#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on September 19, 2025; 21:29 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Réblová M., Mostert L., Gams W., & Crous P.W. 2004. New genera in the Calosphaeriales: Togniniella and its anamorph Phaeocrella, and Calosphaeriophora as anamorph of Calosphaeria. Studies in Mycology, 50. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1268] [ The following blocks are input data for analysis step 2351 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep2351; DIMENSIONS NTAX=57; TAXLABELS Apiospora_sinensis Arthrinium_phaeospermum Calosphaeria_pulchella Camarops_microspora Ceratocystis_fimbriata Ceratosphaeria_lampadophora Chaetomium_elatum Chaetopsina_fulva Chaetosphaeria_curvispora Cochliobolus_sativus Coniochaeta_ligniaria Coniochaeta_velutina Cordyceps_ophioglossoides Cryphonectria_parasitica Diaporthe_phaseolorum Diatrype_disciformis Endomyces_scopularum Endothia_gyrosa Gaeumannomyces_graminis Gibberella_pulicaris Gnomonia_setacea Gnomoniella_fraxini Graphium_penicillioides Graphostroma_platystoma Hypocrea_lutea Hyponectria_buxi Hypoxylon_fragiforme Kionochaeta_ramifera Lasiosphaeria_ovina Lecythophora_lignicola Leucostoma_persoonii Lophiostoma_crenatum Madurella_mycetomatis Magnaporthe_grisea Melanomma_sanguinarium Melanospora_zamiae Microascus_cirrosus Microdochium_nivale Nectria_pseudotrichia Ophiostoma_stenoceras Pestalosphaeria_hansenii Petriella_setifera Phialophora_repens Phialophora_richardsiae Phyllachora_graminis Pleospora_betae Pleurostoma_otheca Pseudallescheria_boydii Sordaria_fimicola Sphaerodothis_acrocomiae Sporothrix_schenckii Togninia_fraxinopennsylvanica Togninia_minima Togninia_novaezealandiae Togniniella_acerosa_AY761072 Togniniella_acerosa_AY761073 Xylaria_carpophila ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M1317] TITLE 18S_rDNA; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep2351; DIMENSIONS NCHAR=1724; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Arthrinium_phaeospermum ????????????????TTATACGGCG-AAACTGCGAAACT-GCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGATAGTACCTTA-CTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTTAAAA-TCCCGACTCACGAAGGGATGTATTTATTAGATTAAAAACCAATGCCCTTCGGGGCTCTT-TGGTGATTCATAATAACTTTTCGAATCGCATGGCCTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGCAGGGTCTTGGCCTGCCATGGTGACAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTCGACCCCGGAGAAGGAGCCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACTCGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGGCTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGCACTGG-TTCGGCCGGGCCTTTCCCTCTGGGGAACCGCATGCCCTTCACTGGGTGTGTCGGGGAACCAGGACTTTTACTGTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCCTATGCTCGAATACATTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGT-GTGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCGTCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTCGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGGCGATGTTA--TTATTTGACTCGCTCGGCACCTTACGAGAAA-TAAA-GTCTTTGGG?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Calosphaeria_pulchella ??????????????????????ACTT-AAACGGTGAAACT-GCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTATTTGATAGTACCT-A-CTACATGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAA-CCCCGACGCAAGGAGGGGTGTATTTATTAGATTAAAAACCAATGCCCTCCGGGGCTCAG-TGGTGATTCATGATAACTTTTCGAATCGCATGGCCTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGACGGCTGGGTCTTGGCCAGCCATGGTGACAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTCGACCCCGGAGAAGGAGCCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACTCGGGGAGGTAGTGACAAAAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGCCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAATTTGCTGAGGTTGAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGGCTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGCACTGG-TCCGGCCGGGCCTTTCCCTCTGGGGAGCCGCATGCCCTTCACTGGGCGTGTCGGGGAACCAGGACTTTTACTGTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCCTATGCTCGGATACATTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGT-GCGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGACGGCGTTA--TTTTTTGACCCGTTCGGCACCTTACACGAAAGTACAAGTGCTTGGGTTCCTGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGAAATTGACGGAAGGGC-ACC-ACCA-GGGGTGGAACCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACACAATTAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTTTGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGGATGACTTGTCTGCTTAATTGCGATAACGAACGAGACCTTAACCTGCTAAATAGCCCGTATTGCTTTGGCAGTACGCCGGCTTCTTAGAGGGACTATCGGCTCAAGCCGATGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGC-GCGTTACACTGACAGAGCCAGCGAGTACTC--CCTTGGCCGGAAGGTCCGGGTAATCTTGTTAAACTCTGTCGTGCTGGGGATAGAGCATTGCAATTATTGCTCTTCAACGAGGAATCCCTAGTAAGCGCAAGTCATCAGCTTGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAACGGCTCAGTGAGGC-TTCCGGACTGG-CCCAGGGAGGTCGGCAACGACCACCCA-GGGCCGGAAAG????????????????????????????????? Camarops_microspora ????????????????????????????????????????