#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on September 20, 2025; 9:11 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Cialdella A., Giussani L., Aagesen L., Zuloaga F., & Morrone O. 2007. A Phylogeny of Piptochaetium (Poaceae: Pooideae: Stipeae) and Related Genera Based on a Combined Analysis, including trnL-F, rpl16 and Morphology. Systematic Botany, null. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1753] [ The following blocks are input data for analysis step 3492 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep3492; DIMENSIONS NTAX=58; TAXLABELS Aciachne_acicularis Anatherostipa_brevis Bromus_catharticus Hesperostipa Jarava_ichu Jarava_juncoides Jarava_leptostachya Jarava_media Jarava_plumosa Jarava_plumosula Jarava_scabrifolia Jarava_vaginata Nassella_arcaensis Nassella_arcuata Nassella_cabrerai Nassella_caespitosa Nassella_charruana Nassella_cordobensis Nassella_curamalalensis Nassella_hyalina Nassella_megapotamica Nassella_melanosperma Nassella_mexican Nassella_meyeri Nassella_neesiana Nassella_novari Nassella_pampagrandensis Nassella_pubiflora Nassella_punensis Nassella_sanluisensis Nassella_tenuis Nassella_tenuissima Nassella_trichotoma Nassella_tucumana Piptatherum_miliaceum Piptochaetium_avenaceum Piptochaetium_bicolor Piptochaetium_calvescens Piptochaetium_fimbriatum Piptochaetium_hackelii Piptochaetium_indutum Piptochaetium_lasianthum Piptochaetium_lejopodum Piptochaetium_medium Piptochaetium_montevidensis Piptochaetium_napostaense Piptochaetium_panicoides Piptochaetium_pilosum Piptochaetium_ruprechtianum Piptochaetium_sagasteguii Piptochaetium_seleri Piptochaetium_setosum Piptochaetium_stipoides_echinulatum Piptochaetium_stipoides_stipoides Piptochaetium_tovarii Piptochaetium_uruguense Piptochaetium_virescens Poa_holciformis ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M1773] TITLE rpl16; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep3492; DIMENSIONS NCHAR=1329; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Jarava_ichu 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Nassella_cabrerai ???????????????GTGTGTCTCGTTAGTT-------------TTTTCTTTAAAAAAGAAAAAAACTTAGTAATTAT-----AGAAAATTAACTAATAACCAACCTATTGCTTCGTATTGTCGAGATCCTAACTAAGAAACAGTCACTATATGAATAAATACTTCT-------ATCATAAATGAGTAGATCTATCATATAGTTGTAGCAACTGCAATTTTTTCTGTAAAAAAGAAATGGAATTCTAGGTTGTGAAGTAAAACTAAAGGGATGTGGATAAAGGGAGGGATGATAGAAA----GAAGAAGAA-TAAGTAAGATATAGGATTCCAATATGTATGGTCTATGAATTGCATCATAAAAGGCAATGTGATAAAGCATCAATATAATAAAAATAACAGAGAATTCGAAATCGTTACTTGAAACAAGAACTACAAATTTAAAGCAATAAT-------AAAGAGCCGCTCGGGTTAATAAAACTGAGAAAATTAACTCGGAAAGA-AATTTTTTGGAAGCTCCATTGCGGGATTCAGACCTAACCATTCAAGGAGAAGCAGTGGGAACGACAGAAACTATGACTCCATAGGATTTTATTGAAAAGAATCCTAATA?TTCATTGGGTGGGATGGCGGAACAAACCAAAAAAATTGTCTTATTTGGTAAGGTTATAAATTAAGAAATAAGACAGGAAAGAGTAAATATTCGCCCGCGAAATCATTATTGAATTAGAATACTTTACCGCGATTCAATAAGAGTCAAAATAAGGATA--TTTTTTAAGAAAGATTACATTATCTATAAATATAGAATATAGATAAATAGACACACGCATCTAGATATATTCTAGATCTTCTTTCTTTACTAT-------ATATTTTTCTATTTTAACAAATTCAATATTAAATAT-----TAAAAAAAACCTA----------------------ACTTTTTCTATTATCTATTAATGTGTATCTATCCGT------------------------------------AATATTTTTGAATATTATGGAATTAGAGAAATTTGCACGCTTTCTCATTTCATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCATGTCCAGTTTTGCAGTAGAGATGGAACTAAGAAAAAACCATCGACTATAACCCCAAAAGAACCAGATTTCGCAAACAACATAGAGGAAGAATGAAGGGAAAATCCTGCCGAGGCAATCGTATTTGTTTTGGTAGATATGCTCTTCAAGCACTTGAACCCGCTTGGATCACGGCGAGACAGATAGAAGCGGGACGAAGAGGAATAACCCGATA???????? 