#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on October 28, 2025; 16:23 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Boatwright J., Roux M., Wink M., Morozova T., & Wyk B. 2008. Phylogenetic Relationships of the Tribe Crotalarieae (Fabaceae) Inferred from DNA Sequences and Morphology. Systematic Botany, 33(4): 752-761. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1941] [ The following blocks are input data for analysis step 3985 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep3985; DIMENSIONS NTAX=228; TAXLABELS Amphithalea_alba Amphithalea_micrantha Amphithalea_williamsonii Argyrolobium_cf_Sankeyi Argyrolobium_lanceolatum Argyrolobium_megarrhizum Argyrolobium_sp_38 Aspalathus_carnosa Aspalathus_confusa Aspalathus_crenata Aspalathus_galeata Aspalathus_hirta_hirta Aspalathus_histrix Aspalathus_laricifolia_laricifolia Aspalathus_linearis_42 Aspalathus_linearis_S3 Aspalathus_macrantha Aspalathus_nivea Aspalathus_pachyloba Aspalathus_pendula Aspalathus_perfoliata_phillipsii Aspalathus_shawii_shawii Aspalathus_vermiculata Aspalathus_willdenowiana Bolusia_amboensis_22 Bolusia_amboensis_23 Bolusia_capensis Cadia_purpurea Calpurnia_sericea Crotalaria_capensis Crotalaria_griquensis Crotalaria_humilis_1 Crotalaria_humilis_2 Crotalaria_lanceolata Crotalaria_virgultaris Crotolaria_capensis 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Melolobium_aethiopicum Melolobium_alpinum Melolobium_candicans_136 Melolobium_candicans_jsb Melolobium_canencens_137 Melolobium_cf._burchellii Melolobium_ethiopicum Melolobium_exudans Melolobium_humile Melolobium_macrocalyx Melolobium_microphyllum Melolobium_stipulatum Melolobium_subspicatum Melolobium_wilmsii Pearsonia_aristata Pearsonia_cajanifolia Pearsonia_cajanifolia_50 Pearsonia_grandifolia Pearsonia_sessilifolia Pearsonia_uniflora Podalyria_buxifolia Podalyria_speciosa Polhillia_brevicalyx Polhillia_canescens Polhillia_involucrata Polhillia_obsoleta Polhillia_pallens Rafnia_angulata Rafnia_diffusa Rafnia_globosa Rafnia_perfoliata Rafnia_racemosa Rafnia_spicata Robynsiophyton_vanderystii Rothia_hirsuta Spartidium_saharae Stirtonanthus_chrysanthus Ulex_europaeus Virgilia_divaricata Wiborgia_fusca_11 Wiborgia_fusca_S2 Wiborgia_humilis Wiborgia_humilisvanwyk Wiborgia_incurvata Wiborgia_monaptera Wiborgia_monaptera_2 Wiborgia_obcordata Wiborgia_obcordata_47 Wiborgia_sericea 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TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M3212] TITLE rbcL_Crotalarieae; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep3985; DIMENSIONS NCHAR=1435; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Amphithalea_williamsonii