#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on September 21, 2025; 4:45 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Rojas D., Warsi O., & Davalos L.M. 2016. Bats (Chiroptera: Noctilionoidea) challenge a recent origin of extant neotropical diversity. Systematic Biology, 65(3): 432-448. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S17602] [ The following blocks are input data for analysis step 16076 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep16076; DIMENSIONS NTAX=194; TAXLABELS Ametrida_centurio Anoura_caudifer Anoura_cultrata Anoura_geoffroyi Anoura_latidens Ardops_nichollsi Ariteus_flavescens Artibeus_amplus Artibeus_anderseni Artibeus_aztecus Artibeus_bogotensis Artibeus_cinereus Artibeus_concolor Artibeus_fimbriatus Artibeus_fraterculus Artibeus_glaucus Artibeus_gnomus Artibeus_hirsutus Artibeus_incomitatus Artibeus_inopinatus Artibeus_intermedius Artibeus_jamaicensis Artibeus_lituratus Artibeus_obscurus Artibeus_phaeotis Artibeus_planirostris Artibeus_schwartzi Artibeus_toltecus Artibeus_watsoni Brachyphylla_cavernarum Brachyphylla_nana_nana Brachyphylla_nana_pumila Carollia_benkeithi Carollia_brevicauda Carollia_castanea Carollia_perspicillata Carollia_sowelli Carollia_subrufa Centurio_senex Chiroderma_doriae Chiroderma_improvisum Chiroderma_salvini Chiroderma_trinitatum Chiroderma_villosum Choeroniscus_godmani Choeroniscus_minor Choeronycteris_mexicana Chrotopterus_auritus Desmodus_rotundus Diaemus_youngi Diphylla_ecaudata Ectophylla_alba Enchisthenes_hartii Erophylla_bombifrons Erophylla_sezekorni Furipterus_horrens Gardnerycteris_crenulatum Glossophaga_commissarisi Glossophaga_leachii Glossophaga_longirostris Glossophaga_morenoi Glossophaga_soricina Glyphonycteris_daviesi Glyphonycteris_sylvestris Hsunycteris_thomasi Hylonycteris_underwoodi Lampronycteris_brachyotis Leptonycteris_curasoae Leptonycteris_yerbabuenae Lichonycteris_obscura Lionycteris_spurrelli Lonchophylla_chocoana Lonchophylla_dekeyseri Lonchophylla_handleyi Lonchophylla_hesperia Lonchophylla_mordax Lonchophylla_robusta Lonchorhina_aurita Lonchorhina_inusitata Lonchorhina_orinocensis Lophostoma_brasiliense Lophostoma_carrikeri Lophostoma_evotis Lophostoma_schulzi Lophostoma_silvicolum_centralis Lophostoma_silvicolum_laephotis Macrophyllum_macrophyllum Macrotus_californicus Macrotus_waterhousii_mexicanus Macrotus_waterhousii_waterhousii Mesophylla_macconnelli Micronycteris_brosseti Micronycteris_giovanniae Micronycteris_hirsuta Micronycteris_homezi Micronycteris_matses Micronycteris_megalotis Micronycteris_microtis Micronycteris_minuta Micronycteris_schmidtorum Micronycteris_sp. Mimon_bennettii Mimon_cozumelae Monophyllus_plethodon Monophyllus_redmani Mormoops_blainvillei Mormoops_megalophylla Musonycteris_harrisoni Mystacina_tuberculata Myzopoda_aurita Noctilio_albiventris Noctilio_leporinus Phylloderma_stenops Phyllonycteris_aphylla Phyllonycteris_poeyi_obtusa Phyllonycteris_poeyi_poeyi Phyllops_falcatus Phyllostomus_discolor Phyllostomus_elongatus Phyllostomus_hastatus Phyllostomus_latifolius Platalina_genovensium Platyrrhinus_albericoi Platyrrhinus_aurarius Platyrrhinus_brachycephalus Platyrrhinus_dorsalis Platyrrhinus_helleri Platyrrhinus_incarum Platyrrhinus_infuscus Platyrrhinus_ismaeli Platyrrhinus_lineatus Platyrrhinus_masu