#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 15, 2026; 10:47 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Salariato D., Cano A.L., Zuloaga F., & Al-shehbaz I.A. 2020. Molecular phylogeny of Cremolobus (Brassicaceae) supports the recognition of the new genus Yunkia and demonstrates the high habitat diversity of tribe Cremolobeae. Systematics and Biodiversity, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S25286] [ The following blocks are input data for analysis step 25507 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep25507; DIMENSIONS NTAX=94; TAXLABELS Aimara_rollinsii_DS147 Aimara_rollinsii_DS148 Aimara_rollinsii_DS156 Alshehbazia_hauthalii_DS266 Aschersoniodoxa_cachensis_DS285 Aschersoniodoxa_mandoniana_DS287 Aschersoniodoxa_peruviana_DS288 Atacama_nivea_GB10165 Brayopsis_alpaminae_DS272 Brayopsis_calycina_DS277 Brayopsis_colombiana_DS274 Brayopsis_diapensioides_DS273 Brayopsis_gamosepala_DS275 Brayopsis_monimocalyx_DS270 Cremolobus_chilensis_DS225 Cremolobus_chilensis_DS226 Cremolobus_chilensis_DS457 Cremolobus_chilensis_DS459 Cremolobus_chilensis_DS460 Cremolobus_chilensis_DS466 Cremolobus_chilensis_DS469 Cremolobus_chilensis_DS470 Cremolobus_chilensis_DS473 Cremolobus_chilensis_GQ424530 Cremolobus_peruvianus_DS220 Cremolobus_peruvianus_DS221 Cremolobus_peruvianus_DS222 Cremolobus_peruvianus_DS223 Cremolobus_peruvianus_DS468 Cremolobus_rhomboides_DS219 Cremolobus_rhomboideus_DS467 Cremolobus_rhomboideus_DS472 Cremolobus_stenophyllus_DS458 Cremolobus_subscandens_DS224 Cremolobus_subscandens_DS227 Cremolobus_subscandens_DS229 Cremolobus_subscandens_DS461 Cremolobus_subscandens_DS462 Cremolobus_suffruticosus_DS463 Cremolobus_suffruticosus_DS471 Dactylocardamum_imbricatifolium_DS304 Eudema_nubigena_nubigena_DS290 Eudema_nubigena_remyana_DS292 Eudema_rupestris_DS289 Machaerophorus_arequipa_DS316 Machaerophorus_laticarpus_DS347 Mathewsia_auriculata_GB2202 Mathewsia_collina_GB3599 Mathewsia_densifolia_GB11678 Mathewsia_foliosa_GB9837 Mathewsia_incana_GB190 Mathewsia_linearifolia_GB11658 Mathewsia_peruviana_GB739 Menonvillea_chilensis_DS150 Menonvillea_cicatricosa_DS164 Menonvillea_comberi_DS169 Menonvillea_cuneata_DS162 Menonvillea_famatinensis_DS239 Menonvillea_filifolia_DS184 Menonvillea_flexuosa_DS237 Menonvillea_frigida_DS241 Menonvillea_hookeri_DS167 Menonvillea_linearis_DS152 Menonvillea_litoralis_DS181 Menonvillea_marticorenae_DS183 Menonvillea_minima_DS146 Menonvillea_nordenskjoeldii_DS172 Menonvillea_orbiculata_DS151 Menonvillea_patagonica__DS161 Menonvillea_pinnatifida_DS149 Menonvillea_purpurea_DS145 Menonvillea_rigida_DS186 Menonvillea_scapigera_DS190 Menonvillea_spathulata_DS165 Menonvillea_virens_DS168 Onuris_alismatifolia_DS262 Onuris_graminifolia_DS257 Onuris_hatcheriana_DS267 Onuris_papillosa_DS258 Onuris_spegazziniana_DS260 Schizopetalon_arcuatum_GB51 Schizopetalon_bipinnatifidum_GB4231 Schizopetalon_biseriatum_GB10685 Schizopetalon_brachycarpum_GB926 Schizopetalon_dentatum_GB995316 Schizopetalon_maritimum_GB53 Schizopetalon_rupestre_GB1140 Schizopetalon_tenuifolium_GB423 Schizopetalon_walkeri_GB8217 Smelowskia_calycina_GB Thlaspi_arvense_GB Xerodraba_patagonica_DS253 Xerodraba_pectinata_pectinata_DS248 Xerodraba_pectinata_pycnophylloides_DS251 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M52215] TITLE 'Cremolobus ITS+cpDNA'; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep25507; DIMENSIONS NCHAR=3330; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Aschersoniodoxa_cachensis_DS285 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Menonvillea_famatinensis_DS239 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Menonvillea_minima_DS146 TCGATACC?TGTCC?AAAACAGAACGACTCGAGAACAA?TCGATCATCACTCTCGGTGAGC???CGGTTTTCTAGCGAATCCCGTGCTTGCCGAT?TCCGTGGTTTCATGTTTGGTTCCCATCCAG??AG?TTTTATCTCTGT??TGGGCCATGCGTGATGC?TTCCGG??ATATCACAAAACCCCGGCACG?AAAAGTGTCAAGGAACATGCAAATAAACAGCATGCCTCCACTACTCCGGAGACGGTGTGTGTGTGAGGATGAAGTGC?TGC?AATCTAAAGTC?TAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCCAAGCCTTCTGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGTGTCACAAATCATCGT?C???CCCCATCC?????TTCGCGGGTGCTGGACGGAAGCTGGTCT?CCCGTGTGATACCGCATGCGGTTGGCCAAAATATGAGCTAAGGATGCTAGGAGCGTCTCGACATGCGGTGGTGAAATCAAACCTCGTCATAATGTCGGCCGAC?CAAGTCTAGAAGCTCT?TGATGGAGCCTTGGTATGGAAACCTACTAAGTGATAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAATAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTGGTTTACGCGAACAAACCAGAGTTTGGAAAGCGAG?AAAAAAGGGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAATGGAGTTCACTAC?????????CTTGT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GTTGATCAAATGATTAACTTA?????????????TATAGTCTGATAGATCCTTGGTGGAAC?TTATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTAC???????????????????????ATGTCAATACTGACAACAATGAAATTTATAGTAAGATGAAAATCCGTTGACTTTTAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCAACTCTACTCC?CCCAAAAAGTCTGTTTGATACCTTACT???????????TTTTTTTAGTTATTCAAGAATTCATTATCTTTTTTCATTCATCCTACGCTTTTCC?????????????????AAACTATAATTTATATTCTTATTATAGACTTATAGACTTA????????TAGACAAGTCTTGTGGGATATATCATACACGTACAAATGAGAAAGAAATATCGATTTGAATTATTTAGAATC?????TATATAATTTTTCATTTT?AAAACTTAGAAAGTTTTCTTTTCACAGATCCAAGAAATTCCCGGTCCAAAACTTTTTTCATT???????????TTTTGCGTTTCTTTTAATTGACATAGACCTAAGTCATCTAGTAAAATGAGGATGATACTTCGGTAATGGCCGGGATAGCTC??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Menonvillea_nordenskjoeldii_DS172 TCGATACCTTGTCC?AAAACAGAACGACCCGAGAACAA?CTGATCATCACTCTCGGCGGGC???CGGTTTCTTAGCCGATCTCGTGCTCGCCGGA?TCCGTGGTTTTGCGCATCGTCCTTTTCATG??GG?TTAATCCGTGGT??TGGGTCATGTGCAATGC?TTCCGG??ATATCACAAAACCCCGGCACG?AAAAGTGTCAAGGAACATGCAAACAACCAGCCTGCCTCAGCCACCCTGGAGACGGTGTGTGCGC??CGATGCAGTGC?TGC?AATCTAAAGTC?TAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCCAAGCCTTCTGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGTGTCACAAATCGTCGT?C???CTCTATCC?????TTCG?GGATTCTGGACGGAATCTGGTCT?CCCGTGTGGTACCGCACGCGGTTGGCCGAAAACCGAGCAAAGGATGCTAGGAGCGTCTCGACATGCGGTGGTGAATCCAAGCCTCGTCAATTCGTCGACCGCT?CCTCTCTGGAAGCTCT?TGATGGAGCCTTAGTATGGAAACCTACTAAGTGATAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAATAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTGGTTTACGCGAACAAACCAGAGTTTAGAAAGCGAGAACAAAAGGGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAAAGGAGTTCACTAC?????????CTTGT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GTTGATCA??????????TT??????????????CATAGTCTGATAGATCCTTGGTGGAAT?TTCTTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTAC???????????????????????ATGTCAATACTGACAACAATGAAATTTATAGTAAGATGAAAATCCGTTGACTTTTAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCAACTCTACTCC?CCAAAAAAGTCTGTTTGACACCGTACC???????TTTTTTTTTTTAGTTATTCAAGAATACATTATCTTTCTTCATTCATCCTACGCTTTTCC?????????????????AAACTATCATTTCTTTTCCTA????????????????TTA????????TATACAAGTCTTGTGGGATATATCATACACGTACAAATGAGAAAGAAATCTCTATTTGAATTATTTAAAATC?????TATATAATTTTTCATTTT?AAAACTTAGAAAGTCTTCTTTTCGCGGATCCAAGAAATTCCCGGTCCAAAACTTTTTTCATTTACTACTTTTGTTTTGCGTTTCTTTTAATTGACATAGACCTAAGTAATCTAGTAAAATGAGGATGATACTTCGATAATGGCCGGGATAGCTCCACTTGGCTACATCCGCCCCTACTCTACTCT?????????????ACTATTCTATTTTTGTT??????????ATTGT?????CTAAAATAAAAACGCACCGATTTCAATAAAAAA?????ACTGG?????????????TAGCAAATTGAATCTTATTTTAT???????????????????????????????AAAAAAAA???????TTCTATTT???CTT????????TTGATTTTTTATATT????TTTTTATATTT??????ATA?GTAGTGTAGT?ACTTTTATTAGTAGTGTAGTACTTTTATTAGT????????????????AGTGTAGTACTTTTATA???????????????AA?AGTAAAAAAAAATGATACTCACAAAATAGTTGGTAATTTTAATA?????????GTAAAAAAGAGCAATATAAGCCT???TCTTTA???????????????????????AAATTTAAAGATAAAGGC?????TTATATTGCTC?TTTTTTACTAT???????????TACTAAACTAGGTTTAG?ACTAACGCTAAAGAATTATCCATTTGTACTTTA??????????TTTTATA????????????GGAATATAG?GTGCTTTTGGCCGGACATTTTGTGTTCTATTTTACTAGAGTCCTACACTTT?TTTGAATATAA?????AAAA?GAGTACAGGATGGAGCTCGAGGAGAATAGAAAGTTTTTATTACTTTAGCAGGAG?TAAGGATCTAGGGTTAGTGCGAATCAATAAG?TGGAACAACTTCGTAATTTTTTTTTTTTT??????????????????AAG??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TCCTT?TCAAGCAA?TTTACAATGGAAAAGGAAAAAATTTTTTTAT????????TGTAAAATTCGTTGAATAAAAAGTCTATAATGCGTGAATCAAGCGTTTCTATGATTCTTTGATAGAAAGAAAAGAAATCATAAGAAAAATCAGGGGCTTGTTGCTGCCCTTTTTTAATAAAACGATTCAA?GATCACCGAAGTTATGTCTAAACCAAAAGATTCAAAG?TAAAGAT??????AAAGAATCCTGAAACAAGGAAATCCAGTTTTCAATTGTTTGAATAACTAGATCAGAATGAAGAATTAAAATTTATTCT?AAAAAATGAGAAAAAC??AAAAAAAGGGTTAGAGACTACTC???????AATAAAAAGAGTACTTAAGGATTCTCTGTTGAGATATTTGAGAGTTATTTAACTTGAGTTACGAGAGGACGAATGTTACGAATGCTTTTTATGG????AAAAAA????????ATATTTAGGGGTTTCAATACTGGCTA?????????????????????ATAGATTAAATATTTTTATTAATCGATTTAATATTTGA?????????A?TTTTAAACAG????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Menonvillea_orbiculata_DS151 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(Smelowskia_calycina_GB:0.050886,Thlaspi_arvense_GB:0.081594,(((((((Aimara_rollinsii_DS147:3.51E-4,Aimara_rollinsii_DS148:3.45E-4,Aimara_rollinsii_DS156:0.001266):0.018615,(((Cremolobus_chilensis_DS466:0.004451,(((Cremolobus_chilensis_DS225:0.002652,Cremolobus_chilensis_DS460:0.001127,Cremolobus_chilensis_DS470:3.34E-4):0.003132,(Cremolobus_suffruticosus_DS463:6.85E-4,Cremolobus_suffruticosus_DS471:0.001425):0.002909):8.79E-4,((Cremolobus_chilensis_DS457:0.001863,(Cremolobus_chilensis_DS473:0.004739,Cremolobus_chilensis_GQ424530:7.23E-4):0.003655):0.001194,(Cremolobus_chilensis_DS459:3.54E-4,Cremolobus_chilensis_DS469:0.001484):0.001631):8.68E-4):0.010483):0.010695,((Cremolobus_chilensis_DS226:5.87E-4,Cremolobus_stenophyllus_DS458:0.001285):0.011821,(Cremolobus_rhomboides_DS219:6.5E-4,(Cremolobus_rhomboideus_DS467:7.58E-4,Cremolobus_rhomboideus_DS472:3.87E-4):9.11E-4):0.005035):0.003451):0.016938,((Cremolobus_peruvianus_DS222:4.8E-4,(Cremolobus_peruvianus_DS220:3.64E-4,Cremolobus_peruvianus_DS221:0.001361):9.02E-4):0.002042,(Cremolobus_peruvianus_DS223:0.001815,Cremolobus_peruvianus_DS468:0.001465):0.003402):0.009133):0.018954):0.018615,((Menonvillea_minima_DS146:0.015897,((Menonvillea_chilensis_DS150:0.00526,Menonvillea_orbiculata_DS151:0.00531):0.006017,(Menonvillea_flexuosa_DS237:0.005716,(Menonvillea_litoralis_DS181:0.003171,(Menonvillea_filifolia_DS184:4.88E-4,Menonvillea_pinnatifida_DS149:4.86E-4):0.001212):0.001882,(Menonvillea_linearis_DS152:0.003102,(Menonvillea_marticorenae_DS183:0.002272,Menonvillea_purpurea_DS145:5.37E-4):0.002092):0.003292):0.00694):0.020195):0.035007,(((Menonvillea_cicatricosa_DS164:0.019616,(Menonvillea_spathulata_DS165:0.004931,(Menonvillea_nordenskjoeldii_DS172:0.005073,Menonvillea_rigida_DS186:0.007628):0.010918):0.005325):0.012427,((Menonvillea_comberi_DS169:0.008717,Menonvillea_patagonica__DS161:0.007321):0.009859,(Menonvillea_frigida_DS241:0.007248,(Menonvillea_cuneata_DS162:0.005894,Menonvillea_virens_DS168:0.005998):0.002512):0.020315):0.00408):0.045547,(Menonvillea_famatinensis_DS239:0.008552,(Menonvillea_hookeri_DS167:0.002644,Menonvillea_scapigera_DS190:0.002594):0.004241):0.035087):0.005576):0.005626):0.002718,((Aschersoniodoxa_peruviana_DS288:0.026893,(Brayopsis_gamosepala_DS275:0.008689,((Aschersoniodoxa_cachensis_DS285:0.00227,Aschersoniodoxa_mandoniana_DS287:4.4E-4):0.027074,(Dactylocardamum_imbricatifolium_DS304:0.008298,(Brayopsis_diapensioides_DS273:0.013119,(Eudema_rupestris_DS289:8.05E-4,(Brayopsis_calycina_DS277:0.002707,(Brayopsis_alpaminae_DS272:8.02E-4,Brayopsis_monimocalyx_DS270:0.003696):0.002411):0.002101):0.003419):9.74E-4):0.002944):0.003374,(Brayopsis_colombiana_DS274:0.005171,(Eudema_nubigena_nubigena_DS290:0.00168,Eudema_nubigena_remyana_DS292:0.002434):0.003682):0.012338):0.017239):0.017138,((Onuris_graminifolia_DS257:0.007899,(Onuris_alismatifolia_DS262:0.003083,(Onuris_hatcheriana_DS267:3.5E-4,Onuris_papillosa_DS258:3.4E-4,Onuris_spegazziniana_DS260:8.05E-4):0.001858):0.005107):0.014767,(Alshehbazia_hauthalii_DS266:0.016347,(Xerodraba_pectinata_pectinata_DS248:0.006669,(Xerodraba_patagonica_DS253:0.001141,Xerodraba_pectinata_pycnophylloides_DS251:0.001124):0.013093):0.012983):0.00253):0.006043):0.015032):0.002871,(Machaerophorus_arequipa_DS316:0.004235,Machaerophorus_laticarpus_DS347:0.005138):0.013071):0.002804,(Atacama_nivea_GB10165:0.029911,((Mathewsia_foliosa_GB9837:0.008272,((Mathewsia_auriculata_GB2202:0.0021,Mathewsia_linearifolia_GB11658:0.001618):0.005423,(Mathewsia_collina_GB3599:0.006737,(Mathewsia_incana_GB190:0.007116,(Mathewsia_densifolia_GB11678:3.58E-4,Mathewsia_peruviana_GB739:0.004968):0.007158):0.001134):0.002807):0.002531):0.002125,(Schizopetalon_arcuatum_GB51:0.004795,(Schizopetalon_bipinnatifidum_GB4231:0.002995,(Schizopetalon_rupestre_GB1140:0.007189,(Schizopetalon_biseriatum_GB10685:6.88E-4,Schizopetalon_tenuifolium_GB423:6.66E-4):0.001232):0.002079):0.008105,(Schizopetalon_brachycarpum_GB926:0.003247,(Schizopetalon_maritimum_GB53:0.010102,(Schizopetalon_dentatum_GB995316:0.004229,Schizopetalon_walkeri_GB8217:0.004934):0.003003):0.001096):0.003316):0.007882):0.01244):0.002898):0.006127,((Cremolobus_subscandens_DS224:0.00756,(Cremolobus_subscandens_DS227:4.08E-4,Cremolobus_subscandens_DS462:0.001433):0.006964):0.00504,(Cremolobus_subscandens_DS229:0.002489,Cremolobus_subscandens_DS461:3.68E-4):0.005671):0.051744):0.021559); 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TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr120326] END;