#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on November 12, 2026; 11:19 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Da silva T.G., Stenclova L., Pereira archanjo N.C., & Bagatini I.L. 2019. Review and phylogenetic position of genus Nephrocytium Nägeli (Sphaeropleales, Chlorophyceae), with description of Nephrocytiaceae fam. nov. and Nephrocytium vieirae sp. nov. Taxon, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S25044] [ The following blocks are input data for analysis step 25833 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep25833; DIMENSIONS NTAX=32; TAXLABELS Ankyra_sp. Bracteacoccus_sp. Bracteacoccus_sp._Copy Bracteacoccus_sp._Copy1 Bracteamorpha_sp. Chlorosarcinopsis_sp. Dictyochloris_sp. Dictyococcus_sp. Dictyococcus_sp._Copy Follicularia_sp. Mychonastes_sp. Neochloris_sp. Nephrocytium_sp. Nephrocytium_sp._Copy Nephrocytium_sp._Copy1 Nephrocytium_sp._Copy2 Nephrocytium_sp._Copy3 Nephrocytium_sp._Copy4 Nephrocytium_sp._Copy5 Pediastrum_sp. Planktosphaeria_sp. Podohedriella_sp. Pseudomuriella_sp. Radiococcus_sp. Rotundella_sp. Rotundella_sp._Copy Scenedesmus_sp. Scenedesmus_sp._Copy Schizochlamys_sp. Schroederia_sp. Sphaeroplea_sp. Tumidella_sp. ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M52868] TITLE Nephrocytium_tufA; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep25833; DIMENSIONS NCHAR=668; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .] Ankyra_sp. TTAAATAAGGAAGACCAAGTAGATGATACTGAACTTTTAGAATTAGTTGAACTTGAAGTGCGCGAAACACTAGATAAATATGAATTTCCTGGTGATGAAATTCCTATTGTTACAGGATCAGCTTTATTAGCATTAGAAGCTTTAGTTGAAAATCCAAAGATTCAACCTGGTGACAATAAATGGGTAGATAAAATTTATGCACTAATGGATAAAGTAGATAGTTATATTCCTACACCAGAACGTGAAACAGATAAACCATTCTTATTAGCAGTAGAAGATGTTTTATCAATTACAGGTCGTGGTACAGTTGCGACAGGTCGTGTTGAACGAGGTACATTACGTGTTGGTGATAACCTTGAAATTGTAGGTCTTAAAGACACAAAAAACTGTGTTGTAACAGGATTAGAAATGTTTAAGAAAACTTTAGACGAAACTATGGCGGGTGACAACGTTGGTGTATTATTACGTGGTGTTCAAAAGAAAGATATCGAACGCGGTATGGTTTTAGCAAAACCTGGCTCAATCTTACCACATACTAAATTTGAAGCTCAAGTTTATATTCTTACTAAAGAAGAAGGTGGCCGACACTCAGCATTTTTAGTAGGGTATCAACCACAATTTTATGTTCGTACAACAGATGTAACTGGTAAAGTAGAAGGGTTTAGTCA