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Nassella_charruana ??????????????????TGTCTCGTTAGTT-------------TTTTCTTTAAAAAAGAAAAAAACTTAGTAATTAT-----AGAAAATTAACTAATAACCAACCTATTGCTTCGTATTGTCGAGATCCTAACTAAGAAACAGTCACTATATGAATAAATACTTCT-------ATCATAAATGAGTAGATCTATCATATAGTTGTAGCAACTGCAATTTTTTCTGTAAAAAAGAAATGGAATTCTAGGTTGTGAAGTAAAACTAAAGGGATGTGGATAAAGGGAGGGATGATAGAAA----GAAGAAGAA-TAAGTAAGATATAGGATTCCAATATGTATGGTCTATGAATTGCATCATAAAAGGCAATGTGATAAAGCATCAATATAATAAAAATAACAGAGAATTCGAAATCGTTACTTGAAACAAGAACTACAAATTTAAAGCAATAAT-------AAAGAGCCGCTCGGGTTAATAAAACTGAGAAAATTAACTCGGAAAGA-AATTTTTTGGAAGCTCCATTGCGGGATTCACACCTAACCATTCAAGGAGAAGCAGTGGGAACGACAGAAACTATGACTCCATAGGATTTTATTGAAAAGAATCCTAATAGTTCATT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Nassella_curamalalensis 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Nassella_hyalina 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Nassella_megapotamica 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Nassella_melanosperma 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Nassella_meyeri 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Nassella_novari 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Nassella_pubiflora 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Nassella_trichotoma ?????????????????????????????????????????????????????AAAAAGAAAAAAACTTAGTAATTAT-----AG?AAATTAACTAATAACC?ACCTATTGCTTCGTATTGTCGAGATCCTAACTAAGAAACAGTCACTATATGAATAAATACTTCT-------ATCATAAATGAGTAGATCTATCATATAGTTGTAGCAACTGCAATTTTTTCTGTAAAAAAGAAATGGAATTCTAGGTTGTGAAGTAAAACTAAAGGGATGTGGATAAAGGGAGGGATGATAGAAA----GAAGAAGAA-TAAGTAAGATATAGGATTCCAATATGTATGGTCTATGAATTGCATCATAAAAGGCAATGTGATAAAGCATCAATATAATAAAAATAACAGAGAATTCGAAATCGTTACTTGAAACAAGAACTACAAATTTAAAGCAATAAT-------AAAGAGCCGCTCGGGTTAATAAAACTGAGAAAATTAACTCGGAAAGA-AATTTTTTGGAAGCTCCATTGCGGGATTCAGACCTAACCATTCAAGGAGAAGCAGTGGGAACGACAGAAACTATGACTCCATAGGATTTTATTGAAAAGAATCCTAATAGTTCATTGGGTGGGATGGCGAAACAAACCAAAAAAATTGTCTTATTTGGTAAGGTTATAAATTAAGAAATAAGACAGGAAAGAGTAAATATTCGCCCGCGAAATCATTATTGAATTAGAATACTTTACCGCGATTCAATAAGAGTCAAAATAAGGATA--TTTTTTAAGAAAGATTACATTATCTATAAATATAGAATATAGATAAATAGACACACGCATCTAGATATATTCTAGATCTTCTTTCTTTACTAT-------ATATTTTTCTATTTTAACAAATTCAATATTAAATAT-----TAAAAAAAACCTA----------------------ACTTTTTCTATTATCTATTAATGTGTATCTATCCGT------------------------------------AATATTTTTGAATATTATGGAATTAGAGAAATTTGCACGCTTTCTCATTTCATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCATGTCCAGTTTTGCAGTAGAGATGGAACTAAGAAAAAACCATCGACTATAACCCCAAAAGAACCAGATTTCGCAAACAACATAGAGGAAGAATGAAGGGAAAATCCTGCCGAGGCAATCGTATTTGTTTTGGTAGATATGCTCTTCAAGCACTTGAACCCGCTTGGATCACGGCGAGACAGATAGAAGCGGGACGAAGAGGAATAACACGATATGCACGTC Nassella_tucumana ?????????????GTGTGTGTCTCGTTAGTT-------------TTTTCTTTAAAAAAGAAAAAAACTTAGTAATTAT-----AGAAAATTAACTAATAACCAACCTATTGCTTCGTATTGTCGAGATCCTAACTAAGAAACAGTCACTATATGAATAAATACTTCT-------ATCATAAATGAGTAGATCTATCATATAGTTGTAGCAACTGCAATTTTTTCTGTAAAAAAGAAATGGAATTCTAGGTTGTGAAGTAAAACTAAAGGGATGTGGATAAAGGGAGGGATGATAGAAA----GAAGAAGAA-TAAGTAAGATATAGGATTCCAAAATGTATGGTCTATGAATTGCATCATAAAAGGCAATGTGATAAAGCATCAATATAATAAAAATAACAGAGAATTCGAAATCGTTACTTGAAACAAGAACTACAAATTTAAAGCAATAAT-------AAAGAGCCGCTCGGGTTAATAAAACTGAGAAAATTAACTCGGAAAGA-AATTTTTTGGAAGCTCCATTGCGGGATTCAGACCTAACCATTCAAGGAGAAGCAGTGGGAACGACAGAAACTATGACTCC?TAGGATTTTATTGAAAAGAATCCTAATAGTTCATTGGG??????????????????????????????????????????????ATAA?TTAAGAAATAAGACAGGAAAGAGTAAATATTCGCCCGCGAAATCATTATTGAATTAGAATACTTTACCGCGATTCAATAAGAGTCAAAATAAGGATA--TTTTTTAAGAAAGATTACATTATCTATAAATATAGAATATAGATAAATAGACACACGCATCTAGATATATTCTAGATCTTCTTTCTTTACTAT-------ATATTTTTCTATTTTAACAAATTCAATAT------------TAAAAAAAACCTA----------------------ACTTTTTCTATTATCTATTAATGTGTATCTATCCGT------------------------------------AATATTTTTGAATATTATGGAATTAGAGAAATTTGCACGCTTTCTCATTTCATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCATGTCCAGTTTTGCAGTAGAGATGGAACTAAGAAAAAACCATCGACTATAACCCCAAAAGAACCAGATTTCGCAAACAACATAGAGGAAGAATGAAGGGAAAATCCTGCCGAGGCAATCGTATTTGTTTTGGTAGATATGCTCTTCAAGCACTTGAACCCGCTTGGATCACGGCGAGACAGATAGAAGCGGGACGAAGAG????????????????????? 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Piptochaetium_bicolor 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Piptochaetium_indutum 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Piptochaetium_lasianthum ?TGCTATGC?TTAGTGTGTGTCTCGTTAGCT-------------TTTTCTTTTTTAAAGAAAAAAATTTAGTAATTAT-----AGAAAATTAACTAATAACCAACCTATTGCTTCGTATTGTCGAGATCCTAACTAAGAAACAGTCACTATATGAA-----ACTTCT-------ATCATAAATGAGTAGATCTATCATATAGTTGTAGCAACTGCAATTTTTTCTCTAAAAAAGAAATAGGATTCTAGGTTGTGAAGGAAAACTAAAGGGATGTGGATAAAGGGAGGGATGATAGAAA----G------AA-TAAGTAAGATATAGGATTCCAATATGTATGGTCTATGAATTGCATCATAAAAGGCAATGTGATAAAGCATCAATATAATAAAAATAACAGAGAATTCGAAATCGTAACTTGAAACAAGAACTACAAATTTCAAGCAATAAT-------AAAGA-CTGCTCGGGTTAATAAAACTGAGAAAATTAACTCGGAAAGA-AATTTTTTGAAAGCTCCATTGCGGGATTTAGACCTAACCATTCAAGGAGAAGCAGTGGGAACGACAGAACCTATGACTCCATAGGATTTTATTGAAAAGAATCCTAATACTTCATTGGGTGGGATGGCGGAACAAACCAAAAAAATTGTCTTATTTGGTA?GGTTATAAATTAACAAATAAGACAGGAAAGAGTAAATATTCGCCCGCGAAATCCTTATTGAATTAGAATACTTTACCGCGATTCAATAAGAGTAAAAATAAGGAGA-TTTTTTTAAGAAAGATTACATTATCTATA-------AATATAGATAAATAGACACA--CATCTAGATATATTCTAGATCTTCTTTCTTTACTAT-------ATATTTATCTATTTTAACAAATTCAATATTAAATAT-----TAAAAAAAACCTA----------------------ACTTTTTCTATTATCTATTAATGTGTATCTATCCGT------------------------------------AATATTTTTGAATATTATGGAATTAGAGAAATTTGCACGCTTTCTCATTTCATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCATGTCCAGTTTTGCAGTAGAGATGGAACTAAGAAAGAACCATCGACTATAACCCCAAAAGAACCAGATTTCGCAAACAACATAGAGGAAGAATGAAGGGAAAATCCTTCCGAGGCAATCGTATTTGTTTTGGTAGATATGCTCTTCAAGCACTTGAACCCGCTTGGATCACGGCGAGACAGATAGAAGCGGGACGAAGAGGAATAACACGATATGCACGTC Piptochaetium_lejopodum ??GCTATGCCTTAGTGTGTGTCTCGTTAGCT-------------TTTTCTTTTTTAAAGAAAAAAATTTAGTAATTAT-----AGAAAATTAACTAATAACCAACCTATTGCTTCGTATTGTCGAGATCCTAACTAAGAAACAGTCACTATATGAA-----ACTTCT-------ATCATAAATGAGTAGATCTATCATATAGTTGTAGCAACTGCAATTTTTTCTCTAAAAAAGAAATAGGATTCTAGGTTGTGAAGGAAAACTAAAGGGATGTGGATAAAGGGAGGGATGATAGAAA----G------AA-TAAGTAAGATATAGGATTCCAATATGTATGGTCTATGAATTGCATCATAAAAGGCAATGTGATAAAGCATCAATATAATAAAAATAACAGAGAATTCGAAATCGTAACTTGAAACAAGAACTACAAATTTAAAGCAATAAT-------AAAGA-CTGCTCGGGTTAATAAAACTGAGAAAATTAACTCGGAAAGA-AATTTTTTGAAAGCTCCATTGCGGGATTTAGACCTAACCATTCAAGGAGAAGCAGTGGGAACGACAGAACCTATGACTCCATAGGATTTTATTGAAAAGAATCCTAATACTTCATTGGGTGGGATGGCGGAACAAACCAAAAAAATTGTCTTATTTGGTAAGGTTATAAATTAACAAATAAGACAGGAAAGAGTAAATATTCGCCCGCGAAATCCTTATTGAATTTGAATACTTTACCGCGATTCAATAAGAGTAAAAATAAGGAGA-TTTTTTTAAGAAAGATTACATTATCTATAAATATAGAATATAGATAAATAGACACA--CATCTAGATATATTCTAGATCTTCTTTCTTTACTAT-------ATATTTATCTATTTTAACAAATTCAATATTAAATAT-----TAAAAAAAACCTA----------------------ACTTTTTCTATTATCTATTAATGTGTATCTATCCGT------------------------------------AATATTTTTGAATATTATGGAATTAGAGAAATTTGCACGCTTTCTCATTTCATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCATGTCCAGTTTTGCAGTAGAGATGGAACTAAGAAAGAACCATCGACTATAACCCCAAAAGAACCAGATTTCGCAAACAACATAGAGGAAGAATGAAGGGAAAATCCTTCCGAGGCAATCGTATTTGTTTTGGTAGATATGCTCTTCAAGCACTTGAACCCGCTTGGATCACGGCGAGACAG???????????????????????????????????????? Piptochaetium_medium ???????????????GTGTGTCTCGTTAGCT-------------TTTTCTTTTTTAAAGAAAAAAATTTAGTAATTAT-----AGAAAATTAACTAATAACCAACCTATTGCTTCGTATTGTCGAGATCCTAACTAAGAAACAGTCACTATATGAA-----ACTTCT-------ATCATAAATGAGTAGATCTATCATATAGTTGTAGCAACTGCAATTTTTTCTCTAAAAAAGAAATAGGATTCTAGGTTGTGAAGGAAAACTAAAGGGATGTGGATAAAGGGAGGGATGATAGAAA----G------AA-TAAGTAAGATATAGGATTCCAATATGTATGGTCTATGAATTGCATCATAAAAGGCAATGTGATAAAGCATCAATATAATAAAAATAACAGAGAATTCGAAATCGTAACTTGAAACAAGAACTACAAATTTAAAGCAATAAT-------AAAGA-CTGCTCGGGTTAATAAAACTGAGAAAATTAACTCGGAAAGA-AATTTTTTGAAAGCTCCATTGCGGGATTTAGACCTAACCATTCAAGGAGAAGCAGTGGGAACGACAGAACCTATGACTCCATAGGATTTTATTGAAAAGAATCCTAATACTTCATT??????????GCGGAACAAACCAAAAAAATTGTCTTATTTGGTAAGGTTATAAATTAACAAATAAGACAGGAAAGAGTAAATATTCGCCCGCG?CATCCTTATTGAATTAGAATACTTTACCGCGATTCAATAAGAGTAAAAATAAGGAGA-TTTTTTTAAGAAAGATTACATTATCTATAAATATAGAATATAGATAAATAGACACA--CATCTAGATATATTCTAGATCTTCTTTCTTTACTAT-------ATATTTATCTATTTTAACAAATTCAATATTAAATATTAAAATAAAAAAAACCTA----------------------ACTTTTTCTATTATCCATTA?TGTGTATCTATCCGT------------------------------------AATATTTTTGAATATTATGGAATTAGAGAAATTTGCACGCTTTCTCATTTCATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCATGTCCAGTTTTGCAGTAGAGATGGAACTAAGAAAGAACCATCGACTATAACCCCAAAAGAACCAGATTTCGCAAACAACATAGAGGAAGAATGAAGGGAAAATCCTTCCGAGGCAATCGTATTTGTTTTGGTAGATATGCTCTTCAAGCACTTGAACCCGCTTGGATCACGGCGAGACAGATAGAAGCGGGACGAAGAGGAATAACACGATATGCACGTC Piptochaetium_montevidensis GTGCTATGC?TTAGTGTGTGTCTCGTTAGCT-------------TTTTCTTTTTTAAAGAAAAAAATTTAGTAATTAT-----AGAAAATTAACTAATAACCAACCTATTGCTTCGTATTGTCGAGATCCTAACTAAGAAACAGTC?CTATATGAA-----ACTTCT-------ATCATAAATGAGTAGATCTATCATATAGTTGTAGCAACTGCAATTTTTTCTCTAAAAAAGAAATAGGATTCTAGGTTGTGAAGGAAAACTAAAGGGATGTGGATAAAGGGAGGGATGATAGAAA----G------AA-TAAGTAAGATATAGGATTCCAATATGTATGGTCTATGAATTGCATCATAAAAGGCAATGTGATAAAGCATCAATATAATAAAAATAACAGAGAATTCGAAATCGTAACTTGAAACAAGAACTACAAATTTAAAGCAATAAT-------AAAGA-CTGCTCGGGTTAATAAAACTGAGAAAATTAACTCGGAAAGA-AATTTTTTGAAAGCTCCATTGCGGGATTTAGACCTAACCATTCAAGGAGAAGCAGTGGGAACGACAGAACCTATGACTCCATAGGATTTTATTGAAAAGAATCCTAATACTTCATTGGGTGGGATGGCGGAACAAACCAAAAAAATTGTCTTATTTGGTAAGGTTATAAATTAACAAATAAGACAGGAAAGAGTAAATATTCGCCCGCGAAATCCTTATTGAATTAGAATACTTTATCGCGATTCAATAAGAGTAAAAATAAGGAGA-TTTTTTTAAGAAAGATTACATTATCTATAAATATAGAATATAGATAAATAGACACA--CATCTAGATATATTCTAGATCTTCTTTCTTTACTAT-------ATATTTATCTATTTTAACAAATTCAATATTAAATAT-----TAAAAAAAACCTA----------------------ACTTTTTCTATTATCTATTAATGTGTATCTATCCGT------------------------------------AATATTTTTGAATATTATGGAATTAGAGAAATTTGCACGCTTTCTCATTTCATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCATGTCCAGTTTTGCAGTAGAGATGGAACTAAGAAAGAACCATCGACTATAACCCCAAAAGAACCAGATTTCGCAACCAACATAGAGGAAGAATGAAGGGCAAATCC??