#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on August 25, 2026; 14:44 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Hines H. 2008. Historical biogeography, divergence times, and diversification patterns of bumble bees (Hymenoptera: Apidae: Bombus). Systematic Biology, 57(1): 58-75. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1927] [ The following blocks are input data for analysis step 3942 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep3942; DIMENSIONS NTAX=31; TAXLABELS Apis_dorsata Axestotrigona_ferruginea Bombus_appositus Bombus_auricomus Bombus_bohemicus Bombus_breviceps Bombus_caliginosus Bombus_confusus Bombus_consobrinus Bombus_dahlbomii Bombus_diversus Bombus_lapidarius Bombus_mendax Bombus_opifex Bombus_rubicundus Bombus_soroeensis Bombus_sporadicus Bombus_veteranus Euglossa_imperialis Eulaema_boliviensis Geniotrigona_thoracica Heterotrigona_itama Hypotrigona_gribodoi Liotrigona_mahafalya Melipona_grandis Meliponula_bocandei Odontotrigona_haematoptera Plebeia_frontalis Tetragonisca_augustula Tetragonula_fuscobalteata Trigona_amazonensis ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M2934] TITLE reduced_16S; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep3942; DIMENSIONS NCHAR=465; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=N GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Apis_dorsata NNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTCGATCTGCTCCATGATT-AATAGCTGCAGTATA-TTGACTGTACAAAGGTAGCATAATAAATTGTCTTTTAATTGAAGAATTGAATGAACGAATTAATGAAATAATAACTGTCTCTAAATTATTTAATGAATTTAAATTTTTGGTTAAAATTCTAAAATTTAATTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTTATTTTAAATTTGATTGGGAGGATTGATAAATTAAAAAAACTTT----TTTGATAAAAGAGAATTATAATTTATAATTAATAGAATAAATTACCTTAGG-ATAACAGCGTAATATCTTTTGATAGACCTTATAGATAAAGATGATTGCGACCTCGATGTTGAATTAAGATTAAAGTTAAATGCAGAAGTTTAAATTTTGAGTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN Axestotrigona_ferruginea GTCTTATTGATAATTTTAAGTCGATCTGCCCAATGATTTAATGGCTGCAGTATAACTGACTGTACAAAGGTAGCATAATCAATTGGTTTTTAAATGAAATCTAGAATGAAAGGATTAATGAAATATATACTGTCTCAAATATATTTTATGAATTTAAAATTTTAATAAAAATGTTAAAATTTTTTTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTTATATTATATTTAATTGGGGGGATTATTAAATTTAAAGAACTTTAAACTCAGATTAGAGAGATCTTGAATTTTAAATTATTAGAGTAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTAATATTTTTTTATAGGTCGTATAGAAAAAAATGTTTGCGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTAAATGCAGGAGTTTAATAATTAAGTCTGTTCGACTTTTAAAATCTTACATGATTTGAGTTCAAATCGACGTAAGT Bombus_appositus CGCTTAATGATAATTTTAAGTCAATCTGCCCAATGATTTAATGGCTGCAGTATAACTAACTGTACAAAGGTAGCATAATCAATTGTTTTTTAATTGAAAACTGGAATGAAAGAATTAATGAGATATATACTGTCTCATATATATTTAATGAATTTAAATTTTTAGTAAAAATGCTTAAATAATTTTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTTATATAATATTTAATTGGGAGGATTAGTAAATTTAAAAAACTTTAAACTTTGATTTAAGAGATCTTGTATTATAAATTAAAAGAATAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTAATATCTTTTTAAAGATCATATTAATAAAGATGATTACGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTGTAAACGAAGAAGTTTAAAAATTAAGTCTGTTCGACTTTTAAAATCTTACATGATTTGAGTTCAAATCGACGTAAGT