#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on September 09, 2025; 23:10 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Gottlieb A., Giberti G., & Poggio L. 2003. Molecular analyses of the genus Ilex (Aquifoliaceae) in southern South America, evidence from AFLP and ITS sequence data. American Journal of Botany, null. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1091] [ The following blocks are input data for analysis step 1943 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep1943; DIMENSIONS NTAX=48; TAXLABELS Helwingia_chinensis Helwingia_japonica Ilex_amelanchier Ilex_anomala Ilex_argentina Ilex_argentina_Gbk Ilex_beecheyi Ilex_brasiliensis Ilex_brevicuspis Ilex_buergeri Ilex_canariensis Ilex_cassine Ilex_collina Ilex_cornuta Ilex_crenata Ilex_decidua Ilex_dimorphophylla Ilex_dumosa_dumosa Ilex_dumosa_guaranina Ilex_glabra Ilex_integerrima Ilex_integra Ilex_kiusiana Ilex_latifolia Ilex_liukiuensis Ilex_macropoda Ilex_maximowicziana Ilex_mertensii Ilex_micrococca Ilex_microdonta Ilex_microdonta_Gbk Ilex_mitis Ilex_mucronata Ilex_mutchagara Ilex_opaca Ilex_paraguariensis Ilex_pedunculosa Ilex_percoriacea Ilex_pseudobuxus Ilex_rotunda Ilex_rugosa Ilex_serrata Ilex_taubertiana Ilex_theezans Ilex_theezans_Gbk Ilex_vomitoria Ilex_warburgii Ilex_yunnanensis ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M2483] TITLE ITS_241; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep1943; DIMENSIONS NCHAR=822; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Helwingia_chinensis C--AAAATAGAC-CC-GCGAACA-TGTT-----------CA--T-C---CA-TC---GGGGG-TTG-GC-G--A--GGGGTGCGCGAG----CCCCC-AAT-C-CAC---CCCC-T---------CT-C--C--GGCGA-TGCT---GC-TT-TGAA---T-TGT--CGCCA-ATGC-GGTGGCATCCATTGTT-GT-G-TCGACTGAAC---AACGAA---CCCCGGCGCAAACAAGCGCCAAGGAACCATAACACAAAG-AGCCAG-TCT-TCGAAAGC-CCCGTACGCGGTGCGC--TT----G-GGAGG{CT}GTT-GGCGTC-TTTAA---AATCATCATAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACATGTCACGTCGC--------CC-C-CAA------CC--C-----AC------TCC------------A--CACACGA-ATTGC--GGTGTTGCTTTG---G---GG-G-CGGAGATTGGCCTCCCAT--A--CAAAA-TA---A---GCT-TGCGTGGTTGG-CCT-----------A-AA-A-G-CGAGTGCTCGG-G--GATGGGTC-TCACGATAAGTGGTGGTTAAATATG-C-CTC-TTGCGT-AT-TATCGCGA-G-A--CAA--CC-CA-T---CTCCGGCGTGT-G-CTC--TTT-GAGA--C-C-----------C-------C--A------AT--G-ACGATGCTT-CGATT Helwingia_japonica C--AAAATAGAC-CC-GCGAACA-TGTT-----------CA--T-C---CA-TC----GGGG-TTG-GC-G--A--GGGGTGCGCGAG----CCCCC-AAT-C-CAC---CCCC-T---------CT-C--C--GGCGA-TGCT---GC-TT-TGAA---T-TGT--CGCCA-ATGC-GGTGGCATCCATTGTT-GT-G-TCGACTGAAC---AACGAA---CCCCGGCGCAAACAAGCGCCAAGGAACCATAACACAAAG-AGCCAG-TCT-TCGAAAGC-CCCGTACGCGGTGCGC--TT----G-GGAGGCGTT-GGCGTC-TTTAA---AATCATCATAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACATGTCACGTCGC--------CC-C-CAA------CC--C-----AC------TCC------------A--CACACGG-ATTGC--GGTGTTGCTTTG---G---GG-G-CGGAGATTGGCCTCCCAT--A--CAAAA-TA---A---GCT-TGCGTGGTTGG-CCT-----------A-AA-A-G-CGAGTGCTCGG-G--GATGGGTC-TCACGATAAGTGGTGGTTAAATATG-C-CTC-TTGCGT-AT-TATCGCGA-G-A--CAA--CC-CA-T---CTCCGGCGTGT-G-CTC--TTT-GAGA--C-C-----------C-------C--A------AT--G-ACGATGCTT-CGATT Ilex_amelanchier C--AAAGTAGAC-CCGGTGAACT-TGTT-----AAA--ACA--T-G---C--C--C-GGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGCGAG--CCCCCCC-GA--CACACT--CCCC-CA--------CC-T--C--GG-GA-T-TT--GGC-TTGTG-----T-T-C-CC-CT--A-GC-GG-GG-ACTCG--GTC-AA-GCTC--CCA-AC---AACGAA---CCCCGGCGC-TGTCTGCGCCAAGGAACCATAAC-TGAAG-AGCTGG-CCTCCCG-ATGT-CCCGTTCGCGGTGTGC--AC----G-GGAGGCATT-TGCATC-TTTCG---AATC----TAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTTG---------CC-C-CAA----CCCC--C----AATT-----CCTATA-T-------A-GT-TG-GATATTGT--GT-A-AG--TT----G---GG-GCCGGAAATTGGCCTCCCGT--C--C---A-C----G---ACCGTGAGCGGTTGG-CCC-----------A-AA-A-AATGAGT-TCTTG-A-CGATGGA-CGTCACGACAAGGGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCATCA--TGTCGTGAGGCA-CCTAGTCTGTAGCGAGCTCTAAC-CGT-GACCCTATAT-G-CG--C-C--------TT-C---T-T-C--A------GT--G-ATGGTGCTT-CGACC Ilex_anomala C--AAAGTAGAC-CCGGCGAACT-TGTT-----AAA--ATA--T-G---CA-T-----GGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGCGAG---CCCCCC-AA--CACACT--CCCC-CA--------CC-T--C--GG-GA-T-TT--GGC-TTGTG-----T-T-C-AC-CT--A-GT-GG-AG-ACTCG--GTCAAA-GGTC--CCG-AC---AACGAA---CCCCGGCGC-TATATGTGCCAAGGAACCATAAC-TGAAG-AGCTGG-CCTCTCG-ATGT-CCCGTTCGCGGTGTGC--AC----G-GGAGGCATT-TGCATC-TTTTG---AATC-T-ATAAAATGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG---------CC-C-CAA-----CCC--C----AA---------T------------G--C-TG-GATATTAC--GG-G-AG--TTG---G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--A--C---A-C----G---GCTGTGCGCGGTTGG-CCC-----------A-AA-A-ATTGAGC-TCTGG-A-CGATGGA-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCATCA--AGTTGTGAGGCA-CCAAGTCTGTAGCGAGCTCTGAC-TGT-GACCC--TGT-G-CA--C-C--------TT-C---T-T-T--A------G--GGAATGGTGCTT-CGACT Ilex_argentina C--AAAGTAGAC-CCGGCGAACT-TGTT-----AAA--ATATTTGG---G--C----GGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGCGAG--CCCCCCC-GA--CACACT--CTCC-CA--------CC-C-AC--GG-GA-T-TT--GGC-TTGCG-----T-T-C-CC-CT--A-GT-GG-GG-ACCCG--GTC-GA-CCTC--CCG-AC---AACGAA---CCCCGGCGC-TGTCTGCGCCAAGGAACCTTAAC-TGAAG-AGCTAG-CCCCCTG-ATGT-CCCGTTCGCGGTGTGC--AC----G-GGAGGCATT-TGCGTC-TTTTG---AATC----TAAAATGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCA---------CC-C-CAA-----CCC--C----AATG-----CCTG-GCT-ACCA--G--C-TG-GACGTTGC--GG-G-AG--CT----G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--C--C---A-C--ACG---ACCGTGTGCGGTTGG-CCC-----------AAAA-A-AATGAGC-TCTTG-A-CGATGGA-CGTCACCACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCATC--TAGTCGTGAGGCA-CCGAGTCTATAGCGAGCTCTGAT-CGT-GACCC--TGT-G-CA--C-C--------TT-C--TTAT-T--A------G-GGG-ATGGTGCTT-TGACC