#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on June 15, 2026; 10:58 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Delfini C., Acosta J.M., Souza V.C., & Zuloaga F.O. 2020. Molecular Phylogeny of Axonopus (Poaceae, Panicoideae, Paspaleae): Monophyly, Synapomorphies, and Taxonomic Implications for Infrageneric Classification and Species Complexes. Annals of the Missouri Botanical Garden, 105(4): 459-480. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S26628] [ The following blocks are input data for analysis step 26926 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep26926; DIMENSIONS NTAX=54; TAXLABELS Anthaenantia_lanata Axonopus_anceps Axonopus_andinus Axonopus_apricus Axonopus_argentinus Axonopus_aureus Axonopus_boliviensis Axonopus_brasiliensis Axonopus_capillaris Axonopus_caulescens Axonopus_centralis Axonopus_chrysoblepharis Axonopus_comans Axonopus_compressus Axonopus_conduplicatus Axonopus_cuatrecasasii Axonopus_eminens Axonopus_fastigiatus Axonopus_fissifolius Axonopus_flabelliformis Axonopus_furcatus Axonopus_hirsutus Axonopus_hirsutus_II Axonopus_hydrolithicus Axonopus_hydrolithicus_II Axonopus_kuhlmannii Axonopus_laxiflorus Axonopus_leptostachyus Axonopus_longispicus Axonopus_marginatus Axonopus_mathewsii Axonopus_micay Axonopus_obtusiolius Axonopus_oiapocensis Axonopus_pellitus Axonopus_pennellii Axonopus_poiophyllus Axonopus_poiophyllus_II Axonopus_polystachyus Axonopus_pressus Axonopus_purpusii Axonopus_scoparius Axonopus_senescens Axonopus_siccus Axonopus_singularis Axonopus_suffultus Axonopus_tenuis Axonopus_triglochinoides Ichnanthus_pallens Paspalum_acuminatum Paspalum_notatum Plagiantha_tenella Steinchisma_laxum Streptostachys_asperifolia ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M55231] TITLE Axonopus_BI_matrix_ETS; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep26926; DIMENSIONS NCHAR=480; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Anthaenantia_lanata GGACCCCCG-CCGTTGTG-CGGC---CGACTTGTCGGCGCCT-GTGTCCCTT-CACTTTGTTGGCTTTTGGG--CTCAGACC----GACGTGTGCTTGC-GTGTT-CT--ACCA-ATGCTATTGGAAGTTGCACTTCTCAAATGTGGGCATTTGTCGCGCGCCCTC-CCATGGTGTCGCGCGTCGAACGTTGAAAGCGTTCACGGCGTTGCCTTGTG-AGCTGGCCA-AACTAGCTTCATCA-------AGGCCACCTC-GTGTATGCCTTGTGGATCGGATTGGTCTCGGATTGTAAA-GGCCGT-TGGTGCTTTATGGCGCCTCGTTCCTACCTGAAAGGAAGTCCGAACGGAAACAA-CGACAGATAGCCTAGTGGATGCCTTGTGTTGA-TGCTAGCGTTATCTCGTCGAG-GAGGACGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTC-TATGCCTTGTCTAA-------------- Axonopus_anceps 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Axonopus_brasiliensis GGACCCCCGCCCCTTGTG-CGGC---TGACT-GCTGGCGCCT-GTGTCCCTT-CAATTTTTTGCTATTGTT--CCT-GACTCCTTTATTA-ATGCCTTC-CTGTTGCT--ACCA-GTCCTACCGGAAGTTTCCTTTGACACATGTTA-CCTTTCTCCGCTCCGCCC--TTGGGCGCTGCACGTCGACA--TGAAAGCATTCACAGCGTTGCCTCGTGTAACTAGCCCCCTAGGCCACTCTCAC----CAAGGACACCTT-GTGCATTCTAGTGTTCTTGTATGCCTCAT--ACTAAAAA-GGTAAA-GGGCTCTT--CCGCCCCACGCCCCTA--CCAAAGATTGTCCAGTCGAAAAAAAACGACAGCAGGCCTAGCCCATTCATTGTGTAG-AGGCTTGAGCTTGCTAGTCGAT-GAGGACGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAATAGTCATATGCCTAATCTA--------------- Axonopus_capillaris 