Bombus_auricomus GGCTTGAAGATAATTTTAGGTCGATCTGCCCAATGATTTAATGGCTGCAGTATAATTAACTGTACAAAGGTAGCATAATAAATTGTTTTTTAATTGAGAACTAGAATGAAAGAATTAATGAGATATATACTGTCTCATATATATTTAATGAATTTAAATTTTTAGTAAAAATGCTAAAATTAATTTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTTATATAATATTTTATTGGGAGGATAAGTAAATTTATTAAACTTTAAACTTTAATTAAAGAGATCTTGTATTATAAAATAATAGAAAAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTAATATCTTTTTAAAGATCATATTGATAAAGATGATTGCGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTAAATGTAGAAGTTTAATAATTAAGTCTGTTCGACTTTTAAAATCTTACATGATTTGAGTTCAAATCGACGTGAGT Bombus_bohemicus GTCTTAATGATAATTTTAAGTCGATCTGCCCAATGATTTAATGGCTGCAGTATATTTAACTGTACAAAGGTAGCATAATCAGTTGTTTTTTAATTGAAAACTAGTATGAAAGGATTAATGAGATATATACTGTCTCATATATATTTAATGAATTTAAATATTTAGTAAAAATGCTGAAATTATTTTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTTATATAAAATTTAATTGGGAGGATTAGTAAATTAAAAAAACTTTAAACTTAGATTAAAGGGATCTTGTATTATAAATTAAAAGAATAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTAATATCTTTTAGAAGATCAAATTTAAAAAGATGATTGCGACCTCGATGTTGAATTAAGATTAATTTTAAATGCAGGAGTTTAATAATTAAGTCTGTTCGACTTTTAAAATCTTACATGATTTGAGTTCAAATCGACGTGAGT Bombus_breviceps GGCTTAATGATAATTTTAGGTCGATCTGCCCAATGATTAAATGGCTGCAGTATAACTGACTGTACAAAGGTAGCATAATCAATTGTTTTTTAATTGGAAACTGGAATGAAAGAATTAATGAGATATATACTGTCTCATATATATTTAATAAAATTAAATTTTTAGTAAAAATGCTAAAATTAATTTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTTATATAATATTTAATTGGGAGGATTGGTAAATTTAATAAACTTTAAACTTTGATTAAAGGGATCTTGTATTATAAATTATAAGAATAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTAATATCTTTTTAAAGATCGTATTGATAAAGATGATTGCGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTAAATGTAGAAGTTTAATGATTAAGTCTGTTCGACTTTTAAAATCTTACATGATTTGAGTTCAAATCGACGTGAGT Bombus_caliginosus GGCTTAATGATAATTTTAAGTCAATCTGCCCAATGATTAAATGGCTGCAGTATAATTGACTGTACAAAGGTAGCATAATCAATTGTTTTTTAATTAAAAACTGGAATGAAAGAATTAATGAGATATATACTGTCTCATATATATTTAATTAACTTAAATTTTTAGTAAAAATGCTAAAATAAATTTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTTATATAATATTTAATTGGGAGGATTAATAAATTTATAAAACTTTAAACTTTGATTAAAGAGATTATGTATTATGAATTATAAGAATAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTAATATCTTTTTAAAGATCAAATTAATAAAGATGATTGCGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTAAATGCAGAAGTTTAATAATTAAGTCTGTTCGACTTTTAAAATCTTACATGATTTGAGTTCAAATCGACGTGAGT Bombus_confusus GGCTTAAAGATAATTTTAGGTCGATCTGCCCAATGATTAAATGGCTGCAGTATAATTAACTGTACAAAGGTAGCATAATAAATTGTTTTTTAATTGAAAACTAGAATGAAAGAATTAATGAGATATATACTGTCTCATATATATATTGTGAATTTAAATTTTTAGTAAAAATGCTAAAATTATTTTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTTATATAATATTTGATTGGGAGGATTAATAAATTTATAAAACTTTAAACTTTAATTAAAGGGATCTTGTATTAAAAATTAAAAGAATAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTAATATCTTTTTAAAGATCATATTGATAAAGATGATTGCGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTAAATGTAGAAGTTTAATAATTAAGTCTGTTCGACTTTTAAAATCTTACATGATTTGAGTTCAAATCGACGTGAGT