Ilex_argentina_Gbk C--AAAGTAGA--CCGGCGAACT-TGTT-----AAA--ACA--T-G---C--T--G-GGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGTGAG--CCCCCCC-AA--CACACT-CCCCC-CA--------CC-T--C--GG-GA-T-TTC-GGC-TTGCG-----T-C-C-CC-CT--A-GC-GG-GG-ACTCG--GTC-AA-GCTC--CCG-ACAA-AACGAA-C-CCCCGGCGC-TATCTGCGCCAAGGAACCACAAC-TGAAG-AGCTGG-CCTCCCG-ATGT-CCCGTTCGCGGTGTGC--AC----G-GGAGGCATCATGCATC-TTTTG---AATC----TAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG--CCCC---CC-CTCCA-----CCC--C----AATG-CCCACCTA-G------------C-TG-GATATTGT--GG-G-AG--TC----G-TCGGCG-CGGAAATTGGTCTCCCGT-CC-GC---A-C----G---ATCGGGAGCGGTTGG-CCC----------AA-AA-A-AATGAGC-TCTTG-A-CGATGGA-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCATCA--CGTCGTGAGGCA-CCGAGTCTGTGGCGAGCTCTAAC-CGT-GACCC--TGC-G-CA--C-C--------TT-C---T-T-C--A------GC--G-ATGGTGCTT-CGACC Ilex_beecheyi C--AAAGTAGAC-CCGGCGAACT-CGTTA----AAAT-ATA--T-GG--C--T----GGGGGTCTGGG--A--A--GGGGTGCGCGAG---CCCCCC-AA--CACACT--CCCC-CA-GCC---CGC-T--C--GG-GA-T-TT--GGC-TTGCG-----T-T-C-CC-CT--A-GC-GG-GG-ACTTG--GCC-AA-GCTC--CCG-AC---AACGAA---CCCCGGCGC-TGTCTGCGCCAAGGAACCACAAC-TGAA--GGCTGG-CCTCTCG-ATGT-CCCGTTCGCGGTGTGCA-AC----G-GGAGGCATT-TGCATC-TTTTG---AATC----TAAAATGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAACCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG--------------C-------CCC--C----AA-------CCC---------------C-----A-ATTGC--GG-G-AG--TCG---G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--C--C---A-C----G---AACGTGCACGGTTGG-CCC--A--------A-AA-A-AATGAGT-TCTTG-A-CGATGGA-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCGTCA--TGTCGTGAGGCA-CCAAGTCTGTAGCGAGCTCTGAC-CGT-GACCC--TGT-G-CA--C-C--------TC-C---T-T-C--G-------C-GG-ATGGTGCTC-CGACC Ilex_brasiliensis C--AAAGTAGAC-CCGGCGAACT-TGTT-----AAA--ATATTTGG---C--C---GGGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGCGAG--CCCCCCC-GA--CACACT--CCCC-CG-------CCC-C--C--GG-GA-T-TT--GGC-TTGCG-----T-T-C-CC-CT--A-GC-GG-GG-ACCCG--GCC-TA-GCTC--CCG-AC---AACGAA---CCCCGGCGC-TGTCTGCGCCAAGGAACCTTAAC-TGAAGAAGCTAGCCCCCCC--GTGT-CCCGTTCGCGGCGTGC--AC----G-GGAGGCATT-TGCGTC-TTTTG---AATC----CAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG---------CC-C-CAA-----CCC--C----AATG-----CCTG-GCT-ACCA--G--C-CG-GACGTTGC--GG-G-AG--TT----G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--C--C---A-C--ACG---ACCGTGTGCGGTTGG-CCC--------A--AAAA-A-AATGAGC-TCTC--ACCGATGGG-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCATC--TAGTCGTGAGGCA-CCGAGTCTACAGCGAGCTCTGAT-CGT-GACCC--TGC-G-CA--C-C--------TT-C--TTAT-T--A-----GG-GGG-ATGGTGCTT-TGACC Ilex_brevicuspis C--AAAGTAGAC-CCGGCGAACT-TGTT-----AAA--ATATTTGG---C--C----GGGGGTTTGAG--A--A-GGGGGTGCGCGAG--CCCCCCC-GA--CACACT--CCCC-CG-------CCC-C-TC--GG-GA-T-TT--GGC-TTACG-----T-T-C-CC-CT--A-CT-GG-GG-ACCCG--GTC-GA-GCTC--CCG-AC---AACGAA---CCCCGGCGC-TGTCTGCGCCAAGGAACCTTAAC-TGAAG-AGCTGGCCCCCCCG-ATGT-CCCGTTCGCGGTGTGC--AC----G-GGAGGCATT-TGCGTC-TTTTG---AATC----TAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG---------CC-C-CAA-----CCC--C----AATG-----CCTG-GCT-ACTA--G--C-TG-GACGTTGC--GG-G-AG--CT----G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--C--C---A-C--ACG---ACCGTGCGCGGTTGG-CCC-------AA--AAAA-A-AATGAGC-TCTTG-A-CGATGGA-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GGC-CTC-TTGCATC--TAGTCGTGAGGCA-CCGAGTCTGTAGCGAGCTCTGAT-CGT-GACCC--TGT-G-CA--C-C--------TC-C--TTAT-T--A------G-GGT-ATGGTGCTT-CGACC Ilex_buergeri CA-AAAGTAGAC-CCGGCGAACT-TGTT-----AAA--ATA--T-GC--C--T----GGGGGTTTGAA--A--A--GGGGTGCGCGAG---CCCCCC-AA--CACACT--CCCC-CA-GCC---CCC-T--C--GG-GA-T-TT--GGC-TTGCG-----T-T-C-CC-CT--A-GC-GG-GG-ACTCG--GTC-AA-GCTC--CCG-AC---AACGAA---CCCCGGCGC-TATTTGCGCCAAGGAACCATAAC-TGAAG-GGCTGG-CCTCCCG-ATGT-CCCGTTCGCGGTGTGC--AG----G-GGAGGCATT-TGCATC-TTTTG---AATC----TAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG---------CCAC-CAA-----CCC--C----AATG-----CCCA-----------G--C-TG-GATATTGC--GG-G-AG--TTG---G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--C--C---A-T----G---AACGCGCGCGGTTGG-CCC-----------A-AA-A-AATGAGT-TCTTG-A-CGATGGA-CGTCACGGCAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCGTCA--TGTCGTGAGGCA-CCAAGTCTGTAGCGAGCTCTGAC-CGC-GACCC--TGT-G-CA-CC-C--------TTCC---T-T-C--A-------C-GG-ATGGTGCTC-CGACC Ilex_canariensis C--AAAGTAGAC-CCGGCGAACC-CGTT-----AAA--ACA--T-G---C-CT----GGGGGTTTGAG--A--A--GGGGCGCGCAAG---CCCCCC-GA--CGCACT--CCCC-CA------CCCC-C--C-GGG-GG-T-TT--GGC-TTGGG-----T-T-C-CC-CT--A-GC-GG-GG-ACCCG--GTC-AG-GCTC--CCG-GC---AACGAA---CCCCGGCGC-TGTCTGCGCCAAGGAACCTTAAC-AGAAG-AGCTGG-CCCCCCG-GTGTCCCCGTTCGCGGTGTGC--AC-T--G-GGAGGCATT-TGCGTC-TTTCG---AATC----TGAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGCGAACCATCGAGCTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCGTTAGGCCAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACCCATCACGTCG------C--CC-C-CAA-----CCC--C----AATG-----CCTG-GCT----A--G--C-CG-GGTATCGC--GG-G-AG--TT----G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--C--C---A-C--AGG---ACCGTGCGCGGTTGG-CCC----A---A--AAAACA-AATGAGT-TCCTG-A-CGATGGG-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCGTCA-T-GTCGTGGGGCA-CCGAGTCTATGGCGAGCTCCGAC-CGG-GACCC--TGC-G-CA--CAC--------TC-C---T-C-C--G------G-GGG-ATGGTGCTC-CGACC Ilex_cassine