#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on May 07, 2024; 22:31 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Chen K., Miadlikowska J.M., Molnar K., Arnold A.E., U'ren J.M., Gaya E., Gueidan C., & Lutzoni F. 2015. Phylogenetic analyses of eurotiomycetous endophytes reveal their close affinities to Chaetothyriales, Eurotiales, and a new order - Phaeomoniellales. Molecular Phylogentics and Evolution, 85: 117-130. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S17149] [ The following blocks are input data for analysis step 15595 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep15595; DIMENSIONS NTAX=157; TAXLABELS Anthracothecium_australiense Arachniotus_littoralis Arachnomyces_glareosus Arachnomyces_minimus Arthroderma_ciferrii Arthroderma_curreyi Ascosphaera_apis Ascosphaera_colubrina Ascosphaera_larvis Aspergillus_fumigatus Aspergillus_nidulans Aspergillus_sp._AK0184 Aspergillus_sp._AK1472 Aspergillus_sp._DC474 Aspergillus_sp._DC485 Aspergillus_sp._NC1598 Bagliettoa_baldensis Byssochlamys_nivea Caliciopsis_orientalis Caliciopsis_pinea Capnodium_coffeae Capronia__munkii Capronia_fungicola Capronia_munkii Capronia_parasitica Capronia_pilosella Capronia_sp_WUC_236 Capronia_sp_WUC_26 Capronia_sp_WUC_315 Capronia_sp_WUC15_551 Capronia_sp._AK1130 Ceramothyrium_carniolicum Chaenotheca_furfuracea Chaenotheca_trichialis Chaenothecopsi_savonica Chaetosartorya_stromatoides Chaetothyriales_sp_Rock_H5 Chaetothyriales_sp_Rock_TRN1 Chaetothyriales_sp_Rock_TRN107 Chaetothyriales_sp_Rock_TRN4 Chaetothyriales_sp_Rock_TRN475 Chaetothyriales_sp_TRN488 Chaetothyriales_sp._Rock_TRN210 Chaetothyriales_sp._Rock_TRN508 Chaetothyriales_sp._Rock_TRN515 Chaetothyriales_sp1 Chaetothyriales_sp2 Chaetothyriomycetidae_sp_Rock_TRN242 Chromocleista_malachitea Cladophialophora_boppii Cladophialophora_carrionii Cladophialophora_minourae Cladophialophora_modesta Cladophialophora_sp._AK0094 Cladophialophora_sp._Rock_TRN247 Cladophialophora_sp._Rock_TRN486 Cladophialophora_sp._Rock_TRN531 Coccidioides_immitis Coccomyces_dentatus Cochliobolus_heterostrophus Coniosporium_perforans Corynelia_uberata Ctenomyces_serratus Cyphellophora_europaea Cyphellophora_laciniata Cyphellophora_sp._Rock_TRN214 Cyphellophora_sp._Rock_TRN436 Dactylospora_haliotrepha Dactylospora_imperfecta Dactylospora_mangrovei Dermatocarpon_miniatum Dolabra_nepheliae Dothidea_sambuci Eremascus_albus Eurotiomycetes_sp._FQ10867A Exophiala_bergeri Exophiala_castellanii Exophiala_dermatitidis Exophiala_jeanselmei Exophiala_lecanii_corni Exophiala_nigra Exophiala_oligosperma Exophiala_pisciphila Exophiala_salmonis Exophiala_sp._422 Exophiala_sp._Rock_TRN30 Exophiala_sp._rock_TRN14 Exophiala_sp._rock_TRN493 Exophiala_xenobiotica Fonsecaea_monophora Geoglossum_nigritum Granulopyrenis_seawardii Gymnoascus_reessii Hamigera_avellanea Histoplasma_capsulatum Lachnum_virgineum Leiothecium_ellipsoideum Leucothecium_emdenii Lindra_thalassiae Lulworthia_grandispora Monascus_purpureus Monilinia_fructicola Mycoblastus_sanguinarius Mycocalicium_polyporaeum Onygena_corvina Paracoccidioides_brasiliensis Peltula_umbilicata Penicillium_freii Penicillium_javanicum Penicillium_limosum Penicillium_sp._1211 Penicillium_sp._DC376 Penicillium_sp._DC509 Penicillium_sp._DC568 Penicillium_sp._NC0339 Phaeococcomyces_catenatus Phaeomoniella_chlamydospora Phaeomoniella_dura Phaeomoniella_effusa Phaeomoniella_prunicola Phaeomoniella_sp._4466 Phaeomoniella_sp._AZ0963 Phaeomoniella_sp._AZ1057 Phaeomoniella_sp._FL0086 Phaeomoniella_sp._FL0854 Phaeomoniella_sp._FL1432 Phaeomoniella_tardicola Phaeomoniella_zymoides Placidium_lacinulatum Pleopsidium_chlorophanum Pseudotulostoma_japonica Pyrenula_aspistea Pyrenula_sp Pyrgillus_javanicus