Bombus_consobrinus GGCTTAATGATAATTTTAGGTCGATCTGCCCAATGATTAAATGGCTGCAGTATATTTGACTGTACAAAGGTAGCATAATCAATTGTTTTTTAATTAAGAACTGGAATGAAAGAATTAATGAGATATATACTGTCTCATATATATATAATGAATTTAAATTTTTAGTTAAAATGCTTAAATAATTTTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTTATATAATATTTAGTTGGGAGGATTAGTAAATTTAGTAAACTTTAAACTTTGATTAAAGAGATCTTGTATTATGAATAAAAAGAAAAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTAATATCTTTTTAAAGGTCATATTAATAAAGATGATTGCGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTAGATGAAGAAGTTTAAAAATTAAGTCTGTTCGACTTTTAAAATCTTACATGATTTGAGTTCAAATCGACGTAAGT Bombus_dahlbomii GGCTTAAAGATAATTTTAAGTCAATCTGCCCAATGATTAAATGGCTGCAGTATACCTGACTGTACAAAGGTAGCATAATCAATTGTTTTTTAATTGAAAACTTGTATGAAAGAATTAATGAGATATATACTGTCTCATATATATTAAATAAATTTAAATTTTTAGTAAAAATGCTTAAATAATTTTACGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTTATATAATATTTAATTGGGAGGATTAGTAAATTAAATAAACTTTAAACTTTGATTTAAGAGATCTTATATTATAAATCAAAAAAATAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTAATATCTTTTTAAAGGCCATATTGATAAAGATGTTTGCGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTAAATGGAGAAATTTAAAAATTAAGTCTGTTCGACTTTTAATATCTTACATGATTTGAGTTCAAATCGACGTAAGT Bombus_diversus GGCCTATTGATAATTTTAGGTCGATCTGCCCAATGATTTAATGGCTGCGGTAT-TTTGACTGTACAAAGGTAGCATAATCAATTGTTTTTTAAATGAAAACTAGAATGAAAGAATTAATGAGATATATACTGTCTCATATATAATTAATGAATTTAAATTTTTAGTAAAAATGCTTAAATTATTTTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTTATATAATATTTAATTGGGAGGATTAGTAAATTTAATAAACTTTAAACTTTGATTTAAGAGATCTTGTATTATAAA-AATAAGAATAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTAATATCTTTTTAAAGGTCATATTAATAAAGATGATTGCGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTAGATGGAGAAGTTTAAAAATTAAGTCTGTTCGACTTTTAAAATCTTACATGATTTGAGTTCAAATCGACGTGAGT Bombus_lapidarius GGCTTATTGATAATTTTAAGTCTATCTGCCCAATGATTTAATGGCTGCAGTATAATTAACTGTACAAAGGTAGCATAATCAATTGTTTTTTAATTAAGAACTAGAATGAAAGAATTAATGAGATATATTCTGTCTCATATATATATTATGAAATTAAATTTTTAGTAAGAATGCTAAAATATGTTTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTTATATAGTATTTGATTGGGAGGATTAATAAATTTAATTAACTTTAAACTTTAATTAAAGAGATCTTTTATTAAAAATTAAAAGAAAAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTAATATCTTTTTAAAGATCATATTAATAAAGATGGTTGCGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTAAACGGAGAAGTTTAATGATTAAGTCTGTTCGACTTTTAAAATCTTACATGATTTGAGTTCAAATCGACGTGAGT Bombus_mendax GGCTTATTGATAATTTTAAGTCGATCTGCCCAATGATTGAATGGCTGCGGTATAACTAACTGTACGAAGGTAGCATAATAAATTGTTTTTTAATTGAAAACTGGAATGAAAGAATTAATGAAATATATACTGTCTCATATATATATTATGAATTTAAAATTTTAGTAAAAATGCTGAGATATTTTTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTTATATAATATTTGATTGGGAGGATTAATAAATTTGAATAACTTTAAACTTTAATTTAAGAGATCTTGTATTATTAATTAAAAGAAAAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTAATATCTTTTTTAAGATCGTATTAATAAAGATGATTGCGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTAAATGCAGAAGTTTAATAATTGAGTCTGTTCGACTTTTAAAATCTTACATGATTTGAGTTCAAATCGACGTGAGT