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Axonopus_comans -----------ACTTGTG-AGGC---CGAC-TGCTGGCGCCT-GTGTCCCTT-CAATCATTGGCTGTTGCG--TCCCGACCCTATTAAGA-GTGCTTGC-GTGCTGCT--ACCA-GTCGTTCTGGAAGTTGCATTCGATACAAGTTG-TGTTTGTCGTGCTTGCCC--TACGGCTTTGCACGTCGACT--TGAAAGCGTTCACGGCGTTGCCTCGTGTAGCTACCCATCTAGGCTGCTATCAC----CAAGGACACCTT-GTGGACGCTCTTGGTCTCGGATGCGGCAT--ACGAAAAA-GGCCGA-TGGTGCTT--TGGCGCCCCGTGCCTA--GCAAAGATTGTCCAATCGGAAAAAA-CGACAGCTGGCCTAGCTGATGCCTTGTGCAG-AGGCTTGTGCTGGCTCGTCGAC-GAGGACGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTC-TATGCC-TTGTCTA-------------- Axonopus_compressus GGGACCTCGCCC-TTGAG-CGGC---CGAC-TGCCGGCGCCT-GTGTCCCTT-CAATATATGGCTCTTGCG--CCT-GACTCTATTATGA-GTGCTTGC-GTGCTGCT--ACCA-GTCATACTGGAAGTTGCATTCGACACAGATTG-CGTTCGTCGTTCACGCCC--CAGGGCGCTGCACGTCGACA--TGAAAGAATTCACATCGTTGCCTCGTGTAGCTAGCCACATATGCGCTGCTGTC----CAAGGACACCTT-GTGGATGCTATTGGTCTCGGATGCGGCTA--ACAAAAAA-GGCCGA-TGGTGCTT--AGGCCCCTTGTGCCTA--GCAAAGATTGTCCAGTCGGAAACA--CGACAGCGGGCCTAGCTGATGCCTTGTGTAG-AGGCTTGAGCCGGCTCGTCGAT-GAGGACGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTA-TCA-A-GTTTTTGTAAA-------------- Axonopus_conduplicatus GGACCCCCGCCC-TTGTG-CGGC---CGAC-TGCCGGCGCCT-GTGTCCCTT-CAATCGTTAGCCGTTGCG--CCC-GACCCTATTAAGA-GTGCTTGC-GTGCTGCT--ACCA-GTCATACTGGAAGTTGCATTCGCTACAAGTTG-TGTTCGTCGTGCTTGACC--TAGGGCTTTGCATGTCGACT--TGAAAGCGTTCACGGCGTTGCCTCGTGTAGCTAGCTGTCTAGGCTGCTGTCAC----CAAGGACACCTTTGTGGACGCTGTTGGTCTCGGATGCGGCAT--ACGAAAAAAGGCCGA-TGGTGCTT--CGGCGCCCCGTGCCTA--GCAAAGATTGTCCGAACGGAAAAAA-CGACAGCTGGCCTGGCTGATGCCTTGTGCAG-ATGCTGGTGCTGGCTCGTCGAC-GAGGACGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTA-TC-TATGCCTTGTCTA--------------- Axonopus_cuatrecasasii GGACCCCCGCCC-TTGTG-CGGC---CGAC-TGCCGGCGCCT-GTGTCCCTT-CAAATTTTGGCTGTTGTG--CCT-GACCACATTATGA-GTGCTTGC-GTGTTGCT--ACCAAGTCGTACTGGAAGTTGCATTCGACACAGGTTT-CGTTCGTCGTTCACGCCT--TTGGGCGCTTCACGTCGACA--TGAAAACATTCACAGCGTTGCCTCGTGTAGGTAGCCGCATAGGCTGCTTTCAC----CAAGGACACCTT-GTGGATGCCATTGGTCTTGGATGCGGCTT--ACTAAAAA-GGTCGA-TGGTGCTT--CGGCGCCGCGTGCCTA--GCAAAGATTGTCCAGTCGGAAAAA--CGACAGCAGGCCTAGCTGATGCCTTGTGTAG-AGGCTTGAGCCTGCTCGTCGAT-GAGGACGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTA-TC-T-TCTTTCTTTTTA-------------- Axonopus_eminens -GAGGCAAGAGGAAGGTT-GGGC---T-AG-TAGATGCCTTAAGAATCCCG-CCAGTCTACGGCTGTTTCG--CCCAGACCGTATTAAGA-GTGCTTGT-GTGCTGCT--CCCA-GTATAATTGGAAGTTGCATTCGCTACAAGTTG-CGTTTGTCGTGCTTGCCC--TATGGCTTTGCACGTCGACT--TGAAAGCGTTCACGGCGTTGCCTCGTGTAGCTAGCTGCCTAGGCTGCTATCAC----CAAGGACACCTT-GTGGACGCTTTTGGTCTTGGATGCGGCAT--ACGAAAAA-GGCCGA-TGGTGCTT--TGGCGCCCCGTGCCTA--GCAAAGATTGTCCAATCGGAAATAA-CGACATCCAGCCTAGCTGATGCCTTGTGCAG-AGGCTTGTGCTGGCTCGTCGAC-GAGGACGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTC-TATGC-TTGTCTA--------------- Axonopus_fastigiatus