#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on September 22, 2025; 5:13 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Castlebury L., Rossman A., Sung G., Hyten A., & Spatafora J. 2004. Multigene phylogeny reveals new lineage for Stachybotrys chartarum. Mycological Research, 108: 864-872. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1523] [ The following blocks are input data for analysis step 2963 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep2963; DIMENSIONS NTAX=67; TAXLABELS Aniptodera_chesapeakensis Aphysiostroma_stercorarium Balansia_sclerotica Bionectria_ochroleuca Bionectria_pityrodes Ceratocystis_fimbriata Ceratocystis_virescens Cercophora_septentrionalis Chaetomium_globosum Claviceps_paspali Colletotrichum_gloeosporioides Cordyceps_ophioglossoides Daldinia_concentrica Diaporthe_phaseolorum Diatrype_disciformis Didymostilbe_echinofibrosa Fragosphaeria_purpurea Glomerella_cingulata Gnomonia_setacea Gyromitra_esculenta Haematonectria_haematococca Halosarpheia_fibrosa Halosphaeria_appendiculata Halosphaeriopsis_mediosetigera Helvella_lacunosa Hypocrea_rufa Hypocrea_schweinitzii Hypomyces_polyporinus Leuconectria_clusiae Lindra_marinera Lindra_thallassiae Lulworthia_grandispora Lulworthia_medusa Melanconis_marginalis Melanospora_tiffani Melanospora_zamiae Microascus_trigonosporus Morchella_esculenta Myrothecium_cinctum Myrothecium_inundatum Myrothecium_roridum Myrothecium_verrucaria Nectria_cinnabarina Nectriopsis_violacea Neurospora_crassa Niesslia_exilis_1 Niesslia_exilis_2 Ochronectria_calami Ophiostoma_piliferum Paecilomyces_tenuipes Peethambara_spirostriata Petriella_setifera Peziza_badia Pleuroceras_pleurostyla Pseudonectria_rousseliana Sphaerodes_compressa Sphaerodes_fimicola Sphaerostilbella_aureonitens Stachybotrys_chartarum_1 Stachybotrys_chartarum_2 Stachybotrys_echinata Stephanonectria_keithii Stilbocrea_macrostoma Tuber_gibbosum Viridispora_diparietispora Xylaria_curta Xylaria_hypoxylon ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M1136] TITLE 18S_&_28S_rDNA; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep2963; DIMENSIONS NCHAR=1620; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .] Aniptodera_chesapeakensis 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Aphysiostroma_stercorarium 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Bionectria_ochroleuca 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Bionectria_pityrodes 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Claviceps_paspali TTATACAGCGAAACTGCGAATGGCTCATTATATAAGTTATCGTTTATTTGATAGTACCTT-ACTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTGAAAATCCCGACTCC--GGAAGGGATGTATTTATTAGATTAAAAACCAATGCCC-CCGTGGGCTCGCT---GGTGAATCATGATAACTTCTCGAATCGCATGGCCTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTTCCCTATCAACTTTCGATGTTTGGGTAGTGGCCAAACATGGTTGCAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTCGACCCCGGAGAAGGAGCCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACCCGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAG-CGTATATTAAAGTTGTTGTGGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGG--CTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGTACTGG---TCCGGCCGGGCCTTTCCCTCTGTGGAA-CCC-CATGCCCTTCACTGGGCGTGGCGGGGAAACAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGCTCCAGGCAGGCCTATGCTCGAATACATTAGCATGGAATAATGAAATAGGACGC-GCGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCG-CCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTAC-GCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAAC--ATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGACGATGTTATTTTTT--GACTCGTTCGGC???GAAAAGAAACCAACAGGGATTGCCCCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCAAATTTGAAATCTGG---CCCCC---GGGCCCCGAGTTGTAATTTGCAGAGGATG-TTT-TGGCGAGG-CGCCTTCCGA-GTTCCCTGGA-ACGGGACGCCATTGAGGGTGAGAGCCCCGT--CTGGTTGGATGCCGAGCC-TCTGTAAAGCTCCTTCGACGAGTCGAGTAGTTTGGGAATGCTGCTCTAAATGGGAGGTATATGTCTTCTAAAGCTAAATATTGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGAAAAGAGGGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGTGACCAGACTT-GGGCCCGG-GGATCACCCAGCGTTCT----CGCT--GGTGCACTCCGGCGGGC--CCAGGCCAGCATCAGCTCGTCCC--GGGGGACAAAGGCTCTGGGAATGTGGCTCCTCC--------GGGAG-TGTTATAGCCCTCTGCGCAATGCC-CTGGGGCGGGCT-GAGGACCGCG-CATCAC--GCAA---TGCT-GGCGTAAT Colletotrichum_gloeosporioides TTTTACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTATATAAGTTATCGTTTATTTGATAGTACCTT-ACTACATGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAACCTCGACTTC--GGAAGAGGTGTGTTTATTAGATTAAAAACCAATGCCC-TTCGGGGCTCACT---GGCGATTCATAATAACCTCTCGAATCGCATGGCCTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTTCCCTATCAACTTTCGATGCTAGAGTAGTGTTCTAGCATGGTTACAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTCGACCCCGGAGAAGGAGCCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACGATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAG-CGTATATTAAAGTTGTTGTGGTTAAAAAGCTCGTAGTAGAACCTTGGGCCTGG--CTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGCACTGG---TCCGGCCGGGCCTTTCCCTCTGTGGAA-CCG-CATGCCCTTCACTGGGTGTGCCGGGGAAACAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGCTCCAGGCAGGCCTTTGCTCGAATACATTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGT-GTGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCG-CCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTTATCAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACC-ATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGACGATGTTATTTTTT--GACTCGTTCGGCACCGAAAAGAAACCAACAGGGATTGCCTCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCAAATTTGAAATCT-G-CCCTA-------GGCCCGAGTTGTAATTTGCAGAGGATGCTTT-TGGTGCGG-TGCCTTCCAA-GTTCCCTAGA-ACGGGACGCCAGAGAGGGTGAGAGCCCCGT--ACAGTTGGACACCAAGCC-TTTGTAAAGCTCCTTCGACGAGTCGAGTAGTTTGGGAATGCTGCTCAAAATGGGAGGTATATTTCTTCTAAAGCTAAATACCGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGAAAAGAGGGTTAAACAGCACGTGAAATTGTTAAAAGGGAAGCGCTTGTGACCAGACTT-GCGTCCGGTGAATCACCCAGCTCTC---GCGGCT--GGGGCACTTCGCCGG---CTCAGGCCAGCATCAGCTCGCTGT--CGGGGACAAAAGCTTCAGGAACGTAGCTCTCTTC------GGGGAG-TGTTATAGCCTGTTGCATAATACC--TTCGGCGGGCT-GAGGTA-CGC-CGTCC---GCAAGGATGCT-GGCATAAT Cordyceps_ophioglossoides TTATACAGCGAAACTGCGAATGGCTCATTATATAAGTTATCGTTTATTTGATAGTACCTT-ACTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAATCCCGACTTC--GGAAGGGATGTATTTATTAGATTAAAAACCAATGCCC-TCT-GGGCTCTCT---GGTGATTCATGATAACTTCTCGAATCGCATGGCCTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTTCCCTATCAACTTTCGATGTTTGGGTAGTGGCCAAACATGGTTGCAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTCGACCCCGGAGAAGGAGGCTGAGAAACGG-TACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAG-CGTATATTAAAGTTGTTGTGGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGG--CTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGTACTGG---TCCGGCCGGGCCTTTCCCTCTGTGGAA-CCC-CATGCCCTTCACTGGGTGTGGCGGGGAAACAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGCTCCAGGCAGGCCTATGCTCGAATACATTAGCATGGAATAATGAAATAGGACGT-GCGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCG-CCGTAATGATTAATAGGGACAG-CGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGGCAAGGATGTTTTCATTAATCAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGGCGTAGGCTTAACC-ATAAACTATGCCGA-TAGGGATCGGACGATGTTATTTTT---GGCTCG-CCG-CACCGAAAAGAAACCAACAGGGATTGCCCCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCAAATTTGAAATCTGGCCCCC------AGGGCCCGAGTTGTAATTTGCAGAGGATGCTTT-TGGCGCGG-CGCCTTCCGA-GTTCCCTGGA-ACGGGACGCCATAGAGGGTGAGAGCCCCGT--CTGGTCGGACGCCAAGCC-AGTGTAAAGCTCCTTCGACGAGTCGAGTAGTTTGGGAATCCTGCTCTAAATGGGAGGTATATGTCTTCTAAAGCTAAATATTGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGAAAAGAGGGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGTGACCAGACTT-GGGCCCGGTGAATCATCCAGCGTTCT----CGCT--GGTGCACTTCGCCGGG--CTCAGGCCAGCATCAGTTCGCCGC--GGGGGATAAAAGCTTCGGGAACGTGGCTCCCTC--------GGGAG-TGTTATAGCCCGTTGCACAATACC-CTGCGGTGGACT-GAGGTTCGCG-CTCC----GCAAGGATGCT-G-CGTAAT Daldinia_concentrica TTATACTGCGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGTTAGTACCTT-ACTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAACCCCGACTCA--CGGAGGGGTGTATTTATTAGATTAAAAACCAATG-CC-TTCGGGGCTCTTT---GGTGATTCATAATAACTTCTCGAATCGCATGGCCTTGCGC-GGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGCAGGGTCTTGGCCTGCCATGGTTACAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTCGACCCCGGAGAAGGAGCCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGATACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAG-CGTATATTAAAGTTGTTGACGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGG--CTGGCTGGTCCGCCTCACCGCGTGCACTGG---TTCGGCCGGGCCTTTCCCTCTGGGGAA-CCC-CATGCCCTTCACTGGGTGTGGTGGGGAACCAGGACTTTTACTGTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCCTATGCTCGAATACATCAGCATGGAATAATAGAATAGGACGT-GCGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCG-CCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACC-ATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGACGATGTTATTTTTT--GACTCGTTCGGCACCGAAAAGAAACCAACAGGGATTGCCCTAGTAACGGCGAGTGAAGCG-CAACAGCTCAAATTTGAAATCTGGCCCT------AGCGGTCCGAGTTG-AATTTGTAGAGGATGCTTT-TGGTTAGG-TGCCTTCTGA-GTTCCCTGGA-ACGGGACGCCAGAGAGGGTGAGAGCCCCGT--ACGGTTGGACACCGAGCC-TCTATATAGCTCCTTCGACGAGTCGAGTAGTTTGGGAATGCTGCTCTAAATGGGAGGTAAATTTCTTCTAAAGCTAAATACCGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGTACTTTGAAAAGAGGGTTAAATAGCACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGTTTGCGACCAGACTT-TTTCCAGGCGGATCATCCGGTGTTCT----CACC--GGTGCACTTCGCCTGG--TTTAGGCCAGCATCGGTTCTCTTA--GGGGGATAAAGGCCTGGGGAACGTAGCTCCTTC--------GGGAG-TGTTATAGCCCCTTGCGTAATACC--TTCGGGGGACC-GAGGAACGCG-CATCT---GCAAGGATGCT-GGCGTAAT