GTGTTGGGTTCAAAGCTGGTGTTAAAGATTATAAATTGACTTATTATACTCCTGACTATAAAACCAAAGATACTGATATCTTAGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACC{AT}GGAGTTCCGCCTGAAGAAGCAGGTGCCGCGGTAGCTGCCGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACCGTGTGGACTGATGGACTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTATCA{CT}ATCGAGCCCGTTGCTGGAGAAGAAAGTCAATTTATTGCTTATGTAGCTTATCCCTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCCATTGTAGGTAATGTATTTGGGTTCAAGGCCCTGCGCGCTTTACGTCTGGAAGATTTGCGAATCCCTACTGCTTATGTTAAAACTTTCCAAGGTCCGCCCCA{CT}GGCATCCAAGTTGAGAGAGATAAATTGAACAAGTATGGCCGTCCCCTATTGGGATGTACTATTAAACCTAAATTGGGGTTATCCGCTAAGAATTACGGTAGAGCGGTTTATGAATGTCTCCGCGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAAAATGTGAATTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTTTGTGCCGAAGCTCTTTATAAAGCACAGGCCGAAACAGGTGAAATTAAAGGGCATTACTTGAATGCTACTGCGGGTACATGCGAAGAAATGATAAAAAGAGCTGTATTTGCCAGAGAATTGGGCGTTCCTATTGTAATGCATGACTATTTAACAGGGGGATTCACTGCAAATACTAGTTTAGCTCATTATTGCCGGGATAATGGTCTACTTCTTCATATCCATCGTGCAATGCATGCAGTTATCGATAGACAGAAGAATCATGGTATGCACTTTCGTGTACTAGCTAAAGCCTTACGTTTGTCTGGTGGAGATCATATTCACGCTGGTACCGTAGTAGGTAAACTTGAAGGGGAAAGAGAGATCACTTTAGGTTTTGTTGATTTACTACGTGATGATTTTGTTGAAAAAGATCGAAGCCGCGGTATTTATTTCACTCAGGATTGGGTTTCTCTACCAGGTGTTCTGCCCGTTGCTTCGGGGGGTATTCACGTTTGGCATATGCCTGCTCTGACCGAGATTTTTGGAGATGATTCCGTACTCCAATTCGGTGGAGGAACTTTAGGGCACCCTTGGGGAAATGCACCCGGTGCCGTAGCTAATCGAGTAGCTCTCGAAGCATGTGTACAAGCTCGGAATGAGGGACGTGATCTTGCTCGTGAGGGTAATCAAATTATCCGTGAGGCTAGCAAATGGAGTCCTGAATTAGCTGCTGCTTGTGAAGTATGGAAGGAGATCAAATTTGAATTCCAAGCAATGGATACTTTGTAA??????????????????????????????????? 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Bolusia_amboensis_22 ??????????????????????????????????????ACTTATTATACTCCTGACTATGAAACCAAAGATACTGATATCTTAGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCCGGAGTTCCGCCTGAAGAAGCAGGTGCTGCGGTAGCGGCCGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGGCTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTATCACCTCGAGCCCGTTGCTGGAGAAGAAAATCAATATATTGCTTATGTAGCTTATCCCTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCTATTGTAGGTAATGTATTTGGGTTCAAGGCTCTGCGCGCTTTACGTCTGGAAGATTTGCGAATCCCTACTGCTTATATTAAAACTTTCCAAGGTCCGCCTCACGGCATCCAAGTTGAAAGAGATAAATTGAACAAGTATGGCCGTCCCCTATTGGGATGTACTATTAAACCTAAATTGGGGTTATCCGCTAAGAATTACGGTAGAGCAGTTTATGAATGTCTTCGCGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAAAATGTGAACTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTTTGTGCGGAAGCACTTTTTAAAGCACAGGCCGAAACGGGTGAAATCAAAGGGCATTACTTGAATGCTACTGCAGGAACATGCGAAGAAATGATAAAAAGAGCTGTATGTGCTCGAGAGTTGGGCGTTCCTATCGTAATGCATGACTATTTAACAGGCGGATTCACCGCAAATACTAGTTTAGCTCACTATTGCCGGGATAATGGTCTACTTCTTCATATCCATCGTGCAATGCATGCAGTTATCGATAGACAGAAGAATCATGGTATGCACTTTCGTGTACTAGCTAAAGCGTTACGTTTGTCTGGTGGAGATCATATTCACGCTGGTACCGTAGTCGGTAAACTTGAAGGCGAAAGAGAGATCACTTTAGGTTTTGTTGATTTATTACGTGATGATTTTGTTGAAAAAGACCGAAGCCGTGGTATTTATTTTACTCAGGATTGGGTTTCTTTACCTGGTGTTCTGCCTGTAGCTTCAGGGGGTATTCACGTTTGGCATATGCCCGCTCTGACCGAGATCTTTGGGGATGATTCTGTACTCCAATTCGGTGGCGGAACTTTAGGGCACCCTTGGGGAAATGCACCTGGTGCCGTAGCTAATCGAGTAGCTCTGGAAGCATGTGTACAAGCTCGGAATGAGGGACGTGATCTTGCTCGTGAGGGTAATCAAATTATCCGTGAGGCTAGCAAATGGAGTCCTGAA????