Bombus_opifex GGCTTATTGATAATTTTAAGTCAATCTGCCCAATGATTAAATGGCTGCAGTATAATTAACTGTACAAAGGTAGCATAATCAATTGTTTTTTAATTGAAAACTGGAATGAAAGAATTAATGAGATATATACTGTCTCATATATATTTAATGAATTTAAATTTTTAGTAAAAATGCTTAAATAATTTTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTTATATAATATTTAATTGGGAGGATTAATAAATTTAAAAAACTTTAAACTTTGATTTTAGAGATCTTTTATTATAAATCAAAAGAATAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTAATATTTTTTTAAAGATCGTATTTATAAAAATGTTTGCGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTAAACGGAGAAGTTTAATAATTAAGTCTGTTCGACTTTTAAAATCTTACATGATTTGAGTTCAAATCGACGTAAGT Bombus_rubicundus GTCTTAATGATAATTTTAAGTCGATCTGCCCAATGATTTAATGGCTGCAGTATAATTAACTGTACAAAGGTAGCATAATCAATTGTTTTTTAATTGAGAACTAGAATGAAAGAATTAATGAGATATATACTGTCTCATATATATTATATTAAATTAAATTTTTAGTAAAAATGCTAAAATATATTTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTTATATAATATTTGATTGGGAGGATTGATAAATTTAATTAACTTTAAACTTTAATTAGAGAGATTTTGTATTATGGATTAAAAGAAAAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTAATATCTTTTTTAAGATCATATTGATAAAGATGGTTGCGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTAAATGCAGAAGTTTAATAATTAAGTCTGTTCGACTTTTAAAATCTTACATGATTTGAGTTCAAATCGACGTGAGT Bombus_soroeensis GGCTTAATGATAATTTTAAGTCTATCTGCCCAATGATTTAATGGCTGCAGTATATCTAACTGTACAAAGGTAGCATAATCAATTGTTTTTTAATTGGAAACTGGGATGAAAGAATTAATGAGATATATACTGTCTCATATATATGTAATTAATTTAAAATTTTAGTAAAAATGCTAAAATAAATTTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTTATATAATATTTAATTGGGAGGATTGGTAAATTTGAATAACTTTAAACTTTAATTTGAGAGATCTTGTAATATAAATTGAAAGATAAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTAATATCTTTTTAAAGATCAAATTGATAAAGATGATTGCGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTAAATGAAGAAGTTTAATAATTAAGTCTGTTCGACTTTTAAAATCTTACATGATTTGAGTTCAAATCGACGTGAGT Bombus_sporadicus GGCTTATTGATAATTTTAAGTCAATCTGCCCAATGATTTAATGGCTGCAGTATAATTGACTGTACAAAGGTAGCATAATCAATTGTTTTTTAATTAAGAACTAGAATGAAAGAGTTAATGAGATATATACTGTCTCATATATATATAATTAATTTAAATTTTTAGTAAAAATGCTGAAATTGATTTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTAATATAATATTTTGTTGGGAGGATAAGTAAATTTAATAAACTTTAAACTTTAATTAAAGAGATCTTTTAGTAGAAAATATAAGAATAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTAATATCTTTTTAGAGATCATATTAATAAAGATGATTGCGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTAAATGGAGAAGTTTAATAATTAAGTCTGTTCGACTTTTAAAATCTTACATGATTTGAGTTCAAATCGACGTGAGT Bombus_veteranus GTCTTATAGATAATTTTAAGTCAATCTGCCCAATGATTAAATGGCTGCAGTATAATTAACTGTACAAAGGTAGCATAATCAATTGTTTTTTAATTAAAAACTAGAATGAAAGAATTAATGAGATATATACTGTCTCATATATATAAAATAAACTTAAATTTTTAGTAAAAATGCTTAAATTTTTTTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTAATATAATATTTAATTGGGAGGATTAATAAATTCAATAAACTTTAAACTTTAATTTTAGAGATCTTTTATTAAAAATTAAAAAAATAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTAATATCTCTTTAAAGACCATATTAATAAAGATGTTTGCGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTAGATGAAGAGATCTAAATATTAAGTCTGTTCGACTTTTAAAATCTTACATGATTTGAGTTCAAATCGACGTAAGT