#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on August 02, 2025; 5:59 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Kenaley S.C. 2017. First report of Puccinia coronata var. coronata s.s. infecting alder buckthorn in the United States. Plant Health Progress, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S20727] [ The following blocks are input data for analysis step 20286 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep20286; DIMENSIONS NTAX=16; TAXLABELS Puccinia_brachypodii_GQ457303 Puccinia_bromina_DQ460719 'Puccinia cerinthes-agropyrina DQ460720' Puccinia_coronata_DQ355443 Puccinia_coronata_DQ355449 Puccinia_coronata_KC305496 Puccinia_graminis_f.sp._avenae_DQ460727 Puccinia_hordei_AY187089 'Puccinia hordei-secalini DQ460723' Puccinia_persistens_DQ460722 Puccinia_recondita_AY187088 Puccinia_sp._Alder_Buckthorn_CT Puccinia_striiformis_GQ457304 Puccinia_triticina_DQ417418 Uromyces_aemulus_AF511081 Uromyces_scillarum_AY302495 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M40444] TITLE Puccinia_ITS_Nearest_matches_in_GenBank_alignment; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep20286; DIMENSIONS NCHAR=1263; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Puccinia_triticina_DQ417418 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; END; [ The following blocks are output data for analysis step 20286 ] BEGIN TREES; TITLE Puccinia_ITS_MJ_con_MLT; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep20286; TREE Fig._2A = [&R] (((((Puccinia_hordei_AY187089,Uromyces_scillarum_AY302495),(((Puccinia_graminis_f.sp._avenae_DQ460727,(Puccinia_striiformis_GQ457304,Puccinia_brachypodii_GQ457303)),((Puccinia_sp._Alder_Buckthorn_CT,Puccinia_coronata_DQ355443),(Puccinia_coronata_KC305496,Puccinia_coronata_DQ355449))),(Puccinia_recondita_AY187088,((Puccinia_bromina_DQ460719,'Puccinia cerinthes-agropyrina DQ460720'),Uromyces_aemulus_AF511081)))),Puccinia_persistens_DQ460722),Puccinia_triticina_DQ417418),'Puccinia hordei-secalini DQ460723'); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr102764] END;