Platyrrhinus_matapalensis Platyrrhinus_nigellus Platyrrhinus_recifinus Platyrrhinus_vittatus Pteronotus_davyi_davyi Pteronotus_davyi_fulvus Pteronotus_gymnonotus Pteronotus_macleayii Pteronotus_parnellii_parnellii Pteronotus_parnellii_portoricensis Pteronotus_parnellii_pusillus Pteronotus_parnellii_rubiginosus_1 Pteronotus_parnellii_rubiginosus_2 Pteronotus_parnellii_rubiginosus_3 Pteronotus_personatus_personatus Pteronotus_personatus_psilotis Pteronotus_quadridens Pygoderma_bilabiatum Rhinophylla_alethina Rhinophylla_fischerae Rhinophylla_pumilio Sphaeronycteris_toxophyllum Stenoderma_rufum Sturnira_angeli Sturnira_aratathomasi Sturnira_bakeri Sturnira_bidens Sturnira_bogotensis Sturnira_burtonlimi Sturnira_erythromos Sturnira_hondurensis Sturnira_koopmanhilli Sturnira_lilium Sturnira_ludovici Sturnira_luisi Sturnira_magna Sturnira_mordax Sturnira_nana Sturnira_oporaphilum Sturnira_parvidens Sturnira_paulsoni Sturnira_perla Sturnira_sp. Sturnira_tildae Thyroptera_discifera Thyroptera_lavali Thyroptera_tricolor Tonatia_bidens Tonatia_saurophila Trachops_cirrhosus Trinycteris_nicefori Uroderma_bilobatum Uroderma_magnirostrum Vampyressa_melissa Vampyressa_pusilla Vampyressa_thyone Vampyriscus_bidens Vampyriscus_brocki Vampyriscus_nymphaea Vampyrodes_caraccioli Vampyrodes_major Vampyrum_spectrum ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M31295] TITLE Noctilionoidea_Nuclear_and_mitochondrial_matrix; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep16076; DIMENSIONS NCHAR=9517; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 2010 2020 2030 2040 2050 2060 2070 2080 2090 2100 2110 2120 2130 2140 2150 2160 2170 2180 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Artibeus_amplus 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Artibeus_anderseni 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Artibeus_aztecus 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Artibeus_bogotensis 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Artibeus_cinereus 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Artibeus_glaucus 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Artibeus_gnomus 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Artibeus_hirsutus 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Artibeus_incomitatus 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Artibeus_inopinatus 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Artibeus_intermedius 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Artibeus_jamaicensis 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Artibeus_lituratus 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Artibeus_obscurus 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Artibeus_phaeotis 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Artibeus_planirostris 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Artibeus_schwartzi 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Artibeus_toltecus 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Carollia_castanea 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Carollia_perspicillata 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Carollia_sowelli 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Centurio_senex 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Chiroderma_salvini 