GGA--CCCGCC--TTGTAGCGGC---CGAC-TATCGGCGCCT-GTGTCCCTT-CGATAATTGGCTGTTGCG--CCT-GACCCTATTATGA-GTGCTTGCAGTGCTGCT--ACCA-GTCATATTGGAAGTTGCCTTTGAAATATGTTG-CGGACGTCATGCATGCCC--TAGGGTGTTGCATGTCGACA--TGAAAGCATTCACAGCGTTGCCTCGTTCAGCAAGCCGTTTAGGCTGCTGACAC----CAAGGACACCTT-GTGGATGCTATTGGTCTCGGATGTGGCTA--ACTAAAAA-GGCCGA-TGGTGCTT--CGGCGCCTTGTGCCTA--GAAAAGAATGTCCAGTCGGAAAAA--CGACAGTTGGCCTAGCTGATGCCTTGTGCTA-AGGTTGGAGCT-ACTTGTCGAT-GAGGACGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCA-ATGGCTTGTCTAA-------------- Axonopus_fissifolius GGACCCTCGCC-TTTGTG-CGGC---CGAC-TACCGACGCCC-GTGTCCCTT-CAATTTTTGGCTGTTGTG--CCT-GACTGCATTATGA-GTGCTTGC-GTGTTGCT--ACCA-GTCGTACTGGAAGTTGCATTCGACACATGTTG-CGTTCGTCGTTCACGCCCCTTAGGGCGCTGCACGTCGACA--TGAAAGCATTCACAGCGTTTCCTCGTGGAGCTAGCCGCCTAGGCTTCTTTCAC----CAAGGACACCTT-GTGGATGCCATTGGTCTTGGATGTGGCTT--ACTATAAA-GGTCGC-TGGTGCTT--TGGCGCTGCGTGCCTA--GCAAACATTGTCCAGTCGGAAAATA-CGACAACAGGCCTAGCTGATGCCTTGTGTAG-AGGCTTGAGCCTGCTCGTCGAT-GAGGACGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTC-TAAGCCCTTGTTAA-------------- Axonopus_flabelliformis GGACCCCCGCC--TTGTG-CGGC---CGAC-TACCGGCGCTT-GTGTCCCTTTCAATTTTTGGCTGTTGTG--CCT-GATCGCATTATGA-GTGCTTGC-ATGTTGCT--ACCA-GTCGTACTGGAAGTAGCATTCGACACAGGTTG-CGTTCGTCGTTCACGCCC--TTGGGCGCTGCACGTCGACA--TGAAAACATTCACAGCGTTGCCTCGTGTAGCTAGCCGCCTAGGCTGCTTTCAC----CAAGGACACCTT-GTGGATGCCATTGGTCTCGGATGCGGCTT--ACTAAAAA-GGTCGA-TGGTGCTT--CGGCGCCGCGTGCCTA--GCAAAGATTGTCCAGTCGGAAAAA--CGACAGCAGGCCTAGCTGATGCCTTGTGTAG-AGGCTTGAGCCTGCTCGTCGAT-GAGGACGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATTCTTTGTTTTAAA-------------- Axonopus_furcatus ---------------------GC---CGAC-TGCTGGCGCCT-GTGTCCCTT-CAATCATTGGCTGTTGCG--CCTCGACCCTATTAAGA-GTGCTTGC-GTGCTGCT--ACCA-GTCATACTGGAAGTTGCATTCGATACAAGTTG-CGTTTGTCGTGCTTGCCC--TACGGCTTTGCACGTCGACT--TGAAAGCGTTCACGGCGTTGCCTCGTGTAGCTAGCCGTCTAGGCTCCTATCAC----CAAGGACACCTT-GTGGACGCTCTTGGTCTCGGATGCGGCAT--ACGAAAAA-GGCCGT-TGGTGCTT--TGGCGCCCCGTGCCTA--GCAAAGATTGTCCAATCGGAAAAAA-CGACAGCTGGCCTAGCTGATGCCTTGTGCAG-AGGCTTGTGCTGACTCGTCGAC-GAGGACGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTC-TATGCCCTTGTCTA-------------- Axonopus_hirsutus GCATCCCCG--TTTTTTG-CGGC---CGAC-TGCCGGCGCCT-GTGTCCCTT-CAAATTTTGGCTGTTGTG--CCT-GACCACATTATGA-GTGCTTGC-GTGTTGCT--ACCA-GTCGTACTGGAAGTTGCATTCGACACAGGTTT-CGTTCGTCGTTCACGCCT--TTGGGCGCTTCACGTCGACA--TGAAAATATTCACAGCGTTGCCTCGTGTAGGTAGCCGCATAGGCTGCTTTCAC----CAAGGACACCTT-GTGGATGCCATTGGTCTTGGATGCGGCTT--ACTAAAAA-GGTCGA-TGGTGCTT--CGGCGCCGCGTGCCTA--GCAAAGATTGTCCAGTCGGAAAAA--CGACAGCAGGCCTAGCTGATGCCTTGTGTAG-AGGCTTGAGCCTGCTCGTCGAT-GAGGACGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATTCTTTTTTTTTAA-------------- Axonopus_hirsutus_II 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Axonopus_hydrolithicus_II ------CCGCCC-TTGTG-AGCT---TGTC-TGTCGGTGCAT-TTGTCCCTT-CATTATTTGGCTGTTGTG--CCT-GATCGTGTTATGA-GTGCTTGC-GTGCTGCT--ACCG-GTCATACTGGAAGTTGCATTCGACACAGGTTG-CGTTCGTCGTTCACGCCC--TAGGGCGCTGCACGTCGACA--AGAAAGCATTCATAGCGTTGCCTCGTGTAGCTAGCCGCATTGGCTGCCTTCAC----CAAGGACACCTT-GTGGATGCCGTTGGTCTTGGATGTGGCTT--ACTAAAGA-GGTTGA-TGGTGCTT--CGGCGCCTCGTGCCTA--CCAAAGATTGTCCAATCG-AAAGA--CGACAGCAGGCCTAGCTGATGCCTTGTGTGGGAGGCTTGAGC----------------------------------------------------------------------------- Axonopus_kuhlmannii