Euglossa_imperialis NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCAATCTGCTCAATGATTAAATAGCTGCAGTATA-TTGACTGTACTAAGGTAGCATAATCAATTGTCTTTTAATTAAAGAATGGAATGAAAGAATTAATGAAATATATACTGTCTCAATTATAAAAAGTTAATTTAAATTTTTAGTAAAAATGCTAAATTAAAATTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTTATATTATATTTAATTGGGAGGATTTATAAATTTAATAAACTTT---CTTTGATTTAAGAGATATAGTAATATTAATTAAAAAAAAAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTAATATCTTTTTAAAGTACAAATTAATAAAGATGATTGCGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTAAATGTAGAAATTTAAAAATTAAGTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN Eulaema_boliviensis GTCTTATAGATAATTTTAAGTCAATCTGCTCAATGATTAAATGGCTGCAGTATA-TTGACTGTACAAAGGTAGCATAATAAATTGTCTTTTAATTGAAGAATGGAATGAAAGAATTAATGAAATATAAACTGTCTCTATTATATTTAATAAAATTAAATTTTTAGTTAAAATGCTAAAATTAAATTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTTATATAATATTTTATTGGGATGATTAATAAATTAAATTAACTT--AACTTTGATTTAAGAGATAAAATTATATTAATTAATAAATTAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTAATATCTTTTATAAGATCTTATTAATAAAGATGTTTGCGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTAAATGAAGAAATTTAATAATTAAGTCTGTTCGACTTTTAAAATCTTACATGATTTGAGTTCAGATCGACGTAAGT Geniotrigona_thoracica GTCTTATTGATAATTTTAAGTCGACCTGCTCAATGATTAAATGGCTGCAGTATAACTGACTGTACAAAGGTAGCATAATCAATTGATTTTTAAATGAAATCTGGAATGAAAGGATTAATGAAATATGTACTGTCTCATATATATTTAATGAAATTAAAATTTTAATAAAAATGTTAAAATTTATTTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTTATATAATATTTAGTTGGGAGGATTATTGAATTTAATTAACTTCAAACTTTAATTTAAGAGATCTTTAATTTAAAATCATTAGAATAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTAATATTTTTTTATAGACCATATAGAAAAAAGTGATTGCGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTAAATGCAGGAGTTTAATAATTAAGTCTGTTCGACTTTTAAAATCTTACATGATTTGAGTTCAAATCGACGTAAGT Heterotrigona_itama GTCTTATTGATAATTTTAAGTCGATCTGCCCAATGATTTAATGGCTGCAGTATAACTGACTGTACAAAGGTAGCATAATCAATTGGTTTTTAAATGAAATCTGGAATGAAAGGATTAATGAAATATGTACTGTCTCAATTGTACAATATGAAATTAAAATTTTAATAAAAATGTTAAAATTCACTTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTTATATAATATTTGATTGGGAGGATTATTAAAATTAACCAACTTTAAACTTTAATTTAAGAGATCTTCAATTTGAAATTGCTAGAATAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTAATACTTTTTTATAGGCCATATAGAAAAAAGTGGTTGCGACCTCGATGTTGAATTAGGATAAATTTTAAATGCAGGAGTTTAATAATTAAGTCTGTTCGACTTTTAAAATCCTACATGATTTGAGTTCAAATCGACGTAAGT Hypotrigona_gribodoi GTCTTATTGATAATTTTAAGTCGATCTGCCCAATGATTAAATGGCTGCAGTATAATTGACTGTACAAAGGTAGCATAATAAATTGATTTTTAAATGAAATCTAGAATGAAAGAATTAATGAAATATATACTGTCTCAATTATATAAAATGAATTTAAAATTTTAATTAAAATGTTAAAATTTATTTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTTATATAATATTTAATTGGGAGGATTATTAAATTTAAAAAACTTTAAACTTAAATTAAAGAGATCTTTAAATTGAAATTATTAGAATAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTAATATTTTTTTATAGATCTTATAGAAAAAAATGATTGCGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTAAATGTAGAAGTTTAATAATTAAGTCTGTTCGACTTTTAAAATCTTACATGATTTGAGTTCAAATCGACGTAAGT