#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on May 22, 2024; 3:53 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Martins A.C., Bochorny T., Pérez-escobar O.A., Chomicki G., Monteiro S., & Smidt E.D. 2018. From tree tops to the ground: reversals to terrestrial habit in Galeandra orchids (Epidendroideae: Catasetinae). Molecular Phylogenetics and Evolution, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S22882] [ The following blocks are input data for analysis step 23103 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep23103; DIMENSIONS NTAX=31; TAXLABELS Catasetum_blackii Catasetum_denticulatum Catasetum_gladiatorium Catasetum_luridum Clowesia_russelliana Cyanaeorchis_arundinae Cycnoches_egertonianum Cycnoches_haagii Cyrtopodium_aliciae Dressleria_sp Eulophia_alta Galeandra_batemanii Galeandra_baueri Galeandra_beyrichii Galeandra_blanchetii Galeandra_cristata Galeandra_devoniana Galeandra_greenwoodiana Galeandra_junceaoides Galeandra_leptoceras Galeandra_macroplectra Galeandra_magnicolumna Galeandra_minax Galeandra_montana Galeandra_paraguayensis Galeandra_santarena Galeandra_stangeana Galeandra_styllomisantha Grobya_amherstiae Mormodes_buccinator Mormodes_paraensis ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M46200] TITLE Galeandra_orchids; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep23103; DIMENSIONS NCHAR=6014; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Catasetum_blackii 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Catasetum_gladiatorium 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Catasetum_luridum 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Galeandra_batemanii 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Galeandra_baueri 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Galeandra_beyrichii 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Galeandra_blanchetii 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Galeandra_devoniana 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Galeandra_magnicolumna 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Galeandra_santarena 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Galeandra_styllomisantha 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Mormodes_buccinator ?????????????GCGGACCATGCTAGTATTGGTTGGTGGCTTCTTTTGTGAGGCCAACTATTATTATGGCAGTCCTTTCACTT--AATAACTCCAAATA--ATTTTGGAGATTGATATTGGTTATAAAATAGTTGCTTGCATTCCGAATCCTTATGCGGGTGGTATTAATATATGTGGATGCTTCGTGGAAAAGCCTCTATGCCTGTGTCCAAGGCATGGAGACCGCCCTATG-AAATGAGACCCTTCCACCTTCTCCTTCGAGCAATGTTACATGATATTTCTTGTTTTGTGGGGTGGTGGAACTTAGGTCTCAA-TATATTGTTGCAAATGCTGCTCTTCGAAATTTGGTGTTGGTGTTATGCCATGCCACCATGTTCGAGGTCATTATTCCAAGTGATAGTGCCCTTAACCTCTGTGCGACTTTGGTTCTTTCCTCGCTTGCCATATGATATGTATGGTTGTGGCGGGGTGAGTCTGTGGTTGTGCTGAGGACTTGCTACCT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CAAAGAGAAATTTACCCATTCGACCATATCCGCATTTAATTCATTCCTGATACGTACGCATATGTCCACACAAATATGATCCAGACGCATATATGATATATCATATATGCGTCTGGATCATATTTGCGCAGGGCCAGTATAGTTAAGTAAAGTCAGATTCCAATTAAGATCAGATTCTTAATTATC---------TATATCCAATTTATAACATATAACAATGAAATGTAATTTTTGGATCGGGTAAATACCAAATAAGTTCAAGAGATGAGAGAATTCAGGATAGCTACCAGAAAGACTAATCCAATCCATAATGATGTACCAGAAAATACAACATTTTTGTTATTCGACCAACCATCAGAAGAAGCAAATACAACGGGTACACTAATCAGTAAGATTAATGAAGTTGCAATTAATGCAAAAACAGCTAATTGGAAAGCAATAGTCATGTTTGTAATCCTCCAAACTACCAACAAATGAACTATACCATTGGATCTCTCACTTAGTAAAAATTGTAAAAAATGCATCATGAAGGGATTTGACATGAATGAATTGATTCATTAGAACTTATTACCGCTTTATTTTGTTTATTCGGGCATGGAGTCGAGCAGATAGTTAATGTATCATCTCATAGGGTCATGTTCTATTCGTAGGAAGAAAATAGAGATTATATTTTGGAGAGATGGCTGAGTGGTTGATAGCCCCGGTCTTGAAAACCGGTATAGTTTTTAACAAGGAACTATCG?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCGAGACCGAAATATAAATCGAGTGATTTAGAGAACACGTGAATCGAGTGATGGCTGCTGCCG-TCGCGGGATGACCGGCTTGGCCGTCACCGCCGCCTCCTCT-ACGGGGAGAGC-GGGGGTACGACCGTGGACGGATAATAACACAAATCGGCGCAGCATTGCGCCAAGGAAAA-ATTGGAAGGGACGAGCTCGGTGAAGGGCTCGGTGGCGTGGGGTGTTGCGGCACACCACGCGGTTGGACATGACTCTCGGCAATGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAGCGCAGCGAAATGCGATACGTGGTGCGAATTGCAGAATCCCGCGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAGGCCAGCAGGCCAAGGGCACGTCCGCCTGGGCGTCAAGCATTGCGTCGCTCCGTGC--CAGCTCTGACACTACTTTTTGTGTGTTGTCCGAGGCTCGGAAGTGTAGAGTGGCTCATCGTGCTTATCGGTGCGGCGAGCTGAAGATAGCGTGACATCTCGTTGGCCGCGAACAACAAGGGGTGGGTGAAAGCTGTGAGCGCAGCCTGCGTTGTCTCGTGTTGGCTCAAGAGATGGATTGTGCCTTCAAGGTGATCCCGACCCATGCGTCGATCCATATGCGGGCGGCGGCTTGGAATGCGACCCCAGGATGGGC?????????????????????????????????????????????????????????????????TCTAGATCTAGCTTCTGTGGAAGTTCCATCTATAAATGGATAAGACTTTTGTATTCATATGTATATGAATTTTTGATATGAATTTTTGAAGATAGCAAT-CCCC----------------------CAAGATATT-GGGGGATTGCTATCTTGTTGGATTCAATTGTTTTTTGCTTCTCTATCCGAATTTTCGTTCTTTATCATAAAAGTTCTCCCCCGCCAATGAATGATAAGTGCCTAGGTGAAGTATAGTATAAGATAAGTCAGAAAAGTCTAAGTCTTATGAAAAAGAAAATAAATATACCTATACTCTTACTATAAGATAAAGACTCTTAAGTCTAAATACTTTAGACTCTTAAGATAAGGCTTTTCACATGAATACTTAGTAGAACGACTAACGACGAGATTTATTATCGTTTCTCGTGTGTCTCACGAAAGTTCTAGTAGGTGCAAATTCTCCCAATTTGTGACCGACCATACGATCTGTGATATAAATAGGTAAATGTTCCTTTCCATTATGAATAGCGATTGTATGGCCAATCATTGTGGGTATAATGGTAGATGCCCGAGACCAAGTCACTATGATTTCTTTCTCCTCCCTCCTGTTGAGTTTTTCAATTCTTCCCGATAAATGATTAGCTACAAAAGGATTTTTTTTGAGTGAACGTGTCACGGCTGATTACTCCTTTTTTTTTACATTTTTTAAATTGGCATTCTATGTCCAATATCTCGATCTTAATCTGAAGTATAATGATGAATGGAAAAAAGAGAAAATCCTTTAGCTAGATAA-GGAAGGGGCGGATGTAGCCAAGT???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TCTCTATTATTACCTAAAGAATGCAAAAATAGAATCAATAAACATTGTATGATTCAAAAGAAGGAATCAAGTCAATTGGATTTATATAAAAAATACCAATTCATTTATTCCATGAAAAAGAATGACTATGCAACGAATTCATTTATGAGTCAAAAAGACAAATGGAAAAAACATTACAGATATGATCTTTTATCATATAAATACATAAGCCTCCCTAATTTATACATTTCTAGATCAACATTAGAAAAAAATGGGGACCAAGAAATTCCATATCATTTCAATACATCGAAACCTGAATCATTTTATGTATTGGTAAGTATACCGAGTAATGATTATATAGAAAAAGGATATTTTATTGATAGGAATACAAATTTTTTGGATAGAAAATATTTTAATTGTAGAATTCTTCCTATTTGTTTTATACATAATATCGAGATCTGGACTAATGCACATATTGGCATCAAGATTCATAAAAATACTAAGAGTGAAATTACTAATTTCAAAAAAATGGGAAAAAAAGAT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; END; [ The following blocks are output data for analysis step 23103 ] BEGIN TREES; TITLE Galeandra_orchids_RAxML; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep23103; TREE tree_1 = [&R] 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[! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr112289] END;