#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on November 12, 2026; 7:32 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Heidmarsson S., Gueidan C., Miadlikowska J.M., & Lutzoni F. 2017. Multi-locus phylogeny supports the placement of Endocarpon pulvinatum within Staurothele s. str. (lichenised ascomycetes, Eurotiomycetes, Verrucariaceae). Phytotaxa, 306(1): 37-48. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S20693] [ The following blocks are input data for analysis step 20264 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep20264; DIMENSIONS NTAX=45; TAXLABELS Bagliettoa_baldensis_CG1760 Capronia_pilosella_WUC28 Capronia_semiimmersa_WUC244 Dermatocarpon_bachmannii_SH155 Dermatocarpon_cf_meiophyllizum_SH199 Dermatocarpon_miniatum_CG387 Dermatocarpon_miniatum_SH175 Endocarpon_pallidulum_SJ4028 Endocarpon_pulvinatum_BMC20686 Endocarpon_pulvinatum_BMC26544 Endocarpon_pulvinatum_BMC27176A Endocarpon_pulvinatum_BMC27947 Endocarpon_pulvinatum_BMC32483 Endocarpon_pulvinatum_RR3686 Endocarpon_pulvinatum_SH300 Endocarpon_pulvinatum_SH314 Endocarpon_pusillum_CG470 Endocarpon_pusillum_Z07020 Henrica_melaspora_AA62248 Heteroplacidium_fusculum_CG582 Hydropunctaria_aractina_SH310 Hydropunctaria_maura_SH233 Hydropunctaria_rheitrophila_SH304 Hydropunctaria_scabra_SH273 Parabagliettoa_cyanea_CG1761 Placidium_arboreum_CG579 Placopyrenium_canellum_CG808 Sporodictyon_schaererianum_SH298 Staurothele_areolata_SH154 Staurothele_areolata_SH268 Staurothele_fissa_SH194 Staurothele_fissa_SH248 Staurothele_fissa_SH260 Verrucaria_aethiobola_SH184 Verrucaria_aethiobola_SH197 Verrucaria_alpicola_SH228 Verrucaria_ceuthocarpa_SH236 Verrucaria_degelii_SH315 Verrucaria_latebrosa_SH183 Verrucaria_latebrosa_SH210 Verrucaria_margacea_SH163 Verrucaria_margacea_SH202 Verrucaria_muralis_SH160 Wahlenbergiella_mucosa_SH271 Wahlenbergiella_tavaresiae_CG1101 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M40374] TITLE 'Endocarpon pulvinatum within Staurothele 4-gene DS'; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep20264; DIMENSIONS NCHAR=2895; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 2010 2020 2030 2040 2050 2060 2070 2080 2090 2100 2110 2120 2130 2140 2150 2160 2170 2180 2190 2200 2210 2220 2230 2240 2250 2260 2270 2280 2290 2300 2310 2320 2330 2340 2350 2360 2370 2380 2390 2400 2410 2420 2430 2440 2450 2460 2470 2480 2490 2500 2510 2520 2530 2540 2550 2560 2570 2580 2590 2600 2610 2620 2630 2640 2650 2660 2670 2680 2690 2700 2710 2720 2730 2740 2750 2760 2770 2780 2790 2800 2810 2820 2830 2840 2850 2860 2870 2880 2890 2900 2910 2920 2930 2940 2950 2960 2970 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Bagliettoa_baldensis_CG1760 