C--AAAGTAGA--CCGGCGAACT-TGTT-----AAA--ACA--T-G---C--T--G-GGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGTGAG--CCCCCCC-AA--CACACT-CCCCC-CA--------CC-T--C--GG-GA-T-TTC-GGC-TTGCG-----T-C-C-CC-CT--A-GC-GG-GG-ACTCG--GTC-AA-GCTC--CCG-ACAA-AACGAA-C-CCCCGGCGC-TATCTGCGCCAAGGAACCACAAC-TGAAG-AGCTGG-CCTCCCG-ATGT-CCCGTTCGCGGTGTGC--AC----G-GGAGGCATCATGCATC-TTTTG---AATC----TAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG--CCCC---CC-CTCCA-----CCC--C----AATG-CCCACCTA-G------------C-TG-GATATTGT--GG-G-AG--TC----G-TCGGGG-CGGAAATTGGCCTCCCGT-CC-GC---A-C----G---ATCGTGAGCGGTTGG-CCC----------AA-AA-A-AATGAGC-TCCTG-A-CGATGGA-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCATCA--CGTCGTGAGGCA-CCGAGTCTGTGGCGAGCTCTAAC-CGT-GACCC--TGC-G-CA--C-C--------CT-C---T-T-C--A------GC--G-ATGGTGCTT-CGACC Ilex_collina C--AAAGTAGA--CCCGCGAACT-TGTT-----AAA--ATA--T-G---C--T----GGGGGTTTGAG--GTTAG-GGGGTGCGCGAG--CCCCCCC-AA--CACACT--CCCC-CA--------CC-T--C--GG-GA-T-TT--GGCTTTGTG-----T-T-C-CC-CT--A-GT-GG-GG-ACTCG--GTC-AG-GCTC--CCG-AC-A-AACGAA---CCCCGGCGC-TATCTGCGCCAAGGAATCATAAC-TGAAG-AGCTGG-CCTCCCG-ATGT-CCCGTTCGCGGCGCGC--AC----G-GGGGGCATT-TGCATC-TTTTG---AATC----TAAAA{CT}GACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG---------CC-C-CAA-----CCC--C----AATG-----CCTA-G------------T-TG-GATATTGT--GG-G-AG--TT----G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--C--C---A-T----G---ACCGTGAGCGGTTGG-CCC-----------A-AA-A-AATGAGT-TCTTG-A-CGATGGA-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCATCA--TGTCGTGAGGCA-CCTAGTCTGTAGCGAGCTCTAAT-CGT-GACCC--TG{CT}-G-CA--C-C--------TT-C---T-T-C--A------AC--G-ACGGTGCTT-CGACC Ilex_cornuta C--AAAGTAGAC-CCGGCGAACT-TGTT--A--AAA--ATA--T-GC--C--T----GGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGCGAG---CCCCCC-AA--CACACT--CCCC-CA-GCC---CCC-T--C--GG-GA-T-TT--GGC-TTGCG-----T-T-C-CC-CT--A-GC-GG-GG-ACGCG--GCC-AA-GCTC--CCG-AC---AACGAA---CCCCGGCGC-TGTCTGCGCCAAGGAACCATAAC-TGAAG-GGCTGG-CCTCCCG-GTGT-CCCGTTCGCGGCGTGC--AC----G-GGAGGCATT-TGCATC-TTTTG---AATC----TAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCCCGTCG---------CCAC-CAA-----CCC--C----AATG-----CCCA-----------G--C-CG-GATATTGC--GG-G-AG--TTG---G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCC?GT--T--?---A-C----G---AACGTGCGCGGTTGG-CCC-----------A-AA-A-AATGAGT-TCTTG-A-CGATGGA-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCGTCA--TGTCGTGAGGCA-CCAAGTCTGTAGCGAGCTCTGAC-CGC-GACCC--TGT-G-CA-CC-C--------TT-C---T-T-C--A-------C-GG-ATGGTGCTC-CGACC Ilex_crenata C--AAAGTA{AC}A--CCGGCGAACT-TGTT-----AAA--ACA--T-G---C----CG-GGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGCGAG--CCCCCCC-AA-T-AAGGT-TCCCC-CA--------CC-T--C--CG-GA-T-TT--GGC-TTGT---TT-T-C-C-CC-CT--G-GCGGG-GA-ACTCG--GCC-CA-GCTC--CCG-AC-A-AACGAA---CCCCGGCGC-TGTTTGCGCCAAGGAACCATAAC-CGAAG-AGCTGG-TCTCCCG-GTGC-CCCGTCCGCGGTGTGC--AC----G-GGAGGCGTT-TGCGTC-TTTTG---AATC----CAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCCAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG---------CC-C-CAA-C---CCC--C---CAACGG----CCTA-G----------C-C--G-GATATTGC--GG-G-AG--TT----G---GG-G-CGGAGATTGGCCTCCCGT-CC-GC---G-C----G---ACCGTGAGCGGTTGG-CCC-----------A-AA-A-AACGAGT-TCTTG-A-CGATGGA-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TCGCATCA--CGTCGTGGGGCG-CCTAGTCTGTAGCGA--GCT--C-C---GACCC--TGT-G-CA--C-C-T-G--A-TT-CG--C-TCT--AG--G--GC--G-A-GGTGCTT-CGACC Ilex_decidua C--AAAGTAGA--CCGGCGAACT-TGTT-----AAA--ATA--T-G---C--T----GGGGGTTTGAG--AAAAG-GGGGTGCGCGAG--CCCCCCC-AA--CACACT--CCCC-CA--------CC-T--C--GG-GA-T-TT--GGCTTTGTG-----T-T-C-CC-CT--A-GC-GG-GG-ACTCG--GTC-AA-GCTC--CCG-AC-A-AACGAA---CCCCGGCGC-TATCTGCGCCAAGGAACCATAAC-TGAAG-AGCTGG-CCTCCCG-ATGT-CCCGTTCGCGGCGCGC--AC----G-GGGGGTATT-TGCATC-TTTTG---AATC----TAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG---------CC-C-CAA-----CCC--C----AATG-----CCTA-G------------C-TG-GATATCGT--GG-G-AG--TT----G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--T--C---G-C----G---ACCGTGAGCGGTTGG-CCC-----------A-AA-A-AATGAGT-TCCTG-A-CGATGGA-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCATCA--TGTCGTGAGGCA-CCTAGTCTGTAGCGAGCTCTAAC-CGT-GACCC--TGT-G-CA--C-C--------TT-C---T-T-C--A---G--A---G-ACGGTGCTT-CGACC Ilex_dimorphophylla C--AAAGTAGAC-CCGGCGAACT-TGTT--A--AAA--ATA--T-GC--C--T----GGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGCGAG---CCCCCC-AA--CGCACT--CCCC-CA-GCC---CCC-T--C--GG-GG-T-TT--GGC-TTGCG-----T-T-C-CC-CT--A-GC-GG-GG-ACGCG--GCC-AA-GCTC--CCG-AC---AACGAA---CCCCGGCGC-TGTCTGCGCCAAGGAACCATAAC-TGAAG-GGCTGG-CCTCCCG-GTGT-CCCGTTCGCGGCGTGC--AC----G-GGAGGCATT-TGCATC-TTTTG---AATC----TAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCCCGTCG---------CCAC-CAA-----CCC--C----AATG-----CCCA-----------G--C-CG-GATATTGC--GG-G-AG--TTG---G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--T--C---A-C----G---AACGTGCGCGGTTGG-CCC-----------A-AA-A-AATGAGT-TCTTG-A-CGATGGA-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCGTCA--TGTCGTGAGGCA-CCAAGTCTGTAGCGAGCTCTGAC-CGC-GACCC--TGT-G-CA-CC-C--------TT-C---T-T-G--A-------C-GG-ATGGTGCTC-CGACC Ilex_dumosa_dumosa C--AAAGTAGA--CCGGCGAACTCTGTT-----AAA--ACA--T-G---C--T-GG-GGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGCGAG--CCCCCCC-AA-TCACGCT-CCCCC-CA--------CC-T--C--GG-GA-T-CT--GG{CT}-TTGT---TT-T-C-C-CC-CT--G-GCGGG-GA-ACTCG--GCG-GA-GCTC--CCG-AC-A-AACGAA---CCCCGGCGC-TGTATGCGCCAAGGACCCATAAC-CGAA{AG}-AGCTGG-TCTCCCG-TTGT-CCCGTTCGCGGTGTGC--AC----G-GGAGGCATC-TGCGTC-TTTTG---AATC----CAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCCAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG---------CC-C-CAA-----CCC--CAAAAAACGT----CCTA-G----------G-T--G-GACATTGT--GG-G-AG--TT----G---GG-G-CGGAGATTGGCCTCCCGT-CC-AC---A-C----GT--CCCGTGAGCGGTTGG-CCC---------A-A-AA-A-AACGAGT-TCTTG-A-CGACGGA-CGTCACGGCAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTCTTTGCATCA--TGTCGTGAGGCG-CCTAGT?TGCAACGA--?CT--C-C---GACCC--TGT-G-CA--C-C-TAGTTG-TC-CG--C-TGT--AG--G--GC--G-ACGGTGCTT-CGACC