Diaporthe_phaseolorum 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Diatrype_disciformis TTATACCGCGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGATAGTACCTT-ACTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAATCCCGACTTA--CGGAGGGATGTATTTATTAGATTAAAAACCAATGCCC-TTCGGGGCTCCTT---GGTGATTCATAATAACAACTCGAATCGCATGGCCTTGTGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGCAGGGTCTTGGCCTGCCATGGTTACAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTCGACCCCGGAGAAGGAGCCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTATCCAATCCCGATTCGGGGAGATAGTGACGATAAATACTGATACAGGGCTCTTTCGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAG-CGTATATTAAAGTTGTTGAGGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGG--CTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGCACTGG---TCTGGCCGGGCCTTTTCCTCTGGGGAT-CCC-CATGCCCTTCACTGGGTGTGGTGGGGAACCAGGACTTTTACTGTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCATATGCTCGAATACATTAGCATGGAATAATAAAATAGGACGT-GCGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCG-CCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACC-ATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGACGATGTTATTTTTT--GACTCGTTCGGCACCGAAAAGAAACCAACAGGGATTGCCCTAGTAACGGCGAGTGAAGCG-CAACAGCTCAAATTTG--ATCTGGCCTTC-------GGGTCCGAGTTGTAATTTGTAGAGGATGCTTT-TGGTGAGG-TGCCTTCCGA-GTTCCTTGGA-ACAGGACGCCTTAGAGGGTGAGAGCCCCGT--ACGGTTGGACACCAAGCC-TTTGTAAAGCTCCTTCGACGAGTCGAGTAGTTTGGGAATGCTGCTCTAAATGGGAGGTAAATTTCTTCTAAAGCTAAATACCGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGTACTTTGAAAAGAGGGTTAAATAGCACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGTTTATGACCAGACCT-TTGTCAGGCGGATCATCCGGTGTTCTT---CACC--GGTGCACTTCGCCTGG--CTCAGGCCAGCATCGATTTCTGTA--GAGGGATAAAGACCATGGGAACGTAGCTCTCTTC------GGGGAG-TGTTATAGCCCTAGGTGTAATACC-TTTACGGGGATC-GAGGTTCGCG-CTTCT---GCAAGGATGCT-GGCGTAAT Didymostilbe_echinofibrosa TTATACAGCGAAACTGCGAATGGCTCATTATATAAGTTATCGTTTATTTGATAGTACCTT-ACTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAATCCCGACTTC--GGAAGGGATGTATTTATTAGATTAAAAACCAATGCCC-TCT-GGGCTCTCT---GGTGATTCATGATAACTTCTCGAATCGCATGGCCTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTTCCCTATCAACTTTCGATGTTTGGGTAGTGGCCAAACATGGTTGCAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTCGACCCCGGAGAAGGAGCCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAG-CGTATATTAAAGTTGTTGTGGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGG--CTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGTACTGG---TCCGGCCGGGCCTTTCCCTCTGTGGAA-CCC-CATGCCCTTCACTGGGTGTGGCGGGGAAACAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGCTCCAGGCAGGCCTATGCTCGAATACATTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGT-GTGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCG-CCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACC-ATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGACGATGTTACTTTTT--GACTCGTTCGGCACCGAAAAGAAACCAACAGGGATTGCCCCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCAAATTTGAAATCTGGCCCCA--------GGCCCGAGTTGTAATTTGCAGAGGATGCTTT-GGGCGCGG-TGCCTTCCGA-GTTCCCTGGA-ACGGGACGCCACAGAGGGTGAGAGCCCCGT--CTGGTCGGACACCAAGCC-TATGTAAAGCTCCTTCGACGAGTCGAGTAGTTTGGGAATGCTGCTCAAAATGGGAGGTATATGTCTTCTAAAGCTAAATACCGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGAAAAGAGAGTTAAACAGCACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGTTCATGACCAGACTT-GGCCC-GGTTGATCATCCAGCGTTCT----CGCT--GGTGCACTCTGCCGG---TCCAGGCCAGCATCAGTTCGCCGC--GGGGGATAAAGGTTTCGGGAATGTGGCTCCTC----------GGAG-TGTTATAGCCCGTTGCGCAATACC-CTGTGGTGGACT-GAGGTCCGCGC-TCT----GCAAGGATGCT-GGCGTAAT Fragosphaeria_purpurea ??????????AAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTCTATTTGATAGTACCTT-ACTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTGAAAACCCCGACTTC--GGAAGGGATGTATTTATTAGATTAAAAACCAATGCCC-TCCGGGGCTCCCT---GGTGATTCATAATAACTGCTCGAATCGCACGGCCTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGACGGCTGGGTCTTGGCCAGCCATGGTGACAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTCGACCCCGGAGAAGGAGCCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACGCGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAATTCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAG-CGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGGC--TGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGCACTGG---TCCGGCCGGGCCTTTCCCTCTGGGGAG-CCG-CATGCCCTTCACTGGGCGTGCCGGGGAACCAGGACGTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCTTATGCTCGGATACATTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGC-GCGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCG-CCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATCTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACC-ATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGACGGTGTTATTTTTT--GACCCGTTCGGCACCGAAAAGAAACCAACAGGGATTGCCCCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCAAATTTGAAATCTGGCCCC------CCGGGCCCGAGTTGTAATTTGGAGAGGATGCTTCT-GGCGCGG-CGCCTTCCGA-GTGCCTTGGA-ACAGGCCGCCACAGAGGGTGAGAGCCCCGT--ACGGTTGGTCGCCTAGCC-TCTGCGAAGCTCCTTCGACGAGTCGAGTAGTTTGGGAATGCTGCTCAAAATGGGAGGTAAATTTCTTCTAAAGCTAAATACCGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGAAAAGAGGGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCCCGGGGCCAGACTT-GCGCCCCGCGGACCACCCGGC-GTTCCG--CGCC--GGTGCACTCCGCGGGG--CGCAGGCCAGCATCGGTTCTTCCA--GGGGGAGAAAGGCCGCGGGAACGTAGCTCCTCC--------GGGAG-TGTTATAGCCCGCGGCGTCATGCC-CCTGGGGGGACC-GAGGACCGCGCTTCG----GCAAGGATGCT-GGCGTAAT Glomerella_cingulata TTATACAGCGAAACTGCGAATGGCTCATTATATAAGTTATCGTTTATTTGATAGTACCTT-ACTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAATCCCGACTTA--CGAAGGGATGTATTTATTAGATTAAAAACCAATGCCC-TTCGGGGCTCACT---GGTGATTCATAATAACTTCTCGAATCGCATGGCCTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTTCCCTATCAACTTTCGATGCTAGAGTAGTGTTCTAGCATGGTTACAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTCGACCCCGGAGAAGGAGCCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACGATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGT-TGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAG-CGTATATTAAAGTTGTTGTGGTTAAAAAGCTCGTAGTAGAACCTTGGGCCTGG--CTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGCACTGG---TCCGGCCGGGCCTTTCCCTCTGTGGAA-CCC-CATGCCCTTCACTGGGTGTGGCGGGGAA--AGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGCTCCAGGCAGGCCTATGCTCGAATACATTAGCATGGAATAATGAAATAGGACGT-GCGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCG-CCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTTATCAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACC-ATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGACGATGTTATTTTTT--GACTCGTTCGGCACCGAAAAGAAACCAACAGGGATTGCCTCAGTAACGGCGAGTGAAGCG-CAACAGCTCAAATTTG-TATCTGG--CCCT-------AGGCCGA-TTGTAATTTGTAGAGGTTG-TTT-TG-TGCGG-TGCCTTCCAA-GTTCCCTAGA-ACGGGACGCCAGAGAGGGTGAGAGCCCCGT--ACAGTTGGACACCAAGCC-TTTGTAAAGCTCCTTCGACGAGTCGAGTAGTTTGGGAATGCTGCTCAAAATGGGAGGTATATTTTTTCTAAAGCTAAATACCGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGAAAAGAGGGTTAAACAGCACGTGAAATTGTTAAAAGGGAAGCGCTTGTGACCAGACTT-GCGTCCGGTGAATCACCCAGCTCTC---GCGGCT--GG-GCACTTCGCCGG---CTCAGGCCAGCATCAGCTCGCTGT--CGGGGACAAAAGCTTCAGGAACGTAGCTCTCTTC------GGGGAG-TGTTATAGCCTGTTGCACAATACC-CTTCGGCGGGCT-GAGGTA-GCG-CCTCC---GCAAGGATGCT-GGCATAAT 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Gyromitra_esculenta 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Haematonectria_haematococca 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Halosarpheia_fibrosa 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Halosphaeria_appendiculata 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Halosphaeriopsis_mediosetigera 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Helvella_lacunosa 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Hypocrea_rufa 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Hypocrea_schweinitzii 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Hypomyces_polyporinus ??????????AAACTGCGAATGGCTCATTATATAAGTTATCGTTTATTTGATAATACCTT-ACTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAATCCCGACTTC--GGAAGGGTTGTATTTATTAGATTAAAAACCAATG-CC-TCT-GGGCTCTCT---GGTGAATCATGATAACTAGTCGAATCGACAGGCCTTGTGCCGGCGATGGCTCATTCAAATTTCTTCCCTATCAACTTTCGATGTTTGGGTATTGGCCAAACATGGTGGCAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTCGACCCCGGAGAAGGAGCCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTCGGGTCTTGTAATCGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGG-GGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAG-CGTATATTAAAGTTGTTGTGGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGG--CTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGTACTGG---TCCGGCCGGGCCTTTCCCTCTGTGGAA-CCC-CATGCCCTTCACTGGGTGTGGCGGGGAAACAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGCTCAAGGCAGGCCTATGCTCGAATACATTAGCATGGAATAATAAAATAGGACGT-GTGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCG-CCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATAC-GTCGTAGTCTTAACC-ATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGACGATGTTA-ATTTT--GACGCGTTCGGCAC???????????????????????CCCCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCAAATTTGAAATCTG---CTCC-------GGGCCGAGTTGTAATTTGTAGAGGATGCTTT-TGGTGCGG-CGCCAGCTGA-GTTCCCTGGA-ACGGGACGCCACAGAGGGTGAGAGCCCCGT--CACGCTGGACGCCAAGCC-TATGTAAAGCTCCTTCGACGAGTCGAGTAGTTTGGGAATGCTGCTCAAATTGGGAGGTATATGTCTTCTAAAGCTAAATACCGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGAAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTCATGACCAGACTT-GGGCTTGGCGAATCATCCAGCGTTCT----CGCC--GGTGCACTTCGCCTCG--CCCAGGCCAGCATCAGTTCGTCGC--GGGGGACAAAAGCGCCGGGAACGTGGCTCCCCC--------GGGAG-TGTTATAGCCCGGCGCACAATACC-CTGCGGTGGACT-GAGGTTCGCG-CATCT---GCAAGGATGCT-GGCGTAAT