#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on May 06, 2024; 22:33 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Martins A.C., Scherz M.D., & Renner S.S. 2014. Several origins of floral oil in the Angelonieae, a Southern Hemisphere disjunct clade of Plantaginaceae. American Journal of Botany, 101(12): 2113-2120 . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S16619] [ The following blocks are input data for analysis step 15047 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep15047; DIMENSIONS NTAX=44; TAXLABELS Angelonia_angustifolia_McGregor16461_Mexico Angelonia_arguta_Cerrado_Caatinga Angelonia_biflora_Martins200_AM153_Caatinga Angelonia_blanchetii_Harley16787_AM136_Cerrado_Caatinga Angelonia_campestris_Harley16756_AM131_Caatinga Angelonia_cornigera_Harley16302_AM134_Caatinga Angelonia_eriostachys_Martins_AM177_Cerrado Angelonia_gardneri_Beck27908_AM184_Chaco Angelonia_hassleriana_Zardini33730_AM147_Chaco Angelonia_hirta_Rodrigues30_AM144_Caatinga Angelonia_integerrima_Martins_AM178_grasslands Angelonia_pilosella_Curtis_AM137_Cuba Angelonia_procumbens_Paixao87_AM142_Caatinga Angelonia_pubescens_dePamphilis9403_Caatinga Angelonia_salicariifolia_Martins_AM179_Chaco Angelonia_verticillata_Lutzelburg176_AM175_Caatinga Bacopa_monnieri_TurnerTurner97527_Texas Basistemon_bogotensis_VanderWeff7448_AM150_Venezuela Basistemon_intermedius_SeidelSchulte2184_AM187_Bolivia Basistemon_klugii_Plowman11387_Peru Basistemon_peruvianus_Hatschbach74234_AM135_Chaco Basistemon_pulchellus_WoodSoto25300_AM188_Bolivia Basistemon_silvaticus_Nee38032_Bolivia Basistemon_spinosus_Chaco Gratiola_sp_Asia Mecardonia_procumbens_DennyHarvey449_Texas Melosperma_andicola_AooryoHumana206607_Monte Monopera_micrantha_Goncalo_AM139_Caatinga Monttea_aphylla_AAC4463_Monte Monttea_chilensis_Dillon8132_Monte Monttea_schickendantzii_AAC4516_Monte Otacanthus_Albach_Brazil Ourisia_alpina_Chile Ourisia_breviflora_Argentina Ourisia_caespitosa_NewZealand Ourisia_chamaedrifolia_Peru Ourisia_glandulosa_NewZealand Ourisia_integrifolia_Tasmania Ourisia_microphylla_Chile Ourisia_modesta_NewZealand Ourisia_remotifolia_NewZealand Ourisia_ruellioides_Chile Scoparia_dulcis_Fischer10254_Texas Stemodia_sp_Mexico ; END; BEGIN CHARACTERS; [! 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Ourisia_remotifolia_NewZealand TTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCGAAA-CCTGC-AAGACAGACCCGCGCACACGTGTTTAACAT----TCGGGGTCT{CG}GG?GAGGGGTGG--ACGCGA---G----TCCA--CCCACGCCGT-GTCCCCCTCCCCGCCCGGCGCGCGCCTCG-----GC-GTGC----GACGGGTGGGCT--AACGAACCCGGGCGCGGCATGCGCCAAGGAAAACTT-AAAAGAAGCGCCGACCCTTCACTGTCCCGTTCGCGGTGTGC--GTGGGGGGT-GCGGGCGTCTCTTCA---ATGTC-AAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAACGCGATATTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCATTAGGCCGAGGGCACGTCTGCATGGGCGTCACGCATCGCGTCACCCCCCTCCTA-CTCCCTCG---------