#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on September 19, 2025; 4:17 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Zhang L., & Simmons M. 2005. Phylogeny and delimitation of the Celastrales inferred from nuclear and plastid genes. Systematic Botany, null. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1421] [ The following blocks are input data for analysis step 2705 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep2705; DIMENSIONS NTAX=49; TAXLABELS Afrostyrax_kamerunensis Afrostyrax_lepidophyllus Anisophyllea_fallax Averrhoa_carambola Bauera_rubioides Bhesa_paniculata Bhesa_robusta Brexia_madagascariensis Brunellia_sp Canotia_holacantha Casearia_javitensis Connarus_championii Crinodendron_patagua Davidsonia_pruriens Dicarpellum_pancheri Elaeocarpus_reticulatus Empleuridium_juniperinum Fagus_grandifolia Glycine_max Hua_gabonii Humiria_balsamifera Juglans_nigra Lacistema_aggregatum Lagenaria_breviflora Lepidobotrys_staudtii Lepuropetalon_spathulatum Mortonia_greggii Oxalis_stricta Parnassia_faberi Parnassia_glauca Parnassia_laxmanii Parnassia_palustris Parnassia_palustris_A Parnassia_tenella Parnassia_trinervis Peripterygia_marginata Perrotetetia_longistylis Perrotetetia_ovata Pottingeria_acuminata Prunus_persica Quetzalia_occidentalis Rinorea_sp Ruptiliocarpon_caracolito Siphonodon_celastrineus Sloanea_australis Stackhousia_monogyna Tripterococcus_brunonis Zinowiewia_concinna Zizizphus_glabrata ; END; BEGIN CHARACTERS; [! 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TGGTTCAAGTCCC-TCTATCCCCAAAAA-----AGCCTCTTTGACTCCGATTCCCTTA---------------TTATTAT-TCTTCTGA??????------CTTTTCGTT-----AACGTTTCAAAATTGGTTTTCTTTC-----TCATAC--CTTCTAC-----------------TCTTTCACAAATGGATCTGAACAAAATGCCTT-----------TTTT-ATCA???--------------------------ATAGTATCTTATGATACACGTACAAATTAACATCTT-------TGAG--------AACAGAATACCTTTT-TTTAATCTTTTAATC----?TTGTTAATCATTAAAAATCCATA---CTATTTACTC-----GTAT------CGAAACTTATTTCT--------------------AAAGTCTTGGTTGT-----GAAT-CTTCACAAACACAAA----?-----AGGCA--------GAGCCGGAATAAAACTTT-GTAATC---------TTTTTGTTAGTCTTTTTAATT----AACACAGACCGAAGTA-----------------TTCGAGTAAAA--ATAA-----------------GGATGA-TGCGGTGAGAAGGGTCGGGATAGCTCAG-ATGGTAGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGTGTCACCA-GTTCAAATA610101?00020T0220 Parnassia_trinervis 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TGGTTCAAGTCCC-TCTATCCCCAAAAAGGCA-----TCTTTGACTCCGATTCTCT------------------AATTAT-TGTTCTTG??????------CTTTTCGTT-----ACCGTTTCCAAATTCGTTATCTTTC-----TCATTC--ATTCTAC-----------------TCTTTCACAAACGGATCTGAGCAAAAATTTGT-----------TTCTTATCATATATCTTATG------------------ATACA----TATGATACACGTACAAATGAACATCTT-------TGAG--------AAAGGAATCCCCATT-T???-----------------------TCATTAACAATCCATA---CTCTTA-TTC-----GTACTCGTGCCGAAACT???------------------------AAAGTCTTCGTTGT-----GAAG-ATCCACAAAATTTCA----AGGCCTGGATA--------AAACTTT-GTAATTCTTTTTTTTTT--------TACCCAATCCGTTTTTTTAATT----GACATAGACCAAAGTC-----------------GTCTAGTAAAA---TAAAAAAAA------------GATAG-TGCGTTGAGAATGGTCGGGATAGCTCAG-CTGGTAGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGTGTCACCA-GTTCAAATA61010020002?