#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on July 12, 2025; 11:15 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Whittall J., Carlson M., Meinke R., & Liston A. 2005. The Mimulus moschatus Alliance (Phrymaceae): Molecular and Morphological Phylogenetics and their Conservation Implications. Systematic Botany, null. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1395] [ The following blocks are input data for analysis step 2622 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep2622; DIMENSIONS NTAX=23; TAXLABELS Mimulus_alsinoides Mimulus_ampliatus Mimulus_bicolor Mimulus_bodinieri Mimulus_breviflorus Mimulus_dentatus Mimulus_dudleyi Mimulus_floribundus_CO Mimulus_floribundus_OR Mimulus_guttatus_CA Mimulus_guttatus_OR Mimulus_hymenophyllus Mimulus_jungermannioides Mimulus_latidens Mimulus_lewisii Mimulus_moschatus Mimulus_nepalensis Mimulus_norrisii Mimulus_patulus Mimulus_primuloides Mimulus_pulsiferae Mimulus_tenellus Mimulus_washingtonensis ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M2732] TITLE mimulus_moschatus_molecular_matrix; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep2622; DIMENSIONS NCHAR=2947; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 2010 2020 2030 2040 2050 2060 2070 2080 2090 2100 2110 2120 2130 2140 2150 2160 2170 2180 2190 2200 2210 2220 2230 2240 2250 2260 2270 2280 2290 2300 2310 2320 2330 2340 2350 2360 2370 2380 2390 2400 2410 2420 2430 2440 2450 2460 2470 2480 2490 2500 2510 2520 2530 2540 2550 2560 2570 2580 2590 2600 2610 2620 2630 2640 2650 2660 2670 2680 2690 2700 2710 2720 2730 2740 2750 2760 2770 2780 2790 2800 2810 2820 2830 2840 2850 2860 2870 2880 2890 2900 2910 2920 2930 2940 2950 2960 2970 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Mimulus_alsinoides ??CGGTGCGTACGGGCTTGTCGGATCCCTGCTCGGGCAGCGACGGCAACTTGTGCGCGCCTCTTCAATGGTCGGTTCAAGTGTGCTCCTTACCTTGATCGGTGTGGGTTTCCTGTGTTGCATACCTATCTTGGAGGTATTATGTCGGTTGAAAGTGCCCCTTTCCGTCTTGCGCTGCATCCCTTTCAGGGCTGCGGCGTGGGATGGACCATGAAG?ATTCGT?CGTGTTCCACATCCCGGACG????TAATTGTCACTGGGTTGTTGGCGCACGGCGGCATGCTCGATCTCTCGGATGCGGAAAATTGAGTGGGTACGAGGCGTTTGCCCTCT?ATTTACCCC???AAAAAT??GGCGTTTCACGCTCCAAGCGGACGACGTCCGTCGCCGTTTTGATCGAGTCCT?TGTGGCTTGCATCATGCGG?CGTCG?TGTCGGTAAGGAACGAAACCTGCAAAGCAGACCGCGAATTCGTGTTTAAATA?CTCTGGGGAGG?TGGCG????CGGG?????????????????????????????TCTCCCCGTCGATGCGCACGAAAGTGCGTCTCGTGCGGACT?AACGTACCCCGGCGCGGAATGCGCCAAGGAAAACTCAA?CGAAGCGTCAGCCCTCCC?GTTGCCTCGTTCGCGACGTGCGCGGGGGTGCGAG?ACGTGTCTTGAATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATTGCGTCGCCCCC??TTCTCGCTCCATTGGTGCGGGAT?TGGGTG?CGGATATTGGTCTCCCGTGCGCTC?GCGCGCGCGGCTGGCCCAAATGAGATCCCTCGGCGATGCATGTCACGAGCAGTGGTGGTTGAATTCTCGACTCGCTTGCTGTAATGCTTGATGGCATCGTCCGCTCGGGCATCGCCAACGACCCAACGGCGCCACTT??GGTGCCTTCGATT??????????????????TAT?GGAAACCTACTAAGTGATAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAAGAAAAACGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTCTTTTTTCAAAAGAAAGGTTTAGAAAACGAAAAAAAAC???GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAATGGAGTTGACTGCGTTGCTAAAGGAATCTTTCCATCGAAACTTCAGAAAGGATGAAGGATAAACGTATCTATTGTATATCAAATGATTACTGATAGCCTGAA???????TCTGTATCTGTATTTTTT??????AAGATGAAAAATGAAAGAATTGGTGTGAATTGATTCCACATTGAAAAAAGAATCAAATATTCATTCATCAAATCATTCATT?CACTCCACAGTCCGATAGATCTTTTAAAAAACTAATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCGTTCTACATGTCAATACCGGCAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTTAAAATCGTGGGG?TTCAAGTCCCT?TATCCCCAAAAAAAGTCTAT?TTGACTCCAAAAATATTTATCCTAT?CCCCT??????TTTTTCATTAGCGGTGCCAAATTTACTTTATCTTTCTGATTCTTCGATAAACGTATTTGGGCGTAAATGACTATCTCTTATCACATGTGATATAGAATACACTTCCAAATT?????????AAGCAAAGAATTCCTAT??????TTGAATGATGCAAAATAAATAGCATTACTCTATTCATACTGAAACTTAGAAAGTCGTCTTTTTGAAGATCCAAGAAATTACAGGACTTGGAGAAAACTTTAGAATCCCCCC???TTATCCCTTTAATTGACATAGACCCCAGTCCTCTAATAAAATGAGGATAGGGATGCTACATTGCGAATGTAGGGT?AGGATTCAAAAAAGACCAACCCGGTAGTATCAAAACCAACTCATCACTTCGTATTATCTGGATCTAAAGAACCAGTCGAGATATGCTAAATTAG?TCATATCTTTGTAGCAACTGAAATTTTTTTT?CAATAAACTTGAATTCTAAGTTTAAAGTTAAAAAAAAAATAT?CAGAAGAAAAGTGTGGATAAATGGAAGGATGAGAGAAAGAGAGAAAAAGAATATCAATGATATAAAATTCCAATATGTAAGGTCTATGAGTCATCTCATAAAAGACAGTGTAATAAAGCATCTATACT???AA?TAGATTCATCCATAATTGAAA?TATTCAATGAATCCTTCTT??????????ACTTATAAAAGAAGAAAATCAAGAGCTTCGAGCCAATAAAGACTAAGAAA?GTTGACTCAAGAATAAATTGATTATAAGCTCCGTTGTAGAATTCTGACCTAACCATAAAATACGAAGCGGTGGGAACGATGAAACCTGTGAATGCAAAAGATTTTATT?GAACAAATGAATCTTACTAATTCACTAGTTGGGATGGCGAAATGAACCGGAAATCAACTCCTCTATCCTGAGAAGTCACGAAGAAGCGCTACGACTGAAATAGAGATTG?CAAGAGTAAA?TATTCGCCTGCGAAAACTTTCTTTTTTT????ATTGGTAAACTTGGAAAAAGGACAAAAGAAAATAAA???GATTGATTAGAATAACTATTCTATTATTTATAAAATATTTA?????TAAAATTTTTT?AGAAAAATCTTCTAATATCTATTCAAATTAATT??????????GAAATTCCATTTTGAAGCC???????????TTTTATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAATTCTCACGTCCAGTTTTGTAGTAGAGATGGAATTCCGAAAGAACCATCAACTATAACCCC Mimulus_ampliatus CTTG?TG?GTACGGGCTTGTCGGATCCCTGCTCGGGCAGCGACGGCAACTCGTGCTCGCCTCTTCAATCGTCGGTTCAAGCGTG???????CCTTGATCGATGTCGGTTTCCTGTGTTGCATACCTATTGTGGAGGTATCCCGCCGGTTAAAAGTGCCCCGTTCCGTCTTGCGTTGCGTCCTTTTCAAGGCTGCGGCGTGGGATGGACCATGAAG?ATTCGT?CGTGTTCCACATCCCTGACG????TAACTGTCCTCGGGTTGTTGGCCCACGGCGGCATGCTCGATCTTTCGGATGCGGAAAATTGAGTGGGTACGAGGCGTTTGCTCTCT?ATTTGCCCCAAAACAA????GGCGTTTCACGCTCTATGCGAACGACAACCGTCGCCGTTGTGATCGAGTCCT?CGCGGCTCGCATCACGCGGTGCCGGGTGTC?GTAAGGAACGAAACCTGCAAAGCAGACCGCGAATTCGTGACTAAATA?CTCTGGGGAAG?CGGCG????CGGG?????????????????????????????TCTACCCGCCGATGCGCACGAAACTGCGCACCGTGCGGACT?AACGTACCCCGGCGCGGAATGCGCCAAGGAAAACTCAA?CGAAGCG?TCCGCCCCCC?GTCGCCTCGTTCGCGACGTGCGCGGGGGTGCCGG?GCGTGTCTTGAATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATTGCGTCGCCCCC??TTCCCGCTCCATCGGGGCGGGAT?CGGGCG?CGGACATTGGTCTCCCGTGCGCTC?GCGCGCGCGGCTGGCCCAAATGAGATCCCTCGGCGATGCATGTCACGAGCAGTGGTGGTTGAATTCTCGACTCGCTTGCTGCAGTGCTTGACGGCATCGTCCGCTCGGGCATCACCAACGACCCAACGGCGCCCCTC??GGCGCCTTCGATT???TGAATTG??CCTTGGTAT?GGAAACCTACTAAGTGATAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAAGAAAAACGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTCTTTTTTCAAAAGAAAGGTTTAGAAAACGAAAAAAAAAA??GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGATGTTCTAACAAACGGAGTTGATTGCGTTGGTAGAGGAATCTTTCCATCGAAACTTCAGAAAGGATGAAGGATAAACGTATCTATTGTATA?CAAATGATTAATGATATCCTGAT??????ATCTGTATCTGTATTTTTTAATTTTAAGATGAAAAATGAAAGAATTGGTGTGAATTGATTCCACATTGAAGAAAGAATGAAATATTCATTCATCAAATAATTCACTCCATA?????GTCCAATAGATCTTTTAAAGAACTGCTTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCGTTCTACATGTCAATACCGGCAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCAAAAAAAGCCTAT?TTGACTCCAAAAATATTTATACTAT?CCCCTCCCCT?TTTTTCGTTAGCGGTTCCAAAGT?CCTTTATCTTTCTGATTCTTCGATAAACGTATTGGGGTGTAAATGACTATCTCTTATCACATGTGATATAGAATACACATCCAAATT?????????AAGCAAAGAATTCTTATTTTAATTTGAATGATTCAAAATCAGTAGCATTACTCTATTCATATTGAAACTTAGAAAGTCGTCTTTTTGAAGATCCAAGAAATTACAGGACTTGTAGAAAACTTTGTAATCCCCC????TTATCCCTTTAATTGACATAGACCCCAGTGCTCTAATAAAATGAGGATAGGGATGCTACATTGAGAATGTAGGGTTAGGATTCAAAAAAGACCAATCCCATAGTATCAAAACCAACTCATCACTTCGTATTATCTGAATCTAAAAAAACAGTCGAGATATGCTAAATTAG?TCATATCTTTGTAGCAACTGAAA??TTTTTTTCACTAAACTTTAATTCTAGGTTTAAAGCAAAA?????????TATAGAAGAAAAGTGTGGATAAATGGAAAGATGAGAGAAAGAGAGAAAAATAATATCAATGATATAAAATTCCAATATGTAAGGTCTACGAATCATCTCATAAAAGACAATGTAATAAAGCATCAATACT???AAGTCGATTCATCCATAATTGAAAATATTCAATGAATCCTTCTTGTTT?????ATCGAATAGAAGAAGAAAATCAAGAGCTTCGAGCCAATAAAGACTAAGAAAA?TTGACTCAAGAATAAATTGATTATAAGCTCCGTTGTAGAATTCTGACCTAACCATTAAATACGAAGCGGTGGGAACGATGAAACCTGTGAATGCAAAAGATTTTTTT?GAACAAATGAATCTTGTTGATTCACTAGTCGGGATGGCGAAATGAACCGGAAATCAATTCCTCTATTCTAAGAAGTCAGGAAGAAGCGCTACGACTGAAATAGAGATTG?CAAGAGTAAA?TATTCGCCTGCGAAAACTTTCTTTTTTT????ATTGGTAAACTTGTAGAAAGGACAAAAGAAAAAAAAA??GATTTATTAGAATAACTATT?ATTTA????????????????????TAAAATTTTTT?AGAAAACTGTTTTAATATCTATTCAAATTAATTT??????????AAATTCCATTTTGAATCC???????????TTTTATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCACGTCCAGTTTTGTAGTAGAGATGGAATTCCGAAACAACCATCAACTATAACCCC Mimulus_bicolor