#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on November 09, 2025; 0:17 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Del prado R., Buaruang K., Lumbsch H.T., Crespo A., & Divakar P.K. 2019. DNA sequence-based identification and barcoding of a morphologically highly plastic lichen forming fungal genus (Parmotrema, Parmeliaceae) from tropics. The Bryologist, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S24137] [ The following blocks are input data for analysis step 24588 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep24588; DIMENSIONS NTAX=62; TAXLABELS Flavoparmelia_baltimorensis_7660FBalti2 Flavoparmelia_caperata_10175FCape Flavoparmelia_caperata_10176FCape 'Parmotrema andinum 184PAndi_Brazil' Parmotrema_cetratum_7649PCetra Parmotrema_cetratum_9425PCetra Parmotrema_corniculans_KY35PTin Parmotrema_crinitum_6061PCrini 'Parmotrema cristiferum KY26PCristi_Th' 'Parmotrema dilatatum Th_3199' 'Parmotrema endosulphureum 1594i_PEndo_Punctelia_USA' 'Parmotrema endosulphureum 1714i_PEndo_Costa' 'Parmotrema endosulphureum 20517b_PEndo_Fiji' 'Parmotrema endosulphureum 20531j_PEndo_Fiji' 'Parmotrema explnatum KY31PExpla_Th' Parmotrema_fistulatum_7655PFistu 'Parmotrema gardneri 3203PGard_Th' 'Parmotrema gardneri PH1PGard_Th' 'Parmotrema hababianum KY27PHaba_Th' Parmotrema_haitiense_7657PHaiti Parmotrema_hypoleucinum_7637PHypoleu 'Parmotrema internexum 78861PInter_India' 'Parmotrema maclayanum PH2PMacla_Th' 'Parmotrema nilgherrense 182i_PNilg_India' 'Parmotrema overremii KY28POver_Th' Parmotrema_perforatum_7983PPerfo Parmotrema_perlatum_6965PPerla 'Parmotrema permutatum PH3PPermu_Th' Parmotrema_pilosum_7656PPilosu 'Parmotrema poolii 3204PPoo_Th' 'Parmotrema praesorediosum 313i_PPra_India' 'Parmotrema praesorediosum 3209PPra_Th' 'Parmotrema praesorediosum PH4PPraeso_Th' Parmotrema_pseudoreticulatum_7650PPseudo 'Parmotrema pseudotinctorum 1606i_PPstin_Tenerife' 'Parmotrema pseudotinctorum 1608i_PPstin_Tenerife' 'Parmotrema rampoddense PH5PRampod_Th' 'Parmotrema reticulata KY15PReti_Th' Parmotrema_reticulatum_10164PReticu Parmotrema_robustum_10166PRobus 'Parmotrema rubromarginatum KY33PRubro_Th' 'Parmotrema saccatilobum 2086i_PSac_Japan' 'Parmotrema saccatilobum 3180i_PSac_Th' 'Parmotrema saccatilobum 3202PSac_Th' 'Parmotrema saccatilobum 3205PSac_Th' 'Parmotrema saccatilobum 3208PSac_Th' 'Parmotrema saccatilobum 3212i_PSac' 'Parmotrema sanctiangelii KY24PSancti_Th' Parmotrema_sp._3250i Parmotrema_ssp1_3197i_PSsp1Th_use Parmotrema_subcaperatum_324283PSubca 'Parmotrema submerrillii Th_3201' Parmotrema_subtinctorium_696PSubtin 'Parmotrema sulphuratum KY32PSulphu_Th' Parmotrema_tinctorum_10163PTin 'Parmotrema tinctorum 20543b_PTin_Fiji' 'Parmotrema tinctorum 3178i_PTinc_Fiji' 'Parmotrema tinctorum 3179i_PTin_Fiji' 'Parmotrema tinctorum 3200i_PTinc_Th' 'Parmotrema tinctorum aff_3211i_PTin' 'Parmotrema tinctorum aff_3213i_PTin' 'Parmotremopsis antillensis 3010i_PAnti' ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M49830] TITLE Parmotrema_Combined_Alignment; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep24588; DIMENSIONS NCHAR=2022; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 2010 2020 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Flavoparmelia_baltimorensis_7660FBalti2 