#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on May 03, 2024; 23:58 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Oh S., & Potter D. 2005. Molecular phylogenetic systematics and biogeography of tribe Neillieae (Rosaceae) using DNA sequennces of cpDNA, rDNA, and LEAFy. American Journal of Botany, 92: 179-192. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1440] [ The following blocks are input data for analysis step 2770 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep2770; DIMENSIONS NTAX=34; TAXLABELS Lyonothamnus_floribundus Neillia_affinis_144 Neillia_gracilis_255 Neillia_sinensis_140 Neillia_sinensis_149 Neillia_sparsiflora_264 Neillia_thibetica_145 Neillia_thibetica_169 Neillia_thyrsiflora_170 Neillia_thyrsiflora_254 Neillia_thyrsiflora_258 Neillia_uekii_152 Neillia_uekii_168 Physocarpus_alternans_175 Physocarpus_alternans_253 Physocarpus_amurensis_265 Physocarpus_capitatus_082 Physocarpus_capitatus_155 Physocarpus_capitatus_184 Physocarpus_malvaceus_252 Physocarpus_malvaceus_266 Physocarpus_monogynus_183 Physocarpus_monogynus_269 Physocarpus_opulifolius_141 Physocarpus_opulifolius_142 Physocarpus_opulifolius_156 Physocarpus_opulifolius_164 Stephanandra_chinensis_147 Stephanandra_chinensis_172 Stephanandra_incisa_102 Stephanandra_incisa_160 Stephanandra_tanakae_162 Stephanandra_tanakae_171 Vauquelinia_californica ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M1597] TITLE 'Oh_rDNA'; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep2770; DIMENSIONS NCHAR=1119; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Lyonothamnus_floribundus TCGATACCTGCGTAGCAGAACGACCCGAGAACCAGTCAAAA-CGTCGAGGG-CCGGGGGGCCTTGCGGCTCCTCGTCCCCTTATC-TCGGGAGGCGACCACCGCCAACGCGGCCGA---CCCTCCCGGGCGTACAAACGAACACCGGCGCGAATTGCGCCAAGGAATTTGAACGAAAGTGCGCGCTCCCGTCGCCCCGGAAACGGTGCGCGTTCGGG-CAGCGTCGTCATCTTCAA----TATGTCTAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCGTTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCCC-----GCAACTCCCACGGGAACGCGAGG--GGACGGATGATGGCCTCCCGCGCGCTTTGCCGCTCGGCTGGCACAAATACCAAGTCCACGGCGACGGCCGCCA-CGACAATCGGTGGTTGCGAAA---CCTCGGTGCCCTGTCGTGCGCGGGCGTCGCGTTTCGCG-GGCTCGCGAAAAACAACTCTTCGCTCCGGCGAAGCTTTCAACATGGTCTGGCAGGCTCCGTGCTTCGGCATCGAACTGTTGGCTCCATACCCCTCGTCAGTG-ATGCAACAAGATT---TTCTTGTGCTAG-CAACGGATTCCTGTTTTGGCTACCTATTGTAACGGAATGGCGCTTCTCGATGTCCCTTTCCTTCTCTCGCC--CTCTCAGGGCTGTAGGAGGACACTGTAGCGGCTCTCGTGTCCCGATCAAGCCATGCATTGTCGTGAGATTGTGACGGTCCACGAGTTGTTGCTCGACTTCTCGGATGCGGAACATAAAGCCGACGTTGGGGGTCTTT--GACCCTCGATTGTCCAATCGATAGCCTTTGTCGCTTTACACGCACGACAGCCGCGCTCGCTGAGAGCTCCTCCGGCCCACAAGGTCGTTGGTTCTTGCACGGGCGTCGGCGTCGGAAAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Neillia_affinis_144 TCGATACCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACGCGTTATGA-ACTCGGGGG-AGGAGGGGCCTCGCGCCTC-TCGTCCCCT--TTGTC------------CCG-----GCGGGCGA---CCGTC--GGGCGAACAAACGAACACCGGCGCGAATTGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCCTGCGGGGGGCGGCGTCGCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCCCC-TCCGCAACTCCCTCGGGAATGCGGGGCGGGGCGGAAGATGGCCTCCCGTGCGCTCCGCCGCGCGGTTGGCGTAAATACCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGTTGTCAAA---CCTCGGTGGCATGTCGTGCGCGCGCGCCGCGACTCGAG-GGCTCTTCGGACCCAACGCTTCGCTTCGGCGACGCTTTCAACATGCGACGGCAGGCTCCATGCTTCGGCATCGAACTGTCGCCTC-GCGCCCCTCGTCAGTTTACGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAAATGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTATTTCCTCCTCCAGCC--CCCCGCGGGTCGGAGGAGGACGTCGTAGCACTGCTTGTGTCCCGATCAAGCCGCACATCGTTGTGAGATTGTGACGGTCCACGAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAACGCTAAGCGGGCGC--GGAGTCTTC--GGCCTCCGATCGTCCAACTCGAAGCCTTTGTCGCTTGATGCGTACGACTGCCGTCGCCGCTGCGGGCT--TTCGACCTCCAAGGTCGCTGGT-CTCGCACGG-CGCCGGCGTCGAAGAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Neillia_gracilis_255 TCGATACCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACGCGTTATGA-ACTCGGGGG-GGGAGGGGCCTCGCGCCTC-TCGTCCCCT--TTGTC------------CCG-----GCGGGCGA---CCGTC--GGGCGAACAAACGAACACCGGCGCGAATTGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCCTGCGGGGGGCGGCGTCGCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCCCCATCCGCAACTCCCTCGGGAATGCGGGGCGGGGCGGAAGATGGCCTCCCGTGCGCCCCGCCGCGCGGTTGGCGTAAAT{AG}CCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGTTGTCAAA---CCTCGGTGGCCTGTCGTGTGCGCGCGTCGCGACTCGAG-GGCTCGTCGGACCCAACGCTTCGCTTCGGCGACGCTTTCAACATGCGACGGCAGGCTCCATGCTTCGGCATCGAACTGTCGCCTC-GCGCCCCTCGTCAGTTTACGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTATTTCCTCCTCCAGCC--CCCCGCGGGTCGGAGGAGGACGTCGTAGCACTGCTTGTGTCCCGATCAAGCCACACATCGTTGTGAGATTGTGACGGTCCACGAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAACGCTAAGCGG{GT}CGC--GGAGTCTTC--GGCCTCCGATCGTCCAACTCGAAGCCTTTGTCGCTTGATGCGTACGACTGCCGT{CG}GCCGCTGCGGGCT--TTCGACCTCCAAGGTCGCTGGT-CTCGCACGG-CGTCGGCGTCGAAGAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Neillia_sinensis_140 TCGATACCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACGCGTTATGA-ACTCGGGGG-AGGA{GT}GGGCC{AT}CGCGCCCT-TCGTCCCCT--TTGTC------------CCG-----GCGGGCGA---CCGTC--GGGCGAACAAACGAACACCGGCGCGAATTGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCCTGCGGGGGGCGGCGTCGCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCCC--TCCGCACCTCCCTCGGGAATGCGGGGCGGGGCGGAAGATGGCCTCCCGTGCGCTTCGCCGCGCGGTTGGCGTAAATACCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGTTGTCAAA---CCTCGGTGGCATGTCGTGCGCGCGCGCCGCGACTCG{AG}G-GGCTCTTCGGACCCAACGCTTCGCTTCGGCGACGCTTTCAACATGCGACGGCAGGCTCCATGCTTCGGCATCGAACTGTCGCCTC-GCGCCCCTCGTCAGTTTACGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTATTTCCTCCTCCAGCC--CCCCGCGGGTCGGAGGAGGACGTCGTAGCACTGCTTGTGTCCCGATCAAGCCACACATCGTTGTGAGATTGTGACGGTCCACGAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAACGCTAAGCGGGCGC--GGAGTCTTC--GGCCTCCGATCGTCCAACTCGAAGCCTTTGTCGCTTGA{CT}GCGTACGACTGCCGT{CG}GCCGCTGCGGGCT--TTCGACCTCCAAGGTCGCTGGT-CTCGCACGG-CGTCGGCGTCGAAGAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Neillia_sinensis_149 TCGATACCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACGCGTTATGA-ACTCGGGGG-AGGAGGGGCCTCGCGCCCC-TCGTCCCCT--TTGTC------------CCG-----GCGGGCGA---CCGTC--GGGCGAACAA{AC}CGAACACCGGCGCGAATTGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCCTGCGGGGGGCGGCGTCGCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCCC--TCCGCA{AC}CTCCCTCGGGAATGCGGGGCGGGGCGGAAGATGGCCTCCCGTGCGCTTCGCCGCGCGGTTGGCGTAAATACCAAGTCCTCGGCGACGGGCGCCA-CGACGATCGGTGGTTGTCAAA---CCTCGGTGGCATGTCGTGCGCGCGCGCCGCGACTCGAG-GGCTCTTCGGACCCAACGCTTCGCTTCGGCGACGCTTTCAACATGCGACGGCAGGCTCCATGCTTCGGCATCGAACTGTCGCCTC-GCGCCCCTCGTCAGTTTACGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTATTTCCTCCTCCAGCC--CCCCGCGGGTCGGAGGAGGACGTCGTAGCACTGCTTGTGTCCCGATCAAGCCACACATCGTTGTGAGATTGTGACGGTCCA{CT}GAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAACGCTAAGCGGGCGC--GGAGTCTTC--GGCCTCCGATCGTCCAACTCGAAGCCTTTGTCGCTTGA{CT}GCGTACGACTGCCGTCGCCGCTGCGGGCT--TTCGACCTCCAAGGTCGCTGGT-CTCGCACGG-CGTCGGCGTCGAAGAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Neillia_sparsiflora_264 TCGATACCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACGCGTTATGA-ACTCGGGGG-AGGAGGGGCCTCGCGCCTC-TCGTCCCCT--TTGTC------------CCG-----GCGGGCGA---CCGTC--GGGCGAACAAACGAACACCGGCGCGAATTGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCCTGCGGGGGGCGGCGTCGCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCCCCATCCGCAACTCCCTCGGGAATGCGGGGCGGGGCGGAAGATGGCCTCCCGTGCGCCCCGCCGCGCGGTTGGCGTAAATACCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGTTGTCAAA---CCTCGGTGGCCTGTCGTGTGCGCGCGTCGCGACTCGAG-GGCTCGTCGGACCCAACGCTTCGCTTCGGCGACGCTTTCAACATGCGACGGCAGGCTCCATGCTTCGGCATCGAACTGTCGCCTC-GCGCCCCTCGTCAGTTTACGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTATTTCCTCCTCCAGCC--CCCCGCGGGTCGGAGGAGGACGTCGTAGCACTGCTTGTGTCCCGATCAAGCCGCACATCGTTGTGAGATTGTGACGGTCCACGAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAACGCTAAGCGGGCGC--GGAGTCTTC--GGCCTCCGATCGTCCAACTCGAAGCCTTTGTCGCTTGATGCGTACGACTGCCGTCGCTGCTGCGGGCT--TTCGACCTCCAAGGTCGCTGGT-CTCGCACGG-CG{CT}CGGCGTCGAAGAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Neillia_thibetica_145 TCGATACCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACGCGTTATGA-ACTCGGGGG-AGGAGGGGCCTCGCGCCTC-TCGTCCCCT--TTGTC------------CCG-----GCGGGCGA---CCGTC--GGGCGAACAAACGAACACCGGCGCGAATTGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCCTGCGGGGGGCGGCGTCGCGATCTTCGA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCCCC-TCCGCAACTCCCTCGGGAATGCGGGGCGGGGCGGAAGATGGCCTCCCGTGCGCTCCGCCGCGCGGTTGGCGTAAAT{AG}CCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGTTGTCAAA---CCTCGGTGGCATGTCGTGCGCGCGCGCCGCGAC{CT}CGAG-GGCTCTTCGGACCCAACGCTTCGCTTCGGCGACGCTTTCAACATGCGACGGCAGGCTCCATGCTTCGGCATCGAACTGTCGCCTC-GCGCCCCTCGTCAGTTTACGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTATTTCCTCCTCCAGCC--CCCCGCGGGTCGGAGGAGGACGTCGTAGCACTGCTTGTGTCCCGATCAAGCCACACATCGTTGTGAGATTGTGACGGTCCACGAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAACGCTAAGCGGGCGC--GGAGTCTTC--GGCCTCCGATCGTCCAACTCGAAGCCTTTGTCGCTTGACGCGTACGACTGCCGTCGCCGCTGCGGGCT--TTCGACCTCCAAGGTCGCTGGT-CTCGCACGG-CGCCGGCGTCAAAGAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Neillia_thibetica_169 TCGATACCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACGCGTTATGA-ACTCGGGGG-AGGAGGGGCCTCGCGCCTC-TCGTCCCCT--TTGTC------------CCG-----GCGGGCGA---CCGTC--GGGCGAACAAACGAACACCGGCGCGAATTGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCCTGCGGGGGGCGGCGTCGCGATCTTCGA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCCCC-TCCGCAACTCCCTCGGGAATGCGGGGCGGGGCGGAAGATGGCCTCCCGTGCGCTCCGCCGCGCGGTTGGCGTAAAT{AG}CCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGTTGTCAAA---CCTCGGTGGCATGTCGTGCGCGCGCGCCGCGAC{CT}CGAG-GGCTCTTCGGACCCAACGCTTCGCTTCGGCGACGCTTTCAACATGCGACGGCAGGCTCCATGCT{CT}CGGCATCGAACTGTCGCCTC-GCGCCCCTCGTCAGTTTACGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTATTTCCTCCTCCAGCC--CCCCGCGGGTCGGAGGAGGACGTCGTAGCACTGCTTGTGTCCCGATCAAGCCACACATCGTTGTGAGATTGTGACGGTCCACGAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAACGCTAAGCGGGCGC--GGAGTCTTC--GGCCTCCGATCGTCCAACTCGAAGCCTTTGTCGCTTGACGCGTACGACTGCCGTCGCCGCTGCGGGCT--TTCGACCTCCAAGGTCGCTGGT-CTCGCACGG-CGCCGGCGTCGAAGAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Neillia_thyrsiflora_170 TCGATACCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACGCGTTATGA-GCTCGGGGG-AGGAGGGGCCTCGCGCCTC-TCGTCCCCT--TTGTC------------CCG-----GCGGGCGA---CCGTC--GGGCGAACAACCGAACACCGGCGCGAATTGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCCTGCGGGGGGCGGCGTCGCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCCCC-TCCGCAGCTCCCTCGGGAATGCGGGGCGGGGCGGAAGATGGCCTCCCGTGCGCTCCGCCGCGCGGTTGGCCTAAATGCCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGTTGTCAAA---CCTCGGTGGCCTGTCGTGTGCGCGCGTCGCGACTCGAG-GGCTCGTCGGACCCAACGCTTCGCTTCGGCGACGCTTTAAACATGCGACGGCAGGCTCCATGCTTCGGCATCGAACTGTCGCCTC-GCGCCCCTCGTCAGTTTACGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTATTTCCTCCTCCAGCC--C-CCCGCGGTCGGAGGAGGACGTCGTAGCACTGCTTGTGTCCCGATCAAGCCACACCTGGTTGTGAGATTGTGACGGTCCACGAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAACGCTAAGCGGGCGC--GGAGTCTTC--GGCCTCCGATCGTCCAACTCGAAGCCTTTGTCGCTTGACGCGTACGACTGCCGTGGCCG{AC}TGCGGGCT--TTCGACCTCCAAGGTCGCTGGT-CTCGCACGG-CGCCGGCGTCGAAGAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Neillia_thyrsiflora_254 TCGATACCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACGCGTTATGA-ACTCGGGGG-AGGAGGGGCCTCGCGCCTC-TCGTCCCCT--TTGTC------------CCG-----GCGGGCGA---CCGTC--GGGCGAACAACCGAACACCGGCGCGAATTGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCCTGCGGGGGGCGGCGTCGCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCCC{AC}-TCCGCA{CG}CTCCCTCGGGAATGCGGGGCGGGGCGGAAGATGGCCTCCCGTGCGC{CT}CCGCCGCGCGGTTGGCGTAAAT{AG}CCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGTTGTCAAA---CCTC{GT}GTGGCCTGCCGTG{CT}GCGCGCGTCGCGACTCGAG-GGCTCGTCGGACCCAACGCTTCGCTTCGGCGACGCTTTCAACATGCGACGGCAGGCTCCATGCTTCGGCATCGAACTGTCGCCTC-GCGCCCCTCGTCAGTTTACGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTATTTCCTCCTCCAGCC--CCCCGCGGGTCGGAGGAGGACGTCGTAGCACTGCTTGTGTCCCGATCAAGCCACACCTGGTTGTGAGATTGTGACGGTCCACGAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAACGCTAAGCGGGCGC--GGAGTCTTC--GGCCTCCGATCGTCCAACTCGAAGCCTTTGTCGCTTGACGCGTACGACTGCCGTGGCCGCTGCGGGCT--TTCGACCTCCAAGGTCGTTGGT-CTCGCACGG-CGCCGGCGTCGAAGAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Neillia_thyrsiflora_258 TCGATACCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACGCGTTATGA-ACTCGGGGG-AGGAGGGGCCTCGCGCCTC-TCGTCCCCT--TTGTC------------CCG-----GCGGGCGA---CCGTC--GGGCGAACAACCGAACACCGGCGCGAATTGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCCTGCGGGGGGCGGCGTCGCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCCCC-TCCGCAGCTCCCTCGGGAATGCGGGGCGGGGCGGAAGATGGCCTCCCGTGCGCTCCGCCG{CT}GCGGTTGGCCTAAATGCCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGTTGTCAAA---CCTCGGTGGCCTGTCGTGTGCGCGCGTCGCGACTCGAG-GGCTCGTCGGACCCAACGCTTCGCTTCGGCGACGCTTTAAACATGCGACGGCAGGCTCCATGCTTCGGCATCGAACTGTCGCCTC-GCGCCCCTCGTCAGTTTACGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTATTTCCTCCTCCAGCC--CCCCGCGGGTCGGAGGAGGACGTCGTAGCACTGCTTGTGTCCCGATCAAGCCACACCTTGTTGTGAGATTGTGACGGTCCACGAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAACGCTAAGCGGGCGC--GGAGTCTTC--GGCCTCCGATCGTCCAACTCGAAGCCTTTGTCGCTTGACGCGTACGACTGCCGTGGCCGCTGCGGGCT--TTCGACCTCCAAGGTCGCTGGT-CTCGCACGG-CGCCGGCGTCGAAGAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Neillia_uekii_152 TCGATACCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACGCGTTATGA-ACTCGGGGG-GGGAGGGGCCTCGCGCCCC-TCGTCCCCT--TTGTC------------CCG-----GCGGGCGA---CCGTC-GGGGCGAACAAACGAACACCGGCGCGAATTGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCCTGCGGGGGGCGGCGTCGCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCCC--TCCGCAACTCCCTCGGGAATGCGGGGCGGGGCGGAAGATGGCCTCCCGTGCGCTTCGCCGCGCGGTTGGCGTAAATACCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGTTGTCAAA---CCTCGGTGGCATGTCGTGCGCGCGCGCCGCGACTCGAG-GGCTCTTCGGACCCAACGCTTCGCTTCGGCGACGCTTTCAACATGCGACGGCAGGCTCCGTGCTTCGGCATCGAACTGTCGCCTC-GCGCCCCTCGTCAGTTTACGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTATTTCCTCCTCCAGCC--CCCCGCGGGTCGGAGGAGGACGTCGTAGCACTGCTTGTGTCCCGATCAAACCACACATCGTTGTGAGATTGTGACGGTCCACGAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAACGCTAAGCGGGCGC--GGAGTCTTC--GGCCTCCGATCGTCCAACTCGAAGCCTTTGTCGCTTGACGCGTACGACTGCCGTGGCCGCTGCGGGCT--TTCGACCTCCAAGGTCGCTGGT-CTCGCACGG-CGCCGGCGTCGAAGAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Neillia_uekii_168 TCGATACCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACGCGTTATGA-ACTCGGGGG-GGGAGGGGCCTCGCGCCCC-TCGTCCCCT--TTGTC------------CCG-----GCGGGCGA---CCGTC-GGGGCGAACAAACGAACACCGGCGCGAATTGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCCTGCGGGGGGCGGCGTCGCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCCC--TCCGCAACTCCCTCGGGAATGCGGGGCGGGGCGGAAGATGGCCTCCCGTGCGCTTCGCCGCGCGGTTGGCGTAAATACCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGTTGTCAAA---CCTCGGTGGCATGTCGTGCGCGCGCGCCGCGACTCGAG-GGCTCTTCGGACCCAACGCTTCGCTTCGGCGACGCTTTCAACATGCGACGGCAGGCTCCGTGCTTCGGCATCGAACTGTCGCCTC-GCGCCCCTCGTCAGTTTACGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTATTTCCTCCTCCAGCC--CCCCGCGGGTCGGAGGAGGACGTCGTAGCACTGCTTGTGTCCCGATCAAACCACACATCGTTGTGAGATTGTGACGGTCCACGAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAACGCTAAGCGGGCGC--GGAGTCTTC--GGCCTCCGATCGTCCAACTCGAAGCCTTTGTCGCTTGACGCGTACGACTGCCGTGGCCGCTGCGGGCT--TTCGACCTCCAGGGTCGCTGGT-CTCGCACGG-CGCCGGCGTCGAAGAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Physocarpus_alternans_175 TCGATGCCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACAAGTTTTAACGCTCGGGGGGAGGGGGGGTCTCGCGCCTC-CCGTCCCCTTTTTGTC------------CCG-----GCGGGCGAAAGCCCTC{CT}-GGGCGATCAAACGAACACCGGCGCGAATTGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCTCGCGGGGGGCGGCGTCGCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCC---TCCGCAGCTCCCTCGGGAACGCGGG-CGGGGCGGAAGGTGGCCTCCCGTGCGCCCCGCCGCGCGGTTGGCATAAATACCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGCTTTCAAAACCCCCCCGTTGCGTGCCGTGCGCGCCCGTCGCGACTCGAG-GGCTCGCTTGCCCCTCTGCTTCGCTCCGGCGACGCTCTCAACATGCGGCGGCAGGCTCCGTGCTTCGGCATCGAACTGTCGCCTC-GCTTCCCTCGTCAGTG-GCGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTCTTTCCTCCTCCTGCC--CTTCGCGGGTCGGAGGGGGACGTTGTAGCACTGCTTGCGTCCCGATCAAGCCGCACATTGTTGCGAGCCTGCGACGGTCCCCAAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAATGCTAAGCGGGCGT--GGGGTCTTT--GACCTCCCATCGTCCAATTCGAAGCCTTTGTCGCTTGACGCGGACGACTGCCGTGCCCGCTGCGGACT--TTCGACCTC-AGGGTCGCTGGT-CTCGCACGG-CGCCGGCGTCGAAAAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Physocarpus_alternans_253 TCGATGCCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACAAGTTTTAACGCTCGGGGGGAGGGGGGGTCTCGCGCCTC-CCGTCCCCTTTTTGTC------------CCG-----GCGGGCGAAAGCCCTCC-GGGCGATCAAACGAACACCGGCGCGAATTGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCTCGCGGGGGGCGGCGTCGCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCC---TCCGCAGCTCCCTCGGGAACGCGGG-CGGGGCGGAAGGTGGCCTCCCGTGCGCCCCGCCGCGCGGTTGGCATAAATACCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGCTTTCAAAACCCCCCCGTTGCGTGCCGTGCGCGCCCGTCGCGACTCGAG-GGCTCGCTTGCCCCTCTGCTTCGCTCCGGCGACGCTCTCAACATGCGGCGGCAGGCTCCGTGCTTCGGCATCGAACTGTCGCCTC-GCTTCCCTCGTCAGTG-GCGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTCTTTCCTCCTCCTGCC--CTTCGCGGGTCGGAGGGGGACGTTGTAGCACTGCTTGCGTCCCGATCAAGCCGCACATTGTTGCGAGCCTGCGACGGTCCCCAAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAATGCTAAGCGGGCGT--GGGGTCTTT--GACCTCCCATCGTCCAATTCGAAGCCTTTGTCGCTTGACGCGGACGACTGCCGTGCCCGCTGCGGACT--TTCGACCTC-AGGGTCGCTGGT-CTCGCACGG-CGCCGGCGTCGAAAAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Physocarpus_amurensis_265 TCGATGCCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACAAGTTTTGACGCTCGGGGG-AGGGGGGGTCTCGCGCCTC-CCGTCCCCTTTTTGTC------------CCG-----GAGGGCGAAAGCCCTCCCGGGCGATCAAACGAACACCGGCGCGAACTGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCTCGCGGGGGGCGGCGTCGCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCC---TCCGCAGTTCCCTCGGGAACGCGGG-CGGGGCGGAAGGTGGCCTCCCGTGCGCCCCGCCGCGCGGTTGGCATAAATACCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGCTTTCAAAACCCCCCCGTTGCGTGCCGTGCGCGCCCGTCGCGACTCGAG-GGCTCGCTTGCCCCTCTGCTTCGCTCCGGCGACGCTCTCAACATGCGGCGGCAGGCTCCGTGCTTCGGCATCGAACTGTCGCCTC-GCTTCCCTCGTCAGTG-GCGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTCTTTCCTCCTCCTGCC--CTTCGCGGGTCGGAGGGGGACGTTGTAGCACTGCTTGCGTCCCGATCAGGCCTCACATTGTTGCGAGCCTGCGACGGTCCCCAAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAATGCTAAGCGGGCGT--GGGGTCTTT--GACCTCCCATCGTCCAATTCGAAGCCTTTGTCGCTTGACGCGGACGACTGCCGTGCCCGCTGCGGACT--CTCGACCTC-AGGGTCGCTGGT-CTCGCACGG-CGCCGGCGTCGAAAAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Physocarpus_capitatus_082 TCGATGCCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACAAGTT-TAACGCTCGGGGG-AGG-GGGGTCTCGCGCCTC-CCGTCCCCTTTTTGTC------------CCG-----GAGGGCGAAAGCCCTCCCGGGCGATCAAACGAACACCGGCGCGAATTGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCTCGCGGGGGGCGGCGT{AC}GCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCC---TCCGCAGCTCCCTCGGGAACGCGGG-CGGGGCGGAAGGTGGCCTCCCGTGCGCCCCGCCGCGCGGTTGGCATAAATACCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGCTTTCAAAACCCCCCCGTTGCGTGCCGTGCGCGCCCGTCGCGACTCGAG-GGCTCGCTTGCCCCTCTGCTTCGCTCCGGCGACGCTCTCAACATGCGGCGGCAGGCTCCGTGCTTCGGCACCGAACTGTCGCCTC-GCTTCCCTCGTCAGTG-GCGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTCTTTCCTCCTCCTGCC--CTTCGCGGGTCGGAGGGGGACGTTGTAGCACTGCTTGCGTCCCGATCAAGCCGCACATTGTTGCGAGCCTGCGACGGTCCCCAAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAATGTTAAGCGGGCGT--GGGGTCTTT--GACCTCCCATCGTCCAATTCGAAGCCTTTGTCGCTTGACGCGGACGACTGCCGTTGCCGCTGCGGACT--TTCGACCTC-AGGGTCGCTGGT-CTCGCACGG-CGCCGGCGTCGAAAAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Physocarpus_capitatus_155 TCGATGCCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACAAGTT-TAACGCTCGGGGGGAGGGGGGGTCTCGCGCCTC-CCGTCCCCTTTTTGTC------------CCG-----GAGGGCGAAAGCCCTCCCGGGCGATCAAACGAACACCGGCGCGAATTGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCTCGCGG{AG}GGGCGGCGT{AC}GCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCC---TCCGCAGCTCCCTCGGGAACGCGGG-CGGGGCGGAAGGTGGCCTCCCGTGCGCCCCGCCGCGCGGTTGGCATAAATACCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGCTTTCAAAACCCCCCCGTTGCGTGCCGTGCGCGCCCGTCGCGACTCGAG-GGCTCGCTTGCCCCTCTGCTTCGCTCCGGCGACGCTCTCAACATGCGGCGGCAGGCTCCGTGCTTCGGCACCGAACTGTCGCCTC-GCTTCCCTCGTCAGTG-GCGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTCTTTCCTCCTCCTGCC--CTTCGCGGGTCGGAGGGGGACGTTGTAGCACTGCTTGCGTCCCGATCAAGCCGCACATTGTTGCGAGCCTGCGACGGTCCCCAAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAATGCTAAGCGGGCGT--GGGGTCTTT--GACCTCCCATCGTCCAATTCGAAGCCTTTGTCGCTTGACGCGGACGACTGCCGTTGCCGCTGCGGACT--TTCGACCTC-AGGGTCGCTGGT-CTCGCACGG-CGCCGGCGTCGAAAAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Physocarpus_capitatus_184 TCGATGCCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACAAGTTTTAACGCTCGGGGGGAGGGGGGGTCTCGCGCCTC-CCGTCCCCTCTTTGTC------------CCG-----GAGGGCGAAAGCCCTCCCGGGCGATCAAACGAACACCGGCGCGAACTGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCTCGCGGGGGGCGGCGTCGCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCC---TCCGCAGCTCCCTCGGGAACGCGGG-CGGGGCGGAAGGTGGCCTCCCGTGCGCCCCGCCGCGCGGTTGGCATAAATACCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGCTTACAAAACCCCCC-GTTGCGTGCCGTGCGCGCCCGTCGCGACTCGAG-GGCTCGCTTGCCCCTCTGCTTCGCTCCGGCGACGCTCTCAACATGCGGCGGCAGGCTCCGTGCTTCGGCACCGAACTGTCGCCTC-GCTTCCCTCGTCAGTG-GCGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTCTTTCCTCCTCCTGCC--CTTCGCGGGTCGGAGGGGGACGTTGTAGCACTGCTTGCGTCCCGATCAAGCCGCACATTGTTGCGAGCCTGCGACGGTCCCCAAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAATGTTAAGCGGGCGT--GGGGTCTTT--GACCTCCCATCGTCCAATTCGAAGCCTTTGTCGCTTGACGCGGACGACTGCCGT{GT}GCCGCTGCGGACT--TTCGACCTC-AGGGTCGCTGGT-CTCGCACGG-CGCCGGCGTCGAAAAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Physocarpus_malvaceus_252 TCGATGCCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACAAGTTTTAACGCTCGGGGGGAGGGGGGGTCTCGCGCCTC-CCGTCCCCTCTTTGTC------------CCG-----GAGGGCGAAAGCCCTCCCGGGCGATCAAACGAACACCGGCGCGAATTGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCTCGCGGGGGGCGGCGT{AC}GCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCC---TCCGCAGCTCCCTCGGGAACGCGGG-CGGGGCGGAAGGTGGCCTCCCGTGCGCCCCGCCGCGCGGTTGGCATAAATACCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGCTTTCAAAACCCCCCCGTTGCGTGCCGTGCGCGCCCGTCGCGACTCGAG-GGCTCGCTTGCCCCTCTGCTTCGCTCCGGCGACGCTCTCAACATGCGGCGGCAGGCTCCGTGCTTCGGCACCGAACTGTCGCCTC-GCTTCCCTCGTCAGTG-GCGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTCTTTCCTCCTCCTGCC--CTTCGCGGGTCGGAGGGGGACGTTGTAGCACTGCTTGCGTCCCGATCAAGCCGCACATTGTTGCGAGCCTGCGACGGTCCCCAAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAATGCTAAGCGGGCGT--GGGGTCTTC--GACCTCCCATCGTCCAATTCGAAGCCTTTGTCGCTTGACGCGGACGACTGCCGTGCCCGCTGCGGACT--TTCGACCTC-A{CG}GGTCGCTGGT-CTCGCACGG-CGCCGGCGTCGAAAAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Physocarpus_malvaceus_266 TCGATGCCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACAAGTTTTAACGCTCGGGGGGAGGGGGGGTCTCGCGCCTC-CCGTCCCCTTTTTGTC------------CCG-----GAGGGCGAAAGCCCTCCCGGGCGATCAAACGAACACCGGCGCGAATTGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCTCGCGGGGGGCGGCGT{AC}GCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCC---TCCGCAGCTCCCTCGGGAACGCGGG-CGGGGCGGAAGGTGGCCTCCCGTGCGCCCCGCCGCGCGGTTGGCATAAATACCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGCTTTCAAAACCCCCCCGTTGCGTGCCGTGCGCGCCCGTCGCGACTCGAG-GGCTCGCTTGCCCCTCTGCTTCGCTCCGGCGACGCTCTCAACATGCGGCGGCAGGCTCCGTGCTTCGGCACCGAACTGTCGCCTC-GCTTCCCTCGTCAGTG-GCGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTCTTTCCTCCTCCTGCC--CTTCGCGGGTCGGAGGGGGACGTTGTAGCACTGCTTGCGTCCCGATCAAGCCGCACATTGTTGCGAGCCTGCGACGGTCCCCAAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAATGCTAAGCGGGCGT--GGGGTCTTC--GACCTCCCATCGTCCAATTCGAAGCCTTTGTCGCTTGACGCGGACGACTGCCGTGCCCGCTGCGGACT--TTCGACCTC-A{CG}GGTCGCTGGT-CTCGCACGG-CGCCGGCGTCGAAAAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Physocarpus_monogynus_183 TCGATGCCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACAAGTT-TAACGCTCGGGGGGAGGGGGGGTCTCGCGCCTC-CCGTCCCCTTTTTGTC------------CCG-----GAGGGCGAAAGCCCTCCCGGGCGATCAAACGAACACCGGCGCGAA{CT}TGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCTCGCGGGGGGCGGCGTCGCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCC---TCCGCAGCTCCCTCGGGAACGCGGG-CGGGGCGGAAGGTGGCCTCCCGTGCGCCCCGCCGCGCGGTTGGCATAAATACCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGCTTTCAAAACCCCCCCGTTGCGTGCCGTGCGCGCCCGTCGCGACTCGAG-GGCTCGCTTGCCCCTCTGCTTCGCTCCGGCGACGCTCTCAACATGCGGCGGCAGGCTCCGTGCTTCGGCACCGAACTGTCGCCTC-GCTTCCCTCGTCAGTG-GCGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTCTTTCCTCCTCCTGCC--CTTCGCGGGTCGGAGGGGGACGTTGTAGCACTGCTTGCGTCCCGATCAAGCCGCACATTGTTGCGAGCCTGCGACGGTCCCCAAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAATGCTAAGCGGGCGT--GGGGTCTTC--GACCTCCCATCGTCCAATTCGAAGCCTTTGTCGCTTGACGCGGACGACTGCCGTGCCCGCTGCGGACT--TTCGACCTC-AGGGTCGCTGGT-CTCGCACGG-CGCCGGCGTCGAAAAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Physocarpus_monogynus_269 TCGATGCCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACAAGTT-TAACGCTCGGGGG-AGGGGGGGTCTCGCGCCTC-CCGTCCCCTTTTTGTC------------CCG-----GAGGGCGAAAGCCCTCCCGGGCGATCAAACGAACACCGGCGCGAATTGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCTCGCGGGGGGCGGCGTCGCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCC---TCCGCAGCTCCCTCGGGAACGCGGG-CGGGGCGGAAGGTGGCCTCCCGTGCGCCCCGCCGCGCGGTTGGCATAAATACCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGCTTTCAAAACCCCCCCGTTGCGTGCCGTGCGCGCCCGTCGCGACTCGAG-GGCTCGCTTGCCCCTCTGCTTCGCTCCGGCGACGCTCTCAACATGCGGCGGCAGGCTCCGTGCTTCGGCACCGAACTGTCGCCTC-GCTTCCCTCGTCAGTG-GCGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTCTTTCCTCCTCCTGCC--CTTCGCGGGTCGGAGGGGGACGTTGTAGCACTGCTTGCGTCCCGATCAAGCCGCACATTGTTGCGAGCCTGCGACGGTCCCCAAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAATGCTAAGCGGGCGT--GGGGTCTTC--GACCTCCCATCGTCCAATTCGAAGCCTTTGTCGCTTGACGCGGACGACTGCCGTG{CT}CCGCTGCGGACT--{CT}TCGACCTC-AGGGTCGCTGGT-CTCGCACGG-CGCCGGCGTCGAAAAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Physocarpus_opulifolius_141 TCGATGCCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACAAGTT-TAACGCTCGGGGGGAGGGGGGGTCTCGCGCCTC-CCGTCCCCTTTTTGTC------------CCG-----GAGGGCGAAAGCCCTCCCGGGCGATCAAACGAACACCGGCGCGAA{CT}TGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCTCGCGGGGGGCGGCGTCGCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCC---TCCGCAATTCCCTCGGGAACGCGGG-CGGGGCGGAAGGTGGCCTCCCGTGCGCCCTGCCGCGCGGTTGGCATAAATACCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGCTTTCAAA-CCCCCCCGTTGCGTGCCGTGCGCGCCCGTCGCGACTCGAG-GGCTCGCTTGCCCCTCTGCTTCGCTCCGGCGACGCTCTCAACATGCGGCGGCAGGCTCCGTGCTTCGGCACCGAACTGTCGCCTC-GCTTCCCTCGTCAGTG-GCGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTCTTTCCTCCTCTTGCC--CTTCGCGGGTCGGAGGGGGACGTTGTAGCACTGCTTGCGTCCCGATCAAGCCGCACATTGTTGCGAGCCTGCGACGGTCCCCAAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAATGCTAAGCGGGCGT--GGGGTCTTC--GACCTCCCATCGTCCAATTCGAAGCCTTTGTCGCTTGACGCGGACGACTGCCGTGGCCGCTGCGGACT--CTCGACCTC-AGGGTCGCTGGT-CTCGCACGG-CGCCGGCGTCGAAAAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Physocarpus_opulifolius_142 TCGATGCCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACAAGTT-TAACGCTCGGGGGGAGGGGGGGTCTCGCGCCTC-CCGTCCCCTTTTTGTC------------CCG-----GAGGGCGAAAGCCCTCCCGGGCGATCAAACGAACACCGGCGCGAA{CT}TGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCTCGCGGGGGGCGGCGTCGCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCC---TCCGCAATTCCCTCGGGAACGCGGG-CGGGGCGGAAGGTGGCCTCCCGTGCGCCCTGCCGCGCGGTTGGCATAAATACCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGCTTTCAAA-CCCCCCCGTTGCGTGCCGTGCGCGCCCGTCGCGACTCGAG-GGCTCGCTTGCCCCTCTGCTTCGCTCCGGCGACGCTCTCAACATGCGGCGGCAGGCTCCGTGCTTCGGCACCGAACTGTCGCCTC-GCTTCCCTCGTCAGTG-GCGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTCTTTCCTCCTCCTGCC--CTTCGCGGGTCGGAGGGGGACGTTGTAGCACTGCTTGCGTCCCGATCAAGCCGCACATTGTTGCGAGCCTGCGACGGTCCCCAAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAATGCTAAGCGGGCGT--GGGGTCTTC--GACCTCCCATCGTCCAATTCGAAGCCTTTGTCGCTTGACGCGGACGACTGCCGTGGCCGCTGCGGACT--CTCGACCTC-AGGGTCGCTGGT-CTCGCACGG-CGCCGGCGTCGAAAAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Physocarpus_opulifolius_156 TCGATGCCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACAAGTT-TAACGCTCGGGGGGAGGGGGGGTCTCGCGCCTC-CCGTCCCCTTTTTGTC------------CCG-----GAGGGCGAAAGCCCTCCCGGGCGATCAAACGAACACCGGCGCGAA{CT}TGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCTCGCGGGGGGCGGCGTCGCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCC---TCCGCAATTCCCTCGGGAACGCGGG-CGGGGCGGAAAGTGGCCTCCCGTGCGCCCCGCCGCGCGG{AT}TGGCATAAATACCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGCTTTCAAA-CCCCCCCGTTGCGTGCCGTGCGCGCCCGTCGCGACTCGAG-GGCTCGCTTGCCCCTCTGCTTCGCTCCGGCGACGCTCTCAACATGCGGCGGCAGGCTCCGTGCTTCGGCACCGAACTGTCGCCTC-GCTTCCCTCGTCAGTG-GCGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTCTTTCCTCCTC{CT}TGCC--CTTCGCGGGTCGGAGGGGGACGTTGTAGCACTGCTTGCGTCCCGATCAAGCCGCACATTGTTGCGAGCCTGCGACGGTCCCCAAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAATGCTAAGCGGGCGT--GGGGTCTTC--GACCTCCCATCGTCCAATTCGAAGCCTTTGTCGCTTGACGCGGACGACTGCCGTGCCCGCTGCGGACT--CTCGACCTC-AGGGTCGCTGGT-CTCGCACGG-CGCCGGCGTCGAAAAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Physocarpus_opulifolius_164 TCGATGCCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACAAGTT-TAACGCTCGGGGGGAGGGGGGGTCTCGCGCCTC-CCGTCCCCTTTTTGTC------------CCG-----GAGGGCGAAAGCCCTCCCGGGCGATCAAACGAACACCGGCGCGAA{CT}TGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCTCGCGGGGGGCGGCGTAGCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCC---TCCGCAATTCCCTCGGGAACGCGGG-CGGGGCGGAAGGTGGCCTCCCGTGCGCCC{CT}GCCGCGCGGTTGGCATAAATACCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGCTTTCAAA-CCCCCCCGTTGCGTGCCGTGCGCGCCCGTCGCGACTCGAG-GGCTCGCTTGCCCCTCTGCTTCGCTCCGGCGACGCTCTCAACATGCGGCGGCAGGCTCCGTGCTTCGGCACCGAACTGTCGCCTC-GCTTCCCTCGTCAGTG-GCGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTCTTTCCTCCTCCTGCC--CTTCGCGGGTCGGAGGGGGACGTTGTAGCACTGCTTGCGTCCCGATCAAGCCGCACATTGTTGCGAGCCTGCGACGGTCCCCAAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAATGCTAAGCGGGCGT--GGGGTCTTC--GACCTCCCATCGTCCAATTCGAAGCCTTTGTCGCTTGACGCGGACGACTGCCGTGGCCGCTGCGGACT--CTCGACCTC-AGGGTCGCTGGT-CTCGCACGG-CGCCGGCGTCGAAAAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Stephanandra_chinensis_147 TCGATACCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACGCGTTATGA-ACTCGGGGG-AGGAGGGGCCTCGCGCCTC-TCGTCCCCT--TTGTC------------CCG-----GCGGGCGA---CCGCC--GGGCGAACAAACGAACACCGGCGCGAATTGCGCCAAGGAACCT{GT}AACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCCTGCGGGGGGCGGCGTCGCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACATCGTTGCCCCCCC-TCCGCA{CG}CTCCCTCGGGAATGCGGGGCGGGGCGGAAGATGGCCTCCCGTGCGCTCAGCCGCGCGGTTGGCATAAATGCCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGTTGTCAAA---CCTCGGTGGCCTGTC{AG}TGTGCGCGCGTCGCGACTCGAG-GGCTCGTCGGAC{AC}CAACGCTTCGCTTCGGCGACGCTTTCAACATGCGACGGCAGGCTCCATGCTTCGGCATCGAACTGTCGCCTC-GCGCCCCTGGTCAGTTTACGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTATTTCCTCCTCCAGCC--CCCCGCGGGTCGGAGGAGGACGTCGTAGCACTGCTTGTGTCCCGATCAAGCCACACATCGTTGTGAGATTGTGACGGTCCACGAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAACGCTAAGCGGGCGC--GGAGTCTTC--GGCCTCCGATCGTCCAACTCGAAGCCTTTGTCGCTTGACGCGTACGACTGC{CT}GTGGCCGCTGCGGGCT--TTCGACCTCCAAGGTCGCTGGT-CTCGCACGG-CGCCGGCGTCGAAGAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Stephanandra_chinensis_172 TCGATACCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACGCGTTATGA-ACTCGGGGG-AGGAGGGGCCTCGCGCCTC-TCGTCCCTT--ATGTC------------CCG-----GCGGGCGA---CCGTC-GGGGCGAACAAACGAACACCGGCGCGAATTGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCCTGCGGGGGGCGGCGTCGCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCCCT-TCCGCAACTCCCTCGGGAATGCGGGGCGGGGCGGAAGATGGCCTCCCGTGCGCCCCGCCGCGCGGTTGGCATAAATGCCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGTTGTCAAA---CCTCGGTGGCCTGTCGTGTGCGCGCGTCGCGACTCGAG-GGCTCGTCGGACCCAACGCTTCGCTTCGGCGACGCTTTCAACATGCGACGGCAGGCTCCATGCTTCGGCATCGAACTGTCGCCTC-ACGCCCCTGGTCAGTTTACGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTATTTCCTCCTCCAGCC--CCCCGCGGGTCGGAGGAGGACGTCGTAGCACTGCT{CT}GTGTCCCGATCAAGCCACACATCGTTGTGAGATTGTGACGGTCCACGAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAACGCTAAGCGGGCGC--GGAGTCTTC--GGCCTCCGATCGTCCAACTCGAAGCCTTTGTCGCTTGACGCGTACGACTGCCGTGGCCGCTGCGGGCT--TTCGACCTCCAAGGTCGCTGGT-CTCGCACGG-CGCCGGCGTCGAAGAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Stephanandra_incisa_102 TCGATACCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACGCGTTATGA-ACTCGGGGG-AGGAGGGGCCTCGCGCCTC-TCGTCCCCT--TTGTC------------CCG-----GCGGGCGA---CCGTC--GGGCGAACAAACGAACACCGGCGCGAATTGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCCTGCGGGGGGCGGCGTCGCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCCC--TCCGCACCTCCCTCGGGAATGCGGGGCGGGGCGGAAGATGGCCTCCCGTGCGCCCCGCCGCGCGGTTGGCATAAATGCCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGTTGTCAAA---CCTCGGTGGCCTGTCGTGTGCGCGCGTCGCGACTCGAG-GGCTCGTCGGACACAACGCTTCGCTTCGGCGACGCTTTCAACATGCGACGGCAGGCTCCATGCTTCGGCATCGAACTGTCGCCTC-ACGCCCCTGGTCAGTTTACGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTATTTCCTCCTCCAGCC--CCC{CT}GCGGGTCGGAGGAGGACGTCGTAGCACTGCTTGTGTCCCGATCAAGCCACACATCGTTGTGAGATTGTGACGGTCCACGAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAACGCTAAGCGGGCGC--GGAGTCTTC--GGCCTCCGATCGTCCAACTCGAAGCCTTTGTCGCTTGACGCGTACGACTGCCGTGGCCGCTGCGGGCT--TTCGACCTCCAAGGTCGCTGGT-CTCGCACGG-CGCCGGCGTCGAAGAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Stephanandra_incisa_160 TCGATACCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACGCGTTATGA-ACTCGGGGG-AGGAGGGGCCTCGCGCCTC-TCGTCCCCT--TTGTC------------CCG-----GCGGGCGA---CCGTC--GGGCGAACAAACGAACACCGGCGCGAATTGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCCTGCGGGGGGCGGCGTCGCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGTCGTTGCCCCCC--TCCGCACCTCCCTCGGGAATGCGGGGCGGGGCGGAAGATGGCCTCCCGTGCGCCCCGCCGCGCGGTTGGCATAAATGCCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGTTGTCAAA---CCTCGGTGGCCTGTCGTGTGCGCGCGTCGCGACTCGAG-GGCTCGTCGGACACAACGCTTCGCTTCGGCGACGCTTTCAACATGCGACGGCAGGCTCCATGCTTCGGCATCGAACTGTCGCCTC-ACGCCCCTGGTCAGTTTACGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTATTTCCTCCTCCAGCC--CCC{CT}GCGGGTCGGAGGAGGACGTCGTAGCACTGCTTGTGTCCCGATCAAGCCACACATCGTTGTGAGATTGTGACGGTCCACGAGTTGCTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAACGCTAAGCGGGCGC--GGAGTCTTC--GGCCTCCGATCGTCCAACTCGAAGCCTTTGT{CG}GCTTGACGCGTACGACTGCCGTGGCCGCTGCGGGCT--TTCGACCTCCAAGGTCGCTGGT-CTCGCACGG-CGCCGGCGTCGAAGAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Stephanandra_tanakae_162 TCGATACCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACGCGTTATGA-ACTCGGGGG-AGGAGGGGCCTCGCGCCTC-TCGTCCCCT--TTGCC------------CCG-----GCGGGCGA---CCGTC--GGGCGAACAAACGAACACCGGCGCGAATTGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCTTGCGGGGGGCGGCGTGGCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACATGTCGTTGCCCCCCC-TCCGCAACTCCCTCGGGAATGCGGGGCGGGGCGGAAGATGGCCTCCCGTGCGCCCCGCCGCGCGGTTGGCATAAATGCCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGTTGTCAAA---CCTCGGTGGCCTGTCGTGTGCGCGCGTCGCGACCCGAG-GGCTCGTCGGACCCAACGCTTCGCTCCGGCGACGCTTTCAACATGCGGCGGCAGGCTCCATGCTTCGGCATCGAACTGTCGCCTC-ACGCCCCTCGTCAGTTTACGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTATTTCCTCCTCCAGCC--CCCCGCGGGTCGGAGGAGGACGTCGTAGCACTGCTTGTGTCCCGATCAAGCCACACATCGTTGTGAGATTGTGACGGTCCACGAGTTGGTGCTCGATTTCTCGGATGCGGAACGCTAAGCGGGCGT--GGAGTCTTC--GGCCTCCGATCGTCCAACTCGAAGCCTTTGTCGCTTGACGCGTACGACTGCCGGGGCCGCTGCGGGCT--TTCGACCTCCAAGGTCGCTGGC-CTCGCACGG-CGCCGGCGTCGAAGAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Stephanandra_tanakae_171 TCGATACCTGCCTAGCAGAACGACCCGAGAACGCGTTATGA-ACTCGGGGG-AGGAGGGGCCTCGCGCCTC-TCGTCCCCT--TTGCC------------CCG-----GCGGGCGA---CCGTC--GGGCGAACAAACGAACACCGGCGCGAATTGCGCCAAGGAACCTTAACGAAAGAGCGCGCTCCCTCCGCCCCGGAAACGGTGCTTGCGGGGGGCGGCGTTGCGATCTTCAA---ATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACATGTCGTTGCCCCCCC-TCCGCAACTCCCTCGGGAATGCGGGGCGGGGCGGAAGATGGCCTCCCGTGCGCCCCGCCGCGCGGTTGGCATAAATGCCAAGTCCTCGGCGACGAGCGCCA-CGACAATCGGTGGTTGTCAAA---CCTCGGTGGCCTGTCGTGTGCGCGCGTCGCGACCCGAG-GGCTCGTCGGACCCAACGCTTCGCT{CT}CGGCGACGCTTTCAACATGCGGCGGCAGGCTCCATGCTTCGGCATCGAACTGTCGCCTC-ACGCCCCTGGTCAGTTTACGCATCAAGATT---GGCTTGTGCGAA-TGTCGGGTTCCTGTGTTGCCTACCTATCTCGAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-CTATTTCCTCCTCCAGCC--CCCCGCGGGTCGGAGGAGGACGTCGTAGCACTGCTTGTGTCCCGATCAAGCCACACATCGTTGTGAGATTGTGACGGTCCACGAGTTG{CG}TGCTCGATTTCTCGGATGCGGAACGCTAAGCGGGCG{CT}--GGAGTCTTC--GGCCTCCGATCGTCCAACTCGAAGCCTTTGTCGCTTGACGCGTACGACTGCCGGGGCCGCTGCGGGCT--TTCGACCTCCAAGGTCGCTGG{CT}-CTCGCACGG-CGCCGGCGTCGAAGAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT Vauquelinia_californica TCGA-ACCTGCCCAACAGAACGACCCGAGAACCAGTTTCAA-CGTCGGGTG-CCGGGGGCCCTTCGGGCTCTCCGTCCCGT--TAATC------------CCG-----G-GAGC-A---CGCTCCCGGGCGTACAAACGAACACCGGCGCGTATTGCGCCAAGGAACCCGAAAGAAA{CG}AGCGCGCT{CT}CCGCCGCCCCGAAAACGGTGCGCGCGCGGGT--GCGTCGTCTTCTTCAATGTATATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCACTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGCGTCACACGCCGTTGCCCCCCC-TCCGCGCCTCCCTCGGGAGCGTCGGGGGGAGCGGATGATGGCCTCCCGTGCGTCACCCCGCGCGGTTGGCACAAATGCCGGGTCCTCGGCGACGAGCGCCAACGACGATCGGTGGTTGTCAAA---CCTCGGTTGCATGTCGTGGCCGCCCGTCGCGCTTCGAGCGGCTCGCGACGCACGTCGCTCTGCTTCGGCGGAGCTTTCAACATTCGACGGCAGGCTCCGTGCTTTGGCATCGAACTGTCGGCTC-GTACCCCGCTTCAGTG-ATGCATCAAGATTTGTGTCTTGTGCGCG--GTTAGGTTTCTGTTTTGGCTACCTATCGTAAAGGAATGTTGCCTCTCGTTG-TCCCTTCATCCTCTTGCTGGCCTTGCTGGCGGGAGGACGACATTGTAGCGATGCCCGTGTCCCGAACAACCCACA-GTTTTTGTGCGATTGTGTCGGTGCTCGAGTTTTTGCTTGATATCTCGGATGCGGAACACTAGAGGGACGATGGG--TCTCTATGGCCTCCTATCGTCCA-TTCGAAGCCTT-GTCGCTCGATGCGTACGACTGTTGTGCCCGTGGCGAGCG--ATCGACCTTCAAGGTCGTTTGT-CTCGCGCGG-CGCCGGCGTCGAAGAGGAATGCTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT ; END; BEGIN SETS; CHARSET ETS (CHARACTERS = 'Oh_rDNA') = 633-1059; CHARSET 18S (CHARACTERS = 'Oh_rDNA') = 1060-1119; CHARSET ITS (CHARACTERS = 'Oh_rDNA') = 1-632; END; [ The following blocks are output data for analysis step 2770 ] BEGIN TREES; TITLE Tb7544; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep2770; TREE rDNA = [&R] (Lyonothamnus_floribundus,(Vauquelinia_californica,(((Physocarpus_amurensis_265,((Physocarpus_capitatus_082,Physocarpus_capitatus_184),Physocarpus_capitatus_155),Physocarpus_malvaceus_252,Physocarpus_malvaceus_266,Physocarpus_monogynus_183,Physocarpus_monogynus_269,(Physocarpus_opulifolius_156,(Physocarpus_opulifolius_141,Physocarpus_opulifolius_142,Physocarpus_opulifolius_164))),Physocarpus_alternans_253,Physocarpus_alternans_175),((Stephanandra_tanakae_162,Stephanandra_tanakae_171),(((((Neillia_sinensis_140,Neillia_sinensis_149),(Neillia_uekii_152,Neillia_uekii_168)),(Neillia_thibetica_145,Neillia_thibetica_169),Neillia_affinis_144),Neillia_sparsiflora_264,Neillia_gracilis_255),((Neillia_thyrsiflora_170,Neillia_thyrsiflora_258),Neillia_thyrsiflora_254),Stephanandra_chinensis_147,Stephanandra_chinensis_172,Stephanandra_incisa_102,Stephanandra_incisa_160))))); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr4569] END;