#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on June 15, 2021; 9:54 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Ahyong S., Lai J., Sharkey D., Colgan D., & Ng P. 2007. Phylogenetics of the brachyuran crabs (Crustacea: Decapoda): the status of Podotremata based on small subunit nuclear ribosomal RNA. Molecular Phylogenetics and Evolution, 45(2): 576-586. 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Daira_perlata 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Dorippoides_facchino 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Eriphia_sebana 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Hepatus_ephileticus 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Latreillia_valida 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Lauridromia_dehaani 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Leptograpsus_variegatus 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Macrophthalmus_setosus 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Menaethius_monoceros CTAATTCGGTACGTACAGATTCATGTCCGGC-TTTG-TTCCACTTTGGCGCTTACCGAGTAATTTAGTCGATACTAAGTAACCTAGACAT--GGGTGTGAATGAACCTATTGACACCATTAAGATCTCGATTATGTACGGGGCT----CAGAGACTGGCGTTCCCTTCTCGCGAAAATAATCAA-GTTTTGGCCAGCCCGGA----AGCCCAGGCAGTGGGATCA-CACAACTTAGACTTATTGAAACACGACTCGCGTGCCAGAAGCGTGGCCGCGGCGGAGAAAGTTCACAGACGGAATAGTCGAAAGCTAACATCCGATATGCGGATGTTACCGATATTGCCCATTGCCCCTTAGTCCCAAGCTAAGGCCTCTCCCTCGGACTCTTTGCCGATGGTGTAGATTCCTTCCGTCGTCCGTGCGTTTAATGGGTGAGGGCCGTGCCCCTCCATCACTGCTTTTTATTGCTACGCTCTGAGTAGGCTCCGGAGCGTTAGCCTTACTCATGTGAAATTTAGGAAATTGCTCCTAGGTAACCTCCCGTTCAGACCACGGTCGTCGGCGCCATTAAGGTCGAGGTTATCGCATATAATTTCAACAACGCCAATTTTT-CGAGCATCAACCTAAAGTCAAGACCTGACTGCCAA--GTGGCGGGCCACTGGTG-ACAGTGCGAGGCTTG---------------------------TGAAAAATCGTAGG-CGACCGAGCGTGCCCCACGAGAAATGGCTCACAGGGCGCACCGGCCGTCTCAAATGAAACTTTTTTAATCTCACGAGTTTCGTCCGATGTGACT-GCCGGACTTACGGAT-ACGTACCTTATTACCTTATCCTGGAGCCAAGATAAAACAGCCAAAAG--ACTTGGGCTCCATTACTGATTATCCTTGTCCGCCCCCGTAAGCATAACGCTGCGATCTCCACTTTAAGAACCTGGCAGCGTTCTGCTTGATGACGCTTTCGTAAA-CGGTTCCTACAAAAGTAATTAGTTCTTGCTTTCAATCTCCAAGCTTCCGCTAGTCTATGGCGGGATCAAGATTGGTATTTGCTACGACTGGTCGCTAGGCGGCCTCAATAAGGG-TACTGGGCCGCCCGTCGAA-GGCCCTTTGGTTTCAGAAACCCAAGGCCCCCTTCATACCAACGTTTCGACTTTGAATTTCCTTAACTGCCTTCCCGTGGTGGTCCTCACCTCGGACGCCGAATTAAACTGAGTTGTGCCCCTTGGAGTGGTCCGGGTCTGTGGCCTTCCTAACTGTCTAACTCTCGAGAAAGAACTAAGCCACCCACCACCACGTACCGGCAAGA-ATCAACCACCTCGCTAAACAGACCAATTAAGGCTATTGCTTGCTCTGAGATCGGATGATTGATCAGCTGCCTAGAGGTCGTTAACCACAGGTCA-GCGTCGAAGAAGAATCTCCCTATTCGCCGT-TAAGATCGGCGTGCTCTAACTCGTTATTGTCCAGACACTACGGGAATCTACAAGACCCGGCGTGCGCGCGATGTGACTTCCCTAGTTGCACAGCAGGGGGAGGCTCTCCTCGCCCATTGGGCAACTTTAGGAAAGTACTATCCCTAACCCCAAACGTTAACAGAGGGTACTTGCTCCTTAAGGGTCATTCGCGTTCAGTACTCGAACGCAACTAATGCAGGGACGGGAAACATGTGTGGCGGGCAGCGATGATGGCTAACTTACTAAATCACTCCGGAAGCCTGACCGCGAGAACCTACGAACCTCCGGCG-CTCAAGAGAGAACCC-GCGGAGCTCGACTGCCTTTCTACAGGTTTGAACTAGTAAATCT