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'Parmotrema andinum 184PAndi_Brazil' ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TAACGGCGTGAAGCGGCAACAGAAATTTGAAATCCCCCCTTTGGGGTCCGAGTTGTAATTTGTAGAGAGTGCGGGGGAGACCGCGATCTAAGTCCCTTGGAACATGGTGTCATAGAGGGTGAGAATCCCGTATGTGACCGCGGCTCGAACCCATGTGAAGCCTCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAAATGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATACTGGCTGGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAACCAGACCTGCCCGTAGGCGATCAGCCGCTGTTCTCAGCGGTGCACTCGCTCTGCGATCAGGCCAGCATCGGTTTCGGCGGTCGGATAAAGGCCTTGGGAATGTAGCTTCCTTTCGGGGGAGTGTTATAGCCCTCGGTGCAATGCGGCCAGCCGGGACCGAGGACCGCGCTTCGGCTAGGATGCTGGCGTAATGGTTGTCAGCGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTATGCGAGTGTTTGGGTGTCAAACCCATGCGCGGAATGAAAGTGAACGGATGTGAGAACCCTTAAGGGCGCATCATCGACCGATCCAGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTATGAGCATAGCCGGTGGGACCC???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GGATGTATAGCAATAGCTACTTGTATCATGATGCAAGCTCGACTATGTTGAATTTCTAGGTAGAATTATGATAATGACATTGTCTGCCTATGTGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATGTTTAATCGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGCGAATCAAGCTTTAGAATAAACAAGAAAAGGAACTAATTCGCTAGAGTTACTTACGAGGGGGTAGTAAAGTACTGCTGGTGTAGAGATGAAATTCTGTCATACCTCTTTTCGAAAGAAAAATTATGGCACGGGTATAGGCGAAGGCATCTCCTTATGTGATAACTGACATTGAGGACCGAAGGCTTCGTGGAACAAACAGGATTAGATACCCTAGTAGTTGAAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGATTAGACGTCTAAGTTTATTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCATGAGTAATTTGGCAACATTGGAATTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATAATACGCAAAAAACCTTACCACAATTTGAATATTTATATTTAACATATATCTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGCGAGATTGGTTAGTTCCATTAAATTAACGTAAACCCTTACTTTATTTTTTATATAGAGTAGTTCCCCGCTATATTGGATATGAT 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Parmotrema_cetratum_9425PCetra ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AGGAATGTATAGCAATAGCTACTTGTATCATGATGCAAGCTCGACTATGTTGAATTTCTAGGTAGAATTATGATAATGACATTGTCTGCCTATGTGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATGTTTAATCGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTGAATCAAGCTTT-AAATAAATAAGAAAAGGGACTAATTTACTAGAGTTACTTACGAGGGGGTATTAAAGTACTGCTGGTGTAGAGATGAAATTCTGTCATACCTCTTTTCGAAAGAAAAATCATGGCACAGGTATAGGCGAAGGCATCCCCTTATGTGATAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTTGTGTAACAAACAGGATTAGATACCCTAGTAGTTGAAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGATTAGACGTCTAAGTTTATTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCATGAGTAATTTGGCAACATTGGAATTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATAATCCGCAAAAAACCTTACCACAATTTGAATATTTATATTTAACATATATCTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGCGAGATTGGTTAGTTCCATTAAATTAACGTAAACCCTTACTTTATTTTTTATATAGAGTAGTTCCCCGCTATATTGGATATGAT Parmotrema_corniculans_KY35PTin ATCATTACTGAGAGAGGGGCTTCGCGCTCCCGGGGGCCTCGGCCCCCAACTCTTCACCCTGCGTGTACCTACCTTTGTTGCTTTGGCGGACCTTGGGGACCATCCTCCGCATCGGCTTTCGGGTCGGTGAGCGTCCGTCAGAGGCCTATTTGCATTCTGTTTATCAGTGTTGTCCGAGTACAAAACCAAGTAAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTACACCTCTCAAGCTTCGCTTGGTATTGGGTCCCCCGAGGCGCACCCGAAAAGTAGTGGCGGTCCGGCGTGACTTTAAGCGTAGTAAATGACCATCCCGCTTTGAAAG????