Leuconectria_clusiae 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Lindra_marinera 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Lindra_thallassiae 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Lulworthia_grandispora 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Lulworthia_medusa 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Melanconis_marginalis 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Melanospora_tiffani TTATACAGCGAAACTGCGAATGGCTCATTATATAAGTTATCGTTTATTTGATAGTGCCTT-ACTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTGAAAGCCCCGACTTAC-GGAGGGG-CGTATTTATTAGATTAAAAACCAATGCCC-TTCGGGGCTCTTT---GGTGATTCATGATAACTTCTCGAATCGCACGGCCTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTTCCCTATCAACTTTCGATGTTTGGGTAGTGGCCAAACATGGTGGCAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTCGACCCCGGAGAAGGAGCCTGAGAAACGGCTCCTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCTCAACTCGAGGAG-TAGTGACAATAAATACCGATGCAGGGCTCTTTAGGGTCTTGCAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAAGGAGGAACAATAGG--------------------------CGTTACTC-AGCTCC-ATAG-CGTATATTAAAGTTGTTGTGGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGG--CCGGCTGGTCCGCCTAACAGCGTGCACTGG---TGCGGCCGGGTCTT-CCCACCGCGGAG-CCG-CATGTCCTTCACTGGGCGTGTCGGGGAAGCGGTACTTTTACTGTGAAAAAATAAGAGTGCTCTAAGCAGGCCTATGCTCGAATACATTAGCATGGAATAATAGAATAGGACA--GTCGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACGT-CTGTAATGATTAACAGAAACAATCGGGGGCGTCAGTATTGCATCGTCAGAGGTGAAATTCTTAGATCGATGCAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTCGCCAAGGGTGTTTTCATTAATCAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACC-ATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGGCGGTGTTAATTTTT--GACCCGCTCGGCACC??????????????????????CCCTAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAGCAGCCCAGATTTGGAATCTGGTCCTTTT----GGGGCCCGAGTTGTAATCTGCAGAGGAAGCGTCT-GGTGCGG-TGCCGGCCTA-GTTCCCTGGA-ACGGGACGCCGTAGAGGGTGACAGCCCCGT--ACGGTCGGCCACCAAACC-TGTGTGTCGCTCCTTCGAAGAGTCGCGTAGTTTGGGAATGCTGCGCAAAGTGGGAGGTATGCTCCTCCTAAGGCTAAATACCGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACCTTGAAAATGGGGTTAAAAAGTACGTGAAATTGCCAAAGGGGAAGCGCTCGTGGCCAGACTC-GTGCCTTATGGATCATCCGGCTATTT----CGCC--GGTGCACTCCATTAGG--CTCGGGCCAGCGTCGGTCGGCGCC--GGTACTAAAAGACAGCGTGAACGTGGCTCTCTTC------GGGGAG-TGTTATAGCGCGCTGTGTAATGTG-CTGGCGCCGTCC-GAGGACCGCGCATTTAT--GCAAGGACGCT-GGCGTAAT Melanospora_zamiae 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Myrothecium_cinctum 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Myrothecium_inundatum 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Myrothecium_roridum 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Myrothecium_verrucaria 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Nectria_cinnabarina 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Nectriopsis_violacea 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Neurospora_crassa 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Niesslia_exilis_1 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Niesslia_exilis_2 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Paecilomyces_tenuipes TTATACAG-GAAACTGCGAATGGCTCATTATATAAGTTATCGTTTATTTGATAGTACCTT-ACTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAATCCCGACTTC--GGAAGGGATGTATTTATTAGATTAAAAACCAATGCCC-TCT-GGGCTCCTT---GGTGATTCATGATAACTCTTCGAATCGCACGG-CTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTTCCCTATCAACTTTCGATGTTTGGGTATTGGCCAAACATGGTTGCAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTCGACCCCGGAGAAGGAGGCTGAGAAACGGGTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGG-GCGCAAATTACCCAATCCCGATTCGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAG-CGT-TATTAAAGTTGTTGTGGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGG--CTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGCACTGG---TCCGGCCGGGCCTTTCCCTCTGTGGAA-CCC-CATGCCCTTCACTGGGCGTGGCGGGGAAACAGGACGTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGCTCCAGGCAGGCCTATGCTCGAATACATTAGCATGGAATAATGAAATAGGACGC-GTGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCG-CCGTAATGATTAATAGGGACAG-CGGGGGCATCAG-ATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCAT-TGGCAAGGATGTTTTCATTAATCAG-GAACGA-AGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCG-CGTAGGCTTAACC-ATAAACTATGCCGATTAGGGATCGGACGATGTTATTTTTT--GGCGCGTTCGGCAACGA-AAGAAACCAACAGGGATTGCCCCAGTAACGGCGAGTGAAGCGG-CAC-GCTC-AATTTGAAATCTGGCCCCC-------GGGTCCGAGTTGTAATTTGC-GAGGATGCTTC-GGGCGAGG-TGCCTTCCGA-GTTCCCTGGA-ACGGGACGCCACAGAGGGTGAGAGCCCCGT--CTGGTCGGACTCCGAGCC-CGTGTGAAGCTCCTTCGAAGAGTCGAGTAGTTTGGGAATGCTGCTCAAAATGGGAGGTATATGTCTTCTAAAGCTAAATATTGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGAAAAGAGGGTTAAAAAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCCCATGACCAGACTT-GGGCCCGGTGAATCACCCGGCGTTCT----CGCC--GGTGCACTTTGCCGGG--CACAGGCCAGCATCAGTTTGGCGC--GGGGGACAAAGGCTTCGGGAACGTGGCTCCCTC--------GGGAG-TGTTATAGCCCG-TGCGTAATACC-CTGCGCCGGACT-GAGGTACGCG-CATC----GCAAGGATGCT-GCCGTAAT 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Petriella_setifera TTATACCGCGAAACTGCGAATGGCTCATTATATAAGTTATCGTTTATTTGATAGCACATT-ACTACATGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAATCCCGACTTC--GGAAGGGATGTATTTATTAGATTAAAAGCCAATG-CC-TTCGGGGCTTCCT---GGTGATTCATAATAACTTTTCGAATCGCATGGCCTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTTCCCTATCAACTTTCGATGCGAAGGTATTGTCTTCGCATGGTTGCAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTCGACCCCGGAGAAGGAGCCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATCGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGT-TGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAG-CGTATATTAAAGTTGTTGTGGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGG--CTGGCCGGTCCCCCTCACCGGGTGCACTGA---TCCAGCCGGGCCTTTCCCTCTGTGGAA-CCC-CATGGCCTTCACTGGCTGTGGTGGGGAA-CAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGCTCCAGGCAGGCCTATGCTCGAATACATTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGT-GTGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCG-CCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATCTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTGATAAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCTATAAACTATGCCGACTAGGGATCGAACCGTGTTATTTCTTCCGAGCC??????????GAAAAGAAACCAACAGGGATTGCCTCAGTAACGGCGAGTGTTGCG-CAACAGCTCAAATTTG-AATCTGGCTGCTG-------AGTCCGAGTTGTAATTTGAAGAGGATG-TTT-TG-CAAGG-TGCCTTCCGA-GTTCCCTGGA-ATGGGACGCCATAGAGGGTGAGAGCCCCGT--ATGGTCGGTCGCCGAGCC-TCTGTAAAGCTCCTTCGACGAGTCGAGTAGTTTGGGAATGCTGCTCAAAATGGGAGGTAAACCCCTTCTAAAGCTAAATATTGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGAAAAGAGAGTTAAACAGCACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCGACCAGACTT-GTGCTCGTCGAATCAGCCGTCGCTCGT---CGGC--GGCGCATTTCGGCGGG--CTCAGGCCAGCATCAGTTCGCTGT-AGGGGGAGAAAGGCGGTAGGAATGTGGCTCTTC----------GGAG-TGTTATAGCCTACCGTATAATACC-CCTCGGTGGACT-GAGGACCGCG-CATCT---GCAAGGATGCT-GGCGTAAT Peziza_badia 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Pleuroceras_pleurostyla 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Pseudonectria_rousseliana 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Sphaerodes_compressa 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Stachybotrys_chartarum_2 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Stachybotrys_echinata 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Stephanonectria_keithii TTATACGGCGAAACTGCGAATGGCTCATTATATAAGTTATCGTTTATTTGATAGTATCTT-ACTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTTAAAATCCCGACTTC--GGAAGGGATGTATTTATTAGATTAAAAACCAATGCCC-TTCGGGGCTCTCT---GGTGATTCATGATAACTTCTCGAATCGCATGGCCTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTTCCCTATCAACTTTCGATGTTTGGGTATTGGCCAAACATGGTTGCAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTCGACCCCGGAGAAGGAGCCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACTCGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGTTCTTTTGGATCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAG-CGTATATTAAAGTTGTTGTGGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGG--CTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGTACTGG---TCCGGCCGGGCCTTTCCCTCTGTGGAA-CCC-CATGCCCTTCACTGGGTGTGGCGGGGAAACAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGCTCCAGGCAGGCCTTTGCTCGAATACATTAGCATGGAATAATGAAATAGGACGT-GCGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCG-CCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACC-ATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGACGGTGTTAACAATT--GACCCGTTCGGCACC???????AACCAACAGGGATTGCCCCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCAAATTTGAAATCTGGCCCTA--------GGCCCGAGTTGTAATTTGCAGAGGATGTTTCT-GGCGACG-CGCCTTCCGA-GTTCCCTGGA-ACGGGACGCCATAGAGGGTGAGAGCCCCGT--ACGGTTGGATGCCTAGCC-TCTGTGAAACTCCTTCGACGAGTCGAGTAGTTTGGGAATGCTGCTCTAAATGGGAGGTATACGTCTTCTAAAGCTAAATATAGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGAAAAGAGGGTTAAATAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCACTTATGACCAGACTT-GGGCA-GGTTGATCATCCGTCGTTCT----CGGC--GGTGCACTCTGCCTG---CCCAGGCCAGCATCAGTTCGCTTC--GGGGGATAAAGGTTTCGGGAATGTAGCTCCTTC--------GGGAG-TGTTATAGCCCGTTGCGTAATACC-CTGGGGTGGACT-GAGGTTCGCGCATCT----GCAAGGATGCT-GGCGTAAT