-??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGGTGATTCATAATAACTTCTCGAATCGCACGGCCTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGACGGCTGGGTCTTGGCCAGCCATGGTGACAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTTGACCCCGGAGAAGGAGCCTGAGAGACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATGCCGACACGGCGAGGTAGTGACGATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGAGGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGGCTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGTACTGG-TCCGGCCGGGCCTTTCCCTCTGGGGAGCCGCATGCCCTTCACTGGGTGTGTCGGGGAACCAGGACTTTTACCGTGAAAAAATCAGATCGCTTAAAGAAGGCCTATGCTCGAATGCATTAGCATGGAATAATGAAATAGGACGC-GTGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGATTAGGGATCGGACGATGTTACTTTTTTTGACTCGTTCGGCACCTTACGATAAA-TCAAAATGTTTGGGCTCCTGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGAAATTGACGGAAGGGC-ACC-ACCA-GGGGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACATGAGTAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTTCATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGCTTAATTGCGATAACGAACGAGACCTTAACCTGCTAAATAGCCCGCATTGCTTTGGCAGTGCGCCGGCTTCTTAGAGGGACTATCGGCTCAAGCCGATGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGC-GCGCTACACTGACAGAGCCAGCGAGTTCTT--CCTTGGCCGGAAGGCCCGGGTAATCTTGTTAAACTCTGTCGTGCTGGGGATAGAGCATTGCAATTATTGCTCTTCAACGAGGAATCCCTAGTAAGCGCAAGTCATCAGCTTGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGGCTCAGTGAGGC-TTTC???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Ceratocystis_fimbriata CCATGCATGTCTAAGTATAAGCAATT-ATACAGCGAAACT-GCGAATGGCTCATTATATAAGTTATCGTTTATTTGATAGCACCTTA-CTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAA-TCCCGACTTCGGAAGGGATGTATTTATTAGATTAAAAACCAATG-CCTTCGGG-CTTTC-TGGTGATTCATGATAACTTCTCGAATCGCATGGCCTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTTCCCTATCAACTTTCGATGCGAAGGTCTTGTCTTCGCATGGTTACAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTCGACCCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAATGGCTACCACTTTTAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTATGGGTCTTGTAATCGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGTGGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGGCTGGCCGGTCCCCCTCACCGGGTGCACTGGTTCCGGCCGGGTCTTTCCCTCTGTGGAACCGCATGCCCTTCACTGGGTGTGTCGGGGAAACAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGCTCCAGGCAGGCCTATGCTCGAATAGTACAGCATGGAATAATAGAATAGGACGT-GTGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAGCTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATCTGCTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTGATAAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGACGATGTTATTTTTTTTGACTCGTTCGGCACCTTTCGAGAAA-TCAAAGTGCTTGGGCTCCAGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGAAATTGACGGAAGGGC-ACC-ACCA-GGGGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACACAGTGAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCTGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGCTTAATTGCGATAACGAACGAGACCTTAACCTGCTAAATAGCCCGTATTGCTTTGGCAGTACGCTGGCTTCTTAGAGGGACTATCGGCTCAAGCCGATGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGC-GCGTTACACTGACACAGCCAGCGAGTTTCTT-CCTTGACAGAGATGTCCGGGTAATCTTGTTAAACTGTGTCGTGCTGGGGATAGAGCATTGCAATTATTGCTCTTCAACGAGGAATCCCTAGTAAGCGCAAGTCATCAGCTTGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGGATGGCTCAGTGAGAC-CTCCGGACTGG-CCGAGAGAGGTGGGAAACTACCCCTCA-TGGCCGGAAAGCTGTTCAAACTCGGTCATCTAGAGGAAGTAAAA 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Cochliobolus_sativus 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Coniochaeta_ligniaria 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Coniochaeta_velutina 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Cordyceps_ophioglossoides 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Cryphonectria_parasitica 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Diaporthe_phaseolorum ?????????????????????????T-AAACGGCGAAACT-???AATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTATATTTGATAGTACCTTA-CTACATGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTTAAAA-TCCCGACTTCGGAAGGGATGTATTTATTAGATTAAAAACCAATGCCCTTCGGGGCTCAC-TGGTGATTCATAATAACTTCTCGAATCGCATGGCCTTGTGC?GGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGACGGCTGGGTCTTGGCCAGCC??GGTTACAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTTGACCCCGGAGAAGGAGCCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACTCGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGGCTGGCCGGTCTGCCTCACCGCATGCACTGG-TCCGGCCGGGCCTTTCCCTCTGG?GAGCCGCATGCCCTTCACTGGGTGTGTCGGGGAACCAGGACTTTTACTGTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCATATGCTCGAATACATTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGTCGCGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATCGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATCGATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAAACGATCAGATACCGTTGTAGTCT???CCATAAACTATGCCGACTAGGGATC?G?CGGTGTTA--TTTCTTGACCCGCTCGGCACCTTA???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Diatrype_disciformis ??????ATGTCTAAGTATAAGCAATT-ATACCGCGAAACT-GCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGATAGTACCTTA-CTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAA-TCCCGACTTACGGAGGGATGTATTTATTAGATTAAAAACCAATGCCCTTCGGGGCTCCT-TGGTGATTCATAATAACAACTCGAATCGCATGGCCTTGTGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGCAGGGTCTTGGCCTGCCATGGTTACAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTCGACCCCGGAGAAGGAGCCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTATCCAATCCCGATTCGGGGAGATAGTGACGATAAATACTGATACAGGGCTCTTTCGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGAGGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGGCTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGCACTGG-TCTGGCCGGGCCTTTTCCTCTGGGGATCCCCATGCCCTTCACTGGGTGTGGTGGGGAACCAGGACTTTTACTGTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCATATGCTCGAATACATTAGCATGGAATAATAAAATAGGACGT-GCGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGACGATGTTA--TTTTTTGACTCGTTCGGCACCTTACGAGAAA-TCAAAGTCTTTGGG?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Endomyces_scopularum CCATGCATGTCTAAGTATAAGCAATT-ATACCGCGAAACT-GCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGATAGTACCTTA-CTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTGAAAA-CCCCGACTTCGGAAGGGATGTATTTATTAGATTAAAAACCAATGCCCTTCGGGGCTCCC-TGGTGATTCATAATAACTTCTCGAATCGCACGGCCTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGACGGCTGGGTCTTGGCCAGCCATGGTGACAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTCGACCCCGGAGAAGGAGCCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAATTCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGGCTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGCACTGG-TCCGGCCGGGTCTTTCCCTCTGGGGAGCCGCATGCCCTTCACTGGGTGTGTCGGGGAACCAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCTTATGCTCGGATACATTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGT-GCGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGACGATGTTA--TTTTTTGACTCGTTCGGCACCTTACACGAAAGTACAAGTTTCTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGAAATTGACGGAAGGGC-ACC-ACCA-GGGGTGGAATCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACACGATGAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTTCGTGGGTGGTGGTGCATGCCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGCCTAATCGCGATAACGAACGAGACCTTAACCTGCTAAATAGCCCGCGTTGCTTTGGCAGCGCGCTGGCTTCTTAGAGGGACTATCGGCTCAAGCCGATGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGC-GCGTTACACTGACAGAGCCAGCGAGTTCCT--CCTTGGCCGAAAGGCCTGGGTAATCTTGTGAAACTCTGTCGTGCTGGGGATAGAGCATTGCAATTATTGCTCTTCAACGAGGAATCCCTAGTAAGCGCAAGTCATCAACTTGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGGCTCAGTGAGGC-TTCCGGACTGG-CCCAGAGGGGTGGGCAACTACCCTTCC-GGGCCGGAAAGTTATCCAAACTCGGTCATTTAGAGGAAGTAAAA Endothia_gyrosa ?????????????????????????T-AAACGGCGAAACT-GCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTATATTTGATAGTACCT-A-CTACATGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTTAAAA-TCCCGACTTCGGAAGGGATGTATTTATTAGATTAAAAACCAATGCCCTTCGGGGCTCAC-TGGTGATTCATAATAACTTCTCGAATCGCATGGCCTTGTGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGACGGCTGGGTCTTGGCCAGCCGTGGTTACAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTTGACCCCGGAGAAGGAGCCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGATACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGGCTGGCCG-TCTGCCTCACCGCATGCACTGG-TCCGGCCGGGCCTTTCCCTCTGGGGAGCCGCATGCCCTTTACTGGGTGTGTCGGGGAACCAGGACTTTTACTGTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCCTATGCTCGAATACATTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGTTGTGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATCGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATCGATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAAACGATCAGATACCGTTGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGGCGATGTTA--TTCTTTGACTCGCTCGGCACCTTACACGAAAGTAAA-GTTTTTGGGTTCT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Lecythophora_lignicola