Metadynomene_tanensis CTAATTCGGTACGTACACATTCATGGTCGGC-TCAA-TTCCGCTTTGGCGCTTACCGAGTAATTTAGTCGATACAAAGTAACCTAGACAT-TCTGGGTGAATGAACCTATTGACACCATTAAGATCTCGATTATGTACGATGTG----CAGAGACTGGCGTTCCCTTCTCGCGAAAATAATCAA-GTTTTGGCCAGCCCGGA-----GCC-AGGCGCGTGGGACA-CACCACTTAGACTTATTGAAACACGACTCGCGTGCCAGAGGCGTGGCCGCGGCGTAGAAAGTTCACAGACGGAATAGTCGAAAGCTAACATCCAATACGCGGATGTTACCGATATTGCCCATTGCCCCTTAGTCCCAAGCTAAGGCCTCTCCCTCGGACTCTTTGCCGATGGTGTAGATTCCTTCCGTCGTCCGTGCGTTTAATGGGTGAGGGCCGTGCCCCTCCATCACTGCTTTTTATTGCTACGCTCTGAGTAGGCTCCGGAGCGTTAGCCTTACTCATGTGAAATTTAGGAAATTGCTCCTAGGTAACCTCCCGTTCAGACCACGGTCGTCGGCGCCATTAAGGTCGAGGTTATCGCATATAATTTCAACAACGTCAATTTTT-CGAGCATCAACCTAAAGTCAAGTCCTGACTGCCAA--GTGGCGGGCCACGTATGGACAGTGCGAGGCTTG---------------------------TCGGTGTTGTCGGGTCGGCCGAGCGTGCCCCACGAGAAGTGGCTCACAGGGCTCACCGGCCGTG?CAAATGAAACTTTTTTAATCTCACGAGTCTCGTCCGATGGAATT-ACCGGACTTACGAATGACGTACCTTATTACCTTATCCTGGGGCCAAGATAAAACAGCCAAAAG--CCTTGGGCCCCATTACTGATTATCCTTGTTCGCCCCCGTAAGCATAACGCTGCGATCTCCACTTTAAGAACCTGGCAGCGTTCTGCTTGTTGACGCTTTCGTAAA-CGGTTCCTACAAAAGTAATTAGTTCTTGCTTTCAATCTCCAAGCTTCCGCTAGTCTATGGCGGGATCAAGATTGGTATTTGCTACGACTGATCGCTAGGCGGCCACAATAAGGG-TACTGGGCCGCCCGTCGAAGGGCCCTTTGGTTTCAGAAACCCAAGGCCCCCTTCATACCAACGTTTCGACTTTGAATTTCCTTAACTGCCTTCCCGTGGTGGTCCTCACCTCGGACGCCGAATTAAACTGAGTTGTGCCCCTTGGAGTGGTCCGGGCCTGTGGCCTTCCTAACTGTCTAACTCTCGAGAAAGAGCTAAGCCACCCACCACCACGTACCGGCAAGA-ATCAACCACCTCGCTAA?CAGACCAATTAAGGCTATTGCTTGCTCTGAGACCGGATAATTGATCAGCTGCCTAGAGGTCGTTAACCACAGGTCAAGCGTTGAAGAAGAATCTCCCTATTCGCCGT-TGAGATCGGCGTGCTCTAACTCGTTATTGTCCAGACACTACGGGAATCTACAAGACCCGGCGTGCGCGCGATGTGACTTCCCTAGTTGCACACAAGGGGGAGGCTCTCCTCGCCCATTGGGCAAGTTTGGGGAAGTACTATCCCTAACCCCGAACGTTAACAAAGGGTACTTGCTCCTTAAGGGTCATTCGCGTTCAGTAGTCGAACGCAACTAATGCAGGGACGGGAAACATGTGTGGCGGGCAGCGATGAT????A????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Moloha_majora 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Munida_quadrispina 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Paromola_japonica 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Pylocheles_macrops 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Ranina_ranina 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Raninoides_sp 