#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on June 15, 2026; 9:44 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Delfini C., Acosta J.M., Souza V.C., & Zuloaga F.O. 2020. Molecular Phylogeny of Axonopus (Poaceae, Panicoideae, Paspaleae): Monophyly, Synapomorphies, and Taxonomic Implications for Infrageneric Classification and Species Complexes. Annals of the Missouri Botanical Garden, 105(4): 459-480. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S26628] [ The following blocks are input data for analysis step 26924 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep26924; DIMENSIONS NTAX=51; TAXLABELS Anthaenantia_lanata Anthaenantiopsis_rojasiana Axonopus_affinis Axonopus_anceps Axonopus_andinus Axonopus_apricus Axonopus_arcuatus Axonopus_argentinus Axonopus_aureus Axonopus_bryoides Axonopus_canescens Axonopus_capillaris Axonopus_centralis Axonopus_chrysoblepharis Axonopus_comans Axonopus_compressus Axonopus_conduplicatus Axonopus_cuatrecasasii Axonopus_eminens Axonopus_fastigiatus Axonopus_fissifolius Axonopus_flabelliformis Axonopus_furcatus Axonopus_hirsutus Axonopus_hydrolithicus Axonopus_kuhlmannii Axonopus_laxiflorus Axonopus_leptostachyus Axonopus_marginatus Axonopus_mathewsii Axonopus_micay Axonopus_monticola Axonopus_obtusifolius Axonopus_pellitus Axonopus_pennellii Axonopus_poiophyllus Axonopus_polystachyus Axonopus_pressus Axonopus_purpusii Axonopus_scoparius Axonopus_siccus Axonopus_singularis Axonopus_suffultus Axonopus_tenuis Ichnanthus_pallens Ocellochloa_stolonifera Paspalum_acuminatum Paspalum_notatum Plagiantha_tenella Steinchisma_laxum Streptostachys_asperifolia ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M55228] TITLE 'Axonopus ML matrix (plastid)'; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep26924; DIMENSIONS NCHAR=3020; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Axonopus_andinus GGACTTTTTCTTATTCCGACAGCAACAAAAAATCTTCGTCGCATATGGGCTTTTCCTAGTATTTTACTCTTAAGTATAGCTATGGTATTCTCAGTTTACCTGTCTATTGAACAAATAAATGGAAGTTCTATCTATCAATATCTATGGTCTTGGACCATCAATAATGATTTTTCCTTAGAATTTGGATACTTGATCGACCCCCTTACGTCTATTATGTTAATACTAATTACTACTGTAGGAATCTTGGTTCTTATTTATAGTGACGATTATATGTCTCACGATGAAGGATATTTGAGATTTTTTGTTTATATAAGTTTTTTTAATACTTCCATGTTGGGATTGGTTACTAGTTCCAATTTGATACAAATTTATTTTTTTTGGGAACTTATTGGAATGTGTTCCTATTTATTGATAGGCTTTTGGTTTACACGGCCAATTGCAGCAAGTGCTTGTCAAAAAGCTTTTGTAACTAATCGTGTAGGGGATTTTGGTCTGTTATTAGGAATTTTAGGCTTTTTTTGGATAACGGGTAGTTTAGAGTTTCGGGATTTGTTCAAAATAGCTAATAACTGGATTCCTAATAATGGGATTAATTCCTTACTTACTACTTTGTGTGCTTTTTTATTATTCCTTGGTGCAGTTGCAAAATCTGCACAATTCCCTCTTCACGTATGGTTACCCGATGCTATGGAGGGACCCACTCCCATTTCGGCTCTTATACACGCAGCAACTATGGTTGCCGCGGGGATTTTTCTTTTAGCTCGACTTCTTCCTCTTTTCATATCCCTACCCTTGATAATGAATTTTATTTCTTTAGTAGGTACAATAACACTCTTCTTAGGAGCCACTTTAGCTCTTGCTCCGAGAGATATTAAAAAAAGTT?????