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Chiroderma_trinitatum 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Chiroderma_villosum 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Choeroniscus_godmani 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Choeronycteris_mexicana 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Enchisthenes_hartii 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Furipterus_horrens 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Gardnerycteris_crenulatum 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Glossophaga_commissarisi 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Glossophaga_leachii 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Glossophaga_soricina 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Lampronycteris_brachyotis 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Leptonycteris_yerbabuenae 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Lichonycteris_obscura 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Lionycteris_spurrelli 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Lonchorhina_aurita 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Lonchorhina_inusitata 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Lonchorhina_orinocensis 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Lophostoma_carrikeri 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Lophostoma_silvicolum_centralis 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Macrophyllum_macrophyllum 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Macrotus_californicus 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Macrotus_waterhousii_mexicanus 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Macrotus_waterhousii_waterhousii 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Mesophylla_macconnelli 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Micronycteris_minuta 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Micronycteris_schmidtorum 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Mimon_cozumelae 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Monophyllus_redmani 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Mormoops_blainvillei 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Musonycteris_harrisoni 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Mystacina_tuberculata 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Noctilio_albiventris 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Noctilio_leporinus 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Phylloderma_stenops 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Platyrrhinus_aurarius 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Platyrrhinus_nigellus 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Pteronotus_davyi_davyi 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Pteronotus_gymnonotus 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Pteronotus_macleayii 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Pteronotus_parnellii_parnellii 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Pteronotus_parnellii_pusillus 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Pteronotus_parnellii_rubiginosus_1 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Pteronotus_parnellii_rubiginosus_3 