CTTGGTGCGTATGGGCATGTCGGATCCCTGCTCGGGCAGCGACGGCATCTCATTCGCTCCTTTTCAATTTTCGGTTCAAGCGTGCTTCTTACCTTGATCGAAGTCGGTTTCCTGTGTTGCATACCAATCGTGGCGGTATTTGATCGGCTAAAA?TG?ACTGTTTCGTCCCGCGTTCCG?CCTTTCCAAGG?TGCGGCGTGGGATGGACTAAGAAG?ATTCGCTTGTGCTCCACATCCCAGACA???GTAA?TGTGCTTGGGTTGTTGGCGCATGGCGGCATGCTCGTACTTTCGGATGCGGAAAATTGAGCGGGTACGAGGCATTTGTCCTCT?ATCTACCCC?AAAGAAA???TGCGTTTCACGCTTTCAGCGAA?GACGGCCGGACCCG?TTTGAT?GA?TCCT?CGTGGT?CGCGTCAT???GAGTC????????????????CGAAGCATGCAAAGCAGACCGCGAATCCGTGTTTAAAAA?CTCT??GGGA??CGG?TGCGTCGGGGC???AGAG?CCCATGCGCCGCCGTCCC?TCC?CCCGCCAATGCGCACGAAAATGCGTGTTGTGCGGGCTAAACGTACCCCGGCGCGGAACGCGCCAAGGAAAACTCAA?CGAAGCG?TCTGCCCCC?TGTTGCCTCGTTCGCGA?GTGCGCGGGGGCGCCGG?ACGTGTCTTGAATGTCTAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCATTAGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATTGCGTCGCCCCC??TTCTCCCTCGCTTGGGGCCGGAT?GGGGTG?CGGATATTGGTCTCCCGTGCGCTCTGCGTGTGCGGCTGGCCCAAATGAGATCCCTCGGCGACGCATGTCACGAGCAGTGGTGGTGGAATTCTCGACTCCCTTGCT????????CGATGGCGTCGTCCGCTCGGGCATCACGAATGACCCAACGGTGCTACAC??GGCACCTTCGATTAATTGGATTGAGCCTTGGTAT?GGAAACCTACTAAGTGATAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAAGAAAAACGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTCGTTTTTCTTAAGA?????TTAGAAAACGAAAAAAAA????GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTATTCTAACAAATGGAGTTGACTGCGTTGGTAGAGGAATCTTTCCATCGAAACTTCAGAAAAGATGAAGGATAAACGTATCATTTGTATATCAAATGATTAATGATAGCCTGAA???????TCTGTATCTGTATTTTTT??????AAGATGAAAAATGAAAGAATTGGTGTGAATTGATTCCACATTGAAGAAAGAATCAAATATTCATTCATCAAATCATTTACTCCATA?????GTCCGATAGATCTTTTAAAGAACTGATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCGTTCTACATGTCAATACCGGCAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTTAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCAAAAAAAGCCTAT?TTGACTCCAAAAATATTTATCCTAT?CCCCC??????TTTTTCGTTAGTGGTTTCAAATT?CCTTTATCTTTCTGATTATTCGATAAATGTATTTGGGCGTAAATGACTATCTCTTATCACATGTGATATAGAATACACATCCAAATTAAGCAAATTAAGTAAAGAATTCCTAG??????TTGAATGATTCAAAATAAATAGCATTACTCTACTCATACTGAAACTTAGTATGTTGTCTTTTTGAAGATCCAAGAAATTAGAGGACTTGGAGAAAA????GTAATCCCTCC???TTATCCCTTTAATTGACATAGACCCCAGTCCTCTAATAAAATGAGGATAGGGATTCTACATTGAGAATGTAGAGTTAGGATTCAAAAAAAACTAACCCGGTAGTATAAAAAACAACTCATCACTTCTTATTATCTGGATATAAGGAACCAGTCGAGATAGGCTAATATAGGTCATATCTTTGTAGCAACTGAAATTTTTTTTTCAATAAACTTTAATTCTAAGTTTAAAGAAAAA??????????{AC}CAGAAGAAAAGTGTGGATAAATGGAAGGATGAGAGAAAGAGAGAAAAAGAATATCAATGATATAAAATTCCAATATGTAAGGTCTAGGAGTCATCTCATAAAAGACAGTGTAATAAAGCATCAATATT???AA?TTAATTCATCTGAAATTGAAA?TATTCAATGAATCCTTCTT?????????AACTTATAGAATAAAAAAATCAAGAGCTTCGAGCCAATAAAGACTAAGAAA?GTTGACTCAAGAATAAATTGATTATAAGCTCCATTGTAGAATTCTGACCTAACCATTAAATACGAAGCGGTGGGAACGATGAAACCTGTGAATGCAAAAGATTTATTTT??CCAAATGAATCTTACTGATTCACTAGTCGGGATGGCGAACTGAACCGGAAATAAATTCCTCTATTCTGAGAAGTCACGAAGAAGCGTTATGACTGAAATAGAGATTG?CAAGAGTAAA?TATTCGCCTGCGAAAACTTTCTTTTTTT????ATTGGTAAACTTGGAAAAAGGACAAAAGAAACTAAA???GATTTATTAGAATAACTAGCCTATTGTTTATAAAA???????????TAAAATTTTTT?AGAAAAAGGGTTTAATATCTATTCAAATTAAT??????????GGAAATTCCATTTTGAATCC???????????TTTTATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCACGTCCAGTTTTGTAGTAGAGATGGAATTCCGAAACAACCATCAACTATAACCCC Mimulus_bodinieri ?????TGCGTA?CGGC?TTTCGGATCC?TGCTCGGGCAGCGACGGCAACTTGTGCGCGCCTTTTCAATCGTCGGTTCAAGTGTG???????CCTTGATCGATGTCGGTTTCCTGTGTTGCATACCTATTGTGGAGGTATTCTGCCGGTTAAAA?TGCCCCGTTTCGTCTTGCGTTGCATCCTTTTCAAGGCTGCGGCGTGGGATGGACCATGAAG?ATTCGT?CGTGTTCCACAT????????????????????????????????????????????????????????????????????????GA?TGGG?A{CG}GAGGCGTTTG{CT}{CT}{CT}T{CT}T?ATTT{AC}CCCC??AA{AG}AAAA??GGCGTTTCACGCTCTATGCGAACGACGACCGTCGCCGTTGTGAT?GAGTCCCTTG?CGCTTGCATCATGCGGTGCC?G?TGTC?GTAAG?AACGAAACCTGCAAAGCAGACCGCGAATTCGTGATTAAATA?CTTTGGGGAAG?CGGCG????CGGGTCC?GAAAG??CCCCGCGCCGCCGCCCC?TCC?CC?GCCGATGCGCAC?AAACTGCGTATCGTGCGGA?T?AACGTACCCCGGCGCGGAATGCGCCAAGGAAAACTCAA?CGAAGCG?TCCG?CCCCCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGCGT?GGGGTGCTGG?ACGTGTCTTGAATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATAT???????????????????????????????????????????TGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGA?TCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTA?GCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATTGCGTCGCCCCC??TTCTCGCTCCATCGGGGCGGGAT?CGGGCG?{CT}{GT}GATATTGGTCTCCCGTGCGCTC?GCGCGCGCGGCTGGCCCAAATGAGATCCCTCGGCGATGCATGTCACGAGCAGTGGTGGTTGAATTCTCGACTCGCTTGCTGTAGTGCTTGATGGCATCGTCCGCTCGGGCATCACCAACGACCCAA{AC}GG?GCCCCTT??GGCGCCTTCGATT???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Mimulus_breviflorus CTTGGTGCGTACGGGCTTGTCGGATCCCTGCTCGGGCAGCGACGGCAACTCGTGCTCGCCTCTTCAATCGTCGGTTCAAGCGTG???????CCTTGATCGATGTCGGTTTCCTGTGTTGCATACCTATTGTGGAGGTATCCTGCCGGTTAAAAGTGCCCCGCTCCGTCTTGCGTTGCGTCCTTT?CGAGGCCGCGGCGTGGGATGGACCATGAAG?ATTCGT?CGTGTTCCACATCCCAGACG????TAACTGTCCTCGGGTTGTTGGCCCACGGCGGCATGCTCGATCTCTCGGATGCGGAAAATTGTGTGGGTACGAGGCGTTTGCTCTCT?ATTTACCCC????GAAAAAAGGCGTTTCACGCTCTATGCGAACGACTACCGTCGCCGTTGTGATCGAGTCCT?TGCGGCTTGCATCATGCGGTGCCGG?TGTCGGTAA?GAA?GAAACCTGCAAAGCAGACCGCGAATTCGTGACTAAATA?CTCCGGGGGAG?CGGCG????CGG??????????????????????????????TCTCCCCGCCGGTGCGCACGAAACTGCGTACCGTGCGGACT?AACGTACCCCGGCGCGGAATGCGCCAAGGAAAACTCAA?CGAAGCG?TCCGCCCCCC?GTTGCCTCGTTCGCGACGTGCGCGGGGGTGCCTG?GCGTGTCTTGAATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATTGCGTCGCCCCC??CTCTCGCCCCATCGGGGCGGGAT?CGGGCG?CGGATAATGGTCTCCCGTGCGCTC?GCGCGCGCGGCTGGCCCAAATGAGATCCCTCGGCGATGCACGTCACGAGCAGTGGTGGTTGAATTCTCGACTCGCTTGCTGCAATGCTTGACGGCATCGTCCGC?CGGGCATCACCAACGACCCAACGGCGCCCCCC??GGCGC?TTCGATT?ATTGAATTG?GCCTTGGTAT?GGATTCCTACTAAGTGATAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAAGAAAAACGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTCTTTTTTCAAAAGAAAGGTTTAGAAAACGAAAAAAAAA???GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGATGTTCTAACAAATGGAGTTGATTGCGTTGGTAGAGGAATCTTTCCATCGAAACTTCAGAAAGGATGAAGGATAAACGTATCTATTGTATATCAAATGATTAATGATAGCCTGATCCTGATATCTGTATCTGTATTTTTTAATTTTAAGATGAAAAATGAAAGAATTGGTGTGAATTGATTTCACATTGAAGAAAGAATGAAATATTCATTCATCAAATCATTCACTCCATA?????GTCCAATAGATCTTTTAAAGAACTGCTTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCGTTCTACATGTCAATACCGGCAACAATGAAATTT?TAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTGTA?AAAT?GTGAGGGTTCAAGTCC?TGTATCCCCAAAAAA?GCCTAT?TTGACTCCAAAAATATTTATACTAT?CCCCTCCCCC?TTTTTCGTTAGCGGTTCCAAAGT?CCTTTATCTTTCTGATTCTTCGATAAACGTATTGGGGCGTAAATGACTATCTCTTATCACATGTGATATAGAATACACATCCAAATT?????????AAGCAAAGAATTCCTATTTTAATTTGAATGATTCAAAATCAATAGCATTACTCTATTCATATTGAAACTTAGAAAGTCGTCTTTTTGAAGATCCAAGAAATTACAGGACTTGTAGAAAACTTTGTAATCCCCCC???TTATCCCTTTAATTGACATAGACCCCAGTGCTCTAATAAAATGAGGATAGGGATGCTACATTGAGAATGTAGGGTTAGGATTCAAAAAAGACCAACCCCGTAGTATCAAAACCAACTCATCACTTCGTATTATCTGGATCTAAAAAAACAGTCGAGATATGCTAAATTAG?TCATATCTTTGGAGCAACTGAAC??TTTTTTTCACTAAACTTTAATTCTAGGTTTAAAGCAAAA?????????TACAGAAGAAAAGTGTGGATAAATGGAAAGATGAGAGAAAGAGAGAAAAATAATATCAATGATATAAAATTCCAATATGTAAGGTCTACGAATCATCTCATAAAAGACAATGTAATAAAGCATCAATACT???AAGTCGATTCATCCATAATTGAAAATATTGAATGAATCCTTCTTATTT?????ATAGAATAGAAGAATAAAATCAAGAGCTTCGAGCCAATAAAGACTAAGAAATGTTGACTCAAGAATAAATTGATTATAAGCTCCGTTGTAGAATTCTGACCTAACCATTAAATACGAGGCGGTGGGAACGATGAAACCTGTGAATGCAAAAGATTTTTTT?GAACAAATGAATCTTATTGATTCACTAGTCGGGATGGCGAAATGAACCGGAAATCAATTCCTCTATTCTGAGAAGTCAGGAAGAAGCGCTACGGCTGAAATAGAGATTG?CAAGAGTAAA?TATTCGCCTGCGAAAACTTTCTTTTTT?????ATTGGTAAAATTGTAGAAAGGAC{AC}AAAG{AG}AAAAAAAAAAGATTTATTAGAATAACTATT?ATTTC????????????????????TAAAATTTTTT?AGAAAACTGTTCTAATATGTATTCAAATTAATTT??????????AAATTCCATTTTGAATTC???????????TTTAATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCACGTCCAGTTTTGTAGTAGAGATGGAATTCCGAAACAACCATCAACTATAACCCC Mimulus_dentatus ??????GCGTACGGGCTTGTCGGATCCCTGCTCGGGCAGCGACGGCAGCTTGTGCGCGCCTTTTCAATCGTCGGTTCAAGTGCG???????CCTTGATCGATGTCGGTTTCCTGTGTTGCATACCTATCTTGGAGGTATTATGTCGGTTAAAAGTGCCC?GTTTCGTCTTGCGCTGCATCCTTTTCAAGGCTGCGGCGTGGGATGGACCATGAAG?ATCCGT?CGTGTTCCACATCCCAGACG????TAATTGTCCTCGGGTTGTTGGCGCACGGCGGCATGCTCGATCTCTCTGATGCGGAAAATTGAGTGGGTACGAGGCGTTTGTTCTCT?ATTTACCCC???AGAAAAA?GGCGTTTCACGCTCCAAGCGAACGACGGCCGTCGCCGTTGTGATCGAGTCTT?TGTGGCTTGCATCATGCGGTGTCGG?TGTC?GTAAGGAACGAAACCTGCAAAGCAGACCGCGAATTCGTGTTTAAATA?CT?TGGGGAAG?TGGC?????CGGG?????????????????????????????TCTCCCCGCCGATGCGCACGAAACTGCGCCTCGTGCGGACT?AACGTACCCCGGCGCGGAATGCGCCAAGGAAAACTCAA?CGAAGCG?TCCGCCCCCC?GTTGCCTCGTTCGCGACGTGCGCGGGGGTGCGAG?ACGTGTCTTGAATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATTGCGTCGCCCCC??TTCTCGCTCCATCGGGGCGGGAT?CGGGCG?CGGATA?TGGTCTCCCGTGCGCTC?GCGCGCGCGGCTGGCCCAAATGAGATCCCTCGGCGATGCATGTCACGAGCAGTGGTGGTTGAATTCTCGACTCGCTTGCTGTAATGCTTGATGGCATCGTCCGCTCGGGCATCACCAACGACCCAACGGCGCCACTT??GGCGCCTTCGATT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TAGGGTTAGGATTCAAAAAAGACCAACCTCGTAGTATCAAAACCAACTCATCACTTCGTATTATCTGGATCTAAAGAACCAGTCGAGATATGCTAAATTGG?TCATATCTTTGTAGCAACTGAAA??TTTTTTTCACTAAACTTTAATTCTAGGTTTAAAGCAAAA?????????TACAGAAGAAAAGTGTGGATAAATGGAAGGATGAGAGAAAGAGAGAAAAATAATATCTATGATATAAAATTCCAATATGTAAGGTCTACGAGTCATCTCATAAAAGACAGTGTAATAAAGCATTAATACT???AAGTTGATTCATCCATAATTGAAA?TATTCAATGAATCCTTCTTATTT?????ATAGAATAGAAGAAGAAAATCAAGAGCTTCGAGCCAATAAAGACTAAGAAA?GTTGACTCAAGAATAAATTGATTATAAGCTCCGTTGTAGAATTCTGACCTAACCATTAAATACGAAGCGGTGGGAACGATGAAACCTGTGAATGCAAAAGATTTTTTT?GAACAAATGAATCTTATTGATTCACTAGTCGGGATGGCGAAATGAACCGGAAATCAATTCCTCTATTCTGAGAAGTCAGGAAGAAGCGCTACGACTGAAATAGAGATTG?CAAGAGTAAA?TATTCGCCTGCGAAAACTTTCTTTTTTTT???ATTGGTAAACTTGGAGAAAGGACAAAAGAAAATAAA???GATTTATTAGAATAACTATT?AT??AT????????TATTTA?????TAAAATTTTTT?ATAAAACTGTTCTAATACCTATTCAAATTAATTT??????????AAATTCCATTTTGAATCCTTTTTGAATCCTTTTATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCATGTCCAGTTTTGTAGTAGAGATGGAATTCCGAAACAACCATCAACTATAACCCC