#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on July 29, 2025; 4:55 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Costa M.M., Carmo F.S., Melo M.P., Moreira G.M., Guimarães E.A., Rocha F.S., Abreu L.M., Costa S.D., & Pfenning L.H. 2020. Fusarium species from tropical grasses in Brazil and description of two new taxa. Mycological Progress, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S26793] [ The following blocks are input data for analysis step 28028 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep28028; DIMENSIONS NTAX=31; TAXLABELS 'Fusarium andiyazi CBS_119857' 'Fusarium brachiariae CML_3032' 'Fusarium brachiariae CML_3163' 'Fusarium caapiises CML_3657' 'Fusarium caapiises CML_3658' 'Fusarium caapiises CML_3659' 'Fusarium caapiises CML_3660' 'Fusarium caapiises CML_3881' 'Fusarium circinatum NRRL_25331' 'Fusarium coicis NRRL_66233' 'Fusarium denticulatum NRRL_25302' 'Fusarium fujikuroi NRRL_13566' 'Fusarium inflexum NRRL_20433' 'Fusarium konzum CBS_119849' 'Fusarium madaense CML_3853' 'Fusarium mundagurra NRRL_66235' 'Fusarium mundagurra NRRL_66236' 'Fusarium musae NRRL_25059' 'Fusarium napiforme NRRL_13604' 'Fusarium nygamai NRRL_13448' 'Fusarium oxysporum NRRL_22902' 'Fusarium proliferatum NRRL_22944' 'Fusarium ramigenum NRRL_25208' 'Fusarium sacchari NRRL_13999' Fusarium_sp._NRRL_25221 'Fusarium subglutinans NRRL_22016' 'Fusarium thapsinum NRRL_22045' 'Fusarium tjaetaba NRRL_66243' 'Fusarium tupiense CML_282' 'Fusarium udum CML_3238' 'Fusarium verticillioides NRRL_22' ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M57759] TITLE Fusarium_brachiaria_tub_FFSC; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep28028; DIMENSIONS NCHAR=528; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] 'Fusarium andiyazi CBS_119857' ?????????TGCTGTTGCACGCGTTGAGTTTATCGTGCCCCTGATTCTATTCTACCCCGCTGGGCGGTGGCAGCTCAACGACAATGCATGATAGATACCTAGCTAGCAGCTTTCACATACCTCCTGTCAAGACGAAGAAGCTAATCAGATCTTTTCTCTACGATAGGTTCACCTCCAGACCGGTCAGTGCGTAAGTGCTCATCGCTTCCTCAACGTCGCATGCGGGGG-ATACTTACAGTGTTTATCAGGGTAATCAAATTGGTGCTGCTTTTTGGCAAACCATCTCTGGCGAGCACGGCCTCGACAGCAATGGTGTCTACAACGGTACCTCCGAGCTTCAGCTCGAGCGCATGAGTGTTTACTTCAACGAGGTATGCATTAGCAGTCAATGTCAA-AAGTTCCCAAGCTCACACATCTAGGCCTCTGGCAACAAGTATGTTCCCCGAGCCGTCCTCGTCGATCTCGAGCCTGGTACCATGGACGCCGTCCGTGCT???????????????????????????????? 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TTCGTGCTGTGCTGTTGCACGCGTTGCGTTTGTCGTGCCCC-----TGATTCTACCCCGCTGGGCGGTGGCAGCTCAACGACAATGCATGATAGATA----GCTAGCAGCTTTCACATACCTTCTGTCAAGACGAAGAAGCTAATCAGATCTTTTCTCTACGATAGGTTCACCTCCAGACCGGTCAGTGCGTAAGTGCTCATCGCTTCCTCAGCGTCGCATGAGGGGGGATACTTACAGTGTTTATCAGGGTAACCAAATTGGTGCTGCTTTCTGGCAAACCATCTCTGGCGAGCACGGCCTCGACAGCAATGGTGTCTACAATGGTACCTCCGAGCTTCAGCTCGAGCGCATGAGTGTTTACTTCAACGAGGTATGCATTAGCAGTCAATGTCAA-GAGTTCACACGCTCACACATCTAGGCCTCTGGCAACAAGTATGTTCCCCGAGCCGTCCTCGTCGACCTCGAGCCTGGTACCATGGACGCCGTCCGTGCTGGTCCCTTCGGTCAGCTCTTCCGTCCCGACAA ; END; [ The following blocks are output data for analysis step 28028 ] BEGIN TREES; TITLE Fusarium_brachiaria_tub_FFSC; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep28028; TREE PAUP_1 = [&R] ((('Fusarium thapsinum NRRL_22045':0.00985,(('Fusarium andiyazi CBS_119857':0.001994,'Fusarium madaense CML_3853':0.019128):0.004847,('Fusarium napiforme NRRL_13604':0.011706,('Fusarium ramigenum NRRL_25208':0.00386,'Fusarium tjaetaba 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TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr128398] END;