#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on July 06, 2025; 16:11 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Schultheis L., & Donoghue M.J. 2004. Molecular phylogenetic and biogeographic analyses of Ribes (Grossulariaceae) with an emphasis on gooseberries (subg. Grossularia). Systematic Botany, null. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1096] [ The following blocks are input data for analysis step 1964 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep1964; DIMENSIONS NTAX=53; TAXLABELS Itea_ilicifolia Itea_virginica Ribes_aciculare Ribes_alpestre Ribes_alpinum Ribes_amarum Ribes_aureum_2 Ribes_binominatum Ribes_bracteosum Ribes_burejense Ribes_californicum Ribes_cereum Ribes_cynosbati_1 Ribes_diacanthum Ribes_divaricatum_1 Ribes_echinellum Ribes_fasciculatum_1 Ribes_formosanum_2 Ribes_giraldii Ribes_glaciale Ribes_glandulosum_2 Ribes_grossularioides Ribes_himalense Ribes_hirtellum_2 Ribes_indecorum Ribes_inerme_2 Ribes_komarovii_2 Ribes_lacustre_2 Ribes_lobbii Ribes_malvaceum Ribes_manshuricum Ribes_menziesii Ribes_missouriense Ribes_montigenum Ribes_nevadense Ribes_niveum Ribes_odoratum_2 Ribes_orientale Ribes_oxyacanthoides_2 Ribes_oxyacanthoides_cognatum Ribes_oxyacanthoides_irriguum Ribes_oxyacanthoides_setosum Ribes_roezli Ribes_rotundifolium Ribes_rubrum_1 Ribes_sanguineum Ribes_speciosum_1 Ribes_stenocarpum Ribes_tenue Ribes_triste_2 Ribes_uvacrispa_2 Ribes_velutinum Ribes_watsonianum ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M142] TITLE 'psbA-trnH intergenic spacer'; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep1964; DIMENSIONS NCHAR=502; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Itea_ilicifolia --ATCTAGCTGCTGTTGAAGCTCCATCTACAAATGGATAAGA-CTTCGGTC-TTAGTC-TATATGAGTTCTTGAAAGTAAAGTAAAATAAAGGAGCAATAACCAATT-----TCTTGTTCTCTCAAGAAACTTGGTATTGCTCCTTTATTTGGTTTACATAAGTTTTTTTTATTTTCAATTTAATTTAAGAAAAAGTATTCTTGTATTCTTATGCGTTGCTTTATTATTGAGTATCACAATTTAGTTCTTTAATAATT----------------------------------AATAATTTGTAAGTT---GAAAATAAAAAAA---AAAAGATCACAATTTACAATTGCTGTCTAA---------------AGTAATA------GATAGAAAGCTAATTTTTT-GTAATTATAAATTACAAAAAAT---TAAATTACTATA--AAATTACTAA--ATACTATACTAATAACTAATAGTATAGGGGCGG-------------- Itea_virginica 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TREE Fig._3 = [&R] ((((((((Ribes_alpestre,Ribes_burejense,Ribes_formosanum_2,Ribes_grossularioides,(Ribes_oxyacanthoides_irriguum,Ribes_stenocarpum)),Ribes_aciculare,(Ribes_oxyacanthoides_cognatum,Ribes_cynosbati_1,Ribes_divaricatum_1,Ribes_inerme_2,Ribes_oxyacanthoides_2,Ribes_oxyacanthoides_setosum),Ribes_echinellum,Ribes_missouriense,Ribes_niveum,Ribes_uvacrispa_2),Ribes_hirtellum_2,Ribes_rotundifolium,(((Ribes_amarum,Ribes_binominatum,Ribes_lobbii,Ribes_menziesii,Ribes_roezli,Ribes_watsonianum),Ribes_californicum,Ribes_speciosum_1),Ribes_velutinum),(((Ribes_cereum,Ribes_nevadense),Ribes_sanguineum),(Ribes_indecorum,Ribes_malvaceum)),Ribes_lacustre_2,Ribes_montigenum),(Ribes_fasciculatum_1,Ribes_triste_2),(Ribes_himalense,Ribes_manshuricum,Ribes_rubrum_1)),(((Ribes_alpinum,Ribes_diacanthum),Ribes_giraldii,Ribes_komarovii_2),(Ribes_glaciale,Ribes_orientale,Ribes_tenue))),Ribes_bracteosum,Ribes_glandulosum_2),Ribes_aureum_2,Ribes_odoratum_2),(Itea_virginica,Itea_ilicifolia)); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr1682] END;