GGA--CGCTGGG-GTG-GGGGCGTAAATTGGCCTCCCGTGCGTG-CAAGCGTGCGGCCGGCCCAAATGCGATCCCGCATCGACGGATGTCACGACCAAGAACTTTGGCTCGGAAACACAAAAGTACTGTACGTGCTTTTTTGAAAAGATTAGGCTCGGAATTATTGGAAGAATTTCTTATGTCAGAAGAAGACGTTCTTTCTTTGACCTTCCCCAAAGCTTCTTCCACTGTACGTGGCGTACATAGAAGCCGGATTTGGTATTTGGATATTATTTCTATCCATGATCTGGCCAATCATAAATAAAAATTCTGAGACCTTGGAAATCTAAATTTTTCCTAAATCCTAAATAAGAAAAAGATAGATCAAGAGATTAAAA---AAAACCGGGATTTCCACTATTCTGAAATGTTGATGTAGTAT------TAAGGGTTAAATCAACTGAGTATTCAACT----------------------------------AAAAGGAAATGATGTATACATAGGGAAAGCCGTGTGCAATGAAAAATGCAAGCACGGCTTGGGGAGGGGTTTTTC--TTTATTTATTA-GTTAA-TAACATAAC-AAAGAAAATAT???????????????CTACT-AAGTGATAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAATAAAAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTTCTCACAACAAAGGTTCAAAAAGTG-AAAA-----AGGGGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAACGGAGTTGACTG----------CGTTGGTAGAGGAATCTTCCCATCGAAACTTCAGAAAGGATGAAGGATAAACGTATCTATTGAATACTATATCAAATGATTAATGATGGCCCGAATCTATATCTGTATTT------TTTTATATGA---------AAAATGAAAGAATTGGTGTGAATTCATTCCACATTCAAGAAAGAATCGAATATTGATTCATCAAAGCATTCACTCCACAGTCTGATAGATCTTTTAAAGAACTGATTAATCGGACAAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGGCAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCAAAAAAG-GACTATTCGACTCCC-AAAATATTTATCCTATACCCCT------TTTTCGTTAGCGGTTCAAAATGCCTTTATCTTTCTCATTCTTTTCCAGATGTATTTGGGCATAAATGACTTTCTCTTATCACA------TG?AAT---A????CACATCCAAATTAAGCAAGGAATCCC------TATGTGAATGATTCACAGTCAATAGTATGACTCATACTGC------AACTTAGAAAATCGTCTTTTTG-----AAGATCCAAGAAATTATAGGACTTGAAAAAA-CTTTGTAATCC-CCCTTGTCCCTTTAATTGACATAGACCCCAT?TCATCTA---------ATAATAATAAAATGAGCATAGGATGCTACATTGGGAATGGTCGGGATAGCT??????????? Ourisia_ruellioides_Chile ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AGAACTTTGGCTCGGAAACACAAAAGTACTGTACGTGCTTTTTTGAAAAGATTAGGCTCGGAATTATTGGAAGAATTTCTTATGTCAGAAGAAGACGTTCTTTCTTTGACCTTTCCAAAAGCTTCGTACACTGTACGTGGCGTACATAGAAGCCGGATTTGGTATTTGGATATTATTTCTATCCATGATCTTTCCAATCACAAATAAAAATTCTGAGACCTTGGAAATCGAAATCTTTCCTAAATCCTAAATAAGAAAAAGATAGATCAAGAGATTAAAA---AAAACCGGGATTTCCACTATTCTGAAATGTTGATGTAGTAT------TAAGGGTTAAATCAACTGAGTATTCAACT----------------------------------AAAAGGAAATGATGTATACATAGGGAAAGCCGTGTGCAATGAAAAATGCAAGCACGGCTTGGGGAGGGGTTTTTC--GTTATTTATTA-GTTAACTAACATAACTAAAGAAATTA{AT}?????????????????ACTAAGGTGATAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAATAAAAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTTCTCACAACAAAGGTTCAAAAAGTG-AAAA-----AGGGGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAACGGAGTTGACTG----------CGTTGGTAGAGGAATCTTCCCATCGAAACTTCAGAAAGGATGAAGGGTAAACGTATCTATTGAATACTATATCAAATGATTAATGATGGCCCGAATCTGTATCTGTATTT------TTTTATATGAAAAATATG{AG}AAAATGCAAGAATTGGTGTGAATGCATTCCACATTCAAGAAAGAATCGAATATTGATTCATCAAAGCATTCACTCCACAGTCTGATAGATCTTTTAAAGAACTGATTAATCGGACAAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGGCAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCAAAAAAG-GACTATTCGACTCCC-AAAATATTTATCCTATACCCCT------TTTTCGTTAGCGGTTCAAAATTCCTTTATCTTTCTCATTCTTTTCCAAATGTATTTGGGCATAAATGACTTTCTCTTATCACA------TGTGATCTGGAATACACATCCAAATTAAGCAAGGAATCCC------TATGTGAATGATTCACAGTCAATAGTATGACTCATACTGC------AACTTAGAAAATCGTCTTTTTG-----AAGATCCAAGAAATTATAGGACTTGAAAAAA-CTTTGTAATCC-CCCTTGTCCCTTTAATTGACATAGACCCCATTCATC----------------TAATAAAATGAGCATAGGATGCTACATT?????????????????????????????? 