#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on September 15, 2025; 10:11 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Takahashi K., Kawai-toyooka H., Ootsuki R., Hamaji T., Tsuchikane Y., Sekimoto H., Higashiyama T., & Nozaki H. 2021. Three sex phenotypes in a haploid algal species give insights into the evolutionary transition to a self-compatible mating system. Evolution, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S28238] [ The following blocks are input data for analysis step 28963 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep28963; DIMENSIONS NTAX=40; TAXLABELS Colemanosphaera_angeleri_NIES3382 Colemanosphaera_charkowiensis_NIES3383 Eudorina_cylindrica_UTEX1197 Eudorina_elegans_NIES456 Eudorina_elegans_UTEX1205 Eudorina_elegans_UTEX1212 Eudorina_illinoisensis_NIES460 Eudorina_peripheralis_UTEX1215c Eudorina_unicocca_UTEX737 Platydorina_caudata_UTEX1658 Pleodorina_californica_UTEX809 Pleodorina_indica_UTEX1990 Pleodorina_japonica_UTEX2523 Pleodorina_sphaerica_NIES4066 Pleodorina_starrii_NIES1362 Pleodorina_thompsonii_UTEX2804 Volvox_africanus_NIES3780 Volvox_aureus_NIES541 Volvox_aureus_NIES891 Volvox_aureus_NIES892 Volvox_barberi_UTEX804 Volvox_carteri_kawasakiensis_NIES732 Volvox_carteri_nagariensis_UTEX1885 Volvox_carteri_weismannia_UTEX1875 Volvox_dissipatrix_Marb2RS29 Volvox_gigas_UTEX1895 Volvox_globator_UTEX955 Volvox_obversus_UTEX1865 Volvox_ovalis_NIES2569 Volvox_powersii_UTEX1863 Volvox_reticuliferus_NIES3782 Volvox_reticuliferus_UTEX1891 Volvox_rousseletii_UTEX1862 Volvox_tertius_NIES4068 Volvox_tertius_NIES544 Volvox_tertius_UTEX132 Volvox_zeikusii_NIES731 Yamagishiella_unicocca_NIES872 Yamagishiella_unicocca_UTEX2428 Yamagishiella_unicocca_UTEX2430 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M61388] TITLE Volvocaceae_rbcL; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep28963; DIMENSIONS NCHAR=1128; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Pleodorina_sphaerica_NIES4066 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