GGACCCCCGC---TTGTG-CGGC---CGAC-TGCCGGCGCCT-GTGTCCCTT-CAATATTTGGCTATTGTG--CCT-GACCGTATTATGA-GTGCTTGT-GTGCTGCT--ACCA-GTCGTACTGGAAGTTGCATTCGACACAGGTTG-CGTTCGTCGTTCACGCCC--TAGGGCATTGCATGACGACA--TGAAAGCATTCACAGCGTTGCCTCGTGTAGCTAGCCGCCTAGGCTGCTTTCAC----CAAGGACACCTT-GTGGATGCCTTTGGTCTCGGATGCGGCTT--ACTGAAAA-GGTCGG-TGGTGCTT--TGGCGCCCCGTGCCTA--GCAAAGATTGTCCAGTCGGAAAAT--CGACAGCAGGCCTAGCTAATGCCTTGTGTAG-AGGCTTGAGCCTGCTTGTCGAT-GAGGACGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAG-CATACTTAGTTA{AT}AAA-------------- Axonopus_laxiflorus GGATCCTCGCTC--TGTGACGGC---CGAC-TGCCGGCGCCT-GTGTCCCTT-CAATTTTTGGCTGTTGTT--ACT-GACCGCATTACGAAGTGCTTGC-GTGTTGCT--ACCA-GTTGTACTGGAAGTTGCATTCGACAAAGGTTG-CGTTCGTCGTTCACGCCC--TTCGGCGCTGCACGTCGACA--TGAAAACATTCACAGCGTTGCCTCGTGTAGCTAGCCGCCTAGGCTGCTTTCAC----CAAGGACACCTT-GTGGATGCCATTGGTCTTGGATGCGGCTT--ACTAAAAA-GGTCGA-TGGTGCTT--CGGCGCCGCGTGCCTA--GCAAAGATTGTCCAGTCGGAAAAA--CGACAGCAGGCCTAGCTGATGCCTTGTGTAG-AGGCTTGAGCTTGCTCGTCGAT-GAGGACGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATTCTTTTTTTTTTA-------------- Axonopus_leptostachyus GGACCCCCGCCC-TTGTG-CGGC---CGAC-TGCCGGCGCCT-GTGTCCCTT-CAATTTTTGGCTGTTGTG--ACT-GACCGCATTACGA-GTGCTTGC-GTGTTGCT--ACCA-GTTGTACTGGAAGTTGCATTCGACAAAGGTTG-CGTTCGTCGTTCACGCCC--TTCGGCGCTGCACGTCGACA--TGAAAACATTCACAGCGTTGCCTCGTGTAGCTAGCCGCCTAGGCTGCTTTCAC----CAAGGACACCTT-GTGGATGCCATTGGTCTTGGATGCGGCTT--ACTAAAAA-GGTCGA-TGGTGCTT--CGGCGCCGCGTGCCTA--GCAAAGATTGTCCAGTCGGAAAAAA-CGACAGCAGGCCTAGCTGATGCCTTGTGTAG-AGGCTTGAGCCTGCTCGTCGAT-GAGGACGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTC{AT}{AT}?????????????-------------- Axonopus_longispicus GGACCCCCGCCCTTTGTT-AGTCAA-TCAAATACT-GTCCTA-GTGTCCCTT-CTATCTATGGCTGTTTTG--CCC-GACTGCATTTATGAGTGCTTGT-GTGCTGCT--ACCA-GACATATTGGAAGTTGCATTCGACACATGTTG-CGTTTGTCGTTCTCGCCC--TATGGCTCTGCACGTCGACA--TGAAAGCTTCCCAGCGGTTGCCTCGGGTAGCCAGCTGCTAAGCCTGCCTTCCC----CCAGGAACCCTTTGTGGAAGCCTTTGGGCCTGGAAGGGGGTT--AACAAAAAAGGCCGA-TGGGCCTT--TGCCCCCCCGTGCCCT--GCAAAAATTGCCCAACCGGAAAATAACGACACCGGGCCAAGTTAAGCCCTTGGGCGA-AGCCTTGGCCTGCTCCGCCAACAGAGGACTGGCTAACTGGGTGAACCCGCCAGTAGGCCTAGGCC-TTGTTAA-------------- Axonopus_marginatus GGACCCC-GC--TTTGTAGCGGC---CGAC-TGCCGACGCCC-GTGTCCCTT-CAATTTTTGGCTGTTGTG--CCT-GACCGCATTATGA-GTGCTTGC-GTGTTGCT--ACCA-GTCATACTGGAAGTTGCATTCGACACATGTTG-CGTTCGTCGTTCACGCCC--TAGGGCGTTGCACGTCGACA--TGAAAGCATTCATAGCGTTGCCTCGTGGAGCTAGCCGCCTAGGCTTCTTTCAC----CAAGGACACCTT-GTGGATGCCATTGGTCTAGGATGTGGCTT--ACTATAAA-GGTCGC-TGGTGCTT--TGGCGCCGCGTGCCTA--GCAAAGATTGTCCAGTCGGAAAAATACGACAACAGGCCTAGCTGATGCCTTGTGTAG-AGGCTTGAGCCTGCTCGTCGAT-GAGGACGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGACTTAACTAA-------------- Axonopus_mathewsii -------------------------------------------------------------GGTTCTCGTG--CCT-GACCGCATTATGA-GTGCTTGC-GCGTTGCT--ACCA-GTAGTACTGGAAGTTGCATTCGACACAGGTTG-CGTTCGTCGTTCACGCCC--TTGGGCGCTGCACGTCGACA--TGAAAGCATTCACAGCGTTGCCTCGTGTAGCTAGCCTCCTAGGCTGCTTTCAC----CAAGGACACCTT-GTGGATGCCATTGGTCTCGGATGCGGCTT--ACTAAAAA-GGTCGA-TGGTGCTT--CGGCGCCGCGTGCCTA--GCAAAGATTGTCCAGTCGGAAAAA--CGACAGCAGGCCTAGCTGATGCCTTGTGTAG-AGGCTTGAGCCTGCTCGTCGAT-GAGGATGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTC-AAGGCCCTTGTCTA-------------- Axonopus_micay -------------------------------------------------------------GGCTGTTGTG--CCC-GACCGCATTATGA-GTGCTTGC-GTGTTGCT--AACA-GTAGTACTGGAAGTTGCATTCGACACAGGTTG-CGTTCGTCGTTCACGCCC--TTGGGCGCTGCACGTCGACA--TGAAAACATTCACAGCGTTGCCTCGTGTAGCTAGCCGCCTAGGCTGCTTTCAC----CAAGGACACCTT-GTGGATGCCATTGGTCTCGGATGCGGCTT--ACTAAAAA-GGTCGA-TGGTGCTT--CGGCGCCGCGTGACTA--GCAAAGATTGTCCAGTCGGAAAAA--CGACAGCAGGCCTAGCTGATGCCTTGTGTAG-AGGCTTGAGCCTGCTCGTCGAT-GAGGACGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTC-TATTCC-TTGTCTA-------------- Axonopus_obtusiolius 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Axonopus_poiophyllus GGACCCCCGC--TTTGTG-CGGC---CGACTTGCCGGCGCCTTGTGTCCCTTTCAGTTTTTGGCTGTTGTG--CCTTGACCG{CT}ATTATGAAGTGCTTGC-GTGTTGCT--ACCAAGTCGTACTGGAAGTTGCATTCGACACAGGTTG-CGTTCGTCGTTCACGCCC--TAGGGCGCTGCACGTCGACA--TGAAAGCATTCACAGCGTTGCCTCGTGTAGCTAGCCGCCTAGGCTGCTTTCAC----CAAGGACACCTT-GTGGATGCCATTGGTCTCGGATGCGGCTT--ACTAAAAA-GGTCGA-TGGTGCTT--CGGCGCCGCGTGCCTA--GCAAAGATTGTCCAGTCGGAAAAAA-CGACAGCAGGCCTAGCTGATGCCTTGTGTAG-AGGCTTGAGCCTACTTGTCGAT-GAGGACGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAG-AGTCAT-TCTTTTTTTTTA-------------- Axonopus_poiophyllus_II 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Axonopus_pressus GGATAATAGCCC-TTGTG-CGGC---CGAC-TGCCGGCGCCT-GTGTCCTTC-AGTTTTTTGGCTGTTGTG--CCG-ACCAGTATTAAGA-GTGCTTGT-GTGTTGCT--ACCA-GTCGTACTGGAAGTTGCATTCGACACAGGTTG-CGTTCGTCGTTCACGCCC--TTGGGCGCTGCACGTCGACA--TGAAAGCATTCACAGCGTTGCCTCGTGTAGCTAGCCACCTAGGCTGCTTTCAC----CAAGGACACCTT-GTGGATGCCATTGGTCTCGGATGCGGCTT--ACTAAAAA-GGTCGA-TGGTGCTT--TGGCGCCGCGTGCCTA--GCAAAGATTGTCCAGTCGGAAAAAA-CGACAGCAGGCCTAGCTGATGCCTTGTGTAG-AGGCTTGAGCCTGCTTGTCGAT-GAGGACGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTA-TCATAGGCTTGTCTAAA-------------- Axonopus_purpusii GGACCCCCGCC-TTTGTG-CGGC---CGAC-TGCCGACGCCT-GTGTCCCTT-CAATTTTTGGCTATTGTG--CCT-GACCGCGTTATGA-GTGCTTGC-GTGTTGCT--ACCA-GTTGTACTGGAAGTTGCATTCGACACATGTTG-CGTTCGTCGTTCACGTCC--TAGGGCGTTGCACGTCGACA--TGAAAGCATTCACAGCGTTGCCTCGTGTAGCTAGCCGCCTAGGCTACTTTCAC----CAAGGACACCTT-GTGGATGCCATTGGTCTTGGATGTGGCTT--ACTATAGA-GGTCCC-TGGTGCTT--TGGCGCCACGTGCCTA--GCAAAGATTGTCCAGTCGGAAAAAA-CGACAACAGGCCTAGCTGATGCCTTGTGTGG-AGGCTTGAGCCTGCTCGTCGAT-GAGGACGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCAT-TCTTGGTTAAAA-------------- Axonopus_scoparius GGACCCCCGCCC-TAGTG-CGGC---TGAC-TGCCGGTGCCT-GTGTCCCTT-CAATATTTGGCTGTTGTG--CCA-GACCGTAATACGA-GTGCTTGC-GTGCTGCT--ACCA-GTCATATTGGAAGTTGCATTCGACACATGTTG-CGTTCGTCGTTCACGCCC--TAGGGCGCTGCACGTCGACA--TGAAAGCATGCACAGCGTTGCCTCGTGTAGCTAGCCGCCTAGGCTGCTTTCAC----CAAGGACACCTT-GTGGATGCCATTGGTCTCGGATGTGGCTT--ACTAAAAA-GGACGA-TGGTGCTT--CGGCGCCCCGTGCCTA--GCAAAGATTGTCCAGTCGGGAAAAA-CGACAGCAGACCTAGCTTATGCCTTGTGTAG-AGGCTTGAGCCTGCTCGTCGAT-GAGGACGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCAAGTTTTTTTTTAAA-------------- Axonopus_senescens