#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on November 13, 2026; 6:52 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Crous P.W., Wingfield M.J., Cheewangkoon R., Carnegie A., Burgess T.I., Summerell B., Edwards J., Taylor P.W., & Groenewald J.Z. 2019. Foliar pathogens of eucalypts. Studies in Mycology, 94: 125-298. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S24522] [ The following blocks are input data for analysis step 25515 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep25515; DIMENSIONS NTAX=54; TAXLABELS Blastacervulus_eucalypti_CPC_13956 Blastacervulus_eucalyptorum_CPC_26089_ Blastacervulus_eucalyptorum_CPC_29450 Blastacervulus_eucalyptorum_CPC_31592 Blastacervulus_robbenensis_CPC_12174 Blastacervulus_robbenensis_CPC_13957 Blastacervulus_robbenensis_CPC_27661 Leptosphaeria_doliolum_CBS_505.75 Thyrinula_dunnii_CPC_12574 Thyrinula_dunnii_CPC_12974 Thyrinula_dunnii_CPC_12977 Thyrinula_dunnii_CPC_12980 Thyrinula_dunnii_CPC_12983 Thyrinula_dunnii_CPC_12987 Thyrinula_dunnii_CPC_12988 Thyrinula_dunnii_CPC_13214 Thyrinula_dunnii_CPC_13216 Thyrinula_dunnii_CPC_32944 Thyrinula_dunnii_CPC_35767 Thyrinula_dunnii_CPC_35783 Thyrinula_dunnii_CPC_35845 Thyrinula_eucalypti_CPC_12978 Thyrinula_eucalypti_CPC_12986 Thyrinula_eucalypti_CPC_13212 Thyrinula_eucalypti_CPC_33394 Thyrinula_eucalypti_CPC_33561 Thyrinula_eucalypti_CPC_33581 Thyrinula_eucalyptina_CPC_11270 Thyrinula_eucalyptina_CPC_12981 Thyrinula_eucalyptina_CPC_12982 Thyrinula_eucalyptina_CPC_12984 Thyrinula_eucalyptina_CPC_13748 Thyrinula_eucalyptina_CPC_31927 Thyrinula_eucalyptina_CPC_31933 Thyrinula_eucalyptina_CPC_32217 Thyrinula_eucalyptina_CPC_32229 Thyrinula_eucalyptina_CPC_32868 Thyrinula_eucalyptina_CPC_32870 Thyrinula_eucalyptina_CPC_32874 Thyrinula_eucalyptina_CPC_32880 Thyrinula_eucalyptina_CPC_32886 Thyrinula_eucalyptina_CPC_33011 Thyrinula_eucalyptina_CPC_33762 Thyrinula_eucalyptina_CPC_35781 Thyrinula_eucalyptina_CPC_35990 Thyrinula_parasitica_CPC_12835 Thyrinula_parasitica_CPC_16825 Thyrinula_parasitica_CPC_32188 Thyrinula_parasitica_CPC_36157 Thyrinula_uruguayensis_CPC_12111 Thyrinula_uruguayensis_CPC_31921 Thyrinula_uruguayensis_CPC_31923 Thyrinula_uruguayensis_CPC_33772 Thyrinula_uruguayensis_CPC_35836 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M52227] TITLE 'Blastacervulus/Thyrinula (Fig. 12)'; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep25515; DIMENSIONS NCHAR=4442; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 2010 2020 2030 