#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on November 15, 2026; 21:45 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Kim T., Kim J., Nadler S., & Park J. 2015. The complete mitochondrial genome of Koerneria sudhausi (Diplogasteromorpha: Nematoda) supports monophyly of Diplogasteromorpha within Rhabditomorpha. Current Genetics, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S18115] [ The following blocks are input data for analysis step 16683 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep16683; DIMENSIONS NTAX=63; TAXLABELS Acanthocheilonema_viteae Aelurostrongylus_abstrusus Agamermis_sp Ancylostoma_duodenale Angiostrongylus_vasorum Anisakis_simplex Ascaridia_columbae Ascaris_lumbricoides Baylisascaris_procyonis Brugia_malayi Bunostomum_phlebotomum Bursaphelenchus_xylophilus Caenorhabditis_elegans Chabertia_ovina Chandlerella_quiscali Contracaecum_rudolphii Cooperia_oncophora Cucullanus_robustus Cylicocyclus_insignis Dictyocaulus_viviparus Dirofilaria_immitis Dracunculus_medinensis Enterobius_vermicularis Haemonchus_contortus Heliconema_longissimum Heterodera_glycines Heterorhabditis_bacteriophora Hexamermis_agrotis Koerneria_sudhausi Limulus_polyphemus Lithobius_forficatus Loa_loa Mecistocirrus_digitatus Meloidogyne_chitwoodi Metastrongylus_pudendotectus Necator_americanus Nematodirus_oiratianus Oesophagostomum_dentatum Onchocerca_volvulus Parafilaroides_normani Pratylenchus_vulnus Pristionchus_pacificus Radopholus_similis Rhigonema_thysanophora Romanomermis_culicivorax Setaria_digitata Spirocerca_lupi Steinernema_carpocapsae Strelkovimermis_spiculatus Strongyloides_stercoralis Strongylus_vulgaris Syngamus_trachea Teladorsagia_circumcincta Thaumamermis_cosgrovei Thelazia_callipaeda Toxascaris_leonina Toxocara_malaysiensis Trichinella_spiralis Trichostrongylus_axei Trichuris_trichiura Wellcomia_siamensis Wuchereria_bancrofti Xiphinema_americanum ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M32843] TITLE Rhabditomorpha_KS_NT_excl; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep16683; DIMENSIONS NCHAR=7892; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Baylisascaris_procyonis 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Chabertia_ovina 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Heterorhabditis_bacteriophora 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Lithobius_forficatus 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Loa_loa 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Strongylus_vulgaris 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Toxascaris_leonina 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Toxocara_malaysiensis 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Xiphinema_americanum 