-1111 Prunus_persica 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TGGTTCAAGTCCC-TCTATCCCCAAAAAGAAAAAGTCTCTTTGGCCCCGATTCCCTACCCGATTCCC------TAATTAT-TGTTTCTATTCTCTCTTTTCCTTTTTGTT-----AACGTTTCAAAAGTCGTTATCTGTC-----TCAGTC--AGTCTAC--------------------------TGAGCATCTGAGCAAAATTTTTT-------------CTTATCACAAATCTTCTA------------------ATAGA----TACGATACACGTAGAAATGAACATCCT-------TGAG--------AAAGGAATCCCCATT-TGAT--------------------GAATCATTAACAATCCAGA---CTCTTC-CTC-----GTAC------CGAAACTTAG------------------------AAAGTCTTTGTTGT-----GAAG-ATCCACAAAAGTTTA----GGGCCTGGATA--------AAACTTT-GTAATCCTTTTTTCGT-------------CTTTTTTATTTT-TAATT----GACATAGACCGAATTC-----------------GTTTAGTAAAA---TAAAAAAA------------GGATGA-TGTGTTGAGAATGGTCGGGATAGCTCAG-CTGGTAGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCCTGTCACCA-GTTCATATA0T210020002011111 Sloanea_australis 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= 717; CHARSET gap_271 (CHARACTERS = 'Celastrales trnL-F') = 713; CHARSET 'gap 334-356' (CHARACTERS = 'Celastrales trnL-F') = 718; CHARSET gap_225 (CHARACTERS = 'Celastrales trnL-F') = 709; CHARSET gap_292 (CHARACTERS = 'Celastrales trnL-F') = 715; CHARSET 'gap 504-505' (CHARACTERS = 'Celastrales trnL-F') = 722; CHARSET 'gap 230-279' (CHARACTERS = 'Celastrales trnL-F') = 711; CHARSET 'gap 411-443' (CHARACTERS = 'Celastrales trnL-F') = 720; CHARSET 'gap 474-483' (CHARACTERS = 'Celastrales trnL-F') = 721; CHARSET 'gap 295-315' (CHARACTERS = 'Celastrales trnL-F') = 716; CHARSET gap_382 (CHARACTERS = 'Celastrales trnL-F') = 719; CHARSET 'gap 241-271' (CHARACTERS = 'Celastrales trnL-F') = 712; CHARSET 'gap 283-290' (CHARACTERS = 'Celastrales trnL-F') = 714; CHARSET gap_228 (CHARACTERS = 'Celastrales trnL-F') = 710; END; [ The following blocks are output data for analysis step 2705 ] BEGIN TREES; TITLE Tb7480; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep2705; TREE 'Fig. S7_trnL-F Strict' = [&R] ((((Afrostyrax_kamerunensis,Afrostyrax_lepidophyllus),Hua_gabonii),(((Bhesa_paniculata,Bhesa_robusta),(Casearia_javitensis,Lacistema_aggregatum)),(Humiria_balsamifera,Rinorea_sp)),(((((Brexia_madagascariensis,Empleuridium_juniperinum),Canotia_holacantha),(Dicarpellum_pancheri,Peripterygia_marginata,Siphonodon_celastrineus,(Stackhousia_monogyna,Tripterococcus_brunonis))),(((Lepuropetalon_spathulatum,(Parnassia_faberi,((Parnassia_glauca,(Parnassia_palustris_A,Parnassia_palustris)),(Parnassia_tenella,Parnassia_trinervis)),Parnassia_laxmanii)),(Quetzalia_occidentalis,Zinowiewia_concinna)),(Mortonia_greggii,Pottingeria_acuminata))),(Lepidobotrys_staudtii,Ruptiliocarpon_caracolito)),((Perrotetetia_longistylis,Perrotetetia_ovata),(Anisophyllea_fallax,Lagenaria_breviflora)),Averrhoa_carambola,(((Bauera_rubioides,Sloanea_australis),Crinodendron_patagua),Brunellia_sp),Connarus_championii,Davidsonia_pruriens,(Fagus_grandifolia,Juglans_nigra),Oxalis_stricta,(Prunus_persica,Zizizphus_glabrata)),Elaeocarpus_reticulatus,Glycine_max); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr2275] END;