2040 2050 2060 2070 2080 2090 2100 2110 2120 2130 2140 2150 2160 2170 2180 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. . . . . . . . . . . ] Blastacervulus_eucalypti_CPC_13956 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Thyrinula_uruguayensis_CPC_35836 GAAGATTGTAGTGTGCGTGGTCAGCGATGGCCGTGCAAAGATCAATCCGCGAACACGCTCTGTTCTTGCTGCGTTGGGTGTGTATCAAGATGGTATCGCTAAGCAGCAGGTCAACGGCAAGGATGTGACTGCGCATATCTACG-----------------------------------------------------AGTACACTACTCAAATGACACTCGAGATTAAAAAGAACGTCGTCGGGGTGAAGAGGGGCAACACACCGGTGCAGCTGCTCTTCTGCCTGAAGGAGAAGAA?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GCTGCCCCTCGGTACC-GAGGGAGGCGCCCGCGACTCTAAATAACGGGTACCGCGCCAGCTAGTCCCTGCCGGCG--CCCAGCGCA-CCGGCCCGGGCAACATCGTCAAACTGCGGGAAAGCCCTGCCACGA--CTACCGGGACCCCACCGCCCCAGCAATGAGAGCGGGTGCCTGCGGCTAACAGCTGCGGGTACGGTAAAGCACCGAAGTCTAGGGGCAATCCGCCGCCAAACCCTCCCC-GCTCCGGGAGGGCCCAGCTCACAGGCCAGACGGCGATGGGCG--CAGCCGCGCTTAAGATATGGTCGAGTGACCCGTCGAGAGGCGGGTGCAACTCAGGAAACGTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTACCGAGGAAAGTCGCGGCCTAACCGGCGGACACCT-CCAACCCTTTGTGTAC-CTAAC-ACTGTTGCTTTGGCGGGGCGTAGCCGGTGCCTTCTAGGTACCCGCGCTCCCCCGGC--CTCCGGGCTGGGGTGTACCCGCC----AGAGACCCCAAC--AAACCCTTCGCGAACCGTGCCGTCTGAAGC--AAGCTAT-ACGCAACCAAATAAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAGTTTTTGAACGCACATTGCGCCCGCTGGTACTCCGGCGGGCACACCTGTTCGAGCGTCATTTCAAACCTCAAGCTGTGCTTGGTATTGGGTGCTCG-CCCCCGGCTGCG-GGGCGCACCTGGAACCCGTCGGCGGTACGGTACTGCACCCGAGTCGAGAGTAGCAGGCTGTCAAAAGCGTCTCTCGCGCCCGGTGCCCG-CG-CCCGC-CGGTAAACGAATCCAT---TGCAAG-TTGACCTCGG????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AGCGGCAACAGCTCAAATTTGAAATCTGGCGCCTTCGGTGCCCGAGTTGTAATTTGTAGAGGGTAGCTCGA-GCCCGCCCCCGTCTAAGTCCCCTGGAACGGGGCGTCGTAGAGGGTGAGAATCCCGTATGCGACGGGGTGGCGTGCTCGTGTGAGCTCCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGAGGTAAATTCCTTCTAAAGCTAAATACCGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTTAAAAAGCACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTCACGACCAGACTCGGGTGCGGCTGCTCAGCCGGTCTTCTGACCGGTGCA-TCGGTTGCACCCGGGCCAGCATCGGTTCGGGCGGTCGGATAAAGGTCTCGGGAACGTAGCTCCCCTCGGGGAGTGTTATAGCCCGGGGCGCAATGCGGCCTGCCCGGACCGAGG--AACGCGTTCGCTAGGATGCTGGCGTAATGGTCGTTAGC-GGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTACCATCTGTGCGAGTATTAGGGTGTC-AAACCCTCGTGCGTAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAACCCTT-TGGGTGCACCATCGACCGATCCAGATGTCCTCGGACGGATTTGAGTAAGAGCACCGCTGGTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCGCGGATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTC-GCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCA?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TCATTGCTGCCGGTACTGGTGAGTTCGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGCCAGACTCGTGAGCACGCCCTGCTCGCCTACACCCTCGGTGTCAAGCAGCTCATCGTCGCCATCAACAAGATGGACACCACCAAGTGGTCTGAGGAGCGTTTCAACGAAATCATCAAGGAGACGTCCAACTTCATCAAGAAGGTCGGCTACAACCCCAAGACTGTTCCTTTCGTCCCCATCTCTGGTTTCAACGGCGACAACATGATCGAGGTCTCCACCAACGCCCCCTGGTACAAGGGCTGGGAGAAGGAGACCAAGACCAAGTCCACTGGCAAGACCCTCCTCGAGGCCATTGACTCCATCGATCCCCCAAGCCGTCCCTCTGACAAGCCCCTCCGCCTGCCCCTCCAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGCACGGTACCTGTCGGTCGTGTCGAGACTGGTACCATCAAGGCCGGTATGGTTGTCACCTTCGCCCCCGCTGGTGTCACCACCGAAGTCAAGTCCGTGGAAATGCACCACGAACAGCTTACTGAGGGTGTCCCTGGTGACAACGTCGGCTTCAACGTCAAGAACGTCTCCGTCAAGGAGATCCGTCGTGGCAACGTCGCTGGTGACTCCAAGAACGACCCACCCAAGGGTGCCGAGTCTTTCAACGCTCAGGTCATTGTCCTGAACCACCCCGGTCAGGTCGGTGCTGGCTACGCACCAGTGCTCGACTGCCACACTGCCCACATTGCCTGCAAGTTCTCCGAGCTGCTCGAGAAGATCGATCGCCGTACTGGCAAGTCCATCGAAGCTACCCCCAAGTTCATCAAGGTAAA-TTCATTGAATTCACTTTCGCAATCCGTGAGCTGACAATCTTGCAGTCTGGTGATGCCGCCATCGTCAAGATGATACCCTCCAAGCCCATGTGCGTTGAGGCTTCACCGAG???????????????????????????????????????????????????????????TAGACGCGACCCCCCTAATACCCCACCACGCGTATCAACATTAAGAACATTGAAGGCTAATCGTTTCTTCTCGCGATATAGGTCCACCTCCAGACCGGCCAATGTGTGAGTACCCTCC-AAACCCCAATACAACTTTCACGCGCTGACGTTGTTGACACAGGGCAACCAAATCGGTGCTGCCTTCTGGTTCGTTTACCGCCGAGCCGACTTCGACTCT----GCACAAGCACAACGCGTTGATCTGACTGGAAACATAGGCAAACCATCTCTGGCGAGCACGGTCTTGATGGGTCCGGCGTGTAGGTCACACCATTGAAGAGTCTAGGAATAAGTCTAGGCA-GGGCACTGACCTCCTGCAGTTACAACGGCACGTCTGATCTGCAACTCGAGCGCATGAACGTGTACTTCAACGAGGT---TCGTCAATATCGCGTCTTGTCAAGAG--AAGGAGTGCTGAC-ACTTTTAGGCGTCAAACAACAAATATGTCCCCCGCGCTGTCCTGGTCGACCTCGAACCGGGCACCATGGATGCGGTCCGCGCTGGCCCATTCGGTCAGCTCTTCCGCCCCGACAACTTCGTCTTCGGCCAGTCTGGTGCTGGTAACAATTGGGCCAAGGGTCACTACACTG????????????????????? ; END; BEGIN SETS; CHARSET locus5 (CHARACTERS = 'Blastacervulus/Thyrinula (Fig. 12)') = 3898-4316; CHARSET locus3 (CHARACTERS = 'Blastacervulus/Thyrinula (Fig. 12)') = 1576-2371; CHARSET locus1 (CHARACTERS = 'Blastacervulus/Thyrinula (Fig. 12)') = 1-144 147-151 197-296; CHARSET locus2 (CHARACTERS = 'Blastacervulus/Thyrinula (Fig. 12)') = 791-1320; CHARSET locus4 (CHARACTERS = 'Blastacervulus/Thyrinula (Fig. 12)') = 2792-3716; END; [ The following blocks are output data for analysis step 25515 ] BEGIN TREES; TITLE 'Fig 12. The first of 45 equally most parsimonious trees from the Blastacervulus/Thyrinula alignment'; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep25515; TREE 