#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on September 20, 2025; 13:47 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Starr J., Harris S., & Simpson D. 2003. Potential of the 5' and 3' ends of the intergenic spacer (IGS) of rDNA in the Cyperaceae: new sequences for lower-level phylogenies in sedges with an example from Uncinia Pers. International Journal of Plant Sciences, 164(2): 213–227. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S926] [ The following blocks are input data for analysis step 1550 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep1550; DIMENSIONS NTAX=19; TAXLABELS Carex_vallis_pulchrae Uncinia_banksii_1 Uncinia_banksii_2 Uncinia_clavata Uncinia_ecuadorensis Uncinia_ferruginea Uncinia_flaccida Uncinia_hamata Uncinia_lacustris Uncinia_laxiflora Uncinia_leptostachya Uncinia_multifaria Uncinia_phleoides Uncinia_rubra Uncinia_rupestris Uncinia_scabra Uncinia_subsacculata Uncinia_tenuis_1 Uncinia_tenuis_2 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M417] TITLE 'ITS_ETS1f_5''IGSf rDNA'; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep1550; DIMENSIONS NCHAR=1639; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Uncinia_lacustris 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Uncinia_tenuis_2 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; END; BEGIN SETS; CHARSET 5IGSf (CHARACTERS = 'ITS_ETS1f_5''IGSf rDNA') = 1206-1639; CHARSET ETS1f (CHARACTERS = 'ITS_ETS1f_5''IGSf rDNA') = 612-1205; CHARSET 5.8S (CHARACTERS = 'ITS_ETS1f_5''IGSf rDNA') = 224-389; CHARSET ITS (CHARACTERS = 'ITS_ETS1f_5''IGSf rDNA') = 1-611; END; [ The following blocks are output data for analysis step 1550 ] BEGIN TREES; TITLE Tb6326; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep1550; TREE Fig._5._ETS_1f_phylogeny = [&R] (Carex_vallis_pulchrae,((((Uncinia_laxiflora,Uncinia_scabra,Uncinia_rubra,Uncinia_leptostachya,Uncinia_banksii_1,Uncinia_banksii_2,Uncinia_rupestris),Uncinia_flaccida),(Uncinia_clavata,Uncinia_ferruginea)),(Uncinia_subsacculata,(Uncinia_tenuis_1,Uncinia_tenuis_2))),(Uncinia_ecuadorensis,(Uncinia_hamata,(Uncinia_multifaria,(Uncinia_phleoides,Uncinia_lacustris))))); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr806] END;