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Bolusia_capensis ??????????????????????????????????????ACTTATTATACTCCTGAATATGAAACCAAAGATACTGATATCTTAGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCCGGAGTTCCGCCTGAAGAAGCAGGTGCTGCGGTAGCGGCCGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGGCTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTATCACCTCGAGCCCGTTGCTGGAGAAGAAAATCAATATATTGCTTATGTAGCTTATCCCTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCTATTGTAGGTAATGTATTTGGGTTCAAGGCTCTGCGCGCTTTACGTCTGGAAGATTTGCGAATCCCTACTGCTTATATTAAAACTTTCCAAGGTCCGCCTCACGGCATCCAAGTTGAAAGAGATAAATTGAACAAGTATGGCCGTCCCCTATTGGGATGTACTATTAAACCTAAATTGGGGTTATCCGCTAAGAATTACGGTAGAGCAGTTTATGAATGTCTTCGCGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAAAATGTGAACTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTTTGTGCGGAAGCAATTTTTAAAGCACAGGCCGAAACGGGTGAAATCAAAGGGCATTACTTGAATGCTACTGCAGGAACATGCGAAGAAATGATAAAAAGAGCTGTATGTGCTCGAGAGTTGGGCGTTCCTATCGTAATGCATGACTATTTAACAGGCGGATTCACCGCAAATACTAGTTTAGCTCACTATTGCCGGGATAATGGTCTACTTCTTCATATCCATCGTGCAATGCATGCAGTTATCGATAGACAGAAGAATCATGGTATGCACTTTCGTGTACTAGCTAAAGCGTTACGTTTGTCTGGTGGAGATCATATTCACGCTGGTACCGTAGTCGGTAAACTTGAAGGCGAAAGAGAGATCACTTTAGGTTTTGTTGATTTATTACGTGATGATTTTGTTGAAAAAGACCGAAGCCGTGGTATTTATTTTACTCAGGATTGGGTTTCTTTACCTGGTGTTCTACCCGTTGCTTCAGGGGGTATTCACGTTTGGCATATGCCCGCTCTGACCGAGATCTTTGGGGATGATTCTGTACTCCAATTCGGTGGCGGAACTTTAGGGCACCCTTGGGGAAATGCACCTGGTGCCGTAGCTAATCGAGTAGCTCTGGAAGCATGTGTACAAGCTCGGAATGAGGGGCGTGATCTTGCTCGTGAGGGTAATCAAATTATCCGTGAGGCTAGCAAATGGAGTCCTGAA????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Crotalaria_capensis ????????????AAGCCGGTGTTAAAGATTATAAATTGACTTATTATACTCCTGAATATGAAACCAAAGATACTGATATCTTAGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCCGGAGTTCCGCCTGAAGAAGCAGGTGCTGCGGTAGCTGCCGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGGCTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTATCACCTCGAGCCCGTTGCTGGAGAAGAAAATCAATATATTGCTTATGTAGCTTATCCCTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCTATTGTAGGTAATGTATTTGGGTTCAAAGCTCTGCGCGCTTTACGTCTGGAAGATTTGCGAATCCCTACTGCTTATATTAAAACTTTCCAAGGTCCGCCTCACGGCATCCAAGTTGAAAGAGATAAATTGAACAAGTATGGCCGTCCCCTATTGGGATGTACTATTAAACCTAAATTGGGGTTATCCGCTAAGAATTACGGTAGAGCAGTTTATGAATGTCTTCGCGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAAAATGTGAACTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTTTGTGCGGAAGCTCTTTTTAAAGCACAGGCCGAAACGGGTG??