Mimulus_dudleyi CTTGGTGCGTACGGGCTTGTCGGATCCCTGCTCGGGCAG{AC}GACGGCAGCTTGTGCGCGCCTTTTCAATCGTCGGTTCAAGTGTG???????CCTTGATCGATGTCGGTTTCCTGTGTTGCATACCTACTGTGGAGGTATCCTGCCGGTTAAAAGTGCCCCGTTCCGTCTTGCGTTGCGTCCTTTTCAAGGCCGCGGCGTGGGATGGACCACGAAG?ATTCGT?CGTGTTCCACATCCCAGACG????TAACCGTCCTCGGGTTGTTGGCCCACGGCGGCGTGCTCGATCTTTCGGATGCGGAAAATTGAGTGGGTACGAGGCGTTTGCCCTCT?ATTTACCCC??AAGAGAAA?GGCGTTTCACGCTCTATGCGAACGACGTCCGTCGCCGCCGTGATCGAGTCCT?TGCGGCTTGCATCATGCGGTGGCGG?TGTCGGTAAGGAACGAAACCTGCAAAGCAGACCGCGAATTCGTGATTAAATAGCTC?GGGGAAG?CGGC?????CGG??????????????????????????????TCTCCCCGCCGGTGCGCACGAAACTGCGCATCGTGCGGACT?AACGTACCCCGGCGCGGAACGCGCCAAGGAAAACTCAA?CGAAGCG?TCCGCCCACC?GTTGCCTCGTTCGCGACGTGCGCGGGGGTGCCGG?ACGTGTCTTGAAAGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATTGCGTCGCCCCC??TTCTCGCTCCACCGGGGCGGGAT?CGGGCG?CGGATATTGGTCTCCCGTGCGCTC?GCGCGCGCGGCTGGCCCAAATGAGATCCCTCGGCGATGCATGTCACGAGCAGTGGTGGCTGAATTCTCGACTCGCTCGCTGTAATGCTTGATGGCATCGTCCGCTCGGGCATCACCAACGACCCAACGGCGCCCCTC??GGCGCCTTCGATT???????????????????AT?GGAAA?CTACTAAGTGATAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAAGAAAAACGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTCTTTTTTCAAAAGAAAGGTTTAGAAAACGAAAAAAAAAAA?GGATAGGTGCAGAGAC?CAATGGAAGATGTTCTAACAAATGGATTTGATTGCGTTGGTAAAGGAATCTTTCCATCGAAACTTCA{AG}AAAGGATGAAGGATAAACGTATCTATTGTATATCAAATGATTAATGATAGCCTGAA??????ATCTGTATCTGTATTTTTTAATTTTAAGATGAAAAATGAAAGAATTGGTGTGAATTGATTCCACATTGAAGAAAGAATGAAATATTCATTCATCAAATCATTCACTCCATA?????GTCCAATAGATCTTTTAAAGAACTGCTTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCGTTCTACATGTCAATACCGGCAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCAAAAAA?GCCTAT?TTGACTCCAAAAATATTTATACTAT?CCGCTCCCCC?TTTTTCGTTAGCGGTTCCAAAGT?CCTTTATCTTTCTGATTCTTCGATAAACGTATTGGGGCGTAAATTACTATCTCTTATCACATGTGATATAGAATACACATCCAAATT?????????AAGCAATCAATTCCTATTTTAATTTGAATGATTCAAAATCAATAGCATTACTCTATTCATATTGAAACTTAGAAAGTCGTCTTTTTGAAGATCCAAGAAATTACAGGACTTGTAGAAAACTTTGTAATCCCCCC???TTATCCCTTTAATTGACATAGACCCCAGTGCTCTAATAAAATGAGGATAGGGATGGT?TC?TGAAAGCTTAGGGTTAGGATTCAAAAAAGACCAACCCCATAGTATCAAAACCAACTCATCACTTCGTATTATCTGGATCGAAAAAAACAGTCGAGATATGCTAAATTAG?TCATATCTTTGTAGCAACTGAAA??TTTTTTTAACTAAACTTTAATTCTAGGTTTAAAGCAAAA?????????TACAGAAGAAAAGTGTGGATAAATGGAAAGATGAGAGAAAGAGAGAAAAATAATATCAATGATATAAAATTCCAATATGTAAGGTCTACGAATCATCTCATAAAAGACAATGTAATAAAGCATCAATACT???AAGTCGATTCATCCATAATTGAAAATATTCAATGAATCCTTCTTATTT?????ATAGAATAGAAGAAGAAAATCAAGAGCTTCGAGCCAATAAAGACTAAGAAA?GTTGACTCAAGAATAAATTGATTATAAGCTCCGTTGTAGAATTCTGACCTAACCATTAAATACGAAGCGGTGGGAACGATGAAACCTGTGAATGCAAAAGATTTTTTTTGAACAAATGAATCTTATTGATTCACTAGTCGGGATGGCGAAATGAACCGGAAATCAATTCCTCTATTCTGAGAAGTAAGGAAGAAGCGCTACGACTGAAATAGAGATTG?CAAGAGTAAA?TATTCGCCTGCGAAAACTTTCTTTTTTT????ATTGGTAAACTTGTAGAAAGGACAAAAGAAAAAAAAA??GATTTATTAGAATAACTATT?ATTTA????????????????????TAAAATTTTTT?AGAAAACTGTTCTAATATCTATTCAAATTAATTT??????????AAATTCCATTTTGAATCC???????????TTTAATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCACGTCCAGTTTTGTAGTAGAGATGGAATTCCGAAACAACCATCAACTATAACCCC Mimulus_floribundus_CO C?TGGTGCGTACGGGCTTGTCGGATCCCTGCTCGGGCAGCGACGGCAACTTGTGCGCGCCTTTTCAATCGTCGGTTCAAGTGTG???????CCTTGATCGATGTCGGTTTCCTGTGTTGCATACCTACTGTGGAGGTATCCTGCCGGTTAAAAGTGCCCCGTTCCGTCTTGCGTTGCGTCCTTTTCAAGGCTGCGGCGTGGGATGGACCACGAAG?ATGCGT?CGTGTTCCACATCCCAGACG????TAACTGTCCTCGGGTTGTTGGCCCACGGTGGCGTGCTCGATCTTTCGGATGCGGAATATTGAGTGGGTACGAGGCGTTTGCCCTCT?ATTTACCCC??AAGAAAA??GGCGTTTCACGCTCTATGCGAACGACGACCGTCGCCGTCGTGATCGAGTCCC?TGCGGCTTGCATCACGCGGTGCCGG?TGTCGGTAAGGAACGAAACCTGCAGAGCAGACCGCGAATTCGTGATTAAACAGCTT?GGGG?AG?CGG?G????CGGGTCC??A??G????G?G?G??GCCGCCC??TCC?CC?GCCGATGCGCACGAAACTGCGCACCGTGCGGACT?AACGTACCCCGGCGCGGAACGCGCCAAGGAAAACTCAA?CGAAGCG?TCCGCCCCCC?GTTGCCTCGTTCGCGACGTGCGCGGGGGTGCCGG?ACGTGTCTTGAATTTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATTGCGTCGCCCCC??TTCTCGCTCCACCGGGGCGGGAT?CGGGCG?CGGATATTGGTCTCCCGTGCGCTC?GAGCGCGCGGCTGGCCCAAATGAGATCCCTCGGCGATGCATGTCACGAGCAGTGGTGGTTGAATTCTCGACTCGCTTGCTGTAATGCTTG?TGGCATCGTCCGCTCGGGCATCACCAACGACCCAACGGCGCCCCCC??GGCGCCTTCGATTAATTGAATTGACCCTTGGTTT?G?AAACCTACTAA?TGATAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAAGAAAAACGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTCTTTTTTCAAAAGAAAGGTTTAGAAAACGAAAAAAAAA???GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGATGTTCTAACAAATGGAGTTGATTGCGTTGGTAGAGGAATCTTTCCATCGAAACTTCAGAAAGGATGAAGGATAAACGTATCTATTGTATATCAAATGATTAATGATAGCCTGAT??????ATCTGTATCTGTATTTTTTAATTTTAAGATGAAAAATGAAAGAATTGGTGTGAATTGATTCCACATTGAAGAAAGAATGAAATATTCATTCATCAAATCATTCACTCCATA?????GTCCAATAGATCTTTTAAAGAACTGCTTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCGTTCTACATGTCAATACCGGCAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCAAAAAA?GCCTAT?TTGACTCCAAAAATATTTATACTAT?CCGCTCCCCC?TTTTTCGTTAGCGGTTCCAAAGT?CCTTTATCTTTCTGATTCTTCGATAAACGTATTGGGGCGTAAATGACTATCTCTTATCACATGTGATATAGAATACACATCCAAATT?????????AAGCAATCAATTCCTATTTTAATTTGAATGATTCAAAATCAATAGCATTACTCTATTCATATTGAAACTTAGAAAGTCGTCTTTTTGAAGATCCAAGAAATTACAGGACTTGTAGAAAACTTTGTAATCCCCCC???TTATCCCTTTAATTGACATAGACCCCAGTGCTCTAATAAAATGAGGATAGGGATGCTACATTGAGAATG???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Mimulus_floribundus_OR CTTGGTGCGTACGGGCTTGTCGGATCCCTGCTCGGGCAGCGACGGCAACTTGTGCGCGCCTTTTCAATCGTCGGTTCAAGTGTG???????CCTTGATCGATGTCGGTTTCCTGTGTTGCATACCTACTGTGGAGGTATCCTGCCGGTTAAAAGTGCCCCGTTCCGTCTTGCGTTGCGTCCTTTTCAAGGCTGCGGCGTGGGATGGACCACGAAG?ATGCGT?CGTGTTCCACATCCCAGACG????TAACTGTCCTCGGGTTGTTGGCCCACGGTGGCGTGCTCGATCTTTCGGATGCGGAATATTGAGTGGGTACGAGGCGTTTGCCCTCT?ATTTACCCC??AAGAAAA??GGCGTTTCACGCTCTATGCGAACGACGACCGTCGCCGTCGTGATCGAGTCCC?TGCGGCTTGCATCACGCGGTGCCGG?TGTCGGTAAGGAACGAAACCTGCAGAGCAGACCGCGAATTCGTGATTAAACAGCTT?GGGG?AG?CGG?G????CGGGTCC??A??G????G?G?G??GCCGCCC??TCC?CC?GCCGATGCGCACGAAACTGCGCACCGTGCGGACT?AACGTACCCCGGCGCGGAACGCGCCAAGGAAAACTCAA?CGAAGCG?TCCGCCCCCC?GTTGCCTCGTTCGCGACGTGCGCGGGGGTGCCGG?ACGTGTCTTGAATTTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATTGCGTCGCCCCC??TTCTCGCTCCACCGGGGCGGGAT?CGGGCG?CGGATATTGGTCTCCCGTGCGCTC?GAGCGCGCGGCTGGCCCAAATGAGATCCCTCGGCGATGCATGTCACGAGCAGTGGTGGTTGAATTCTCGACTCGCTTGCTGTAATGCTTG?TGGCATCGTCCGCTCGGGCATCACCAACGACCCAACGGCGCCCCCC??GGCGCCTTCGATTAATTGAATTGA?CCTTGGTATGGGAAACCTACTAAGTGATAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAAGAAAAACGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTCTTTTTTCAAAAGAAAGGTTTAGAAAACGAAAAAAAAA???GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGATGTTCTAACAAATGGAGTTGATTGCGTTGGTAGAGGAATCTTTCCATCGAAACTTCAGAAAGGATGAAGGATAAACGTATCTATTGTATATCAAATGATTAATGATAGCCTGAT??????ATCTGTATCTGTATTTTTTAATTTTAAGATGAAAAATGAAAGAATTGGTGTGAATTGATTCCACATTGAAGAAAGAATGAAATATTCATTCATCAAATCATTCACTCCATA?????GTCCAATAGATCTTTTAAAGAACTGCTTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCGTTCTACATGTCAATACCGGCAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCT?TATCCCCAAAAAA?GCCTAT?TTGACTCCAAAAATATTTATACTAT?CCGCTCCCCC?TTTTTCGTTAGCGGTTCCAAAGT?CCTTTATCTTTCTGATTCTTCGATAAACGTATTGGGGCGTAAATGACTATCTCTTATCACATGTGATATAGAATACACATCCAAATT?????????AAGCAATCAATTCCTATTTTAATTTGAATGATTCAAAATCAATAGCATTACTCTATTCATATTGAAACTTAGAAAGTCGTCTTTTTGAAGATCCAAGAAATTACAGGACTTGTAGAAAACTTTGTAATCCCCCC???TTATCCCTTTAATTGACATAGACCCCAGTGCTCTAATAAAATGAGGATAGGGATGCTACATTGAGAATGTAGGGTTAGGATTCAAAAAAGACCAACCCCATAGTATCAAAACCAACTCATCACTTCGTATTATCTGGATCTAAAAAAACAGTCGAGATATGCTAAATTAG?TCATATCTTTGTAGCAACTGAAA??TTTTTTTAACTAAACTTTAATTCTAGGTTTAAAGCAAAA?????????TACAGAAGAAAAGTGTGGATAAATGGAAAGATGAGAGAAAGAGAGAAAAATAATATCAATGATATAAAATTCCAATATGTAAGGTCTACGAATCATCTCATAAAAGACAATGTAATAAAGCATCAATACT???AAGTCGATTCATCCATAATTGAAAATATTCAATGAATCCTTCTTATTT?????ATAGAATAGAAGAAGAAAATCAAGAGCTTCGAGCCAATAAAGACTAAGAAA?GTTGACTCAAGAATAAATTGATTATAAGCTCCGTTGTAGAATTCTGACCTAACCATTAAATACGAAGCGGTGGGAACGATGAAACCTGTGAATGCAAAAGATTTTTTTTGAACAAATGAATCTTATTGATTCACTAGTCGGGATGGCGAAATGAACCGGAAATCAATTCCTCTATTCTGAGAAGTCAGGAAGAAGCGCTACGACTGAAATAGAGATTG?CAAGAGTAAA?TATTCGCCTGCGAAAACTTTCTTTTTTT????ATTGGTAAACTTGTAGAAAGGACAAAAGAAAAAAAA???GATTTATTAGAATAACTATT?ATTTA????????????????????TAAAATTTTTT?ATAAAACTGTTCTAATATCTATTCAAATTAATTT??????????AAATTCCATTTTGAATCC???????????TTTAATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCACGTCCAGTTTTGTAGTAGAGATGGAATTCCGAAACAACCATCAACTATAACCCC Mimulus_guttatus_CA