Liotrigona_mahafalya GTCTTATTGATAATTTTAAGTCGATCTGCCCAATGATTAAATGGCTGCAGAATAATTAACTGTACAAAGGTAGCATAATCAATTGGTTTTTAAATGAAATCTGGAATGAAAGGATTAATGAAATATATACTGTCTCATATATATTAAATGAATTTAAAATTTTAATAAAAATGTTAAAATTTATTTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTTATAATTTATTTAATTGGGAGGATTATTAAATTTAAAAAACTTTAAACTTTAATTAAAGAGATCTTAAATTTTAAATTTTTAGAATAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTTATATTTTTTTATAGATCATATAGAAAAAAATGATTGCGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTAAATGCAGAAGTTTAATAATTAAGTCTGTTCGACTTTTAAAATCTTACATGATTTGAGTTCAAATCGACGTAAGT Melipona_grandis GTCTTATTGATAATTTTAAGTCGATCTGCCCAATGATTTAATGGCTGCAGTATAACTGACTGTACAAAGGTAGCATAATCAATTGGTTTTTAAATGGAATCTGGAATGAAAGGATTAATGAAATATATTCTGTCTCATATATATTTTATGAATTTAAAATTTTAATAAAAATGTTAAAATTTTTTTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTTATATTATATTTAATTGGGAGAATTATTAAATTTAATAAATTTTAAACTTTGATTTAAGAGATCTTTAATTTAAAATTAATAGAATAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTTATATTTTTTTATAGATCTTATAGAAAAAAGTGATTGCGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTAAATGCAGGAGTTTAATAATTAAGTCTGTTCGACTTTTAATATCTTACCTGATTTGAGTTCAAATCGACGTAAGT Meliponula_bocandei GTCTTATTGATAATTTTAAGTCGATCTGCCCAATGATTAAATGGCTGCAGTATAATTGACTGTACAAAGGTAGCATAATCAATTGATTTTTAAATGAAATCTGGAATGAAAGGATTAATGAAATACATACTGTCTCAAATATATTTTATGAATTTAAAATTTTAATAAAAATGTTAAAATTTTTTTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTTATATAATATTTGATTGGGAGGATTATTAAATTTAATTAACTTTAAACTTAAATTAGAGAGATCTTGAATTTTAAATTAATAGAATAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTAATATTTTTTTATAGATCGTATAGAAAAAAATGGTTGCGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTAAATGCAGGAGTTTAATAATTAAGTCTGTTCGACTTTTAAAATCTTACATGATTTGAGTTCAAATCGACGTAAGT Odontotrigona_haematoptera GTCTTATTGATAATTTTAAGTCGATCTGCCCAATGATTGAATGGCTGCAGTATAACTGACTGTACAAAGGTAGCATAATCAATTGGTTTTTAAATGAAATCTGGAATGAAAGGATTAATGAAATATAAACTGTCTCACGTATATTTTATGAATTTAAAATTTTAATAAAAATGTTAAAATTTTTTTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTTATACAGTATTTGATTGGGAGGATTATTAAATTTGAAAAACTTTAAACTTTAATTTAAGAGATCTTTAATTTGAAATTGATAGAATAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTAATATTTTTTTATAGACCATATAGAAAAAAGTGATTGCGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTAAATGCAGGAGTTTAATAATTAAGTCTGTTCGACTTTTAAAATCTTACATGATTTGAGTTCAAATCGACGTAAGT Plebeia_frontalis GTCTTATTGATAATTTTAAGTCGATCTGCCCAATGATTAAATGGCTGCAGTATAACTAACTGTACAAAGGTAGCATAATCAATTGATTTTTAAATGAAATCTGGAATGAAAGGATTAATGAAATATATACTGTCTCATATTTATTTTATAAATTTAAAATTTTAATAAAAATGTTAAAATTTTTTTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTTATATAATATTTGATTGGGAGAATTATTAAATTTAATAAATTTTAAACTTTAATTAAAGAGATCTTTAATTTAAAATTAATAGATTAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTAATATTTTTTTATAGATCGTATAGAAAAAAATGATTGCGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTAAATGTAGAAGTTTAATGATTAAGTCTGTTCGACTTTTAAAATCTTACATGATTTGAGTTCAAATCGACGTAAGT