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Lotononis_rigida ??????????????????????????????????????ACTTATTATACTCCTGACTATGAAACCAAAGATACTGATATCTTAGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCTGGAGTTCCGCCGGAAGAAGCAGGTGCTGCGGTAGCTGCCGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGGCTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTATCACATCGAGCCCGTTGCTGGAGAAGAAAACCAATTTATTGCTTATGTGGCTTATCCCTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCTATTGTAGGTAATGTATTTGGGTTCAAGGCTCTGCGCGCTTTACGTCTGGAAGATTTGCGAATCCCTAATGCTTATGTTAAAACTTTCCAAGGTCCGCCTCACGGCATCCAAGTTGAAAGAGATAAATTAAACAAGTATGGCCGTCCCCTATTGGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGGTTATCTGCTAAGAATTACGGTAGAGCTGTTTATGAATGTCTTCGCGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAAAATGTGAATTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTTTGTGCCGAAGCTCTTTATAAAGCACAGGCAGAAACGGGTGAAATCAAAGGACATTACTTGAATGCTACTGCAGGTACATGCGAAGAAATGATAAAAAGAGCTGTATTTGCTCGAGAGTTGGGCGTTCCTATCGTAATGCATGACTATTTAACAGGGGGGTTCACTGCAAATACTAGTTTAGCTCACTATTGCCGGGATAATGGTCTACTTCTTCATATCCACCGTGCAATGCATGCAGTTATCGATAGACAGAAGAATCATGGTATGCACTTTCGTGTACTAGCTAAAGCTTTACGTTTGTCTGGTGGAGATCATATTCACGCTGGTACCGTAGTAGGTAAACTTGAAGGCGAAAGAGAGATCACTTTAGGTTTTGTTGATTTATTACGTGATGATTTTGTTGAAAAAGATCGAAGCCGTGGTATTTATTTTACTCAGGATTGGGTTTCTTTACCTGGTGTTCTGCCCGTTGCTTCGGGGGGTATTCACGTTTGGCATATGCCTGCTCTGACCGAGATCTTTGGAGATGATTCCGTACTGCAATTTGGTGGCGGAACTTTAGGGCACCCTTGGGGAAATGCACCTGGTGCTGTAGCTAATCGAGTAGCTCTGGAAGCATGTGTACAAGCTCGGAATGAGGGACGTGATCTTGCTCGTGAGGGTAATCAAATTATCCGTGAGGCTAGCAAATGGAGTCCTGAA????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Lotononis_sparsiflora ??????????????????????????????????????ACTTATTATACTCCTGAATATGAAACCAAAGATACTGATATCTTAGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCTGGAGTTCCGCCGGAAGAAGCAGGTGCTGCGGTAGCTGCCGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGGCTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTATCACATCGAGCCCGTTGCTGGAGAAGAAAATCAATTTATTGCTTATGTAGCTTATCCCTTAGACCTTTTTGAAGAAGGCTCTGTTACTAACATGTTTACTTCTATTGTAGGTAATGTATTTGGGTTCAAGGCTCTGCGCGCTTTACGTCTGGAAGATTTGCGAATCCCTAATGCTTATATTAAAACTTTCCAAGGTCCGCCTCACGGCATCCAAGTTGAAAGAGATAAATTAAACAAGTATGGCCGTCCCCTATTGGGATGTACTATTAAACCTAAATTGGGGTTATCCGCTAAGAATTACGGTAGAGCTGTTTATGAATGTCTTCGCGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAAAATGTGAATTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTTTGTGCCGAAGCTCTTTATAAAGCACAGGCCGAAACGGGTGAAATCAAAGGACATTACTTGAATGCTACTGCAGGAACATGCGAAGAAATGATAAAAAGAGCTGTATTTGCTCGAGAGTTGGGCGTTCCTATCGTAATGCATGACTATTTAACAGGGGGGTTCACTGCAAATACTAGTTTAGCTCACTATTGCCGGGATAATGGTCTACTTCTTCATATCCACCGTGCAATGCATGCAGTTATCGATAGACAGAAGAATCATGGTATGCACTTTCGTGTACTAGCTAAAGCTTTACGTTTGTCTGGTGGAGATCATATTCACTCTGGTACCGTAGTAGGTAAACTTGAAGGCGAAAGAGAGATCACTTTAGGTTTTGTTGATTTATTACGTGATGATTTTGTTGAAAAAGATCGAAGCCGTGGTATTTATTTTACTCAGGATTGGGTTTCTTTACCTGGTGTTCTTCCCGTTGCTTCAGGGGGTATTCACGTTTGGCATATGCCTGCTCTGACCGAGATCTTTGGAGATGATTCCGTACTCCAATTTGGTGGCGGAACTTTAGGGCACCCTTGGGGAAATGCACCTGGTGCTGTAGCTAATCGAGTAGCTCTGGAAGCATGTGTACAAGCTCGGAATGAGGGACGTGATCTTGCTCGTGAGGGTAATCAAATTATTCGTGAGGCTAGCAAATGGAGTCCTGAA????