#NEXUS
[!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file.


Generated on May 09, 2024; 23:30 GMT

TreeBASE (cc) 1994-2008

Study reference:
Sato H., & Hattori T. 2014. New species of Boletellus section Boletellus (Boletaceae,
Boletales) from Japan, B. auricarnosus sp. nov. and B. areolatus sp. nov. Mycologia,
.

TreeBASE Study URI:  http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S16362]

[ The following blocks are input data for analysis step 14712 ]
BEGIN TAXA;
        TITLE  TaxaForAnalysisStep14712;
        DIMENSIONS NTAX=7;
        TAXLABELS
            BLT23__BLT38__BLT42__BLT62__BLT64__BLT65__BLT68__BLT116__BLT30__BLT66__BLT69__BLT39__BLT63__BLT67__BLT117__BLT123__BLT126__BLT130
            BLT7__BLT12__BLT124
            Boletellus_emodensis_BLT3_40_22_35_58_59_60_36_111_113_128
            Boletus_edulis_AF002153
            Boletus_pseudocalopus_AB426526
            Strobilomyces_seminudus_AB353783
            Xerocomus_chrysenteron_AF002155
            ;
END;

BEGIN CHARACTERS;
[! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M24076]

	TITLE Boletellus_aligned_cox_3;
	LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep14712;
	DIMENSIONS NCHAR=571;
	FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -;