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GTGTATTTTTGTTTGTATCTATTTTTTTTTCATTATCTTCGATATCTTTTACCAGAATTTTCCCTTGATCGGTTGAAGTTAAACTCTCTT--TTGGAGTATTTTTTATGCGTTTTTGTTTTTGAATGATTATCTATTTCCGGGTCT----------TCTCTCTTGTGATCTTTGATTTTTTTTCTTATTTGTACTTTTTTGATGGTCTTCGGTTAATGATGT------------------------------------------ATATTTTGATGCCTTTTCATAT--------------GTATCATTAAGATATCTTGTACAAGTGG--TTTTGATCTTAGGTTTATATTGCTGCGTGGAG--------GTGTTTGCTACTAGTCCGTC------------TTACATCTTGGGAGTTATGTTTTGATAGACTTTTATTCAATTTTTGTTTATTATTTGATTAGTTTTCCATTTGTATATCTTTTGGGGGCACCGACGTTAGGCAGATTATTATGTTAACATGTTTTCGTCCTTCTGTATATATGGATGGATGTTA----TTTGTGCCCTTATCATCCAGTTCTAT--------AGATACTTACTTCCTTTTGTAACTCCGTTTGGCTCATTTGTTCCAAGCCAGTGAGCAGACAGGGTCATATTTGCAGCTCTTTAATTGGTCTTGGTTTTCGGTTTTCATATGTTTAG------------GTTTCCATTTATTTTTTGGCATATAGAGATTTACATATCAGTGATTAAAATTGTGCTAAGAGGTACCAATACTTTTTCGTGCAGATACGTAAAAACATTTTTGTATGTTTTTTCGTGCCAGGTGGTTCTCAGTTTTTTTTGTGGCATCAGAGGTTCTATCCGTTGGGTTTTTAG------AGAGTCAATTTTTGTTTATTATTTGGCTATCTATTCAATCTCATCCCCATCCTCTTTTCCGAGTCTACATTGGGGCTTATAGATAGGTGCGTGTTGTTGCCTTTAGCTTTGTTGTATTAATCATTTTTTTGGGTTCAATCAAGGCACACTAAGGGGATTTAAATTCGAGCATATATCTATCAGTGGTTTCGTGTTCATATCTATTTCGTT----------------------------------ATGTGCCTTTGTAGTTATGTGGGTGCTTTTTTGTTCTTAGGTTTAATGTCAACCTTTTGTATGTTTTTGAGGGTGTGTCTTTCTTGCTCTTTCATGGTGCGG----------CCGTATTTGCATCTTCTTTTGTGGGAGCTTATTT--TTACTCTTTTAGGTCTCGTGTCGGAGCCTAGGTCATTTTTTA----------ATATTGAATACTTTGCTGCTGTATAATTAAACTGTTTATAATTGTTCTTTTGTGTTTTATCCGTACTCCTCCTTAAATGTGTACGATTATAGAAGTGGATTTAGCTTCATCTGGAAATCAGTTTGTTTTTGTTTGTATGTATTCCTTGGTTTTCTGTCCGTTTAATCAAAAAAG--CTAGTGTTTTTCACCTTTATTTGTCTTCATAT--ATTTATTTAGGAAGCTTTTTATTTCTGGTGGAGGCTGGGTTCTCTTCTCTATATTTTACAAATGATAGGTAAGGGGTTTTACTTCTACAACGGTGGGAGCTGTTATATAGTTTCTATGAT------------TTCTCTTCCCACTTAACTAACATTTT--------ATATTTGTTTATTTGCTTACAAAGGCCATGCCTTACAGTGTTCCGCGCATGCGCCCACCCGTAGGCTTGTCAAGTCACCTGTACGCGGATTGATTTATCGTTTTTAAATCTC--------TCATCTTGCTCTTTGG--AGTTACACTTATGCAGCTGCGCTTTTGAGCGAACAAAA--ATGTGCTTTCACTTAGCACTGGATATGTCTTCTTTACTGGGGAATTATTGTTTTCATTGTTGCAGCTTGCAAGCAACTTTTTATGTGGAGATCTAGCTAATATCCACAGATCCGAATTTCGTTCATAAACTT--AGATGCCTCTATAGATTTAG------TTGGGGACTTTTCAAGGGATTATCAAGACAATCTCTACCATTGT--TTTCAAAGGTTATCTGATATCTACGCTTGTACTTACCTTCTATGCTAATTTTTTATTGCTTGAGGATCGAAAACTTAC--ACTCAGAGGTGTATCACTCCATTTGTCTTCATTGACTTGTTTGGTATTTAAAAAAAACTTATAAGTGGACTTAGAGTATGGTCTTTTTATTTTTTTTTGCAG------------------------------------------------------------------------------GTTCTTCCTTTTTTGGTTTCCTCACTTTGTAGAAAGGCTTATCTGGTTTTAATAATTCTCTA----ATTTATTTGACCATTATTATTTTCAAATTTTTTTAAACACCTAGACCTACCCCTACATATCTCTGTATTTTTGT--------------------------------------ATAGGAATCTTTCTTTACACCTTTATACCTCAAGACTTTGTGAGTTTTACATCCCTTCATTTTCATTTATACCGCAGTCTGATTTCGGTTGT--------------GTTTATTTTGTTGTTTATGGGGTTCTCTTTATGTATGTTCACTTTCCACAGAAGAGCTATATGAAAATTC----ATATGCGTTAATATTCTATTTTCTTTAAGTAGGAATGA------------------------TTAGAAAAGTAGGCATTTTGTAGAAAACCCTT--ATATAGCTCCCTATTCCTTTATTCTTATACATAGTTTTTTTCAATCAAATATAGCGGTGT------------ ; END; [ The following blocks are output data for analysis step 16683 ] BEGIN TREES; TITLE 'Rhabditomorpha KS_NT_excl_BI'; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep16683; TREE