'Fig 12. The first of 45 equally most parsimonious trees from the Blastacervulus/Thyrinula alignment' = [&R] (((((((((((((Thyrinula_eucalyptina_CPC_11270:23.0,(Thyrinula_eucalyptina_CPC_12981:11.0,(Thyrinula_eucalyptina_CPC_32880:23.0,Thyrinula_eucalyptina_CPC_33011:13.0):10.0):13.0):8.0,((Thyrinula_eucalyptina_CPC_12984:104.0,Thyrinula_eucalyptina_CPC_32217:22.0):8.0,Thyrinula_eucalyptina_CPC_13748:4.0):5.0):11.0,Thyrinula_eucalyptina_CPC_12982:11.0):8.0,Thyrinula_eucalyptina_CPC_31933:14.0):7.0,Thyrinula_eucalyptina_CPC_35990:21.0):8.0,Thyrinula_eucalyptina_CPC_32868:31.0):16.0,(Thyrinula_eucalyptina_CPC_32870:23.0,Thyrinula_eucalyptina_CPC_32886:20.0):6.0):9.0,((Thyrinula_eucalyptina_CPC_31927:28.0,Thyrinula_eucalyptina_CPC_35781:32.0):10.0,Thyrinula_eucalyptina_CPC_32874:23.0):9.0):25.0,(Thyrinula_eucalyptina_CPC_32229:30.0,Thyrinula_eucalyptina_CPC_33762:52.0):10.0):20.0,(((((Thyrinula_uruguayensis_CPC_12111:0.0,(Thyrinula_uruguayensis_CPC_31921:0.0,Thyrinula_uruguayensis_CPC_31923:10.0):1.0):3.0,Thyrinula_uruguayensis_CPC_35836:7.0):8.0,Thyrinula_uruguayensis_CPC_33772:4.0):62.0,((Thyrinula_parasitica_CPC_12835:4.0,Thyrinula_parasitica_CPC_16825:0.0):13.0,(Thyrinula_parasitica_CPC_32188:0.0,Thyrinula_parasitica_CPC_36157:0.0):16.0):30.0):16.0,(((((((Thyrinula_dunnii_CPC_12574:31.0,Thyrinula_dunnii_CPC_12988:27.0):16.0,Thyrinula_dunnii_CPC_12980:23.0):15.0,Thyrinula_dunnii_CPC_32944:34.0):7.0,Thyrinula_dunnii_CPC_12974:26.0):15.0,Thyrinula_dunnii_CPC_35767:56.0):6.0,((Thyrinula_dunnii_CPC_12977:28.0,Thyrinula_dunnii_CPC_12987:21.0):13.0,Thyrinula_dunnii_CPC_13216:32.0):9.0):13.0,((Thyrinula_dunnii_CPC_12983:30.0,(Thyrinula_dunnii_CPC_13214:18.0,Thyrinula_dunnii_CPC_35845:41.0):15.0):9.0,Thyrinula_dunnii_CPC_35783:26.0):7.0):12.0):17.0):25.0,(((Thyrinula_eucalypti_CPC_12978:16.0,(Thyrinula_eucalypti_CPC_12986:17.0,Thyrinula_eucalypti_CPC_13212:18.0):17.0):2.0,(Thyrinula_eucalypti_CPC_33561:14.0,Thyrinula_eucalypti_CPC_33581:16.0):6.0):14.0,Thyrinula_eucalypti_CPC_33394:13.0):47.0):45.0,((((Blastacervulus_robbenensis_CPC_12174:1.0,Blastacervulus_robbenensis_CPC_27661:0.0):3.0,Blastacervulus_robbenensis_CPC_13957:2.0):37.0,Blastacervulus_eucalypti_CPC_13956:48.0):16.0,((Blastacervulus_eucalyptorum_CPC_26089_:1.0,Blastacervulus_eucalyptorum_CPC_31592:0.0):13.0,Blastacervulus_eucalyptorum_CPC_29450:22.0):38.0):51.0):229.0,Leptosphaeria_doliolum_CBS_505.75:485.0):0.0; [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr120334] END;