Bracteacoccus_sp. TTAAATAAAGAAGATCAGGTAGACGACGCAGAACTTTTAGAATTAGTAGAACTTGAAGTTCGCGAAACTTTAGATAAATATGAATTCCCAGGGGATGAAATTCCGATCATCAGCGGTTCTGCTTTATTAGCTCTAGAAGCATTAGTAGAAAATCCTCAAATCAAACGCGGAGAAAATAAATGGGTAGATAAAATTTATAACCTAATGGATCAAGTAGACCAATATATTCCAACTCCAGAGAGACAAACGGATAAACCTTTCTTATTAGCAGTAGAAGACGTATTATCAATCACCGGGCGTGGTACTGTTGCTACAGGTCGTGTAGAAAGAGGAACACTTAAAGTAGGCGAAAACGTTGAACTTGTTGGTTTAAAAGATACGAAATCAACAGTTGTAACTGGGCTTGAAATGTTTAAAAAAACATTAGACGAAACGATGGCGGGTGATAATGTTGGTGTTTTACTTCGCGGTATTCAAAAAAAAGAAATTGAGCGCGGTATGGTTTTAGCTAAACCTGGTACGATTACTCCACACACTAAATTTGAAGCTCAAGTTTATGTGTTAACAAAAGAAGAGGGTGGTCGTCACTCTCCTTTCTTAGTTGGTTACCAACCTCAATTTTTCATGCGTACTACAGACGCAACTGGTCGCGTGACTGATTTTTCTCA Bracteacoccus_sp._Copy TTAAATAAAGAAGATCAAGTAGATGACGCAGAACTTTTAGAACTAGTTGAACTTGAAGTTCGTGAAACTTTAGATAAATATGAATTTCCTGGAGACGAAATTCCTATCATCAGTGGCTCTGCTTTATTAGCTTTAGAGGCACTAGTAGAAAATCCTCAAATGAAACGCGGGGATAACAAATGGGTAGACAAAATTTTTAACCTAATGGATCAAGTAGATGAATATATTCCAACTCCGGAAAGACAAACTGATAAACCTTTCTTATTAGCAGTCGAAGACGTATTATCTATTACTGGACGTGGTACTGTTGCTACAGGTCGTGTAGAAAGAGGAACGCTTAAAGTAGGAGAAAACGTCGAACTTGTTGGTTTAAAAGATACAAAATCGACAGTTGTGACTGGACTTGAAATGTTTAAAAAAACTTTAGATGAAACAATGGCCGGTGATAATGTTGGTGTTTTACTTCGTGGTGTTCAAAAAAAAGATATTGAACGCGGTATGGTTTTAGCTAAACCTGGTACGATCACACCACATACTAAATTCGAAGCTCAAGTTTATGTACTGACAAAAGAAGAGGGTGGTCGTCACTCTCCTTTTTTAATTGGCTATCAACCTCAATTTTTCATGCGTACGACAGACTCGACTGGTCGTGTGACTGATTTTTCTCA Bracteacoccus_sp._Copy1 TTAAACAAAGAAGACCAAGTGGATGATGCAGAATTATTAGAACTGGTAGAATTAGAAGTTCGTGAAACTTTAGATAAATATGAATTCCCAGGAGATGATATTCCAATTGTAACTGGTTCAGCATTATTAGCTTTAGAAGCTTTAGTTGAAAATCCTCAAATTAAACGTGGGGATAATCCATGGGTTGATAAAATTTATAAACTAATGGATGAAGTCGATTCATATATTCCAACTCCAGAACGACAAACAGACAAACCGTTCTTATTAGCAGTTGAGGATGTATTATCTATTACAGGTCGTGGTACTGTTGCTACTGGTCGTGTAGAAAGAGGAACATTAAAAGTTGGAGATACTATTGAAATCATTGGATTTAAAGATACAAAATCGACTGTAGTAACAGGTCTTGAAATGTTTAAAAAAACATTAGATGAAACTGTAGCAGGAGATAACGTAGGTATTTTACTTCGTAGTGTTCAAAAAAAAGACATTGAACGTGGTATGGTATTAGCTAAACCTGGAAGTTTAAAACCTTGGTCTAAATTTGAAGCGCAAGTCTATGTATTAACGAAAGAAGAAGGAGGACGTCACTCTCCGTTTTTAATCGGGTATCAACCACAATTTTATGCGCGTACTACAGATATTACAGGTAAAGTAATAGGTTTCAACCA