#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 28, 2024; 14:48 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Miranda L.S., Hirano Y.M., Mills C.E., Falconer A., Fenwick D., Marques A.C., & Collins A. 2016. Systematics of stalked jellyfishes (Cnidaria: Staurozoa). PeerJ, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S18971] [ The following blocks are input data for analysis step 17943 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep17943; DIMENSIONS NTAX=27; TAXLABELS Craterolophus_convolvulus_GERMANY Craterolophus_convolvulus_UK Depastromorpha_africana Depastromorpha_sp_AUS Haliclystus_antarcticus_ANT Haliclystus_californensis Haliclystus_octoradiatus Haliclystus_sanjuanensis Haliclystus_stejnegeri Haliclystus_tenuis Kishinouyea_sp_MOOREA Kishinouyea_sp_NZ Kishinouyea_sp_SAF Lipkea_ruspoliana Lipkea_sp_JAPAN Lucernaria_bathyphila_DEEPSEA Lucernaria_janetae Lucernaria_sainthilarei Lucernaria_sp_EPR Lucernariopsis_campanulata Lucernariopsis_cruxmelitensis Lucernariopsis_sp_NZ Lucernariopsis_vanhoeffeni Manania_gwilliami Sasakiella_cruciformis Stenoscyphus_inabai Stenoscyphus_sp_AUS ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M35566] TITLE 'Staurozoa COI_alignment_matrix_PA'; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep17943; DIMENSIONS NCHAR=587; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Craterolophus_convolvulus_GERMANY GGTGCTTTTTCTGGTATGGTAGGCACAGCCTTTAGTATGTTAATCAGGTTGGAACTCTCTTCCCCTGGCTCTATGTTGGGAGACGATCAACTTTACAATGTTCTTGTTACTGCTCATGCGTTTGTTATGATTTTCTTTTTAGTTATGCCAGTTATGATTGGAGGGTTCGGTAATTGGTTAGTACCTCTATATATTGGAGCTCCTGATATGGCTTTTCCTAGACTTAACAATATTAGCTTTTGATTGTTACCTCCAGCTCTAATTTTACTATTAGGTTCCTCTTTAATAGAACAAGGTGTAGGAACAGGGTGAACTGTTTATCCCCCCCTTTCTGGTATTCAAGCACATTCGGGTGGGGCTGTAGATATGGGTATTTTTAGCCTGCATTTAGCTGGTGCATCTTCTATTTTAGGGGCAATGAATTTCATAACCACTATATTTAATATGAGAGCCCCTGGCCTTAGTTGAGATAAGCTACCCCTATTTGTCTGATCTGTTTTAATAACGGCTTTTCTACTCTTATTATCTCTTCCTGTGTTAGCCGGGGCTATTACTATGTTATTGACTGACCGTAATTTTAATACCTC Craterolophus_convolvulus_UK GGTGCTTTTTCTGGTATGGTAGGCACAGCCTTTAGTATGTTAATCAGGTTGGAACTCTCTTCCCCTGGCTCTATGTTGGGAGACGATCAACTTTACAATGTTCTTGTTACTGCTCATGCGTTTGTTATGATTTTCTTTTTAGTTATGCCAGTTATGATTGGAGGGTTCGGTAATTGGTTAGTACCTCTATATATTGGAGCTCCTGATATGGCTTTTCCTAGACTTAACAATATTAGCTTTTGATTGTTACCTCCAGCTCTAATTTTACTATTAGGTTCCTCTTTAATAGAACAAGGTGTAGGAACAGGGTGAACTGTTTATCCCCCCCTTTCTGGTATTCAAGCACATTCAGGTGGGGCTGTAGATATGGGTATTTTTAGCCTGCATTTAGCTGGTGCATCTTCTATTTTAGGGGCAATGAATTTCATAACCACTATATTTAATATGAGAGCCCCTGGCCTTAGTTGAGATAAGCTACCCCTATTTGTCTGATCTGTTTTAATAACGGCTTTTCTACTCTTATTATCTCTTCCTGTGTTAGCCGGGGCTATTACTATGTTATTGACTGACCGTAATTTTAATACCTC