#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on September 19, 2025; 10:52 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Harrington M., Edwards K., Johnson S., Chase M., & Gadek P.A. 2005. Phylogenetic inference in Sapindaceae sensu lato using plastid matK and rbcL DNA sequences. Systematic Botany, 30(2). TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1292] [ The following blocks are input data for analysis step 2402 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep2402; DIMENSIONS NTAX=35; TAXLABELS Acer Aesculus Alectryon_connatus Allophylus Anacardiaceae Arytera Atalaya_alata Billia Blighia_sapida Cardiospermum_grandiflorum Cupaniopsis_anacardioides Dimocarpus_longan Dipteronia_sinensis Dodonaea Erioglossum_rubiginosum Filicium_decipiens Ganophyllum_falcatum Guindillia_trinervis Guioa Handeliodendron Harpullia Hebecoccus_ferrugineus Koelreuteria_paniculata Lepisanthes_alata Litchi_chinensis Nephelium_mutabile Paranephelium_macrophyllum Paullinia Peganum_harmala Sapindus_saponaria Schleichera_oleosa Tristira_triptera Tristiropsis_acutangula Ungnadia_speciosa Xanthoceras_sorbifolium ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M2801] TITLE 'rbcl-matK combined'; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep2402; DIMENSIONS NCHAR=2977; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Anacardiaceae 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Arytera 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Dimocarpus_longan 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Dipteronia_sinensis 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Filicium_decipiens 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Koelreuteria_paniculata 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Lepisanthes_alata 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Litchi_chinensis 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Nephelium_mutabile 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Paullinia 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Peganum_harmala 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Ungnadia_speciosa ATGGAGGAATTTCAAATATATTTAGAACTAGATGGATCTCAGCAACGTAACTTCCTATATCCACTTTTTTTTCGGGAGTATATTTATGCACTTGCTCATGATCATGGTTTAAATAGATCGATGATTTCATTGGAAAATGGGGGTTATGATAATAAATCTAATTCACTAAGTGTGACACGTTTAATTACTTTGTTGTATCAACAGATACATTTGAGTATTTATGTTAATGATTCTAATCGAAATCAATTTATTGGACACAACAATAAATTGTATTCTCAAATGATATCAGAGGAATTTGCAGTCATTGTGGAAATTCCATTTTCCCTACGATTAGTATCTTTTTTAGAAGGGAAAGAAATGGCGAAATCTCATAATTTCCAATCAATTCATTCAATATTTCCTTTTTTCGAGGACAATTTTTCACATTTAAATTATGTCTTAGATGTACTAATACCCCACCCCATTTATCCGGAAATCTTGGTTCAAACCTTTCGCTACTGGCTAAAAGATGCCTCTTCTTTACATTTATTGCGATTTTTTCTTCACGAGTATTTTAATTGGAATAGTCTTATTACTCCAAAAAAATCAATTTCCATTTTTTCAATAAGTAATTCAAGATTTTTCTTGTTCCTATATAATTCTCATGTATATGAATATGAATCCATCTTCTTTTTTCTCCGTAACCAATCTTCTCATTTACGATCAACATCTTCTGAAATCCTTCTTGAGCGAATCCATTTTTATGGAAAAGTGGACCATCTTGTCGAAGTCTTTGCTAATGATTTTCAGGACATCTTATGGTTGTTCAAGGATCCTTTCATGCATTATGTTAGATATCAAGGAAAAGCCATTCTGGCTTCAAAAGATACGCCTCTTCTGATGAATAAATGGAAATATTACCTTGTCAATTTATGGCAATGGCATTTTCACGTGTGGTCTCAACCCGGAAGGGTTTATATAAACCACTTATACAAAGATTCTATCAACTTTCTGGGCTATTTTTCCAATGGGCGACTAAATACTTTGGTGGTACGGAGTCAAATGCTAGAAAATGCGTTTCTAATAGATAATACTATGAAGAAGTTTGAGACAACCGTTTCAATTATTCCTCTGATTGAATCATTGACTAAGGCGCATTTTTGTAACCCATTAGGACATCCCATTAGTAAGTCTACCTGGGCCGATTCCTCAGATTCTCATATTATCGACCGGTTTGTGCGTATATGCAGAAATCTTTCTCATTATCACAGTGGATCCTCAAAAAAAAAGAGTTTGTATCGAATAAAATATATACTTCGGGTTTCTTGTGTTAAAAGCTTGGTTCGTAAACACAAAAGTACTGTACGCGTTTTTTTGAAAAGGTTAGGTTCGGAATTCTTGGACGAATTC????