Fig_S3 = [&R] (Acanthocheilonema_viteae:0.09446822,((((((((((((((((((Aelurostrongylus_abstrusus:0.1246555,Angiostrongylus_vasorum:0.1389724):0.01939938,Parafilaroides_normani:0.1358708):0.02133524,Metastrongylus_pudendotectus:0.1484091):0.0374256,Dictyocaulus_viviparus:0.3550583):0.08987362,((((Ancylostoma_duodenale:0.03367346,((Chabertia_ovina:0.05107023,Oesophagostomum_dentatum:0.02552926):0.009380455,(Cylicocyclus_insignis:0.04397796,Strongylus_vulgaris:0.03428108):0.01057181):0.01103706):0.01069255,(Bunostomum_phlebotomum:0.06163204,Necator_americanus:0.04509352):0.01359809):0.0113995,Syngamus_trachea:0.1030222):0.01741647,(((Cooperia_oncophora:0.07186817,Teladorsagia_circumcincta:0.07484084):0.01693618,((Haemonchus_contortus:0.07713028,Mecistocirrus_digitatus:0.08225262):0.04744893,Trichostrongylus_axei:0.09975879):0.011344):0.02263604,Nematodirus_oiratianus:0.1225938):0.02007655):0.01780541):0.05161288,((Caenorhabditis_elegans:0.08423791,(Koerneria_sudhausi:0.1604036,Pristionchus_pacificus:0.06370739):0.03001551):0.01513826,Heterorhabditis_bacteriophora:0.1033653):0.01776865):0.0485387,((Bursaphelenchus_xylophilus:0.4118234,Strongyloides_stercoralis:0.3542831):0.06816914,Steinernema_carpocapsae:0.1297619):0.02673706):0.0324166,((Anisakis_simplex:0.06565321,Contracaecum_rudolphii:0.08472821):0.01603336,(((Ascaris_lumbricoides:0.02909931,Baylisascaris_procyonis:0.02344783):0.01396498,Toxascaris_leonina:0.02989094):0.03764002,Toxocara_malaysiensis:0.05633698):0.01141428):0.05330487):0.02971048,Cucullanus_robustus:0.2394783):0.02326258,(Ascaridia_columbae:0.197146,Rhigonema_thysanophora:0.3803867):0.04174114):0.06517211,Dracunculus_medinensis:0.5171766):0.06180321,((((((Agamermis_sp:0.3249142,Hexamermis_agrotis:0.2254634):0.3724997,((Romanomermis_culicivorax:0.7332792,Strelkovimermis_spiculatus:0.7667526):0.1802397,Thaumamermis_cosgrovei:0.6606519):0.07807891):0.8433347,Xiphinema_americanum:1.253249):0.1384186,(Trichinella_spiralis:0.431211,Trichuris_trichiura:0.5656318):0.8283664):0.1535922,(Lithobius_forficatus:0.3022151,Limulus_polyphemus:0.2745724):0.6464184):0.8056954,((Heterodera_glycines:0.8354086,Radopholus_similis:1.820913):0.1093773,(Meloidogyne_chitwoodi:0.7680726,Pratylenchus_vulnus:0.9470931):0.3326583):0.3751779):0.1559823):0.06027642,(Enterobius_vermicularis:0.2242227,Wellcomia_siamensis:0.2904153):0.3404706):0.6174643,Heliconema_longissimum:0.3359491):0.1211853,Thelazia_callipaeda:0.1909615):0.04323281,Spirocerca_lupi:0.1821118):0.05074576,Setaria_digitata:0.08074578):0.03362592,(Dirofilaria_immitis:0.07852665,Onchocerca_volvulus:0.04058872):0.01296917):0.00984287,((Brugia_malayi:0.03029444,Wuchereria_bancrofti:0.03724516):0.05186044,(Chandlerella_quiscali:0.1252441,Loa_loa:0.05408789):0.01067943):0.01303278); 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TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr89835] END;