Rhinocladiella_anceps Roccella_fuciformis Rock_TRN115 Rock_TRN497 Rock_TRN506 Sclerococcum_parmeliae Sclerococcum_sphaerale Sclerophora_farinacea Shanorella_spirotricha Simonyella_variegata Sordaria_fimicola Sphinctrina_turbinata Spiromastix_warcupii Staurothele_areolata Stenocybe_pullatula Thermoascus_crustaeus Trichocoma_paradoxa Trichoglossum_hirsutum Umbilicaria_mammulata Wahlenbergiella_striatula Xeromyces_bisporus Xylaria_hypoxylon Xylona_heveae ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M30639] TITLE Eurotiomycetous_Endophytes__nrLSU_nrSSU_mitSSU_RPB1_RPB2_MCM7_5.8s; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep15595; DIMENSIONS NCHAR=8683; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 2010 2020 2030 2040 2050 2060 2070 2080 2090 2100 2110 2120 2130 2140 2150 2160 2170 2180 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Anthracothecium_australiense TAAGCGGAGGAAAAGAAACCAACAGGGATTGCCTCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCAAATTTGAAATCTGGCGTCCGAGTTGTAATTTGTAGAGGATGCTTCGGGCAAGACTGCGGTCAAATCTCTTGGAACAGGGTATCAAAGAGGGTGAGAGTCCCGTCCCATGTGAAGCTCCTTCGACGAGTCGGGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAAATGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATACCGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGAAAAGAGAGTTAAACAGCATGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAACCAGACTTGCAGGCCAGCATCGGTTTCGGTAGCCAGTTAAAGGCTTGGTGAATGTATCTACGAAGACTTATAGCCCCAGGTGACATCTGGCTTATCGAGACCGAGGTACGCGCACGGATGCTGGCGTAATGGTTGTAAGCGGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTATGCGAGTGTTTGGGCGTAAACCCGCGCGTAATGAAAGTGAACGGAGGTAGGAGCCGGCGCACTATCGACCGATCCTGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTAAGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGTATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACCATCTGGTAGCTGGTTCCTGCCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGTAACGCAGTTTTATGAGGTAAAGC-AATGATTAGCGGCCTTGGGGAATTCCTTAACCGATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAAGTCCTTGTTACTTAGTTGAACGTGGACATTTGAATGACGTTACTAGTGGGCCATTTTTGGTAAGCAGAACTGGCGATGCGGGATGAACCGAACGCGAGGTTAAGGTGCCGGAATGTACGCTCATCAGACCCCACAAAAGGTGTTAGTTCATCTTGACAGCCGGACGGTGGCCATGGAAGTCGGAATCCGCTTAGGAGTGTGTAACAACTCACCGGCCGAATGAACTAGCCCTGAAAATGGATGGCGCTCAAGCGTGCTACCCATACCTCGCCGTTAAAGTTGAAATGATGCTTTAACGAGTAGGCAGGCGTGGAGG????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGGCCTAAAGGCTGAACCAGTAACTTGAAAGAAGTTCTAGACATGACTAAGTATTGACCAATTACGTGCCAGCCGTCGCGGTAATACGTAAAATACAAGTGTTATTCATCTTTAATGGGTTTAAAGGGTACCTAGACAGAAAATCACTAATTTTCTAGAGTTTATTGTTGATGAAATTCATTAATACACTGGTAACGGCGAAGGCATTTTTCTATGTAAAAA?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????---------------------------CGTTTCGAGAAAATATGGCAGTTGAGCAGAAAGCAGAGAGTATGCGAAGCGGACGTGAGCGAGCACGGTGGTTGCGGGAATGCGCAGCCTGATATTCGTATGAGCGGTCTCAATCTTATGACATCGTGGAAACCGACAAAAGATGAGGATCAGGCTGAGACGAGACCACTATCGCCGCAGACCGCTCTGAATATTCTTCGGCTTATGAGTGACGAAGAAATGGAGGATCTTGGCCTTGATGTTAGGAACGCCCGACCAGAATACATGATATTGAGCTGTCTCTTGGTTCCTCCGCCACCCGTGCGACCTAGCATCTCCATGGACGGCAGCGGTCAGGGTACAAGAAGTGAAGATGATCTCACATTCAAGCTCGGAGACATCATTCGCGCCAATCAGAACGTTCGAAGAGTGCAGCAAGAGGGTTCGCCGGAACACATCTTGAATGAGCATGTCCAACTTCTTCAGTGGCACGTTGCGACGTACATGAACAATGACATCGCTGGAATGGACAAAGCACAACATAAGACGGGCCGCCCAATTAAATCTATCCGCGCCAGACTCAAAGGCAAAGATGGTCGTCTTCGACAAAATCTCATGGGAAAGCGGGTAGATTTCTCCGCGCGTACTGTCATTACAGGGGATCCTAATCTTTCTCTGGACGAGGTCGGTGTTCCAAGGAGTATTGCCCGAACTCTCACCTATCCAGAAGTTGTCACTCCTTTCAATGTGGATAAATTGAAGAGGCTCGTTGCCAACGGTCCAACTGAACACCCAGGGGCTCGGTTTGTCGTTCGAGACGATGGCACTCGGATCGATTTGCGTCATCACAAACTT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????