#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 23, 2024; 21:59 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Pennington R., Lavin M., Prado D., A pendry C., Pell S., & Butterworth C. 2003. Neotropical seasonally dry forest plants show patterns of both Tertiary and Quaternary diversification. Philosophical Transactions of the Royal Society B, null. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1036] [ The following blocks are input data for analysis step 1808 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep1808; DIMENSIONS NTAX=75; TAXLABELS Coursetia_andina Coursetia_axillaris Coursetia_brachyrhachis Coursetia_caribaea_1064 Coursetia_caribaea_892 Coursetia_caribaea_chi_4514 Coursetia_caribaea_och_1063 Coursetia_caribaea_tri_5189 Coursetia_chiapensis Coursetia_dubia Coursetia_elliptica Coursetia_ferruginea Coursetia_fruticosa Coursetia_glabella Coursetia_glandulosa_4671 Coursetia_glandulosa_5347 Coursetia_gracilis Coursetia_grandiflora Coursetia_hassleri_5805 Coursetia_hassleri_6937 Coursetia_hidalgoana Coursetia_hintonii Coursetia_insomniifolia Coursetia_madrensis Coursetia_maraniona_745 Coursetia_maraniona_948 Coursetia_mollis_1039 Coursetia_mollis_1048 Coursetia_oaxacensis Coursetia_paniculata Coursetia_planipetiolata Coursetia_polyphylla Coursetia_pumila Coursetia_rostrata_1062 Coursetia_rostrata_930 Coursetia_vicioides Genistidium_dumosum Gliricidia_brenningii Gliricidia_ehrenbergii Gliricidia_maculata Gliricidia_robustum Gliricidia_sepium Hebestigma_cubense Lennea_melanocarpa Lennea_modesta Lennea_viridiflora Olneya_tesota Peteria_glandulosa Peteria_scoparia Peteria_thompsoniae_6157 Peteria_thompsoniae_7048_2 Poissonia_heterantha_5832 Poissonia_heterantha_5860 Poissonia_hypoleuca_121088 Poissonia_hypoleuca_5787 Poissonia_orbicularis Poissonia_weberbaueri_917 Poissonia_weberbaueri_918 Poitea_campanilla Poitea_carinalis Poitea_dubia Poitea_florida Poitea_galegoides Poitea_glyciphylla Poitea_gracilis Poitea_immarginata Poitea_multiflora Poitea_paucifolia Poitea_punicea Robinia_hispida Robinia_neomexicana_190789 Robinia_neomexicana_717 Robinia_pseudoacacia Robinia_viscosa Sphinctospermum_5120 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M638] TITLE Fabaceae; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep1808; DIMENSIONS NCHAR=745; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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TCATTGTCAATGCCTC---AAAAGCAATCGACCCGTGGACCCGTC--CCTTCGGTTAATCGGGG-CTGGC-TCGGGGTGCTTAGCTCC-TCGA--------CCACCCCTGTG--CTAGGGGGTGTGGGTCACCT-------CGTGGCCCCCATCCTC--TCAGCCTCG--AACAAAAAACCCC-GGCGCGGAAAGCGTCAAGGAATCGAAATTC-----TTTACACGTGCTCGCGTCTACCCG----GGGGCGTT-GCCCGCACGGG-TGGCGTTGCAGC-ACGTTATGTACAA-----TGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCATTAGGCTGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACACGCTGTTGCCCC--GAA----GCCAATCGCCTCACCGCGC----GTG-----GGCA-TTTGCCAGGGG---TGAATGTTGGCCTCCCGTGAGC--CTCGTCTCGCGGTTGGTTGAAAC-TCGAGTGCATGGTGTTGGGTG-GCCATGATGGATGGTGG-CT-GAGCGA-----TGCTC-GAGA-CCAA-TCATGTG--CGACCCCTCC----GTGATCGCGCTCGGAGACCCACA--TGCATCC-------CAGGATGCTCC-TAGATGAGACCTCAGGTCAGGCGG ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = Fabaceae) = N: 1-745; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = Fabaceae) = N: 1-745; END; [ The following blocks are output data for analysis step 1808 ] BEGIN TREES; TITLE Tb6583; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep1808; TREE Fig._7 = [&R] ((Hebestigma_cubense,((Lennea_modesta,Lennea_melanocarpa),Lennea_viridiflora)),((((Poitea_immarginata,((Poitea_galegoides,Poitea_campanilla),(Poitea_multiflora,Poitea_glyciphylla))),((((Poitea_florida,Poitea_punicea),Poitea_carinalis),(Poitea_paucifolia,Poitea_dubia)),Poitea_gracilis)),(((Gliricidia_robustum,(Gliricidia_maculata,Gliricidia_sepium)),Gliricidia_ehrenbergii),Gliricidia_brenningii)),(((((((Coursetia_elliptica,(Coursetia_polyphylla,Coursetia_chiapensis)),((Coursetia_oaxacensis,(Coursetia_madrensis,Coursetia_planipetiolata)),Coursetia_paniculata)),((((Coursetia_ferruginea,(Coursetia_brachyrhachis,(Coursetia_fruticosa,(Coursetia_maraniona_948,Coursetia_maraniona_745)))),(((Coursetia_glandulosa_4671,Coursetia_glandulosa_5347),((((((Coursetia_pumila,Coursetia_hidalgoana),Coursetia_glabella),Coursetia_caribaea_tri_5189),(((Coursetia_caribaea_1064,Coursetia_caribaea_892),Coursetia_andina),Coursetia_caribaea_chi_4514)),(Coursetia_hassleri_5805,(Coursetia_hassleri_6937,(Coursetia_mollis_1039,Coursetia_mollis_1048)))),Coursetia_caribaea_och_1063)),((Coursetia_dubia,Coursetia_grandiflora),Coursetia_gracilis))),(Coursetia_vicioides,(Coursetia_rostrata_930,Coursetia_rostrata_1062))),Coursetia_hintonii)),(Coursetia_axillaris,Coursetia_insomniifolia)),Sphinctospermum_5120),(Genistidium_dumosum,((Peteria_scoparia,Peteria_glandulosa),(Peteria_thompsoniae_7048_2,Peteria_thompsoniae_6157)))),(((((Poissonia_hypoleuca_5787,Poissonia_hypoleuca_121088),Poissonia_orbicularis),((Poissonia_heterantha_5860,Poissonia_heterantha_5832),(Poissonia_weberbaueri_918,Poissonia_weberbaueri_917))),(((Robinia_hispida,Robinia_viscosa),Robinia_pseudoacacia),(Robinia_neomexicana_190789,Robinia_neomexicana_717))),Olneya_tesota)))); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr1251] END;