CTTGGTGCGCACGGGCTTGTCGGATCCCTGCTCGGGCAGCGACGGCAACTTGTGCGCGCCTCTTCAATCGTCGGTTCAAGTGTG???????CCTTGATCGGTGTCGGTTTCCTGTGCTGCGTACCTATCGTGTTGGTATCGTGTCGGTTAAAAGTGCCCCATTTCGTCTTGCGTTGCATCCTTTTCAAGGCTGCGGCGTGGGATGGACCATGAAG?ATCCGT?CGTGTTCCACATCCCAGACG????TAACTGTCCCCGGGTTGTTGGCGCACGGCGGCACGCTCGATCTCTCGGATGCGGAAAATTGAGTGGGTACGAGGCGTTGGCCCTCT?ATTTACCCC??AAGAAAA??TGCGTTTCACGCTCTATGCGAACGACGACCGTCGCCGTCGCGATCGAGTCCT?TGCGGCTTGCATCGCACGGTGCCGG?TGTCGGTAAGGAAC?AAACCTGCAAAGCAGACCGCGA?TTCGTGATTAAATA?CTC?GGGGA?GGC?CCG????CGGGGCC??AAAGA?CCCCGCGCCGCCGACCCAA???CCCGCCGATGCGCACGAAACTGCGCCTCGTGCGGACT?AACGTACCCCGGCGCGGAATGCGCCAAGGAAAACTCAA?CGAAGCG?TCCGCCCCCCCGTTGCCTCGTTCGCGATGTGCGCGGGGGAGCGAG?ACGTGTCTTGAATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATTGCGTCGCCCCCCCCTCTCGCTCCGTCGGGGCGGGATGCGGGGG?CGGATATTGGTCTCCCGTGCGCTC?GCGCGCGCGGCTGGCCCAAATGAGATCCCTCGGCGATGCACGTCACGAGCAGTGGTGGTTGAATTATCGACTCGCTTGCTGCGGTGCTTGACGGCATCGTCCGCTCGGGCATCAACAACGACCCAACGGCGCCACATC?GGCGCCTTCGATT????????????????????T?GGAA?CCT?CTAAGTGATAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAAGAAAAACGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTCTTTTTTCAAAAGAAAGGTTTAGAAAACGAAAAAAAA????GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAATGGAGTTGATTGCGTTGGTAGAGGAATCTTTCCATGGAAACTTCAGAAAGGATGAAGGATAAACGTATCTATTGTATATCAAATGATTAATGATAGCCTGAT??????ATCTGTATCTGTATTTTTTCATTTGAAGATGAAAAATGAAAGAATTGGTATGAATTGATTCCACATTGAAGAAAGAATGAAATATTCATTCATCAAATCATTCACTCCATA?????GTCCAATAGATCTTTTAAAGAACTTATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGGCAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGT?GACTTTAAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCT?T?TCCCCAAAAAAAGCCTATATTGACTCCAAAAATATTTATACTAT?CCCCTCCCCT?TTTTTCGTTAGCAGTTCCAAATT?CCTTTATCTTTCTGATTCTTCGATAAACGTATTGGGGCGTAAATGACTATCTCTTATCACATGTGATATAGAATACACATCCAAATT?????????AAGCAAAGAATTCCTATTTGAATTTAAATGATTCAAAATAAATAGCATTACTCTACTCATATTGAAATTTAGAAAGTCGTCTTTTTGAAGATCCAAGAAATTACAGGACTTGGGGAAAACTTTGTAATCCCCCCTTCTTATCCCTTTAATTGACATAGACCCCAGTGCTCTAATAAAATGAGGATAGGGATGATACATTGAGAATG???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Mimulus_guttatus_OR CTTGGTGCGCACGGGCTTGTCGGATCCCTGCTCGGGCAGCGACGGCAACTTGTGCGCGCCTCTTCAATCGTCGGTTCAAGTGTG???????CCTTGATCGGTGTCGGTTTCCTGTGCTGCGTACCTATCGTGTTGGTATCGTGTCGGTTAAAAGTGCCCCGTTTCGTCTTGCGTTGCATCCTTTTCAAGGCTGCGGCGTGGGATGGACGATGAAG?ATCCGT?CGTGTTCCACGTCCCAGACG????TAACTGTCCCCGGGTTGTTGGCGCACGGCGGCACGCTCGATCTCTCGGATGCGGAAAATTGAGTGGGTACGAGGCGTTGGCCCTCT?ATTTACCCC??AAGAAAA??TGCGTTTCACGCTCTATGCGAACGACGACCGTCGCCGTCGCGATCGAGTCCT?TGCGGCTTGCATCGCGCGGTGCCGG?TGTC?GTAAAGAACGAAACCTGCAAAGCAGACCGCGAATTCGTGATTAAATA?CTCCGGGGA?GGCGGCG????CGGGGC??????????????????????????AA???CCCGCCGATGCGCACGAAACTGCGCCTCGTGCGGACT?AACGTACCCCGGCGCGGAATGCGCCAAGGAAAACTC???CGAAGCG?CCCGCCCCCCCGTTGC?TCGTAC?CGACGTGCGCGGGGGTGCGAG?ACGTGTCTTGAATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGAT?AAGAACGTAGCGAAAT?CGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCAT?GAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCC?AAGCCACTAG?CC?AG?GCACGT?TGC?TGGGCGTCACGCA?TG?GTCGCCCCCCCCTCT?GCTC?GTC?GGGCGGGAT?C?GGGGGCGGATATTGGTCTCCCGTGCGCTC?GCGCGCGCGGCTGGCCCAAATGAGATCCCTCGGCGATGCACGTCACGAGCAGTGGTGGTTGAATTCTCGACTCGCTTGCTGCGGTGCTTGACGGCATCGTCCGCTCGGGCATCACCAACGACCCAACGGCGCCACATC?GGCGCCTTCGATTTAATGG??TGAGCCTTGGTAT?GGAAACCTACTAAGTGATAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAAGAAAAACGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTCTTTTTTCAAAAGAAAGGTTTAGAAAACGAAAAAAAA????GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAATGGAGTTGATTGCGTTGGTAGAGGAATCTTTCCATGGAAACTTCAGAAAGGATGAAGGATAAACGTATCTATTGTATATCAAATGATTAATGATAGCCTGAT??????ATCTGTATCTGTATTTTTTCATTTGAAGATGAAAAATGAAAGAATTGGTATGAATTGATTCCACATTGAAGAAAGAATGAAATATTCATTCATCAAATCATTCACTCCATA?????GTCCAATAGATCTTTTAAAGAACTTATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGGCAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTTTATCCCCAAAAAAAGCCTATATTGACTCCAAAAATATTTATACTAT?CCCCTCCCCT?TTTTTCGTTAGCAGTTCCAAATT?CCTTTATCTTTCTGATTCTTCGATAAACGTATTGGGGCGTAAATGACTATCTCTTATCACATGTGATATAGAATACACATCCAAATT?????????AAGCAAAGAATTCCTATTTGAATTTAAATGATTCAAAATAAATAGCATTACTCTACTCATATTGAAATTTAGAAAGTCGTCTTTTTGAAGATCCAAGAAATTACAGGACTTGGGGAAAACTTTGTAATCCCCCCTTCTTATCCCTTTAATTGACATAGACCCCAGTGCTCTAATAAAATGAGGATAGGGATGATACATTGAGAATGTAGGGTTAGGATTCAAAAAAGACCAACCCCGTAGTATCAAAACCAACTCATCACTTCGTATTATCTGGATCTAAAGAACCAGTCGAGATATGCTAAATGGG?TCATATCTTTGTAGCAACTGAAA?TGTTTTTTCACTAAACTTTAATTCTAGGTTTAAAGCAAAA?????????TACAGAATAAAAGTGTGGATAAATGGAAGGATGAGAGAAAGAGAGAAAAATAATATCAATGATATAAAATTCCAATATGTAAGGTCTACGAGTCATCTCATAAAAGACAATGTAATAAAGCATCAATACT???AAGTTGATTCAGCCATAATTGAAA?TATTCAATGAATCCTTCTTATTT?????ATAGAATAGAAGAAGAACATCAAGAGCTTCGAGCCAATAAAGACTAAGAAA?GTTGACTCAAGAATAAATTGATTATAAGCTCCGTTGTAGAATTCTGACCTAACCATTAAATACGAAGCGGTGGGAACGATGAAACCTGTGAATACAAAAGATTATTTT?GAACAAATGAATCTTATTAATTCACTAGTCAGGATGGCGAAATGAACCGGAAATCAATTCCTCTATTCTGAGAAGTCAGGAAGAAGCGATACGACTCAAATAGAGATTG?CAAGAGTAAA?TATTCGCCTGCGAAAACTTTCTTTTTTTTTT?ATTGGTAAACTTGGAGAACGGACAAAAGAAAATAAA???GATTTATTAGAATAACTATT?ATTTA????????????????????TAAAATTTTTT?ATAAAATTGTTCTAATATCTATTCAAATTCATTT??????????AAATTTCATTTTGAATCC???????????TTTTATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCATGTCCAGTTTTGTAGTAGAGATGGAATTACGAAACAACCATCAACTATAACCCC Mimulus_hymenophyllus ?CTGGTGCGTACGGGCTTGTCGGATCCCTGCTCGGGCAGCGACGGCAACTCGTGCTCGCCTCTTCAATCGTCGGTTCAAGCGTG???????CCTTGATCGATGTCGGTTTCCTGTGTTGCATACCTATTGTGGAGGTATCCCGCCGGTTAAAAGTGCCCCGTTCCGTCTTGCGCTGCGTCCTTTTCAAGGCTGCGGCGTGGGATGGACCATGAAG?ATTCGT?CGTGTTCCACATCCCAGACG????TAACTGTCCTCGGGTTGTTGGCCCACGGCGGCATGCTCGATCTTTCGGATGCGGAAAATTGAGTGGGTACGAGGCGTTTGCTCTCT?ATTTACCCCAAAACAA????GGCGTTTCACGCTCTATGCGAACGACTACCGTCGCCGTTGTGATCGAGTCCT?CGCGGCTCGCATCATGCGGTGCCGG?TGTCGGTAAAGAACGAAACCTGCAAAGCAGACCGCGAATTCGTGACTAAATA?CTCTGGGGAAG?CGGCG????CGGG?????????????????????????????TCTACCCGCCGATGCGCACGAAAGTGCGCACCGTGCGGACT?AACGTACCCCGGCGCGGAATGCGCCAAGGAAAACTCAA?CGAAGCG?TCCGCCCCCC?GTCGCCTCGTTCGCGACGTGCGCGGGGGTGCCGG?GCGTGTCTTGAATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATTGCGTC?CCCCC??TTCCCGCTCCATCGGGGCGGGAT?CGGGCG?CGGACATTGGTCTCCCGTGCGCTC?GCGCGCGCGGCTGGCCCAAATGAGATCCCTCGGCGATGCATGTCACGAGCAGTGGTGGTTGAATTCTCGACTCGCTTGCTGCAGTGCTTGACGGCATCGTCCGCTCGGGCATCACCAACGACCCAACGGCGCCCCTC??GGCGCCTTCGATTAATTGAATTGGGCCTTGGTAT?GGAAACCTACTAAGTGATAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAAGAAAAACGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTCTTTTTTCAAAAGAAAGGTTTAGAAAACGAAAAAAAAAAA?GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGATGTTCTAACAAACGGAGTTGATTGCGTTGGTAGAGGAATCTTTCCATCGAAACTTCAGAAAGGATGAAGGATAAACGTATCTATTGTATATCAAATGATTAATGATATCCTGAT??????ATCTGTATCTGTATTTTTTAATTTTAAGATGAAAAATGAAAGAATTGGTGTGAATTGATTCCACATTGAAGAAAGAATGAAATATTCATTCATCAAATAATTCACTCCATA?????GTCCAATAGATCTTTTAAAGAACTGCTTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCGTTCTACATGTCAATACCGGCAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAAAAATCGTG?GGGTTCAAGTCCCTGT?TCCCCAAAAAAAGCCTAT?TTGACTCCAAAAATATTTATACTAT?CCCCTCCCCT?TTTTTCGTTAGCGGTTCCAAAGT?CCTTTATCTTTCTGATTCTTCGATAAACGTATTGGGGTGTAAATGACTATCTCTTATCACATGTGATATAGAATACACATCCAAATT?????????AAGCAAAGAATTCTTATTTTAATTTGAATGATTCAAAATCAGTAGCATTACTCTATTCATATTGAAACTTAGAAAGTCGTCTTTTTGAAGATCCAAGAAATTACAGGACTTGTAGAAAACTTTGTAATCCCCC????TTATCCCTTTAATTGACATAGACCCCAGTGCTCTAATAAAATGAGGATAGGGATGCTACATTGAGAATGTAGGGTTAGGATTCAAAAAAGACCAATCCCATAGTATCAAAACCAACTCATCACTTCGTATTATCTGAATCTAAAAAAACAGTCGAGATATGCTAAATTAG?TCATATCTTTGTAGCAACTGAAA??TTTTTTTCACTAAACTTTAATTCTAGGTTTAAAGCAAAA?????????TATAGAAGAAAAGTGTGGATAAATGGAAAGATGAGAGAAAGAGAGAAAAATAATATCAATGATATAAAATTCCAATATGTAAGGTCTACGAATCATCTCATAAAAGACAATGTAATAAAGCATCAATACT???AAGTCGATTCATCCATAATTGAAAATATTCAATGAATCCTTCTTGTTT?????ATCGAATAGAAGAAGAAAATCAAGAGCTTCGAGCCAATAAAGACTAAGAAAA?TTGACTCAAGAATAAATTGATTATAAGCTCCGTTGTAGAATTCTGACCTAACCATTAAATACGAAGCGGTGGGAACGATGAAACCTGTGAATGCAAAAGATTTTTTT?GAACAAATGAATCTTGTTGATTCACTAGTCGGGATGGCGAAATGAACCGGAAATCAATTCCTCTATTCTAAGAAGTCAGGAAGAAGCGCTACGACTGAAATAGAGATTG?C{AC}AGAGTAAA?TATTCGCCTGCGAAAACTTTCTTTTTTT????ATTGG{GT}AAACTTGTAGAAAGGACAAAAGAAAAAAAAAA?GATTTATTAGAATAACTATT?ATTTA????????????????????TAAAATTTTTT?AGAAAACTGTTTTAATATCTATTCAAATTAATTT??????????AAATTCCATTTTGAATCC???????????TTTTATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCACGTCCAGTTTTGTAGTAGAGATGGAATTCCGAAACAACCATCAACTATAACCCC Mimulus_jungermannioides ???GGTGC?TACGGGCTTGTCGGATCC?TGCTCGGGCAGCGACGGCAACTCGTGCTCGCCTCTTCAATCGTCGGTTCAATCGTG???????CCTTGATCGATGTCGGTTTCCTGTGTTGCATACCTATTGTGGAGGTATCCTGCCGGTTAAAAGTGCCCCGCTCCGTCTTGCGTTGCGTCCTTTTCAAGGCCGCGGCGTGGGATGGACCATGAAG?ATTCGT?TGTGTTCTACATCCCA?ACG????TAACTGTCCTCGGGTTGTTGGCCCACGGCGGCATGCTCGATCTCTCGGATGCGGAAAATTGTGTGGGTACGAGGCGTTTGCTCTCT?ATTTACCCC????GAAAAAAGGCGTTTCACGCTCTATGCGAACGACTACCGTCGCCGTTGTGATCGAGTCCT?TGCGGCTCGCATCATGCGGTGCCGG?TGTCGGTAAGGAACGAGACCTGCAGAGCAGACCGCGAATTCGTGATTAA?TA?CTCTGGGGAAG?CGGCG????CGGG?????????????????????????????TCTCCCCGCCGGTGCGCACGAAGCTGCGCACCGTGCGGACT?AACGTACCCCGGCGCGGAATGCGCCAAGGAAAACTCAA?CGAAGCG?TCCGCCCCCC?GTTGCCTCGTTCGCGACGTGCGCGGGGGTGCCGG?GCGTGTCTTGAATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACGCATTGCGTCGCCCCC??TTCTCGCTCCA?CGGGGCGGGAT?CGGGCG?CGGACATTGGTCTCCCGTGCGCTC?GCGCGCGCGGCTGGCCCAAATGAGATCCCTCGGCGATGCATGTCACGAGCAGTGGTGGTTGAATTCTCGACTCGCTTGCTGCGATGCTTGACTGCACCGTCCGCTCGGGCATCACCAACGACCCAACGGCGCCCCACGAGGCGCCTTCGATTAATTGAATTGAGCCTTGGTAT?GGAAACCTACTAAGTGATAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAAGAAAAACGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTCTTTTTTCAAAAGAAAGGTTTAGAAAACGAAAAAAAAAA??GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGATGTTCTAACAAATGGAGTTGATTGCGTTGGTAGAGGAATCTTTCCATCGAAACTTCAGAAAGGATGAAGGATAAACGTATCTATTGTATATCAAATGATTAATGATAGCCTGAT??????ATCTGTATCTGTATTTTTTAATTTTAAGATGAAAAATGAAAGAATTGGTGTGAATTGATTCCACATTGAAGAAAGAATGAAATATTCATTCATCAAATCATTCACTCCATA?????GTCCAATAGATCTTTTAAAGAACTGCTTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCGTTCTACATGTCAATACCGGCAACAATGAAATTTCTAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCAAAAAAAGCCTAT?TTGCCTCCAAAAATATTTATACTAT?CCCC?CCCC??TTTTTCGTTAGCGGTTCCAAAGT?CCTTTATCTTTCTGATTCTTCGATAAACGTATTGGGGCGTAAATGACTATCTCTTATCACATGTGATATAGAATACACATCCAAATT?????????AAGCAAAGAATTCCTATTTTAATTTGAATGATTCAAAATCAATAGCATTACTCTATTCATATTGAAACTTAGAAAGTCGTCTTTTTGAAGATCCAAGAAATTACAGGACTTGTAGAAAACTTTGTAATCCCCCC???TTATCCCTTTAATTGACATAGACCCCAGTGCTCTAATAAAATGAGGATAGGGATGCTACATTGAGAATGTAGGGTTAGGATTCAAAAAAGACCAACCCCGTAGTATAAAAACCAACTCATCACTTCGTATTATCTGGATCTAAAAAAACAGTCGAGATATGCTAAATTAG?TCATATCTTTGTAGCAACTGAAC??TTTTTTTCACTAAACTTTAATTCTAGGTTTAAAGCAAAA?????????TACAGAAGAAAAGTGTGGATAAATGGAAAGATGAGAGAAAGAGAGAAAAATAATATCAATGATATAAAATTCCAATATGTAAGGTCTACGAATCATCTCATAAAAGACAATGTAATAAAGCATCAATACT???AAGTCGATTCATCCATAATTGAAAATATTCAATGAATCCTTCTTATTT?????ATAGAATAGAAGAAGAAAATCAAGAGCTTCGAGCCAATAAAGACTAAGAAA?GTTGACTCAAGAATAAATTGATTATAAGCTCCGTTGTAGAATTCTGACCTAACCATTAAATACGAGGCGGTGGGAACGATGAAACCTGTGAATGCAAAAGATTTTTTT?GAACAAATGAATCTTATTGATTCACTAGTCGGGATGGCGAAATGAACCGGAAATAAATTCCTCTATTCTGAGAAGTCAGGAAGAAGCGCTACGACTGAAATAGAGATTG?CAAGAGTAAA?TATTCGCCTGCGAAAACTTTCTTTTTTT????ATTGGTAAACTTGTAGAAAGGACAAAAGAAAAAAAAA{AC}?GATTTATTAGAATAACTATT?ATTTC????????????????????TAAAATTTTTT?AGAAAACTGTTCTAATATGTATTCAAATTAATTT??????????AAATTCCATTTTGAATTC???????????TTTAATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCACGTCCAGTTTTGTAGTAGAGATGGAATTCCGAAACAACCATCAACTATAACCCC Mimulus_latidens CTTGGTG?ATACGGG?TT?TCGGATCCCTGCTCGGGCA{AG}CGACGGCAACTTGTGCGCGCCTTTTCAATCGTCGGTTCAAGTGTG???????CCTTGATCGATGTCGGTTTCCTGTGTTGCATACCTATTGTGGAGGTATCCTGCCGGTTAAAAGCGCCCCATTCCGTCTTGCGTTGCATCCTTTTCAAGGCTGCGGCGTGGGATGGACCATGAAG?ATTCGT?CGTGTTCCACATCCCGGACG????TCATTGTCCTCGGGTTGTCGGCCCACGGCGGCATGCTCGATCTTTCGGATGCGGAAAATTGAGTGGGTACGAGGCGTTTGCTCTCT?ATTTACCCC??AAGAAAA??GGCGTTTCACGCTCTATGCGAACGACGGCCGTCGCCGTTGCGATCGAGTCCT?CGCGGCTCGCATCGCGCGGTGCCGG?TGTCGGTAAGGAACGAAACCTGCAAGGCAGACCGCGAATTCGTGATTAAATA?CTTTGGGGAAG?CGGCG????CGGG?????????????????????????????TCTCCCCGCCGATGCGCACGAAACTGCGTACCGTGCGGACT?AACGTACCCCGGCGCGGAATGCGCCAAGGAAAACTCAA?CGAAGCG?TCCGCCCCCC?GTTGCCTCGTTCGCGACGTGCGC?GGGGTGCCGG?ACGTGTCTTGAATGTCAA?ACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATTGCGTCGCCCCC??TTCTCGCTCCATCGGGGCGGGAT?CGGGCG?C?GATATTGGTCTCCCGTGCGCTC?GCGCGCGCGG?TGGCCCAAATGAGATCCCTCGGCGATGCATGTCA?GAGCAG?GGTGGTTGAATTCTCGACTCGCTTGCTGCAATGCTTGATGTCATCGTCCGCTCGGGCATCACCAACGACCCAACGGCGCCC?TTC?GGCGCCTTCGATTAA?TGA??T???CCTTGGTAT?GGAAACCTACTAAGTGATAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAAGAAAAACGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTCTTTTTTCAAAAGAAAGGTTTAGAAAACGAAAAAAAAAAAAGGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAATGGAGTTGATTGCGTTGGTAGAGGAATCTTTCCATCGAAACTTCAGAAAGGATGAAGGATAAACGTATCTATTGTATATCAAATGATTAATGATAGCCTGAT??????ATCTGTATCTGTATTTTTTAATTTTAAGATGAAAAATGAAAGAATTGGTGTAAATTGATTCCACATTGAAGAAAGAATGAAATATTCATTCATCAAATCATTCACTCCATA?????GTCCAATAGATCTTTTAAAGAACTGATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCGTTCTACATGTCAATACCGGCAACAATGAAATTTATAGTAAAAGGAAAATCCGTCGACTTTAAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTTTATCCCCAAAAAAAGCCTAT?TTGACTCCAAAAATATTTATACTACCCCCCTCCCCT?TTTTTCGTTAGCGGTTCCAAATT?CCTTTATCTTTCTGATTCTTCGATAAACGTGTTGGGGCGTAAATGACTATCTCTTATCACATGTGATATAGAATACACATCCAAATT?????????AAGCAATTAATTCCTATTTTAATTTGAATGATTCAAAATCAATAGCATTACTCTATTCATATTGAAACTTAGAAAGTCGTCTTTTTGAAGATCCAAGAAATTACAGGACTTGGAGAAAACTTTGTAATCCCCCC???TTATCCCTTTAATTGACATAGACCCCAGTGCTCTACTAAAATGAGGATAGGGATGCTACATTGAGAATGTAGGGTTAGGATTCAAAAAAGACCAACCCCGCAGTATCAAAACCAACTCATCACTTCGTATTATCTGGATCTAAAGAACCAGTCGAGATATGCTAAATTGG?TCATATCTTTGTAGCAACTGAAA?TTTTTTTTCACTAAACTTTAATTCTAGGTTTAAAGCAAAA?????????TACAGAAGAAAAGTGTGGATAAATGGAAGGATGAGAGAAAGAGAGAAAAATAATATCAATGATATAAAATTCCAATATGTAAGGTCTACGAGTTATCTCATAAAAGACAATGTAATAAAGCATCAATACTACTAAGTTGATTCATCCATAATTGAAA?TATTCAATGAATCCTTCTTATTT?????ATAGAATAGAAGAAGAAAATCAAGAGCTTCGAGCCAATAAAGACTAAGAAA?GTTGACTCAAGAATAAATTGATTATAAGCTCCGTTGCAAAATTATGACCTAACCATTAAATACGAAGCGATGGGAACGATGAAACCTGTGAATGCAAA?GATTTTTTT?GAACAAATGAATCTTATTGATTCACTAGTCGGGATGGCGAAATGAACCGGAAATCAATTCCTCTATTCTGAGAAGTCAGGAAGAAGCGCTACGACTGAAATAGAGATTG?CAAGAGTAAA?TATTCGCCTGCGAAAACTTTGTTTTTTT????ATTGGTAAACTTGGAGAAAGGACAAAAGAAAATAAA???GATTTATTAGAATAACTATT?ATTTA????????????????????TAAAATTTTTT?ATAAAACTGTTCTAATATCTATTCAAATTAATTT??????????AAATTCCATTTTGAATCC???????????TTTTATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCACGTCCAGTTTTGTAATAGAGATGGAATTCCGAAACAACCATCAACTATAACCCC Mimulus_lewisii ????GTGCGTATGGGCATGTCGGATCCCTGCTCGGGCAG?GACGGCAT?T?ATCCGC?CCTTTTCAATTT??GGTT?AAGTGTG?TT?TT?CCTTGAT?GAAGTCGGTTTCCTGTGTTGCA?ACCAAT?GTAGCGGTATTTG?TCGG?TAAAA?TGTA?TGTTT?GTCCCGCGTTCCG?CCTTTCCAAGG?TGCGGCGTGGG?TGGA?TAAGAAGCATT?GT?TGTGTTCCACATCCC?GACA???GTAA?TGTGCTTGGGTTGTTGGCGCATGGCGGCATGCTCGTACTTTCGGATGCGGAAAATTGAGCGGGTACGAGGCATCTGTCCT?T?ATCTACCCC?AAAGAAA????GCGTTCCACGCT?TCAGCGAACGACGG????????????????????????????????????????????????????????????????CGAAGCCTGCAAAGCAGACCGCGAATCCGTGTTTAAAAA?CTC??GGGGA??CGGTTGCGTCGGGGC??GAAAG?CCCATGCGCTGCCGTCCC?TCC?CCCGCCAATGCGCACGAAACTGCGTCTTGTGCGGGCT?AACGTACCCCGGCGCGGAACGCGCCAAGGAAAACTCAA?CGAAGCG?TCTGCCCCC?TGTTGCCTCGTTCGCGAAGTGCGCGGGGGCGCCGG?ACGTGTCTTGAATGTCTAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCATTAGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATTGCGTCGCCCCC??TTCTCCCTCGCTTGAGGCCGGAT?GGGGTG?CGGATATTGGTCTCCCGTGCGCTCTGCGCGTGCGGCTGGCCCAAATGAGATCCCTCGGCGACGCATGTCACGAGCAGTGGTGGTGGAATTCTCGACTCGCCTGCTGTGATGCTTGATGGCGTCGTCCGCTCGGGCATCACGAATGACCCAACGGTGCTCCAT??GGCACCTTCGATTAATTGGATTGAGC?TTGGTAT?GGAAACCTACTAAGTGATAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAAGAAAAACGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTCGTTTTTCAAAAGAAAGGTTTAGAAAACGAAAAAAAA????GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTATTCTAACAAATGGAGTTGACTGCGTTGGTAGAGGAATCTTTCCATCGAAACTTCAGAAAAGATGAAGGATAAACGTATCTCTTGTATATCAAATGATTAATGATAGCCTGAA???????TCTGTATCTGTATTTTTT??????AAGATGAAAAATGAAAGAATTGGTGTGAATTGATTCCACATTGAAGAAAGAATCAA?TATTCATTCATCAAATCATTTACTCCATA?????GTCCGATAGATCTTTTAAAGAACTGATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCGTTCTACATGTCAATACCGGCAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTTAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCAAAAAAAGCCTAT?TTGACTCCAAAAATATTTATCCTAT?CCCCC??????TTTTTCGTTAGTGGTTTCAAATT?CCTTTATCTTTCTGATTATTCGATAAATGTATTTGGGCGTAAATGACTATCTCTTATCACATGTGATATAGAATACACATCCAAATTAAGCAAATTAAGTAAAGAATTCCTAG??????TTGAATGATTCAAAATAAATAGCATTACTCTACTCATACTGAAACTTAGTATGTTGTCTTTTTGAAGATCCAAGAAATTAGAGGACTTGGAGAAAA????GTAATCCCTCC???TTATCCCTTTAATTGACATAGACCCCAGTCCTCTAATAAAATGAGGATAGGGATTCTACATTGAGAATGTAGAGTTAGGATTCAAAAAA??CTAACCCGGTAGTATAAAAAACAACTCATCACTTCTTATTATCTGGATATAAGGAACCAGTCGAGATAGGCTAATATAGGTCATATCTTTGTAGCAACTGAAATTTTTTTTTCAATAAACTTTAATTCTAAGTTTAAAGAAAAA?????????TACAGAAGAAAAGTGTGGATAAATGGAAGGATGAGAGAAAGAGAGAAAAAGAATATCAATGATATAAAATTCCAATATGTAAGGTCTAGGAGTCATCTCATAAAAGACAGTGTAATAAAGCATCAATATT???AA?TTAATTCATCCATAATTGAAA?TATTCAATGAATCCTTCTT?????????AACTTATAGAATAAAAAAATCAAGAGCTTCGAGCCAATAAAGACTAAGAAA?GTTGACTCAAGAATAAATTGATTATAAGCTCCATTGTAGAATTCTGACCTAACCATTAAATACGAAGCGGTGGGAACGATGAAACCTGTGAATGCAAAAGATTTATTTT??CCAAATGAATCTTACTGATTCACTAGTCGGGATGGCGAACTGAACCGGAAATAAATTCCTCTATTCTGAGAAGTCACGAA?AAGCGTTATGAC??AAATAGAGATTG?CAAGAGTAAA?TATTCGCCTGCGAAAACTTTCTTTTTTT????ATTGGTAAACTTGGAAAAAGGACAAAAGAAACTAAA???GATTTATTAGAATAACTAGCCTATTGTTTATAAAATGTTTATAAAATAAAATTTTTT?AGAAAAAGGGTCTAATATCTATTCAAATTAAT??????????GGAAATTCCATTTTGAATCC???????????TTTTATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCACGTCCAGTTTTGTAGTAGAGATGGAATTCCGAAACAACCATCAACTATAACCCC Mimulus_moschatus