#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on July 10, 2025; 11:57 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Verbruggen H., Clerck O., Schils T., Kooistra W., & Coppejans E. 2005. Evolution and phylogeography of Halimeda section Halimeda. Molecular Phylogenetics and Evolution, 37: 789-803. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1472] [ The following blocks are input data for analysis step 2859 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep2859; DIMENSIONS NTAX=18; TAXLABELS Halimeda_cuneata_1_AY826353_AY826369_AY823860 Halimeda_cuneata_2_AY826354_AY826370_AY823865 Halimeda_cuneata_3_AY826355_AY826371_AY823869 Halimeda_cuneata_4_AY826356_AY826372_AY823872 Halimeda_cuneata_7_AY826358_AY826374_AY823881 Halimeda_cuneata_undulata Halimeda_discoidea_1_AY826359_AY826375_AY823886 Halimeda_discoidea_1_AY826360_AY826376_AY823890 Halimeda_discoidea_2_AY826361_AY826377_AY823892 Halimeda_discoidea_3_AY826362_AY826378_AY823895 Halimeda_gracilis Halimeda_hummii Halimeda_lacunalis Halimeda_macrophysa Halimeda_magnidisca Halimeda_taenicola Halimeda_tuna_1_AY826367_AY826383_AY823910 Halimeda_tuna_2_AY826366_AY826382_AY823907 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M1039] TITLE plastid_concatenated; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep2859; DIMENSIONS NCHAR=2250; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=N GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 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Halimeda_gracilis 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Halimeda_magnidisca 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