Stilbocrea_macrostoma TTATACGGCGAAACTGCGAATGGCTCATTATATAAGTTATCGTTTATTTGATAGTACCTT-ACTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAATCCCGACTTC--GGAAGGGATGTATTTATTAGATTAAAAACCAATGCCC-TTCGGGGCTCTCT---GGTGATTCATGATAACTTCTCGAATCGCATGGCCTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTTCCCTATCAACTTTCGATGTTTGGGTATTGGCCAAACATGGTTGCAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTCGACCCCGGAGAAGGAGCCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTAGGGTCTTGTAATCGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAG-CGTATATTAAAGTTGTTGTGGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGG--CTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGTACTGG---TCCGGCCGGGCCTTTCCCTCTGTGGAA-CCC-CATGCCCTTCACTGGGTGTGGCGGGGAAACAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGCTCCAGGCAGGCCTATGCTCGAATACATTAGCATGGAATAATAAAATAGGACGC-GCGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCG-CCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACC-ATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGACGATGTTATTCTTT--GACTCGTTCGGCACC?????????????????????GCCCTAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCAAATTTGAAATCTGGCCCTA--------GGCCCGAGTTGTAATTTGTAGAGGATGTTTCT-GGTGCGG-TGCCTTCCGA-GTTCCCTGGA-ACGGGACGCCATAGAGGGTGAGAGCCCCGT--CCGGTCGTGCGCTAAGCC-TATGTGAAACTCCTTCGACGAGTCGAGTAGTTTGGGAATGCTGCTCTAAATGGGAGGTATACGTCTTCTAAAGCTAAATATTGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGAAAAGAGGGTTAAATAGTACGTGAAATTGCTGAAAGGGAAGCGCTTATGACCAGACTT-GGGCTAGGTGAATCATCCGGCGTTCT----CGCC--GGTGCACTTTGCCTG---CCCAGGCCAGCATCAGTTCACGTC--GGGGGACAAAGGCGTCGGGAATGTGGCTCCCTC--------GGGAG-TGTTATAGCCCGGCGTGTAATGCC-CTGGCGAGGACT-GAGGTACGCGC-TCC----GCAAGGATGCT-GGCGTAAT Tuber_gibbosum CTATACAGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGATAGTACCTTTGCTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAATCCCAACCCCT-GGAAGGGATGTATTTATTAGATAAAAAACCAATG-GC-TTCGGC-CTCCCT---GGTGATTCATGATAACTTAACGAATCGCATGGCCTTGCGCTGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTTTCAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCTATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAACAG-CGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGTCTGG--CTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGCACTGG---TCCGGCCGGATCTTTCCTTCTGGCTAG-CCG-CATGCCCTTCACTGGGTGTGTCGGGGAACCAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCATATGCTCGAATACATTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGT-GCGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCG-CCGTAATGATTAATAGGGATAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAGTGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACC-ATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGGCGATGTTCTTTTTCT-GACTCGCTCGGCACC??????????CAACAGGGATTGCCTCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAAAAGCTCAAATTTTAAATCTGACGCC-CACA--AGCGTTCGAGTTGTACTTTGGAGAGGCATCTTC-GTAAGGGGT-CCAGCCTAT-GTTCCTTGGA-ACAGGGCGTCATAGAGGGTGAGAATCCCGTTCATGGCTGGATACTCCTTGTATTATGTAGTGTCTTCAACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAAATGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGAAAATAGAGTTAAAAAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGAGATCAGAGTC-AGTCGATTATAAACAACTTTCCTTCT----GGAT--GGTGCACTTATTATTG--ATTGGGCCAGCATCAGTTGGGACG--GCAGGATAAAGGCCATGGGAATGTGACTCCATTTT-------GGAG-TGTTATAGCCCCTGGTGCCATGCTGTCTGCCCTGACT-GTGGACCGCG-CTTCG--GCTT-GGATGCT-GGCTTAAT Viridispora_diparietispora 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Xylaria_curta TTATACGGCGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGATAGTACCTT-ACTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAATCCCGACTCA--CGAAGGGATGTATTTATTAGATTAAAAACCAATGCCC-CTCGGGGCTTTCT---GGTGATTCATAATAACTTCTCGAATCGCATGGCCTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGCAGGGTCTTGGCCTGCCATGGTTACAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTCGACCCCGGAGAAGGAGCCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAG-CGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGG--CTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGCACTGG---TCTGGCCGGGCCTTTTCCCTCTGGGAG-CCC-TATGCCCTTCACTGGGTGTAGTGGGGAACCAGGACTTTTACTGTGAAAAAATTAGAG---TCAAA--AGGCCTATGCTCGAATAC-TCAGCATGGAAT-ATAGAATAGGA-GT-GTGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCG-CCGTAATG-TTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCA--AATCAG-GAACGAAAGTTAGGGG-TC-AAGACG--CAGATACCGTCGTAGTCTTAACC-ATAAACTATGCCGACTAGGGATCGG-CGGTGTTATTTTTT--GACTCGTTCGGCACCGAAAAGAAACCAACAGGGATTGCCCTAGTAACGGCGAGTGAAGCG-CAACAGCTCAAATTTG--ATCTGGCCCTC-------GGGTCCGAGTTGTAATTTGTAGAGGATG-TTT-TGGCGCGG-TGCCTTCCGA-GTTCCCTGGA-ACGGGACGCCTTAGAGGGTGAGAGCCCCGT--ACGGTTGGACACCTTGCC-TCTGTAAAGCTCCTTCGACGAGTCGAGTAGTTTGGGAATGCTGCTCTAAATGGGAGGTAAATTTCTTCTAAAGCTAAATATTGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGAAAAGAGGGTTAAATAGCACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGTTTGCGACCAGACCT-TTTCCTAGCGGATCATCCGGTGTTCT----CACC--GGTGCACTTCGCTAAG--TTTAGGCCAGCATCGGTTTCTGTA--GGGGGATAAAAGCTCTGGGAACGTAGCTCCTCC--------GGGAG-TGTTATAGCCCTCTGCATAATACC-TTTACGGGGACC-GAGGACCGCG-CTTCG---GCAAGGATGCT-GGCGTAAT Xylaria_hypoxylon TTATACGGCGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGATAGTACTTT-ATTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAATCCCGACTCA--CGAAGGGATGTATTTATTAGATTAAAAACCAATGCCC-CTCGGGGCTTATA---GGTGATTCATAATAACTTCTCGAATCGCATGGCCTTGCGCTGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGCAGGGTCTTGGCCTGCCATGGTTTCAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTCGA--CCGGAGAAGGAGCCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAG-AGG-G---AAATTACCCAAT-CCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGC-GTAATTCCAGCTCCAATAG-CGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGG-CCTGG--CTGGCCGGT-CGCCTCACCGCGTGCACTGG---TCT-GCCGGGCC-TTTCCTCTGGGGAG-CCC-CATGCCCTTCACTGGGTGTGGTGGGGAACCAGAACTTTTACTGTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCCTATGCTCGAATACATCAGCATGGAATAATAGAATAGGACGT-GTGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCG-CCGTAATGAT-AATA----CAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCA-TAATCAG-GAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACA---AGATACCGTCGTAGTCTT-ACC-ATAAACTATG-CGACTAGGGATCGGACGATG-TATTTTTT--GACTCGTTCGGCACCGAAAAGAAACCAACAGGGATTGCCCTAGTAACGGCGAGTGAAGCG-CAACAGCTCAAATTTG-TATCTGGCCTTC-------GGGTCCGAGTTGTAATTTGCAGAGGATG-TTT-GTGCGCGG-TGCCTTCCGA-GTTCCCTGGA-ACGGGACGCCTTAGAGGGTGAGAGCCCCGT--ACGGTTGGACACCAAGCC-TCTGTAAAGCTCCTTCGACGAGTCGAGTAGTTTGGGAATGCTGCTCTAAATGGGAGGTAAATTTCTTCTAAAGCTAAATATTGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGAAAAGAGGGTTAAATAGCACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGTTTACGACCAGACCT-TTTC-CAGCGGATCATCCGGTGTTCT----CACC--GGTGCACTTCGCTGGG--TTGAGGCCAGCATCGGTTTCCGCA--GGGGGATAAAAGCCTGGGGAACGTAGCTCCCTC--------GGGAG-TGTTATAGCCCCTCGCATAATACC--TTGCGGGGACC-GAGGACCGCG-CTTCG---GCAAGGATGCT-GGCGTAAT ; END; BEGIN SETS; CHARSET LSU (CHARACTERS = 18S_&_28S_rDNA) = 1025-1620; CHARSET SSU (CHARACTERS = 18S_&_28S_rDNA) = 1-1024; END; [ The following blocks are output data for analysis step 2963 ] BEGIN TREES; TITLE Tb7736; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep2963; TREE Fig._1 = [&R] ((((((((Melanospora_zamiae,Melanospora_tiffani),(Sphaerodes_compressa,Sphaerodes_fimicola)),(((Hypomyces_polyporinus,(Sphaerostilbella_aureonitens,(Aphysiostroma_stercorarium,(Hypocrea_schweinitzii,Hypocrea_rufa)))),(Nectria_cinnabarina,(Haematonectria_haematococca,(Pseudonectria_rousseliana,(Leuconectria_clusiae,Viridispora_diparietispora)))),((Claviceps_paspali,Balansia_sclerotica),(Cordyceps_ophioglossoides,Paecilomyces_tenuipes)),((Ochronectria_calami,(Stilbocrea_macrostoma,(Nectriopsis_violacea,(Stephanonectria_keithii,(Bionectria_ochroleuca,Bionectria_pityrodes))))),(((Stachybotrys_echinata,(Stachybotrys_chartarum_1,Stachybotrys_chartarum_2)),((Didymostilbe_echinofibrosa,Peethambara_spirostriata),(Myrothecium_roridum,Myrothecium_cinctum,Myrothecium_verrucaria,Myrothecium_inundatum))),(Niesslia_exilis_1,Niesslia_exilis_2)))),((Glomerella_cingulata,Colletotrichum_gloeosporioides),(((Petriella_setifera,Microascus_trigonosporus),((Halosphaeria_appendiculata,Aniptodera_chesapeakensis),(Halosphaeriopsis_mediosetigera,Halosarpheia_fibrosa))),(Ceratocystis_virescens,Ceratocystis_fimbriata))))),(Lulworthia_medusa,(Lulworthia_grandispora,(Lindra_marinera,Lindra_thallassiae)))),(((Xylaria_hypoxylon,Xylaria_curta),(Diatrype_disciformis,Daldinia_concentrica)),((Diaporthe_phaseolorum,(Melanconis_marginalis,(Pleuroceras_pleurostyla,Gnomonia_setacea))),((Neurospora_crassa,(Chaetomium_globosum,Cercophora_septentrionalis)),(Ophiostoma_piliferum,Fragosphaeria_purpurea))))),Peziza_badia),(Helvella_lacunosa,(Morchella_esculenta,Gyromitra_esculenta))),Tuber_gibbosum); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr4592] END;