#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on September 17, 2025; 17:41 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Le D.P., Smith M.K., & Aitken E. 2015. Pythiogeton ramosum, a new pathogen of soft rot disease of ginger (Zingiber officinale) at high temperatures in Australia. European Journal of Plant Pathology, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S16932] [ The following blocks are input data for analysis step 15410 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep15410; DIMENSIONS NTAX=14; TAXLABELS Pythiogeton_cinnamomi_HQ708267.1 Pythiogeton_ramosum_UQ6020 Pythiogeton_ramosum_UQ6053 Pythiogeton_ramosum_UQ6207 Pythiogeton_ramosum_UQ6208 Pythiogeton_ramosum_UQ6209 Pythiogeton_ramosum_UQ6210 Pythiogeton_ramosum_UQ6211 Pythiogeton_ramosum_UQ6212 Pythiogeton_ramosum_UQ6213 Pythiogeton_ramosum_UQ6214 Pythiogeton_zeae_HQ708452.1 Pythium_irregulare_GU071876.1 Pythium_myriotylum_HQ708745.1 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M25653] TITLE 'Pythiogeton ramosum COI matrix 8-1-15'; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep15410; DIMENSIONS NCHAR=743; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Pythiogeton_cinnamomi_HQ708267.1 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((((Pythiogeton_ramosum_UQ6053:0.0,Pythiogeton_ramosum_UQ6020:0.0):0.002878,(((((((Pythiogeton_ramosum_UQ6207:0.0,Pythiogeton_ramosum_UQ6214:0.0):0.0,Pythiogeton_ramosum_UQ6208:0.0):0.0,Pythiogeton_ramosum_UQ6209:0.0):0.0,Pythiogeton_ramosum_UQ6210:0.0):0.0,Pythiogeton_ramosum_UQ6211:0.0):0.0,Pythiogeton_ramosum_UQ6212:0.0):0.0,Pythiogeton_ramosum_UQ6213:0.0):0.002878):0.055611,Pythiogeton_zeae_HQ708452.1:0.058489):0.017421,((Pythium_irregulare_GU071876.1:0.048903,Pythium_myriotylum_HQ708745.1:0.048903):0.012172,Pythiogeton_cinnamomi_HQ708267.1:0.061075):0.017421); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr80856] END;