#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on September 20, 2025; 2:15 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Whitlock B., Karol K., & Alverson W. 2003. Chloroplast DNA sequences confirm the placement of the enigmatic Oceanopapaver within Corchorus (Grewioideae: Malvaceae s.l., formerly Tiliaceae). International Journal of Plant Sciences, 164(1): 35–41. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S917] [ The following blocks are input data for analysis step 1533 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep1533; DIMENSIONS NTAX=90; TAXLABELS Acanthus Acer Achillea Afrostyrax Ailanthus Akebia Amborella Ardisia Asarum Asclepias Asimina Austrobaileya Baeckea Balanops Barbeya Betula Bixa Brasenia Brassica Bretschneidera Bursera Buxus Byrsonima Caltha Calycanthus Camellia Capparis Carica Carya Chloranthus Cistus Clethra Cornus Crossosoma Cucumis Dianthus Dicentra Dillenia Diospyros Dovyalis Drimys Drypetes Elaeocarpus Euonymus Euptelea Flacourtia Gossypium Heliocarpus Helwingia Humulus Illicium Impatiens Itea Jasminum Juglans Muntingia Myristica Nelumbo Nepenthes Nypa Oceanopapaver Oenothera Orontium Osyris Oxalis Paeonia Passiflora Pelargonium Persea Petunia Piper Pisum Platanus Plumbago Podophyllum Salix Sanguinaria Sedum Tamarix Tapiscia Thymelaea Tilia Tillandsia Trimenia Trochodendron Tropaeolum Viburnum Vitis Xanthorhiza Zelkova ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M404] TITLE Angiosperm_rbcL_matrix; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep1533; DIMENSIONS NCHAR=1408; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Ailanthus 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Austrobaileya 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Baeckea 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Byrsonima 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Caltha 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Calycanthus 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Camellia 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Capparis 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Carya 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Chloranthus 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Cistus 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Crossosoma 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Cucumis 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Dianthus 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Dillenia 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Diospyros 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Dovyalis 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Drimys 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Drypetes 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Elaeocarpus 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Euonymus 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Euptelea 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Flacourtia 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Gossypium 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Heliocarpus 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Nepenthes ??????????GTTGGATTCAAAGCTGGTGTTAAAGATTACAAATTGACTTATTATACTCCTGACTATGAAACCCTAGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTCACTCCTCAACCTGGAGTTCCGCCGGAAGAAGCAGGGGCCGCGGTAGCTGCCGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGACTTACCAGCCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTACCACATCGAGCCTGTTGCTGGAGAAGAAAATCAATATATTGCTTATGTAGCTTACCCATTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCCATTGTGGGTAATGTATTTGGGTTCAAAGCCCTGCGTGCTCTACGCTTGGAGGATTTGCGAATCCCTCCTGCTTATTCGAAAACTTTCCAAGGACCGCCTCATGGTATCCAAGTTGAGAGAGATAAATTGAACAAATATGGTCGTCCACTATTGGGATGTACTATTAAACCGAAATTGGGGTTATCCGCTAAGAACTACGGTCGAGCAGTTTATGAATGTCTTCGCGGTGGACTGGATTTTACCAAAGATGATGAAAACGTGAACTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCGTATTTTTTGCCGAAGCACTTTATAAAGCACAGGCTGAAACAGGTGAAATCAAAGGGCATTACTTGAATGCTACTGCAGGTACATGCGAAGAAATGATAAAAAGGGCAGTATTTGCCAGAGAATTGGGAGTTCCTATCGTAATGCATGACTACCTAACAGGGGGATTCACAGCAAATACTAGCTTGGCTCATTATTGCCGAGATAATGGCCTACTTCTTCACATCCACCGTGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAAAATCATGGTATACATTTCCGTGTACTAGCTAAAGCGTTACGTCTGTCTGGTGGAGATCATATTCATGCTGGTACTGTAGTAGGTAAACTTGAAGGGGAAAGAGACATTACTTTAGGTTTTGTTGATTTATTACGTGATGATTATGTTGAAAAAGACCGAAGTCGCGGTATTTATTTCACTCAATTTTGGGTTTCCATACCTGGTGTTCTGCCCGTGGCTTCGGGGGGTATTCACGTTTGGCATATGCCCGCTCTAACCGAAATCTTTGGGGATGATTCCGTATTACAGTTCGGTGGAGGAACTTTAGGACATCCTTGGGGAAATGCGCCGGGTGCTGTAGCGAATCGAGTAGCTCTAGAAGCATGTGTACAAGCTCGTAATGAGGGACGTGATCTTGCTCGCGAGGGTAACGAAATTATCCGTGAGGCTAGCAAATGGAGTACTGAACTAGCTGCTGCTTGTGAGATATGGAAGGAAATAAAATTTGTATTCGAAGCAATGGATACTTTGTAA Nypa ??????????GCTGGATTTAAAGCTGGTGTTAAAGATTACAAATTGACTTATTATACTCCTGACTACGAAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCCGGAGTTCCGCCTGAGGAAGCAGGGGCAGCGGTAGCTGCCGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACTGATGGGCTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTACCACATCGAAACCGTTGTCGGGGAGGAAAATCAATATATTGCTTATGTAGCTTATCCTTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCCATTGTGGGTAATGTATTTGGTTTCAAAGCCCTACGAGCTCTACGTCTGGAGGATCTGCGAATCCCCCCTTCTTATTCCAAAACTTTCCAAGGCCCACCTCATGGCATCCAAGTTGAAAGAGATAAGTTGAACAAGTATGGTCGTCCTCTATTGGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGATTATCCGCAAAGAACTACGGTAGGGCGGTTTATGAATGTCTACGCGGTGGACTTGATTTTACCAAGGATGATGAAAACGTGAACTCACAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTTTGTACCGAAGCAATTTATAAAGCGCAGACCGAAACGGGTGAAATCAAAGGACATTACTTGAATGCTACCGCGGGTACATGTGAAGAAATGATGAAAAGGGCCATATTTGCCAGAGAATTGGGAGTTCCTATCATAATGCATGACTACTTAACTGGGGGATTCACTGCAAATACTAGCTTGGCTCATTATTGCCGCGATAACGGCCTACTTCTTCACATCCATCGCGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAAAATCATGGTATGCATTTTCGTGTACTAGCTAAAGCATTACGTATGTCTGGTGGAGATCATATTCACGGAGGTACAGTAGTGGGTAAACTGGAAGGGGAACGTGAGATGACTTTGGGTTTTGTTGATTTATTACGTGATGATTTTATTGAAAAAGACCGAAGTCGCGGTATCTTTTTTACTCAAGATTGGGTCTCTATGCCAGGTGTTATACCCGTGGCTTCAGGGGGTATTCATGTTTGGCATATGCCTGCCCTGACCGAAATCTTTGGGGATGATTCCGTATTACAGTTTGGCGGAGGAACTTTAGGACACCCTTGGGGAAATGCACCCGGTGCAGTAGCTAATCGGGTGGCTTTAGAAGCGTGTGTACAAGCTCGTAATGAGGGACGTGATCTTGCTCGTGAAGGTAATGAAATTATCCGTGAAGCTAGCAAATGGAGCCCTGAACTAGCTGCCGCTTGTGAAGTATGGAAGGAGATCAAATTCGACTTC????????????????????? Oceanopapaver ??????AAGTGTTGGATTCAAAGCTGGTGTTAAAGAGTATAAATTGACTTATTATACTCCTGAGTATCAAGTCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCCTTCCGAGTAACTCCTCAACCCGGAGTTCCGCCTGAGGAAGCAGGAGCCGCGGTAGCTGCTGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACCGTGTGGACCGATGGGCTTACCAGCCTTGATCGTTACAAAGGGCGCTGCTACCACATCGAGCCCGTTGCTGGAGAAGAAGATCAATATATATGTTATGTAGCTTACCCCTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCCATTGTGGGTAATGTATTTGGGTTCAAAGCCCTGCGCGCTCTACGTCTAGAGGATCTGCGAATCCCTCCTGCTTATATTAAAACTTTCCAAGGCCCGCCTCATGGGATCCAGGTCGAAAGAGATAAATTGAACAAGTATGGTCGTCCCCTATTGGGATGTACTATTAAACCTAAATTGGGGTTATCCGCTAAGAACTACGGTAGAGCTGTTTATGAATGTCTACGTGGGGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAGAATGTGAACTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTTTGTGCCGAAGCAATTTTTAAATCACAGGCTGAAACAGGTGAAATCAAAGGGCATTACTTGAATGCTACTGCGGGTACATGCGAAGAAATGATTAAAAGGGCCGTATTTGCCAGAGAATTGGGAGTTCCTATCGTAATGCATGACTACTTAACAGGTGGGTTCACTGCAAATACTAGCTTGGCTCATTATTGCCGAGATAATGGTCTACTTCTTCACATCCACCGCGCAATGCACGCAGTTATTGATAGACAGAAGAATCATGGTATGCACTTTCGTGTACTAGCTAAAGCTTTACGTCTGTCTGGTGGAGATCATATTCACGCGGGTACAGTAGTAGGTAAACTTGAAGGAGAAAGGGACATTACTTTGGGCTTTGTTGATTTACTACGTGATGATTTTATTGAAAAAGATCGAAGCCGCGGTATTTATTTCACTCAAGATTGGGTTTCTATACCAGGTGTTCTGCCCGTAGCTTCGGGGGGTATTCACGTTTGGCATATGCCCGCTTTGACCGAGATCTTTGGAGATGATTCCGTACTACAATTCGGTGGAGGAACCTTAGGACACCCTTGGGGAAATGCACCGGGTGCCGTAGCTAATCGAGTAGCTTTAGAAGCATGTGTACAAGCTCGTAATGAGGGACGTGACCTTGCCCGCGAGGGTAATGAAGTTATCCGCGAGGCTAGCAAATGGAGTCCTGAACTAGCTGCTGCTTGTGAAGTATGGAAGGAGATCAAATTTGAATTCCAAGCAGTGGATACTTTGTAA Oenothera TAAAGCAAGTGTTGGATTCAAAGCCGGCGTTAAAGATTATAAATTGACTTATTATACTCCTGAATACGAAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCATTCAGAGTAACTCCTCAACCTGGAGTTCCGCCTGAGGAAGCAGGGGCTGCAGTAGCTGCCGAATCTTCTACTGGTACCTGGACAACTGTGTGGACCGATGGGCTTACCAGCCTTGATCGTTATAAAGGAAGATGCTACCACATCGAGCCTGTTGCGGGAGAAGAGAATCAATATATATGTTATGTAGCTTACCCCTTAGACCTTTTTGAAGAGGGTTCTGTTACTAATATGTTTACTTCCATTGTGGGTAATGTATTTGGGTTCAAAGCCCTGCGTGCTCTACGTCTGGAGGATCTGAGAATCCCTACTGCATATGTTAAAACTTTCCAAGGCCCGCCTCACGGCATCCAAGTTGAGAGAGATAAGTTGAACAAGTATGGCCGTCCCCTATTGGGATGTACCATTAAACCGAAATTAGGGTTATCCGCTAAGAACTACGGTAGAGCTGTTTATGAATGTCTTCGTGGTGGACTTGATTTTACCAAGGATGATGAAAACGTAAACTCACAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTTTGTGCCGAAGCAATTTATAAAACACAGGCTGAAACTGGTGAAATCAAAGGGCATTACTTGAATGCTACTGCGGGTACATGCGAAGAAATGATGAAAAGGGCTATATTTGCCAGAGAATTGGGAGTTCCCATCGTAATGCATGACTACTTAACAGGGGGATTCACTGCAAATACTAGCTTGGCTCATTATTGCCGAGATAACGGTCTACTTCTTCACATCCACCGTGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAAAATCATGGTATACACTTTCGTGTACTAGCTAAAGCCTTACGTATGTCTGGTGGAGATCATATTCACTCAGGTACCGTAGTAGGTAAACTTGAAGGAGAAAGAGATATTACTTTAGGCTTTGTTGATTTACTACGTGATGATTTTATTGAAAAAGACCGAAGCCGCGGTATTTATTTCACTCAAGATTGGGTCTCTCTACCTGGTGTTTTGCCTGTGGCTTCAGGGGGTATTCACGTGTGGCATATGCCTGCTCTGACCGAAATCTTTGGAGATGATTCCGTACTACAATTCGGTGGTGGAACTTTAGGACACCCTTGGGGAAATGCACCGGGTGCTGTAGCGAATCGAGTAGCTCTAGAAGCATGCGTACAAGCCCGTAATGAGGGGCGTGTACTTGCTCGTGAGGGTAATGAAATTATACGGGAGGCTTGCAAATGGAGTCCGGAACTAGCTGCTGCTTGTGAAGTATGGAAAGAGATCAGATTTGAATTC????????????????????? Orontium 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Osyris 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Paeonia 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Passiflora 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Pelargonium 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Persea 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Petunia 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Piper 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Tamarix 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Tillandsia 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Trimenia 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Trochodendron 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Tropaeolum 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Viburnum 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Vitis 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; END; [ The following blocks are output data for analysis step 1533 ] BEGIN TREES; TITLE Tb6309; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep1533; TREE strict.consensus = [&R] (Amborella,Brasenia,(((Illicium,Trimenia),Austrobaileya),(((((Chloranthus,((Asimina,Myristica),Drimys)),(Calycanthus,Persea)),(Piper,Asarum)),((((((Caltha,Xanthorhiza),Podophyllum),Akebia),Euptelea),Sanguinaria,Dicentra),((((((Petunia,((Acanthus,Jasminum),Asclepias)),((((Clethra,Ardisia),Camellia),Diospyros),Impatiens)),Cornus,(Viburnum,Helwingia)),((((((((((Achillea,Pisum),Cucumis),Elaeocarpus),(((Carya,Juglans),Betula),(Barbeya,(Humulus,Zelkova)))),(((Byrsonima,Drypetes,Passiflora,Balanops),((Dovyalis,Flacourtia),Salix)),(Oxalis,Dillenia),(Euonymus,Afrostyrax))),(Oenothera,Baeckea)),(((((Capparis,Brassica),Carica),(Bretschneidera,Tropaeolum)),Tapiscia),(((Acer,Bursera),Ailanthus),((((Muntingia,Cistus),Thymelaea),((Gossypium,Tilia),(Heliocarpus,Oceanopapaver))),Bixa)))),(Crossosoma,Pelargonium)),Vitis),(Itea,(Sedum,Paeonia)))),((Dianthus,((Plumbago,Tamarix),Nepenthes)),Osyris)),((Platanus,Trochodendron),Buxus),Nelumbo))),((Tillandsia,Nypa),Orontium)))); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr789] END;