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Piptochaetium_napostaense ?TGCTATGCCTTAGTGTGTGTCTCGTTAGCT-------------TTTTCTTTTTTAAAGAAAAAAATTTAGTAATTAT-----AGAAAATTAACTAATAACCAACCTATTGCTTCGTATTGTCGAGATCCTAACTAAGAAACAGTCACTATATGAA-----ACTTCT-------ATTATAAATGAGTAGATCTATCATATAGTTGTAGCAACTGCAATTTTTTCTCTAAAAAAGAAATAGGATTCTAGGTTGTGAAGGAAAACTAAAGGGATGTGGATAAAGGGAGGGATGATAGAAA----G------AA-TAAGTAAGATATAGGATTCCAATATGTATGGTCTATGAATTGCATCATAAAAGGCAATGTGATAAAGCATCAATATAATAAAAATAACAGAGAATTCGAAATCGTAACTTGAAACAAGAACTACAAATTTAAAGCAATAAT-------AAAGA-CTGCTCGGGTTAATAAAACTGAGAAAATTAACTCGGAAAGA-AATTTTTTGAAAGCTCCATTGCGGGATTTAGACCTAACCATTCAAGGAGAAGCAGTGGGAACGACAGAACCTATGACTCCATAGGATTTTATTGAAAAGAATCCTAATACTTCATTGGGTGGGATGGCGGAACAAACCAAAAAAATTGTCTTATTTGGTAAGGTTATAAATTAACAAATAAGACAGGAAAGAGTAAATATTCGCCCGCGAAATCCTTATTGAATTAGAATACTTTACCGCGATTCAATAAGAGTAAAAATAAGGAGA-TTTTTTTAAGAAAGATTACATTATCTATAAATCTAGAATATAGATAAATAGACACA--CATCTAGATATATTCTAGATTTTCTTTCTTTACTAT-------ATATTTATCTATTTTAACAAATTCAATATTAAATAT-----TAAAAAAAACCTA----------------------ACTTTTTCTATTATCTATTAATGTGTATCTATCCGT------------------------------------AATATTTTTGAATATTATGAAATTAGAGAAATTTGCACGCTTTCTCATTTCATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCATGTCCAGTTTTGCAGTAGAGATGGAACTAAGAAAGAACCATCGACTATAACCCCAAAAGAACCAGATTTCGCAAACAACATAGAGGAAGAATGAAGGGAAAATCCTTCCGAGGCAATCGTATTTGTTTTGGTAGATATGCTCTTCAAGCACTTGAACCCGCTTGGATCACGGCGAGACAGATAGAAACGGGACGAAGAGGAATAACACGATATGCACGTC Piptochaetium_panicoides ??????????????TGTGTGTCTCGTTAGCT-------------TTTTCTTTTTTAAAGAAAAAAATTTAGTAATTAT-----AGAAAATTAACTAATAACCAACCTATTGCTTCGTATTGTCGAGATCCTAACTAAGAAACAGTCACTATATGAA-----ACTTCT-------ATCATAAATGAGTAGATCTATCATATAGTTGTAGCAACTGCAATTTTTTCTCTAAAAAAGAAATAGGATTCTAGGTTGTGAAGGAAAACTAAAGGGATGTGGATAAAGGGAGGGATGATAGAAA----G------AA-TAAGTAAGATATAGGATTCCAATATGTATGGTCTATGAATTGCATCATAAAAGGCAATGTGATAAAGCATCAATATAATAAAAATAACAGAGAATTCGAAATCGTAACTTGAAACAAGAACTACAAATTTAAAGCAATAAT-------AAAGA-CTGCTCGGGTTAATAAAACTGAGAAAATTAACTCGGAAAGA-AATTTTTTGAAAGCTCCATTGCGGGATTTAGACCTAACCATTCAAGGAGAAGCAGTGGGAACGACAGAACCTATGACTCCATAGGATTTTATTGAAAAGAATCCTAATACTTCATTGGG????ATGGCGGAACAAACCAAAAAAATTGTCTTATTTGGTAAGGTTATAAATTAACAAATAAGACAGGAAAGAGTAAATATTCGCCCGCGAAATCCTTATTGAATTAGAATACTTTATCGCGATTCAATAAGAGTAAAAATAAGGAGA-TTTTTTTAAGAAAGATTACATTATCTATAAATATAGAATATAGATAAATAGACACA--CATCTAGATATATTCTAGATCTTCTTTCTTTACTAT-------ATATTTATCTATTTTAACAAATTCAATATTAAATAT-----TAAAAAAAACCTA----------------------ACTTTTTCTATTATCTATTAATGTGTATCTATCCGT------------------------------------AATATTTTTGAATATTATGGAATTAGAGAAATTTGCACGCTTTCTCATTTCATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCATGTCCAGTTTTGCAGTAGAGATGGAACTAAGAAAGAACCATCGACTATAACCCCAAAAGAACCAGATTTCGCAAACAACATAGAGGAAGAATGAAGGGAAAATCCTTCCGAGGCAATCGTATTTGTTTTGGTAGATATGCTCTTCAAGCACTTGAACCCGCTTGGATCACGGCGAGACAGATAGAAGCGGGACGAAGAGGAATAACACGATATGCACGTC