MATRIX
[                                                                                                                                             10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220       230       240       250       260       270       280       290       300       310       320       330       340       350       360       370       380       390       400       410       420       430       440       450       460       470       480       490       500       510       520       530       540       550       560       570    ]
[                                                                                                                                              .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .    ]
BLT23__BLT38__BLT42__BLT62__BLT64__BLT65__BLT68__BLT116__BLT30__BLT66__BLT69__BLT39__BLT63__BLT67__BLT117__BLT123__BLT126__BLT130     TGTAATGTATATGCAAGGTTACTATTCAGGTGATCTTATATTAGAGTTAGGATTTATCTTAACATTAGGAGGTATGATATTCTGGTTTAGAGATGTAGGAAATGAAGCTACTTTAGGAGGACACCATACAAAACAAGTTAAAAAAGGTTTAGAAATTGGATTCTTACTTTTTGTTGTTAGTGAAGTTTTTGCTTTCTTAAGTATTTTCTGGGCTTTCTTTCATGCTAGTTTATCACCAGCAATAGAGATTGGAGGAGTTTGGCCACCTCAAGGTATAACACCATTAAATCCTTTTGCAATTCCATTATTAAATACAATATTATTAGTATCTTCAGGTGCTTTTGTAACTTATGGTCACCATGCTTTAATTAATGGTAACAGAAAAGATACTTTAAGAGGGTTAGAATTAACTGTTTTATTTGCAGTTCTTTTCACTTTCTTACAATATTTAGAATATGCTAATTCATCTTTCTCAATATCAGATTCAGTATTTGGAAGTGCATTCTTCTGTTCAACAGGTTTACATGGTATTCATGTATTAGTAGGAACTATTTTTATCTTAGTACAATTA
BLT7__BLT12__BLT124                                                                                                                   TGTAATGTATATGCAAGGTTACTATTCTGGAGATCTTATCTTAGAATTAGGATTTATCTTAACTTTAGGAGGAATGATATTCTGGTTTAGAGATGTAGGAAATGAAGCAACATTAGGAGGACACCATACAAAACAAGTTAAAAAAGGTTTAGAAATAGGATTCTTACTTTTTGTAGTTAGTGAAGTTTTTGCTTTCTTAAGTATATTCTGGGCTTTCTTCCATGCTAGTTTATCACCAGCAATAGAGATAGGTGGTGTTTGGCCACCTCAAGGAATAACTCCTTTAAATCCTTTTGCAATACCATTATTAAATACAATATTATTAGTATCTTCAGGAGCTTTTGTAACTTATGGTCACCATGCTTTAATTAATGGTAACAGAAAAAATACATTAAGAGGGTTAGAATTAACTGTATTATTCGCAGTTCTTTTCACTTTCTTACAATATTTAGAATATGCTAATTCATCTTTCTCAATATCAGATTCAGTATTTGGAAGTGCATTTTTCTGTTCAACTGGTTTACATGGTATTCATGTAATAGTAGGAACTATATTTATCACAGTACAATTA
Boletellus_emodensis_BLT3_40_22_35_58_59_60_36_111_113_128                                                                            TGTAATGTATATGCAAGGTTACTATTCTGGAGATCTTATCTTAGAATTAGGATTTATCTTAACTTTAGGGGGAATGATTTTCTGGTTTAGAGATGTAGGAAATGAAGCTACTTTAGGAGGACACCATACAAAACAAGTTAAAAAAGGTTTAGAAATTGGATTCTTACTTTTTGTTGTTAGTGAAGTTTTTGCTTTCTTAAGTATATTCTGGGCTTTCTTCCATGCTAGTTTATCACCAGCAATAGAGATAGGTGGTGTTTGGCCTCCTCAAGGAATTACTCCTTTAAATCCTTTTGCAATACCATTATTAAATACAATATTATTAGTATCTTCAGGAGCTTTTGTAACTTATGGTCACCATGCTTTAATTAATGGAAACAGAAAAAATACATTAAGAGGGTTAGAATTAACTGTATTATTCGCAGTTCTTTTCACTTTCTTACAATATTTAGAATATGCTAATTCATCTTTCTCAATATCAGATTCAGTATTTGGAAGTGCATTCTTCTGTTCAACAGGTTTACATGGTATTCATGTAATAGTAGGAACTATATTTATCACAGTACAATTA