Depastromorpha_africana ---------------------------------AA---GTTAATCCGGTTGGAATTATCTGCCCCGGGAACCATGCTAGGAGACGACCAGTTATACAATGTACTAGTCACTGCACATGCTCTTATTATGATTTTCTTCTTAGTCATGCCTGTAATGATTGGAGGATTTGGTAATTGATTAGTTCCCCTTTATATAGGAGCTCCTGATATGGCTTTTCCTCGATTGAATAATATTAGTTTTTGGTTACTTCCTCCTGCCTTGATTTTACTTCTAGGGTCATCTCTAATAGAACAAGGTGTAGGAACAGGTTGAACTGTTTACCCCCCACTCTCTGGCATACAAGCCCATTCTGGAGGAGCAGTTGATATGGGTATTTTTAGTCTCCATCTTGCAGGAGCTTCCTCTATTTTAGGAGCAATGAATTTTATTACTACTATTATTAATATGAGAGCACCAGGTGTCTCATGAGATAAACTCCCTTTATTTGTATGGTCTGTGTTAATAACAGCTGTATTGCTTCTTTTATCTTTACCTGTTCTAGCCGGAGCTA------------------------------------- Depastromorpha_sp_AUS GGGGCTTTCTCTGGTATGGTGGGTACCGCTTTTAGCATGCTAATACGGCTTGAATTATCTGCTCCTGGTACTATGTTAGGGGATGATCAATTGTACAATGTATTAGTGACTGCTCACGCTCTTATTATGATTTTCTTTCTTGTCATGCCAGTCATGATTGGGGGATTTGGAAATTGACTTGTACCTCTCTACATTGGTGCTCCCGACATGGCATTTCCTCGTTTAAACAATATCAGTTTTTGATTGTTACCTCCAGCCCTTATTTTACTCTTAGGTTCCTCTTTAATTGAACAAGGAGTGGGTACAGGATGAACTATTTATCCTCCCTTGTCTGGGATTCAAGCTCACTCGGGTGGTGCTGTTGACATGGGTATTTTTAGCCTTCATCTAGCTGGAGCTTCCTCTATTTTAGGAGCCATGAATTTTATCACTACTATTATTAACATGCGAGCTCCGGGAATCTCTTGGGATAAACTCCCTTTATTTGTATGATCTGTGCTAATTACCGCTGTTTTATTATTGCTCTCATTACCAGTATTAGCTGGTGCGATTACAATGCTTTTAACAGATCGGAATTTTAACACTTC Haliclystus_antarcticus_ANT -------TTTCAGGAATGGTGGGTACAGCTTTTAGTATGCTTATCCGTCTTGAATTATCTGCTCCCGGCACTATGCTAGGAGACGACCAACTCTACAACGTTTTGGTCACAGCTCATGCTTTTGTTATGATTTTCTTCTTAGTCATGCCTGTTATGATTGGCGGGTTTGGAAATTGGTTGGTCCCCCTTTACATTGGTGCCCATGATATGGCTTTTCCTCGGCTTAACAATATTAGTTTTTGATTGCTACCTCCTGCCCTTATTTTATTATTGGGGTCTTCTTTAATTGAACAAGGAGTAGGAACAGGATGGACAGTTTACCCTCCCTTATCTGGAATCCAAGCCCATTCCGGTGGGGCTGTAGATATGGGAATTTTTAGCCTCCATTTAGCAGGTGCTTCTTCTATCTTAGGAGCTATGAATTTTATTACAACTATATTCAACATGCGAGCCCCTGGAGTTACTTGGGACAAACTCCCTCTTTTTGTTTGATCTGTCCTCATTACTGCTTTT-------------------------------------------------------------------------- Haliclystus_californensis GGTGCTTTTTCAGGTATGGTGGGCACTGCTTTTAGTATGCTTATCCGTCTTGAATTATCTGCCCCCGGTTCTATGCTAGGGGATGACCAACTTTACAACGTGCTGGTAACAGCCCATGCTTTTATTATGATTTTCTTTTTAGTTATGCCTGTTTTAATTGGTGGATTTGGTAATTGGTTAGTACCCCTTTATATAGGTGCTCCCGATATGGCTTTTCCTCGACTTAATAACATTAGTTTTTGGCTTTTACCTCCTGCTCTTATTTTACTATTAGGATCTTCCCTTATTGAACAAGGAGTAGGAACAGGGTGGACTGTTTACCCCCCTTTATCAGGTATTCAAGCACATTCCGGAGGAGCTGTTGATATGGGAATTTTTAGCCTCCATTTAGCTGGAGCCTCCTCTATTCTAGGAGCTATGAATTTTATTACTACTATTTTTAACATGCGAGCACCAGGAGTTACCTGGGACAAACTCCCTCTCTTTGTTTGGTCTGTCCTTATTACAGCCTTTCTTCTCCTTCTATCTCTCCCTGTATTAGCAGGTGCTATTACTATGCTTTTAACAGATAGAAATTTTAATACTTC