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????-----ATGTCACCACAAACAGAAACTAAAGCAAGTGTTGGATTCAAAGCCGGTGTTAAAGATTATAAATTGACTTATTATACTCCTGACTATGTAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCCGGGGTTCCGCCCGAGGAAGCAGGGGCCGCGGTAGCTGCGGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGGCTTACCAGCCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTACAACATTGAGCCTGTTGCTGGAGAAGAAAATCAATATATATGTTATGTAGCTTATCCTTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCCATTGTGGGTAATGTATTTGGGTTTAAAGCCCTGCGCGCTCTACGTCTAGAGGATCTACGAATCCCTCCCGCGTATTCGAAAACTTTCCAAGGTCCCCCTCACGGCATCCAAGTTGAGAGAGATAAATTGAACAAGTATGGACGTCCCCTATTGGGATGTACTATTAAACCTAAATTGGGATTATCCGCTAAGAACTACGGCAGAGCTGTTTATGAATGTCTACGTGGTGGACTTGACTTTACCAAAGATGATGAGAACGTAAACTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTTTTGTTTTGTGCAGAAGCTATTTATAAAGCGCAGGCAGAAACTGGTGAAATCAAAGGTCATTACTTGAATGCTACTGCAGGTACATGCGAAGAAATGATAAAAAGGGCTGTATTTGCCAGAGAGTTGGGAGTTCCTATCATAATGCATGACTACTTAACAGGGGGATTCACCGCAAATACTAGCTTGGCTCATTATTGCCGAGATAATGGTCTACTTCTTCACATCCATCGTGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAGAATCATGGTATACACTTTCGTGTACTAGCTAAAGCTTTACGTATGTCTGGTGGAGATCATATTCACTCTGGTACAGTAGTAGGTAAACTTGAAGGGGAAAGAGACATAACTTTGGGCTTTGTTGATTTACTACGTGATGATTTTATTGAAAAAGACCGAAGCCGCGGTATTTATTTCACTCAAGATTGGGTCTCTCTACCAGGTGTTCTGCCCGTGGCTTCAGGGGGTATTCACGTTTGGCATATGCCTGCTTTGACCGAGATCTTTGGGGACGATTCCGTACTACAATTCGGTGGAGGAACTTTAGGGCACCCTTGGGGAAATGCGCCGGGCGCCGTAGCTAATCGAGTAGCTCTCGAAGCATGTGTACAAGCTCGTAATGAAGGTCGCGACCTTGCTCGCGAGGGTAATGAAATTATCCGTGAGGCTAGCAAATGGAGTCCTGAATTGTCTGCTGCTTGTGAAGTATGGAAGGAGATCAAATTTGAATTCCCAGCAATGGATACTTTGTAACCCCC?? Xanthoceras_sorbifolium ATGGAGGAATTTCAAATATATTTAGAACTAGATAGATCTCAGCAACACAACTTCCTATACCCACTTCTTTTTCGAGAGTATATTTATGCACTTGC?CATGATCAT---------AGATTGA?GATTTCATTGGAAAATGGAGGTTATAACAATAAATCTAGTTCACTAAGTGTGAAACGTTTAATTACTCGAATGTATCACAAGATTCATTTGAGTATTTATGCTAATGATTCTAATCCAAATCAATTTTTTGGACACAATAAAAATTTCTATTCTGAAATGATATCTGAGGGATTTGCAGTCATTGTGGAAATTCCATTTTCCCTACGATTAGTATCTTTCTTGGAAGGGAAAGAAATGGCGAAATCTCATAATTTCCAATCAATTCATTCAATATTTCCCTTTTTCGAGGACAATTTTTCACATTTAAATTATGTCTTAGATGTACTAATACCCCACCCCATTCGCCCGGAAATCTTGGTCCAAGCCTTTCGATACTGGGTAAAAGATGTCTCTTCTTTCCATTTATTGCGATTCTTTCTTCACGAGTATTTTAATTGGAATAGTCTTATTACTCCAAAGAAATCCATTTCCATTTTTTCAACAAGTAATACAAGATTTTTCTTTTTCCTATATAATTCTCATGTATATGAATATGAATCCATCTTCCTTTTTCTTCGTAAGCAATCTTCTCATTTACGATCAACATCTTCTGGAGTCCTTCTTGAGCGAATCCGTTTTTATGGAAAAGTAAAACATCTTGTCGAAGTCTTTGCTAATGATGTCCAAGACATCTTATGGTTGTTCAAGGATCCTTTCATGCATTATGTTAGATATCAAGGAAAATCCATTTTGGCTTCAAAAGATACGCCTCTTCTGATTAATAAATGGAAATATTACCTTGTCAATTTATGGCAATGGCATTTTCGCGTGTGGTCTCAACCAGGAAGGATTCATATAAACCACTTATACAAAGATTCTATCAACTTTCTGGGCTATCTTTCGAGGGGGCGACCAAATACTTTGGTGGTACGAAGTCAAATGCTAGAAAATGCATTTCTAATAGATAATGCTATGAAGAAGTTCGAGACAACTGTTCCGATTATTCCTCTCATTGGATCATTGACTAAGGCGCGTTTTTGTAATCCATTAGGCCATCCCATTAGTAAGCCAATCTGGGCCGATTCCTCCGATTCTCGTATTATTGACCGGTTTGCGCGTATATGCAGAAATCTTTCTCATTATCACAGCGGGTCCTCAAAAAAAAAGAGTTTGTATCGAATAAAATATATACTTCGGGTTTCTTGTGTTAAAAGCTTGGTTCGTAAACATAAAAGTACTGTACGTGTTTTTTTGAAAAGATTGGGTTCGGAATTCTTGGAAGAATTCCTTACGGAAGAAGAGCACGCTCTTTCTTTAATCTTTCCAAGAGCTTCGTTTACTCCGCGGAGGTTATATAGAGGGCGGGTTTGGTATTTGGATATTTTTTGTATTAATGATTTGGTTAATCATGATAAATTAGAAATTTTTTCTAAAT-----??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AAGATACTGATATTTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCCGGGGTTCCGCCCGAGGAAGCGGGGGCCGCAGTAGCTGCGGAATCTTCTACAGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGACGGGCTTACCAGCCTTGATCGTTACAAAGGGCGATGCTACAACATTGAGCCCGTTGCTGGAGAAGAAAATCAATATATATGTTATGTAGCTTACCCTTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCCATTGTAGGTAATGTATTTGGGTTTAAAGCCTTGCGCGCTCTACGTCTAGAGGATCTACGAATCCCTCCCGCGTATGTTAAGACTTTCCAAGGCCCGCCTCACGGCATTCAAGTTGAGAGAGATAAATTGAACAAGTATGGACGTCCCCTATTGGGATGTACTATTAAACCTAAATTGGGATTATCCGCTAAGAACTATGGTAGAGCAGTTTATGAATGTCTACGTGGTGGACTTGACTTTACCAAAGATGATGAGAACGTGAACTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTTTGTGCCGAAGCTATTTATAAATCGCAGGCAGAAACTGGTGAAATCAAAGGGCATTACTTGAATGCTACTGCAGGTACATGCGAAGAGATGATAAAAAGAGCTGTATTTGCCAGAGAGTTGGGAGCTCCTATCGTAATGCATGACTACTTAACAGGGGGATTCACCGCAAATACTAGCTTGGCTCATTATTGCCGAGATAATGGTCTACTTCTTCACATCCATCGTGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAGAATCATGGTATGCATTTTCGTGTACTAGCTAAAGCTTTACGTATGTCTGGTGGAGATCATATTCACGCTGGTACAGTAGTAGGTAAACTTGAAGGGGAAAGAGACATAACTTTGGGCTTTGTTGATTTACTACGTGATGATTTTATTGAAAAAGACCGAAGCCGCGGTATTTATTTCACTCAAGATTGGGTCTCTCTACCAGGTGTTCTACCCGTGGCTTCAGGGGGTATTCACGTTTGGCATATGCCTGCTTTGACCGAGATCTTTGGGGATGATTCCGTACTCCAATTCGGTGGAGGAACTTTAGGACACCCTTGGGGAAATGCGCCGGGCGCCGTAGCGAATCGAGTAGCTCTAGAAGCATGTGTACAAGCTCGTAATGAAGGACGGGATCTTGCTCGCGAAGGTAATGAAATTATCCGTGAGGCTAGCAAATGGAGTGCTGAATTGGCTGCTGCTTGTGAAGTATGGAAGGAGATCAAATTCGAATTCCCAGCAATGGATACTTTGTAACCCCCCA ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = 'rbcl-matK combined') = N: 1-2977; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = 'rbcl-matK combined') = N: 1-2977; END; [ The following blocks are output data for analysis step 2402 ] BEGIN TREES; TITLE Tb7177; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep2402; TREE Fig._3 = [&R] (((((((((((((Cardiospermum_grandiflorum,Paullinia),Allophylus),Guindillia_trinervis),(Guioa,(Cupaniopsis_anacardioides,Arytera))),(Alectryon_connatus,Tristiropsis_acutangula)),((Blighia_sapida,((Litchi_chinensis,Dimocarpus_longan),Nephelium_mutabile)),((((Lepisanthes_alata,Hebecoccus_ferrugineus),(Erioglossum_rubiginosum,Sapindus_saponaria)),Atalaya_alata),Tristira_triptera))),(Paranephelium_macrophyllum,Schleichera_oleosa)),Koelreuteria_paniculata),Ungnadia_speciosa),((Filicium_decipiens,Ganophyllum_falcatum),(Harpullia,Dodonaea))),((Dipteronia_sinensis,Acer),((Aesculus,Billia),Handeliodendron))),Xanthoceras_sorbifolium),(Peganum_harmala,Anacardiaceae)); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr4437] END;