#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on September 21, 2025; 6:27 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Mossebo D.C., Essouman F.E., Machouart M.C., & Gueidan C. 2017. Phylogenetic relationships, taxonomic revision and new taxa of Termitomyces (Basidiomycota, Lyophyllaceae) inferred from combined nLSU- and mtSSU-rDNA sequences. Fungal Diversity, 321(1): 71-102. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S20092] [ The following blocks are input data for analysis step 19461 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep19461; DIMENSIONS NTAX=77; TAXLABELS ' Termitomyces striatus striatus DM_208' 'Lyophyllum ambustum CBS_450_87' 'Lyophyllum decastes JM_87_16' 'Lyophyllum semitale CBS_369_47' Termitomyces_DM_150G Termitomyces_DM_151 Termitomyces_DM_151C Termitomyces_DM_152E Termitomyces_DM_213E Termitomyces_DM_223E Termitomyces_DM_224C Termitomyces_DM_24E Termitomyces_DM_25E Termitomyces_DM_25G Termitomyces_DM_260F Termitomyces_DM_268E Termitomyces_DM_280 Termitomyces_DM_280B Termitomyces_DM_370G Termitomyces_DM_372G Termitomyces_DM_382_A_A Termitomyces_DM_394 Termitomyces_DM_407 Termitomyces_DM_602B Termitomyces_DM_665 Termitomyces_DM_666A Termitomyces_DM_671 Termitomyces_DM_735 Termitomyces_DM_737 Termitomyces_DM_770 Termitomyces_KM_109538 Termitomyces_KM_109563 Termitomyces_KM_109565 Termitomyces_KM_109566 Termitomyces_KM_128338 Termitomyces_KM_128340 Termitomyces_KM_128346 Termitomyces_KM_142416 Termitomyces_KM_142418 Termitomyces_KM_142419 Termitomyces_KM_142436 Termitomyces_KM_143968_DM_370B Termitomyces_KM_143969_DM_260B Termitomyces_KM_143971_DM_223 Termitomyces_KM_144285_DM_150D Termitomyces_KM_144295_DM_426 Termitomyces_KM_144296_DM_435 Termitomyces_KM_144298_DM_436 Termitomyces_KM_144300_DM_392 Termitomyces_KM_16528 Termitomyces_KM_16685 Termitomyces_KM_29920 Termitomyces_aurantiacus_tgf82 Termitomyces_aurantiacus_tgf84 Termitomyces_aurantiacus_tgf89 'Termitomyces clypeatus KM_29150' Termitomyces_clypeatus_tgf21 Termitomyces_clypeatus_tgf93 Termitomyces_entolomoides_tgf103 Termitomyces_eurhizus_tgf101 Termitomyces_globulus_tgf11 'Termitomyces heimii Muid_sn' Termitomyces_letestui_tgf16 Termitomyces_letestui_tgf5 Termitomyces_letestui_tgf83 Termitomyces_mammiformis_tgf100 Termitomyces_mammiformis_tgf102 Termitomyces_mammiformis_tgf104 Termitomyces_medius_dka138 Termitomyces_microcarpus_PRU3900 Termitomyces_microcarpus_tgf12 Termitomyces_microcarpus_tgf28 Termitomyces_robustus_tgf95 Termitomyces_schimperi_tgf18 Termitomyces_singidensis_tgf74 Termitomyces_striatus_tgf99 Termitomyces_titanicus_tgf94 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M45439] TITLE 'Termitomyces nLSU-mtSSU'; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep19461; DIMENSIONS NCHAR=774; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] ' Termitomyces striatus striatus DM_208' 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Termitomyces_DM_151C