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Rafnia_spicata ?????????TCAAAGCTGGTGTTAAAGATTATAAATTGACTTATTATACTCCAGACTATGAAACCAAAGATACTGATATCTTAGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCTGGAGTTCCGCCTGAAGAAGCAGGTGCTGCGGTAGCTGCCGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGGCTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTATCACATCGAGCCCGTTGCTGGAGAAGAAAGTCAATTTATTGCTTATGTAGCTTATCCCTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCTATTGTAGGTAATGTATTTGGGTTCAAGGCTCTGCGCGCTTTACGTCTAGAAGATTTGCGAATCCCTAATGCTTATATTAAAACTTTCCAAGGTCCGCCTCACGGCATCCAAGTTGAAAGAGATAAATTAAACAAGTATGGCCGTCCCCTATTGGGATGTACTATTAAACCTAAATTGGGGTTATCCGCTAAGAATTACGGTAGAGCTGTTTATGAATGTCTTCGCGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAAAATGTGAATTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTTTGTGCCGAAGCTATTTATAAAGCACAGGCCGAAACGGGTGAAATCAAAGGACATTACTTGAATGCTACTGCAGGAACATGCGAAGAAATGATAAAAAGAGCTGTATTTGCTCGAGAGTTGGGCGTTCCTATCGTAATGCATGACTATTTAACAGGGGGATTCACTGCAAATACTAGTTTAGCTCACTATTGCCGGGATAATGGTCTACTTCTTCATATCCATCGTGCAATGCATGCAGTTATCGATAGACAGAAGAATCATGGTATGCACTTTCGTGTACTAGCTAAAGCGTTACGTTTGTCTGGTGGAGATCATATTCACGCTGGTACCGTAGTAGGTAAACTTGAAGGCGAAAGAGAGATCACTTTAGGTTTTGTTGATTTATTACGTGATGATTTTGTTGAAAAAGATAGAAGCCGTGGTATTTATTTTACTCAGGATTGGGTTTCTTTACCTGGTGTTCTGCCCGTTGCTTCAGGGGGTATTCATGTTTGGCATATGCCTGCTCTGACCGAGATCTTTGGAGATGATTCCGTACTCCAATTCGGTGGCGGAACTTTAGGGCACCCTTGGGGAAATGCACCCGGTGCCGTAGCTAATCGAGTAGCTCTGGAAGCATGTGTACAAGCTCGGAATGAGGGACGTGATCTTGCTCGTGAGGGTAATCAAATTATCCGTGAGGCTAGCAAATGGAGTCCTGAATTAGCTGCTGCTTGTGAAATATGGAAGGAGATCAAATTTGAATTCGAAGCA?????????????????????????????????????????????????? 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Rothia_hirsuta GTGTTGGGTTCAAAGCTGGTGTTAAAGATTATAAATTGACTTATTATACTCCTGATTATGAAACCAAAGATACTGATATCTTAGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCTGGAGTTCCGCCTGAAGAAGCAGGTGCTGCGGTAGCTGCCGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGGCTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTATCACATCGAGCCCGTTGCTGGAGAAGAAAATCAATATATTGCTTATGTAGCTTATCCCTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCTATTGTAGGTAATGTATTCGGGTTCAAGGCTCTGCGCGCTTTACGTCTGGAAGATTTGCGAATCCCTAAGTCTTATATTAAAACTTTCCAAGGTCCGCCTCACGGCATCCAAGTTGAAAGAGATAAATTAAACAAGTACGGCCGTCCCCTATTGGGATGTACTATTAAACCTAAATTGGGGTTATCCGCTAAGAATTACGGTAGAGCTGTTTATGAATGTCTTCGCGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAAAATGTGAATTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTTTGTGCCGAAGCTATTTTTAAATCACAGGCCGAAAC???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Spartidium_saharae GTGTTGGATTCAAAGCTGGTGTTAAAGATTATAAATTGACTTATTATACTCCTGAGTATGAAACCAAAGATACTGATATCTTAGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCTGGAGTTCCGCCTGAAGAAGCCGGTGCTGCGGTAGCTGCCGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGGCTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTATCACATCGAGCCCGTTGCTGGAGAAGAAAATCAATTTATTGCTTATGTAGCTTATCCCTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCTATTGTAGGTAATGTATTTGGGTTCAAGGCTCTGCGCGCTTTACGTCTGGAAGATTTGCGAATCCCTACTGCTTATGTTAAAACTTTCCAAGGTCCGCCTCACGGCATCCAAGTTGAAAGAGATAAATTAAACAAGTATGGCCGTCCCCTATTGGGATGTACTATTAAACCTAAATTGGGGTTATCCGCTAAGAATTACGGTAGAGCTGTTTATGAATGTCTTCGCGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAAAATGTGAATTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTTTGTGCCGAAGCTCTTTATAAAGCACAGGCCGAAACGGGTGAAATCAAAGGACATTACTTGAATGCTACTGCAG?