Bracteamorpha_sp. TTAAATAAAGAAGACCAGGTGGATGATGCAGAGCTGCTTGAATTAGTAGAGCTAGAAGTTCGTGAAACTTTAGACAAGTACGAATTCCCTGGCGATGAGATCCCTATTGTTACGGGTTCAGCGCTACTTGCTTTAGAAGCATTAGTAGAAAGTCCAACATTAAAACGCGGACAAAACGAGTGGGTAGACAAGATCCACAAGCTTATGGACCAAGTGGATGAATACATCCCAACGCCAGAAAGACAGACTGATAAACCTTTCCTTCTTGCTGTAGAAGATGTGCTTTCAATCACAGGCCGTGGGACAGTAGCTACTGGTCGTGTAGAAAGAGGAACATTACGTGTTGGTGAAAACATTGAAATCGTAGGTCTTCGCGATACGAAATCAACGGTTGTAACAGGTCTTGAGATGTTTAAAAAAACTCTGGATGAGACTGTAGCTGGAGACAACGTAGGTGTATTACTTCGTGGTGTTCAAAAAAAAGACATTGACCGTGGGATGGTTTTAGCAAAACCAGGATCAATCACACCTCATACAAAGTTCGAGGGTCAAGTTTATGTTCTGACTAAAGAAGAGGGCGGTCGTCACTCTCCGTTCCTTATCGGTTACCAACCGCAATTCTTCGTTCGCACAACGGACGTAACTGGTAAAGTGGTTGGGTTTAACCA Chlorosarcinopsis_sp. TTAAACAAAGAAGACCAAGTAGACGACAAAGAATTATTAGAATTAGTAGAATTAGAAGTTCGTGAAACTTTAGATAAATATGAATTCCCGGGAGATGAAATTCCAATCGTTCCTGGTTCAGCATTATTAGCTTTAGAAGCTTTAGTTGAAAACCCTAAAACTCAACGTGGTGAAAACCCATGGGTAGACAAAATCCATGAATTAATGGATAAAGTAGATAGTTACATTCCAACTCCTCAACGTGAAACAGACAAACCATTCTTATTAGCTGTTGAAGACGTATTATCTATTACTGGTCGTGGTACAGTAGCAACAGGACGTGTTGAACGTGGTACTTTAAAAGTAGGTGAAAACGTTGAAGTTGTAGGTTTAAAAGATACTAAAACTTCAGTTGTTACTGGTTTAGAAATGTTCAAGAAAACATTAGATGAAACTATGGCTGGTGACAACGTTGGTGTTTTATTACGTGGTGTTCAAAAGAAAGAAATTGAACGTGGTATGGTATTAGCTAAACCAGGATCAATTGCACCTCACAATAAATTTGAAGCACAAGTTTATATTTTAACTAAAGAAGAAGGTGGCCGTCACTCTGCTTTCTTAGTTGGTTACCAACCTCAATTCTATGTACGTACAACAGACGTAACTGGAAAAGTAACTTCATTCACTCA Dictyochloris_sp. TTAAATAAAGAAGACCAAGTTGATGATAAAGAACTTTTAGAACTAGTAGAATTAGAAGTTCGTGAAACTTTAGATAAATATGAATATCCTGGAGATGATATTCCTGTTGTTTCAGGATCTGCTTTATTAGCTTTAGAAGCTTTATTAGAAAATCCTAAAATTCAACGTGGTGAAAACAAATGGGTTGATAAAATTTATGATTTAATGGATAAAGTAGATAGTTATATTCCTACTCCAGAAAGAGAAACTGACAAACCGTTCTTATTAGCTGTTGAAGACGTTCTTTCTATCACTGGACGTGGTACTGTAGCTACTGGTCGAGTTGAAAGAGGTACATTAAAAATTGGTGAAAACATTGAAATTGTTGGTCTTAAAGACACAAAAACAACAGTTGTTACTGGATTAGAAATGTTTAAAAAAACTTTAGAAGAAACATTAGCAGGAGATAACGTAGGTGTTTTACTTCGTGGTGTTCAAAAAAAAGATATTGAACGTGGTATGGTATTAG{CT}TAAACCAGGAACTATTAAGCCACACA{AC}TAAATTTGAAG{CG}TCAAGTTTATGTTTTAACTAAAGAAGAAGGTGGACGACACTCTGCTTT{CT}TTAATTGGTTATCAACCACAATTTTTTATGCGTACTACAGATTGTACTGGAAAAGTAACTTCATTTTCTCA