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Parmotrema_crinitum_6061PCrini ATCATTACCGAGAGAGGGGCCTCGCGCT-CCGGGGGTTTCGGCCCCCAACTCTTCACCCTGTGTGTACCTATCTTTGTTGCTTTGGCGGACCTCGGGGGTCTTCCTTCGCACCGGCTTCCGGGTCGGTGAGTGTCCGTCAGAGGCCCATCTAAATTCCGTTTATCAGTGTTGTCCGAGTCCAAAATTAAGTAAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGTATTCCGGGGGGCATACCTGTTCGAGCGTCATTACACCCCTCAAGCTTCGCTTGGTATTGGGCCCCCCGCGGCGTGCCCGAAAAACAGTGGCGATCCGGCGTGACTTTAAGCGTAGTAAACTTTGATCCCGCTTTGAAAGGGGATTGCCTCAGTAACGGCGTGAAGCGGCAACAGAAATTTGAAATCTGGCTCCCGGGGTCCGAGTTGTAATTTGTAGAGAGTGTGGGGGAGAGCGCGGTCTAAGTCCATTGGAACATGGTGTCATAGAGGGTGAGAATCCCGTATGCGACCGCGAATCGAACCCATGTGAAGCCTCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAAATGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATACTGGCTGGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTGGCAACCAGACCTGCCCGTAGGCGATCAGCCGCTGTTCTCAGCGGTGCACTCGCTCTGCGATCAGGCCAGCATCGGTTTCGGCGGTCGGATAAAGGCCTTGGGAATGTAGCTTCCTTTCGGGGGAGTCTTATAGCCCTCGGTGCAATGCGGCCAGCCGGGACCGAGGACCGCGCTTCGGCTAGGATGCTGGCGTAATGGTTGTCAGCGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTATGCGAGTGTTTGGGTGTTAAACCCATGCGCGGAATGAAAGTGAACGGAGGTGAGAACCCTGAAGGGCGCATCATCGACCGATCCAGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTATGAGCATAGCTGTTGGGACCCAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGAGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGTATAGGGGCGAAAGACTAATCGAGGAATGTATAGCAATAGCTACTTGTATCATGATGCAAGCTCGACTATGTTGAATTTCTAGGTAGAATTATGATAATGACATTGTCTGCCTATGTGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATGTTTAATCGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTGAATCAAGCTTTAAATTAAATAAGAAAAGGGACTAATTCGCTAGAGTTACTTACGAGGGGGTATTAAAGTACTGCTGGTGTAGAGATGAAATTCTGTCATACCTCTTTTCGAAAGAAAAATCATGGCACAGGTATAGGCGAAGGCATCCCCTTATGTGATAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTCGTGTAACAAACAGGATTAGATACCCTAGTAGTTGAAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGATTAGACGTCTAAGTTTCTTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCAGGAGTAATTTGGCAACATTGGAATTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATAATCCGCAAAAAACCTTACCACAATTTGAATATTTATATTTAACATATATTTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGCGAGATTGGTTAGTTCCATTAAATTAACGTAAACCCTTACTTTATTTTTTATATAGAGTAGTTCCCCGCTATATTGGATATGAT 'Parmotrema cristiferum KY26PCristi_Th' ATCATTACTGAGAGAGGGGCTTCGCGCTCCCGGGGGCCTCGGCCCCCAACTCTTAACCCTATGTGTACCTACCTTTGTTGCTTTGGCGGACTTCGAAGGCCCTCCTTCGCACTGGCTTTCGGGTCGGTGAGCGTCCGTCAGGGGCCCATTTTAATCCTATTTATCAGTGTCGTCCGAGTCTAAAATGAAATAAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTACACCCCTCAAGCCTGGCTTGGTATTGGGCCCCCCGCGGCGCGCCCGAAAAGCAGTGGCGGTCCGGCGTGACTTTAAGCGTAGTAAATTTCCATTCCGCTTTGAAAG????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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'Parmotrema endosulphureum 1594i_PEndo_Punctelia_USA' ATCATTACTGAGAGAGGGGCTCCGCGCTCCCGGGGGCCTCCGCCCCCAACTCTTCACCCAATGTGTACTCACCTTTGTTGCTTTGGCGGACCTCGGGGGTCCTCCTCCGCACTGGCTTTCGGGTCGGTGAGCGTCCGTCAGAGGCCCACTTCAATTCCGTTTATCAGTGTCGTCCGAGTCGAAAATTAAGTAAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTACACCCCTCAAGCTTGGCTTGGTACTGGGCCCCCCGCGGCGTGCCTGAAAAGCAGTGGCGGTCCGGCGTGACTTTAAGCGTAGTAAATTTTTGACCCGCTTTGAAAG??