CTTGTGTGGTA?GGGCTTGTCGGATCCCTGCTCGGGCA{AG}CGACGGCAACTTGTGCGCGCCTCTTCAATCGTCGGTTCAAGTGTG???????TCTTGATCGATGTCGGTTTCCTGTGTTGCATACCTACTGTGGAGGTATCCTGCCGGTCAAAAGTGCCCCGTTCCGTCTTGCGTTGCGTCCTTTTCAAGGCCGCGGCGTGGGATGGACCATGAAG?ATTCGT?CGTGTTCCACATCCCAGACG????TAACTGTCCTCGGTTTGTTGGCCCACGGCGGCATGCTCGATCTTTCGGATGCGGAAAATTGAGTGGGTACGAGGCGTTTGCTCTCT?ATTTACCCC???AGAAAAA?GGCGTTTCACGCTCTATGCGAACGACGACCGTCGCCGTTGTGATCGAGTCCT?TGCGGCTTGCATCATGCGGTGCCGG?TGTCGGTAAGGAACGAAACCTGCAAAGCAGACCGCGAATTCGTGATTAAATA?CTCCGGGGAAG?CGGCG????CGGG?????????????????????????????CCTCCCCGCCGGTGCGCACGAAACTGCGCACCGTGCGGACT?AACGTACCCCGGCGCGGAATGCGCCAAGGAAAACTCAA?CGAAGCG?TCCGCCCCCC?GTTGCCTCGTCCGCGACGTGCGCGGGGGTGCCGG?GCGTGTCTTGAATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATTGCGTCGCCCCC??TTCCCGCCCCATCGGGGCGGGAT?CGGGCG?CGGATATTGGTCTCCCGTGCGCTC?GCGCGCGCGGCTGGCCCAAATGAGATCCCTCGGCGATGCACGTCACGAGCAGTGGTGGTTGAATTCTCGACTCGCTTGCTGCAGTGCTTGATGGCATCGTCCGCTCGGGCATCACCAACGACCCAACGGCGCCCCAC??GGCGCCTTCGATT??TTGAATTGAGCCTTGGTAT?GGAAACCTACTAAGTGATAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAAGAAAAACGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTATTTTTTAAAAAGAAAGGTTTAGAAAACGAAAAAAAAA???GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGATGTTCTAACAAATGGAGTTGATTGCGTTGGTAGAGGAATCTTTCCATCGAAACTTCAGAAAGGATGAAGGATAAACGTATCTATTGTATATCAAATGATTAATGATAGCCTGAT??????ATCTGTATCTGTATTTTTTAATTTTAAGATGAAAAATGAAAGAATTGGTGTGAATTGATTCCACATTGAAGAAAGAATGAAATATTCATTCATCAAATCATTCATTCCATA?????GTCCAATAGATCTTTTAAAGAACTGCTTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCGTTCTACATGTCAATACCGGCAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCC?TCGACTTTAAAAATGGTGAGGGT?CAAGTCCCT?TATCCCCAAAAAAAGCCTAT?TTGACTCCAAAAATATTTATACTAT?CCCCTCCCCC?TTTTTCGTTAGCGGTTCCAAAGT?CCTTTATCTTTCTGATTCTTCGATAAACGTATTGGGGCGTAAATGACTATCTCTTATCACATGTGATATAGAATACACATCCAAATT?????????AAGCAAAGAATTCCTATTTTAATTTGAATGATTCAAAATCAATAGCATTACTCTATTCATATTGAAACTTAGAAAGTCGTCTTTTTGAAGATCCAAGAAATTACAGGACTTGTAGAAAACTTTGTAATCCCCCC???TTATCCCTTTAATTGACATAGACCCCGGTGCTCTAATAAAATGAGGATAGGGATGCTACATTGAGAATGTAGGGTTAGGATTCAAAAAAGAC?ACCCC?GTATTATCAAAACCAACTCATCACTTCGTATTATCTGGATCTAAAAAAACAGTCAAGATATGCTAAATTAG?TTATATCTTTGTAGCAACTGAAA?TTTTTTTTCACTAAACTTTAATTCTAGGTTTAAAGCAAAA?????????TACAGAAGAAAAGTGTGGATAAATGGAAAGATGAGAGAAAGAGAGAAAAATAATATCAATGATATAAAATTCCAATATGTAAGGTCTACGAATCATCTCATAAAAGACAATGTAATAAAGCATCAATACT???AAGTCGATTCATCCATAATTGAAAATATTCAATGAATCCTTCTTATTT?????ATAGAATAGAAGAAGAAAATCAAGAGCTTCGAGCCAATAAAGACTAAGAAA?GTTGACTCAAGAATAAATTGATTATAAGCTCCGTTGTAGAATTCTGACCTAACCATTAAATACGAAGCGGTGGGAACGATGAAACCTGTGAATGCAAAAGATTTTTTT?GAACAAATGAATCTTATTGATTCACTAGTCGGGATGGCGAAATGAACCGGAAATCAATTCCTCTATTCTGAGAAGTCAGGAAGAAGCGCTACGACTGAAATAGAGATTGGCAAGAGTAAAATATTCGCCTGCGAAAACTTTCTTTTTTT????ATTGGTAAACTTGTAGAAAGGACAAAAGAAAAAAAA???GATTTATTAGAATAACTATT?ATTTA????????????????????TAAAATTTTTTTAGAAAACTGTTCTAATATCTATTCAAATTAATTT??????????AAATTCCATTTTGAATCC???????????TTTTATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCACGTCCAGTTTTGTAGTAGAGATGGAATTCCGAAACAACCATCAACTATAACCCC Mimulus_nepalensis CTTGGTGCGTACGGGCTTGTCGGATCCCTGCTCGGGCAGCGACGGCAACTTGTGCGCGCCTTTTCAATCGTCGGTTCAAGTGTG???????CCTTGATCGATGTCGGTTTCCTGTGTTGCATACCTATTTTGGAGGTATTCTGCCGGTTAAAAGTGCCCCGTTTCGTCCTGCGTTGCATCCTTTTCAAGGCTGCGGCGTGGGATGGACCATGAAG?ATTCGT?CGTGTTCCACATCCCAGACG????TAACTGTCCTCGGGTTGTTGGCCCACGGTGGCGTGCTCGATCTTTCGGATGCGGAAAATTGAGTGGGTAGGAGGCGTTTGCCCTCT?ATTTACCCC??AAAAAAA??GGCGTTTCACGCTCTATGCGAACGACGACCGTCGCCGTTGTGATCGAGTCCT?TGCGGCTTGCATCATGCGGTGCCGG?TGTCGGTAAGGAA???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CCGCCGCCCC?TCC?CC?GCCGATGCGCACGAAACTGCGTATCGTGCGGACT?AACGTACCCCGGCGCGGAATGCGCCAAGGAAA?CTCAA?CGAAGCG?TCCGCCCCCC?GTTGC?TCGTTCGCGGCGTGCGC?GGGGTGCCGG?ACGTGTCTTGAATGTC?AAACGA?TCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGAATCGATGAA?AACG?AGA?AATTGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAAC?ATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGC?GAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATTGCGTCGCCCCC??TTCTCGCTCCATCGGGGCGGGAT?CGGGCG?CGGATATTGGTCTCCCGTGCGCTC?GCGCGCGCGGCTGGCCCAAATGAGATCCCTCGGCGATGCATGTCACGAGCAGTGGTGGTTGAATTCTCGACTCGCTTGCTGTAATGCTTGATGGCATCGTCCGCTCGGGCATCACCAACGACCCAACGGCGCCCCTT??GGCGCCTTCGATTAATTGGATTGAGCCTTGGTAT?GGAAACCTATTAAGTGATAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAAGTAAGAAAAACGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTCTTTTTTCAAAAGAAAGGTTTAGAAAACGAAAAAAAA????GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAATGGAGTTGATTGCGTTGGTAGAGGAATCTTTCCATCGAAACTTCAGAAAGGATGAAGGATAAACGTATCTATTGTATATCAAATGATTAATGATAGCCTGAT??????ATCTGTATCTGTATTTTTTAATTTTAAGATGAAAAATGAAAGAATTGGTGTGAATTGATTCCACATTGAAAAAAGAATGAAATATTCATTCATCAAATCATTCACTCCATA?????GTCCAATAGATCTTTTAAAGAACTGATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCGTTCTACATGTCAATACCGGCAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGT???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CTCCC?T?TTTTTCGTTAGCGGTTCCAAATT?CCTTTATCTTTCTGATTCTTCGATAAACGTATTGGGGCGTAAATGACTATCTCTTATCACATGTGAGATAGAATACACATCCAAATT?????????AAGCAAAGAATTCCTATTTTAATTTGAATGATTCAAAATCAATAGCATTACTCTATTCATATTGAAACTTAGAAAGTCGTCTTTTTGAAGATCCAAGAAATTACAGGACTTGTAGAAAACTTTGTAATCCCCCC???TTATCCCTTTAATTGACATAGACCCCAATGCTCTAATAAAATGAGGATAGGGATGCTACATTGAGAATG???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Mimulus_norrisii ?????GTGCTA?CGGCTTGTCGGATCC?TGCTCGGGCAGCGACGGCAACTTGTGCGCGCCTTTTCAATCGTCGGTTCAACTGTG???????CCTTGATCGATGTCGGTTTCCTGTGTTGCATACCTATTGTGGAGGTATCCTGCCGGTTAAAAGGGCCCCGTTCCGTCTTGCGTTGCGTCCTTATCAAGGCTGCGGCGTGGGATGGACCACGAAG?ATGCGT?CGTGTTCCACATCCCAGACG????TAACTGTCCCCGGGTTGTTGGCCCACGGTGGCGTGCTCGATCTTTCGGATGCGGAATATTGAGTGGGTACGAGGCGTTTGCCCTCT?ATTTACCCC??AAAAAAA??GGCGTTTCACGCTCTATGCGAACGACGACCGTCGCCGTCGTGATCGAGTCCC?TGCGGCTTGCATCATGCGGTGCCGG?TGTCGGTAAGGAA?TAAACCTGCAGACCA?ACCGCGAATTCGTGATTAAACAGCTC?GGGGGAG?CGGCG????CGGGTCC?GAA?GG??CCCGCGCCGCCGCCCC?TCC?CC?GCCGATGCGCACGAAACTGCGCACCGTGCGGACT?AACGTACCCCGGCGCGGAACGCGCCAAGGAAAACTCAA?CGAAGCG?TCCGCCCCCC?GTTGCCTCGTTCGCGACGTGCGCGGGGGTGCCGG?ACGTGTCTTGAATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATTGCGTCGCCCCC??TTCTCGCTCCACCGGGGCGGGAT?CGGGCG?CGGATACTGGTCTCCCGTGCGCTC?GCGCGCGCGGCTGGCCCAAATGAGATCCCTCGGCGATGCATGTCACGAGCAGTGGTGGTTGAACTCTCGACTCGCTTGCTGTAGTGCTTGATGGCATCGTCCGCTCGGGCATCACCAACGACCCAACGGCGCCCCCC??GGCGCCTTCGATT??????????????TTGGTCC??GAAACCTAC?ATTTGATAACTTTCAAATTCAGAGAAACTCCGGAATTAAGAAAAACGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTCTTTTTTGAAAAGAAAGGTTTAGAAAACGAAAAAAAAAAA?GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGATGTTCTAACAAATGGAGTTGATTGCGTTGGTAGAGGAATCTTTCCATCGAAACTTCAGAAAGGATGAAGGATAAACGTATCTATTGTATATCAAATGATTAATGATAGCCTGAT??????ATCTGTATCTGTATTTTTTAATTTTAAGATGAAAAATGAAAGAATTGGTGTGAATTGATTCCACATTGAAGAAAGAATGAAATATTCATTCATCAAATCATTCACTCCATA?????GTCCAATAGATCTTTTAAAGAACTGCTTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCGTTCTACATGTCAATACCGGCAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCAAAAAA?GCCTAT?TTGACTCCAAAAATATTTATACTAT?CCACTCCCCCCTTTTTCGTTAGCGGTTCCAAAGT?CCTTTATCTTTCTGATTCTTCGATAAACGTATTGGGGCGTAAATGACTATCTCTTATCACATGTGATATAGAATACACATCCAAATT?????????AAGCAATCAATTCCTATTTTAATTTGAATGATTCAAAATCAATAGCATTACTCTATTCATATTGAAACTTAGAAAGTCGTCTTTTTGAAGATCCAAGAAATTACAGGACTTGTAGAAAACTTTGTAATCCCCCC???TTATCCCTTTAATTGACATAGACCCCAGTGCTCTAATAAAATGAAGATAGGGATGCTACATTGAGAATGTAGGGTTAGGAT{AC}CACAA{CT}AGACCAACCCCATAGTATCAAAACCAACTCATCACTTCGTATTATCTGGATCTAAAAAAACAGTCGAGATATGCTAAATTAG?TCATATCTTTGTAGCAACTGAAA??TTTTTTTAACTAAACTTTAATTCTAGGTTTAAAGCAAAA?????????TACAGAAGAAAAGTGTGGATAAATGGAAAGATGAGAGAAAGAGAGAAAAATAATATCAATGATATAAAATTCCAATATGTAAGGTCTACGAATCATCTCATAAAAGACAATGTAATAAAGCATCAATACT???AAGTCGATTCATCCATAATTGAAAATATTCAATGAATCCTTCTTATTT?????ATAGAATAGAAGAAGAAAATCAAGAGCTTCGAGCCAATAAAGACTAAGAAA?GTTGACTCAAGAATAAATTGATTATAAGCTCCGTTGTAGAATTCTGACCTAACCATTAAATACGAAGCGGTGGGAACGATGAAACCTGTGAATGCAAAAGATTTTTTTTGAACAAATGAATCTTATTGATTCACTAGTCGGGATGGCGAAATGAACCGGAAATCAATTCCTCTATTCTGAGAAGTCAGGAAGAAGCGCTACGACTGAAATAGAGATTG?CAAGAGTAAA?TATTCGCCTGCGAAAACTTTCTTTTTTT????ATTGGTAAACTTGTAGAAAGGACAAAATAAAAAAAA???GATTTATTAGAATAACTATT?ATTTA????????????????????TAAAATTTTTT?AGAAAACTGTTCTAATATCTATTCAAATTAATTT??????????AAATTCCATTTTGAATCC???????????TTTAATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCACGTCCAGTTTTGTAGTAGAGATGGAATTCCGAAACAACCATCAACTATAACCCC Mimulus_patulus ?????TGCG?ACGGGCTTGTC?GATCCCTGTTCGGGCAGCGACGGCAACTCGTGCTCGCCTCTTCAATCGTCGGTTCAAGCGTG???????CCTTGATCGATGTCGGTTTCCTGTGTTGCATACCTATTGTGGAGGTATCCCGCCGGTTAAAAGTGCCCCGTTCCGTCTTGCGTTGCGTCCTTTTCAAGGCTGCGGCGTGGGATGGACCATGAAG?ATTCGT?CGTGTTCCACATCCCAGACG????TAACTGTCCTCGGGTTGTTGGCCCACGGCGGCATGCTCGATCTTTCGGATGCGGAAAATTGAGTGGGTACGAGGCGTTTGCTCTCT?ATTTACCCCAAAACAA????GGCGTTTCACGCTCTATGCGAACGACTACCGTCGCCGTTGTGATCGAGTCCT?CGCGGCTCGCATCATGCGGTGCCGG?TGTCGG???????CGAAACCTGCAAAGCAGACCGCGAATTCGTGACTAAATA?CTCTGGGGAAG?CGGCG????CGGG?????????????????????????????TCTACCCGCCGATGCGCACGAAAGTGCGCACCGTGCGGACT?AACGTACCCCGGCGCGGAATGCGCCAAGGAAAACTCAA?CGAAGCG?TCCGCCCCCC?GTCGCCTCGTTCGCGACGTGCGCGGGGGTGCCGG?GCGTGTCTTGAATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATTGCGTCGCCCCC??TTCCCGCTCCATCGGGGCGGGAT?CGGGCG?CGGACATTGGTCTCCCGTGCGCTC?GCGCGCGCGGCTGGCCCAAATGAGATCCCTCGGCGATGCATGTCACGAGCAGTGGTGGTTGAATTCTCGACTCGCTTGCTGCAGTGCTTGACGGCATCGTCCGCTCGGGCATCACCAACGACCCAACGGCGCCCCTC??GGCGCCTTCGATT???TGAATTGAGCCTTGGTAT?GGAAACCTACTAAGTGATAACTTTCAAATTCA?AGAAACCCCGGAATTAAGAAAAACGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTCTTTTTTCAAAAGAAAGGTTTAGAAAACGAAAAAAAAAAA?GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGATGTTCTAACAAACGGAGTTGATTGCGTTGGTAGAGGAATCTTTCCATCGAAACTTCAGAAAGGATGAAGGATAAACGTATCTATTGTATATCAAATGATTAATGATAGCCTGAT??????ATCTGTATCTGTATTTTTTAATTTTAAGATGAAAAATGAAAGAATTGGTGTGAATTGATTCCACATTGAAGAAAGAATGAAATATTCATTCATCAAATAATTCACTCCATA?????GTCCAATAGATCTTTTAAAGAACTGCTTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCGTTCTACATGTCAATACCGGCAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCT?TATCCCCAAAAAAAGCCTAT?TTGACTCCAAAAATATTTATACTAC?CCCCTCCCCT?TTTTTCGTTAGCGGTTCCAAAGT?CCTTTATCTTTCTGATTCTTCGATAAACGTATTGGGGTGTAAATGACTATCTCTTATCACATGTGATATAGAATACACATCCAAATT?????????AAGCAAAGAATTCTTATTTTAATTTGAATGATTCAAAATCAGTAGCATTACTCTATTCATATTGAAACTTAGAAAGTCGTCTTTTTGAAGATCCAAGAAATTACAGGACTTGTAGAAAACTTTGTAATCCCCC????TTATCCCTTTAATTGACATAGACCCCAGTGCTCTAATAAAATGAGGATAGGGATGCTACATTGAGAATGTAGGGTTAGGATTCAAAAAAGACCAATCCCATAGTATCAAAACCAACTCATCACTTCGTATTATCTGAATCTAAAAAAACAGTCGAGATATGCTAAATTAG?TCATATCTTTGTAGCAACTGAAA??TTTTTTTCACTAAACTTTAATTCTAGGTTTAAAGCAAAA?????????TATAAAAGAAAAGTCTGGATAAATGGAAAGATGAGAGAAAGAGAGAAAAATAATATCAATGATATAAAATTCCAATATGTAAGGTCTACGAATCATCTCATAAAAGACAATGTAATAAAGCATCAATACT???AAGTCGATTCATCCATAATTGAAAATATTCAATGAATCCTTCTTGTTT?????ATCGAATAGAAGAAGAAAATCAAGAGCTTCGAGCCAATAAAGACTAAGAAAA?TTGACTCAAGAATAAATTGATTATAAGCTCCGTTGTAGAATTCTGACCTAACCATTAAATACGAAGCGGTGGGAACGATGAAACCTGTGAATGCAAAAGATTTTTTT?GAACAAATGAATCTTGTTGATTCACTAGTCGGGATGGCGAAATGAACCGGAAATCAATTCCTCTATTCTGAGAAGTCAGGAAGAAGCGCTACGACTGAAATAGAGATTG?C{AC}AGAGTAAA?TATTCGCCTGCGAAAACTTTC?TTTTTT????A{AT}TGG{GT}AAACTTGTAGAAAGGAC{AC}AAAGAAAAAAAAAAAGATTTATTAGAATAACTATT?ATTTA????????????????????TAAAATTTTTT?AGAAAACTGTTTTAATATCTATTCAAATTAATTT??????????AAATTCCATTTTGAATCC???????????TTTTATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCACGTCCAGTTTTGTAGTAGAGATGGAATTCCGAAACAACCATCAACTATAACCCC Mimulus_primuloides ????GTGCGTATGGGCATGTCGGATCCCTGCTCGGGCAGCGACGGCAT?TCGTTCGTGCCTCTTCATTTTTCGGTTCAAGTGTGCTGCTCACCTTGATCGAAGTCGGTTTCCTGTGTTGCATACCAGTTGTGGAGGTAATTGACCGG?TTAAA?TGTA?T?TTTCGTCCCGCG?TCCG?CCTTTCCAAGGTTGGTGCGTGGGGTGGACAAAGAAG?ATCCGT?CGTGTTCCACGCCCCAGACATCAGTG??TGTGCTTGGGTTGTTGGTGCACGGCGGCATGCTCGTGCTTTTGGATGCGGAAAATTGAGCGGGTACGAGGCATTTGTCCTCTTATATACCCC?GAAGAAA???TGCGTTTCACGCTCTCAGCGAA?GACGG?????????????????????????????????????????????????????????????????GAAGCCTGCAAA?CAGACCGCGAATTCGTGTTTAAGAA?CTGT?GGGG???CGGTTGCGTGGGGCCTGAAAAC?CCCGTGCGCTGCCGTCCCCTCCTCCCGCCAGAGCGCACGAAACTGCGCTCTGTGCGGGCT?AACGCACCCCGGCGCGGAACGCGCCAAGGAAAACTCAA?CGAATCG?TCCGCCCCC?TGTTGCCTCGTTCGCGAAGTGCGCGGGGGTGCGTG?ACGTGTCTTGAATGTCTAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCATTAGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATTGCGTCGCCCCC??TTCCCCCTCGCTCGAGGCCGGAT?GGGGTG?CGGATATTGGTCTCCCGTGCGCCCCGTGCGTGCGGCTGGCCCAAATGAGATCCCTCGGCGACGCACGTCACGAGCAGTGGTGGTTGAATTCTCGACTCGCTTGCTGCGTTGCTTGATGGCGTCGTCCGCTCGGGCATCACGAATGACCCAACGGTGCTGATC??GGCACCTTCGATT?????????????????????????????????????GATAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAAGAAAAGGGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTCGTTTTTCAAAAGAAAGGTTTAGAAAACGAAAAAAAAAAA?GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAATGGAGTTGACTGCGTTGGTAGAGGAATCTTTCCATTGAAACTTCAGAAAAGATGAAGGATAAACGTATCTATTGTATATCAAATGATTAATGATAGCCTGAA???????TCTGTATCTGTATTTTTT??????AAGATGAAAAATGAAAGAATTGGTGTGAATTGATTCCACATTGAAGAAAGAATCAAATATTCATTCATCAAATAATTTACTCCACA?????GTCCGATAGATCTTTTAAAGAATTGATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCGTTCTACATGTCAATACCGGCAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTTAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCACAAAAAGACTAT?TTGACTCCAAAAATATTTATCCTAT?CCCCT??????TTTTTCGTTAGTGGTTTCAAATT?CCTTTATCTTTCTGATTATTCGATAAATGGATTTGGGCGTAAATGACTATCTCTTATCACATGTGATATAGAATACACATTCAAATTAAGCAAATTAAGTAAAGAATTCCTAT??????TTGAATGATTCAAAATAAATAGCATTACTCGATTCATACTGAAACTTAGTATGTTGTCTTTTTGAAGATCCAAGAAATTAGAGGATTTGGAGAAAACTTTGTAATCCCCCC???GTATCCCTTTAATTGACATAGACCCCAGCCCTCTAATAAAATGAGGATAGGAATGCTACATTGAGAATGTAGA?T?AGGATTCAAAAAAGACTAACCCGGTAGTATAAAAACCAACTCATCACTTCTTATTATCTGGATATAAGAAACCAGTCGAGATATGCTAATATAGGTCATATCTTTGTAGCAACTGACAAATTTTTTTCAATAA?CTTTAATTCTAAGTTTAAAG?AAAA?????????TACAGAAGAAAAGTGTGGATAAATGGAAGGATGAGAGAAAGAGAGAAAAAGAATATCAATGATATAAAATTCCAATATGTAAGGTCTAGGAGTCATCTCATAAAATACAGTGTAATAAAGCATGAATATT???AAGT?GATTCATCCATAATT?AAAATATTCAATGAATCCTTC????????????TAGAATA??????AAAAATCAAGAGCTTCGAGCCAATAAAGACTAAGAAA?GTTGACTCAAGACTAAATTGATTATAAGCTCCATTGTAGAATTCTGACCTAACCATTAAATATGAAGCGGTGGGAACGATGAAACCTGTGAATGCAAAAGATTTCTTTT??CCAAATGAATCTTACTGATTCACTAATCGGGATGGCGAAATGAACCGGAAATCAATTCCTCTATTCTGAGAAGTCACGAAGAAGCGTTATGACTGAAATAGAGATTG?CAAGAGTAAA?TATTCGCCTGCGAAAACTTTATTTTTATTTTTATTGGTAAACTTGGAAAAAGGACAAAAGAAACTAAA???GATTTATTAGAATAACTAATCTATTCTTTATAAAA???????????TAAAATTTTTT?AGAAAAATGGTCTAATATCTATTCAAATTAC???AAATTAATTGAAATTCCATTTTGAATTC???????????TTTTATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCACGTCCAGTTTTGTAGTAGAGATGGAATTGTGAAACAACCATCAACTATAACCCC Mimulus_pulsiferae CTTGGTGCGTACGGGCTTGTCGGATCC?TGCTCGGGCAGCGACGGCAACTTGTGCGCGCCTTTTCAATCGTCGGTTCGAGTGTG???????CCTTAATCGATGTCGGTTTCCTGTGTTGCATACCTACTGTTGAGGTATCCTGCCCGTCAAAAGTGCCCCGTTCCGTCTTGCGTCGCGTCCTTTTCAAGGCTGCGGCGTGGGATGGACCATGAAG?ATTCGT?CGTGTTCCACATCCCAGACG????TAACTGTCCTCGGTTTGTTGGCCCACGGCGGCATGCTCGATCTTTCGGATGCGGAAAATTGAGTGGGTACGAGGCGTTTGCTCTCT?ATTTACCCC????GAAAAA?GGCGTTTCACGCTCTATGCGAACGACGACCGTCGTCGTTGTGATCGAGTCCT?TGCGGCTTGCATCATGCGGTGCCGG?TGTCGGTAAGGAACGAAACCTGCAAAGCAGACCGCGAATTCGTGACTAAATG?CCCTGGGGAGG?CGGCG????CGGG?????????????????????????????TCTCCCCGCCGGTGCGCACGAAACTGCGCACCGTGCGGACT?AACGTACCCCGGCGCGGAATGCGCCAAGGAAAACTCAA?CGAAGCG?TCCGCCCCCC?GTTGCCTCGTCCGCGACGTGCGCGGGGGTGCCGG?GCGTGTCTTGAATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATTGCGTCGCCCCC??TTCTCGCTCCATCCGGGCGGGAT?CGGGCG?CGGATATTGGTCTCCCGTGCGCTC?GCGCGCGCGGCTGGCCCAAATGAGATCCCTCGGCGATGCATGTCACGAGCAGTGGTGGTTGAATTCTCGACTCGCTTGCTGCAGTGCTTGACGGCGTCGTCCGCTCGGGAATCACCAACGACCCAACGGCGCCCCAT??GGCGCCTTCGATT??????????????TTGGTAT?GGAAACCTACTAAGTGATAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAAGAAAAACGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTCTTTTTTCAAAAGAAAGGTTTAGAAAACGAAAAAAAAAAA?GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGATATTCTAACAAATGGAGTTGATTGCGTTGGTAGAGGAATCTTTCCATCGAAACTTCAGA??????GAAGGATAAACGTATCTATTGTATATCAAATGATTAATGATAGCCTGAT??????ATCTGTATCTGTATTTTTTAATTTTAAGATGAAAAATGAAAGAATTGGTGTGAATTGATTCCACATTGAAGAAAGAATGAAATATTCATTCATCAAATCATTCACTCCATA?????GTCCAATAGATCTTTTAAAGAACTGCGTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCGTTCTACATGTCAATACCGGCAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCT?TATCCCCAAAAAAAGCCTAT?TTGACTCCAAAAATATTTATACTAT?CCGCTCCCCC?TTTTTCGTTAGCGGTTCCAAAGT?CCTTTATCTTTCTGATTCTTCGATAAACGTATTGGGGTGTAAATGACTATCTCTTATCACATGTGATATAGAATACACATCCAAATT?????????AAGCAATTAATTCCTATTTTAATTTGAATGATTCAAAATCAATAGCATTACTCTATTCATATTGAAACTTAGAAAGTCGTCTTTTTGAAGATCCAAGAAATTACAGGACTTGTAGAAAACTTTGTAATCCCCCC???TTATCCCTTTAATTGACATAGACCCCAGTGCTCTAATAAAATGAGGATAGGGATGCTACATTGAGAATGTAGGGTTAGGATTCAAAAAAGACCAACCCCATAGTATCAAAACCAACTCATCACTTCGTATTATCTGGATCTAAAAAAACAGTCGAGATATGCTAAATTAG?TCATATCTTTGTAGCAACTGAAA??TTTTTTTCACTAAACTTTTATTTTAGGTTTAAAGCAAAA?????????TACAGAAGAAAAGTGTGGATAAATGGAAAGAGGAGAGAAAGAGAGAAAAATAATATCAATGATATAAAATTCCAATATGTAAGGTCTACGAATCATCTCATAAAAGACAATGTAATAAAGCATCAATACT???AAGTCGATTCATCCATAATTGAAAATATTCAATGAATCCTTCTTATTTTATTTATAGAATAGAAGAAGAAAATCAAGAGCTTCGAGCCAATAAAGACTAAGAAA?GTTGACTCAAGAATAAATTGATTATAAGCTCCGTTGTAGAATTCTGACCTAACCATTAAATACGAAGCGGTGGGAACGATGAAACCTGTGAATGCAAAAGATTTTTTT?GAACAAATGAATCTTATTGATTCACTAGTCGGGATGGCGAAATGAACCGGAAATCAATTCCTCTATTCTGAGAAGTCAGGAAGAAGCGCTACGGCTGAAATAGAGATTG?CAAGAGTAAA?TATTCGCCTGCGAAAACTTTCTTTTTTT????ATTGGTAAACTTGTAGAAAGGACAAAAGAAAAAAA????GATTTATTAGAATAACTATT?ATTTA????????????????????TAAAATTTTTT?ATAAAACTGTTCTAATATCTATTCAAATTAATTT??????????AAATTCCATTTTGAATCC???????????TTTAATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCACGTCCAGTTTTGTAGTAGAGATGGAATTCCGAAACAACCATCAACTATAACCCC Mimulus_tenellus CTTGGTGCG?ACGGGCTTGTCGGATCCCTGCTCGGGCAGCGACGGCAGCCTGTGCGCGCCTTTTCAATCGTCGGTTCAAGTGTG???????CCTTGATCGATGTCGGTTTCCTGTGTTGCATACCTATTGTGGAGGTATTCTGCCGGCTAAAAGTGGCCCGTTTCGTCCTGCGTTGCATTCTTTTCAAGGCTGCGGCGTGGGATGGACCATGAAG?ATTCGT?CGTGTTCCACATCCCAGACG????TAACTGTCCTCGGGTTGTTGGCCCACGGTGGCATGCTCGATCTTTCGGATGCGGAAAATTGAGTGGGTAGGAGGCGTTTGCTCTCT?ATTTACCCC??AAAAAAA??GGCGTTTCACGCTCTATGCGAACGACGACCGTCGCCGTTGTGATCGAGTCCT?TGCGGCTTGCATCAAGCGGTGCCGG?TGTCGGTAAGGAA?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GCCGCC{CT}C?{CT}CC?CC?GCCGATGCGCACGAAACTGCG{CT}A{CT}CGTGCGGACT?AACGTACCCCGGCGCGGAA{CT}GCGCCAAGGAAAACTCAA?CGAAGCG?TCCGCCCCCC?GTTGCCTCGTTCGCGGCGTGCGC?GGGGTGCCGG?ACGTGTCTTGAAT{GT}TCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCAT{CG}GATGAAGAACG?AGC?AAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAAC?ATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATTGCGTCGCCCCC??TTCTCGCTCCGTCGGGGCGGGAT?CGGGCG?CGGATATTGGTCTCCCGTGCGCTC?GCGCGCGCGGCTGGCCCAAATGAGATCCCTCGGCGATGCATGTCACGAGCAGTGGTGGTTGAATTCTCGACTCGCTTGCTGTAATGCTTGATGGCATCGTCCGCTCGGGCATCACCAACGACCCAACGGCGCCCCTT??GGCGCCTTCGATT???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Mimulus_washingtonensis ???GG?GCGTACGGGCTTGTCGGATCCCTGCTCGGGCAGCGACGGCAACTCGTGCTCGCCTCTTCAATCGTCGGTTCAATCGTG???????CCTTGATCGATGTCGGTTTCCTGTGTTGCATACCTATTGTGGAGGTATCCTGCCGGTTAAAAGTGCCCCGCTCCGTCTTGCGTTGCGTCCTTTTCAAGGCCGCGGCGTGGGATGGACCATGAAG?ATTCGT?TGTGTTCCACATCCCAGACG????TAACTGTCCTCGGGTTGTTGGCCCACGGCGGCATGCTCGATCTCTCGGATGCGGAAAATTGTGTGGGTACGAGGCGTTTGCTCTCT?ATTTACCCC????GAAAAAAGGCGTTTCACGCTCTATGCGAACGACTACCGTCGCCGTTGTGATCGAGTCCT?TGCGGCTTGCATCATGCGGTGCCGG?TGTCTGTAAGGAACGAAACCTGCAGAGCAGACCGCGAATTCGTGATTAAATA?CTCTGGGGATG?CGGCG????CGGG?????????????????????????????TCTCCCCGCCGGTGCGCACGAAACTGCGCACCGTGCGGGCT?AACGTACCCCGGCGCGGAATGCGCCAAGGAAAACTCAA?CGAAGCG?TCCGCCCCCC?GTTGCCTCGTTCGCGACGTGCGCGGGGGTGCCGG?GCGTGTCTTGAATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACGCATTGCGTCGCCCCC??TTCTCGCTCCA?CGGGGCGGGAT?CGGGCG?CGGATATTGGTCTCCCGTGCGCTC?GCGCGCGCGGCTGGCCCAAATGAGATCCCTCGGCGATGCATGTCACGAGCAGTGGTGGTTGAATTCTCGACTCGCTTGCTGCGATGCTTGACTGCACCGTCCGCTCGGGCATCACCAACGACCCAACGGCGCCCCACGAGGCGCCTTCGATT?ATTGAATTGAGCCTTGGTAT?GGAAACCTACTAAGTGATAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAAGAAAAACGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTCTTTTTTCAAAAGAAAGGTTTAGAAAACGAAAAAAAAAAAAGGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGATGTTCTAACAAATGGAGTTGATTGCGTTGGTAGAGGAATCTTTCCATCGAAACTTCAGAAAGGATGAAGGATAAACGTATCTATTGTATATCAAATGATTAATGATAGCCTGAT??????ATCTGTATCTGTATTTTTTAATTTTAAGATGAAAAATGAAAGAATTGGTGTGAATTGATTCCACATTGAAGAAAGAATGAAATATTCATTCATCAAATCATTCACTCCATA?????GTCCAATAGATCTTTTAAAGAACTGCTTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCGTT?TACATGTCAATACCGGCAACAATGAAATTT?TAGTAAGAGGAAAA?CCGTCGACTTTAAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCAAAAAAAGCCTAT?TTGAC?CCAAAAATATTTATACTAT?CCCCGCCCCT?TTTT?CGTTAGCGGTTCCAAAGT?CCTTTATCTTTCTGATTCTTCGATAAACGTATTGGGGCGTAAATGACTATCTCTTATCACATGTGATATAGAATACACATCCAAATT?????????AAGCAAAGAATTCCTATTTTAATTTGAATGATTCAAAATCAATAGCATTACTCTATTCATATTGAAACTTAGAAAGTCTTCTTTTTGAAGATCCAAGAAATTACAGGACTTGTAGAAAACTTTGTAATCCCCCC???TTATCCCTTTAATTGACATAGACCCCAGTGCTCTAATAAAATGAGGATAGGGATGCTACATTGAGAATGTAGGGTTAGGATTCAAAAAAGACCAACCCCGTAGTATCAAAACCAACTCATCACTTCGTATTATCTGGATCTAAAAAAACAGTCGAGATATGCTAAATTAG?TCATATCTTTGTAGCAACTGAAC??TTTTTTTCACTAAACTTTAATTCTAGGTTTAAAGCAAAA?????????TACAGAAGAAAAGTGTGGATAAATGGAAAGATGAGAGAAAGAGAGAAAAATAATATCAATGATATAAAATTCCAATATGTAAGGTCTACGAATCATCTCATAAAAGACAATGTAATAAAGCATCAATACT???GAGTCGATTCATCCATAATTGAAAATATTCAATGAATCCTTCTTATTT?????ATAGAATAGAAGAAGAAAATCAAGAGCTTCGAGCCAATAAAGACTAAGAAA?GTTGACTCAAGAATAAATTGATTATAAGCTCCGTTGTAGAATTCTGACCTAACCATTAAATACGAGGCGGTGGGAACGATGAAACCTGTGAATGCAAAAGATTTTTTT?GAACAAATGAATCTTATTGATTCACTAGTCGGGATGGCGAAATGAACCGGAAATCAATTCCTCTATTCTGAGAAGTCAGGAAGAAGCGCTACGACTGAAATAGAGATTG?CAAGAGTAAA?TATTCGCCTGCGAAAACTTTCTTTTTTT????ATTGGTAAACTTGTAGAAAGGACAAAAGAAAAAAAA???GATTTATTAGAATAACTATT?ATTTC????????????????????TAAAATTTTTT?AGAAAACTGTTCTAATATGTATTCAAATTAATTT??????????AAATTCCATTTTGAATTC???????????TTTAATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCACGTCCAGTTTTGTAGTAGAGATGGAATTCCGAAACAACCATCAACTATAACCCC ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = mimulus_moschatus_molecular_matrix) = N: 1-2947; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = mimulus_moschatus_molecular_matrix) = N: 1-2947; END; [ The following blocks are output data for analysis step 2622 ] BEGIN TREES; TITLE Tb7397; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep2622; TREE combomol.ML = [&R] (Mimulus_bicolor,(Mimulus_lewisii,(Mimulus_primuloides,(((((((((Mimulus_ampliatus,Mimulus_hymenophyllus),Mimulus_patulus),(Mimulus_breviflorus,(Mimulus_jungermannioides,Mimulus_washingtonensis))),((Mimulus_pulsiferae,(((Mimulus_floribundus_OR,Mimulus_floribundus_CO),Mimulus_norrisii),Mimulus_dudleyi)),Mimulus_moschatus)),Mimulus_latidens),((Mimulus_tenellus,Mimulus_nepalensis),Mimulus_bodinieri)),(Mimulus_guttatus_OR,Mimulus_guttatus_CA)),Mimulus_dentatus),Mimulus_alsinoides)))); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr311] END; BEGIN TREES; TITLE Tb7397; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep2622; TREE Fig.3b = [&R] (Mimulus_bicolor,(Mimulus_lewisii,(Mimulus_primuloides,((((((Mimulus_ampliatus,(Mimulus_hymenophyllus,Mimulus_patulus)),(Mimulus_pulsiferae,(Mimulus_breviflorus,Mimulus_moschatus),(Mimulus_jungermannioides,Mimulus_washingtonensis))),(((Mimulus_floribundus_OR,Mimulus_floribundus_CO),Mimulus_norrisii),Mimulus_dudleyi)),(Mimulus_latidens,(Mimulus_tenellus,(Mimulus_nepalensis,Mimulus_bodinieri)))),(Mimulus_guttatus_OR,Mimulus_guttatus_CA)),(Mimulus_dentatus,Mimulus_alsinoides))))); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr315] END; BEGIN TREES; TITLE Tb7397; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep2622; TREE Fig.3a = [&R] (Mimulus_bicolor,(Mimulus_lewisii,(Mimulus_primuloides,(((((((Mimulus_ampliatus,Mimulus_hymenophyllus,Mimulus_patulus),(Mimulus_breviflorus,(Mimulus_jungermannioides,Mimulus_washingtonensis))),((Mimulus_pulsiferae,Mimulus_moschatus),(((Mimulus_floribundus_OR,Mimulus_floribundus_CO),Mimulus_norrisii),Mimulus_dudleyi))),Mimulus_latidens),(Mimulus_tenellus,Mimulus_nepalensis),Mimulus_bodinieri),(Mimulus_guttatus_OR,Mimulus_guttatus_CA)),(Mimulus_dentatus,Mimulus_alsinoides))))); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr316] END; BEGIN TREES; TITLE Tb7397; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep2622; TREE RPL.ML = [&R] (Mimulus_bicolor,(Mimulus_lewisii,(Mimulus_primuloides,(((((Mimulus_ampliatus,Mimulus_hymenophyllus),Mimulus_patulus),(((Mimulus_pulsiferae,Mimulus_floribundus_OR),Mimulus_norrisii,Mimulus_dudleyi),(Mimulus_breviflorus,Mimulus_jungermannioides,Mimulus_washingtonensis)),Mimulus_moschatus),(Mimulus_latidens,(Mimulus_dentatus,Mimulus_guttatus_OR))),Mimulus_alsinoides)),Mimulus_floribundus_CO,Mimulus_tenellus,Mimulus_nepalensis,Mimulus_guttatus_CA,Mimulus_bodinieri)); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr312] END; BEGIN TREES; TITLE Tb7397; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep2622; TREE Fig.3c = [&R] (Mimulus_bicolor,(Mimulus_lewisii,(Mimulus_primuloides,(((((((Mimulus_ampliatus,Mimulus_hymenophyllus),Mimulus_patulus),((Mimulus_pulsiferae,Mimulus_floribundus_OR,(Mimulus_norrisii,Mimulus_floribundus_CO),Mimulus_dudleyi),Mimulus_breviflorus,Mimulus_moschatus),Mimulus_jungermannioides,Mimulus_washingtonensis),Mimulus_nepalensis),Mimulus_latidens),(Mimulus_guttatus_OR,Mimulus_guttatus_CA)),Mimulus_alsinoides)),Mimulus_dentatus,Mimulus_tenellus,Mimulus_bodinieri)); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr314] END; BEGIN TREES; TITLE Tb7397; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep2622; TREE Fig.3d = [&R] (Mimulus_bicolor,(Mimulus_lewisii,(Mimulus_primuloides,(((((Mimulus_ampliatus,Mimulus_hymenophyllus),Mimulus_patulus),Mimulus_pulsiferae,(Mimulus_breviflorus,Mimulus_jungermannioides,Mimulus_washingtonensis),Mimulus_moschatus,Mimulus_floribundus_OR,Mimulus_norrisii,Mimulus_dudleyi),(Mimulus_latidens,(Mimulus_dentatus,Mimulus_guttatus_OR))),Mimulus_alsinoides)),Mimulus_floribundus_CO,Mimulus_tenellus,Mimulus_nepalensis,Mimulus_guttatus_CA,Mimulus_bodinieri)); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr313] END;