Haliclystus_octoradiatus GGTGCTTTTTCAGGAATGGTGGGTACAGCTTTTAGTATGCTTATTCGCCTTGAACTGTCTGCTCCTGGTACTATGCTAGGAGATGATCAACTTTATAATGTATTAGTTACAGCTCATGCTTTTGTTATGATTTTCTTTTTAGTTATGCCTGTTATGATAGGTGGGTTTGGTAATTGATTGGTTCCCCTTTATATTGGGGCCCCTGATATGGCTTTTCCTCGACTTAATAATATTAGTTTCTGATTACTACCTCCTGCTCTTCTCTTGCTTTTAGGTTCATCCTTAATTGAACAGGGTGTCGGAACTGGGTGAACAGTCTATCCCCCGCTGTCCGGTATTCAAGCTCATTCTGGTGGAGCTGTAGACATGGGAATTTTTAGTCTTCATTTAGCAGGAGCATCATCAATTTTAGGGGCTATGAATTTTATCACAACTATTTTTAACATGAGAGCCCCTGGAATGACCTGAGATAAACTCCCTCTTTTTGTCTGATCTGTTCTCATAACAGCTTTTCTTTTACTCCTTTCTTTACCTGTTTTAGCAGGAGCAATCACCATGTTATTAACAGATAGAAATTTTAACACTTC Haliclystus_sanjuanensis GGTGCTTTTTCAGGAATGGTGGGTACAGCCTTTAGTATGCTTATCCGTCTTGAATTATCTGCTCCCGGCACTATGCTAGGAGACGACCAACTTTACAACGTTTTGGTCACTGCTCATGCTTTTGTTATGATTTTTTTCTTAGTAATGCCTGTTATGATTGGAGGATTTGGAAATTGACTGGTCCCTCTTTATATTGGTGCCCCTGATATGGCTTTCCCCCGTCTTAACAACATTAGTTTTTGGTTACTCCCCCCTGCCCTTATTTTACTTTTAGGGTCTTCTCTAATTGAACAAGGAGTAGGAACAGGGTGAACTGTTTACCCTCCCTTATCTGGTATTCAAGCTCATTCTGGTGGAGCTGTAGATATGGGTATTTTTAGCCTTCATTTGGCAGGAGCCTCCTCTATTCTAGGAGCTATGAACTTTATTACTACCATCTTTAACATGCGAGCCCCGGGTGTCACTTGGGACAAACTCCCTCTTTTTGTATGATCTGTTCTTATTACTGCTTTTTTATTACTTTTATCCCTCCCTGTATTAGCTGGAGCTATTACTATGCTTTTAACAGATCGAAATTTTAATACCTC Haliclystus_stejnegeri GGTGCTTTTTCAGGAATGGTGGGTACAGCTTTTAGTATGCTTATTCGTCTTGAACTGTCTGCTCCTGGTACTATGCTAGGGGACGATCAACTTTATAACGTATTAGTTACAGCTCACGCTTTTGTTATGATTTTCTTTTTAGTAATGCCTGTTTTAATAGGAGGGTTTGGAAACTGACTGGTTCCCCTTTATATTGGAGCTCCCGATATGGCCTTCCCTCGACTTAATAATATTAGTTTTTGACTGCTACCTCCTGCTCTTATTTTACTTTTAGGGTCTTCCCTTATTGAACAAGGTGTGGGGACAGGTTGGACAGTTTACCCTCCCCTATCAGGAATTCAAGCCCACTCTGGAGGGGCTGTTGATATGGGTATATTTAGCCTGCATTTAGCAGGGGCTTCTTCAATTTTAGGGGCCATGAATTTTATTACTACCATATTTAATATGAGAGCTCCTGGTGTTTCTTGAGACAAACTCCCACTTTTTGTATGGTCAGTACTAATTACAGCTTTTCTACTACTTCTCTCCTTACCTGTATTAGCCGGTGCTATCACCATGCTCTTAACAGACAGGAATTTTAATACTTC Haliclystus_tenuis