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GACTAATGCTTAGGACATTGACTGCCTATGTGTCTTGACCGGGTTACGTGCCTA-AGTCAAGGTCATACGTAAAAGACTACTGTTATTCATGTTTAATCGGTTTATAGGGTACCTAGACTGTGAATCAAGCTTTTAAATAAATAAGAAAAGGGACTAATTCGCTAGAGTTACTTACGAGGGGGTTTTAAAGTACTGCTGGTGTAAAGATGAAATTCTGTCATACCTCTTTTCGAAAGAAGAATAACGGCACAGGTATAGGCGAAGGCATCCCCTTATGTGATAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTCGTGGAACAAACAGGATTAGGTACCCTAGTAGTTGAAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGATTAGACGTTTAAGTTTATTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCCGGAGTAATTTGGCAACATTGGAATTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATAATCCGCAAAAAACCTTACCCCAATTTGAATATTTATACCGAACAAATATCTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAAT???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 'Parmotrema endosulphureum 1714i_PEndo_Costa' ATCATTACTGAGAGAGGGGCTCCGCGCTCCCGGGGGCCTCCGCCCCCAACTCTTCACCCAATGTGTAATCACCTTTGTTGCTTTGGCGGACCTCGGGGGTCCTCCTCCGCACTGGCTTTCGGGTCGGTGAGCGTCCGTCAGAGGCCCACTTCAATTCCGTTTATCAGTGTCGTCCGAGTCGAAAATTAAGTAAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTACACCCCTCAAGCTTGGCTTGGTACTGGGCCCCCCGCGGCGTGCCTGAAAAGCAGTGGCGGTCCGGCGTGACTTAATGCGTAGTAAATTTTGATCCCGCTTTGAAAG?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGTATCATGATGCAAGCTCGACTATGTTGAATTTCTAGGTAGAATTATGATAATGACATTGTCTGCCTATGTGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATGTTTAATCGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTGAATCAAGCTTTTAAATAAATAAGAAAAGGGACTAATTCGCTAGAGTTACTTACGAGGGGGTTTTAAAGTACTGCTGGTGTAGAGATGAAATTCTGTCATACCTCTTTTCGAAAGAAGAATAACGGCACAGGTATAGGCGAAGGCATCCCCTTATGTGATAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTCGTGGAACAAACAGGATTAGGTACCCTAGTAGTTGAAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGATTAGACGTCTAAGTTTATTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCAGGAGTAATTTGGCAACATTGGAATTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATAATCCGCAAAAAACCTTACCACAATTTGAATATTTATACCGAACATATATCTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGCGAGACTGGTTAGTTCCATTAAATTAAGGTAAACCC???????????????????????????????????????????????? 'Parmotrema endosulphureum 20517b_PEndo_Fiji' 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'Parmotrema endosulphureum 20531j_PEndo_Fiji' 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'Parmotrema explnatum KY31PExpla_Th' 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Parmotrema_fistulatum_7655PFistu 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'Parmotrema gardneri 3203PGard_Th' 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'Parmotrema gardneri PH1PGard_Th' 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'Parmotrema hababianum KY27PHaba_Th' ATCATTACTGAGAGAGGGGCTTCGCGCTCCCGGGGGCCTCGGCCCCCAACTCTTCACCCTGTGTGTATCTACCTTTGTTGCTTTGGCGGACCTCGGGGGTCCTCCTCCGCATCGGCTTTCGGGTCGGTGAGCGTTCGTCAGAGGCCCATTTACATTCTGTTTATCAGTGTCGTCTGAGTATAAAATATAATTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAATAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTACTCCACTCAAGCTTCGCTTGGTATTGGGTCCCCTGAGGCGTACCCGAAAAGCAGTGGCGGTCCGGCGTGACTTTGAGCGTAGTAAATTGCCATCCCGCTTTGAAAG????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Parmotrema_haitiense_7657PHaiti 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Parmotrema_hypoleucinum_7637PHypoleu 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'Parmotrema internexum 78861PInter_India' 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'Parmotrema overremii KY28POver_Th' ATCATTACTGAGAGAGGGGCTTCGCGCTCCCGGGGGCCTCGGCTCCCAACTCTTCACCCTATGTGTACCTACGATTGTTGCTTTGGCGGGCCTTGGGGGTTCCCCCCCGCGCTGGCTTTTGGGCCGGTGAGCGCCCGTCAGAGGCCCACTGAAACT-CGTTTATCAGTGTCGTCCGAGTCGAAAACTGAATAAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTACATCCCTCAAGCTTGACTTGGTATTGGGCCCCCTGCGGCGTGCCCGAAAAGCAGTGGCGGCCCGGCGTGACTTTAAGCGTAGTAAATTTTGATCCTGCTTTGAAAG????