#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on September 20, 2025; 19:27 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Jung T., Scanu B., Bakonyi J., Seress D., Kovacs G.M., Duran A., Sanfuentes von stowasser E., Schena L., Mosca S., Thu P.Q., Nguyen C.M., Fajardo S., Gonzalez M., Perez-sierra A., Rees H., Cravador A., Maia C., & Horta jung M. 2017. Nothophytophthora gen. nov., a new sister genus of Phytophthora from natural and semi-natural ecosystems. Persoonia, 39: 143-174. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S20801] [ The following blocks are input data for analysis step 20533 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep20533; DIMENSIONS NTAX=42; TAXLABELS Nothophytophthora_amphigynosa_BD269 Nothophytophthora_amphigynosa_BD742 Nothophytophthora_amphigynosa_BD857 Nothophytophthora_amphigynosa_BD858 Nothophytophthora_amphigynosa_BD859 Nothophytophthora_amphigynosa_BD860 Nothophytophthora_amphigynosa_CBS_142348 Nothophytophthora_amphigynosa_CBS_142349 Nothophytophthora_caduca_CBS_142350 Nothophytophthora_caduca_CBS_142351 Nothophytophthora_caduca_CL239 Nothophytophthora_caduca_CL240 Nothophytophthora_caduca_CL320 Nothophytophthora_caduca_CL321 Nothophytophthora_caduca_CL323 Nothophytophthora_caduca_CL325 Nothophytophthora_caduca_CL326 Nothophytophthora_caduca_CL327 Nothophytophthora_caduca_CL334 Nothophytophthora_chlamydospora_CBS_142352 Nothophytophthora_chlamydospora_CBS_142353 Nothophytophthora_chlamydospora_CL317 Nothophytophthora_chlamydospora_CL318 Nothophytophthora_chlamydospora_CL319 Nothophytophthora_intricata_CBS_142354 Nothophytophthora_intricata_CBS_142355 Nothophytophthora_intricata_RK113_1sHa Nothophytophthora_intricata_RK113_1sHb Nothophytophthora_intricata_RK113_1sb Nothophytophthora_valdiviana_CBS_142356 Nothophytophthora_valdiviana_CBS_142357 Nothophytophthora_valdiviana_CL329 Nothophytophthora_valdiviana_CL330 Nothophytophthora_valdiviana_CL332 Nothophytophthora_vietnamensis_CBS_142358 Nothophytophthora_vietnamensis_CBS_142359 Nothophytophthora_vietnamensis_VN230 Nothophytophthora_vietnamensis_VN799 Nothophytophthora_vietnamensis_VN800 Phytophthora_boehmeriae_CBS_291.29 Phytophthora_humicola_CBS_200.81 Phytophthora_rubi_CBS_967.95 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M40744] TITLE Nothophytophthora_ITS_Btub_LSU_Nadh1_Hsp90_Cox1_alignment; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep20533; DIMENSIONS NCHAR=5366; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Nothophytophthora_amphigynosa_BD269 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Nothophytophthora_amphigynosa_BD742 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Phytophthora_humicola_CBS_200.81 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