GGCTCAGAAATATTCCAACCAGTCACCACCAAGCAATTCACTCCTATGCAGCTCTGTCCATCACCTGAATGCCAGAAAAACAACACCAAGGGGCAACTCTTTCCATCGACACGTGCATCAAAATTCTTGCCATTCCAGGAAGTAAAGATTCAGGAAATGGCAGATCAAGTTCCAGTCGGTCATATTCCTCGAACACTCACAGTCCACTGCCATGGCTGCTTGACCCGTCAGATCAATCCTGGAGATGTTGTCGATATTGCCGGAATTTTTCTACCCACGCCATATACTGGATTCCGAGCAATTAGAGCAGGGCTGCTCACAGACACATACCTCGAAGCTCAGCATATAACGCAGCATAAAAAAGCATACCAGGATCTTCTGATGGATGCCAGAACACTACGCAGGATTGATCAATATAGGGCGTCTGGACATATGTACGACTATCTGTCCCGCTCAATTGCACCCGAAATCTTCGGTCATCTTGACGTGAAAAAGGCGCTTCTTCTGCTCCTGATTGGGGGTGTCACGAAAGAGATGGGTGATGGTATGCGTATTCGTGGC??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????--?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AATAGCCTAACGGCTGAACCAGCAACTTGGAAG--AATGTA-TAACGAATAAGTCGTATAAAATTCTAGATAGAAAACTGATAATGACAACTAACTATCTATTAGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGCAATACGCAGAAGACAAGTGTTATTCATCTTTAATCGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGGAAATCAAGCC-ATAGTA----GGGACTAATTTTCTAGAGTTTTATGGGAGAAAGT-GGAATATCA----GGAGTAGAGATAATATATTATGATACCTGAGAGACGGGTAACGGCGTAGGCAACTTTCTATGTAAAAACTGACGTTGAGGGACGAAG--CCCTGGGTAACGATAAGGATTAGATACCCCAGTAGTCCAGGGAGACAATGATGAGTGCCATAGGCTAGACATCTT-AGCCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTTAAGACTAAAGCGGC-AACGCCCAAATTGAAATCATTAGACCGTT-CCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTATTTAATTCGATGATCCGCGAATAACCTTACCACGTTTTGAATAACAAGCGCTGCACGGCTGTCTTTAGTTAATGTCGTGAGACTTTGGTTAACTCCTTTAATTAACGAAAA-CCCTTGTTTT-ATTTAAAACAGTTCTCCGCTATATTGGATAAGATAATAGGGATTAAGACAAGTCATCATGGCCTTAATAACGCATTACTGATCCGTTGCTTTGGCGGACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGCGAATTGCAGAATTCC-GTGAGTCATCGAATCTTTGAACGCATATTGCGCCCTTTGGTATTCCGAAGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTA--TC--AACCCTCAAGC-CC--GGCTTG-CTGTTGAAAGATAATATGCAACGAGCGACCTCGGATC????????????????????????? Capronia_pilosella_WUC28 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Dermatocarpon_cf_meiophyllizum_SH199 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Hydropunctaria_aractina_SH310 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Hydropunctaria_maura_SH233 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Verrucaria_muralis_SH160 GGCTCCGAGATTTTCCAGCCAGTCACTACGAAGCAATTCACACCCATGCAGGTTTGCCCCTCTCCGGAGTGCCAGAAGAATGACAGCAAAGGGCAGCTATTCCCTTCAACTCGTGCATCTAAATTTCTGCCCTTTCAGGAAGTCAAGATTCAAGAAATGGCAGATCAAGTGCCGGTTGGCCATATTCCCCGGACGTTGGCAGTTCACTGTCAAGGCGGCTTGACTCGTCAGATCAATCCTGGAGATGTCGTTGACATTGCTGGAATTTTCTTGCCAACTCCATACACTGGATTCAGAGCAATTCGAGCAGGGCTTCTCACAGACACATATCTGGAGGCTCAGCACATCACTCAGCACAAGAAAGCATACCAAGACCTTCTGATGGATGCGAGAACTCTACGCAGAATCGATCAATATAAAGCGTCGGGTCACATGTATGATTACCTCTCCCGCTCAATTGCACCAGAAATCTTCGGCCATCTGGATGTGAAGAAGGCTTTACTTCTTCTTCTTATTGGCGGTGTCACAAAAGAGATGGGCGACGGGATGCGTATTCGAGGCATATCAATAAGCGGAGGAAAAGAAACCAACAGGGATTGCCTCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCAAATTTGAAATCTGGGAGTTGTAATTTGTAGAGGA--TGCTT-CGGG-CAAGGCTGTGGTCTAATTTGCTTGGAACAGCGAGTCATAGAGGGTGAGAGTCCCGTCTAGGATCGTAAG-CCGC-GTCCATGTGAAGCTCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATATTGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGAAAAGAGAGTTAAACAGTATGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAATCAGACTTG-AGTGTGACGGTTCCCCC--GGCCGGCCGGGCTACT-CCGTCATATCCAGGCCAGCATCGGTTTGGGTGGTCGGTTAAAGACCCCGGGAATGTATCTACCTCC--GGG--TCGACTTATAGCCCGGGGTGCAATGCGGCCCACCCGGACCGAGGAACGCGCTTCGGCTCGGATGCTGGCGTAATGGTTGCAAGCGGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTATGCGAGTGTTTGGGTGTC-AAACCCCTA-CGCGTAATGAAAGTGAACGGAGGTAAGAACCGGTGCATTATCGACCGATCCTGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTAAGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGCATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACCATCTGGTAGCTGGTTCCTGTCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGTAACG-TTTTCAGTTTTATGAGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCCTTGGGGTTGAATCAACCTTAACCTATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAAGTCCTTGTTACTTAATTGAACGTGGACATTTGAATGTATCGTTA?TAGTGGGCCATTTTTGGTAAGCAGAAC?GGCGATGCGGGATGAACCGAACGTGAGGTTAAGGTGCCGGAATGTACGCTCATCAGACACCACAAAAGGTGTCAATGCATCCAGACAGCCGGACGGTGGCCATGGAAGTCGGAATCCGCTTAGGAGTGTGTAACAACTCACCGGCCGAATGCATTGGCCCTGAAAATGGATGGCG?TTAAGCGTGCTACCTATACC???CCGT?GGGG??GAAATGATGCCCCAACGAGTAGGCAGGCG?????????AATAGCCTAACGGCTGAACCAGCAACTTGGAAG--AATGTA-TAACGAATAAGTCGTATAAAATTCTAGATAGAAAACTGATAATGACTATTATCTATCTATTAGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGCAGAAGACAAGTGTTATTCATCTTTATTCGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGGAAATCAAGCC-A-AGTA----GGGACTAATTTTCTAGAGTTTTATGGAAGAAAGT-CGAACATCT----GGAGGAGAGATAAAATATTGTGATACCAGATAGACGGGTAACGGCGTAGGCAACTTTCTATGTAAAAACTGACGTTGAGGGACGAAG--CCCTGGGTATCGAGAAGGATTAGATACCCCAGTAGTCCAGGGAGACAATGATGAGTGCCATAGGCTAGATAAATT-AGTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCAAGACTAAAGCGGC-AACGCCCAAATTGAAATCATTAGACCGTT-TCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTCGATGTTCCGCGAATAACCTTACCACGTTTTGAATAACAAGCGCTGCACGGCTGTCTTTAGTTAATGTCGTGAGACTTTGGTTAACTCCTTTAATTAACGAAAA-CCCTTGTTTT-ATTTAAAACAGTTCTCCGCTATATTGGATAAGATAATAGGGATTAAGGCAAGTCATCATGGCCTAAATAACGCATTATCGATCCGTTGCTTTGGCGGGCTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGCGAATTGCAGAATTCC-GTGAGTCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTTTGGTATTCCGAAGGGCATGCCTGTCCGAGCGTCATTA--TC--AACCTTCAAGC-CC--GGCTTG-CTGTTGAAAGATAATACGCAGCGAGCGACCTCGGATCAGGTAG??????????????????? Wahlenbergiella_mucosa_SH271 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; END; [ The following blocks are output data for analysis step 20264 ] BEGIN TREES; TITLE 'Endocarpon pulvinatum within Staurothele 4-gene Bayesian MJ consensus tree with Br L'; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep20264; TREE con_50_majrule = [&R] 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TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr102685] END;