TTCCCCTAGTAACTGCGAGTGAAGCGGGAAAAGCTCAAATTTAAAATCTGG--TAG-CCTGCCCGAGTTGTAATCTAGAGAAGCATT-ATCAGTGCTAGCG-CGTGTATAAGTGTCCTGGAATGGACCATCATAGAGGGTGAGAATCCCGTCTTTGA-CACG-ACTAGTGCCT-ACGGATGTGCTCTCAAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGCTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGCGTTGGCTGGGTCAACC-TTGCGCTTGGCTTACTTC-CCAG-TTGACGGGTCAGCATCAGTTTTGA--CCAGTGGATAAAGGAGGGGAATGTGGCACCGGGTGTG-TTATAGCCCTTGGTCAGTTGACAGTGAGAGGTATCTGGGTATCTAATCCTATTTCCTATTCTCACCTTCGTTTCTCAGCGTCAATCATTTCTAGATAAATAGTTTTCACTTTTAGTATTCCACTT-AGTATCTACGGATATCATCCC-TACTCTAAGTATTATTTGGCTTATCCTCGTTTTGATTCTAGCTTTTATTCATCCTATCTTACCCTTAGAATGAAGATATAAACAGATCTTCGTTATAAGAGCTAGAAAGATGTGATTTTGAAAGCAGCCTACACACCCTTTACGCCTGATTAGGA Termitomyces_DM_152E TTCCCCTAGTAACTGCGAGTGAAGCGGGAAAAGCTCAAATTTAAAATCTGG--TAGTCCTGCCCGAGTTGTAATCTAGAGAAGCATT-ATCCGCGCTGGAC-CGTGTACAAGTGTCCTGGAATGGACTATCATAGAGGGTGAGAATCCCGTCTTTGA-CACGGACTAGGGCTT-TGTGATGTGCTCTCAAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGCTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGCGTCGGCTGGGTCAACC-TTGCGCTTGGCTTACTTC-CCAG-TTGACGGGTCAGCATCAGTTTTGA--CCAGTGGATAAAGGAAGGGAATGTGGCACCGGGTGTG-TTATAGCCCTTGGTCAGTTGACAGTGAGAGGTATCTGGGTATCTAATCCTATTTCCTATTCTCACCTTCGTTTCTCAGCGTCAATCATTTCTAGATAAATAGTTTTCACTTTTAATATTCCACTT-AGTATCTACGGATATCGACCC-TACTCTAAGTATTATTTGGCTTATCCTCGTTTTGATTCTAGCTTTTATTCATCCTATCTTTACCTTAGAATGAAGATATAAACAGATCTTCGTTATAAGAGCTAGAAAGATATGACTTTGAAAGCAGCCTACACACCCTTTACGCCTGATTAGGA Termitomyces_DM_213E TTCCCCTAGTAACTGCGAGTGAAGCGGGAAAAGCTCAAATTTAAAATCTGG--TAGTCCTGCCCGAGTTGTAATCTAGAGAAGCATT-ATCCGCGCTGGAC-CGTGTACAAGTGTCCTGGAATGGACTATCATAGAGGGTGAGAATCCCGTCTTTGA-CACGGACTAGGGCTT-TGTGATGTGCTCTCAAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGCTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGCGTTGGCTGGGTCAACC-TTGCGCTTGGCTTACTTC-CCAG-TTGACGGGTCAGCATCAGTTTTGA--CCAGTGGATAAAGGAGGGGAATGTGGCACCGGGTGTG-TTATAGCCCTTGATCAGTTGACAGTGAGAGGTATCTGGGTATCTAATCCTATTTCCTATTCTCACCTTCGTATCTCAGCGTCAATCATTTCTAGATAAATAGTTTTCACTTTTAATATTCCACTT-AGTATCTACGGATATCGACCC-TACTCTAAGTATTATTTGGCTTATCCTCGTTTTGATTCTAGCTTTTATTCATCCTATCTTTACCTTAGAATGAAGATATAAACAGATCTTCGTTATAAGAGCTAGAAAGATATGACTTTGAAAGCAGCCTACACACCCTTTACGCCTGATTAGGA Termitomyces_DM_223E TTCCCCTAGTAACTGCGAGTGAAGCGGGAAAAGCTCAAATTTAAAATCTGG--TAGTCCTGCCCGAGTTGTAATCTAGAGAAGCATT-ATCCGCGCTGGAC-CGTGTACAAGTGTCCTGGAATGGACTATCATAGAGGGTGAGAATCCCGTCTTTGA-CACGGACTAGGGCTT-TGTGATGTGCTCTCAAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGCTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGCGTTGGCTGGGTCAACC-TTGCGCTTGGCTTACTTC-CCAG-TTGACGGGTCAGCATCAGTTTTGA--CCAGTGGATAAAGGAAGGGAATGTGGCACCGGGTGTG-TTATAGCCCTTGGTCAGTTGACAGTGAGAGGTATCTGGGTATCTAATCCTATTTCCTATTCTCACCTTCGTTTCT{CT}AGCGTCAATCATTTCTAGATAAATAGTTTTCACTTTTA{AG}TATTCCACTT-AGTATCTACGGATATC{AG}ACCC-TACTCTAAGTATTATTTGGCTTATCCTCGTTTTGATTCTAGCTTTTATTCATCCTATCTTTACCTTAGAATGAAGATATAAACAGATCTTCGTTATAAGAGCTAGAAAGATATGACTTTGAAAGCAGCCTACACACCCTTTACGCCTGATTAGGA Termitomyces_DM_224C TTCCCCTAGTAACTGCGAGTGAAGCGGGAAAAGCTCAAATTTAAAATCTGG--TAGTCCTGCCCGAGTTGTAATCTAGAGAAGCATT-ATCCGCG{CT}TGGAC-CGTGTACAAGTGTCCTGGAATGGACTATCATAGAGGGTGAGAATCCCGTCTTTGA-CACGGACTA{AG}GGCTT-TGTGATGTGCTCTCAAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGCTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGCGTTGGCTG{AG}GTCAACC-TTGCGCTTGGCTTACTCC-{CT}{CT}AG-TTGACGGGTCAGCATCAGTTTTGA--CC{AC}GTGGATAAAGGAAGGGAATGTGGCACCGGGTGTG-TTATAGCCCTTG{AG}TCA??