GGACCCCCGCCCTTTGTT-AGGC---CGAC-TGCTGGCGCCT-GTGTCCCTT-CAATTTTTGAATGTTTAG--CCCGAACCACATAAAGA-GTGCTTGT-GTGCTGCT--CCCA-GACATACTGGAAGTTGCATTCACTACATGTTG-CGTTAGTCGTGCATGCCC--TATGGCTTTGCACGTCGACT--TGAAAGCTTTCCCGGCGTTCCCTCGTGTAGCTAGCTGCCTAGCCTGCTTTCAC----CAAGGACCCCTT-GTGGACGCTTTTGGTCTTGGATGCGGTAT--ACTGAAAAAGGCCGA-TGGGGCTT--TGGCCCCCCGTGCCTA--GCAAAGATTGTCCAATCGGAAATAA-CGACATCCAGCCTAGCTGATGCCTTGGGCAG-AGGCTTGTGCTGGCTCGTCGAC-GAGGACGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTC-TATGCC-TTGTCAA-------------- Axonopus_siccus GGAGACCCGCCCTTAAGG-CGGC---CGAC-TGCTGGCGCCT-GTGTCCCTT-CAATCATTGGCTGTTGCG--CCCAGACCGTATTAAGA-GTGCTTGT-GTGCTGCT--ACCA-GACATATTGGAAGTTGCATTCGCTACAAGTTG-CGTTTGTCGTGCTTGCCC--TATGGCTTTGCACGTCGACT--TGAAAGCGTTCACGGCGTTGCCTCGTGTAGCTAGCTGCCTAGGCTGCTATCAC----CAAGGACACCTT-GTGGACGCTTTTGGTCTTGGATGCGGCAT--ACGAAAAA-GGCCGA-TGGTGCTT--TGGCGCCCCGTGCCTA--GCAAAGATTGTCCAATCGGGGAATAACGACATCCAGCCTAGCTGATGCCTTGTGCAG-AGGCTTGTGCTGGCTCGTCGAC-GAGGACGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATACTTTTGGGCA---------------- Axonopus_singularis --------------------------CGACTTGCCGGCGCCT-GTGTCCCTT-CAATTTTTGGTTGTTGTG--ACT-CACCGCATTATGA-GTGCTTGC-ATGTTGCT--ACCA-GTCGTACTGGAAGTTGCATTCGACACATGTTG-CTTTCGTCGTTCA{CT}GCCC--TAGGGCGTTGCACGTCGACA--TGAAAGCATTCATAGCGTTGCCTCGTGGAGCTAGCCGCCTAGGCTTCTTTCAC----CAAGGACACCTT-GTGGATGCCATTGGTCTTGGATGTGGCTT--ACTATAAA-GGTCGT-TGGTGCTT--TGGCGCCGCGTGCCTA--GCAAACATTGTCCAGTCGGAAAATA-CGACAACAGGCCTAGCTGATGCCTTGTGTTG-AGGCTTGAGCCTGCTCGTCGAT-GAGGACGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTC-TATGCC-TTGTCTA-------------- Axonopus_suffultus GGACCCCCGCCCTTTGTG-CGGC---CGACTTGCCGGCGCCT-GTGTCCCTTTCAATTTTTGGCTGTTGTG--CCT-GACCACATTATGA-GTGCTTGC-GTGTTGCT--ACCA-GTTGTACTGGAAGTTGCATTCGACACAGGTTG-CGTTCGTCGTTCACGCCC--TTCGGCGCTGCACGTCGACA--TGAAAACATTCACAGCGTTGCCTCGTGTAGCTAGCCGCCTAGGCTGCTTTCAC----CAAGGACACCTT-GTGGATGCCATTGGTCTCGGATGCGGCTT--ACTAAAAA-GGTCGA-TGGTGCTT--CGGCGCCGCGTGCCTA--GCAAAGATGGTCCAGTCGGAAAAA--CGACAGCAGGCCTAGCTGATGCCTTGTGTAG-AGGCTTGAGCTTGCTCGTCGAT-GAGGACGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATACTTTGGGGAAAA-------------- Axonopus_tenuis GGACCCCCGCCCTATGTG-CGGC---CCAC-TGTTGGCGCCT-GTGTCCCTT-CATTTCATGGCTGTTGTC--CCATGACCCTATCAAGA-GTGCTTGC-GTGCTGCT--ACCA-GTCATATTGGAAGTTGCATTCAATACAAGTTG-CGTTTGCCGTGCATGTCC--TATGGCTTTGCACGTCGACT--TGAAAGCGTTCACGGCGTTGCCTCGTGTAGCTAGCTGTCTGGGCTGCTTTTAC----CAAGGACACCTT-GTGGACGCTATTGGTCTCGGATGCGGCAT--ATGAAAAA-GGCCGA-TGGTGCTT--TGGCGCCTCGTGCCTA--GAAAAGATTGTCCAATCGGGAAAAAACGACAGCCGGCCTAGCTGATGCCTTGTGCAG-AGGCTTGTGCTAGCTCGTCGAC-GAGGACGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGACATAGGCC-TTGTCTA-------------- Axonopus_triglochinoides