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Stemodia_sp_Mexico TTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCGAAA-CCTGC-AAAGCAGACCCGCGAACACGTGTATAACACCA--C--GG----------GGGCGGGG-CTCT--------CTTTTG----AGCTTCGT-TCCCGTCTCCCCACCGGACTTGCGCCCA------GT-GCGCTCGTTCGGCGTGGGCC--AACCAACCCCGGCGCGGCACGCGCCAAGGAATACTCACAAAGAAGCGTCGGCCCTCCCGTGCCCCGTCCGCGGTGTGCTCGGGGGGAAA-CCGTGCGTATCTTGAA--ATGTC-TAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGTTGAAGAACGTA??GAAATGCGATACTCGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCATTAGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCGCGTCGCCCCCCCTCCCAATCCCTCTCGCAAGACGAGG--GTGCGGCTGCG-GGGGCGGAGATTGGCCTCCCGTGCGCGATCAGCACGCGGCCGGCCCAAAAACGATCCCGCGCCGGCGGAAGTCACGACAAA-------TGCTCGG{AT}AACACATAAGTACTGTACGCGCTTTTTTGAAAAGATTAGGCTCGGAATTATTA{GT}AAGAATTTCTTATGTCGGAAGAAGACGTTCTTTCTTTGACCTTCCCAAAAGCTTCTTCCACTTTTTGGGGAGTATATAGAAGTCGGATTTGGTATTTGGATATTATTTCGATTAACGATCTGGCCAATCACAAATAAAAATTCTGAGACCTTGGAAATCGAAATTTTTCATAAAAA---------AAAATGATAAATGAAGAGAT-AAAAAATAAAAATGGAATTTCCACTATTCTGAAATGCTGATGTAGTATGTAA--TAAGGGTAAAATCAACTGAGTAGCCAACTTTTTAAAG-----TTAAAGTCTTT------ATAAGAAAGGAAATGATGTATACATAGGGAAAGCCGTGTGCAATGAAAAATGCAAGCACGGTTTGGGGAGGGTTTTTCG--TTTA--------GTTAATTAACATAAC-AAGAAT????????TGGTATGGAAACCTACT-AAGTGATAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAATAAAAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTTCTTAAAACAAAGGTTCCGAAAGGG-AAAA-----GAGGGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAATGGAGTTGACTG----------CGTTGGTAGAGGAATCTTTCCTTCGAAACTTCAGAAAGGATGAAGGATAAACGTATCTATTGAATACTATATCAAATTATTAATGATGGCCTGAATTTCTATCTCTATTT------TTTCTATGAA---------AAAACGGAAGAATTGGTGTGAATTGATTCCACATTGAAGAAAGAATCGAATATTCATTAATCAACTCATTCACTCCATAGTCTGATAATTTTTTTTAAGAACTGATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATATCGGCAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCAAAAAGG-ATCTATTTGACTCCC-AAAATATTTATCCTATCCCCCT------TTTTCGTTAGCGGTTCCCAATTCCTTTATCTTTCTCATTCTTTTCCAACGTATTTTGGGCATAAATGACTTGCTCTTATCACATGTGATTGTAATCTAGAATACACATCCAAAATAAGCAAGGAATCTC------TATTTGAATGATTCACAATCAATAGCATTACTCATACTGCAACTTAAACTTACAAAGTCGTCTTTTTG-----AAGATCCAAGAAATTACAGGACTTGGAGAAACCTTTGTAATCTACTCCTGTCCCTTTAATTGACATAAGTTTCTTCTATATAATTAATTAGAGAAATAAAAAAATGAGGATGGGATGCTACATTGGTAATGGTCGGGATAGCTCAGCTGGTAG? ; END; [ The following blocks are output data for analysis step 15047 ] BEGIN TREES; TITLE Angelonieae_ITS_plastid; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep15047; TREE