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Rhinolambrus_longispinus 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Schizophrys_aspera 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Symethis_corallica 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Tanaoa_pustulosus 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Trapezia_symodoce CTAATTCGGTACGTACAGATTCATGTTCGGC-TAAA-TTCCGCTTTGGCGCTTACCGAGTAATTTAGTCGATACTAAGTAACCTAGACAT--GGGTGTGAATGAACCTATTGACACCATTAAGATCTCGATTATGTACGTGGTG----CAGAGACTGGCGTTCCCTTCTCGCGAAAATAATCAA-GTTTTGGCCAGCCCGGA-----GCC-AGGCAGTGGGGTGA-CACAACTTAGACTTATTGAACAGCGACTCGCGTGCCAGAGGCGTGGCCGCGGCGGAGAAAGTTCACAGACGGAATAGTCGAAAGCTAACATCCAATATGCGGATGTTACCGATATTGCCCATTGCCCCTTAGTCCCAAGCTAAGGCCTCTCCCTCGGACTCTTTGCCGATGGTGTAGATTCCTTCCGTCGTCCGTGCGTTTAATGGGTGAGGGCCGTGCCCCTCCATCACTGCTTTTTATTGCTACGCTCTGAGTAGGCTCCGGAGCGTTAGCCTTACTCATGTGAAATTTAGGAAATTGCTCCTAGATAACCTCCCGTTCAGACCACGGTCGTCGGCGCCATTAAGGTCGAGGTTATCGCATATAATTTCAACAACGCCAATTTTT-CGAGCATCAACCTAAAGTCAAGACCTGACTGCCAA--GTGGCGGGCCACGTGTG-ACAGTGCGAGGCTTG---------------------------TCGGTGTTGTCGGG-CGACCGAGCGTGCCCCACGAGAAGTAGCTCACAGGGCGCACCGGCCGTCTCAAATGAAACTTTTTTAATCTCACGAGTTTCGTCCGATGTGACT-GCCGGACTTACGGAT-ACGTACCTTATTACCTTATCCTGGAGCCAAGATAAAACAGCCAAAAG--ACTTGGGCTCCATTACTGATTATCCTTGTCCGCCCCCGTAAGCATAACGCTGCGATCTCCACTTTAAGAACCTGGCAGCGTTCTGCTTGATGACGCTTTCGTAAA-CGGTTCTTACAAAAGTAATTAGTTCTTGCTTTCAATCTCCAAGCTTCCGCTAGTCTATGGCGGGATCAAGATTGGTATTTGCTACGACTGGTCGCTAGGCGGCCGCAATAAGGG-TACTGGGCCGCCCGTCGAA-GGCCCTTTGGTTTCAGAAACCCAAGGCCCCCTTCATACCAACGTTTCGACTTTGAATTTCCTTAACTGCCTTCCCGTGGTGGTCCTCACCTCGGACGCCGAATTAAACTGAGTTGTGCCCCTTGGAGTGGTCCGGGTCTGTGGCCTTCCTAACTGTCTAACTCTCGAGAAAGAGCTAAGCCACCCACCACCACGTACCGGCAAGA-ATCAACCACCTCGCTAAACAGACCAATTAAGGCTATTGCTTGCTCTGAGACCGGATGATTGATCAGCTGCCTAGAGGTCGTTAACCACAGGTCAAGCGTCGAAGAAGAATCTCCCTATTCGCCGT-TAAGATCGGCGTGCTCTAACTCGTTATTGTCCAGACACTACGGGAATCTACAAGACCCGGCGTGCGCGCGATGTGACTTCCCTAGTTGCACAGGAGGGGGAGGCTCTCCTCGCCCATTGGGCAACTTTAGGAAAGTACTATCCCTAACCCCAAACGTTAACAGAGGGTACTTGCTCCTTAAGGGTCATTCGCGTTCAGTACTCGAACGCAACTAATGCAGGGACGGGAAACATGTGTGGCGGGCAGCGATGATGGCTAACTTACTAAATCACTCCGGAAGCCTGACCGCGAGAACCTACGGCCCGGGTACG-CCCGACCCGAGAGCC-GCGGAGCTCGACTGCCTTTCTACAGGTTTGAACTAGTAAATCT Tymolus_brucei CTAATTCGGTACGTACAGAGTCATGTTTGAG-TTTA-TTTCACTTTGGCGCTTACCGAGTAATTTAGTCGACATTAAGTAACCTTGACGT--TTGGGTGAATGAACCTATTGACACCATTAAGATCTCGATTATGTACGTGGATAT--CAGAGACTGGCGTTCCCTTCTCGCGAAAATAATCTA-TTTTTGGCCAGCCCGGA-----GCC-AGGCATA---CTGG-CACAACTGAGACCTATTGAAACCCGACTCGCGTACCAGTGACGTGGCCGCGACGTAGAAAGTTCACAGACGGAATAGTCGACAGCTAACATCCAATACACGGATGTTACCGATATTGCCCATTGCCCCTTAGTCCCAAGCTAAGGCCTCTCCCTCGGACTCTTTGCCGATGGTGTAGATTCCTTCCGTCGTCCGTGCGTTTAATGGGTGAGGGCCGTGCCCCTCCATCACTGCTTTTTATTGCTACGCTCTGAGTAGGCTCCGGAGCGTTAGCCTTACTCATGTGAAATTTAGGAAATTGCTCCTAGGTAACCTCCCGTTCAGACCACGGTCGTCGGCGCCATTAAGGTCGAGGTTATCGCATATAATTTCAACAACGTCAATTTT?