Ilex_dumosa_guaranina C--AAAGTAGA--CCGGCGAACTCTGTT-----AAA--ACA--T-G---C--T-GG-GGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGCGAG--CCCCCCC-AA-TCACGCT-CCCCC-CA--------CC-T--C--GG-GA-T-CT--GGC-TGGT---TT-T-C-C-CC-CT--G-GCGGG-GA-ACTCG--GCC-GA-GCTC--CCG-AC-A-AACGAA---CCCCGGCGC-TGTATGCGCCAAGGACCCATAAC-CGAAG-AGCTGG-TCTCCCG-TTGT-CCCGTTCGCGGTGTGC--AC----G-GGAGGCATC-TGCGTC-TTTTG---AATC----CAAAAC{CG}ACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTT?AACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCAT?AGGCCAAGGGCACGTCT?CCTGGGCGTCACGCATCACGTCG---------CC-C-CAA-----CCC--CAAAAAACGT----CCTA-G----------G-T--G-GACATTGT--GG-G-AG--TT----G---GG-G-CGGAGATTGGCCTCCCGT-CC-AC---A-C----GT--CCCGTGAGCGGTTGG-CCC---------A-A-AA-A-AA?GAGT-TCTTG-A-CGACGGA-CGTCACGGCAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTCTTCGCATCA--TGTCGTGAGGCG-CCTAGTCTGCAACGA--TCT--C-C---GACCC--TGT-G-CA--C-C-TAGTTG-TC-CG--C-TGT--AG--G--GC--G-ACGGTGCTT-CGACC Ilex_glabra C-AAAAGTAGAC-CCGGCGAACC-TGTT---A-AAA--ATA--T-G---C-AT----GGGGGTCTGAG--A--A--AGGGTGCGCGAG---CCCCCC-GA--CACATT--CCCC-CA--------CC-C--C--GG-GA-T-TT--GGC-TTGCG-----T-T-C-CC-CT--A-GC-GG-GG-ACTCG--GTC-AA-GCTC--CCG-AC--AAACGAA--CCCCCGGCGC-TATCTGCGCCAAGGAACCTTAAC-{CT}GAAG-AGCTGG-CCCCCCG-ATGT-CCCGTTCGCGGTGTGC--AC----G-GGAGGCATT-TGCATC-TTTTG-A-AATC----TAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG------C--CC-C-CAA--C--CCC--C----AATG-----CCTG-GCT----A--G--C-TG-GGTATTGC--GG-G-AG--TT----G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--C--C---A-C----G---ACCGTGCGCGGTTGG-CCC------------AAA-A-AATGAGT-TCTTG-A-CGATGGA-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCATCA-T-GTCGTGAGGCA-CCAAGTCTGTAGCGAGCTCAGAC-CGG-GACCC--TGT-G-TG--CAC-------ATT-C---T-T-T--A------G-GGG-ATGGTGCTT-CGACC Ilex_integerrima C--AAAGTAGAC-CCGGCGAACT-TGTT-----AAA--ATATTTGG---C--C----GGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGCGAG--CCCCCCC-GA--CACACT--CCCC-CG-------CCC-C--C--GG-GA-T-TC--GGC-TTGCG-----T-T-A-CC-CT--A-{AG}C-GG-GG-ACCCG--GTC-GA-GCTC--CCG-TC---AACGAA---CCCCGGCGC-TGTCTGCGCCAAGGAACCTTAAC-TGAAGAAGCTGGCCCCCCCG-ATGT-CCCGTTCGCGGTGTGC--AC--GGG-GGAGGCATT-TGCGTC-TTTCG---AATC----TAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGT??????????GTC{CG}--------CCC-C-C{AGT}A-----CCC--C----AAAG-----CCCG-GTT-ACCA--G--C-TG-GACCTTGC--GG-G-A?--CT----G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--C--C---A-C--ACG---ACCGTGCGCGGTTGG-CCC-------?A--AAAA-A-AATGAGC-TCCTG-A-CGATGGG-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGGA-A-GAC-CTC-TTGCAT?--TAGTCGTGAGGCA-CCGAGTCTGTAGCGAGCTCTGAT-CGC-GACCC--TGT-G-CA--C-C--------TT-C-TTTAT-T--A------G-GGG-ACGGTGCTT-TGACC Ilex_integra C--AAAGTAGAC-CCGGCGAACT-TGTTA----AAAT-ATA--T-GC--C--T----GGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGTGCGAG---CCCCCC-AA--CAAAAT--TCCC-CA-GCC---CCC-T--TG-GG-GA-T-TT--GGC-TTGCG-----T-T-C-CC-CT--A-GG-GG-GG-ATTGG--GCC-AA-GTTC--CGG-AA---AACGAA---CCCGGGCGC-TTTTTGCGCCAAGGAACCATAAC-TGAAG-GGCTGG-CCTCCCG-ATTT-CCCGTCCGCGGTGTGC--AC----G-GGAGGCATT-TGCATC-TTTTG---AATC----TAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCCAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG--------------C-------CCC--C----AA-------CCC---------------C-----A-ATTGC--GG-G-AG--TTG---G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--C--C---A-C----G---AACGTGCGCGGTTGG-CCCA-A--------A-AA-A-AATGAGT-TCTTG-A-CGATGGA-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCGTCA--TGTCGTGAGGCA-CCAAGTCTGTAGCGAGCTCTGAC-CGC-GACCC--TGT-G-CA--C-C--------TT-C---T-T-C--A-------C-GG-ATGGTGCTT-CGACC Ilex_kiusiana C--AAAGTAGAC-CC{CT}GCGAACT-{CT}GTTT----AAAT-ATG--T--C--C--T----GGGGGTC-AGA-CA--A--GGGGTGCGCGAGC--CCCCCC-AA--CACACT--CCCC-CAGGCC---C-C-T--C--GG-GA-T-TT--GGC-TTGCG-----T-T-C-CC-CT--A-GC-GG-GG-ACTCG--GTC-AA-GCTC--CCG-AC---AACGAA---CCCCGGCGC-TATTTGCGCCAAGGAACCATAAC-TGAAG-GGCTGG-CCTCCCG-ATGT-CCCGTTCGCGGTGTGCA-G-----G-GGAGGCATT-TGCATC-TTTTG---AATC----TAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG--------------C-------CCC--C----AA-------CCC---------------C-----A-ATTGC--GG-G-AT--T{CG}A---G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--A--C---ATC-T--G---AACGTGCGCGGTTGGCCCC--G--------A-AA-A-AATG{AG}GT-TCTTGAA-TAA-GGA-CGTCACGACAAGTGTTGGTTGAA-A-TACGC-C-TTGAGTCA--TGTCTTGAGGCA-CCTAGTCTGTAACGAGCTCTGAC-CGC-AACTC--TGT-G-CAG-C-CA-------TC-C---T-T-C--A-------T-GG-ATCGTGCTT-CAACC Ilex_latifolia C--AAAGTAGAC-CCGGCGAACT-TGTT-----AAA--ATA--T-GC--C--T----GGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGCGAG---CCCCCC-AA--CACACT--CCCC-CA-GCC---CCC-T--C--GG-GA-T-TT--GGC-TTGCG-----T-T-C-CC-CT--A-GC-GG-GG-ACTCG--GTC-AA-GCTC--CCG-AC---AACGAA---CCCCGGCGC-TATCTGCGCCAAGGAACCATAAC-TGAAG-GGCTGG-CCTCCCG-ATGT-CCCGTTCGCGGTGTGC--AG----G-GGAGGCATT-TGCATC-TTTTG---AATC----TAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG---------CCAC-CAA-----CCC--C----AATG-----CCCA-----------G--C-TG-GATATTGC--GG-G-AG--TTG---G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--C--C---A-T----G---AACGCGCGCGGTTGG-CCC-----------A-AA-A-AATGAGT-TCTTG-A-CGATGGA-CGTCACGGCAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGC{AG}TCA--TGTCGTGAGGCA-CCAAGTCTGTAGCGAGCTCTGAC-{CT}GC-GACCC--TGT-G-CA-CC-C--------TTCC---T-T-C--A-------C-GG-ATGGTGCTT-CGACC Ilex_liukiuensis