Boletus_edulis_AF002153                                                                                                               TGTAATGTATATGCAAGGTTACTATTCTGGTGATCTTATATTAGAATTAGGATTTATATTAACTTTAGGTGGTATGACTTTCTGGTTTAGAGATGTAGGTAATGAAGCTACTTTAGGTGGACATCATACAAAACAAGTTAAAAAAGGTTTAGAAATTGGATTCATACTTTTTGTTGTTAGTGAAATTTTTGCTTTCTTAAGTATTTTCTGGGCTTTCTTCCATTCTAGTTTAACTCCTGCTATTGAAATAGGAGGAGTATGGCCACCTCAAGGTATAACACCTTTAAATCCTTTTGCTATCCCATTATTAAATACAATATTATTAGTATCTTCAGGTGCTTTTGTAACTTTTGGTCACCATGCATTAATTAATGGTAACAGAAAAAACACTTTAATAGGATTAGAATTAACTGTTTTATTTGCTGTTCTTTTCACTTTCTTACAATATTTAGAATATGCTAATTCAACTTTCTCAATATCAGATTCAGTATTTGGAAGTGCTTTCTTCTGTTCAACTGGATTACATGGTATTCATGTAATAGTTGGAACTATCTTTATTGTTGTACAATTA
Boletus_pseudocalopus_AB426526                                                                                                        TGTAATGTTTATGCAAGGTTACTATTCTGGTGATCTTATATTAGAATTAGGATTTATATCAACTTTAGGTGGTATGACTTTCTGGTTTAGAGATGTAGGTAATGAAGCTACTTTAGGAGGACATCATACAAAACAAGTTAAAAAAGGTTTAGAAATTGGATTCTTACTTTTTGTTGTTAGTGAAGTTTTTGCTTTCTTAAGTATTTTCTGGGCTTTCTTCCATGCTAGTTTAGTTCCTGCTATTGAAATAGGAGGAGTATGGCCACCTCAAGGAATAACTCCATTAAATCCTTTTGCTATACCATTATTAAATACAATATTATTAGTATCTTCAGGTGCTTTTGTAACTTATGGTCATCATGCATTGATTAATGGTAACAGAAAAGATACTTTAAGAGGATTAGAATTAACTGTTTTATTTGCTGTTCTTTTCACTTTCTTACAATATTTAGAATATGCTAATTCATCTTTCTCAATATCAGATTCAGTATTTGGAAGTGCTTTCTACTGTTCAACTGGTTTACATGGTATTCATGTAATAGTTGGTACTATCTTTATCGCAGTACAATTA
Strobilomyces_seminudus_AB353783                                                                                                      TGTAATGTTTATGCAAGGTTACTATTCTGGTGATCTTATATTAGAATTAGGATTTATATTAACTTTAGGAGGTATGACATTCTGGTTTAGAGATGTAGGTAATGAAGCTACTTTAGGTGGATATCATACAAAACAAGTTAAAAAAGGTTTAGAAATTGGATTCTTACTTTTTGTTATTAGTGAAGTTTTTGCTTTCTTAAGTATTTTTTGGGCTTTCTTCCATTCTAGTTTAACTCCAGCTATTGAAATAGGAGGAGTATGGCCACCTCAAGGAATAACACCATTAAATCCTTTTGCTATTCCATTATTAAATACAATATTATTAGTATCTTCAGGTGCTTTTGTTACTTATGGTCACCATGCATTAATTAATGGTAACAGAAAAGATACTTTAAGAGGATTAGAATTAACTGTATTATTTGCTGTTCTTTTCACTTTCTTACAATATTTAGAATATGCAAATTCAACTTTCTCAATCTCAGATTCAGTATTTGGAAGTGCTTTCTTCTGTTCCACAGGTTTACATGGTATCCATGTAATAGTAGGAACTATATTTATTGTAGTACAATTA
Xerocomus_chrysenteron_AF002155                                                                                                       TGTAATGTATATGCAAGGTTACTATTCTGGTGATCTTATATTAGAATTAGGTTTTATATTAACTTTAGGTGGTATGATTTTCTGGTTTAGAGATGTAGGAAATGAAGCTACTTTAGGTGGATATCATACAAAACAAGTTAAAAAAGGTTTAGAAATCGGATTCTTACTTTTTGTTGTTAGTGAAGTTTTTGCTTTCTTAAGTATTTTCTGGGCTTTCTTCCATGCTAGTTTATCTCCTGCTATTGAAATAGGAGGAGTATGGCCACCTCAAGGAATAACACCCTTAAATCCATTTG{CG}TATCCCATTATTAAATACAATATTATTAGTATCTTCAGGAGCTTTTGTAACTTATGGTCACCATGCATTAATCAATGGTAACAGAAAAGATACTTTAAGAGGGTTAGAATTAACTGTTTTATTTGCTGTTCTTTTCACTTTCTTACAATATTTAGAATATGCTAATTCATCTTTCTCAATATCAGATTCAGTATTTGGAAGTGCTTTCTACTGTTCAACTGGTTTACACGGTATTCATGTAATAGTTGGAACTATCTTTATTGTAGTACAATTA
;
END;

[ The following blocks are output data for analysis step 14712 ]
BEGIN TREES;
      TITLE Boletellus_bootstrap_cox3;
      LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep14712;
      TREE cox3_tree = [&R] (Xerocomus_chrysenteron_AF002155:0.016574,(Boletus_pseudocalopus_AB426526:0.024024,(Strobilomyces_seminudus_AB353783:0.037668,Boletus_edulis_AF002153:0.020755)62.6:0.006872)56.3:0.007552,(BLT23__BLT38__BLT42__BLT62__BLT64__BLT65__BLT68__BLT116__BLT30__BLT66__BLT69__BLT39__BLT63__BLT67__BLT117__BLT123__BLT126__BLT130:0.018869,(Boletellus_emodensis_BLT3_40_22_35_58_59_60_36_111_113_128:0.008594,BLT7__BLT12__BLT124:0.012312)100.0:0.036843)100.0:0.049178);
[!  TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr77481]


END;