Dictyococcus_sp. TTAAATAAAGAAGACCAAGTAGATGATGCTGAACTTTTAGAACTTGTTGAATTAGAAGTTCGTGAAACTTTAGACAAATATGAATTCCCAGGAGATGATATTCCTGTCGTAACTGGTTCGGCTTTATTAGCTTTAGAAGCTTTAACAAAAAACCCAAATTTAAAACGTGGTGACGATAAATGGGTTGATAAAATTTACACCTTAATGGAACAAGTAGATTCTTACATTCCGACTCCAGAACGTCAAACAGATAAACCATTCCTATTAGCAATTGAAGATGTTTTATCAATTACAGGTCGTGGAACAGTTGCAACAGGACGTGTAGAACGTGGAACGCTTAAAGTTGGTGAAAATGCTGAATTAGTAGGATTAAAAGACACAAAAAGTTTCGTAGTTACTGGATTAGAAATGTTTAAAAAAACATTAGACGAAACTATGGCAGGAGACAATGTTGGTGTTTTATTACGTGGAGCACAAAAAAAAGATGTGGAACGCGGAATGGTTTTAGCTAAACCAGGTTCAATTACTCCACATACAAAATTTTCGGCTCAGGTGTACATCTTAACTAAAGAAGAAGGTGGGCGTCACTCGGCGTTTCTAGTTGGTTACCAACCGCAATTTTTCATGAGAACGACTGATTGTACTGGTCGAGTTGTTTCGTTTAACCA Dictyococcus_sp._Copy TTAAATAAAGAAGACCAAGTAGACGACGCAGAACTATTAGAATTAGTTGAACTAGAAGTTCGTGAAACTTTAGATAAATATGAATTCCCTGGAGATGAAATTCCTGTTGTTACAGGTTCTGCACTTTTAGCTTTAGAAGCTTTAGTAGAAAACCCTACTGTAAAACGTGGAGAAAACAAATGGGTTGACAAAATTTATGATTTAATGGAGCAAGTTGACAAATATATTCCAACTCCAGCACGAGAAACAGATAAGCCTTTCTTATTAGCTGTTGAAGACGTATTATCGATCACAGGTCGTGGTACCGTTGCTACGGGCCGTGTAGAAAGAGGAACTTTAAAAGTTGGAGAAAACGTTGAAATCGTAGGGTTAAAAAATACTAAATCAGCAGTTGTTACAGGACTTGAAATGTTTAAAAAAACATTAGAAGAAACAATGGCTGGAGACAACGTAGGTGTTCTTTTACGTGGAGTTCAAAAAAAAGATATTGAACGTGGTATGGTTTTAGCTAAACCAGGAACAATTACACCACACACTAAATTTGAAGCTCAAGTTTATGTTCTTACAAAAGAAGAAGGTGGTCGCCATTCCGCTTTCTTAGTAGGTTATCAACCACAATTTTATTTAAGAACAACAGACGTAACTGGGAAAATCGCAGGATTTAACCA Follicularia_sp. 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TTAAACAAAGAAGACCAAGTAGATGACGCTGAATTATTAGAACTAGTAGAATTAGAAGTTCGTGAAACATTAGACAAATACGAATTCCCAGGAGATGATATCCCAATCGTAAAAGGTTCAGCACTATTAGCTGTAGAAGCTTTAGCAGCCAACCCTGCTACTAAAAAAGGTGAAAACGAATGGGTAGACAAAATCCACGAATTAATGGCACAAGTAGACTCTTACATTCCAACACCAGAACGTGAAACAAGTAAACCGTTCCTACTAGCTGTAGAAGACGTTTTATCAATCACAGGACGTGGAACAGTAGCTACTGGACGTGTAGAACGTGGTGAAGTAAAAGTTGGTGAAACACTAGAAATCGTAGGTTTAAAAGATACAAAACAAACAACTGTAACAGGTTTAGAAATGTTTAAAAAATCTTTAGAATCATCTGTAGCTGGTGACAACGTAGGTGTTCTACTACGTGGTGTACAAAAAAATGAAATTGAACGTGGGATGGTTTTAGCTAAACCAGGTTCAATCACACCACACACTTCATTCAAAGGACAAGTTTATGTTCTAACAAAAGAAGAAGGTGGGCGTCACTCTCCATTCCTAACTGGATACCAACCGCAATTCTTCGTACGTACAACAGACGTAACTGGTAAAATTGTAGACTTTACACA