GGTGCCTTCTCAGGAATGGTTGGTACAGCCTTTAGTATGTTAATTCGCCTTGAGCTATCAGCCCCAGGAACCATGTTGGGAGATGATCAACTCTATAACGTTTTGGTAACAGCCCATGCTTTTGTTATGATATTTTTTCTTGTAATGCCTGTTATGATTGGAGGTTTTGGGAATTGGTTAGTACCACTTTATATTGGTGCTCCTGACATGGCCTTCCCCCGGCTGAATAATATCAGCTTCTGATTATTACCCCCTGCCTTAATTTTATTATTAGGGTCCTCCCTCATCGAACAAGGGGTTGGTACAGGTTGGACTGTTTATCCTCCCCTTTCTGGAATACAAGCCCATTCAGGTGGTGCCGTAGATATGGGAATTTTTAGCCTCCATTTAGCAGGTGCCTCCTCTATTTTAGGCGCTATGAATTTCATTACAACAATTTTTAATATGCGTGCCCCAGGTGTAACTTGAGACAAATTACCCTTATTTGTTTGATCCGTCTTAATTACAGCTTTCTTACTGTTATTGTCCTTACCAGTGCTAGCGGGAGCTATTACTATGCTTTTGACTGATCGTAACTTCAATACGTC Kishinouyea_sp_MOOREA GGTGCGTTTGCGGGCATGGTGGGAACAGCTTTTAGTATGCTAATCCGCCTAGAGCTGTCTGCACCGGGTAGTATGTTAGGCGATGATCAACTTTATAACGTCCTTGTTACCGCCCATGCTTTAATTATGATCTTTTTTCTTGTGATGCCTGTGATGATTGGTGGGTTTGGCAATTGATTGGTGCCTTTATATATTGGGGCCCCGGATATGGCTTTCCCTCGCCTAAATAATATCAGTTTTTGACTTTTGCCTCCGGCTTTAATTTTACTTTTGGGTTCCTCGCTGATTGAGCAAGGCGTCGGAACAGGGTGAACCATTTACCCTCCCTTAGCGGGGATTCAGGCTCACTCTGGCGGAGCGGTCGATATGGGTATTTTTAGCCTTCATTTAGCAGGTGCTTCATCTATTTTAGGGGCGATGAATTTTATCACCACCATATGTAATATGCGTGCCCCTGGATTAAGCTGAGACAAGTTACCCCTCTTTGTTTGATCCGTGCTGATTACGGCTGTGCTTCTCCTTCTTTCCTTACCGGTTTTAGCCGGAGCGATTACCATGCTTTTAACCGATCGAAACTTTAATACGTC Kishinouyea_sp_NZ ---------------ATGGTCGGAACCGCTTTTAGTATGCTGATTCGGTTAGAACTATCTTCGCCAGGTAGTATGTTAGGAGACGACCAACTTTACAATGTACTAGTAACAGCCCATGCCCTTATAATGATTTTCTTTTTAGTAATGCCTGTTATGATAGGAGGGTTTGGAAACTGATTAGTTCCTTTATATATAGGTGCCCCAGATATGGCTTTTCCTCGGCTAAACAATATAAGCTTTTGACTTCTGCCTCCTGCTTTGATACTCTTGCTAGGTTCTTCCCTTATTGAACAAGGTGTGGGGACAGGGTGAACTATTTATCCCCCTCTCTCAGGAATTCAAGCTCACTCCGGGGGTGCTGTAGATATGGGAATATTCAGTCTCCATTTAGCAGGCGCTTCTTCTATTTTAGGAGCTATGAATTTTATTACCACTATATTTAATATGCGGGCTCC------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ Kishinouyea_sp_SAF GGTGCCTTCTCGGGGATGGTTGGTACAGCTTTTAGCATGCTAATTCGTCTTGAACTATCCGCCCCAGGTAGTATGTTAGGGGATGATCAACTCTATAATGTGTTAGTGACTGCCCACGCTTTAATTATGATTTTCTTTTTAGTGATGCCAGTCATGATTGGGGGTTTTGGTAATTGATTGATCCCCCTCTATATTGGGGCTCCTGATATGGCTTTCCCTCGTCTGAATAACATTAGCTTTTGACTTCTACCCCCTGCCCTTATTCTCTTGTTAGGTTCTTCTCTAATTGAACAAGGTGTTGGAACAGGTTGAACAGTGTACCCTCCTTTAGCAGGTATTCAAGCCCATTCAGGTGGAGCTGTTGATATGGGTATATTTAGTCTACATTTAGCTGGGGCATCTTCTATCTTAGGTGCTATGAACTTTATTACCACTATTATTAATATGCGAGCACCTGGTTTAAGTTGGGATAAATTACCCCTCTTTGTTTGGTCTGTTCTTATTACTGCTGTTCTTCTTTTACTTTCTTTACCTGTTCTAGCTGGGGCTATTACTATGTTATTAACCGATCGGAATTTTAATACTTC Lipkea_ruspoliana