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Pteronotus_personatus_personatus 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Pteronotus_personatus_psilotis 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Stenoderma_rufum 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Sturnira_bogotensis 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Sturnira_burtonlimi 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Sturnira_erythromos 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Sturnira_hondurensis 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Sturnira_koopmanhilli 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Sturnira_lilium 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Sturnira_perla 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Sturnira_sp. 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Sturnira_tildae 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Thyroptera_discifera 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Thyroptera_lavali 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Tonatia_saurophila 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Trachops_cirrhosus 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Trinycteris_nicefori 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Vampyressa_melissa 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Vampyressa_pusilla 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Vampyressa_thyone 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Vampyrodes_major 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Vampyrum_spectrum GTTGTTTATCAACCTCATCTTATCACAGGAGAGGAAATCAAGAAGCAGATTGAAGCTGCGGGCTTTCCAGCATTCATCAAAAAGCAGCCCAAGT---ACCCCAAGTTGGGAGCTATTGATATAGAACGTCTAAAAAACACACCAGTCAAATCCTCAGAAAGATCACAGCCAAGGAGTCTAGCATGTGCCGAAGATTATTCCACAGCCACTTTTGCCATAGATGGCATGCATTGTAAATCGTGCGTGTCAAATATTGAAAGTGCTTTATCTACACTCCAATATGTAAGCAGCATAGTAGTTTCTTTAGAGAACAGATCTGCTGTCGTCAAGTACAATGCAAACTTAGTCACTCCAGAAGCCCTGAGAAAAGCAATAGAGGCCATACCACCAGGACAATATAGAGCTAGTGTTACAAGTGGAATTGACAGTACCTCAAACT---CTCCTTCCGGCTCCTGTCTGCAGAAGATTCCCTTGAACGTAGTTAGCCAGCCCCTGACTCAAGAAACCATGATAAACATCGATGGCATGACTTGTAACTCTTGTGTGCAGTCTATTGAGGGGGTCATATCAAAAAAGGCAGGGGTAAAATCTATACTAGTATCCCTTGCAAACAGCAGTGGAACTGTAGAATACGATCCTCTACTAACCTCTCCAGAAACTTTGAGGAAAGCAATAGAAGACTGCATGAAGGCTGCCCCCATGAAAGAAGCAAACGTCCGCGGACAAGGCAGCTTGGCATACCCAGGTGTTCGAACCCATGGGACTCTGGAGAGCGTGAATGGGCCCAAGGCAGGTTCAAGAGGCCT---GACATCATTGGCTGACACTTTTGAACACGTGATAGAAGAGCTGCTGGATGAGGACCAGAAAGTCCGGCCCCATGAAGAAAACAATAAGGACGCGGACTTGTACACTTCCAGGGTGATGCTCAGTAGTCAAGTGCCTTTGGAGCCGCCTCTTCTCTTTCTGCTTGAGGAATACAAAAATTATCTGGATGCTGCAAACATGTCGATGAGGGTCCGGCGCCACTCCGACCCGGCCCGGCGCGGGGAGCTGAGTGTGTGTGACAGCATTAGCGAGTGGGTAACAGCGGCAGACAAAAAGACTGCAGTGGACATGTCGGGCGGGACGGTCACGGTCCTTGAAAAAGTCCCTGTATCGAAAGGCCAACTGAAGCAGTACTTCTACGAGACCAAGTGCAATCCCATGGGTTACAC-----------------------------------------------------CCTTCTTATTCGCGCTGAACTCGGTCAACCTGGCACCCTACTAGGCGATGACCAGATCTACAATGTCATCGTAACCGCCCACGCCTTCGTGATGATCTTCTTTATAGTGATGCCCATCATAATCGGGGGCTTTGGCAACTGACTGGTCCCTCTAATAATTGGAGCGCCGGATATAGCATTTCCCCGGATAAATAATATAAGCTTCTGACTACTGCCCCCATCATTCCTTTTACTACTCGCCTCCTCCACCGTTGAAGCCGGAGTCGGCACTGGTTGAACAGTCTACCCCCCATTAGCAGGCAACCTTGCCCACGCTGGAGCCTCAGTCGACTTAGCTATCTTCTCCCTACACCTAGCAGGGGTGTCCTCTATCCTGGGAGCAATTAACTTTATCACTACCATCATCAACATAAAACCCCCTGCTCTCTCCCAATACCAAACCCCCCTCTTCGTCTGATCCGTCTTGATTACAGCCGTCCTACTACTCCTCTCACTCCCCGTCCTAGCAGCAGGCATCACCATACTACTAACA------------------------------------------------------------------------ATGACCAACATCCGAAAAACCCACCCCCTCCTAAAAATCATTAACCACTCCTTCGTGGACCTCCCCGCCCCATCAAACTTATCATCTTGATGAAACTTCGGCTCCCTCCTGGGAATCTGCCTTACCGTCCAAATCCTAACAGGGCTATTCCTGGCCATGCACTACACATCAGACACAGCCACAGCATTCAACTCCGTGACCCACATCTGCCGAGACGTCCACTACGGCTG--AATTCTCCGGTACCTCCACGCCAACGGAGCGTCCATATTCTTCATCTGCCTCTACCTTCACATCG-GCCGAGGACTCTACTACGGATCCTACATGTACTCAGAGACATGAAACATTGGAATTCTCTTACTCTTCGCAGTAATAGCCACTGCATTCATGGGCTATGTCCTACCATGAGGACAAATATCCTTCTGAGGGGCCACAGTCATCACCAACCTCCTCTCCGCCATCCCCTACATCGGAACAGACCTCGTCCAATGAATCTGAGGAGGCTTCTCCGTAGACAAAGCCACCCTCACCCGATTCTTCGCCTTTCACTTCCTCCTCCCCTTCCTCGTATCCGCCCTAGTGATAGTCCACCTTCTATTTCTGCACGAAACCGGATCCAACAACCCCATGGGCATCCCATCAGACTCAGACATAATCCCCTTCCATCCCTACTACACCATTAAAGACATCCTAGGCCTTCTAGCAATACTCACAGCCCTATCAACATTAGTCCTGTTCTCACCAGACCTACTCGGAGACCCTGACAACTACATACCAG-CATAGGTTTGGTCCCAGCCTCTCTATTAGTTATAAGCAAAACTACACATGCAAGTATCCGCACCCCAGTGAGGATCCCCTGC-AAG-TCACCA-----TTTGACAA-AAAGGAGTGGGCATCAAGCACAC-----ACA-TGTAGCTCAAGACGCCTTGC-TCAGCCACGCCCCCACGGG-AAACCAGCAGTGATAAAAATTAAGCAATGAACGAAAGTTTGACTAAGTTATGCTT--ACC-AAGGGTTGGTAAATTTCGTGCCAGCCACCGCGGTCATACGATTAACCCTAATTAATAGACCTACGGCGTAAAACGTGTTTAAGA--AACCCAC---ACCATTAAAGCCAAACTCTAGCTACGCTGTAAAAAG-CCTCAGCTACTGTAAGCCCCA-CTACGAAAGTGACTTT-A--AAGTATCTGA-ACACACGACAGCTAAGACCCAAACTGGGATTAGATACCCCACTATGCTTAGCCCTAAACCTAAAGGGT--C-C---ACATAACAAGACCCTTCGCC-AGAGTACTACTAGCCAAAGCTTAAAACTCAAGGGACTTGGCGGTGCTTTATATCCCTCTAGAGGAGCCTGTTCTATAATCGATAAACCCCGATAAACCTCA-CCAACCCTTGCC--A-ACTCAGCCTATATACCGCCATCTTCAGCAAACCCT-GAAAAGGAGT-CGCAGTAAGCTCAATCACA-CAACATAAAAACGTTAGGTCAAGGTGTAGCCCATGGGTTGGAAAGA-AATGGGCTACATTACCTG----CTA--CCA---GGTCACC-------CGCC--------AGACGAATCCCCCTATGAAAATGA-AGGGC-TGAAGGTGGATTTAGCAGTAAACTAAGAATAGAGTGCTTAGTTGAA-TA-AGGCCATGAAGCAC-GTACACACCGCCCGTCACCCTCCTCAAGCA-CC-AACA-GT-A---G-AC--CCCAATCC--TA-TTAAC-ACC-----TA-CTACA-CCTGTCAGAGGAGATAAGTCGTAACAAGGTAAGCGTACTGGAAAGTGTGCTTGGATAACACAAAGCATAGCTTAA--CCCAAAGCATCTAGCTTACACCTAGAAGATATCATGCAACAAATGACTGCTTTGAGCCGTACCTAGCCCA--CACC-TTACAAAACACAACTA---CAACC-CCACTCATAAACTAAAACATTCA-CCA-----CAT-CTCAAAAGTATAGGAGATAGAAA-TTCTA-ATCTGGCGCTATAGAGAA-AGTACCGCAAGGGAACCA-TGAAAGAA-ACAACCC-AAAGCAACAAACAGCAAAGATTACCCCTTGTACCTTTTGCATAATGATTTAACTAGA-ACAACTTAGCGAAGAGA-ACTTAAGTTAATAATCCCGAAACCAGACGAGCTATTCACGAGCAGCCC-AAAAT-AGAGCAAACTCATCTATGTGGCAAAATAGCGAGAAGACTCATGAATAGAGGTGACAAG-CCTACCGAGCCTGGTGATAGCTGGTTGTCCAG-AAAA-GAGTTTTAGCTCAACCTTAAGCCTGCCCAATAAC-CC-CACAATT-CCACTGTAGACTTAAGAGATAATCTAAAAGGGGACAGCCTTTTAGAT-AAAGG-TTACAACCTTGC-CTAGAGAGTAAG--CATGC----T-AA--CAGACCATAGTGGGCCTAAAAGCAGCCATCAATAAAGAAAGCGTTCAAGCTC-AACA--ATCACAACA--ACC-CCGA---TACCAACAG--C-AG--CCA-CCACCTCCTAGCA-CTAA-A-ACTGGACCATTCTAT-AACTA----TATAGAAGAGATACTGTTAATATGAGTAACAAGAATT----TTA-TTCT-CCCC-GCACAAGTGTATATCA-G-AACGGAT-AACCACTGATAGTCAACAT-----ACGT-AGAG-C--AAG-TTCAA-CAAC--AAGCTCTCTACC--CC--TCTAATG-TTAACCCAACACAGGAGTGC--C----C-C-AGGGAAAGATTAAAAGGAGTAAAAGGAACTCGGCAAACAC-AAACCCCGCCTGTTTACCAAAAACATCACCTCTAGCATACCTAGTATTAGAGGCACTGCCTGCCCAGTGAC--ATACGTTCAACGGCCGCGGTATCCTGACCGTGCTAAGGTAGCATAATCACTTGTTCTCTAAATAAGGACTTGTATGAATGGCCACACGAGGGTTTTTCTGTCTCTTACTCCCAATCAGTGAAATTGACCTCCCCGTGAAGAGGCGGGGATGCCACAACAAGACGAGAAGACCCTATGGAGC-TTCAATT--AACTAGCCTA-AGA-GCAAG--ATACCCA-A-CACCAA--AAAGG-CAT-AAAACACCCTCA-TAATAGGTTAGTAATTTAGGTTGGGGTGACCTCGGAGTACAAAAAACCCTCCGAGC--ATATA--CAACTTAGACTTACCAGTCAAAGC-C-AC-A--CCA---TAA--TTGACCCAA--AA---TTTTTGATCAACGGACCAAGTTACCCTAGGGATAACAGCGCGATCCTATTCAAGAGTCCATATCGACAA-TAGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGACATCCTAATGGTGCA-GCAGCTATTAAGGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAGTCCTACGTGATCTGAGTTCAGACCGGAGCAATCCAGGTCGGTTTCTATCTGTT--T-CC-GC---G-CTCCTCCCAGTACGAAAGGACAAGAGAA-GCAAGGCCTCCTTATC----TCAAGCGCCTT-C--CAG-T--TCTACAGATG-ACATAA-TCTTAA-TCTG--GCGCAC-A--ACAAC-CAC-ACCGCCCCTA-GACA-A-GGGCT--ACCGCAGACCAGCAACAGTAGTATGAAACTCCAGAGCACAAACTGAGGCAGCAAACCCACACAGCATC-AAAAGCTCACTCCCAAACTTCTGAACACAGAGTCCATGG-AAGAAAGTTG-TGTC-TTTTGTATTTGTCTCCTTTATGTATAGACAAGGTGTTACCCTAAACCACAGACTAACATAC----TTCTACTTCACATATTGAA-TTTTCTTGGCCAACCAAAAGTAA-CTACAAATCCAC-AAAAA-TTACCATTCCAG-TAAGGCAGAGTGTAACCACTGATAATAGAATTTAAACATGTTTGCTATAAAAGATGTAAAGCATAACCATCTAAAACTGAAGCCTGCAGTTTTCTCTAAGGATTCCTGCTACCTGCCTCCTCTTCGCTACCCAGCCACTTGCACATTCAAAGGCAGTTTAGAGTCTGAAAAGCAACAATACATTATCCATGGGGGGAAAACACCAAACAATGAGCTTTCCGATAAGATTTATGTCATGTCTGTTGTGTGCAAGAACAACAAGAAAGTTACTTTTTGCTGTACTGAGAAAGACTTGGTGGGAGACGTCCCTGAAGCCAGATATGGTCATACCATTGATGTGGTGTACAGTCGAGGGAAGAGCATGGGTGTTGTCTTCGGAGGGCGATCATACATACCTTCTGCCCAAAGAACCACAGAAAAATGGAATAGTGTAGCTGACTGCCTGCCCCACATTTTCTTGGTGGATTTTGAATTTGGGTGCTGTACATCATACATTCTTCCAGAACTTCAGGATGGACTATCTTTTCACGTCTCCATTGCCAGAAATGATACCATTTATATTTTAGGAGGGCATTCACTTGCCAATAACATCCGCCCTGCCAACCTATACAGAATAAGGGTTGATCTCCCCCTGGGTAGCCCGGCTGTGAATTGCACGGTTTTGCCAGGAGGAATCTCTGTCTCCAGTGCAATCCTGACTCAAACAAACAGTGATGAATTTGTTATTGTGGGTGGCTATCAGCTTGAAAATCAGAAAAGAATGGTCTGCAATGTCATCTCTCTTGAGGGGAACAAGATAGAAATTCGTGAGATGGAGACCCCAGATTGGACCCCAGACATTAAGCACAGCAAGATATGGTTTGGAAGCAACATGGGAAATGGAGCTGTTTTCCTTGGCATACCAGGAGACAATAAACAGGCTGCTTCAGAGACATTCTATTTCTACATGCTGAAATGTGCTGAAGATGATGTGAATGAAGAACAGAAAACATTCACAAATAGTCAGACATCAACAGAAGACCCAGGGGATTCCACTCCCTTTGAAGACTCAGAAGAATTTTGCTTCAGTGCAGAAGCAAATAATTTTGATGGTGATGATGAATTTGACACCTATAACGAAGATGATGAGGAAGATGAGTCTGTCACAGGCTACTGGATTACTTGCTGCTCTACCTGTGATGTGGATATCAACACGTGGGTACCATTTTATTCAACTGAGCTAAATAAACCTGCCATGATCTATTGCTCTCATGGAGATGGGCACTGGGTCCATGCCCAGTGCATGGATCTGGCAGAACGCACACTCATCCAACTGTCAGAAGGAAGCAGCAAGTATTACTGCAATGAGCATGTGAAGATAGCAAGAGCATTGCAGACCCCAAAACGAGCTCTACCCTTAAAAAAGCCTCCACTGA-----------------------------------CTGCGCTTTAGCGACTCAGAAATCGGGGGCATCACCATCGCCTGGAAGTTCGATTCCCGTGAGTGCCCTCTGTCATCC-ACG-CTACAGCCCC-GGTTTCC-------GTG--CCCCCATT---CTCC---GTCAGGCC----TG{CT}GCCCTTAGCA-GGTG--------------------------------------------CCCTGTGGGAAAGG{CT}AGGACCTGAGCTCAGAGTCTGGGAGGAGACA--CATTCCCGTTCCATCATTTTCCATTTTGCAGAATCT-AAAATCACTG--GCCCC-CTAGACTC--CAGACTCATTG----------------G--------------GTGGGTCCTC---CAACAGTTTCACGCTCTCCCTCC-------------TCTGCCCTGACCCAGCCTTGGTGGCAGCTCCCCGCCTGG-----------TTTGCCGGGTAGAACGTCCCCTCGGCTCTTTGCTCGCTCTGTGCCAGGCA----GCACAAGGGGTGGG-GATGCA----------GTAAAAGCCGGGGTGCCTCC----GCA-----AGCCCGCACTAAACCCCC--------ATAAT---GCCGGCCCTCCT-CCTGA-CG---GCGGCGGGCTGTGGG-AACCAGCTTGTCC-TCTTCACAGCTGACCGCAACCT-CCTGGGCTTAGTCCATTTCTGTCCAGAAAGGAAA--TCAAATAAATCACATCCCCACTTTCCAAATCTGA-----TGGTGAT--------------TGGCTCCTTAGTGGA----GAATGCACAGGTTACAATATTATGTGCATCTAATCAGCACAATGGGCACAG-ATAATTTTGTAACAGTTTACTTCCACACTTTGT--------TGTCTTACTCCCGTCCCGTGATCAAGGATAAA---GGGGGAT-ATGTGCCACTTTTGTCTGTCTGGGATTCAGTGAGGATGTGTGGAGTTGGTACATGTTAAGC-AAGGCTAAGAAAC------CCT----CTCCCAGTCCTATTTGTGACAACGGAATATAGGTGAATTAATTTTTATCTGTTTTCATTATCTGTATGTACCCTAAAGTCC-TAT----TACA-CTATGTTCCT---------TTTTCTGTTCTCT-CTTCAGGATAT-CAATGGCAAGCT--GTTTCTTTCCAAACATGCTCTGTCCCAGGATGT-TTGTAC---------------------------------------------------------------------------AATTCAATTACAGTTGCCTGGGGTAAACCCATCTATGATGGTGGTAGTGAGATCCTGGGGTATGTAGTAGAACTTTGTAAAGCAGATGAAGAAGAATGGCAAATAGTTACTCCACCAACTGGCCTGAAAGCCACTCGATTTGAAATTGCAAAACTCACTGAACACCAAGAGTATAAAATACGAGTCTGTGCACTCAATAAAGTCGGTTTAGGTGAGGCTACACCAGTTCCTGGTACTGTGAAACCAGAAGATAAACTTGAAGCACCTGAACTTGACCTTGATTCTGAATTAAGGAAAGGGATTGTTGTAAGAGCTGGTGGCTCTGCCAGAATTCACATTCCATTCAAAGGCCGCCCAACACCTGAGATCACTTGGTCTCGAGAAGAAGGTGAATTCACAGACAAGGTTCAAATTGAAAAGGGATTAAACTATACCCAACTATCAATAGATAACTGTGATAGAAATGATGCTGGAAAATATATTCTCAAGCTGGAAAACAGCAGTGGATCTAAATCTGCTTTTGTAACTGTGAAAGTTCTTGATACCCCAGGACCACCACAAAATCTGGCAGTCAAAGAAGTGAAGAAAGATTCTGTCATCCTGGTATGGGAACCACCCATCATTGATGGAGGTGCAAAGGTCAAGAACTATGTTATCGACAAACGTGAGTCAACCAGAAAAGCGTATGCTAATGTCAGCAATAAATGCAACAAAACAAGCTTCAAAGTTGAGAATCTTACAGAAGGAGCCATTTATTACTTCAGAGTGATGGCTGAAAATGAATTTGGAGTTGGTGTTCCAGTAGAAACTGTTGATGCTGTGAAAGCTGCTGAACCTCCTTCCCCACCAGGAAAGGTCACACTCACTGATGTGTCCCAGACCAGTGCATCGCTCATGTGGGAGAAACCTGAATATGATGGCGGTAGCAGAGTCCTGGGGTACGTTGTTGAAATGCAGTCAAAAGGGACTGAAAAATGGAGCA ; END; [ The following blocks are output data for analysis step 16076 ] BEGIN TREES; TITLE Noctilionoidea_RAxML; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep16076; TREE Fig._1 = [&R] (Myzopoda_aurita:0.1477769645,(Mystacina_tuberculata:0.1862722758,((Thyroptera_discifera:0.1054694649,(Thyroptera_lavali:0.06231211236,Thyroptera_tricolor:0.06448245987)100:0.09284049926)100:0.2160547395,((Furipterus_horrens:0.194572059,(Noctilio_leporinus:0.01905292365,Noctilio_albiventris:0.007119801331)100:0.2181860826)100:0.04496369624,(((Mormoops_megalophylla:0.0700090744,Mormoops_blainvillei:0.07952978063)100:0.07113078296,((Pteronotus_parnellii_rubiginosus_1:0.02427677845,((Pteronotus_parnellii_parnellii:0.00468999768,Pteronotus_parnellii_rubiginosus_3:0.0127968977)100:0.007296608043,(Pteronotus_parnellii_rubiginosus_2:0.009604540382,(Pteronotus_parnellii_pusillus:0.008996742623,Pteronotus_parnellii_portoricensis:0.005787991194)87:0.003576852833)84:0.002632331224)99:0.01327350016)100:0.03779855156,((Pteronotus_personatus_psilotis:0.008868569739,Pteronotus_personatus_personatus:0.00961272132)100:0.06897664815,((Pteronotus_quadridens:0.04217464905,Pteronotus_macleayii:0.03286495124)100:0.02186641839,(Pteronotus_davyi_fulvus:0.01789127617,(Pteronotus_davyi_davyi:0.009906472415,Pteronotus_gymnonotus:0.01331414359)76:0.005327226438)100:0.04575974136)61:0.00638230493)95:0.009517985978)100:0.09539172773)99:0.01385242265,((Macrotus_californicus:0.06443143814,(Macrotus_waterhousii_mexicanus:6.251459857E-6,Macrotus_waterhousii_waterhousii:0.001773372845)100:0.04622803235)100:0.1352056241,((Lampronycteris_brachyotis:0.1297339702,((Micronycteris_minuta:0.01928422942,(Micronycteris_homezi:0.01060750212,Micronycteris_schmidtorum:0.02982097474)75:0.006455591869)100:0.05167473406,(Micronycteris_hirsuta:0.04676249194,(Micronycteris_brosseti:0.04189397225,(Micronycteris_matses:0.004816176103,(Micronycteris_microtis:0.004317502843,(Micronycteris_megalotis:0.007166089947,(Micronycteris_sp.:0.01814504273