#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on September 01, 2025; 2:21 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Okane I., & Ono Y. 2017. Phylogenetic study of indigenous grapevine leaf rust fungi in North America and biological identity of an invasive grapevine leaf rust fungus in Brazil. Mycoscience, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S20975] [ The following blocks are input data for analysis step 21205 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep21205; DIMENSIONS NTAX=135; TAXLABELS Phakopsora_ampelopsidis_IBAR10115 Phakopsora_ampelopsidis_IBAR10116 Phakopsora_ampelopsidis_IBAR10126 Phakopsora_ampelopsidis_IBAR10127 Phakopsora_ampelopsidis_IBAR10128 Phakopsora_ampelopsidis_IBAR7988 Phakopsora_ampelopsidis_IBAR8419 Phakopsora_ampelopsidis_IBAR8597 Phakopsora_ampelopsidis_IBAR8613 Phakopsora_ampelopsidis_IBAR8618 Phakopsora_ampelopsidis_IBAR8633 Phakopsora_hornotina_IBAR10434 Phakopsora_hornotina_IBAR10538 Phakopsora_hornotina_IBAR10582 Phakopsora_hornotina_IBAR10583 Phakopsora_hornotina_IBAR10587 Phakopsora_hornotina_IBAR10589 Phakopsora_hornotina_IBAR10590 Phakopsora_hornotina_IBAR10714 Phakopsora_hornotina_IBAR10717 Phakopsora_hornotina_IBAR10721 Phakopsora_hornotina_IBAR10722 Phakopsora_hornotina_IBAR10726 Phakopsora_meliosmae_IBAR10037 Phakopsora_meliosmae_IBAR10038 Phakopsora_meliosmae_IBAR10057 Phakopsora_meliosmae_IBAR10058 Phakopsora_meliosmae_IBAR10059 Phakopsora_meliosmae_IBAR10060 Phakopsora_meliosmae_IBAR7582 Phakopsora_meliosmae_IBAR8085 Phakopsora_meliosmae_IBAR9906 Phakopsora_meliosmae_IBAR9911 Phakopsora_meliosmae_IBAR9912 Phakopsora_meliosmae_IBAR9943 Phakopsora_meliosmae_IBAR9946 Phakopsora_meliosmae_IBAR9977 'Phakopsora meliosmae-myrianthae IBAR10118' 'Phakopsora meliosmae-myrianthae IBAR10119' 'Phakopsora meliosmae-myrianthae IBAR10120' 'Phakopsora meliosmae-myrianthae IBAR10121' 'Phakopsora meliosmae-myrianthae IBAR10122' 'Phakopsora meliosmae-myrianthae IBAR10123' 'Phakopsora meliosmae-myrianthae IBAR10239' 'Phakopsora meliosmae-myrianthae IBAR10240' 'Phakopsora meliosmae-myrianthae IBAR7720' 'Phakopsora meliosmae-myrianthae IBAR8084' 'Phakopsora meliosmae-myrianthae IBAR8106' 'Phakopsora meliosmae-myrianthae IBAR8584' 'Phakopsora meliosmae-myrianthae IBAR8695' 'Phakopsora meliosmae-myrianthae IBAR9605' 'Phakopsora meliosmae-myrianthae IBAR9668' 'Phakopsora meliosmae-myrianthae IBAR9679' 'Phakopsora meliosmae-myrianthae IBAR9680' Phakopsora_montana_IBAR10082 Phakopsora_montana_IBAR10085 Phakopsora_montana_IBAR10089 Phakopsora_montana_IBAR10124 Phakopsora_montana_IBAR10303 Phakopsora_montana_IBAR10309 Phakopsora_montana_IBAR10312 Phakopsora_montana_IBAR10314 Phakopsora_montana_IBAR8556 Phakopsora_montana_IBAR9545 Phakopsora_montana_IBAR9547 Phakopsora_montana_IBAR9682 Phakopsora_muscadiniae_IBAR10516 Phakopsora_muscadiniae_IBAR10519 Phakopsora_muscadiniae_IBAR10522 Phakopsora_muscadiniae_IBAR10525 Phakopsora_muscadiniae_IBAR10526 Phakopsora_muscadiniae_IBAR10527 Phakopsora_muscadiniae_IBAR10533 Phakopsora_muscadiniae_IBAR10546 Phakopsora_muscadiniae_IBAR10547 Phakopsora_muscadiniae_IBAR10548 Phakopsora_muscadiniae_IBAR10551 Phakopsora_muscadiniae_IBAR10611 Phakopsora_muscadiniae_IBAR10628 Phakopsora_muscadiniae_IBAR10631 Phakopsora_muscadiniae_IBAR10746 Phakopsora_muscadiniae_IBAR10755 Phakopsora_muscadiniae_IBAR10757 Phakopsora_muscadiniae_IBAR10758 Phakopsora_orientalis_IBAR10080 Phakopsora_orientalis_IBAR7612 Phakopsora_orientalis_IBAR9942 Phakopsora_pachyrhizi Phakopsora_sp_IBAR10041 Phakopsora_sp._IBAR10042 Phakopsora_sp._IBAR10043 Phakopsora_sp._IBAR10044 Phakopsora_sp._IBAR10217 Phakopsora_sp._IBAR10218 Phakopsora_sp._IBAR10219 Phakopsora_sp._IBAR10220 Phakopsora_sp._IBAR10221 Phakopsora_sp._IBAR10223 Phakopsora_sp._IBAR10225 Phakopsora_sp._IBAR10226 Phakopsora_sp._IBAR10227 Phakopsora_sp._IBAR10228 Phakopsora_sp._IBAR10229 Phakopsora_sp._IBAR10230 Phakopsora_sp._IBAR10231 Phakopsora_sp._IBAR10578 Phakopsora_sp._IBAR8755 Phakopsora_sp._IBAR8758 Phakopsora_sp._IBAR8808 Phakopsora_sp._IBAR8810 Phakopsora_sp._IBAR9657 Phakopsora_sp._IBAR9676 Phakopsora_uva_IBAR10530 Phakopsora_uva_IBAR10534 Phakopsora_uva_IBAR10540 Phakopsora_uva_IBAR10542 Phakopsora_uva_IBAR10544 Phakopsora_uva_IBAR10612 Phakopsora_uva_IBAR10613 Phakopsora_uva_IBAR10615 Phakopsora_uva_IBAR10617 Phakopsora_uva_IBAR10618 Phakopsora_uva_IBAR10627 Phakopsora_vitis_IBAR10098 Phakopsora_vitis_IBAR10101 Phakopsora_vitis_IBAR10108 Phakopsora_vitis_IBAR10117 Phakopsora_vitis_IBAR10125 Phakopsora_vitis_IBAR7143 Phakopsora_vitis_IBAR7682 Phakopsora_vitis_IBAR8047 Phakopsora_vitis_IBAR8105 Phakopsora_vitis_IBAR8107 Phakopsora_vitis_IBAR8732 Phakopsora_vitis_IBAR9894 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M41760] TITLE Phylogeny_of_GLR_fungi_by_iokane; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep21205; DIMENSIONS NCHAR=1018; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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'Phakopsora meliosmae-myrianthae IBAR8084' 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