GGGGCTTTCGCCGGTATGGTAGGAACAGCCTTTAGTATGTTGATTCGGTTAGAGCTTTCCTCTCCCGGATCCATGTTAGGGGACGATCAACTCTATAATGTGCTGGTAACAGCCCACGCCTTAATTATGATTTTCTTTCTAGTGATGCCCGTTATGATTGGTGGGTTTGGAAATTGGCTGGTCCCCCTCTATATTGGGGCTCCTGATATGGCCTTTCCCCGCCTTAATAATATTAGTTTTTGGCTCCTTCCCCCTGCCCTTATCCTGCTAGTAGGTTCCTCTCTTATAGAACAGGGTGTAGGAACAGGTTGAACGGTATATCCCCCTTTGGCTGGTATACAGGCCCACTCGGGGGGTGCCGTTGATATGGGAATCTTTAGTCTGCATCTAGCAGGCGCTTCCTCTATTCTAGGGGCTATGAACTTTATTACCACCATCTTTAATATGCGGGCTCCTGGTGTAAGCTGGGATAAACTTCCTCTCTTTGTTTGATCTGTTTTAATTACGGCCTTCCTTCTTCTCCTTTCACTCCCGGTACTTGCTGGGGCTATTACCATGCTCCTAACGGACCGTAACTTTAATACCTC Lipkea_sp_JAPAN GGGGCCTTTGCGGGAATGGTGGGAACCGCCTTTAGTATGTTGATTAGACTAGAGCTCTCCTCTCCAGGAACTATGCTAGGAGATGATCAACTTTACAATGTGCTGGTAACGGCACATGCCCTTATTATGATATTCTTTCTCGTTATGCCCGTTATGATCGGGGGATTTGGAAACTGGCTTGTACCCCTTTACATCGGGGCCCCAGATATGGCCTTTCCCCGACTTAATAATATTAGTTTTTGGCTTCTACCTCCAGCCCTTATTCTTCTTTTAGGTTCATCCCTAATAGAACAAGGAGTAGGAACAGGATGAACAGTCTATCCTCCCCTAGCGGGTATTCAAGCTCATTCGGGGGGAGCTGTAGATATGGGAATCTTTAGCCTACACCTGGCTGGAGCATCTTCTATATTAGGGGCTATAAACTTTATTACCACTATATTTAATATGCGGGCCCCTGGAGTAGGATGGGATAAACTCCCCCTCTTTGTGTGGTCTGTTTTAATTACAGCTTTTCTTTTACTATTATCATTGCCTGTCTTAGCTGGAGCTATTACGATGCTTCTAACGGATAGGAACTTTAATACATC Lucernaria_bathyphila_DEEPSEA ------TTTGCCGGAATGGTAGGAACCGCCTTTAGTATGCTTATCCGTTTAGAACTCTCTTGCCCAGGGTCTATGTTAGGAGACGACCAACTTTATAACGTTTTAGTAACAGCCCATGCCTTTGTTATGATCTTCTTTTTAGTTATGCCCGTCATGATTGGGGGGTTTGGTAATTGACTTGTACCCCTTTATATTGGGGCTCCTGATATGGCCTTTCCTAGATTAAATAACATTAGTTTTTGATTATTACCTCCAGCCCTTATTCTTTTATTAGGTTCTTCTTTAGTAGAACAGGGTGTAGGAACAGGCTGAACCCTCTATCCCCCCCTTTCAGGTATTCAGGCCCACTCAGGTGGAGCTGTTGATATGGGAATTTTTAGCCTTCACTTAGCTGGAGCTTCTTCTATTTTAGGGGCAATGAACTTTATTACTACTATTTTTAATATGAGGGCACCAGGACTAAGCTGGGATAAACTCCCCCTTTTTGTATGATCCGTTTTAATTACAGCCTTTCTTCTACTACTCTCTTTACCTGTTCTAGCAGGCGCCATTACTATGTTATTAACAGATCGAAACTTCAATACCTC Lucernaria_janetae GGTGCCTTTGCCGGAATGGTAGGAACCGCCTTTAGTATGCTTATCCGTTTAGAACTCTCCTGTCCAGGATCTATGTTAGGAGACGACCAACTTTATAACGTTTTAGTAACAGCCCATGCCTTTGTTATGATTTTCTTTTTAGTGATGCCTGTTATGATTGGAGGGTTTGGTAATTGACTTGTACCCCTTTACATTGGGGCTCCTGATATGGCCTTTCCTCGATTAAATAACGTTAGTTTTTGATTGTTACCTCCAGCCCTAATCCTTTTATTAGGCTCTTCTTTGGTAGAGCAGGGTGTAGGGACAGGTTGAACCGTCTATCCCCCCCTTTCAGGTATTCAAGCCCACTCAGGTGGGGCTGTTGACATGGGAATTTTTAGCCTTCACCTAGCTGGAGCTTCTTCTATTTTAGGGGCAATGAATTTTATTACCACTATTTTTAATATGAGGGCACCAGGACTAGGCTGGGATAAACTCCCCCTTTTTGTGTGATCCGTTTTAATTACAGCCTTCCTTCTCCTGCTCTCTTTACCTGTTTTAGCAGGTGCTATTACTATGTTATTAACAGATCGGAACTTCAATACCTC Lucernaria_sainthilarei