,Micronycteris_giovanniae:0.01351652805)69:0.002423433208)66:0.003311154173)61:0.007560066018)99:0.01871410701)59:0.005559204265)97:0.03444289024)100:0.04766996187)100:0.02771166329,((Diphylla_ecaudata:0.1985964735,(Diaemus_youngi:0.08124747143,Desmodus_rotundus:0.09856378507)100:0.06060712526)100:0.03353322512,((((Chrotopterus_auritus:0.08597008007,Vampyrum_spectrum:0.07708977365)99:0.0170076094,(Mimon_cozumelae:6.251459857E-6,Mimon_bennettii:0.02852904888)100:0.1075504141)100:0.0196022262,((Macrophyllum_macrophyllum:0.1431955736,Trachops_cirrhosus:0.1080548607)95:0.01188898242,((Tonatia_saurophila:0.02538177259,Tonatia_bidens:0.02154203096)100:0.07306216389,((Gardnerycteris_crenulatum:0.1132809441,(Phylloderma_stenops:0.0970004128,(Phyllostomus_discolor:0.05501214062,(Phyllostomus_latifolius:0.02802694587,(Phyllostomus_elongatus:0.03256397475,Phyllostomus_hastatus:0.02299973705)93:0.01021659814)71:0.004884869341)100:0.03112720489)96:0.006393503383)100:0.02495426055,((Lophostoma_silvicolum_centralis:0.01161920122,(Lophostoma_evotis:0.01265755612,Lophostoma_silvicolum_laephotis:0.009118497254)81:0.005485024096)100:0.02960197074,(Lophostoma_schulzi:0.03860624504,(Lophostoma_brasiliense:0.05362002233,Lophostoma_carrikeri:0.04292410675)94:0.008960231623)99:0.01186793274)100:0.0562124051)99:0.009744851431)100:0.01525660206)95:0.008350523983)100:0.01330901473,((((Anoura_cultrata:0.02974390143,(Anoura_caudifer:0.05220178018,(Anoura_latidens:0.01774097731,Anoura_geoffroyi:0.02029250715)100:0.01444483624)77:0.005260622087)100:0.05198180298,((Hylonycteris_underwoodi:0.04201054824,Lichonycteris_obscura:0.03151227875)97:0.01220441517,((Musonycteris_harrisoni:0.008679005235,Choeronycteris_mexicana:0.005675520246)100:0.04203865109,(Choeroniscus_minor:0.01826675445,Choeroniscus_godmani:0.006642140127)99:0.01098224493)100:0.01142880249)100:0.08799833366)100:0.01624559927,(((Brachyphylla_nana_nana:0.01708836383,(Brachyphylla_nana_pumila:0.005462796208,Brachyphylla_cavernarum:0.005278442526)71:0.004808535538)100:0.07909805896,((Erophylla_sezekorni:0.001106221867,Erophylla_bombifrons:0.005164960138)100:0.03443887732,(Phyllonycteris_aphylla:0.01881057122,(Phyllonycteris_poeyi_obtusa:0.01269884262,Phyllonycteris_poeyi_poeyi:0.0103977232)51:0.00701281159)98:0.01994569554)100:0.03936703917)100:0.01592506669,((Monophyllus_plethodon:0.02088690862,Monophyllus_redmani:0.02694039416)100:0.0330381444,((Leptonycteris_yerbabuenae:0.02323748874,Leptonycteris_curasoae:0.003522295457)100:0.05564324607,(Glossophaga_soricina:0.03290139585,(Glossophaga_commissarisi:0.03101854241,(Glossophaga_morenoi:0.03632689058,(Glossophaga_leachii:0.01777575367,Glossophaga_longirostris:0.01306905907)70:0.009119014766)54:0.003285304507)87:0.009736756177)100:0.04126510333)100:0.01626014121)100:0.02550946346)100:0.008148144594)100:0.02577430939,((Lonchorhina_orinocensis:0.06687237755,(Lonchorhina_aurita:0.05415320555,Lonchorhina_inusitata:0.04982582137)100:0.03689520244)100:0.05734873308,(((Lonchophylla_mordax:0.04575505598,Hsunycteris_thomasi:0.06381048317)100:0.0232034592,((Lonchophylla_chocoana:0.03716306466,(Lonchophylla_handleyi:0.03578460715,Lonchophylla_robusta:0.020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[! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr87542] END;