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Arachniotus_littoralis 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Arachnomyces_glareosus 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Arachnomyces_minimus 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Arthroderma_ciferrii 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Arthroderma_curreyi 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Ascosphaera_apis 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Aspergillus_fumigatus 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Aspergillus_nidulans 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Aspergillus_sp._AK0184 TAAGCGGAGGAAAAGAAACCAACCGGGATTGCCTCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAAGAGCTCAAATTTGAAATCTGGCGTCCGAGTTGTAATTTGCAGAGGATGCTTCGGGTGCGGCCCCTGTCAAGTGCCCTGGAACGGGCCGTCAGAGAGGGTGAGAATCCCGTCCCGTGTGAAGCTCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATACCGGCCGGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGAAAAGAGAGTTAAACAGCACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCGACCAGACTCGCGGGCCAGCGTCGGTTTGGGCGGCCGGTCAAAGGCCCCAGGAATGTGTCGCCGGCGTCTTATAGCCTGGGGTGCAATGCGGCCAGCCCGGACCGAGGAACGCGCACGGACGCTGGCGTAATGGTCGCAAACGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTACGCGAGTGTTCGGGTGTAAACCCACGCGCAGTGAAAGCGAACGGAGGTGGGAGCCGGCGCACCATCGACCGATCCTGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTAAGAGCGTAGCTGTGGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGCGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGTATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACCATCTGGTAGCTGGTTCCTGCCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGTAACGCAGTTTTATGAGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCATTGGGGTTAACCTTAACCTATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAAGCCCTTGTTTCTTAGTTGAACGTGGGCATTAGAATGACGTTACTAGTGGGCCATTTTTGGTAAGCAGAACTGGCGATGCGGGATGAACCGAACGCGAGGTTAAGGTGCCGGAATGCACGCTCATCAGACACCACAAAAGGTGTTAGTTCATCTAGACAGCCCGACGGTGGCCATGGAAGTCGGAATCCGCTAAGGAGTGTGTAACAACTCACGGGCCGAATGAACTAGCCCTGAAAATGGATGGCGCTCAAGCGTGCTACCCATACCTC-----------------------------------------------TGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAACCCCGACTGGGAGGGGTGTATTTATTAGATAAAAAACCAATGCCGGGCTCCTTGGTGATTCATAATAACTTAACGAATCGCATGGCCTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTGGCAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACGGGGCTCTTTTGGGTCTCGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAACCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGTCTGGCTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGAGTACTGGTCCGGCTGGACCTTTCCTTCTGGGGAAGCCCATGGCCTTGGGGAACCAGGACTTTTACTGTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCCTTTGCTCGGATACATTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGATAGTCGGGGGCGTCAGTATTCAGCTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTGCTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTCGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAGGGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGGCTGACCCGCTCGGCACCTTACGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGAAATTGACGGAAGGGCACGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACAAAATAAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATCTTTTGGATGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGCTTAATTGCGATAACGAACGAGACCTCGGCCC-TTAAATAGCCCGGTCCGCGTCTGCGGGCCGCTGGCTTCTTAGGGGGACTATCGGCTAAGCCGATGGAAGTGCGCGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGACAGGGCCAGCGAGCCTTGGCCGAGAGGCCTGGGTAATCTTGTTAAACCCTGTCGTGCTGGGGATAGAGCATTGCAATTATTGCTCTTCAACGAGGAATGCCTAGTAGGCACGAGTCATCAGCTCGTGCCGATTACGTCCCGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGGCTCGGTGAGGCCTCCGGACTGGCGCAGGAGGGTTGGCAACGACCCCCCCGCGCCGGAAAGCTGGTCAAACCCGGTCTGGCCGAAAGGCTGAACCAGTAACTTGGAAGAAATTCTAAATATGACTAAGTCTTGACCAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAAGAGACTAGTGTTAGTCATCTTTATTAGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTAAATTACTTTTTTACTAGAGTTTATTTCTGATAGAATATTATGATACACAGGTAACGGCGAAGGCAACCTTCCATGTAAAAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTAGGGTAGCGAAAAGGATTAGATACCCTTGTAGTCCAAGCAGACAATGATGAATGCCATAGACTTTCATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCAAGAGTAATATGGCAACATATAAACTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTCGATGATCCGCGAAAAACCTTACCACAGTTTGAATAACAAGCGCTGCACGGCTGTCTTTAGTTTATGTCGTGAGAGGTTACCTTAAATAAACGAAAACCCTCATTATTATTAAGACAAGTCATCATGGCCTAACTTTCAACAATGGATCTCTTGGTTCCGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAACTGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTC-AGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCACATTGCGCCCCCTGGCATTCCGGGGGGCATGCCTGTCCGAGCGTCATTG??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????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Aspergillus_sp._AK1472 TAAGCGGAGGAAAAGAAACCAACAGGGATTGCCTCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAAGAGCTCAAATTTGAAAGCTGGCGTCCGCGTTGTAATTTGCAGAGGATGCTTCGGGTGCAGCCCCCGTCAAGTGCCCTGGAACGGGCCGTCATAGAGGGTGAGAATCCCGTTCCGTGTGAAGCTCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATACTGGCCGGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGAAAAGAGAGTTAAACAGCACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGTTTGCGACCAGACTCGCGGGCCAGCGTCGGTTTGGGCGGCCGGTCAAAGGCCCTCGGAATGTATCACCGGTGTCTTATAGCCGAGGGTGCAATGCGGCCTGCCCGGACCGAGGAACGCGCTCGGACGCTGGCGTAATGGTCGTAAATGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTACGCGAGTGTTCGGGTGTAAACCCACGCGCAGTGAAAGCGAACGGAGGTGGGAGCCGGCGCACCATCGACCGATCCTGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTACGAGCGTAGCTGTGGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGCGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGTATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACCATCTAGTAGCTGGTTCCTGCCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGTAACGCAGTTTTATGAGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCCTTGGGGTTAACCTTAACCTATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAAGCGCTTGTTGCTTAGTTGAACGTGCGCATTAGAATGACGTTACTAGTGGGCCATTTTTGGTAAGCAGAACTGGCGATGCGGGATGAACCGAACGCGAGGTTAAGGTGCCGGAATGCACGCTCATCAGACACCACAAAAGGTGTTAGTTCATCTAGACAGCCCGACGGTGGCCATGGAAGTCGGAATCCGCTAAGGAGTGTGTAACAACTCACGGGCCGAATGAACTAGCCCTGAAAATGGATGGCGCTCAAGCGTGCTACCCATACCTCGCCGTCGGGGTAGAAACGATGCCCCGACGAGTAGGCAGGCGTGGGGG????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGGCCGAAAGGCTGAACCAGTAACTTGGAAGAAATTCTAAATATGACTAAGTCTTGACCAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTAGTCATCTTTATTAGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTAAATTACTTTTTTACTAGAGTTTATTTCTGATGAAATACTTTGATACACTGGTAACGGCGAAGGCATCCTTCTATGTAAAAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTGGGTAGCAATAAGGATTAGATACCCTAGTAGTCCAAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGGCTTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCAAGAGTAATATGGCAACATATAAACTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTATTTAATTCGATGATCCGCGAAAAACCTTACCACAGTTTGAATAACAAGCGCTGCACGGCTGTCTTTAGTTAATGTCGTGAGAGGTTACCTCTAATTAACGAAAACCCTCATTATTATTAAGACAAGTCATCATGGCCTAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTC-AGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCACATTGCGCCCCCTGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTCCGAGCGTCATTG??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????