GGACCCCCGCCC-TTGTG-CGGC---CGAC-TGCCGGGGCCT-GTGTCCCTT-CATTTTTTGGCTGTTGTG--CCT-GACCA{CT}ATTA{AT}GA-GTGCTTGC-GTGGTGCT--ACCA-GTCATACTGGAAGTTGCATTCGACACA{AGT}GTTG-CTTT{CT}GTCGTTCACGCCCC-TTGGGCGTTGCACGTCGACT--TGAAAGCATTCACAGCGTTGCCTCGTGTAGCTAGCCTCCTAGGCTGCTTTCAC----CAAGGACACCTT-GTGGATGCCATTGGTCTCGGATGCGGCTT--ACTAAAAA-GGTCGA-TGGTGCTT--TGGCGCCCCGTGCCTA--GCAAAGATTGTCCAATCGGAAAAAA-CGACAGCAGGCCTAGCTGATGCCTTGTGTAG-AGGCTTGAGCCTGCTCGTCGAT-GAGGACGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCAT-TGGC-TTGTCTA-------------- Ichnanthus_pallens -------------------------------------------------------------------------------------GACGA-GTGCTTGC-ATTCTGCT--ACCA-GTACCACTGGAAGTTGCATTGCAATATAGTTG-ATTTCATCGTGTGCGCCG-TGTGGGAGTAACACGTTGACT---ATAAACGTTCACGGTGTTGCCTCGTGTAGCCGCCTGCTTAGGTTGGCATCAT----CAAGGCCACCTC-GTGTACGTTTTTGGTCTCGGATGCAGCAA--ACGTAAAA-GGCCGA-TGGTGTTC--TGGCGCCACGTGCCTA--GGGAAAATGGTCCGTTTGGAAACAA-TGACAGTCAGGTCGGTTGATGCATCATGCGG-AAGCCGATGTT---------------------------------------------------------------------------- Paspalum_acuminatum GGAGGCCCCCGCTGTTGTGCGGC---CGACT-TCCGGTGCCA-GTGTCCCTT-CAGTTTTTGGCTATTACG--CCTATCCTTT-CAACGA-GTGCTTGC-GTGCTGCT--ACCA-GTCGCACGGGAAGTTGCATTGCC-AAATGTTG-CTTTTGCCGTGCATGCCC-CAAGGGCATGTCACGTCAACT-AT-AAAGCATTCATGGCGTTGCCTCGTGTAGCTGGCCGCATAGGCTAGCAACAT----CAAGGTGACCTC-ATGTATGCTGTTGGTCTCGGATGTGGCTA--ACCATAAA-GGCTGAA-GGTGCTC--TTGCTCCTCATGCCTA--CAAAACATTGTCCGATTGGAAACAA-CGACAGTAGGCCTGGCCGATGCCTCGTGCGG-AAGCTAGTGCT---------------------------------------------------------------------------- Paspalum_notatum ---CCCCCG-TTGTTGTG-AGGC---CGACT-GCCGGTGCCA-GTGTCCCTT-CAATCGTTGGCTATCGTG-TGCCTATCG{CT}TTCA-CGA-GTGCTTGC-GTGCTGCT--ACCA-GTAACGCTGGAAGTTGCATTGCTAAAAGGTTG-GTTTTGCCGTGCATGCCC-ATTGGGCATGACACGACAATT-AT-AAAGCGGTCATGGCGTTGCCTCGTGTAGCTGGCCGCATTGGCTAGTGGCAT----CAAGGCTACCTC-ATGGTCGCTGTTGGTCTCGGATGTGGCTA--ACTCTAAA-GGCTGA-AGGTGCTT--TGGCACCCCATGCCTA--CAAAATACTGTCCGGTTGGAATAAA-CGACAGTTGGCCTAGCTGAAGCCTTGTGTGG---------------------------------------------------------------------------------------- Plagiantha_tenella GGACCCCCG--TGTT-TG-CGGC---TGACT-ACTGGCGCTA-GTGTCCCTT-TGATTGTTGGCTTTCAAG--CCAAAGCAATTTATG-T-GCGCTTGC-ATGCTTCT--ACCA-GTCTCACTGGAAGTTGAATTTGATAAATGTTG-CCTTCGTTGTGCACTCCC-TT-GGGTGTTGCACGTCGACT--CAAAAGCGTTCACGGCGTTGCCTCGTGTAACCAGTC---CAGGCTGGCCTCAT----GAAGGCGACCTT-GTGCATGCTTATGGTCCTGGATGTGGCTA--ACACTAAA-GGCCTATAGGTGCTT--CAACACCTATGCCTAG--CCAAGTTATGTCCAATTGGAAACAC--GACAGTTGGCCCGGTTGATGCCCTGCGCAG-AGC-TCGTGCTAGCTCGTCGAG-GAG-ACGTGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTC-TATGCCTTTTCTAA-------------- Steinchisma_laxum GGACCCCCG-TTTTTTCT-CGGCC--CGACA-ACCGGCGCCT-GTGTCCCTT-CATAGTTTGGCAATCGTG--CCTAAAC-TATTTAAG--GTGCTTGC-GTGCTTGT--ACCA-ATCTCACTGGAAGTTGCAATTGATTATTGTTG-CCTTTGTTGTGCATGCCC-TTAGGGTGTTGCACATCGACC--TGAAAGCATTCATGGGGTTGCCTCTTGTTGCTGGCC---TAAGC-GGCTTCATTCACCAAGGCCACCTT-GTGTATGCTTTTGGTCTAGGATGTGGCTA--AACTTAAA-GGGCGA-AGGTGCTT--TCACCCCTTTGGCCTA--TAATTGATTGTCCCTTTGGAAACAA-AAACGTTGGGCCTCGTTGATGCCCCCTGGGGACGGCTTGACCCTGCTTGTCGAG-GAGGAAGTGCTACCCGGTTGAACCCGCCCGTAGCC-AATTCCTTTTAAAA-------------- Streptostachys_asperifolia