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Termitomyces_globulus_tgf11 TTCCCCTAGTAACTGCGAGTGAAGCGGGAAAAGCTCAAATTTAAAATCTGG--TAGTCCTGCCCGAGTTGTAATCTAGAGAAGCATT-ATCCGCGTTGGAC-CGTGTACAAGTGTCCTGGAATGGACTATCATAGAGGGTGAGAATCCCGTCTTTGA-CACGGACTAAGGCTT-TGTGATGTGCTCTCAAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGCTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGCGTTGGCTGAGTCAACC-TTG-GCTTGGCTTACTCC-TTAG-TTGACGGGTCAGCATCAGTTTTGA--CCGGTGGATAAAGGAAGGGAATGTGGCACCGGGTGTG-TTATAGCCCTTGGTCA??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 'Termitomyces heimii Muid_sn' ???????????????????????????????????????????AAATCTGG--TAGTCCTGCCCGAGTTGTAATCTAGAGAAGCATT-ATCCGCGCTGGAC-CGTGTATAAGTGTCCTGGAATGGACCATCATAGAGGGTGAGAATCCCGTCTTTGA-CACGGACTAGGGCTT-TGTGATGTGCTCTCAAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGCTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTC-CGTTAGCTGGGTCAACC-TTGCGCTTGGCTTACTTC-CCAG-TTGACGGGTCAGCATCAGTTTTGA--CCAATGGATAAAGGAGGGGAATGTGGCACCGGGTGTG-TTATAGCCCTTGGTCAGTTGACAGTGAGAGGTATCTGGGTATCTAATCCTATTTCCTATTCTCACCTTCGTTTCTCAGCGTCAATCATTCCTAGATAAATAGTTTTCACTTTTAGTATTCCACTTGAGTATCTACG-ATATCAACCCCTACTCTAAGTATTATTTGGCTTATCCTCGTTTTGATTCTAGCTTTTATTCGTCCTATCTTTACCTTAGAATGAAGATATAAA-AGATCTCCGTTATAAGAGCTAGAAAGATATGATTT-GAAAGCAGCCTACACACCCTTTACGCCTGATTAGGA Termitomyces_letestui_tgf16 TTCCCC??GTAACTGCGAGTGAAGCGGGAAAAGCTCAAATTTAAAATCTGG--TAGTCCTGCCCGAGTTGTAATCTAGAGAAGCATT-ATCCGCGCTGGAC-CGTGTACAAGTGTCCTGGAATGGACTATCATAGAGGGTGAGAATCCCGTCTTTGA-CACGGACTAGGGCTT-TGTGATGTGCTCTCAAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGCTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGCGTTGGCTGGGTCAACC-TTGCGCTTGGCTTACTTC-CCAG-TTGACGGGTCAGCATCAGTTTTGA--CCAGTGGATAAAGGAGGGGAATGTGGCACCGGGTGTG-TTATAGCCCTTGATCAGTTGACAGTGAGAGGTATCTGGGTCTCTAATCCTATTTCCTATTCTCACCTTCGTTTCTCAGCGTCAATCATTTCTAGATAAATAGTTTTCACTTTTAGTACTCCACTT-AGTATCTACGGATATCAACCC-TACTCTAAGTATTATTTAGCTTATCCTCGTTTTGATTCTAGCTTTTATTCATCCTATCTTTACCTTAGAATGAAGATATAAACAGATCTTCGTTATAAGAGCTAGAAAGATATGACTTTGAAAGCAGCCTACACACCCTTTACGCCTGATTAGGA Termitomyces_letestui_tgf5 TTCCCCTAGTAACTGCGAGTGAAGCGGGAAAAGCTCAAATTTAAAATCTGG--TAGTCCTGCCCGAGTTGTAATCTAGAGAAGCATT-ATCCGCGCTGGAC-CGTGTACAAGTGTCCTGGAATGGACTATCATAGAGGGTGAGAATCCCGTCTTTGA-CACGGACTAGGGCTT-TGTGATGTGCTCTCAAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGCTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGCGTTGGCTGGGTCAACC-TTG-GCTTGGCTTACTTC-CCAG-TTGACGGGTCAGCATCAGTTTTGA--CCAGTGGATAAAGGAGGGGAATGTGGCACCGGGTGTG-TTATAGCCCTTGATCA??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Termitomyces_letestui_tgf83 TTCCCC??GTAACTGCGAGTGAAGCGGGAAAAGCTCAAATTTAAAATCTGG--TAGTCCTGCCCGAGTTGTAATCTAGAGAAGCATT-ATCCGCGCTGGAC-CGTGTACAAGTGTCCTGGAATGGACTATCATAGAGGGTGAGAATCCCGTCTTTGA-CACGGACTAGGGCTT-TGTGATGTGCTCTCAAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGCTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGCGTTGGCTGGGTCAACC-TTG-GCTTGGCTTACTTC-CCAG-TTGACGGGTCAGCATCAGTTTTGA--CCAGTGGATAAAGGAGGGGAATGTGGCACCGGGTGTG-TTATAGCCCTTGATCA??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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[! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr110818] END;