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Aspergillus_sp._DC474 TAAGCGGAGGAAAAGAAACCAACCGGGATTGCCTCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAAGAGCTCAAATTTGAAAGCTGGCGTCCGCGTTGTAATTTGCAGAGGATGCTTCGGGTGCGGCCCCTGTCAAGTGCCCTGGAACGGGCCGTCAGAGAGGGTGAGAATCCCGTCCCGTGTGAAGCTCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATACCGGCCGGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGAAAAGAGAGTTAAACAGCACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCGACCAGACTCGCGGGCCAGCGTCGGTTTGGGCGGCCGGTCAAAGGCCCCAGGAATGTATCGCCGTTGTCTTATAGCCTGGGGTGCAATGCGGCCAGCCCGGACCGAGGAACGCGCACGGACGCTGGCGTAATGGTCGCAAACGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTACGCGAGTGTTCGGGTGTAAACCCACGCGCAGTGAAAGCGAACGGAGGTGGGAGCCGGCGCACCATCGACCGATCCTGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTAAGAGCGTAGCTGTGGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGCGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGTATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACCATCTGGTAGCTGGTTCCTGCCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGTAACGCAGTTTTATGAGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCATTGGGGTTAACCTTAACCTATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAAGCCCTTGTTGCTTAGTTGAACGTGGGCATTAGAATGACGTTACTAGTGGGCCATTTTTGGTAAGCAGAACTGGCGATGCGGGATGAACCGAACGCGAGGTTAAGGTGCCGGAATACACGCTCATCAGACACCACAAAAGGTGTTAGTTCATCTAGACAGCCCGACGGTGGCCATGGAAGTCGGAATCCGCTAAGGAGTGTGTAACAACTCACGGGCCGAATGAACTAGCCCTGAAAATGGATGGCGCTCAAGCGTGTTACCCATACCTCGCCGTCGGGGTAGAAACGATGCCCCGACGAGTAGGCAGGCGTGGGGGTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAACCCCGACTGGGAGGGGTGTATTTATTAGATAAAAAACCAATGCCGGGCTCCTTGGTGATTCATAATAACTTAACGAATCGCATGGCCTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTGGCAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACGGGGCTCTTTTGGGTCTCGTAATTGGAATGAGAACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGTCTGGCTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGAGTACTGGTCCGGCTGGACCTTTCCTTCTGGGGAACCCCATGGCCTTGGGGAACCAGGACTTTTACTGTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCCTTTGCTCGGATACATTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGATAGTCGGGGGCGTCAGTATTCAGCTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTGCTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTCGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGGCTGACCCGCTCGGCACCTTACGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGAAATTGACGGAAGGGCACGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACAAAATAAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATCTTTTGGATGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGCTTAATTGCGATAACGAACGAGACCTCGGCCC-TTAAATAGCCCGGTCCGCGTCCGCGGGCCGCTGGCTTCTTAGGGGGACTATCGGCTAAGCCGATGGAAGTGCGCGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGACAGGGCCAGCGAGCCTTGGCCGAGAGGCCCGGGTAATCTTGTTAAACCCTGTCGTGCTGGGGATAGAGCATTGCAATTATTGCTCTTCAACGAGGAATGCCTAGTAGGCACGAGTCATCAGCTCGTGCCGATTACGTCCCGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGGCTCGGTGAGGCCTCCGGACTGGCTCAGGAGGGTTGGCAACGACCCCCCCGAGCCGGAAAGCTGGTCAAACCCGGTCTGGCCGAAAGGCTGAACCAGTAACTTGGAAGAAATTCTAAATATGACTAAGTCTTGACCAACTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTAATCATCTTTATTAGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTAAATTACTTATTTACTAGAGTTTATTTCTGATATAATACGTATATACACTGGTAACGGCGAAGGCATCCTTCTATGTAAAAACTGAC??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AACTTTCAACAATGGATCTCTTGGTTCCGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAACTGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTC-AGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCACATTGCGCCCCCTGGCATTCCGGGGGGCATGCCTGTCCGAGCGTCATTG??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????