Neochloris_sp. TTAAATAAAGAAGATCAAGTAGATGATGCTGAATTATTAGAATTAGTAGAATTAGAAGTTCGTGAAACTTTAGACAAATATGAATTCCCTGGAGATGAAATTCCTGTTGTAACTGGTTCAGCTTTATTAGCATTAGAAGCTTTAGTAGAAAACCCTTCAATTAAGCGCGGAGAAAATGAATGGGTAGACAAAATTTTAAAATTAATGGATCAAGTAGATCAATATATTCCTACTCCTGAAAGACAAACTGATAAGCCTTTCCTTCTTGCAGTTGAAGATGTTTTATCAATTACAGGGCGTGGTACTGTTGCTACTGGACGTGTAGAAAGAGGAACTTTAAAAGTTGGTGAAAACGTTGAATTAGTTGGTTTAAAAGATACGAAATCAAGTGTTGTTACTGGATTAGAAATGTTTAAAAAAACATTAGATGAAACCATGGCTGGAGATAATGTTGGAGTATTATTACGCGGAATTCAAAAAAAAGAAATTGAACGTGGTATGGTTTTAGCAAAACCAGGTACTATTACACCTCATACAAAGTTTGAAGCACAAGTTTATGTTTTAACAAAAGAAGAAGGAGGAAGACATAGTCCATTTTTAGTAGGTTATCAACCTCAATTCTTTGTAAGAACTTGTGATATTACAGGAAAAGTTACGAATTTTAATCA Nephrocytium_sp. 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TTAAATAAAGAAGACCAAGTGGATGATCCAGAGTTACTAGAATTAGTAGAACTAGAAGTTCGTGAAACTTTAGACAAGTATGAATTTCCAGGTGATGAAATTCCAATTGTAACTGGTTCTGCTCTTTTAGCTTTAGAAGCATTAATGGAAAACCCTAATTTAAAACGTGGTGAAAATAAATGGGTAGATAAGATCCATGCTCTTATGGATCAAGTAGACCAATATATTCCAACACCAGAAAGACAAACAGATAAGCCATTCTTATTAGCTGTTGAAGATGTTTTATCAATTACAGGACGTGGTACTGTTGCAACAGGACGTGTTGAAAGAGGGACACTTAAAGTTGGTGAAAACATTGAAATTGTAGGTCTTAAAGATACAAAAACAAGTGTTGTAACTGGACTTGAAATGTTTAAAAAAACTCTAGAAGAAACAATGGCTGGTGATAATGTGGGAGTTTTACTTCGTGGTGTTCAAAAAAAAGATGTAGAACGTGGAATGGTTTTAGCAAAACCTGGAAGTATTACTCCACATACAAAATTTGAAGGTCAAGTTTATGTTTTAACAAAAGAAGAAGGAGGTCGTCACTCTCCATTTTTAGTAGGTTATCAACCTCAATTTTTCTTAAGAACAACAGATATTACAGGTAAAGTAGTAAGTTTTGATCA Podohedriella_sp. TTAAATAAAGAAGATCAGGTAGATGATGCGGAATTATTAGAATTAGTAGAATTAGAAGTTCGTGAAACATTAGATAAATATGAATTTCCTGGAGATGATATTCCAATCGTTACAGGTTCTGCCTTATTAGCTTTAGAAGCTTTAATTGAAAATCCTACGATTAAACGCGGAGATAACGAATGGGTTGATAAAATTTATCAATTAATGGATCAAGTCGATTCTTATATTCCAACTCCTGAACGTCAAACAGATAAACCGTTTTTATTAGCTGTTGAAGACGTTTTATCCATTACAGGTCGTGGAACTGTAGCTACAGGTCGTGTAGAACGTGGAACATTAAAAGTTGGTGAAAACGTGGAAATTGTAGGATTAAAAAATACAAAAAATACGGTTGTAACTGGTTTAGAAATGTTTAAAAAAACTTTAGATGAAACTATGGCGGGTGATAATGTAGGTGTTCTTTTACGTGGTGTTCAAAAAAAAGACATTGAACGTGGAATGGTTTTAGCAAAACCAGGAACAATTACTCCTCATACAAAATTTGAAGCTCAAGTTTATATTCTAACAAAAGAAGAAGGTGGACGCCATTCGGCTTTCTTAGTTGGATATCAACCTCAATTTTTCGCACGTACAACAGACGTGACTGGAAGAATTACATCTTTTAACCA Pseudomuriella_sp. 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TTAAATAAAGAAGACCAAGTGGACGACCCTGAATTATTAGAATTAGTTGAACTTGAAGTTCGTGAAACATTAGATAAATATGAATTTCCTGGAGATGAGATTCCAATCGTTACAGGCTCTGCTTTATTAGCATTGGAAGCACTTGTTGAAAATCCTCAAATTAAAAAAGGAGAAAATAAATGGGTTGACAAAATTTATGCTTTAATGGATCAAGTTGACCAATATATTCCAACTCCTGAAAGACAAACAGACAAACCATTCTTATTAGCTGTAGAAGACGTATTATCTATTACTGGTCGTGGTACAGTAGCTACAGGTAGAGTAGAAAGAGGAACTTTAAAAGTTGGTGTTGACGTTGAACTAATTGGTTTAA????????????????????????????????????????????????????????????CAATGGCTGGAGACAACGTAGGCGTTTTATTACGAGGTGTTCAAAAAAAAGACATTGAACGTGGGATGGTTTTAGCAAAACCAGGTTCAATTACACCTCATACAAAATTTGATGCTCAAGTTTATGTTTTAACAAAAGAAGAAGGCGGTCGTCACTCACCTTTCTTAGTAGGGTACCAGCCTCAATTCTATTTAAGAACAACGGATATTACAGGTAAAATTATTGGTTTCAACCA Rotundella_sp. TTAAACAAAGAAGATCAAGTAGATGACCCAGAATTATTAGAATTAGTAGAATTAGAAGTTCGTGAAACTTTGGATAAATATGAATTCCCTGGAGATGAAATTCCAATTGTTAGTGGATCTGCTTTATTAGCTTTAGAAGCATTAATGGAAAATCCAACAATTAAACGTGGGGATAACGAATGGGTTGACAAGATTTTAAAATTAATGGATCAAGTGGATAGTTATATTCCAACTCCAGATCGTGAAACAGATAAACCATTCTTATTAGCTATTGAAGACGTTTTATCGATTACAGGACGTGGTACAGTAGCAACCGGTCGTGTAGAACGTGGAACCTTAAAAGTTGGTGAAAACGTTGAATTGGTAGGATTAAAAGATACAAAAACGACTGTTGTAACTGGTTTAGAAATGTTTAAGAAAACATTAGATGAAACAATGGCTGGTGATAACGTTGGTGTATTATTACGTGGTGTTCAAAAAAAAGATATTGAACGTGGAATGGTTTTAGCTAAACCAGGTACAATTCTTCCTCATACAAAATTTGAAGCTCAAGTTTATATCTTAACAAAAGAAGAAGGTGGACGTCATTCACCATTCTTAATTGGTTATCAACCACAGTTTTATGTACGAACTACAGACGTTACAGGAAAAATTGTTTCTTTTACTCA Rotundella_sp._Copy