------------------------------------CCCACCCGCGAA-CGGTTGA--CCCCCACAC----TCCTCTTAAG-----CTC------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCCCCCTCCC---CG-CGCGT----CGCC-CTCGTCGGCGGCCGC--GG--GGCGGCGGGACGACG-A----ACCTCCGGGCGCGGCCTGCGCCAAGGATTACTGAAC-GGGGACC---GCCCGCGCACGC-----GC--------CT-CGC-TCCGA----GCGGG---GAGCGCT-ACGC-GGTCTCGGTCGCCCCGAACGAACTAAACTAG----TCTCC-GGACGACTCCCGGCAACGGATATCTAGGCTCTCGCATCGATGAAG-AACGTAGCGAAATGCGATACGTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGCGAACCATCGAATCTTCGAACGCAAG-TTGCGCCCGAG-GCCCTCGGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACGCC-CCCC-CGTCGCTCCACG-------CC----TGCCTG--------------------------------------GGC----G-----AGGACGCGGACGTTGGCCTGCCGT----GCT-CC----CGCACGGCGGGCTGAAGGACCT---C-GGCCC---TCTC--GC-GGGGCGAG-CACGGCCAGCGGTGGAC-GA-----------ATTCG---------------------------------------GCGCTCATCGTCGTC---GTG-CTCGCCGCCGAGCCGTCCGA----------CGGAACG---------------GAACGGA-----TCAGAGC---GCCG----CTCACT-------CGCCGCGGGCGA------GTCACGGCGGAAGGAAAAAGG--------------AAGG-----AACCCA---TCCG---CGAGCCGACGC---GCGTCGTCGC-----TCGG-ATCGC-GACCCCAGGT-C------------------------------------------------------------------------------- Philodendron_solimoense_DQ866914 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Philodendron_solimoense_M599 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Philodendron_squamiferum_DQ866916 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Philodendron_surinamense_DQ866918 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TG------------------------------------------------------------------------------------CCCCAACCC----TTCTTTTAAA-----TTCGCCG-GGCGGGGCGGAGGC--------AG----ATAAATGGTCCCCC--------------CCGCCTCTCGGCGGATGGTCGT---------CGGCTGGGCTTGGC-------------TACGTCCGTGTG-----ACCGTTGGG-CCGTCCCACCGCATTGGCCGCCACCC------CCCCCCTCTCCC---CA-CGCGT----TGGC-CTCGCCGACGGCTGC--GG--GGCGATGGGACAATG-A----ACCTCCCGACGCGGCTTGCGCCAAGGATTAGTGAAT--GGGGAC---GCCCGCGCGCGG-----GC--------CT-CGC-TTTGG----ACGGG---GAGGC---GTGC-GGTGTTGGTCGCCACG---------AACGAG----TCTTG-GAATGACTCCTGGCAACGGATATCTAGGCTCTTGCATCGATGAAG-AACGTAGCGAAATGCGATACGTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGCGAACCATCGAATCTTCGAACGCAAG-TTGCGCCCGAG-GCCCAAGGGTCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACGC--CCCG-TGTCGCTCCCTG----CCCCT----CGCGTGCGGT----GTCTACTCACACCGCAT---GGTGGCCGAGGGC----G-----AGGATGCGGAGATTGGCCTTCCAT----GCT-CC----GGCGCGGCGGGCTGAAGGAGCT---C-GGCCC---TCTC--GC-AGGGCGAG-CACGGCGAGCGGTGGAC-GA-----------ATTCA----GCGCTGCGGGCAC-----TAAGGG-----TCGTAGGCGCTCATCGTCGTC---GTG-CTCGTCAC-----CAC-AGA-----T----CGAAAGG---------------GAGTGGAAGTTGGCGGAGTGCTGCCG----CTTACT-------CACCGAGA--------------GCAAGGCG----------------------GAAGG-----AACCCA---TGAG---CGAGCCGACGC---TCGGCGTCGC-----TCAC-A------------------------------------------------------------------------------------------------ Philodendron_undulatum_DQ866919 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Philodendron_xanadu_DQ866920 -------------------------------------------------------------------------------------------------------TTTCCGTAGGT----------------GAACCTGCGG-AAGGATCAT--TG----------TCGCA-------TCTCCGT-----------CTCGG-ACGACTC-------GACGCACCCGCGAA-CGGTTGA--CCC---TTC----TCCTTCTAAATCGTCCCCGCCG-GCCGGGCCGGAGGT-----------------------------------------GAGATCGATCGGTTTCT---------------CGGCTCTGGCCG--------------------------------------CGT-CCGTCGTGCCGCCTCCGCCC-------------------CTCCC---CG-CGCGT-CGCCGGC-CTCGGCGGCGGCGGC------GGCGGCGGGAAGACGCAACCCACCTCCCGGCGCGGCATGCGCCAAGGATCAGTGAAT--GGGGAC---GTCCGCGCGCGC-----GC--------CC-CGC-TCCGA----GCGGG---GAGGC------------CCGGTCGCCCCGAACGGAACGAACGAG----TCTCT-GAACGACTCCCGGCAACGGATATCTAGGCTCTCGCATCGATGAAG-AACGTAGCGAAATGCGATACGTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAATCTTCGAACGCAAG-TTGCGCCCGAG-GCCATCGGGTCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACGC--CCCG-CGTCGCTCCCCG----CCCCC--------------------------------------CCCTGTCGAGGGT----G-----AGGATGCGGAGATTGGCCCGCCGT----GCT-CC----GGCGCGGCGGGCTGAAGGACCT---C-GGCCC---TCTC--GT-GGGGCGAG-CACGGCGAGCGGTGGAC-GA-----------ATTCAGTCGGCGCTGCGGGCACCGCTATGCGGG-----TCGTACGCGCTCATCGTCGTC---GTG-----CCGC---------CGG----------CGAGGCG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------GAAGG-----AACCCA---CCCG---CGAGCCGACGC---ACGTCGTCGC-----TCGG-ACCGC-GACCCCAGGT-CAGGCGGGGCCA-------------------------------------------------------------------- ; END; [ The following blocks are output data for analysis step 14640 ] BEGIN TREES; TITLE Adelonema_ITS; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep14640; TREE con_50_majrule = [&R] (Lasia_spinosa_B1812:0.1943305,(((Homalomena_cochinchinensis_DQ866877:0.248836,Homalomena_pygmaea_M525:0.221657)1.00:0.060803,((Homalomena_ovata_Ar2361:0.018184,((Homalomena_borneensis_Ar2559:0.058578,Homalomena_borneensis_Ar227:0.022283,Homalomena_clandestina_Ar3007:0.007395)1.00:0.013919,(((Homalomena_vivens_Ar2363:0.015262,Homalomena_vivens_Ar3006:0.002522)1.00:0.013646,(Homalomena_matangae_Ar230:0.004807,(Homalomena_baangongensis_Ar2574:0.003229,Homalomena_giamensis_Ar1691:0.02821)1.00:0.018126)1.00:0.00895)1.00:0.008437,(Homalomena_rostrata_Ar2532:0.044989,((Homalomena_sp._Ar3051:0.008562,(Homalomena_debilicrista_Ar3057:0.027569,Homalomena_gastrofructa_Ar2575:0.0179)0.71:0.006503)1.00:0.017069,((Homalomena_hanneae_Ar2382:0.006009,Homalomena_sengkenyang_Ar3004:0.00216)0.72:0.005422,(Homalomena_josefii_Ar2380:0.001895,(Homalomena_hanneae_Ar3010:0.037762,(Homalomena_hanneae_Ar3005:0.008654,(Homalomena_symplocarpifolia_Ar2411:0.011654,(Homalomena_sengkenyang_Ar2387:0.009996,(Homalomena_sengkenyang_Ar2388:0.010189,(Homalomena_sengkenyang_Ar2362:0.001366,(Homalomena_clandestina_Ar2385:0.013861,Homalomena_sengkenyang_Ar3034:0.003976)1.00:0.008718)0.88:0.004232)0.96:0.005135)0.97:0.009203)0.56:0.003497)0.94:0.007808)0.98:0.006203)0.71:0.004437)1.00:0.024377)0.52:0.006851)0.99:0.01293)0.98:0.011808)1.00:0.017051)1.00:0.028918,(((Homalomena_chartacea_Ar2414:0.035546,(Homalomena_punctulata_Ar2424:0.014294,Homalomena_sp._Ar3033:0.009622)1.00:0.019528)1.00:0.016404,((Homalomena_insignis_Ar2066:0.016837,Homalomena_insignis_Ar2111:0.005159)1.00:0.039521,(Homalomena_havilandii_Ar2451:0.04784,(Homalomena_stella_Ar2390:0.015472,Homalomena_stella_Ar3011:0.00166)1.00:0.027857)1.00:0.020184)0.92:0.01015)1.00:0.028341,(Homalomena_tonkinensis_Ar4302:0.032853,((Homalomena_asmae_Ar2597:0.028062,Furtadoa_mixta_Ar4781:0.016842,((Homalomena_sp._Ar4763:0.018356,Homalomena_sp._