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = rbcL_Crotalarieae) = N: 1-1435; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = rbcL_Crotalarieae) = N: 1-1435; END; [ The following blocks are output data for analysis step 3985 ] BEGIN TREES; TITLE Tb8757; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep3985; TREE rbcL_Cotalariaeae = [&R] (((((Amphithalea_alba,Amphithalea_micrantha,Amphithalea_williamsonii,((Liparia_angustifolia,Liparia_hirsuta),(Podalyria_buxifolia,Podalyria_speciosa)),Xiphotheca_guthriei,Xiphotheca_reflexa),Stirtonanthus_chrysanthus),Calpurnia_sericea,(Cyclopia_genistoides,Cyclopia_subternata),Virgilia_divaricata),((((((Argyrolobium_cf_Sankeyi,Argyrolobium_megarrhizum,Argyrolobium_sp_38),Argyrolobium_lanceolatum),(Polhillia_brevicalyx,Polhillia_canescens,Polhillia_involucrata,Polhillia_obsoleta,Polhillia_pallens)),(Lupinus_polyphyllus,Ulex_europaeus)),(Dichilus_gracilis,Dichilus_lebeckioides,Dichilus_pilosus,Dichilus_reflexus,Dichilus_strictus),((Melolobium_adenodes_132,Melolobium_adenodes_144,Melolobium_aethiopicum,Melolobium_alpinum,Melolobium_candicans_136,(Melolobium_candicans_jsb,Melolobium_humile),Melolobium_canencens_137,Melolobium_ethiopicum,Melolobium_exudans,Melolobium_macrocalyx,Melolobium_microphyllum,Melolobium_stipulatum,Melolobium_subspicatum,Melolobium_wilmsii),Melolobium_cf._burchellii)),(((((Aspalathus_carnosa,Aspalathus_crenata,Aspalathus_perfoliata_phillipsii),Aspalathus_confusa,Aspalathus_galeata,(Aspalathus_hirta_hirta,Aspalathus_histrix,Aspalathus_laricifolia_laricifolia,Aspalathus_shawii_shawii),Aspalathus_macrantha,Aspalathus_nivea,Aspalathus_vermiculata,Aspalathus_willdenowiana),Aspalathus_pachyloba),(Aspalathus_linearis_42,Aspalathus_linearis_S3,Aspalathus_pendula),Lebeckia_ambigua_99,Lebeckia_ambigua_MLR6,(Lebeckia_bowieana_127,Lebeckia_bowieana_80),Lebeckia_brevicarpa,Lebeckia_carnosa_7,(Lebeckia_carnosa_MLR16,Lebeckia_meyeriana_154,Lebeckia_meyeriana_33),(((((Lebeckia_cinerea,(Lebeckia_lotononoides,Lebeckia_multiflora)),Lebeckia_halenbergensis,Lebeckia_multiflora_119),Lebeckia_spinescens),Spartidium_saharae),((Lebeckia_cytisioides,Lebeckia_cytisoides,Lebeckia_sericea_102),(Lebeckia_multiflora_34,Lebeckia_sericea)),Lebeckia_macrantha,Lebeckia_macrantha_103,Lebeckia_melilotoides,Lebeckia_psiloloba,Lebeckia_pungens_101,Lebeckia_pungens_S1),(Lebeckia_inflata,Lebeckia_inflata_13),(Lebeckia_leipoldtiana,Wiborgia_humilis,Wiborgia_humilisvanwyk),Lebeckia_leipoldtiana_130,Lebeckia_mucronata,(Lebeckia_pauciflora_28,Lebeckia_pauciflora_MLR7),Lebeckia_plukanetiana,Lebeckia_plukenetiana_29,Lebeckia_sepiaria,Lebeckia_sessilifolia,Lebeckia_simsiana,(Lebeckia_wrighttii_128,Lebeckia_wrighttii_59,Lebeckia_wrighttii_81),Lotononis_acuticarpa,Lotononis_adpressa,(Lotononis_bentamiana,(Lotononis_bolusii,Lotononis_mollis_52,Lotononis_mollis_63,(Lotononis_pentaphylla,(Lotononis_polycephala_P7127,Lotononis_quinata)),Lotononis_plicata,Lotononis_polycephala_114),Lotononis_digitata_65,Lotononis_digitata_77,Lotononis_magnifica),((((Lotononis_brachyantha,Lotononis_falcata_js49,Lotononis_falcata_P7133,Lotononis_fruticoides,Lotononis_parviflora),((((Lotononis_cf_curtii,Lotononis_maculata),(Lotononis_oxyptera,Lotononis_rostrata,Lotononis_rostrata_Namaquensis)),Lotononis_sparsiflora),Lotononis_lenticula_110)),Lotononis_sabulosa),(Lotononis_brevicaulis,Lotononis_carnosa,(Lotononis_densa_leucoclada,Lotononis_exstipulata),(Lotononis_divaricata,(Lotononis_sericophilla_122,Lotononis_sericophilla_125)),Lotononis_elongata,Lotononis_eriocarpa,Lotononis_filiformis,Lotononis_involucrata_70,((Lotononis_involucrata_P7131,Lotononis_pungens_P7129),Lotononis_involucrata_peduncularis),Lotononis_leptoloba_71,Lotononis_leptoloba_js50,Lotononis_lotononoides,Lotononis_maximiliani_126,Lotononis_maximiliani_91,Lotononis_meyeri_113,Lotononis_meyeri_123,Lotononis_prostrata,Lotononis_pulchella_115,Lotononis_pulchella_51,Lotononis_pungens_124,Lotononis_rigida,Lotononis_sericophylla_19,Lotononis_stricta,Lotononis_umbellata),(Lotononis_crumania,(Lotononis_glabra,Lotononis_laxa_106,Lotononis_laxa_72,Lotononis_macrosepala,Lotononis_micrantha))),Lotononis_calycina,((Lotononis_cf_lenticula,(Lotononis_platycarpa_P7137,Lotononis_platycarpa_P7146)),Lotononis_platycarpa_53,Lotononis_platycarpa_96),Lotononis_decumbens,Lotononis_eriantha,Lotononis_foliosa_67,Lotononis_foliosa_P7125,Lotononis_globulosa,((Lotononis_listii,Lotononis_marlothii,Lotononis_subulata),Lotononis_solitudinis),Lotononis_platycarpa_kew,Pearsonia_aristata,(Pearsonia_cajanifolia,Pearsonia_cajanifolia_50,Pearsonia_grandifolia),Pearsonia_sessilifolia,Pearsonia_uniflora,Rafnia_angulata,Rafnia_diffusa,Rafnia_globosa,Rafnia_perfoliata,Rafnia_racemosa,Rafnia_spicata,Robynsiophyton_vanderystii,Rothia_hirsuta,(Wiborgia_fusca_11,Wiborgia_tetraptera,Wiborgia_tetraptera_46),Wiborgia_fusca_S2,Wiborgia_incurvata,Wiborgia_monaptera,Wiborgia_monaptera_2,Wiborgia_obcordata,Wiborgia_obcordata_47,Wiborgia_sericea),((((Bolusia_amboensis_22,Bolusia_amboensis_23),Bolusia_capensis),((((((Crotalaria_capensis,Crotolaria_capensis),Crotolaria_lebeckioides),Crotalaria_lanceolata),((Crotalaria_virgultaris,Crotolaria_virgultaris),Crotolaria_lotoides)),(Crotalaria_humilis_1,Crotalaria_humilis_2)),((Crotalaria_griquensis,Crotolaria_distans),Crotolaria_sp_49))),(Lotononis_hirsuta_157,Lotononis_hirsuta_64,Lotononis_hirsuta_97))))),Cadia_purpurea); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr1074] END;