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Aspergillus_sp._DC485 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Capronia__munkii 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Capronia_fungicola 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Chaetothyriales_sp._Rock_TRN508 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Chromocleista_malachitea 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Cladophialophora_carrionii 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Cladophialophora_sp._Rock_TRN486 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Coccomyces_dentatus 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Cochliobolus_heterostrophus 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Dermatocarpon_miniatum 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Dolabra_nepheliae 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Dothidea_sambuci 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Eremascus_albus 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Exophiala_bergeri 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Exophiala_jeanselmei 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Exophiala_oligosperma 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Exophiala_pisciphila 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Exophiala_sp._rock_TRN493 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Exophiala_xenobiotica 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Fonsecaea_monophora 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Geoglossum_nigritum 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Hamigera_avellanea 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Lachnum_virgineum 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Leucothecium_emdenii 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Monascus_purpureus 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Mycoblastus_sanguinarius 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Peltula_umbilicata 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Penicillium_freii 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Penicillium_javanicum 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Penicillium_sp._1211 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Penicillium_sp._DC568 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Phaeomoniella_chlamydospora 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Phaeomoniella_sp._FL1432 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Pleopsidium_chlorophanum 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Rhinocladiella_anceps 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Roccella_fuciformis 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Rock_TRN497 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Sclerophora_farinacea 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Shanorella_spirotricha 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Trichocoma_paradoxa 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Umbilicaria_mammulata 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Xeromyces_bisporus 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; END; [ The following blocks are output data for analysis step 15595 ] BEGIN TREES; TITLE Eurotiomycetous_Endophytes; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep15595; TREE Fig._3 = [&R] (((Coccomyces_dentatus,(Lachnum_virgineum,Monilinia_fructicola)93.1)48.7,(Xylaria_hypoxylon,(Sordaria_fimicola,(Lindra_thalassiae,Lulworthia_grandispora)100)58.5)100)98.6,((Peltula_umbilicata,(Geoglossum_nigritum,Trichoglossum_hirsutum)100)58.3,((Sclerophora_farinacea,(Chaenotheca_furfuracea,Chaenotheca_trichialis)52.1)100,((Pleopsidium_chlorophanum,(Mycoblastus_sanguinarius,Umbilicaria_mammulata)98.8)71.4,(Xylona_heveae,(((Roccella_fuciformis,Simonyella_variegata)100,(Cochliobolus_heterostrophus,(Capnodium_coffeae,Dothidea_sambuci)99.7)99.8)99,((Sphinctrina_turbinata,(Stenocybe_pullatula,(Chaenothecopsi_savonica,Mycocalicium_polyporaeum)92.5)92)99.9,((Sclerococcum_sphaerale,(Dactylospora_haliotrepha,Dactylospora_mangrovei)91.7)99