Ar4764:0.003028)0.96:0.00393,(Homalomena_atrox_Ar2389:0.036942,(Homalomena_humilis_Ar2371:0.039498,Homalomena_sp._Ar4054:0.015252)1.00:0.013113)0.89:0.005736)1.00:0.00842)0.99:0.006517,(Homalomena_sp._Ar4759:0.024168,(Homalomena_zippelianum_M514:0.003313,Homalomena_philippinensis_DQ866881:0.003151)1.00:0.0116,((Homalomena_sp._Ar3047:0.016588,Homalomena_expedita_Ar2357:0.01418)1.00:0.009906,(Furtadoa_sumatrensis_Ar4045:0.023457,(Homalomena_curvata_Ar3052:0.00404,Homalomena_curvata_Ar3053:0.002424,(Homalomena_rubescens_M527:0.03728,Homalomena_sp._Ar3065:0.006651)0.99:0.012179)1.00:0.024321)1.00:0.011239)0.97:0.006554)0.95:0.004502)1.00:0.008333)0.75:0.007653)1.00:0.021371)1.00:0.049171)1.00:0.045942,(((Philodendron_surinamense_DQ866918:0.142004,Philodendron_sp._DQ866915:0.094706)1.00:0.093539,((Adelonema_speariae_M524:0.009162,Adelonema_hammelii_M531:0.008186,(Adelonema_wallisii_Ar3603:0.011466,(Adelonema_erythropus_DQ866879:0.004992,Adelonema_erythropus_M510:0.001123)1.00:0.014698)0.84:0.003063)1.00:0.184688,((Adelonema_sp._M533:0.019525,(Adelonema_picturata_M511:0.014472,(Adelonema_picturata_M512:0.00625,Adelonema_picturata_DQ866882:0.021532)1.00:0.01715)0.56:0.003787)1.00:0.149454,((Adelonema_peltata_M521:0.007543,(Adelonema_wendlandii_M580:0.013384,(Adelonema_panamensis_DQ866880:0.005953,Adelonema_panamensis_M520:0.002214)0.67:0.002447)1.00:0.011635)0.95:0.006075,(Adelonema_crinipes_M526:0.006287,(Adelonema_wendlandii_DQ866883:0.003754,Adelonema_wendlandii_M529:0.001398)1.00:0.005018,(Adelonema_crinipes_DQ866878:0.00469,Adelonema_picturata_M528:0.005375,Adelonema_crinipes_M519:0.001392,(Adelonema_peltata_M513:0.001462,Adelonema_wendlandii_M532:0.001362,Adelonema_peltata_M522:0.008158)1.00:0.003978)0.96:0.002668)1.00:0.011869)1.00:0.102859)0.91:0.031908)1.00:0.042567)0.83:0.024056,(((Philodendron_goeldii_DQ866895:0.162168,(Philodendron_solimoense_DQ866914:0.002171,Philodendron_solimoense_M599:0.00129)1.00:0.08651)1.00:0.071746,(Philodendron_undulatum_DQ866919:0.033344,(Philodendron_xanadu_DQ866920:0.010284,(Philodendron_lundii_DQ866903:0.002255,Philodendron_selloum_Ar4340:0.024615)1.00:0.019247)1.00:0.023932)1.00:0.078723)1.00:0.038453,((Philodendron_ecordatum_DQ866890:0.050116,Philodendron_fragrantissimum_DQ866893:0.038552)1.00:0.068912,(Philodendron_brevispathum_DQ866887:0.105995,(Philodendron_longistilum_DQ866902:0.015553,((Philodendron_glaziovii_DQ866894:0.024417,Philodendron_linnaei_DQ866901:0.012198)0.90:0.010462,(Philodendron_insigne_DQ866899:0.001719,Philodendron_insigne_M596:0.006332)1.00:0.014371)0.93:0.010358)1.00:0.033103)1.00:0.074649,(Philodendron_martianum_DQ866888:0.058822,((Philodendron_findens_DQ866892:0.023209,(Philodendron_sodiroi_DQ866913:0.023178,(Philodendron_mamei_DQ866904:0.01462,Philodendron_ornatum_DQ866891:0.018526)1.00:0.019785)1.00:0.030014)0.99:0.01956,((Philodendron_pterotum_DQ866907:0.145092,(Philodendron_serpens_DQ866911:0.053141,(Philodendron_grandipes_DQ866896:0.079329,Philodendron_panamense_DQ866905:0.088318):0.030949)1.00:0.011339)0.77:0.012524,((Philodendron_squamiferum_DQ866916:0.041506,Philodendron_pedatum_DQ866906:0.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TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr77959] END;