TTAAACAAAGAAGATCAAGTAGATGATCCAGAATTATTAGAATTAGTCGAATTAGAAGTTCGTGAAACTTTAGATAAATATGAATTCCCAGGAGATGAAATTCCAATTGTTAGTGGATCTGCTTTATTAGCTTTAGAAGCATTAATGGAAAATCCAACGATTAAACGTGGGGACAACGAATGGGTTGACAAGATTTTAAAACTAATGGATCAAGTGGATAGTTATATTCCAACTCCAGATCGTGAAACAGATAAACCATTCTTATTAGCTATTGAAGACGTTTTATCGATTACAGGACGTGGTACAGTAGCAACCGGTCGTGTAGAACGTGGAACATTAAAAGTTGGTGAAAACGTTGAATTAGTAGGATTAAAAGATACAAAAACAACGGTTGTAACTGGTTTAGAAATGTTTAAGAAAACATTAGATGAAACAATGGCTGGGGATAACGTTGGTGTATTATTACGTGGTGTTCAAAAAAAAGATATTGAACGTGGAATGGTTCTAGCTAAACCAGGTACAATTCTTCCTCATACAAAATTTGAAGCTCAAGTTTATATCTTAACAAAAGAAGAAGGTGGACGTCATTCACCATTTTTAATTGGTTATCAACCACAGTTTTATGTACGAACTACAGACGTTACAGGAAAAATTGTTTCTTTTACTCA Scenedesmus_sp. 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TTAAACAAAGAAGATCAAGTAGATGATCCAGAATTATTAGAATTAGTTGAATTAGAAGTTCGTGAAACATTAGATAAATACGAATTCCCAGGGGATGACATTCCAGTTGTAACTGGTTCTGCTTTATTAGCTTTAGAAGCTTTAGTAGAAAATCCAAATTTAAAACGCGGTGAAAATCAATGGGTAGATAAAATTTATTCATTAATGGATCAAGTAGATAACTACATTCCTACACCAGAACGTCAAACAGATAAACCATTCTTATTAGCTGTAGAAGATGTATTATCAATTACAGGTCGTGGAACAGTTGCTACTGGACGTGTAGAAAGAGGAACTTTAAAAGTTGGTGAAAATATTGAGATTGTTGGTTTAAAAGATACAAAAACAACAGTTGTAACTGGTCTTGAAATGTTCAAGAAAACTTTAGATGAAACTCTTGCAGGTGATAACGTAGGAGTTTTATTACGTGGAGTTCAAAAAAAAGATATTCAACGTGGTATGGTTTTAGCAAAACCAGGGACAATTACCCCTCATACAAAATTTGACGCACAAGTTTATGTTTTAACAAAAGAAGAAGGTGGTCGTCACTCAGCATT{CT}TTAATTGGGTACCAGCCACAGTTTTTCTGTCGAACTACTGATGTAACTGGTAAAGTGATTGGATTCGATCA Sphaeroplea_sp. TTAAATAAAGAAGATCAAGTAGATGATACAGAACTTTTAGAATTAGTTGAGCTTGAAGTACGCGAGACTTTAGATAAATATGAATTTCCTGGTGATGAAATTCCGATTGTTACAGGATCAGCTTTATTAGCATTAGAAGCTTTAGTTGAAAATCCACAAATTAAACCTGGGGAAAATAAATGGGTAGACAAAATTTATGCCTTAATGGATAAAGTAGATAGTTATATTCCTACACCAGAACGTGAAACAGACAAGCCATTCTTATTAGCAGTAGAAGACGTCTTATCAATTACAGGTCGTGGTACTGTAGCAACAGGTCGTGTAGAAAGAGGTACTTTACGTGTTGGGGATAACCTTGAAATCGTAGGTCTTAAAGACACAAAAAACTGTATTGTAACAGGATTAGAAATGTTTAAGAAAACTTTAGATGAAACTATGGCTGGTGACAACGTTGGTGTATTATTACGTGGTGTTCAAAAGAAAGATATTGAACGTGGTATGGTTTTAGCAAAACCGGGTTCAATTTTACCACACACTAAATTTGAAGCTCAAGTTTATATTCTTACTAAAGAAGAAGGTGGTCGACATTCAGCATTTTTAGTAGGTTATCAACCACAATTTTATGTTCGCACAACAGATGTAACTGGTAAAGTAGAAGGTTTCAGCCA