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Parmotrema_perforatum_7983PPerfo ATCATTACCGAGAGAGGGGCTTCGCGCTCCCGGGGGCCTCGGCCCCCAACTCTTCACCCTGTGTGTACCCACCTTTGTTGCTTTGGCGGACCTCGGGTGTCTTCCCCCGCGCCGGCTCCCGGGCTGGCGCGCGTCCGTCGAAGGCCCACCGAAATTCCATTTTTCAGTGCCGTCCGAGTACCAAAAGAAATAAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTGCACCCCTCAAGCGTGGCTTGGTATTGGGCCCCCCGCGGCGGGCCCGAAAGGCAGTGGCGGTCCGGCGTGACTTTAAGCGTAGTAAAGACCCATCCCGCTTTGAAAGGGGATTGCCTCAGTAACGGCGTGAAGCGGCAACAGAAATTTGAAATCTGGCCCTCGGGGTCCGAGTTGTAATTTGTAGAGAGTGCGGGGGAGATGGCGGTCTAAGTCCATTGGAACATGGTGTCAGAGAGGGTGAGAATCCCGTACGTGACCGCGGATCGAGCCCGTGTGAAGCCTCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAAATGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATACTGGCTGGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTGGCAACCAGACCTGCCCGTGGGCGATCAACCGCTGTTCTCAGCGGTGCACTCGTTCCGCGATCAGGCCAGCATCGGTTTCGGCGGTCGGATAAAGGCCTTGGGAATGTAGCTTCCTTCCGGGGGAGTCTTATAGCCCTCGGTGCAATGCGGCCAGCCGGGACCGAGGACCGCGCTTCGGCTAGGATGCTGGCGTAATGGTTGTCAGCGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTATGCGAGTGTTTGGGTGTCAAACCCATGCGCGGAATGAAAGTGAACGGAGGTGAGAACCCTTGAGGGCGCATCATCGACCGATCCAGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTATGAGCATAGCTGTTGGGACCCAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGAGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGTATAGGGGCGAAAGACTAATCGAGGAATGTATAGCAATAGCTACTTGTATCATGATGCAAGCTCGACTATGTTGAATTTCTAGGTAGAATTATGATAATGACATTGTCTGCCTATGTGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATGTTTAATCGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTGGATCAAGCTTTTC--TAAATCAGAAAAAGGACTAATTCGCTAGAGTTACTTACGAGGGGGCATTAAAGTACTGCTGGTGTAGAGATGAAATTCTGTCATACCTCTTTTCGAAAGAAAAATGATGGCACAGGTATAGGCGAAGGCATCCCCTTATGTGATAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTCGTGTAACAAACAGGATTAGATACCCTAGTAGTTGAAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGATTAGATGTTTAAGTTTATTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCATGAGTAATTTGGCAACATTGGAATTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAG???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Parmotrema_reticulatum_10164PReticu 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Parmotrema_robustum_10166PRobus 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'Parmotrema rubromarginatum KY33PRubro_Th' 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'Parmotrema saccatilobum 2086i_PSac_Japan' ATCATTACTGAGAGAGGGGCTTCGCGCTCCCGGGGGCCTCGGCCCCCAACTCCTCACCCTATGTGTACTTACCTTTGTTGCTTTGGCGGACCTTGGGGGTCGTCCTCCGCACTGGCTTCGGGGTCGGTGAGTGTCCGTCAGAGGCCTATTTAAACCCTGTTTATCAGTGTCGTCCGAGTCGAAACGCAAGTAAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTACACCCCTCAAGCTTGGCTTGGTATTGGGCCCCCCGCGGCGTGCCCGAAAAGTAGTGGCGGTCCGGCGTGACTTTAAGCGTAGTAAATTTTGATCCCGCTTTGAAAG?????????????????????TGAAGCGGCAACAGAAATTTGAAATCTGGCTCCCGGGGTCCGAGTTGTAATTTGTAGAGAGTGTGGGGGAGACCGCGGTCTAAGTCCATTGGAACATGGTGTCAGAGAGGGTGAGAGTCCCGTATGCGACCGTGGATCGAACCCATGTGAAGCCTCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAAATGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATACTGGCTGGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAACCAGACCTGCCCGTAGGCGATCAGCCGCTGTTCTCAGCGGTGCACTCGCTCTGCGATCAGGCCAGCATCGGTTTCGGCGGTCGGATAAAGGCCGTGGGAATGTAGCTTCTCTTCGGGGGAGTCTTATAGCCCTCGGTGCAATGCGGCCAGCCGGGACCGAGGCCCGCGCTTCGGCTAGGATGCTGGCGTAATGGTTGTCAGCGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTATGCGAGTGTTTGGGTGTCAAACCCATGCGCGGAATGAAAGTGAACGGAGGTGAGAACCCTTTAGGGCGCATCATCGACCGATCCAGATGTCTTCGGAGGGATTTGAGTATGAGCATAGCTGTTGGGACCCAGATGGTGAACTATGCCCGAATAAGGGAACCCAGAGGAAACTCTGGGTGGGAAGC????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Parmotrema_subcaperatum_324283PSubca 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'Parmotrema tinctorum aff_3211i_PTin' ATCATTACTGAGAGAGGGGCTTCGCGCTCCCGGGGGCCTCGGCCCCCAACTCCTCACCCTATGTGTACTTACCTTTGTTGCTTTGGCGGACCTTGGGGGTCGTCCTCCGCACTGGCTTCGGGGTCGGTGAGTGTCCGTCAGAGGCCTATTTAAACCCTGTTTATCAGTGTCGTCCGAGTCGAAACGCAAGTAAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTACACCCCTCAAGCTTGGCTTGGTATTGGGCCCCCCGCGGCGTGCCCGAAAAGTAGTGGCGGTCCGGCGTGACTTTAAGCGTAGTAAATTTTGATCCCGCTTTGAAAGGGGATTGCCTCAGTAACGGCGTGAAGCGGCAACAGAAATTTGAAATCTGGCTCCCCGGGTCCGAGTTGTAATTTGTAGAGAGTGTGGGGGAGACCGCGGTCTAAGTCCATTGGAACATGGTGTCAGAGAGGGTGAGAGTCCCGTATGCGACCGTGGATCGAACCCATGTGAAGCCTCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAAATGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATACTGGCTGGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAACCAGACCTGCCCGTAGGCGATCAGCCGCTGTTCTCAGCGGTGCACTCGCTCTGCGATCAGGCCAGCATCGGTTTCGGCGGTCGGATAAAGGCCGTGGGAATGTAGCTTCTCTTCGGGGGAGTCTTATAGCCCTCGGTGCAATGCGGCCAGCCGGGACCGAGGCCCGCGCTTCGGCTAGGATGCTGGCGTAATGGTTGTCAGCGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTATGCGAGTGTTTGGGTGTCAAACCCATGCGCGGAATGAAAGTGAACGGAGGTGAGAACCCTTTAGGGCGCATCATCGACCGATCCAGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTATGAGCATAGCTGTTGGGACCCAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGAGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGTATAGGGGCGCA?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TAGAGTTTCTTAGGAGGGGGTTTTAAAGTAGTGCTGGTGTAGAGATGAAATTTTGTAATACCTCTTTTCGAAAGAAGAATAACGGCTCAGGTATAGGCGAAGGCATCCCCTTATGTGATAACTGACGTTGAGGGACGAAGGTTTTGTGGAACAAACAGGATTAGGTACCTTAGTAGTTGAAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGATTAGACGTTTAAGTTTATTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCAGGAGTAATTTGGCAACATTGGAATTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATAATACGCAAAAAACCTTACCACAATTTGAATATTTATACCAAGCGTATATCTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGTGAGACGGTTACGTTCC??????????????????????????????????????????????????????????????????? 'Parmotrema tinctorum aff_3213i_PTin' ATCATTACTGAGAGAGGGGCTTCGCGCTCCCGGGGGCCTCGGCCCCCAACTCCTCACCCTATGTGTACTTACCTTTGTTGCTTTGGCGGACCTTGGGGGTCGTCCTCCGCACTGGCTTCGGGGTCGGTGAGTGTCCGTCAGAGGCCTATTTAAACCCTGTTTATCAGTGTCGTCCGAGTCGAAACGCAAGTAAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTACACCCCTCAAGCTTGGCTTGGTATTGGGCCCCCCGCGGCGTGCCCGAAAAGTAGTGGCGGTCCGGCGTGACTTTAAGCGTAGTAAATTTTGATCCCGCTTTGAAAGGGGATTGCCTCAGTAACGGCGTGAAGCGGCAACCAAAATTTGAAATCTGGCTCCCGGGGCCCGAGTTGTAATTTGTAGAGAGTGTGGGGGAGACCGCGGTCTAAGTCCATTGGAACATGGTGTCAGAGAGGGTGAGAGTCCCGTATGCGACCGTGGATCGAACCCATGTGAAGCCTCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAAATGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATACTGGCTGGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAACCAGACCTGCCCGTAGGCGATCAGCCGCTGTTCTCAGCGGTGCACTCGCTCTGCGATCAGGCCAGCATCGGTTTCGGCGGTCGGATAAAGGCCGTGGGAATGTAGCTTCTCTTCGGGGGAGTCTTATAGCCCTCGGTGCAATGCGGCCAGCCGGGACCGAGGCCCGCGCTTCGGCTAGGATGCTGGCGTAATGGTTGTCAGCGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTATGCGAGTGTTTGGGTGTCAAACCCATGCGCGGAATGAAAGTGAACGGAGGTGAGAACCCTTTAGGGCGCATCATCGACCGATCCAGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTATGAGCATAGCTGTTGGGACCCAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGAGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGTATAGGGGCGAAAGGCTAATCG??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 'Parmotremopsis antillensis 3010i_PAnti' ATCATTACTGAGAGAGGAGCTTCGCGCTCCCGGGGGTCTCGGCCCCTAACTCTTCACCCTATGTGTACCTACCTTTGTTGCTTTGGCGGACCTTGGGGG-T-T-CTCCGCACCGGCTTTCGGGTCGGTGAGCGTCCGTCAGAGGCCCATTTAAATTCTGTTTATCAGTGTCGTCCGAGTCGAAAATTAAATAAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTACACCCCTCAAGCTTGGCTTGGTATTGGGCCCCCTGCGGCGTGCCCGAAAATCAGTGGCGGTCCGGCGTGACTTTAAGCGTAGTAAATTTTGATCCCGCTTTGAAAG????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GTGGATCGACCCCATGTGAAGCCTCTTGGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGTCAAAAATGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATACTGGCTGGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAACCAGACCTGCCCGTAGGCGATCAGCCGCTGTTCTCAGCGGTGCACTCGCTCTGCGATCAGGCCAGCATCGGTTTCGGCGGTCGGATAAAGGCCTTGGGAATGTAGCTTCCTTTCGGGGGAGTCTTATAGCCCTCGGTGCAATGCGGCCAGCCGGGACCGAGGACCGCGCTTCGGCTAGGATGCTGGCGTAATGGTTGTCAGCGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTATGCGAGTGTTTGGGTGTTAAACCCATGCGCGGAATGAAAGTGAACGGAGGTGAGAACCCTTTAGGGCGCATCATCGACCGATCCAGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTATGAGCATAGCTGTTGGGACCCAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGAGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGTATAGGGGTAAGATCCAAATCCAGGAATGTATAGCAATAGCTACTTGTATCATGATGCAAGCTCGACTATGTTGAATTTCTAGGTAGAATTATGATAATGACATTGTCTGCCTATGTGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATGTTTAATCGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTGAATCAAGCTTTTAAATAAATAAGAAAAGGGACTAATTCGCTAGAGTTACTTACGAGGGGGTTTTAAAGTACTGCTGGTGTAGAGATGAAATTCTGTCATACCTCTTTTCGAAAGAAGAATAACGGCACAGGTATAGGCGAAGGCATCCCCTTATGTGATAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTCGTGGAACAAACAGGATTAGGTACCCTAGTAGTTGAAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGATTAGACGTTTAAGTTTATTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCAGGAGTAATTTGGCAACATTGGAATTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATAATACGCAAAAAACCTTACCACAATTTGAATATTTATACCGAACGTATATCTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGTGAGACTGGTTAGTTCCATTAAATTAACGTAAACCCTTACTT?????????????????????????????????????????? ; END; BEGIN SETS; CHARSET mtssu (CHARACTERS = Parmotrema_Combined_Alignment) = 1292-2022; CHARSET nuits (CHARACTERS = Parmotrema_Combined_Alignment) = 1-457; CHARSET nulsu (CHARACTERS = Parmotrema_Combined_Alignment) = 458-1291; END; [ The following blocks are output data for analysis step 24588 ] BEGIN TREES; TITLE Parmotrema_Combined; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep24588; TREE con_50_majrule = [&R] ((Flavoparmelia_caperata_10176FCape:0.205062,(Flavoparmelia_baltimorensis_7660FBalti2:0.083627,Flavoparmelia_caperata_10175FCape:0.035016):0.176964):0.1724975,('Parmotrema