-CGAGCATCAACCTAAGGTCAAGACCTGACTGCCAA--GTGGCGGG?CACGTGTG-GCGGTGCGAGGCTTG---------------------------TCGGAGATTATTGG-CGACCGACAGTGCCCTAAGAGAATTAGCTCACAGGGCGCACCGGCCGTCTCAAATGAAACTTTTTTAATCTCACGAGTTTCGTCCGATGTGATT-ACCGGACTTACGGAT-ACGTACCTTATTACCTTGTCCTGGAGCCAAGATAAAACAGCCAAAAG--ACTTGGGCTCCATTACTGATTGCCCCTGACTGCCCCCGTAAGCATAACGCTGCGATCTCCACTTTAAGAACCTGGCAGCGTTCTGCATGTTGTCGCTTTCGTAAA-CGGTTCTTACAAAAGTAATTAGTTCTTGCTTTCAATCTCCAAGCTTCCGCTAGTCTATGGCGGGATCAAGATTGGTATTTGCTACGGTTGGTCGCTAGGCGGCCACAATGTTGT-TACTGGGCTGCCCGTCGAAAGGCCCTTTGGTTTCAGAAACCCAAGGCCCCCTTCATACCAACGTTTCGACTTTGAATTTCCTTAACTGCCTTCCCGTGGTGGTCCTCACCTCGGACGCCGAATTAAACTGAGTTGTGCCCCTTGGAGTGGTCCGGGTCTGTGGCCTTCCTAACTGTCTAACTCTCGAGAAAGAGCTAACCCACCCACCACCACGTACCGGCAAGA-ATCAACCACCTCGCTAAACAGACCAATTAAGGCTATTGCTTGCTCTGAGATCGGATAATTCATCAGCCGCCTAGAGGTCGTTAACCACAGGTCG?GCGTC?AAGAAGAATCTCCCTATTCGTCGT-TAAGGTCCACGTGCTCTAACTCGTTATTGTCCAGACACTACGGGAATCTACAAGACCCGGCGTGCGCGCGATGTGACTTCCCTAGTTGCACACAAGGGGGAGGCTTTCCTCGCCCATTGGGCCACTTTAGGAAAGTACTATCCCTAACCCCAAACGTTAACAGAGGGTACTTGCTCCTTAAGGGTCATTCGCGTTCAGTACTCGAACGCAACTAATGCAGGGACGGGAAACATGTGTGGCGGGCAGCGATGATGGCTAACTTACTAAATCACTCCGGAAGCCTGACCGCGAGAACCAACGGAAAGCTGGGG-TGCCCTAAGAAAACC-GCGGAGCTCGACTGCCTTTCTACAGGTTTGAACTAGTAAATCT ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = 18S) = N: 1-1830; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = 18S) = N: 1-1830; END; [ The following blocks are output data for analysis step 3574 ] BEGIN TREES; TITLE Tb8347; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep3574; TREE MPT = [&R] (Munida_quadrispina,(Pylocheles_macrops,((((Lauridromia_dehaani,Metadynomene_tanensis),Hypoconcha_spinosissima),(Homolodromia_kai,(Paromola_japonica,(Moloha_majora,Latreillia_valida),Homolochunia_sibogae))),(((Ranina_ranina,Raninoides_sp),Symethis_corallica),(((Tymolus_brucei,Cymonomoides_delli),Corycodus_sp),(((Dorippoides_facchino,Amarinus_paralacustris),(((Rhinolambrus_longispinus,Carcinus_maenas),((Chlorodiella_nigra,((Carpilius_convexus,(Daira_perlata,Hepatus_ephileticus),Aethra_scruposa),(Tanaoa_pustulosus,(Leptograpsus_variegatus,Macrophthalmus_setosus))),Eriphia_sebana),Trapezia_symodoce)),Calappa_bilineata)),(Menaethius_monoceros,Schizophrys_aspera))))))); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr4806] END;