GGTGCCTTTGCCGGAATGGTAGGAACCGCCTTTAGTATGCTTATCCGTTTAGAACTCTCCTGCCCAGGATCTATGTTGGGGGACGACCAACTTTATAACGTTTTAGTAACAGCCCATGCCCTTGTGATGATTTTCTTCTTGGTCATGCCCGTTATGATTGGAGGATTTGGTAATTGATTAGTACCCCTTTATATTGGGGCCCCTGATATGGCCTTTCCTCGATTAAACAATATTAGTTTTTGGTTATTACCCCCAGCCCTTATCCTTTTATTGGGCTCTTCTCTGGTAGAACAGGGCGTAGGGACAGGTTGAACTATTTACCCACCCCTTTCAGGAATTCAAGCCCACTCAGGTGGGGCTGTCGATATGGGAATTTTTAGTATTCATCTAGCTGGAGCCTCTTCTATTTTAGGGGCTATGAATTTTATTACTACTATTTTTAATATGAGAGCCCCAGGATTAACCTGAGATAAGCTTCCTCTTTTTGTATGGTCTGTTTTAATTACAGCCTTTCTTCTCTTACTATCTTTACCCGTATTAGCTGGGGCTATTACTATGTTACTAACAGATCGAAACTTTAATACCTC Lucernaria_sp_EPR GGTGCCTTTGCCGGAATGGTAGGAACCGCCTTTAGTATGCTTATCCGTTTAGAACTATCCTGTCCAGGATCTATGTTAGGAGACGACCAACTTTATAACGTTTTAGTAACAGCCCATGCCTTTGTTATGATTTTCTTTTTAGTGATGCCCGTTATGATTGGGGGGTTTGGTAATTGACTTGTACCCCTTTATATTGGGGCTCCTGATATGGCCTTTCCTCGATTAAATAACATTAGTTTTTGATTGTTACCTCCAGCCCTAATCCTTTTATTAGGCTCTTCTTTGGTAGAGCAGGGTGTAGGAACAGGTTGAACCGTCTATCCGCCCCTTTCAGGTATTCAAGCCCACTCAGGTGGAGCTGTTGACATGGGGATTTTTAGTCTTCACCTAGCTGGAGCTTCTTCTATTTTAGGGGCAATGAACTTTATTACCACTATTTTTAATATGAGGGCACCAGGACTAAGCTGGGATAAACTCCCCCTTTTTGTGTGATCCGTTTTAATTACAGCCTTCCTTCTCCTACTCTCTTTACCTGTTTTAGCAGGTGCTATTACTATGTTATTAACAGATCGGAACTTCAATACCTC Lucernariopsis_campanulata GGGGCCTTTTCTGGTATGGTGGGAACCGCTTTTAGTATGTTAATCAGACTAGAGCTTTCTTCCCCTGGAAGTATGTTAGGTGACGACCAACTTTATAATGTATTGGTCACAGCCCATGCTTTTATTATGATATTCTTTTTAGTTATGCCTGTTATGATAGGAGGGTTTGGTAACTGACTAGTTCCCCTTTACATTGGTGCTCCAGACATGGCTTTCCCACGATTAAATAATATTAGTTTTTGGTTGCTTCCTCCAGCTTTATTACTACTCCTCGGGTCTTCTTTAATAGAACAAGGTGTTGGAACAGGGTGAACAGTTTATCCCCCTTTATCTGGTATACAAGCCCACTCTGGTGGGGCTGTTGATATGGGAATTTTCAGTTTACATTTAGCAGGAGCCTCTTCTATTTTAGGAGCAATGAATTTTATTACTACCATATTTAATATGCGTGCACCGGGTATGACATGGGATAAATTGCCTTTATTTGTTTGGTCTGTATTAATTACAGCATTCTTATTATTACTTTCCCTACCAGTATTAGCAGGGGCTATTACTATGTTATTAACAGATAGGAACTTTAATACATC Lucernariopsis_cruxmelitensis GGGGCCTTTGCGGGAATGGTAGGTACCGCTTTTAGTATGCTTATTCGATTGGAGCTTTCATCTCCCGGCAGTATGTTAGGCGACGATCAACTCTACAATGTATTAGTGACAGCCCATGCTTTCGTTATGATTTTCTTTTTAGTAATGCCCGTCATGATTGGGGGTTTTGGTAATTGGTTGGTTCCTCTTTATATAGGAGCCCCCGATATGGCCTTCCCTCGATTGAATAATATTAGCTTTTGACTTCTACCTCCAGCCTTACTCCTACTTTTAGGGTCCTCCCTGATTGAACAGGGGGTAGGTACGGGGTGAACTGTCTATCCCCCTCTGTCAGGCATTCAAGCGCATTCGGGTGGGGCAGTAGATATGGGTATCTTTAGCTTGCATTTAGCCGGTGCTTCTTCTATTCTAGGGGCTATGAATTTTATTACCACTATTTTTAATATGAGAGCCCCTGGGCTAAGTTGGGACAAACTGCCCCTCTTTGTCTGGTCTGTTCTTATCACCGCCTTTTTACTTCTTCTCTCTTTACCCGTCTTAGCCGGAGCTATTACCATGCTTTTAACAGACCGTAATTTTAATACCTC Lucernariopsis_sp_NZ GGGGCTTTTTCTGGAATGGTAGGTACAGCTTTTAGTATGCTTATTAGGTTAGAATTGTCTTCCCCTGGAACTATGCTAGGGGACGATCAACTTTATAATGTGTTAGTCACAGCCCATGCGTTTGTAATGATCTTTTTTTTGGTAATGCCTGTTATGATTGGAGGGTTTGGTAACTGGTTAGTACCCTTATACATTGGGGCCCCAGATATGGCCTTCCCTCGTCTTAACAATATTAGCTTTTGACTTTTACCCCCTGCTTTAATACTTTTATTAGGGTCTTCCCTTATAGAACAAGGGGTAGGAACCGGGTGAACAGTCTATCCCCCATTATCGGGAATTCAAGCTCATTCTGGGGGTGCTGTAGATATGGGGATTTTTAGCCTACATTTGGCTGGAGCTTCCTCTATTTTAGGGGCCATGAACTTTATTACTACTATTTTTAACATGA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Lucernariopsis_vanhoeffeni GGTGCTTTTTCAGGTATGGTCGGAACAGCCTTTAGTATGTTAATACGTTTAGAGTTATCTTCTCCTGGTAGTATGTTAGGGGACGATCAACTTTACAATGTATTGGTTACTGCCCATGCTCTTGTTATGATTTTCTTTTTAGTTATGCCTGTTATGATTGGAGGATTTGGTAATTGGTTAGTACCTCTTTATATTGGGGCACCTGATATGGCTTTCCCTCGACTTAATAATATTAGCTTTTGGTTATTACCTCCTGCTTTAATTTTACTATTGGGTTCTTCTCTTATAGAACAAGGCGTAGGTACAGGTTGAACTGTTTATCCCCCTTTATCTGGTATTCAGGCCCACTCAGGTGGGGCAGTAGATATGGGTATTTTTAGCCTACATTTAGCTGGAGCTTCTTCTATTTTAGGGGCTATGAATTTTATTACCACTATTTTTAATATGAGAGCCCCAGGCCTTGGTTGGGATAAACTCCCCCTTTTTGTTTGATCTGTATTAATTACAGCTTTTTTACTTCTTCTTTCTTTACCTGTTTTAGCTGGAGCTATTACCATGCTTTTAACTGATCGTAATTTTAATACCTC Manania_gwilliami GGTGCTTTTGCTGGTATGATAGGTACTGCTTTTAGTATGCTTATTCGTTTAGAATTATCCGCTCCTGGAAGCATGTTGGGGGACGATCAACTCTATAATGTTCTCGTCACTGCTCATGCCTTTGTTATGATTTTCTTCTTAGTTATGCCTGTCATGATAGGAGGATTTGGTAATTGGTTAGTTCCTCTCTATATAGGAGCTCCTGATATGGCTTTTCCTCGTTTAAATAACATTAGTTTTTGACTTCTTCCCCCAGCTCTTATTTTACTTTTAGGTTCTTCTTTAGTAGAACAAGGGGTTGGGACAGGATGAACAGTTTATCCTCCTTTATCTGGAATTCAAGCTCATTCAGGAGGAGCTGTTGATATGGGTATTTTTAGCCTTCATTTAGCGGGAGCTTCTTCTATTCTAGGGGCTATGAATTTTATCACCACAATTTTTAATATGCGGGCCCCAGGAATGACTTGGGACAAGCTCCCTCTTTTTGTTTGATCAGTTTTAATTACTGCTTTTCTTCTTCTTCTTTCTTTACCCGTTTTAGCCGGAGCTATTACTATGCTTCTAACTGATCGAAATTTTAATACTTC Sasakiella_cruciformis GGTGCTTTTTCAGGCATGGTAGGTACAGCTTTTAGCATGCTGATTCGTTTAGAGTTATCTTCTCCAGGTAGTATGTTGGGAGATGACCAACTCTATAACGTCTTAGTTACCGCTCATGCCTTAATTATGATTTTCTTCTTAGTTATGCCTGTTATGATCGGGGGGTTTGGAAACTGATTAGTTCCCCTATATATCGGAGCCCCTGATATGGCTTTCCCTCGTCTTAATAATATAAGTTTTTGACTTCTTCCTCCTGCCCTTATTTTATTACTAGGTTCTTCACTGATTGAACAAGGAGTTGGTACTGGATGAACTATATATCCTCCTCTATCTGGTATTCAAGCACACTCCGGTGGAGCCGTTGATATGGGTATTTTCAGTCTTCACTTAGCTGGAGCATCCTCCATATTAGGGGCTATGAATTTTATCACTACCATCTTTAACATGAGAGCTCCTGGTTTAAGCTGAGACAAACTACCCTTATTTGTCTGATCAGTTTTGATTACGGCCTTTTTACTCCTTCTTTCCTTACCTGTTTTAGCCGGTGCAATTACCATGCTCTTGAC--------------------- Stenoscyphus_inabai