internexum 78861PInter_India':0.148505,Parmotrema_sp._3250i:0.538283,Parmotrema_cetratum_9425PCetra:0.030885,Parmotrema_fistulatum_7655PFistu:0.116224,Parmotrema_pilosum_7656PPilosu:0.18525,Parmotrema_subcaperatum_324283PSubca:0.31072,'Parmotrema rampoddense PH5PRampod_Th':0.28184,(Parmotrema_haitiense_7657PHaiti:0.034025,Parmotrema_subtinctorium_696PSubtin:0.021804):0.164956,((Parmotrema_pseudoreticulatum_7650PPseudo:0.136451,(Parmotrema_reticulatum_10164PReticu:0.017096,'Parmotrema reticulata KY15PReti_Th':0.070151):0.090341):0.068428,(Parmotrema_cetratum_7649PCetra:0.039617,(Parmotrema_crinitum_6061PCrini:0.037332,Parmotrema_perlatum_6965PPerla:0.02266):0.151879,(Parmotrema_hypoleucinum_7637PHypoleu:0.084222,Parmotrema_perforatum_7983PPerfo:0.122973):0.337582):0.021229):0.026261,('Parmotrema nilgherrense 182i_PNilg_India':0.29735,('Parmotrema submerrillii Th_3201':0.031369,'Parmotrema poolii 3204PPoo_Th':0.114338,'Parmotrema rubromarginatum KY33PRubro_Th':0.247881,'Parmotrema sanctiangelii KY24PSancti_Th':0.144815,(Parmotrema_corniculans_KY35PTin:0.014654,'Parmotrema maclayanum PH2PMacla_Th':0.014653):0.159064,(Parmotrema_tinctorum_10163PTin:0.035048,('Parmotrema tinctorum 3200i_PTinc_Th':0.080706,'Parmotrema tinctorum 20543b_PTin_Fiji':0.07093):0.024108):0.065148,(('Parmotrema andinum 184PAndi_Brazil':0.273795,('Parmotrema pseudotinctorum 1606i_PPstin_Tenerife':0.259859,'Parmotrema pseudotinctorum 1608i_PPstin_Tenerife':0.082308):0.099862):0.055673,((Parmotrema_ssp1_3197i_PSsp1Th_use:0.043487,'Parmotrema hababianum KY27PHaba_Th':0.09814):0.072971,('Parmotrema permutatum PH3PPermu_Th':0.158928,'Parmotrema saccatilobum 3202PSac_Th':0.077955):0.084014):0.082174):0.025368):0.044296):0.066029,('Parmotremopsis antillensis 3010i_PAnti':0.177154,('Parmotrema endosulphureum 1714i_PEndo_Costa':0.052401,('Parmotrema endosulphureum 20517b_PEndo_Fiji':0.006852,('Parmotrema endosulphureum 20531j_PEndo_Fiji':0.028942,'Parmotrema endosulphureum 1594i_PEndo_Punctelia_USA':0.264778):0.02456):0.032691):0.09905,(Parmotrema_robustum_10166PRobus:0.109282,('Parmotrema dilatatum Th_3199':0.0349,('Parmotrema gardneri 3203PGard_Th':0.146121,('Parmotrema cristiferum KY26PCristi_Th':0.026144,'Parmotrema gardneri PH1PGard_Th':0.014785):0.136478):0.125029):0.074301):0.046835,('Parmotrema sulphuratum KY32PSulphu_Th':0.180519,('Parmotrema saccatilobum 3212i_PSac':0.054975,'Parmotrema tinctorum 3178i_PTinc_Fiji':0.006672,('Parmotrema saccatilobum 2086i_PSac_Japan':0.110637,'Parmotrema saccatilobum 3180i_PSac_Th':0.037991):0.021977,('Parmotrema tinctorum aff_3211i_PTin':0.118971,'Parmotrema tinctorum aff_3213i_PTin':0.041006):0.054211):0.150205):0.029749,(('Parmotrema praesorediosum 313i_PPra_India':0.157509,('Parmotrema praesorediosum 3209PPra_Th':0.020586,'Parmotrema praesorediosum PH4PPraeso_Th':0.013975):0.161962):0.0931,(('Parmotrema explnatum KY31PExpla_Th':0.043244,'Parmotrema overremii KY28POver_Th':0.05884):0.105193,('Parmotrema tinctorum 3179i_PTin_Fiji':0.155462,('Parmotrema saccatilobum 3205PSac_Th':0.066193,'Parmotrema saccatilobum 3208PSac_Th':0.069676):0.060626):0.09403):0.136211):0.034954):0.132259):0.1724975); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr117157] END;