CCATGCATGTCTAAGTATAAGCAATT-ATACCGCGAAACT-GCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGATAGTACCTTA-CTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAA-TCCCGACTTCGGAAGGGATGTATTTATTAGATTAAAAACCAATGCCCTTCGGGGCTCTC-TGGTGATTCATAATAACTTCTCGAATCGCACGGCCTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGACGGCTGGGTCTTGGCCAGCCATGGTGACAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTCGACCCCGGAGAAGGAGCCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACTCGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGGCTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGCACTGG-TCCGGCCGGGCCTTTCCCTCTGGGGAACCGCATGCCCTTCACTGGGTGTGTCGGGGAACCAGGACTTTTACTTTGAACAAATTAGATCGCTTAAAGAAGGCCTATGCTCGAATACATTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGT-GTGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGACGATGTTA--TATTTTGACTCGTTCGGCACCTTACACGAAAGTAAA-GTTTCTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGAAATTGACGGAAGGGC-ACC-ACCA-GGGGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACACAAGTAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTTTGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGCTTAATTGCGATAACGAACGAGACCTTAACCTGCTAAATAGCCCGTATTGCTTTGGCAGTACGCTGGCTTCTTAGAGGGACTATCGGCTCAAGCCGATGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGC-GCGCTACACTGACAGAGCCAGCGAGTACTC--CCTTGGCCGGAAGGTCCGGGTAATCTTGTTAAACTCTGTCGTGCTGGGGATAGAGCATTGCAATTATTGCTCTTCAACGAGGAATCCCTAGTAAGCGCAAGTCATCAGCTTGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATCGAATGGCTCAGTGAGGC-TTCCGGACTGG-CCCAGAGAGGTCGGCAACGACCACTCA-GGGCCGGAAAGCTATCCAAACTCGGTCATTTAGAGGAAGTAAAA Leucostoma_persoonii ?????????????????????????T-AAACGGCGAAACT-GCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTATATTTGATAGTACCT-A-CTACATGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTTAAAA-TCCCGACTTCGGAAGGGATGTATTTATTAGATTAAAAACCAATGCCCTTCGGGGCTCAC-TGGTGATTCATAATAACTTCTCGAATCGCATGGCCTTGTGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGACGGCTGGGTCTTGGCCAGCCGTGGTTACAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTTGACCCCGGAGAAGGAGCCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGGCTGGCCGGTCTGCCTCACCGCATGCACTGG-TCCGGCCGGGCCTTTCCCTCTGGGGATCCGCATGCCCTTCACTGGGTGTGTCGGGGAACCAGGACTTTTACTGTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCATATGCTCGAATACATTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGTTGCGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCGTCAGTATTCAATCGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATCGATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTCGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAAACGATCAGATACCGTTGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGGCGATGTTA--TTTCTTGACTCGCTCGGCACCTTACACGAAAGTAAA-GTTTTTGGGTTCT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Lophiostoma_crenatum 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Madurella_mycetomatis 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Magnaporthe_grisea 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Melanomma_sanguinarium 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Melanospora_zamiae 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Microascus_cirrosus 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Microdochium_nivale 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Nectria_pseudotrichia 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Ophiostoma_stenoceras 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Petriella_setifera 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Togninia_novaezealandiae ???????????????????????CCT-AAACGGCGAAACT-GCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGATAGTACCT-A-CTACATGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAA-TCCCGACTTCGGAAGGGATGTATTTATTAGATTAAAAACCAATGCCCTTCGGGGCTCAC-TGGTGATTCATAATAACTTCTCGAATCGCATGGCCTTGCGCTGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGACGGCTGGGTCTTGGCCAGCCATGGTGACAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTCGACCCCGGAGAAGGAGCCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGGCTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGCACTGG-TCCGGCCGGGCCTTTCCCTCTGGGGAGCCGCATGCCCTTCACTGGGTGTGTCGGGGAACCAGGACTTTTACTGTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCCTATGCTCGAATACATTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGT-GCGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGGCGGTGTTA--TTTTTTGACCCGCTCGGCACCTTACACGAAAGTAAA-GTTTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGAAATTGACGGAAGGGC-ACC-ACCA-GGGGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACACAATTAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTTTGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGCTTAATTGCGATAACGAACGAGACCTTAACCTGCTAAATAGCCCGTATTGCTTTGGCAGTACGCCGGCTTCTTAGAGGGACTATCGGCTCAAGCCGATGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGC-GCGCTACACTGACACAGCCAGCGAGTACTC--CCTTGGCCGGAAGGCCCGGGTAATCTTGTTAAACTGTGTCGTGCTGGGGATAGAGCATTGCAATTATTGCTCTTCAACGAGGAATCCCTAGTAAGCGCAAGTCATCAGCTTGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGGCTCAGTGAGGC-TTTCGGACTGG-CCCAGAGAGGTCGGCAACGACCACTCA-GGGCCGGAAAGTATCCAACTCGTCATTAGAGAGA?????????? 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Xylaria_carpophila ???TGCATGTCTAAGTATAAGCAATT-ATACCGCGAAACT-GCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGATAGTACCTTA-CTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAA-TCCCGACTTACGAAGGGATGTATTTATTAGATTAAAAACCAATGCCCCTCGGGGCTTTTCTGGTGATTCATAATAACTTCTCGAATCGCATGGCCTTGTGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGCAGGGTCTTGGCCTGCCATGGTTACAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTCGACCCCGGAGAAGGAGCCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGGCTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGCACTGG-TTCGGCCGGGCCTTTCCCTCTGGGGAGCCCCATGCCCTTCACTGGGTGTGGCGGGGAACCAGGACTTTTACTGTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCCTATGCTCGAATACATCAGCATGGAATAATAGAATAGGACGT-GTGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAAGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGACGATGTTA--TTTTTTGACTCGTTCGGCACCTTACGAGAAA-TCAAAGTCTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGAAATTGACGGAAGGGC-ACC-ACCA-GGAGTGGA--CTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACACAATGAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTTTGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGCTTAATTGCGATAACGAACGAGACATTTACCTGCTAAATAGCCCGTATTGCTTTGGCAGTACGCTGGCTTCTTAGAGGGACTATCCGCTTAAGCGGGTGGAAGTTGGATGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGC-GCGTTACACTGACAGAGACAGCGAGTACTT--CCTTAGTAGAGATACTTGGGTAATCTTGTTAAACTCTGTCGTGCTGGGGATAGAGCATTGCAATTATTGCTCTTCAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGTAAGTCATCAACTTGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGGCTCAGTGAGGC-TTCCGGACTGGCCCCAGAGGAGTCGGCAACGACACCTCA-GGGCCGGAAAGTTAGCCAAACTCGGTCATTTAGAGGAA?????? ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = 18S_rDNA) = N: 1-1724; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = 18S_rDNA) = N: 1-1724; END; [ The following blocks are output data for analysis step 2351 ] BEGIN TREES; TITLE Tb7126; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep2351; TREE Fig._2 = [&R] (Cochliobolus_sativus,(Pleospora_betae,(Melanomma_sanguinarium,(Lophiostoma_crenatum,(((((((((Madurella_mycetomatis,Chaetomium_elatum),Lasiosphaeria_ovina),Sordaria_fimicola),((Phyllachora_graminis,(Kionochaeta_ramifera,Chaetosphaeria_curvispora)),Camarops_microspora)),(Coniochaeta_ligniaria,(Coniochaeta_velutina,Lecythophora_lignicola))Coniochaetales),(((((Gnomonia_setacea,Gnomoniella_fraxini),(Cryphonectria_parasitica,Endothia_gyrosa)),(Leucostoma_persoonii,Diaporthe_phaseolorum)),(Togninia_minima,(Togninia_novaezealandiae,Togninia_fraxinopennsylvanica))Togniniaceae)Diaporthales,(((Phialophora_repens,Pleurostoma_otheca),Phialophora_richardsiae)Pleurostomataceae,(Calosphaeria_pulchella,(Togniniella_acerosa_AY761072,Togniniella_acerosa_AY761073))Calosphaeriaceae)Calosphaeriales)),(((Magnaporthe_grisea,Gaeumannomyces_graminis),Ceratosphaeria_lampadophora)Magnaporthaceae,(Sporothrix_schenckii,(Endomyces_scopularum,Ophiostoma_stenoceras))Ophiostomatales)),(((((Xylaria_carpophila,Diatrype_disciformis),Hypoxylon_fragiforme),Microdochium_nivale),(Hyponectria_buxi,(Pestalosphaeria_hansenii,Graphostroma_platystoma))),(Apiospora_sinensis,Arthrinium_phaeospermum))Xylariales),(((Gibberella_pulicaris,((Chaetopsina_fulva,(Hypocrea_lutea,Melanospora_zamiae)),(Sphaerodothis_acrocomiae,Cordyceps_ophioglossoides))),Nectria_pseudotrichia)Hypocreales,(((Microascus_cirrosus,(Petriella_setifera,Pseudallescheria_boydii)),Graphium_penicillioides),Ceratocystis_fimbriata)Microascales)))))); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr4417] END;