#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 18, 2026; 9:00 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Matsuzaki R., Nozaki H., & Kawachi M. 2018. Taxonomic revision of Chloromonas nivalis (Volvocales, Chlorophyceae) strains, with the new description of two snow-inhabiting Chloromonas species. PLoS ONE, 13(3): e0193603. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S22105] [ The following blocks are input data for analysis step 22537 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep22537; DIMENSIONS NTAX=32; TAXLABELS Chloromonas_asteroidea Chloromonas_augustae 'Chloromonas brevispina Zygotes_Hakkoda1' 'Chloromonas brevispina Zygotes_Hakkoda2' 'Chloromonas chenangoensis UTEX_SNO150' Chloromonas_chlorococoides Chloromonas_fukushimae_NIES3389 'Chloromonas hohamii UTEX_SNO67' 'Chloromonas hoshawii UTEX_SNO66' Chloromonas_kasaiae Chloromonas_krienitzii_NIES3753 Chloromonas_miwae_NIES2379 Chloromonas_miwae_NIES2380 'Chloromonas nivalis UTEX_SNO71' 'Chloromonas nivalis Zygotes_GassanB' 'Chloromonas nivalis Zygotes_GassanNIV1' 'Chloromonas nivalis Zygotes_GassanNIV2' 'Chloromonas nivalis Zygotes_P24DR4' 'Chloromonas nivalis subspecies_tatrae_Zygotes_LP01' 'Chloromonas pichinchae UTEX_SNO33' Chloromonas_pseudoplatyrhyncha Chloromonas_radiata 'Chloromonas remiasii CCCryo_005_99' Chloromonas_reticulata Chloromonas_serbinowii 'Chloromonas tenuis UTEX_SNO132' 'Chloromonas tughillensis UTEX_SNO91' Chloromonas_typhlos Gloeomonas_lateperforata Gloeomonas_rubrifilum Ixipapillifera_deasonii Ixipapillifera_pauromitos ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M46109] TITLE Chlorophyceae_rbcL; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep22537; DIMENSIONS NCHAR=1128; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Chloromonas_asteroidea 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Chloromonas_augustae 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'Chloromonas brevispina Zygotes_Hakkoda1' 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'Chloromonas brevispina Zygotes_Hakkoda2' 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'Chloromonas hohamii UTEX_SNO67' 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Chloromonas_miwae_NIES2380 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'Chloromonas nivalis UTEX_SNO71' 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'Chloromonas nivalis Zygotes_GassanB' 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'Chloromonas nivalis Zygotes_GassanNIV1' 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'Chloromonas nivalis Zygotes_P24DR4' ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCTCACGGTATCCAAGTTGAACGTGACAAATTAAACAAATATGGTCGTGGTCTTTTAGGTTGTACAATCAAACCAAAATTAGGTCTTTCAGCTAAAAACTACGGACGTGCGGTTTACGAATGTTTACGTGGTGGACTAGATTTTACAAAAGATGATGAAAACGTTACATCTCAAGCATTCATGCGTTGGAGAGACCGTTTCATTTTCGTTGCTGAAGCTCTTTACAAATCTCAAGCAGAAACAGGTGAAATTAAAGGACACTATTTAAACGTAACTGCAGGTACATCTGAAGAAATG{AC}T{GT}AAACGTGCGGAAGTAGCTAAAGAATTAGGAGTGCCTATTATTATGCATGACTATTTAACAGGTGGTCTTACTGCAAACACTTCATTAGCTCACTACTGTCGTGACAACGGATTATTATTACACATTCACAGAGCAATGCACGCGGTTATTGACCGTCAAAGAAATCACGGTATTCACTTCCGTGTTTTAGCTAAAGCACTTCGTTTATCAGGTGGTGACCACCTTCACTCAGGAACTGTTGTAGGTAAACTTGAAGGTGAA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 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Chloromonas_pseudoplatyrhyncha 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Chloromonas_radiata GCTGGTTTTAAAGCTGGTGTTAAAGATTATCGTTTAACATATTACACTCCTGACTACGTTGTAAAAGATACAGACATTCTTGCGGCATTCCGTATGACTCCTCAAGCAGGCGTTCCTGCTGAAGAGGCTGGTGCTGCTGTAGCTGCTGAGTCTTCTACTGGTACTTGGACAACAGTATGGACTGATGGTTTAACAAGTCTTGACCGTTACAAAGGCCGTTGTTATGACATCGAACCAGTTGCTGGTGAAGAAAATCAGTATATTGCTTATGTTGCATACCCAATCGACTTATTTGAAGAAGGTTCTGTAACAAACTTATTTACATCAATTGTAGGTAACGTTTTCGGTTTCAAAGCTCTTCGTGCACTTCGTCTTGAAGATCTTCGTATTTCTACTTCTTACGCAAAAACATTCCAAGGGGCTCCACACGGTATTCAAGTAGAACGTGACAAATTAAACAAATATGGTCGTGGTCTTTTAGGTTGTACAATTAAACCAAAATTAGGTCTTTCAGCTAAAAACTACGGACGTGCAGTTTATGAATGTTTACGTGGTGGATTAGATTTTACTAAAGATGACGAAAACGTTACATCTCAACCTTTCATGCGTTGGAGAGACCGTTTTATTTTCGTTGCTGAAGCTCTTTACAAATCTCAAGCTGAAACAGGTGAGGTTAAAGGTCACTATTTAAACGTTACTGCAGGAACTTCTGAAGAAATGTTAAAACGTGCTGAAGTTGCTAAAAACTTAGGTGTACCTATCATCATGCACGACTACCTTACTGGTGGTTTAACATCTAACACTTCGTTAGCACACTACTGTCGTGATAACGGTTTATTATTACACATTCACAGAGCGATGCACGCGGTTATCGACCGTCAAAGAAACCACGGTATTCACTTCCGTGTTTTAGCTAAAGCTCTTCGTATGTCAGGTGGTGACCACCTTCACTCAGGAACTGTTGTAGGTAAACTTGAAGGTGAACGTGAAGTTACTTTAGGTTTCGTAGACTTAATGCGTGATGAATACATCGAAAAAGATCGTAGCCGTGGTATCTACTTCACACAAGATTGGTGTGGATTACCTGGTGTTATGCCAGTTGCTTCTGGTGGTATTCACGTATGGCAC 'Chloromonas remiasii CCCryo_005_99' 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Chloromonas_reticulata 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Chloromonas_serbinowii GCAGGTTTTAAAGCTGGTGTTAAAGATTATCGTTTAACATATTATACTCCTGATTACGTTGTAAAAGAAACAGATATTCTTGCTGCATTCCGTATGACTCCACAAGCTGGTGTTCCTATTGAAGAAGCTGGTGCTGCTGTTGCTGCTGAATCTTCAACAGGTACTTGGACAACTGTATGGACAGACGGTTTAACTAGTCTTGATCGTTATAAAGGTCGTTGCTATGACATCGAACCAGTAGCAGGTGAAGAAAATCAATATATCGCATATGTTGCATACCCTATCGACTTATTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACTTATTTACATCAATTGTAGGTAACGTATTTGGTTTCAAAGCTCTTCGTGCTCTTCGTCTTGAAGATTTACGTATTGCTCCAGCATACTGTAAAACATTCCAAGGACCTCCACACGGTATTCAAGTAGAACGTGATAAATTAAACAAATATGGTCGTGGTCTATTAGGTTGTACTATCAAACCTAAATTAGGTCTTTCAGCTAAAAACTATGGACGTGCTGTTTACGAATGTTTACGTGGTGGATTAGATTTTACAAAAGATGATGAAAACGTAACTTCTCAATCATTCATGCGTTGGAGAGACCGTTTCATTTTCGTTGCTGAAGCTCTTTATAAATCTCAAGCAGAAACTGGTGAAATTAAAGGTCACTATTTAAATGTAACTGCTGGTACTTCAGAAGAAATGTTAAAACGTGCTGAAGTTGCTAAAGATTTAGGTGTACCTATCATTATGCATGACTACTTAACTGGTGGTTTCACTGCTAACACTTCATTATCACACTACTGTCGTGATAATGGTTTACTATTACACATCCACAGAGCTATGCACGCGGTAATTGACCGTCAAAGAAACCACGGTATGCACTTCCGTGTATTAGCTAAAGCTCTTCGTCTATCAGGTGGTGACCACCTTCACTCAGGTACTGTTGTTGGTAAACTTGAAGGTGAACGCGAAGTAACTTTAGGTTTCGTTGATTTAATGCGTGATGAATATATTGAAAAAGACCGTAGCCGTGGTATTTATTTCACACAAGATTGGTGTGGTTTACCAGGTGTTATGCCAGTTGCTTCTGGTGGTATTCACGTATGGCAT 'Chloromonas tenuis UTEX_SNO132' 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'Chloromonas tughillensis UTEX_SNO91' GCAGGTTTTAAAGCTGGTGTTAAAGATTATCGTTTAACATATTACACTCCAGATTACGTTGTAAAAGATACAGACATTCTTGCTGCTTTCCGTATGACACCTCAAGCAGGTGTACCAATTGAAGAAGCTGGTGCTGCTGTTGCAGCAGAATCTTCTACAGGTACTTGGACAACTGTTTGGACTGACGGTTTAACAAGTCTTGACCGTTACAAAGGACGTTGTTACGACATCGAACCAGTAGCTGGTGAAGAAAATCAGTACATTGCGTACGTTGCTTACCCAATCGATTTATTTGAAGAAGGTTCTGTAACAAACTTATTTACATCTATTGTAGGTAACGTTTTTGGTTTTAAAGCTCTTCGTGCTCTTCGTCTAGAAGATTTACGTATTTCTTGTGCGTATGCTAAAACATTCCAAGGACCTCCTCATGGTATTCAAGTAGAACGTGACAAATTAAACAAATATGGACGTGGTCTTTTAGGTTGTACAATTAAACCTAAATTAGGTCTTTCAGCTAAAAACTACGGACGTGCTGTTTACGAATGTTTACGTGGTGGATTAGACTTCACAAAAGATGACGAAAACGTTACTTCTCAAGCTTTCATGCGTTGGAGAGACCGTTTTATTTTCGTAGCTGAAGCTATCTACAAATCTCAAGCTGAAACAGGTGAAATTAAAGGGCATTATTTAAACGTTACTGCTGGTACGTCTGAAGAAATGCTTAAACGTGCTGAAGTTGCTAAAGATTTAGGTGTACCTATTATTATGCATGACTATCTTACAGGTGGTTTAACTTCTAACACTTCATTAGCTCACTACTGTCGTGACAACGGTTTATTACTACACATTCACAGAGCTATGCACGCGGTTATTGACCGTCAAAGAAATCACGGTATTCACTTCCGTGTTTTAGCTAAAGCTCTTCGTCTATCTGGTGGTGACCATCTTCACTCTGGAACTGTTGTTGGTAAACTTGAAGGAGAACGTGAAGTTACTTTAGGTTTCGTTGATTTAATGCGTGACGAATACATCGAAAAAGATCGTAGCCGTGGTATTTATTTCACACAAGACTGGTGTGGTTTACCTGGTGTTATGCCAGTTGCTTCAGGTGGTATTCATGTTTGGCAC Chloromonas_typhlos GCAGGTTTTAAAGCTGGTGTTAAAGATTATCGTTTAACATATTATACTCCTGATTACGTTGTAAGAGAAACAGATATTCTTGCTGCATTCCGTATGACTCCACAAGCTGGTGTTCCTATCGAAGAAGCAGGTGCTGCTGTAGCTGCTGAATCTTCAACAGGTACATGGACAACTGTATGGACTGATGGTTTAACAAGTCTTGACCGTTATAAAGGTCGTTGTTATGATATCGAACCAGTTGCTGGTGAAGATAATCAATATATCGCTTACGTTGCATACCCTATCGAATTATTTGAAGAAGGTTCTGTAACTAGTTTATTAACATCTATTGTTGGTAACGTTTTTGGTTTCAAAGCTCTTCGTGCTCTACGTCTTGAAGATTTACGTATTTCTACTGCATATTGTAAATCATTCCAAGGACCTCCTCACGGTATTCAAGTAGAACGTGACAAATTAAACAAATATGGTCGTGGTCTTTTAGGTTGTACTATCAAACCTAAATTAGGTCTTTCAGCTAAAAACTACGGACGTGCTGTTTATGAATGTTTACGTGGTGGACTTGACTTCACGAAAGATGACGAAAACGTTACTTCTCAATCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTTATTTTCGTTGCTGAAGCTCTTTACAAATCTCAAGCTGAAACTGGTGAAATTAAAGGTCACTATTTAAACGCTACTTCAGGAACTGCTGAAGAAATGTTAAAACGTGCAGAAGTTGCTAAAGACTTAGGTGTACCTATCATCATGCATGACTATTTAACAGGTGGTTTAACAGCTAATACATCATTAGCACACTACTGTCGTGATAATGGTTTATTATTACACATTCACAGAGCTATGCACGCGGTTATTGACCGTCAAAGAAACCATGGTATGCACTTCCGTGTTTTAGCTAAAGCTCTACGTCTATCAGGTGGTGACCACCTTCACTCAGGTACTGTTGTAGGTAAACTTGAAGGTGAACGTGAAGTAACTTTAGGTTTCGTTGATTTAATGCGTGATGAATACATTGAAAAAGACCGTAGCCGTGGTATTTACTTCACTCAAGACTGGTGTGGTTTAGGTGGTGTTATGCCAGTTGCATCTGGTGGTATCCACGTATGGCAT