C--AAAGTAGAC-CCGGCGAACT-TGTT-----AAA--ATA--T-GC--C--T----GGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGCGAG---CCCCCC-AA--CACACT--CCCC-CA-GCG---CCC-T--C--GG-GT-T-TT--GGC-TTGCG-----T-T-C-CC-CT--A-GT-GG-GG-ACTCG--GTC-AA-GCTC--CCG-AC---AACGAA---CCCCGGCGC-TATCTGCG----GGAACCATAAC-TGAAG-GGCTGG-CCTCCCG-ATGT-CCGGTTCGCGGTGTGC--AG----G-GGAGGCATT-TGCATC-TTTTG---AATC----TAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTTAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGATCGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG---------CCAC-CAA-----CCC--C----AATG-----CGCG-----------G--C-TG-GATATTAC--GG-G-AG--TTG---G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT-----T---A-T----G---AACGCGCGCGGTTGG-CCC-----------A-AA-A-AATGAGT-TCTTG-A-CGATGGA-CGTCACGGCAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCCTCA--TGTCGTGAGGCA-CCAAGTCTGTAGCGAGCTCTGAC-TGC-GACCC--TGT-G-CA-AC-C--------TTCC---T-T-C--A-------C-GT-ATGGTGCTC-CGACC Ilex_macropoda C--AAAGTAGAC-CCGGCGAACT-TGTT-----AAA--ATA--T-G--TT--T----GGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGCGAG--CCCCCCC-GA--CACACT--CCCC-CA--------CC-T--C--GG-GG-T-TT--GGC-TTGCG-----T-T-C-CC-CT--A-GC-GG-GG-ACTCG--GTC-AG-GCTC--CCG-AC---AACGAA---CCCCGGCGC-TATTTGCGCCAAGGAACCTTAAC-TGAAG-AGCTGG-CCCCCCG-ATGT-CCCGTTCGCGGTGTGC--AC----G-GGAGGCATA-TGCATC-TTTTG---AATC----TAAAACGACTCTCGGCAACGG?TTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG---------CC-C-CAA-----CCC--C----AATG-----CCTA-CCT----G--G--C-TG-GATATTGC--AG-G-AG--TT----G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--C--C---A-C----G---ACTGTGTGTGGTTGG-CCC---A----A--AAAA-A-AA-GAAT-TCCTG-A-CGACGGA-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCATCA--TGTCGTGAGGCA-TCGAGTCTTTGGCGAGCTCTGAC-CGT-GACCC--TGT-G-CA----C--------TT-C---T-T-T---------C-GGG-ATGGTGCTT-CGACC Ilex_maximowicziana C--AAAGTAGAC-CCGGCGAACT-CGTT-----AAA--ATA--T-GC--C--T----GGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGCGAG---CCCCCC-AA--CACACT--CCCC-CA-GCC---CCC-T--C--GG-GA-T-TT--GGC-TTGCG-----T-T-C-CC-CT--A-GC-GG-GG-ACTCG--GTC-AA-GCTC--CCG-AC---AACGAA---CCCCGGCGC-TGTCTGCGCCAAGGAACCATAAC-TGAAG-GGCTGG-CCTCCGG-GTGT-CCCGTTCGCGGTGTGC--AC----G-GGAGGCATT-TGCATC-TTTTG---AATC----TAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCCCGTCG---------CCAC-CAA-----CCC--C----GATG-----CCCA-----------T--C-TG-GATATTGC--GG-G-AG--TTG---G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--T--C---A-C----G---AACGTGCGCGGTTGG-CCC-----------A-AA-A-AATGAGT-TCTTG-A-CGATGGA-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCGTCA--TGTCGTGAGGCA-CCAAGTCTGTACCGAGCTCTGGC-CGC-GACCC--TGC-G-CA-CC-C--------TT-C---T-T-C--A-------C-GG-ATGGTGCTC-CGACC Ilex_mertensii C--AAAGTAGAC-CCGGCGAACT-CGTTA----AAAT-ATA--T-GG--C--T----GGGGGTCTGGG--A--A--GGGGTGCGCGAG---CCCCCC-AA--CACACT--CCCC-CA-GCC---CGC-T--C--GG-GA-T-TT--GGC-TTGCG-----T-T-C-CC-CT--A-GC-GG-GG-ACTCG--GCC-AA-GCTC--CCG-AC---AACGAA---CCCCGGCGC-TGTTTGCGCCAAGGAACCACAAC-TGAAG-GGCTGG-CCTCTCG-ATGT-CCCGTTCGCGGTGTGCA-AC----G-GGAGGCATT-TGCATC-TTTTG---AATC----TAAAATGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACAATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAACCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG--------------C-------CCC--C----AA-------CCC---------------C-----A-ATTGC--GG-G-AG--TCG---G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--C--C---A-C----G---AACGTGCACGGTTGG-CCC--A--------A-AA-A-AATGAGT-TCTTG-A-CGATGGA-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCGTCA--TGTCGTGAGGCA-CCAAGTCTGTAGCGAGCTCTGAC-CGT-GACCC--TGT-G-CA--C-C--------TC-C---T-T-C--G-------C-GG-ATGGTGCTC-CGACC Ilex_micrococca C--AAAGTAGAC-CCGGCGAACT-TGTT-----AAA--ATA--T-G-CTT--T----GGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGCGAG---CCCCCC-GA--CACACTC-CCCC-CA--------CC-T--C--GG-GA-T-TT--GGC-TTG{CT}G-----T-T-C-CC-CT--A-GC-GG-GG-ACTCG--GTC-AG-GCTC--CCG-AC---AACGAAC--CCCCGGCGC-TATTTGCGCCAAGGAACCTTAAC-TGAAG-AGCTGG-CCCCCCG-ATGT-CCCGTTCGCGGTGTGC--AC----G-GGAGGCATA-CGCATC-TTTTG---AATC----TAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG---------CC-C-CCA-----CCC--C----AATG-----CCTA-GCT----G--G--C-TG-GATATTGC--GG-G-AG--TT-GG-G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--C--C---A-C----G---ACCGTGCGCGGTTGG-CCC---A----A--AAAA-ATAA-GAGT-TCCTG-A-CGATGGA-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCATCA--TGTCGTGAGGCA-CCGAGTCTCTAGCGAGCTCTGAT-CGT-GACCC--TGC-G-CG--C-C--------TC-C---T-T-C---------C-GGG-ATGGCGCTT-TGACC Ilex_microdonta C--AAAGTAGAC-CCGGCGAACT-TGTT-----AAA--ATATTTGG---C--C----GGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGCGAG--CCCCCCC-GA--CACACT--CCCC-CG-------CCC-C-TC--GG-GA-T-TT--GGC-TTGCG-----T-T-C-CC-CT--A-CC-GG-GG-ACCCG--GTC-GA-GCTC--CCG-AC---AACGAA---CCCCGGCGC-TGTCTGCGCCAAGGAACCTCAAC-TGAAG-AGCTGGCCCCCCCG-ATGC-CCCGTTCGCGGTGTGC--AC--GGGAGGAGGCATT-TGCGTC-TTTTG---AATC----TAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCATGTCG-------C-CC-C-CAA-----CCC--C----AACG-----CCTG-GCT-ACTA--G--C-CG-GACGTTGC--GG-G-AG--CT----G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--C--C---A-C--ACG-ACACCGTGCGCGGTTGG-CCC--------A--AAAA-A-AATGAGC-TCCTG-A-CGATGGA-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCATC--TAGTCGTGAGGCA-CCGAGTCTGTAGCGAGCTCTGAT-CGT-GACCC--TGT-G-CA--C-C--------TC-C--TTAT-T--A------G-GGG-ATGGTGCTT-CGACC Ilex_microdonta_Gbk