#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on September 19, 2025; 23:48 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Daniel T., Mcdade L., Manktelow M., & Kiel C. 2007. The "Tetramerium Lineage" (Acanthaceae: Acanthoideae: Justicieae): Delimitation and Infra-lineage Relationships Based on cp and nrITS Sequence Data. Systematic Botany, null. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1882] [ The following blocks are input data for analysis step 3838 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep3838; DIMENSIONS NTAX=63; TAXLABELS Angkalanthus_oligophylla Anisacanthus_boliviensis Anisacanthus_brasiliensis Anisacanthus_junceus Anisacanthus_linearis Anisacanthus_puberulus Anisacanthus_tetracaulis Anisacanthus_thurberi Aphanosperma_sinaloensis Brachystephanus_africanus Calycanthus_magnusianus Carlowrightia_arizonica Carlowrightia_arizonica_MM743 Carlowrightia_ecuadoriana Carlowrightia_hapalocarpa Carlowrightia_huicholiana Carlowrightia_linearifolia Carlowrightia_mcvaughii Carlowrightia_myriantha Carlowrightia_neesiana Carlowrightia_parviflora Carlowrightia_serpyllifolia Carlowrightia_texana Carlowrightia_torreyana Chalarothyrsus_amplexicaulis Chlamydocardia_buettneri Chorisochora_transvaalensis Clinacanthus_siamensis Ecbolium_madagascariense Ecbolium_syringifolium Ecbolium_tanzaniense Ecbolium_viride Henrya_insularis Hoverdenia_speciosa Justicia_adhatoda Justicia_medranoi Megalochlamys_revoluta 'Megalochlamys-clade sp. Daniel et al. 10455' Mexacanthus_mcvaughii Mirandea_grisea Mirandea_huastecensis Mirandea_hyssopus Mirandea_nutans Odontonema_tubaeforme Pachystachys_coccinea Pachystachys_lutea Populina_richardii Ptyssiglottis_pubisepala Schaueria_azaleiflora Schaueria_calicotricha Streblacanthus_cordatus Streblacanthus_dubiosus Streblacanthus_roseus Tetramerium_abditum Tetramerium_glandulosum Tetramerium_nervosum Tetramerium_ochoterenae Tetramerium_peruvianum Tetramerium_sagasteguianum Tetramerium_tenuissimum Tetramerium_yaquianum Trichaulax_mwasumbii Yeatesia_mabryi ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M3743] TITLE 'cptrnSG+trnTL+rps16+trnLF+nrITS'; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep3838; DIMENSIONS NCHAR=4747; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Anisacanthus_junceus 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Clinacanthus_siamensis 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Megalochlamys_revoluta 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'Megalochlamys-clade sp. Daniel et al. 10455' 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Tetramerium_abditum 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Tetramerium_peruvianum 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Trichaulax_mwasumbii 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Yeatesia_mabryi 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; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = 'cptrnSG+trnTL+rps16+trnLF+nrITS') = N: 1-4747; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = 'cptrnSG+trnTL+rps16+trnLF+nrITS') = N: 1-4747; END; [ The following blocks are output data for analysis step 3838 ] BEGIN TREES; TITLE Tb8611; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep3838; TREE Fig._4a = [&R] (((((((((((Anisacanthus_junceus,Mexacanthus_mcvaughii),Anisacanthus_linearis,(Anisacanthus_puberulus,Anisacanthus_thurberi))Anisacanthus_Clade_North_America,(((((Carlowrightia_arizonica,Carlowrightia_arizonica_MM743),Carlowrightia_neesiana),(Carlowrightia_linearifolia,(Carlowrightia_serpyllifolia,(Carlowrightia_texana,Carlowrightia_torreyana)))),Carlowrightia_ecuadoriana)Carlowrightia_Clade_Core,((Tetramerium_abditum,(Tetramerium_glandulosum,Tetramerium_ochoterenae)),(((Tetramerium_nervosum,Tetramerium_yaquianum),(Tetramerium_peruvianum,Tetramerium_sagasteguianum)),Tetramerium_tenuissimum))Tetramerium)),(Anisacanthus_tetracaulis,(((Carlowrightia_hapalocarpa,Carlowrightia_parviflora),Carlowrightia_huicholiana),Carlowrightia_mcvaughii))Carlowrightia_parviflora_Clade),((Aphanosperma_sinaloensis,(Carlowrightia_myriantha,Chalarothyrsus_amplexicaulis)),Henrya_insularis)Henrya_Clade)Tetramerium_Lineage_Core,(((Anisacanthus_boliviensis,Anisacanthus_brasiliensis),(Yeatesia_mabryi,Mirandea_hyssopus))Anisacanthus_Clade_South_America,(Schaueria_calicotricha,(Schaueria_azaleiflora,((((Pachystachys_lutea,Pachystachys_coccinea),Streblacanthus_roseus),Streblacanthus_cordatus),Streblacanthus_dubiosus)))Pachystachys_Clade)),(((Justicia_medranoi,Hoverdenia_speciosa),Mirandea_nutans),(Mirandea_grisea,Mirandea_huastecensis))Mirandea_Clade)Tetramerium_Lineage_New_World,((Trichaulax_mwasumbii,'Megalochlamys-clade sp. Daniel et al. 10455'),Megalochlamys_revoluta)Megalochlamys_Clade,Chorisochora_transvaalensis,(((Ecbolium_madagascariense,Ecbolium_syringifolium),Populina_richardii),(Ecbolium_tanzaniense,Ecbolium_viride))Ecbolium_Clade,Angkalanthus_oligophylla),Clinacanthus_siamensis),Chlamydocardia_buettneri)Tetramerium_Lineage,(((Calycanthus_magnusianus,Ptyssiglottis_pubisepala),(Brachystephanus_africanus,Odontonema_tubaeforme)),Justicia_adhatoda)); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr4904] END;