Tetragonisca_augustula GTCTTATTGATAATTTTAAGTCAATCTGCCCAATGATTAAATGGCTGCAGTATATCTGACTGTACAAAGGTAGCATAATCAATTGATTTTTAAATGGAATCTGGAATGAAAGGATTAATGAAATATATACTGTCTCATGTTTATTATATGAATTTAAAATTTTAATAAAAATGTTAAAATTTATTTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTTATATAATATTTAATTGGGAGAATTATTAAATTTAATAAATTTTAAACTTAGATTTAAGAGATTTATAATTTATAATTATTAGATTAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTTATATTTTTTTATAGATCGTATAGAAAAAAATGATTGCGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTAAATGTAGAAGTTTAATAATTAAGTCTGTTCGACTTTTAAAATCTTACATGATTTGAGTTCAAATCGACGTAAGT Tetragonula_fuscobalteata GTCTTATTGATAATTTTAAGTCGACCTGCCCAATGATTGAATGGCTGCAGTATAACTGACTGTACAAAGGTAGCATAATCAATTGGTTTTTAAATGAAATCTGGAATGAAAGGATTAATGAAATATATACTGTCTCATATATATTTCACGAATTTAAAATTTTAATTAAAATGTTAAAATTTTTTTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTTATATGATATTTGGTTGGGAGGACTATTAAATTTAATAAACTTTAAACTTTAATTAAAGAGACCTTTAAATTAAAACATCTAGAGTAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTAATACTTTTTTATAGATCATATAGAAAAAAGTGATTGCGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTAAACGCAGGAGTTTAATAATTAAGTCTGTTCGACTTTTAAAATCTTACATGATTTGAGTTCAAATCGACGTAAGT Trigona_amazonensis GTCTTATTGATAATTTTAAGTCGATCTGCTCAATGATTTAATAGCTGCAGTATAATTGACTGTGCAAAGGTAGCATAATAAATTGGTTTTTAAATGAAATCTAGAATGAAAGAATTAATGAAATATATACTGTCTCTTATTTATTCAATAAATTTAAATTTTTAATAAAAATGTTAAAATTTATTTATGGGACGATAAGACCCTATAGAATTTTATATAATATTTAATTGGGAGAATTATTAAATTTAATAAATTTTAAACTTTAATTAAAGAGATCTTTAATTTAAAATTAATAGAATAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTAATATTTTTTTATAGTTCATATAGAAAAAAGTGATTGCGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTAAATGCAGGAGTTTAATGATTAAGTCTGTTCGACTTTTAAAATCTTACATGATTTGAGTTCAAATCGACGTAAGT ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = reduced_16S) = N: 1-465; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = reduced_16S) = N: 1-465; END; [ The following blocks are output data for analysis step 3942 ] BEGIN TREES; TITLE Tb8714; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep3942; TREE reduced_16S = [&R] ((((((Bombus_caliginosus,Bombus_sporadicus,((Bombus_rubicundus,Bombus_lapidarius),(Bombus_soroeensis,Bombus_mendax)),Bombus_breviceps,(Bombus_bohemicus,((Odontotrigona_haematoptera,Tetragonula_fuscobalteata,(Melipona_grandis,((Tetragonisca_augustula,Plebeia_frontalis),Trigona_amazonensis)),(Geniotrigona_thoracica,Heterotrigona_itama)),(Axestotrigona_ferruginea,Meliponula_bocandei),Liotrigona_mahafalya,Hypotrigona_gribodoi)),(Bombus_auricomus,Bombus_confusus)),(Bombus_consobrinus,Bombus_diversus)),(Bombus_opifex,Bombus_appositus)),Bombus_veteranus,Bombus_dahlbomii),Euglossa_imperialis),Eulaema_boliviensis,Apis_dorsata); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr2904] END;