con_50_majrule = [&R] ((Mecardonia_procumbens_DennyHarvey449_Texas:0.04372366,(Bacopa_monnieri_TurnerTurner97527_Texas:0.07715877,(Scoparia_dulcis_Fischer10254_Texas:0.04855999,(Gratiola_sp_Asia:0.05185111,(Otacanthus_Albach_Brazil:0.03296305,Stemodia_sp_Mexico:0.03484862):0.008541243):0.01260469):0.008743041):0.01131954):0.01502962,(((Melosperma_andicola_AooryoHumana206607_Monte:0.03306148,(Monttea_aphylla_AAC4463_Monte:0.00914926,(Monttea_chilensis_Dillon8132_Monte:0.002335105,Monttea_schickendantzii_AAC4516_Monte:0.001436951):0.00306601):0.02181169):0.01556175,(Ourisia_microphylla_Chile:0.06016671,(Ourisia_integrifolia_Tasmania:0.006831911,((Ourisia_ruellioides_Chile:0.007697283,(Ourisia_breviflora_Argentina:0.003542985,Ourisia_chamaedrifolia_Peru:0.008111774):0.001929885):0.002179255,(Ourisia_alpina_Chile:0.009610181,(Ourisia_remotifolia_NewZealand:0.004109203,(Ourisia_modesta_NewZealand:0.005387831,(Ourisia_caespitosa_NewZealand:0.003859465,Ourisia_glandulosa_NewZealand:0.002045977):0.001667226):0.002676515):0.008695173):0.001601666):0.005141365):0.0294323):0.01670556):0.01022832,((Basistemon_spinosus_Chaco:0.01108275,(Basistemon_bogotensis_VanderWeff7448_AM150_Venezuela:0.003303969,((Basistemon_intermedius_SeidelSchulte2184_AM187_Bolivia:6.772667E-4,Basistemon_silvaticus_Nee38032_Bolivia:0.01090188):0.003060791,(Basistemon_peruvianus_Hatschbach74234_AM135_Chaco:0.002848649,(Basistemon_klugii_Plowman11387_Peru:0.004866487,Basistemon_pulchellus_WoodSoto25300_AM188_Bolivia:0.00748834):0.003558252):0.002383726):0.003775345):0.004522301):0.02203893,((Angelonia_verticillata_Lutzelburg176_AM175_Caatinga:0.01941386,(Angelonia_integerrima_Martins_AM178_grasslands:0.01078798,(Angelonia_eriostachys_Martins_AM177_Cerrado:0.004580069,(Angelonia_blanchetii_Harley16787_AM136_Cerrado_Caatinga:0.01123993,Angelonia_cornigera_Harley16302_AM134_Caatinga:5.287546E-4):0.00498406):0.01043257):0.01165251):0.007996645,(Angelonia_hassleriana_Zardini33730_AM147_Chaco:0.03535777,((Angelonia_campestris_Harley16756_AM131_Caatinga:0.00690597,Angelonia_pubescens_dePamphilis9403_Caatinga:0.00383461):0.004699765,(Monopera_micrantha_Goncalo_AM139_Caatinga:0.03719492,(Angelonia_arguta_Cerrado_Caatinga:0.04002118,((Angelonia_pilosella_Curtis_AM137_Cuba:0.005753119,Angelonia_procumbens_Paixao87_AM142_Caatinga:0.0112956):0.00751758,(Angelonia_angustifolia_McGregor16461_Mexico:0.001512647,(Angelonia_biflora_Martins200_AM153_Caatinga:0.003707182,(Angelonia_salicariifolia_Martins_AM179_Chaco:8.762557E-4,(Angelonia_gardneri_Beck27908_AM184_Chaco:0.02289746,Angelonia_hirta_Rodrigues30_AM144_Caatinga:0.002636203):0.003844747):0.008535784):0.006706073):0.006524092):0.006129862):0.004152902):0.01448585):0.004951285):0.004885796):0.01934002):0.01580877):0.01502962); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr79385] END;