#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 20, 2024; 7:13 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Brumfield R., & Edwards S. 2007. Evolution into and out of the Andes: a Bayesian analysis of historical diversification in Thamnophilus antshrikes. Evolution, 61(2): 346-367. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1759] [ The following blocks are input data for analysis step 3510 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep3510; DIMENSIONS NTAX=29; TAXLABELS Cymbilaimus_lineatus Frederickena_unduligera Sakesphorus_bernardi Sakesphorus_canadensis Sakesphorus_luctuosus Thamnomanes_caesius Thamnoophilus_doliatus Thamnophilus_aethiops Thamnophilus_amazonicus Thamnophilus_aroyae Thamnophilus_atrinucha Thamnophilus_bridgesi Thamnophilus_caerulescens Thamnophilus_cryptoleucus Thamnophilus_divisorius Thamnophilus_insignis Thamnophilus_murinus Thamnophilus_nigriceps Thamnophilus_nigrocinereus Thamnophilus_palliatus Thamnophilus_praecox Thamnophilus_punctatus Thamnophilus_ruficapillus Thamnophilus_schistaceus Thamnophilus_stictocephalus Thamnophilus_tenuepunctatus Thamnophilus_torquatus Thamnophilus_unicolor Thamnophilus_zarumae ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M1662] TITLE bf7a; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep3510; DIMENSIONS NCHAR=970; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = bf7a) = N: 1-970; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = bf7a) = N: 1-970; END; [ The following blocks are output data for analysis step 3510 ] BEGIN TREES; TITLE Tb8283; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep3510; TREE Fig._2e = [&R] (Cymbilaimus_lineatus,(Frederickena_unduligera,((((((Sakesphorus_bernardi,(Thamnophilus_atrinucha,Thamnophilus_bridgesi)),(Thamnophilus_insignis,Thamnophilus_divisorius)),((((Thamnophilus_aethiops,Thamnophilus_aroyae,((Thamnophilus_nigriceps,Thamnophilus_praecox),Thamnophilus_unicolor),(Thamnophilus_punctatus,Thamnophilus_stictocephalus)),(Thamnophilus_caerulescens,(Thamnophilus_cryptoleucus,Thamnophilus_nigrocinereus))),Thamnophilus_schistaceus),(((Thamnoophilus_doliatus,(Thamnophilus_ruficapillus,Thamnophilus_torquatus)),(Thamnophilus_palliatus,Thamnophilus_tenuepunctatus)),Thamnophilus_zarumae),Thamnophilus_murinus)),Thamnophilus_amazonicus),(Sakesphorus_canadensis,Sakesphorus_luctuosus)),Thamnomanes_caesius))); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr328] END;