.8,(((Corynelia_uberata,(Caliciopsis_orientalis,Caliciopsis_pinea)99.3)100,(((Arachnomyces_glareosus,Arachnomyces_minimus)100,((Spiromastix_warcupii,((Histoplasma_capsulatum,Paracoccidioides_brasiliensis)100,(Eremascus_albus,(Ascosphaera_apis,(Ascosphaera_colubrina,Ascosphaera_larvis)100)100)96.4)55.4)41.6,(Coccidioides_immitis,((Arachniotus_littoralis,Gymnoascus_reessii)100,((Leucothecium_emdenii,Shanorella_spirotricha)56.4,(Ctenomyces_serratus,(Onygena_corvina,(Arthroderma_ciferrii,Arthroderma_curreyi)93.4)74.5)66.6)100)58.5)100)97.3)69.9,((Byssochlamys_nivea,(Pseudotulostoma_japonica,(Eurotiomycetes_sp._FQ10867A,Trichocoma_paradoxa)59.6)54.6)38.9,(Thermoascus_crustaeus,(((Xeromyces_bisporus,(Leiothecium_ellipsoideum,Monascus_purpureus)53.6)97,((Aspergillus_sp._NC1598,(Aspergillus_sp._AK1472,Aspergillus_fumigatus)100)24.2,(Aspergillus_sp._DC485,(Aspergillus_sp._AK0184,(Aspergillus_nidulans,Aspergillus_sp._DC474)100)98.1)59)48.9)24.8,(Chaetosartorya_stromatoides,((Hamigera_avellanea,Penicillium_sp._NC0339)48.8,((Penicillium_javanicum,Penicillium_limosum)100,((Penicillium_sp._1211,Chromocleista_malachitea)99.7,((Penicillium_sp._DC376,Penicillium_freii)99.9,(Penicillium_sp._DC509,Penicillium_sp._DC568)100)99.9)99)99.3)43.6)34.7)79.8)41.1)100)100)100,(((Pyrenula_aspistea,Pyrgillus_javanicus)100,(Granulopyrenis_seawardii,(Anthracothecium_australiense,Pyrenula_sp)100)84.4)100,((Phaeomoniella_tardicola,(Phaeomoniella_sp._4466,((Phaeomoniella_sp._FL0086,Phaeomoniella_effusa)100,(Phaeomoniella_chlamydospora,(Phaeomoniella_sp._FL1432,((Phaeomoniella_sp._AZ1057,Phaeomoniella_sp._FL0854)56.4,((Phaeomoniella_sp._AZ0963,Phaeomoniella_zymoides)100,(Dolabra_nepheliae,(Phaeomoniella_dura,Phaeomoniella_prunicola)88.7)74.5)59)18.1)34.1)56.6)51.7)60.8)100,((Wahlenbergiella_striatula,(Staurothele_areolata,(Bagliettoa_baldensis,(Dermatocarpon_miniatum,Placidium_lacinulatum)99.7)34.1)58.7)100,(Chaetothyriomycetidae_sp_Rock_TRN242,((Chaetothyriales_sp_TRN488,Chaetothyriales_sp_Rock_TRN475)100,(((Chaetothyriales_sp_Rock_TRN107,(Cyphellophora_sp._Rock_TRN214,(Cyphellophora_sp._Rock_TRN436,(Cyphellophora_europaea,Cyphellophora_laciniata)95.9)99.7)89.2)100,(Ceramothyrium_carniolicum,(Cladophialophora_modesta,((Chaetothyriales_sp2,(Phaeococcomyces_catenatus,Chaetothyriales_sp_Rock_TRN4)100)100,(Chaetothyriales_sp_Rock_TRN1,(Rock_TRN115,(Chaetothyriales_sp1,Coniosporium_perforans)100)100)100)100)97.7)83.2)38.3,((Chaetothyriales_sp._Rock_TRN508,(Chaetothyriales_sp._Rock_TRN210,Chaetothyriales_sp._Rock_TRN515)100)100,((Exophiala_sp._Rock_TRN30,((Exophiala_castellanii,Exophiala_lecanii_corni)100,(Exophiala_pisciphila,Exophiala_salmonis)100)99.7)95.7,(Capronia_parasitica,((Capronia_sp._AK1130,(Rhinocladiella_anceps,(Capronia_sp_WUC_26,(Capronia_sp_WUC_236,Capronia_sp_WUC_315)49.4)100)88.7)32.2,(((Cladophialophora_minourae,Fonsecaea_monophora)100,(Cladophialophora_sp._AK0094,((Capronia_pilosella,Sclerococcum_parmeliae)90.5,((Cladophialophora_boppii,Cladophialophora_carrionii)51.8,((Dactylospora_imperfecta,Cladophialophora_sp._Rock_TRN247)69.1,(Cladophialophora_sp._Rock_TRN486,Cladophialophora_sp._Rock_TRN531)99.5)70.3)74)54.9)85.5)100,((Capronia_fungicola,(Capronia_munkii,(Capronia__munkii,Exophiala_dermatitidis)61.2)99.5)40.3,(Capronia_sp_WUC15_551,((Exophiala_bergeri,(Exophiala_sp._rock_TRN14,Exophiala_sp._rock_TRN493)99.8)100,((Exophiala_nigra,(Exophiala_jeanselmei,(Exophiala_sp._422,Exophiala_oligosperma)78)100)100,(Chaetothyriales_sp_Rock_H5,(Rock_TRN506,(Exophiala_xenobiotica,Rock_TRN497)70.2)93.2)100)67.4)99.4)98.7)58.9)42.5)68.3)60.8)99.8)51.2)99.1)100)50.6)100)84)100)97.6)94.9)72.9)76.5)25.5)20.5)31.2)98.6)100; [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr86578] END;