Gloeomonas_lateperforata 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Gloeomonas_rubrifilum GCAGGTTTTAAAGCTGGTGTTAAAGATTATCGTTTAACATATTATACTCCTGATTACGTGGTAAAAGAGACAGACATTCTTGCAGCTTTCCGTATGACTCCACAAGCTGGTGTTCCTATCGAAGAAGCTGGTGCTGCTGTTGCTGCTGAATCTTCAACTGGTACTTGGACAACTGTATGGACTGACGGTTTAACTAGTCTTGATCGTTATAAAGGTCGTTGTTATGACATCGAACCAGTAGCTGGTGAAGACAATCAGTATATTGCTTATGTTGCATATCCTATCGACTTATTTGAAGAAGGTTCTGTAACTAACTTATTTACATCTATTGTAGGTAACGTATTTGGTTTCAAAGCTCTTCGTGCTCTTCGTCTTGAAGATTTACGTATTGCTCCAGCATATTCTAAAACATTCCAAGGACCTCCACATGGTATTCAAGTAGAACGTGATAAATTAAACAAATATGGTCGAGGTCTTTTAGGTTGTACTATTAAACCAAAATTAGGTCTTTCAGCTAAAAACTATGGACGTGCTGTTTATGAATGTTTACGTGGTGGATTAGATTTCACAAAAGATGACGAAAACGTAACTTCTCAACCATTCATGCGTTGGAGAGACCGTTTTATTTTCGTTGCTGAAGCTCTTTACAAATCTCAAGCTGAAACTGGTGAAATCAAAGGTCACTACTTAAACGTAACTGCAGGAACTGCAGAAGAAATGTTAAAACGTGCTGAAGTTGCTAAAGATCTAGGGGTACCAATCATTATGCATGATTACTTAACAGGTGGTTTAACTGCTAACACTTCATTAGCACACTATTGCCGTGACAATGGTTTATTATTACACATCCACAGAGCTATGCACGCTGTTATTGACCGTCAAAGAAACCACGGTATTCACTTCCGTGTTTTAGCTAAAGCTCTTCGTCTATCTGGTGGTGACCACCTTCACTCAGGTACTGTTGTAGGTAAACTTGAAGGTGAACGTGAAGTAACTTTAGGTTTCGTTGATTTAATGCGTGATGAATACGTTGAAAAAGATCGTAGCCGTGGTATTTATTTCACACAAGATTGGTGTGGTTTACCAGGTGTTATGCCAGTTGCTTCTGGTGGTATTCACGTATGGCAC Ixipapillifera_deasonii GCTGGGTTTAAAGCGGGTGTTAAAGACTATCGTTTAACATATTACACACCAGATTACGTTGTTAAAGACACTGACATTCTTGCTGCTTTCCGTATGACTCCACAAGCTGGAGTTCCTATTGAAGAAGCTGGTGCTGCAGTTGCTGCTGAATCTTCAACTGGTACTTGGACAACTGTTTGGACTGATGGTTTAACTAGCTTAGACCGTTACAAAGGACGCTGTTATGATATTGAGCCAGTGGCTGGTGAAGACAACCAATATATTGCGTATGTAGCTTACCCTATCGACTTATTTGAAGAAGGTTCTGTAACAAACTTATTTACTTCTATTGTAGGTAACGTATTTGGTTTTAAAGCTTTACGTGCTTTACGTTTAGAAGATTTACGTATTTCATCTGCTTATGCAAAAACTTTCCAAGGACCTCCACACGGTATTCAAGTTGAACGTGACAAACTAAATAAATATGGTCGTGGTCTTTTAGGTTGTACTATTAAACCTAAATTAGGTTTATCAGCTAAAAACTACGGTCGTGCTTGTTATGAATGTCTTCGTGGTGGTCTTGATTTTACTAAAGATGACGAAAACGTTACTTCTCAATCATTCATGCGTTGGAGAGACCGTTTTGTATTCGTAGCTGAAGCTATTTACAAATCACAAGCTGAAACGGGAGAAATAAAAGGTCATTATTTAAACGCAACAGCAGGAACTTGTGAAGAAATGCTAAAACGTGTAGAAGTAGCTAGAGATTTAGGTGTACCAATTGTAATGCATGACTACCTTACAGGTGGATTTACTGCTAACACTTCATTAGCTCACTATTGTCGTGATAATGGTTTATTATTACACATTCACAGAGCTATGCACGCTGTAATTGACCGTCAAAGAAATCACGGTATTCACTTTAGAGTTTTAGCTAAAGCTCTTCGTATGTCAGGTGGTGACCATTTACACTCTGGTACAGTTGTAGGTAAATTAGAAGGTGAACGTGAAGTTACTTTAGGATTCGTTGACTTAATGCGTGACGAATACATTGAAAAAGATCGTAGCCGTGGTATTTATTTTACACAAGATTGGTGTGGTTTACCTGGAGTAATGCCAGTTGCTTCTGGTGGTATTCATGTATGGCAC Ixipapillifera_pauromitos 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TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr112105] END;