C--AAAGTAGAC-CCGGCGAACT-TGTT----AAAA--ATATTTGG---C--C----GGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGCGAG--CCCCCCC-GA--CACACT--CCCC-CG--------CC-C-TC--GG-GA-T-TT--GGC-TTGCG-----T-T-C-CC-CT--A-CC-GG-GG-ACCCG--GTC-GA-GCTC--CCG-AC---AACGAA---CCCCGGCGC-TGTCTGCGCCAAGGAACCTTAAC-TGAAG-AGCTGGCCCCCCCG-ATGT-CCCGTTCGCGGTGTGC--AC--GGGAGGAGGCATT-TGCGTC-TTTTG---AATC----CAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCAAGTCG-------C-CC-C-CAA-----CCC--C----AACG-----CCCG-GCT-ACTG--G--C-TG-GACGTTGC--GG-G-GG--CT----G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--C--C---A-C--ACG---ACCGTGCGCGGTTGG-CCC--------A--AAAA-A-AATGAGC-TCCTG-A-CGATGGA-CGTCGCGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCATC--TAGTCGTGAGGCA-CCGAGTCTGTAGCGAGCTCTGAT-CGT-GACCC--TGT-G-CA--C-C--------TC-C--TTAT-T--A------G-GGG-ATGGGGCTT-CGACC Ilex_mitis C--AAAGTAGAC-CCGGCGAACT-TGTT-----AAA--ATA--T-G--CC--T----GGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGCGAG--CCCCCCC-GA--CACACT--CCCC-CA--------CC-T--C--GG-GATT-TT--GGC-TTGCG-----T-T-C-CC-CT--A-GC-GG-GG-ACTCG--GCC-AG-GCTC--CCG-AA---AACGAAC--CCCCGGCGC-TGTCTGCGCCAAGGAACCTTAAC-TGAAG-AGCTGG-CCCCCCG-ACGT-CCCGTTCGCGGTGTGC--ACG---G-GGAGGCATG-TGCGTC-TTTTG---AATC----TAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG---------CC-C-CAA-----CCC--C----AATG-----CCTA-GCT----A--G--C-TG-GATATTGT--GG-G-AG--TT----G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--C--C---A-C----G---ACCGTGCGCGGTTGG-CCC---A----A--AAAA-AAAAGGAGT-TCTTG-A-CGACGGA-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTA-TTGCATCA--AGTCGTGAGGCA-CCGAGTCTGTAGCGAGCTCTGAC-CGT-GACCC--TGC-G-CA--C-C--------TT-C---T-T-T-AA------C-GGA-ATGGTGCTC-CGACC Ilex_mucronata C--AAAGTAGAC-CCAGCGAACT-TGTT-----AAA--ACA--T-G---C--T--T-GGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGCGAG---CCCCCC-GA--CACACT--CCCC-CA--------CC-T--C--GG-GA-T-TT--GGC-TTGCG-----T-T-C-CC-CT--A-GC-GG-GG-ACTCG--GTC-AA-GCTC--CCG-AC---AACGAA---CCCCGGCGC-TGTCTGCGCCAAGGAACCATAAC-TGAAG-AGCTGG-CCTCCCG-ATGT-CCCGTTCGCGGTGTGC--AC----G-GGAGGCATT-TGCATC-TTTCG---AATC----TAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG---------CC-C-CAA---CCCCC--C----AATT-----CCTATG-T-------A-CC-TG-GATATTGT--GG-G-AG--AT----G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--A--C---A-C----G---ACCGTGAGCGGTTGG-CCC-----------A-AA-T-AATGAGT-TCTTG-A-CGATGGA-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCATCA--TGTCGTGAGGCA-CCTAGTCTGTAGCGAGCTCTAAC-CGT-GACCCTATAT-G-CA--C-C--------TT-C---T-T-C--A------GC--G-ATGGTGCTT-CGACC Ilex_mutchagara C--AAAGTAGA--CCGGCGAACT-TGTT-----TAA--ACA--T-G---C----GG-GGGGG{GT}TTGAA--A--A--AGGGTTCGCGAA--CCCCCCC-AA-TCACGCT-CCCCC-CA--------CC-T--C--GG-GA-T-CT--GGC-TCGT---TT-TCC-C-CC-CT--G-GCGGG-GA-ACTCG--GCC-AA-GCTC--CCG-AC-A-AACGAA---CCCCGGCGC-TGTTTGCGCCAAGGAACAATAAC-CGAAG-AGCTGG-TCTCCCG-GTGC-CCCGTCCGCGGCGTGC--AC----G-GGAGGCGCT-TGCGTC-TTTTG---AATC----CAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCCAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG---------CC-C-CAA-----CCC--C---CACCGG----CCCA-G----------C-C--G-GATACTGC--GG-G-AG--TT----G---GG-G-CGGAGATTGGCCTCCCGT-CC-GC---G-C----G---ACCGTGAGCGGTTGG-CCC-----------A-AA-A-AACGAGT-TCTTG-A-CGATGGA-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TCGCATCA--TGTCGTGGGGCG-CCTAGTCCGCAGCGA--GCT--C-C---GACCC--TGT-G-CA--C-C-T-G--A-TT-CG--C-TCT--CG--G--GC--G-ACGGTGCTT-CGACC Ilex_opaca C--AAAGTAGA--CCGGCGAACT-TGTT-----AAA--ACA--T-G---C--T--G-GGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGTGAG--CCCCCC{GT}-AA--CACACT--CCCC-CA--------CC-T--C--GG-GA-T-TTT-GGC-TTGCG-----T-C-C-CC-CT--A-GC-GG-GG-ACTCG--GTC-AA-GCTC--CCG-AC-A-AACGAA---CCCCGGCGC-TATCTGCGCCAAGGAACCATAAC-TGAAG-AGCTGG-CCTCCCG-TTGT-CCCGTTCGCGGTGTGC--AC----G-GGAGGCGTCATGCATC-TTTTG---AATC----TAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG----CC---CC-C-CCA-----CCC--C----AATG-CCCACCTA-G------------C-TG-GATATTGC--GG-G-AG--TC----G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT-CC-GC---A-C----G---ATCGTGAGCGGTTGG-CCC----------AA-AA-A-AATGAGC-TCTTG-A-CGATGGA-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCATCA--TGTCGTGAGGCA-CCAAGTCTGTGGCGAGCTCTAAC-CGT-GACCC--TGC-G-CA--C-C--------CT-C---T-T-C--A------GC--G-ATGGTGCTT-CGACC Ilex_paraguariensis C--AACGTAGA-CCCGGCGAACT-TGTT-----AAA--ATA--C-G---C--T-GG-GGGGGTTTGGG--A--A--GGGGTGCGCGAG--CCCCCCCGAA--CACACT-CCCCCGC---------CC-T--C--GG-GA---CTG-GGC-TTGTG--TTCC-C-CTCC-CT-AG-GGGGG-GG-ACTCG--GTC-GA-GCTC--CCG-AC-A-AACGAA---CCCCGGCGC-TGTCTGTGCCAAGGAACCATAAC-CGAAG-AGCTGG-TCTCCCG-ATGT-CCCGTTCGCGGTGCGC--AC----G-GGAGGCATT-TGCATCTTTTTGA--AATC----TAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG-----C---CC-C-CAA-----CCC--C----AATG-----CC----------------C--G-GATGTTGCGGGG-G-AG--TT---GG---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT-CC-AC---A-{CT}----G---ATCGTGAGCGGTTGG-CCC-----------A-AA-A-AGTGAGT-TCCTG-A-CGACGGA-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCATCA--TGTCGTGAGGCG-CCTAGTCTGTAGCGAGCTCTAAC-CGTGGACCC--TGC-G-CA--C-C-T-A--A-TT-CG--T-T-CG-AGAAGA-GC--G-ACGGTGCTT-CGACC Ilex_pedunculosa C--AAAGTAGAC-CCGGCGAACT-CGTT-A---AAA-TATA--T-G--GC--T----GGGGGTCTGGG--A--A--GGGGTGCGCGAG---CCCCCC-AA--CACACT--CCCC-CA----G--CCCGCT-C--GG-GA-T-TT--GGC-TTGCG-----T-T-C-CC-CT--A-GC-GG-GG-ACTCG--GCC-AA-GCTC--CCG-AC---AACGAA---CCCCGGCGC-TGTCTGCGCCAAGGAACCACAAC-TGAAG-GGCTGG-CCTCTCG-ATGT-CCCGTTCGCGGTGTGC-AAC----G-GGAGGCATT-TGCATC-TTTTG---AATC----TAAAATGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCAAGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG---------CC-C-CAA-----CCC--C----AATG-----CCAA-GCT----T--G--C-TG-GGTATTGC--GG-G-AG--CT----G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--C--C---A-C----G---ACCGTGCGCGGTTGG-CCC-----------ATAA-A-AATGAGT-TCCTG-A-CGATTGA-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-A{CT}GCATCA--AGTCGTGAGGCA-CCGAGTCTGTAGCGAGCTCTGAT-CGT-GACCC--T-TCG-CA--C-C--------TT-C---T-C-T--A------ATGGG-ATGGTGCTTCCGACC