GGACCCCCGCC-GTTGTG-CGGC---TGACT-G{AT}CGGCGCCT-GTGTCTTTT-CAATCCGTGGCTAATGAG---CCTGACCCTATGATGA-GTGCTTGC-GTGCTGCT--ACCA-GGAAG-CTGGAAGTTGCATTCGCTATATGTCG-CCTTCGTTGCGTGCGCCC-TTAGGGTGTTGCATGTCGACT--TGGAAACATTCATGTCGTTGCCTCGTGTTGCTAGCCACCTAGGCTGGCATCAT----CAAGGCCACCTC-ATGTTTGCTTTTGGTCATGGATGTGGCTT--ACACAAAA-GGCCGT-TGGTGCTT--TGATGCCTCGTGCCTA--GCAAAGATTGTCCGACCGGAAACAAT-GACAGTTGGCCCGGCTGATGCCCTGTGCGG-ACGTCGGTGCC---------------------------------------------------------------------------- ; END; [ The following blocks are output data for analysis step 26926 ] BEGIN TREES; TITLE Axonopus_ETS_BI; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep26926; TREE 'ETS_con 50 majrule' = [&R] (Anthaenantia_lanata:0.2137648,(Ichnanthus_pallens:0.442899,(Paspalum_acuminatum:0.1755078,Paspalum_notatum:0.1949707):0.1349315,(Plagiantha_tenella:0.2738916,Steinchisma_laxum:0.3307487):0.08024702,(Streptostachys_asperifolia:0.2144775,((Axonopus_centralis:0.09425965,((Axonopus_anceps:0.003222173,Axonopus_conduplicatus:0.00327052):0.06647629,((Axonopus_siccus:0.06742001,((Axonopus_eminens:0.1048114,Axonopus_pellitus:0.1012057):0.06350389,(Axonopus_longispicus:0.3973996,Axonopus_senescens:0.05533146):0.07106083):0.01501319):0.04660373,(Axonopus_oiapocensis:0.05858203,(Axonopus_andinus:0.02221217,Axonopus_caulescens:0.02259415):0.02317973,(Axonopus_aureus:0.06419658,Axonopus_tenuis:0.05234433):0.07076357,(Axonopus_capillaris:0.08342041,Axonopus_obtusiolius:0.07862328):0.02338032,(Axonopus_comans:0.0351505,Axonopus_furcatus:0.0178201):0.008282839):0.01235025):0.02656593):0.04372553):0.02312064,(Axonopus_fastigiatus:0.168145,(Axonopus_compressus:0.1288209,(Axonopus_kuhlmannii:0.0722969,Axonopus_scoparius:0.06859973,((Axonopus_hydrolithicus:0.003073794,Axonopus_hydrolithicus_II:0.007556515):0.1262265,(Axonopus_apricus:0.05447813,Axonopus_brasiliensis:0.2967873,Axonopus_mathewsii:0.04245794,Axonopus_micay:0.02659978,Axonopus_triglochinoides:0.04667527,(Axonopus_purpusii:0.06504853,(Axonopus_marginatus:0.03850721,(Axonopus_fissifolius:0.033069,Axonopus_singularis:0.04836638):0.01408107):0.01227598):0.04050417,((Axonopus_poiophyllus:0.01024548,Axonopus_poiophyllus_II:0.006538965):0.006544581,(Axonopus_polystachyus:0.01261897,Axonopus_pressus:0.09037271):0.009408105):0.0153386,(Axonopus_boliviensis:0.02880876,((Axonopus_cuatrecasasii:0.008028747,Axonopus_hirsutus:0.03330848):0.02258946,(Axonopus_hirsutus_II:0.01344981,Axonopus_pennellii:0.06242291):0.01127712):0.0134906):0.02433547,(Axonopus_chrysoblepharis:0.09026727,(Axonopus_flabelliformis:0.03019735,((Axonopus_argentinus:0.1371121,Axonopus_suffultus:0.02073751):0.01274287,(Axonopus_laxiflorus:0.02785892,Axonopus_leptostachyus:0.003105678):0.02319345):0.01087928):0.01457845):0.01091053):0.02062163):0.0163692):0.02570762):0.03273493):0.05014186):0.110814):0.04508513):0.2137648); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr124877] END;