#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on September 15, 2025; 13:59 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Gurgel C., Fredericq S., & Norris J. 2003. Phylogeography of Gracilaria tikvahiae (Gracilariaceae, Rhodophyta): a study of genetic discontinuity in a continuously distributed species based on molecular evidence. Journal of Phycology, null. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1068] [ The following blocks are input data for analysis step 1881 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep1881; DIMENSIONS NTAX=21; TAXLABELS Gracilaria_damaecornis Gracilaria_lacinulata Gracilaria_tikvahiae_isolate_01 Gracilaria_tikvahiae_isolate_02 Gracilaria_tikvahiae_isolate_03 Gracilaria_tikvahiae_isolate_04 Gracilaria_tikvahiae_isolate_05 Gracilaria_tikvahiae_isolate_06 Gracilaria_tikvahiae_isolate_07 Gracilaria_tikvahiae_isolate_08 Gracilaria_tikvahiae_isolate_09 Gracilaria_tikvahiae_isolate_10 Gracilaria_tikvahiae_isolate_11 Gracilaria_tikvahiae_isolate_12 Gracilaria_tikvahiae_isolate_13 Gracilaria_tikvahiae_isolate_14 Gracilaria_tikvahiae_isolate_16 Gracilaria_tikvahiae_isolate_17 Gracilaria_tikvahiae_isolate_18 Gracilaria_tikvahiae_isolate_19 Gracilaria_tikvahiae_isolate_20 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M696] TITLE 'chloroplast rbcL gene (RUBISCO large subunit)'; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep1881; DIMENSIONS NCHAR=1466; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = 'chloroplast rbcL gene (RUBISCO large subunit)') = N: 1-1466; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = 'chloroplast rbcL gene (RUBISCO large subunit)') = N: 1-1466; END; [ The following blocks are output data for analysis step 1881 ] BEGIN TREES; TITLE Tb6656; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep1881; TREE ML = [&R] 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TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr5839] END;