Ilex_percoriacea C--AAAGTAGAC-CCGGCGAACT-CGTTA----AAAT-ATA--T-GG--C--T----GGGGGTCTGGG--A--A--GGGGTGCGCGAG---CCCCCC-AA--CACACT--CCCC-CA-GCC---CGC-T--C--GG-GA-T-TT--GGC-TTGCG-----T-T-C-CC-CT--A-GC-GG-GG-ACTCG--GCC-AA-GCTC--CCG-AC---AACGAA---CCCCGGCGC-TGTTTGCGCCAAGGAACCACAAC-TGAAG-GGCTGG-CCTCTCG-ATGT-CCCGTTCGCGGTGTGCA-AC----G-GGAGGCATT-TGCATC-TTTTG---AATC----TAAAATGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAACCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG--------------C-------CCC--C----AA-------CCC---------------C-----A-ATTGC--GG-G-AG--TCG---G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--C--C---A-C----G---AACGTGCACGGTTGG-CCC--A--------A-AA-A-AATGAGT-TCTTG-A-CGATGGA-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCGTCA--TGTCGTGAGGCA-CCAAGTCTGTAGCGAGCTCTGAC-CGT-GACCC--TGT-G-CA--C-C--------TC-C---T-T-C--G-------C-GG-ATGGTGCTC-CGACC Ilex_pseudobuxus C--AAAGTAGAC-CCGGCGAACC-TGTT-----AAA--ATATTTGG---C--C----GGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGCGAG--CCCCCCC-GA--CACACT--CCCC-CG-------CCC-C-TC--GG-GA-T-TC--GGC-TTGCG-----T-T-C-CC-CT--G-CC-GG-GG-ACCCG--GTC-GA-GCTC--CCG-AC---AACGAA---CCCCGGCGC-TGTCTGCGCCAAGGAACCTTAAC-TGAAG-AGCTGGCCCCCCCG-ATGC-CCCGTTCGCGGTGTGC--AC--GGGAGGAGGCATT-TGCGTC-TTTTG---AATC----CAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGTTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCAAGTCG-------C-CC-C-CAA-----CCC--C----AACG-----CCCG-GCT-A{CT}TG--G--C-TG-GACGTTGC--GG-G-AG--CT----G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--C--C---A-C--ACG---ACCGTGCGCGGTTGG-CCC--------A--AAAA-A-AACGAGC-TCCTG-A-CGATGGA-CGTCCCGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCATC--TGGTCGTGAGGCA-CCGAGTCTGTAGCGAGCTCTGAT-CGT-GACCC--TGT-G-CA--C-C--------TC-C--TTAT-T--A------G-GGG-ACGGTGCTT-CGACC Ilex_rotunda C--AAAGTAGAC-CCGGCGAACT-CGTT-----AAA--ATA--T-G--CG--T----GGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGCGAG--CCCCCCC-GA--CACATT--CCCC-CA-----C-CCC-C--C--GG-GA-C-TT--GGC-CCGGG-----T-T-C-CC-CT--T-GC-GG-GG-ACTCG--GCC-AAGGCTC--CCG-AC---AACGAA---CCCCGGCGC-TGTCTGCGCCAAGGAACCTTAAC-CGAAG-AGCTGG-CCCCCCG-{AG}TGT-CCCGTTCGCGGTGTGC--AC----G-GGAGGCGTA-CGCATC-TTTCG---AATC----TAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG-C-------CC-C-CAAC----CCCGAC----AATG-----CCCG-GCTG---GCAG--C-CG-GATATTGC--GG-G-AG--TT----GC--GG-G-CGGAGATTGGCCTCCCGT--C--C---A-C----G---ACCGTGCACGGTTGG-CCC------------AAA-A-AGCGAGT-TCTTG-A-CGACGGA-CGTCACGACGAGTGGTGGTTGGA-A-GAC-CTC-TTGCGTCG--AGTCGTGAGGCACCCGAGTCTGTAACGAGCTCTGAC-CGC-GACCC--TGT-G-CG--C-C--------TT-C---C-T-T--A------G-GGG-GCGGCGCTC-CGACC Ilex_rugosa C--AAAGTAGAC-CCGGCGAACT-TGTT-----AAA--ATA--T-GC--C--T----GGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGCGAG---CCCCCC-AA--CACACT--CCCC-CA--------CC-T--C--GG-GA-T-TT--GGC-TTGCG-----T-T-C-CC-CT--A-GC-GG-GG-ACTTG--GTC-AA-GCTA--CCG-AC---AACGAA---CCCCGGCGC-TGTCTGCGCCAAGGAACCATAAC-TGAAG-AGCTGG-CCTCCTG-TTGT-CCCGTCTGCGGTGTGC--AC----G-GGAGGCATT-TGCATC-TTTTG---AATC----TAAAACGACTCTCGGCAACGG?TTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG---------CCAC-CAA-----CCC--C----AATG-----CCTA-----------G--C-TG-GATATTG{AC}--GG-G-AG--TTG---G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--C--C---A-C----G---AACGTGCGCGGTTGG-CCC-AA--------A-AA-A-AATGAGT-TCTTG-A-CGATGGA-CGTCACGATAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTA-TTGCGTCA--TGTCGTGAGGCA-CCAAGTCTGTAGCGAGCTCTGAC-CGT-GACCC--TGT-G-CA--C-C--------TT-C---T-T-C--A-------T-GG-ATGGTGCTT-CGACC Ilex_serrata C--AAAATAGAC-C{CT}GGCGAACT-TGTT-----AAA--ATA--T-G--CT--T----GGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGCGAG--TCCCCCC-GA--CACACT--CCCC-CA-------CCC-C--C--GG-GA-T-TT--GGC-TTGCG-----T-C-C-CC-CT--A-GC-GG-GG-ACTCG--GTC-AA-GCTC--CCG-AC---AACGAA---CCCCGGCGC-TATCTGCGCCAAGGAACCTTAAC-CGAAG-AGCTGG-CCCCCCG-ATGT-CCCGTTCGCGGTGTGC--AC----G-GGAGGCGTA-TGCATC-TTTTG---AATC----TAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACACATCACGTCG---------CC-C-CAA-----CCC--C----AATG-----CCTA-GTT----G--G--T-TA-GGCATTGT--TG-G-AG--TT----GG--GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--C--C---A-C----G---ATTGTGCGCGGTTGG-CCC------------AAA-A-AATGAGT-TCTTG-A-CGATGGA-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCATCA--AGTCGTGAGGCA-CCGAGTCTGTAACGAGCTCTAAC-CGT-GACCC--TGT-G-CA--C-C--------TT-C---T-T-T--A------G-GGG-ATGGTGCTC-CGACC Ilex_taubertiana C--AAAGTAGAC-CCGGCGAACT-TGTT-----AAA--ATATTTGG---C--C----GGGGGTTTGAG--A--A-GGGGGTGCGCGAG--CCCCCCC-{AG}A--CACA{CT}T--CCCC-CG--------CC-C-T---GG-GA-T-TT-GGGT-TTGCG-----T-T-C-CC-CT--A-CC-GG-GG-ACCCG--GT{CG}-GA-GCTC--CCG-{AC}C---ACCAA{AC}---CCCCGGCGC-TGTTTGCGCCAAGGAACCTTAAC-TGAA?-A?CTGGCCCCCCCG-ATGT-CCCGTTC?CGGTGTGC--AC---GG-GGAGGCATT-TGCGTC-TTTTG---AATT----TAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGT{CT}TGCCTGGGCGTCACGCATCACGT{CT}G---------CC-C-CAA-----CCC--C----AATG-----CCCG-GCT-ACTA--{AG}--C-TG-GACGTT{CT}C--GG-G-A{AG}--CT----G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--C--C---A-C--ACG---ACCGTGGGCGGTTGG-CCC-----AAAA--AAAA-A-AATGAGC-TCTTG-A-CGATGGA-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GGC-CTC-TTGCGTC--TAGTCGTGAGGCA-CCGAGTCTGTAGCGAGCTTTGAT-CGT-GACCC--TGT-G-CG--C-C--------TC-C--TTAT-T--A------G-GGG-ACGGTGCTT-CGACC Ilex_theezans C--AAAGTAGAC-CCGGCGAACT-TGTT-----AAA--ATATTTGG---C--C---GGGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGCGAG--CCCCCCC-GA--CACA{CT}T--CCCC-CG-------CCC-C--C--GG-GA-T-TT--GG{CGT}-TTG{CG}G-----T-T-C-CC-CT--A-GC-GG-GG-ACCCG--GCC-GA-GCTC--CCG-AC---AACGAA---CCCCGG{CG}G{CG}-TGTCTGCGCCAAGGAACCTTAAC-TGAA{AG}AAGCT{AG}GCCCCCCCG-{AG}TGT-CCCGTTCGCGGTGTGC--AC----G-GGAGGCATT-TGCGTC-TTTTG---AATC----CAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG---------CC-C-CAA-----CCC--C----AATG-----CCTG-GCT-ACCA--G--C-{CT}G-GACGTTGC--GG-G-AG--CT----G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--C--C---A-C--ACG---{AG}CCGTG{CGT}GCGGTTGG-CCC--------A--AAAA-A-AATGAGC-TCTC--ACCGATGGG-{CG}GTCACG{AG}CAAGTGGTGGTTGAA-A-GGC-CTC-TAGCATC--TAGTCGTGAGGC{AT}-CCGAGTTTACAGCGAGCTCTGAT-CGT-GACCC--TGT-G-CA--C-C--------TT-C--TTAT-T--A-----GG-GGG-A{CT}GGTGCTT-TGACC Ilex_theezans_Gbk C--AAAGTAGAC-CCGGCGAACT-TGTT-----AAA--ATATTTGG---C--C----GGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGCGAG--CCCCCCC-GA--CACACT--CCCC-CG-------CCC-C--C--GG-GA-T-TC--GGC-TTGCG-----T-T-C-CC-CT--A-GC-GG-GG-ACCCG--GTC-GA-GCTC--CCG-TC---AACGAA---CCCCGGCGC-TGTCTGCGCCAAGGAACCTTAA?-TGAAGAAGCTGGCCCCCCCG-ATGT-CCCGTTCGCGGGGTGC--AC--GGG-GGAGGCATT-TGCGTC-TTTCG---AATC----TAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG---------CC-C-CAA-----CCC--C----AATG-----CCCG-GCT-ACCA--G--C-TG-GACGTTGC--GG-G-AG--CT----G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--C--C---A-C--ACG---ACCGTGCGCGGTTGG-CCC-------AA--AAAA-A-AATGAGC-TCCTG-A-CGATGGG-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGGA-A-GAC-CTC-TTGCATC--TAGTCGTGAGGCA-CCGAATCTGTAGCGAGCTCTGAT-CGT-GACCC--TGT-G-CA--C-C--------TT-C-TTTAT-T--A------G-GGG-ACGGTGCTT-TGACC Ilex_vomitoria C--AAAGTAGA--CCGGCGAACT-TGTT-----AAA--ATA--T-G---C--T----GGGGGTTTGAG--AAAAG-GGGGTGCGCGAG-CCCCCCCC-AA--CACACT--CCCC-CA--------CC-T--C--GG-GA-T-TT--GGC-TTGTG-----T-T-C-CC-CT--A-GC-GG-GG-ACTCG--GTC-AA-GCTC--CCG-AC-A-AACGAA---CCCCGGCGC-TATCTGCGCCAAGGAACCATAAC-TGAAG-AGCTGG-CCTCCCG-ATGT-CCCGTTCGCGGCGCGC--AC----G-GGGGGTATT-TGCATC-TTTTG---AATC----TAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG---------CC-C-CAA-----CCC--C----AATG-----CCTA-G------------C-TG-GATATCGT--GG-G-AG--TT----G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--T--C---G-C----G---ACCGTGAGCGGTTGG-CCC-----------A-AA-A-AATGAGT-TCCTG-A-CGATGGA-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCATCA--TGTCGTGAGGCA-CCTAGTCTGTAGCGAGCTCTAAC-CGT-GACCC--TGT-G-CA--C-C--------TT-C---T-T-C--A---G--A---G-ACGGTGCTT-CGACC Ilex_warburgii C--AAAGTAGAC-CCGGCGAACT-TGTT-----AAA--ATA--T-GC--C--T----GGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGCGAG---CCCCCC-AA--CACACT--CCCC-CA-GCG---CCC-T--C--GG-GA-T-TT--GGC-TTGCG-----T-T-C-CC-CT--A-GC-GG-GG-ACTCG--GTC-AA-GCTC--CCG-AC---AACGAA---CCCCGGCGC-TATCTGCGCCAAGGAACCATAAC-TGAAG-GGCTGG-CCTCCCG-ATGT-CCCGTTCGCGGTGTGC--AG----G-GGAGGCATT-TGCATC-TTTTG---AATC----TAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG---------CCAC-CAA-----CCC--C----AATG-----CCCG-----------G--C-TG-GATATTAC--GG-G-AG--TTG---G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGTC-CA-T---A-T----G---AACGCGCGCGGTTGG-CCC-----------A-AA-A-AATGAGT-TCTTG-A-CGATGGA-CGTCACGGCAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCGTCA--TGTCGTGAGGCA-CCAAGTCTGTAGCGAGCTCTGAC-TGC-GACCC--TGT-G-CA-CC-C--------TTCC---T-T-C--A-------C-GG-ATGGTGCTC-CGACC Ilex_yunnanensis C--AAAGTAGAC-CCAGCGAACT-TGTT-----AAA--ATA--T-G--CC--C----GGGGGTTTGAG--A--A--GGGGTGCGCGAG---CCCCCC-GA--CACAAT--CCCC-CA-------CCC-C--C--GG-GA-T-CT--GGC-TTGCG-----T-T-C-CC-AT--A-GC-GG-GG-ACTGG--GTC-AG-GCTC--CCG-GC---AACGAA---CCCCGGCGC-TATCTGCGCCAAGGAATCTTAAC-TGAAG-AGCTGG-CCCCCCG-ATGT-CCCGTTCGCGGTGTGC--AC----G-GGAGGCATA-TGCATC-TTTTG--AAATC----TAAAACGACTCTCGGCAACGGCTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAAGCCATTAGGCTAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCACGTCG---------CC-C-CAA-----CCC--C----AATG-----CCTA-GCT----A--G--C-TG-GATATTGC--GG-G-AG--TT----G---GG-G-CGGAAATTGGCCTCCCGT--C--C---A-C----G---ACCGTGCGCGGTTGG-CCC--------A--AAAA-A-AATGAGT-TCCTG-A-CGATGGA-CGTCACGACAAGTGGTGGTTGAA-A-GAC-CTC-TTGCATCA--AGTCGTGAGGCA-CCGAGTCTGTAGCGAGCTCTGAC-CGT-GACCC--TGC-G-CA--C-C--------TT-C---T-C-T--A------T-GGG-ATGGTGCTT-CGACC ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = ITS_241) = N: 1-822; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = ITS_241) = N: 1-822; END; [ The following blocks are output data for analysis step 1943 ] BEGIN TREES; TITLE Tb6718; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep1943; TREE strict_241 = [&R] (Helwingia_japonica,(Helwingia_chinensis,(Ilex_anomala,((Ilex_rugosa,((Ilex_integra,(Ilex_kiusiana,(Ilex_beecheyi,Ilex_mertensii,Ilex_percoriacea))),((Ilex_maximowicziana,(Ilex_cornuta,Ilex_dimorphophylla)),(Ilex_buergeri,Ilex_latifolia,(Ilex_liukiuensis,Ilex_warburgii))))),(((Ilex_amelanchier,Ilex_mucronata),((Ilex_collina,(Ilex_decidua,Ilex_vomitoria)),((Ilex_opaca,(Ilex_argentina_Gbk,Ilex_cassine)),(Ilex_paraguariensis,((Ilex_crenata,Ilex_mutchagara),(Ilex_dumosa_dumosa,Ilex_dumosa_guaranina)))))),(Ilex_pedunculosa,((Ilex_canariensis,Ilex_glabra),((Ilex_rotunda,Ilex_serrata),(Ilex_yunnanensis,(Ilex_mitis,(Ilex_macropoda,Ilex_micrococca)))),(Ilex_argentina,(((Ilex_brasiliensis,Ilex_theezans),(Ilex_integerrima,Ilex_theezans_Gbk)),((Ilex_brevicuspis,Ilex_taubertiana),(Ilex_microdonta,(Ilex_pseudobuxus,Ilex_microdonta_Gbk)))))))))))); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr1271] END;