Piptochaetium_pilosum ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Piptochaetium_ruprechtianum ?????????????????????????????CT-------------TTTTCTTTTTTAAGGAAAAAAATTTAGTAATTAT-----AGAAAATTAACTAATAACCAACCTATTGCTTCGTATTGTCGAGATCCTAACTAAGAAACAGTCACTATATGAA-----ACTTCT-------ATCATAAATGAGTAGATCTATCATATAGTTGTAGCAACTGCAATTTTTTCTCTAAAAAAGAAATAGGATTCTAGGTTGTGAAGGAAAACTAAAGGGATGTGGATAAAGGGAGGGATGATAGAAA----GAA-------TAAGTAAGATATAGGATTCCAATATGTATGGTCTATGAATTGCATCATAAAAGGCAATGTGATAAAGCATCAATATAATAAAAATAACAGAGAATTCGAAATCGTAACTTGAAACAAGAACTACAAATTTAAAGCAATAAT-------AAAGA-CTGCTCGGGTTAATAAAACTGAGAAAATTAACTCGGAAAGA-AATTTTTTGAAAGCTCCATTGCGGGATTTAGACCTAACCATTCAAGGAGAAGCAGTGGGAACGACAGAACCTATGACTCCATA?????????????????????????????????????????TGGCGGAACAAACCAAAAAAATTGTCTTATTTGGTAAGGTTATAAATTAACAAATAAGACAGGAAAGAGTAAATATTCGCCCGCGAAATCCTTATTGAATTAGAATACTTTACCGCGATTCAATAAGAGTAAAAATAAGGAGA-TTTTTTTAAGAAAGATTACATTATCTATAAATATAGAATATAGATAAATAGACACA--CATCTAGATATATTCTAGATCTTCTTTCTTTACTAT-------ATATTTATCTATTTTAACAAATTCAATATTAAATAT-----TAAAAAAAACCTA----------------------ACTTTTTCTATTATCTATTA?TGTGTATCTATCCGT------------------------------------AATATTTTTGAATATTATGGAATTAGAGAAATTTGCACGCTTTCTCATTTCATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTC?TGTCCAGTTTTGCAGTAGAGATGGAACTAAGAAAGAACCATCGACTATAACCCCAAAAGAACCAGATTTCGCAAACAACATAGAGGAAGAATGA?GGGAAAATCCTTCCGAGGCAATCGTATTTGTTTTGGTAGATATGCTCTTCAAGCACTTGAACCCGCT?GGATCACGGCGAGACAGATAGAAGCGGGACGAAGAGGAATAACACGAT?TGCACGTC Piptochaetium_sagasteguii ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Piptochaetium_seleri TTGCTATGC?TTAGTGTGTGTCTCGTTAGCT-------------TTTTCTTTAAAAAAGAAAAAATTTTAGTAATTAT-----AGAAAATTAACTAATAAGCAACCTATTGCTTCGTATTGTCGAGATCCTAACTAAGAAACAGTCACTATATGAT-----ACTTCT-------ATCAT-----AGTAGATCTATCATATAGTTGTAGCAACTGCAATTTTTTCTCTAAAAAAGAAATAGGATTCTAGGTTGTGAAGGAAAACTAAAGGGATGTGGATAAAGGGAGGGATGATAGAAA----G------AA-TAAGTAAGATATAGGATTCCAATATGTATGGTCTATGAATTGCATCATAAAAGGCAATGTGATAAAGCATCAAT-----------------------------------------------------TTTAAAGCAATAAA-------AAAGA-CCGCTCGGGTTAATAAAACTGAGAAAATTAACTCGGAAATA-AATTTTTTGAAAGCTCCATTGCGGGATTTAGACCTAACCATTCAAGGAGAAGCAGTGGGAACGACAGAACCTATGACTCCATAGGATTTTATTAAAAAGAATCCTAATACTTCATTGGGTGGGATGGCGGAACAAACCAAAAAAATTGTCTTATTTGGTAAGGTTATAAATTAACAAATAAGACAGGAAAGAGTAAATATTCGCCCGCGAAACCCTTATTGAATTAGAATACTTTACCGCGATTCAATAAGAGTAAAAATAAGGAGA-TTTTTTTAAGAAGGATTACATTATCTATAAATATAGAATATAGATAAATAGACACA--CATCTAGATATATTCTAGATCTTCTTTCTTTACTAT-------ATATTTATCTATTTTAACAAATTCAATATTAAATAT-----TAAAAAAAACCTA----------------------ACTTTTTCTATTATCTATTAATGTGTATCTATCCGT------------------------------------AATATTTTTGAATATTATGGAATTAGAGAAATTTGCACGCTTTCTCATTTCATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCATGTCCAGTTTTGCAGTAGAGATGGAACTAAGAAAGAACCATCGACTATAACCCCAAAAGAACCAGATTTCGCAAACAACATAGAGGAAGAATGAAGGGAAAATCCTTCCGAGGCAATCGTATTTGTTTTGGTAGATATGCTCTTCAAGCACTTGAACCCGCTTGGATCACGGCGAGACAGATAGAAGCGGGACGAAGAGGAATAACACGAT?TGCACGTC Piptochaetium_setosum ???????????TAGTGTGTGTCTCGTTAGCT-------------TTTTCTTTTTTAAAGAAAAAAATTTAGTAATTAT-----AGAAAATTAACTAATAACCAACCTATTGCTTCGTATTGTCGAGATCCTAACTAAGAAACAGTCACTATATGAA-----ACTTCT-------ATCATAAATGAGTAGATCTATCATATAGTTGTAGCAACTGCAATTTTTTCTCTAAAAAAGAAATAGGATTCTAGGTTGTGAAGGAAAACTAAAGGGATGTGGATAAAGGGAGGGATGATAGAAA----G------AA-TAAGTAAGATATAGGATTCCAATATGTATGGTCTATGAATTGCATCATAAAAGGCAATGTGATAAAGCATCAATATAATAAAAATAACAGAGAATTCGAAATCGTAACTTGAAACAAGAACTACAAATTTAAAGCAATAAT-------AAAGAGCTGCTCGGGTTAATAAAACTGA?AAAATTAACTCGGAAAGA-AATTTTTTGAAAGCTCC?TTGCGGGATTTA?ACCTAACCATTCAAGGAGAAGCAGTGGGAACGACAGAACCTATGACTCCATAGGATTTTATTGAAAA?AATCCTAATACT------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TC Piptochaetium_stipoides_echinulatum ?TGCTATGC?TTAGTGTGTGTCTCGTTAGCT-------------TTTTCTTTTTTAAAGAAAAAAATTTAGTAATTAT-----AGAAAATTAACTAATAACCAACCTATTGCTTCGTATTGTCGAGATCCTAACTAAGAAACAGTCACTATATGAA-----ACTTCT-------ATCATAAATGAGTAGATCTATCATATAGTTGTAGCAACTGCAATTTTTTCTCTAAAAAAGAAATAGGATTCTAGGTTGTGAAGGAAAACTAAAGGGATGTGGATAAAGGGAGGGATGATAGAAA----GAA-------TAAGTAAGATATAGGATTCCAATATGTATGGTCTATGAATTGCATCATAAAAGGCAATGTGATAAAGCATCAATATAATAAAAATAACAGAGAATTCGAAATCGTAACTTGAAACAAGAACTACAAATTTAAAGCAATAAT-------AAAGA-CTGCTCGGGTTAATAAAACTGAGAAAATTAACTCGGAAAGA-AA?TTTTTGAAAGCTCCATTGCGGGATTTAGACCTAACCATTCAAGGAGAAGCAGTGGGAACGACAGAACCTATGACTCCATAGG????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GGTTATAAATTAACAAATAAGACAGGAAAGAGTAAATATTCGCCCGCGAAATCCTTATTGAATTAGAATACTTTACCGCGATTCAATAAGAGTAAAAATA?GGAGA-TTTTTTTAAGAAAGATTACATTATCTATAAATATAGAATATAGATAAATAGACACA--C?TCTAGATATATTCTAGATCTTCTTTCTTTACTAT-------ATATTTATCTATTTTAACAAATTCAATATTAAATAT-----TAAAAAAAACCTA----------------------ACTTTTTCTATTATCTATTAGTGTGTATCTATCCGT------------------------------------AATATTTTTGAATATT??GGAATTAGAGAAATTTGC?CGCTTTCTCATTTCATTCGCGAGGAGC?GGATGAGAAGAAACTCTC?TGTCCAGTTTTGCAGTAGAGA?GGAACTAAGAAAGAACCATCGACTATA?CCCCAAAAGAACCAGATTTCGCAAACAACATAGAGGAAGAATGA?GGGAAAATCCTTCCGAGGCAATCGTATTTGTTT?GGTAGATATGCTCTTCAAGCACTTGA?CCCGCTTGGATCACGGCGAGACAGATAGAAGCGGGACGAAGAGGAATAACACGAT?TGCACGTC Piptochaetium_stipoides_stipoides 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Piptochaetium_tovarii 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Piptochaetium_uruguense ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Piptochaetium_virescens ??????????????TGTGTGTCTCGTTAGCT-------------TTTTCTTTTTTAAAGAAAAAAATTTAGTAATTAT-----AGAAAATTAACTAATAACCAACCTATTGCTTCGTATTGTCGAGATCCTAACTAAGAAACAGTCACTATATGAT-----ACTTCT-------ATCATAAATGAGTAGATCTATCATATAGTTGTAGCAACTGCAATTTTTTCTCTAAAAAAGAAATAGGATTCTAGGTTGTGAAGGAAAACTAAAGGGATGTGGATAAAGGGAGGGATGATAGAAA----G------AA-TAAGTAAGATATAGGATTCCAATATGTATGGTCTATGAATTGCATCATAAAAGGCAATGTGATAAAGCATCAATATAATAAAAATAACAGAGAATTCGAAATCGTAACTTGAAACAAGAACTACAAATTTAAAGCAATAAT-------AAAGAGCTGCTCGGGTTAATAAAACTGAGAAAATTAACTCGGAAAGA-AATTTTTTGAAAGCTCCATTGCGGGATTTAGACCTAACCATTCAAGGAGAAGCAGTGGGAACGACAGAACCTATGACTCCATAGGATTTTATTGAAAAGAATCCTAATACTTCATTGGG?GG????GCGGAACAAACCAAAAAAATTGTCTTATTTGGTAAGGTTATAAATTAAGAAATAAGACAGGAAAGAGTAAATATTCGCCCGCGAAATCATTATTGAATTAGAATACTTTACCGCGATTCAATAAGAGTCAAAATAAGGATA-TTTTTTTAAGAAAGATTACATTATCTATAAATATAGAATATAGATAAATAGACACACGCATCTAGATATATTCTAGATCTTCTTTCTTTACTGT-------ATATTTTTCTATTTTAACAAATTCAATATTAAATAT-----TAAAAAAAACCTA----------------------ACTTTTTCTATTATCTATTAATGTGTATCTATCCGT------------------------------------AATATTTTTGAATATTATGGAATTAGAGAAATTTGCACGCTTTCTCATTTCATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCATGTCCAGTTTTGCAGTAGAGATGGAACTAAGAAAAAACCATCGACTATAACCCCAAAAGAACCAGATTTCGCAAACAACATAGAGGAAGAATGAAGGGAAAATCCTGCCGAGGCAATCGTATTTGTTTTGGTAGATATGCTCTTCAAGCACTTGAACCCGCTTGGATCACGGCGAGACAGATAGAAGCGGGACGAAGAGGAATAACACGA?????????? Poa_holciformis ?????????????GTGTGTGACTCGTTATTT-------------TTTTTT------AAGAAAAAAACTTAGTAATTATAGAAAAGAAAATTAACTACTAACCAACTTATTGCTTCGTATTGTCGATATCCTAACTAAGAAACAGTCACTATATGAATAAATACCTCT-------ATTATAAATGAATAGATGTATCATATAGTTGTAGCAACTGC---TTTTTCTATAAAAAAGAAATGAGATTCTAGGTTGTGAAGCAAAAATAAAGGGATGTAGATAAAGGGAGGGATGATAGAAAGAAGGAAGAGGAATTAAGTAAGATATAGGATTCCAATATGTATGGTCTATGAATTGCATCATAAAAAACAATGTGATAAAGCATCAATATAATAAAACTAATAGAGAATTAGAAATCGTAACTTGAAAAAAGAACTCTAAATTTAAAGCAATAATAAAGAATAAAGAGCCGACCGGATTAATAAAACTGAGAAAATTAACTCGGAAAGATCTTTTTTTTGAAGCTCCATTGTGGAATTAAGACCTAACCATTCAAGGAGAAGCAGTGGGAACGACGGAACCTATGATTTAATAGGATTTTATTGAAAAAAATCCTAATACTTCATTGGGTGGGATGGCGGAGCAAACCAAAAAAATTGTCTTATTTGGTAAGGTTATAAATTAACAAATAAGACAGGAAAGAGTAAATATTCGCCCGCGAAATCCTTATTGAATTAGAATACTTTACCATTATTCAATAAGAG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TAAAAAAAACCTA----------------------ACTTTTTATATTATCTATTAATGTGTATCTATCCCT------------------------------------AATATTTTTGAATATTATGGAATTAGAGAAATTTGCACGCTCTCTCATTTCATTCGCGAGGAGCTGGATGAGACGAAACTCTCATGTCCAGTTTTGCAGTAGAGATGGAACTAAGAAAGAACCATCGACTATAACCCGAAAAGAACCAGATTTCGCAAACAACATCGAGGAAGAATGAAAGGAAAATCCTGCCGAGGCAATCGTATTTGTTTTGGTAGATATGCTCTTCAAGCACTGGAACCTGCTTGGATCACGGCGAGACAGATAGAAGCAGGACGAAGAGCAATAACACGATATGCACGTC ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = rpl16) = N: 1-1329; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = rpl16) = N: 1-1329; END; [ The following blocks are output data for analysis step 3492 ] BEGIN TREES; TITLE Tb8265; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep3492; TREE tnt_1_rpl16 = [&R] (Bromus_catharticus,(Poa_holciformis,((Piptatherum_miliaceum,Nassella_arcaensis,Jarava_plumosa,Jarava_ichu,Jarava_juncoides,Jarava_plumosula,Nassella_meyeri,(Nassella_cabrerai,Nassella_pampagrandensis,Nassella_megapotamica,Nassella_hyalina,Nassella_tenuis,(Nassella_trichotoma,Nassella_melanosperma,Nassella_cordobensis,Nassella_curamalalensis),Nassella_neesiana,Nassella_tenuissima,Nassella_tucumana,Nassella_charruana),(Nassella_pubiflora,(Nassella_novari,Nassella_arcuata),Jarava_media,(Nassella_caespitosa,Nassella_punensis)),(Jarava_leptostachya,Jarava_scabrifolia)),((Piptochaetium_fimbriatum,Jarava_vaginata),(((Piptochaetium_virescens,(Piptochaetium_setosum,(Piptochaetium_napostaense,Piptochaetium_calvescens,(Piptochaetium_montevidensis,Piptochaetium_panicoides,Piptochaetium_avenaceum),(Piptochaetium_lasianthum,Piptochaetium_hackelii),Piptochaetium_stipoides_echinulatum,Piptochaetium_ruprechtianum,(Piptochaetium_bicolor,Piptochaetium_medium),(Piptochaetium_stipoides_stipoides,Piptochaetium_lejopodum)))),Piptochaetium_seleri),(Aciachne_acicularis,Anatherostipa_brevis)))))); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr4778] END;