GGTGCCTTCTCAGGAATGGTTGGTACAGCTTTTAGTATGTTAATACGCCTTGAATTATCTGCCCCAGGTACTATGTTAGGGGACGATCAACTTTATAATGTTCTAGTGACAGCCCATGCTTTCGTGATGATTTTCTTCCTCGTGATGCCAGTTATGATTGGTGGGTTTGGTAATTGGTTAGTTCCTCTATATATTGGGGCCCCTGATATGGCTTTCCCCCGCCTTAACAACATTAGTTTCTGACTCTTACCCCCAGCCCTTATTCTTCTCTTAGGGTCCTCCCTCATTGAACAGGGCGTTGGTACCGGGTGAACAGTTTATCCCCCTCTCTCAGGTATTCAAGCCCATTCTGGGGGTGCCGTTGATATGGGGATTTTCAGTTTGCATTTAGCTGGGGCTTCATCTATTTTAGGAGCTATGAACTTCATTACGACTATTTTTAATATGCGTGCCCCAGGGGTAACTTGGGATAAATTACCCCTATTTGTTTGGTCAGTTTTAATAACAGCTTTTTTACTTCTTCTATCCTTACCTGTATTAGCAGGGGCAATTACCATGCTTCTTACTGATAGAAATTTCAATACATC Stenoscyphus_sp_AUS GGTGCCTTTTCAGGAATGGTGGGTACAGCTTTCAGTATGCTAATCCGCCTTGAATTATCTGCCCCAGGTACTATGTTAGGGGACGATCAACTTTATAATGTTTTAGTAACAGCTCATGCTTTTGTTATGATTTTCTTCCTTGTTATGCCAGTTATGATTGGTGGGTTTGGGAATTGACTAGTTCCCCTTTACATTGGAGCCCCCGACATGGCTTTTCCCCGTTTAAACAATATTAGCTTTTGACTTTTACCCCCAGCTTTAATTCTTTTACTAGGGTCCTCTTTAGTTGAACAAGGTGTGGGTACTGGTTGAACAGTTTACCCTCCCCTTTCAGGTATCCAAGCTCATTCCGGTGGTGCTGTTGACATGGGAATTTTTAGCCTTCACTTAGCTGGTGCTTCATCTATATTAGGAGCTATGAACTTTATCACCACTATTTTTAATATGCGTGCCCCAGGAGTAACTTGGGATAAGCTTCCCTTATTTGTTTGATCAGTTCTAATCACAGCCTTTTTACTACTCCTATCTTTGCCTGTACTAGCAGGAGCAATTACTATGCTTTTAACTGATAGGAATTTTAACACATC ; END; [ The following blocks are output data for analysis step 17943 ] BEGIN TREES; TITLE 'Staurozoa COI_parsimony'; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep17943; TREE 'COI_parsimony_tree' = [&R] ((Craterolophus_convolvulus_GERMANY:0.1,Craterolophus_convolvulus_UK:0.0):3.697524,(Lucernariopsis_vanhoeffeni:1.917361,((Manania_gwilliami:4.495605,(Kishinouyea_sp_SAF:6.188901,(Sasakiella_cruciformis:5.391667,Kishinouyea_sp_MOOREA:6.104801):2.858692):4.108989):1.969818,((Lucernariopsis_sp_NZ:1.832742,(Lucernariopsis_cruxmelitensis:4.705236,((Lipkea_ruspoliana:6.296152,Lipkea_sp_JAPAN:5.388163):3.359301,(Lucernaria_sainthilarei:2.400508,(Lucernaria_bathyphila_DEEPSEA:1.416285,(Lucernaria_janetae:1.417963,Lucernaria_sp_EPR:0.397009):0.934199):1.812179):4.052523):3.07626):2.900871):3.067918,((((Depastromorpha_sp_AUS:4.204966,(Kishinouyea_sp_NZ:2.566002,(Depastromorpha_africana:5.844037,Lucernariopsis_campanulata:3.50286):2.246575):3.659241):2.973537,(Stenoscyphus_sp_AUS:3.13442,(Haliclystus_tenuis:6.128608,Stenoscyphus_inabai:3.012289):3.343129):2.74213):2.556745,(Haliclystus_californensis:3.552697,(Haliclystus_antarcticus_ANT:3.226636,Haliclystus_sanjuanensis:1.923717):2.190816):1.989025):2.433819,(Haliclystus_octoradiatus:4.486877,Haliclystus_stejnegeri:2.857365):3.139279):2.801822):2.883265):2.604968):3.697524); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr94312] END;