????????????????????????????????????????????????????????TC?AGCTGCTTTA?TCCAT?TGATCACACATGCTTATTCGATAGCTTTATTGTTCTTAGAATCAGGATCCGTTATTCATTCAATGGAACCTCTTGTTGGATATTCACCAGATAAAAGTCAGAATATGGTTCTTATGGGCGGTTTAAGAAAATACATTCCAATTACAAGAACTACTTTTTTATGTGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCGCCTCTTGCTTGCTTCTGGTCCAAAGATGAAATCCTTAGTAATAGTTGGTTGTATTCACCCTTTTTTGGAATAATAGCCTCTTTTACTGCAGGATTAACTGCATTTTATATGTTTCGGATATATTTACTTACTTTTGATGGATATTTGCGTGTTCATTTTCAAAATTACAGCAGTACTAAAGAAGGTTCGTTGTATTCAATATCCTTATGGGGAAAAAGTATATCCAAAGGAGTCAATAGGGATTTTGTTTTATCAACAACGAAGAGTGGAGTTTCTTTTTTTTCACAAAATATGCCTAAAATTCCTCGTAATACAAGAAAAAAAATGGGATCCTTTAGTACTCCCTTTGGGTTTGGGGCTAAAAACACTTTTGTCTATCCTCATGAAACGGGAAATACTATGCTATATCCTCTTC?TATA?TACTGCTTTTTACTTTGTT???CACAGGATCCATAGGAATCCATTTTGATAATGGAGTAAAGGATAATGCAATATCGGAGTTAACTATATTATCAAAGTGGTTAACTCCTTCGATAAACTCTTTCTGGGAAAGTTCTAATTCTTCCATAAATTCCTATGAATTTATCACTAATGCAATTTATTCTGTAAGTTTAGCAATTTTGGGTCTATTCATAGCATATATTTTCTATGGATCCGCTTATTATTTTTTTCAGAATTTGAATTTCCAAAATTCCCTTGGAAAAATAAAAAGGAATCCAAAAAATAACTT??????TTTGGATGAAGTAAAAAAAAAGATATACAGCTGGTCATATAATCGTGGTTATATAGATATTTTCTATACTAGGGTATTCGTCCTAGGTATAAGAAGATTAGCGGAACTAACACATTTTTTCGATA??????????TG??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Axonopus_apricus GGACTTTTTCTTATTCCGACAGCAACAAAAAATCTTCGTCGCATATGGGCTTTTCCTAGTATTTTACTCTTAAGTATAGCTATGGTATTCTCAGTTTACCTCTCTATTGAACAAATAAATGGAAGTTCTATCTATCAATATCTATGGTCTTGGACCATCAATAATGATTTTTCCTTAGAATTTGGATACTTGATCGACCCCCTTACGTCTATTATGTTAATACTAATTACTACTGTAGGAATCTTGGTTCTTATTTATAGTGACGATTATATGTCTCACGATGAAGGATATTTGAGATTTTTTGTTTATATAAGTTTTTTTAATACTTCCATGTTGGGATTGGTTACTAGTTCCAATTTGATACAAATTTATTTTTTTTGGGAACTTATTGGAATGTGTTCCTATTTATTGATAGGCTTTTGGTTTACACGGCCAATTGCAGCGAGTGCTTGTCAAAAAGCTTTTGTAACTAATCGTGTAGGGGATTTTGGTCTGTTATTAGGAATTTTAGGCTTTTTTTGGATAACGGGTAGTTTAGAGTTTCGGGATTTGTTCAAAATAGCTAATAACTGGATTCCTAATAATGGGATTAATTCCTTACTTACTACTTTGTGTGCTTTTTTATTATTCCTTGGTGCAGTTGCAAAATCTGCACAATTCCCTCTTCACGTATGGTTACCCGATGCTATGGAGGGACCCACTCCCATTTCGGCTCTTATACACGCAGCAACTATGGTTGCCGCGGGGATTTTTCTTTTAGCTCGACTTCTTCCTCTTTTCATATCCCTACCCTTGATAATGAATTTTATTTCTTTAGTAGGTACAATAACACTCTTCTTAGGAGCCACTTTAGCTCTTGCTCAGAGAGATATTAAAAGAAGTTTAGCCTATTCTACAATGTC???????????????????????????????????????????????????TTTATTCCATTTGATCACTCATGCTTATTCGAAAGCTTTATTGTTCTTAGGATCAGGATCCGTTATTCATTCAATGGAACCTCTTGTTGGATATTCACCAGATAAAAGTCAGAATATGGTTCTTATGGGCGGTTTAAGAAAATACATTCCAATTACAAGAACTACTTTTTTATGTGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCTTGCTTGCTTCTGGTCCAAAGATGAAATCCTTAGTAATAGTTGGTTGTATTCACCCTTTTTTGGAATAATAGCCTCTTTTACTGCAGGATTAACTGCATTTTATATGTTTCGGATATATTTACTTACTTTTGATGGATATTTGCGTGTTCATTTTCAAAATTACAGCAGTACTAAAGAAGGTTCGTTGTATTCAATATCCTTATGGGGAAAAAGTATATCCAAAGGAGTCAATAGGGATTTTGTTTTATCAACAACGAAGAGTGGAGTTTCTTTTTTTTCAGAAAATATGCCTAAAATTCCTCGTAATACAAGAAATAAAATGGGATCCTTTAGTACTCCCTTTGGGTTTGGGGCTAAAAACACTTTTGTCTATCCTCATGAAACGGGAAATACTATGCTATATCCTCTTCTTATATTACTGCTTTTTACTTTGTT???CATTGGATCCATAGGAATCCATTTTGATAATGGAGTAAAGGATAATGCAATATCGGAGTTAACTATATTATCAAAGTGGTTAACTCCTTCGATAAACTTTTTCTGGGAAAGTTCTAATTCTTCCATAAATTCCTATGAATTTCTCACTAATGCAATTTATTCTGTAAGTTTAGCAATTTTGGGTCTATTCATAGCATATATTTTCTATGGATCCGCTTATTATTTTTTTCAGAATTTGAATTTCCAAAATTCCCTTGGAAAAATAAAAAGGAATCCAAAAAATAACTT??????TTTGGATGAAGTAAAAAAAAAGATATACAGCTGGTCATATAATCGTGGTTATATAGATATTTTCTATACTAGGGTATTCATCCTAGGTATAAGAAGATTAGCAGAACTAACACATTTTTTCGATAAAGGCGTCATTGATGGAATT?GAGAAACCCTGG?AATGAAAAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCCTTTTTTTAA?AAACAAGTGGTTCTCAAACTGAAACCCAAAGGAAAAGGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACGAATCGAAGTAAT?ACGTTGTGTTGGTAGTGGAACCTCCTCGAAATTAGAGAAAGAGGGGCTTTATACATCTAATACACACGCATATATACTTACATAGCAAACGATTAATCACAGAACCCATATCATAATATAGGTTCTTTATTTTATTTT????TT?GAATGAAATTAGGAATGATTATGAA?????ATAGAAAATTCTGAATTTTTTT?AGAATTATTGTGAATCCATTTCAATCGAATATTAAGTAATCAAATCCTTCAATTCATTATTTTGTTTTAGAGATCTTAAA?????AAAAGTGGATTAATCGGACGAGGATAAAGAGAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACTGACAATAATGAAATTTCTAGTAAAAGGAAAATCCGTCGACTTTATAAGTCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCAAACC?????CTCTTT?????????????????TATTCCCTAACCATAG??????????TAGTTATCCTTTTTTTTCT????TTTACTTTTATCAAT?GGGTTTAACATTCATTAGCTTTCTCATTCTACTCTTTCACAAAGGAGTGCGACGAGAACTCAATGAATCTTATGCTATTCATTAAATGGATGGTTTCTTTTTTATT?????AGAGTAGAGTATCGGCAAGGAATCTCGATTATTAATTCGATTTTT?????AAGTATTATTAAGTAAGCCATCCACAATGTATAGGACTACCCC?TCCCCATTTCCAAATTTGGAATACTTTATTTA?ATTA??TTTAATTTATTTTTT?????CTTTAATTGACATA?GATGCAAATACTCTACTAAG?ATGATGCACAAGAAAGGGTCAGGATA? Axonopus_arcuatus GGACTTTTTCTTATTCCGACAGCAACAAAAAATCTTCGTCGCATATGGGCTTTTCCTAGTATTTTACTCTTAAGTATAGCTATGGTATTCTCAGTTTACCTGTCTATTGAACAAATAAATGGAAGTTCTATCTATCAATATCTATGGTCTTGGACCATCAATAATGATTTTTCCTTAGAATTTGGATACTTGATCGACCCCCTTACGTCTATTATGTTAATACTAATTACTACTGTAGGAATCTTGGTTCTTATTTATAGTGACGATTATATGTCTCACGATGAAGGATATTTGAGATTTTTTGTTTATATAAGTTTTTTTAATACTTCCATGTTGGGATTGGTTACTAGTTCCAATTTGATACAAATTTATTTTTTTTGGGAACTTATTGGAATGTGTTCCTATTTATTGATAGGCTTTTGGTTTACACGGCCAATTGCAGCGAGTGCTTGTCAAAAAGCTTTTGTAACTAATCGTGTAGGGGATTTTGGTCTGTTATTAGGAATTTTAGGCTTTTTTTGGATAACGGGTAGTTTAGAGTTTCGGGATTTGTTCAAAATAGCTAATAACTGGATTCCTAATAATGGGATTAATTCCTTACTTACTACTTTGTGTGCTTTTTTATTATTCCTTGGTGCAGTTGCAAAATCCGCACAATTCCCTCTTCACGTATGGTTACCCGATGCTATGGAGGGACCCACTCCCATTTCGGCTCTTATACACGCAGCAACTATGGTTGCCGCGGGGATTTTTCTTTTAGCTCGACTTCTTCCTCTTTTCATATCCCTACCCTTGATAATGAATTTTATTTCTTTAGTAGGTACAATAACACTCTTCTTAGGAGCCACTTTAGCTCTTGCTCAGAGAGATATTAAAAGAAGTTTAGCCTATTCTACAA???????????????????????????????????????????????????????TTTATTCCATTTGATCACTCATGCTTATTCGAAAGCTTTATTGTTCTTAGGATCAGGATCCGTTATTCATTCAATGGAACCTCTTGTTGGATATTCACCAGATAAAAGTCAGAATATGGTTCTTATGGGCGGTTTAAGAAAATACATTCCAATTACAAGAACTACTTTTTTATGTGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCTTGCTTGCTTCTGGTCCAAAGATGAAATCCTTAGTAATAGTTGGTTGTATTCACCCTTTTTTGGAATAATAGCCTCTTTTACTGCAGGATTAACTGCATTTTATATGTTTCGGATATATTTACTTACTTTTGATGGATATTTGCGTGTTCATTTTCAAAATTACAGCAGTACTAAAGAAGGTTCGTTGTATTCAATATCCTTATGGGGAAAAAGTATATCCAAAGGAGTCAATAGGGATTTTGTTTTATCAACAACGAAGAGTGGAGTTTCTTTTTTTTCACAAAATATGCCTAAAATTCCTCGTAATACAAGAAATAAAATGGGATCCTTTAGTACTCCCTTTGGGTTTGGGGCTAAAAACACTTTTGTCTATCCTCATGAAACGGGAAATACTATGCTATATCCTCTTCTTATATTACTGCTTTTTACTTT?TT???CATTGGATCCATAGGAATCCATTTTGATAATGGAGTAAAGGATAATGCAATATCGGAGTTAACTATATTATCAAAGTGGTTAACTCCTTCGATAAACTTTTTCTGGGAAAGTTCTAATTCTTCCATAAATTCCTATGAATTTCTCACTAATGCAATTTATTCTGTAAGTTTAGCAATTTTGGGTCTATTCATAGCATATATTTTCTATGGATCCGCTTATTATTTTTTTCAGAATTTGAATTTCCAAAATTCCCTTGGAAAAATAAAAAGGAATCCAAAAAATAACTT??????TTTGGATGAAGTAAAAAAAAAGATATACAGCTGGTCATATAATCGTGGTTATATAGATATTTTCTATACTAGGGTATTCATCCTAGGTATAAGAAGATTAGCAGAACTAACACATTTTTTCGATAAAGGCGTCATTGATGGAATT?GAGAAACCCTGG?AATGAAAAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCCTTTTTTTAA?AAACAAGTGGTTCTCAAACTAGAACCCAAAGGAAAAGGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACGAATCGAAGTAAT?ACGTTGTGTTGGTAGTGGAACCTCTTCGAAATTAGAGAAAGAAGGGCTTTATACATCTAATACACACGCATATATACTGACATAGCAAACGATTAATCACAGAACCCATATCATAATATAGGTTCTTTATTTTTTTTT????TT?GAATGAAATTAGGAATGATTATGAA?????ATAGAAAATTCTGAATTTTTTT?AGAATTATTGTGAATCCATTTCAATCGAATATTAAGTAATCAAATCCTTCAATTCATTATTTTGTTTTAGAGATCTTAAA?????AAAAGTGGATTAATCGGACGAGGATAAAGAGAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACTGACAATAATGAAATTTCTAGTAAAAGGAAAATCCGTCGACTTTATAAGTCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCAAACC?????CTCTTT?????????????????TATTCCCTAACCATAG??????????TAGTTATCCTTTTTTTTCT????TTTACTTTTATCAAT?GGGTTTAACATTCATTAGCTTTCTCATTCTACTCTTTCACAAAGGAGTGCGACGAGAACTCAATGAATCTTATGCTATTCATTAAATAGATGGTTTCTTTTTTATT?????AGAGTAGAGTATCGGCAAGGAATCTCGATTATAAATTCGATTTTT?????AAGTATTATTAAGTAAGCCATCCACAATGTATAGGACTACCCCCTCCCCATTTCCAAATTTGGAATACTTTATTTA?AATAA?TTTAATTTATTTTTT?????CTTTAATTGACATAAGATGCAAATACTCTACTAAGGATGATGCCCAAGAAAGGGTCAGGGTA? 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; END; [ The following blocks are output data for analysis step 26924 ] BEGIN TREES; TITLE Axonopus_plastid_MLT; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep26924; TREE 'ML tree_plastid' = [&R] (Anthaenantia_lanata:0.008661399037363127,((Steinchisma_laxum:0.007158357163647943,Plagiantha_tenella:0.00542480563766435):0.004314089761586322,((Ocellochloa_stolonifera:0.008952806749197816,Ichnanthus_pallens:0.008495463619723947):0.001188809122403052,((Anthaenantiopsis_rojasiana:0.008136286652257577,(Paspalum_notatum:0.005364911491070622,Paspalum_acuminatum:0.0047346859553613375):0.0030941116793050567):0.006872504011425085,(Streptostachys_asperifolia:0.008437619866712112,(Axonopus_tenuis:0.024834266639512652,((Axonopus_arcuatus:0.0021391157102417097,(Axonopus_centralis:0.0016312955433757,Axonopus_affinis:1.0000005000281E-6):7.067516449517398E-4):3.7093814245414E-4,(Axonopus_anceps:1.0000005000281E-6,(Axonopus_furcatus:0.002845244494905922,(Axonopus_compressus:0.001636857950898886,(Axonopus_obtusifolius:0.0031433697752617715,(((Axonopus_laxiflorus:0.001960932333036538,(Axonopus_leptostachyus:1.00000050003157E-6,(Axonopus_andinus:0.005022458371323174,Axonopus_micay:0.0011034866629808307):1.00000050003157E-6):0.0019504498429414353):0.001562371363476464,(Axonopus_comans:0.0016387810460717321,((Axonopus_bryoides:0.002500301435468394,Axonopus_hydrolithicus:0.0056052953584712975):0.0030061503264036567,(Axonopus_pellitus:7.36982529807105E-4,(Axonopus_siccus:0.005772674056205261,Axonopus_eminens:0.0016930858922218836):5.100252304435782E-4):0.004295126292761051):3.3346069778356427E-4):1.0000005000281E-6):3.5102074091015317E-4,(Axonopus_conduplicatus:1.0000005000281E-6,(((Axonopus_aureus:0.006434612911457811,Axonopus_canescens:0.002500233553453926):0.0017699506719093538,(Axonopus_fastigiatus:3.5102577982098343E-4,(Axonopus_poiophyllus:0.0010914144325005377,Axonopus_apricus:0.0010525248712483122):1.0000005000281E-6):6.924675118421611E-4):3.503533183607799E-4,(Axonopus_scoparius:0.005972485914589602,((Axonopus_purpusii:0.001632381646957115,(Axonopus_cuatrecasasii:0.0016411379085838895,Axonopus_chrysoblepharis:0.0010631363730121204):1.00000050003157E-6):0.0021201117550027314,((Axonopus_singularis:3.5109079970370785E-4,((Axonopus_mathewsii:0.0027620609055274,Axonopus_pennellii:0.0010930320958958267):5.477508632030989E-4,(Axonopus_flabelliformis:0.0017724127545047444,(Axonopus_hirsutus:0.0016404765511522437,Axonopus_capillaris:0.0030478385859591395):0.001213011321936637):5.61721869504761E-5):6.433628922360261E-4):3.5125937707444765E-4,(Axonopus_marginatus:0.001425730451700781,(Axonopus_kuhlmannii:0.004055886128207349,(Axonopus_monticola:5.504887027059403E-4,((Axonopus_argentinus:0.008125489410218428,Axonopus_suffultus:0.0012487199934535856):1.00000050003157E-6,(Axonopus_fissifolius:0.0019342918910061416,(Axonopus_pressus:4.502015642862747E-4,Axonopus_polystachyus:0.003926447811317964):4.238529164870067E-4):8.758592208514132E-4):2.0052621044370014E-4):8.97734591313523E-6):2.1829392779776358E-4):1.0000005000281E-6):3.586323693809401E-4):3.7195928911701315E-4):1.0000005000281E-6):7.250701506784432E-4):3.61831253290968E-4):1.0000005000281E-6):6.472492489791593E-4):4.0286239569352E-4):1.0000005000281E-6):3.5376956606381765E-4):0.003405167154644423):0.0062580140970596165):0.0028067456473717736):2.9889360817395016E-4):0.006228433213971783):0.004330699518681564); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr124874] END;