Tumidella_sp. TTAAATAAAGAAGACCAAGTAGATGACGCAGAATTACTAGAACTAGTAGAACTAGAAGTTCGTGAAACTCTAGATAAATATGAATTCCCAGGTGACGAAATTCCTATTGTAACTGGTTCAGCGTTACTTGCTTTAGAAGCATTAATCGAAAATCCAAATACTAAACGTGGTGAGAATAAATGGGTAGACAAGATTTTAGCTTTAATGGATCAAGTAGATCAATACATTCCTACTCCAGAAAGACAAACTGATAAGCCTTTCTTATTAGCAGTGGAAGACGTTCTTTCTATTACTGGTCGTGGTACAGTTGCTACAGGTCGTGTAGAAAGAGGAACTATTAAAGTTGGTGACACGGTTGAAATTGTAGGTCTTAAAGATACTAAAGCTTCAGTTGTAACTGGACTTGAAATGTTTAAAAAGACTTTATACGAGTCTATGGCTGGTGACAACGTA?GTGTTCTTCTTCGTGGTATTCAAAAGAAAGATATTGA?CGTGGAAT??????????????????????????????????????AATTTGACGCACAAGTATATGTTTTAACAAAAGAAGAAGGTGGACGTCACTCTCCATTCTTAGTGGGGTACCAACCGCAATTTTTCTGTAGAACATGTGATATTACTGGGAAAATTGTTGGTTTTAATCA ; END; [ The following blocks are output data for analysis step 25833 ] BEGIN TREES; TITLE Nephrocytium_tufA; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep25833; TREE PAUP_1 = [&R] ((Ankyra_sp.:0.057479,Sphaeroplea_sp.:0.042599):0.110691,((Dictyochloris_sp.:0.193562,Chlorosarcinopsis_sp.:0.121857):0.032641,(((Dictyococcus_sp.:0.333379,Schroederia_sp.:0.167031):0.072818,((Podohedriella_sp.:0.137208,(Rotundella_sp.:0.00861,Rotundella_sp._Copy:0.017923):0.106484):0.036717,((Neochloris_sp.:0.148206,Pediastrum_sp.:0.112429):0.103705,(Scenedesmus_sp.:0.034383,Scenedesmus_sp._Copy:0.096459):0.121646):0.023128):0.022793):0.002909,((((Bracteamorpha_sp.:0.304688,Mychonastes_sp.:0.327479):0.071872,(Pseudomuriella_sp.:0.064462,Dictyococcus_sp._Copy:0.027623):0.126298):0.041191,((Follicularia_sp.:0.188395,Radiococcus_sp.:0.163848):0.02429,(Tumidella_sp.:0.224905,(Planktosphaeria_sp.:0.130977,Schizochlamys_sp.:0.079795):0.074627):0.020748):0.050939):5.46407E-7,((Bracteacoccus_sp.:0.063219,Bracteacoccus_sp._Copy:0.075244):0.176344,(Bracteacoccus_sp._Copy1:0.215954,((Nephrocytium_sp.:0.019125,Nephrocytium_sp._Copy2:0.019947):0.050491,(Nephrocytium_sp._Copy4:0.012284,(Nephrocytium_sp._Copy3:0.014488,(Nephrocytium_sp._Copy5:0.0,(Nephrocytium_sp._Copy:0.0,Nephrocytium_sp._Copy1:0.0):0.0):0.016665):0.006561):0.029467):0.161244):0.075039):0.018843):0.029183):0.05752):0.110691); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr121422] END;