#NEXUS
[!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file.


Generated on November 10, 2026; 2:51 GMT

TreeBASE (cc) 1994-2008

Study reference:
Mardulyn P., Milinkovitch M., & Pasteels J. 1997. Phylogenetic analyses of DNA and
allozyme data suggest that Gonioctena leaf beetles (Coleoptera; Chrysomelidae)
experienced convergent evolution in their history of host-plant family shifts.
Systematic Biology, 46(4): 722-747.

TreeBASE Study URI:  http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S381]

[ The following blocks are input data for analysis step 428 ]
BEGIN TAXA;
        TITLE  TaxaForAnalysisStep428;
        DIMENSIONS NTAX=21;
        TAXLABELS
            Chrysomela_tremula
            Gonioctena_fornicata_a
            Gonioctena_fornicata_b
            Gonioctena_holdausi
            Gonioctena_intermedia
            Gonioctena_interposita_1
            Gonioctena_interposita_2
            Gonioctena_kamikawai
            Gonioctena_linnaeana
            Gonioctena_nigroplagiata
            Gonioctena_occidentalis
            Gonioctena_olivacea
            Gonioctena_pallida_1
            Gonioctena_pallida_2
            Gonioctena_quinquepunctata
            Gonioctena_rubripennis
            Gonioctena_rufipes
            Gonioctena_tredecimmaculata
            Gonioctena_variabilis
            Gonioctena_viminalis
            Oreina_cacaliae
            ;
END;

BEGIN CHARACTERS;
[! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M3977]

	TITLE 12S;
	LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep428;
	DIMENSIONS NCHAR=358;
	FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -;

MATRIX
[                                       10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220       230       240       250       260       270       280       290       300       310       320       330       340       350        ]
[                                        .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .        ]
Chrysomela_tremula              ACATATTTTAGAGCT-AAATCATTTTAATTAATTAATTTAAATTACTGTCAAATCCTTATTCAAATTACTTTAAAAGTAACCATCCCAAAATTTTA-TTATAGTAACCCATTTCTTCTTACTAATAAACTACACCTTGATCTGATTTT-TTTTATTATAATAAATCTTGAATATTTAAATTCTAATAAAATATTCAAACTACGACGATATGTAAACTAATATAGTAAGTGAATTAAATCGTGGATTATCAATCACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTTGAGAATATACCTTATACTAATTTAGTCTATAAA-AATACATTTTAACCCAAC
Gonioctena_fornicata_a          GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATAAATTAATTAAAATTACCTTCAAATCCAAATTCATATTACTTTAAAAATAATAATCTTCAATTATTT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTTTATATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATTATCAAAATTCTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGTTTTATAA-ATTACATTTAAAACCAAC
Gonioctena_fornicata_b          GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATAAATTAATTAAAATTACCTTCAAATCCAAATTCATATTACTTTAAAAATAATAATCTTCAATTATTT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTTTATATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATTATCAAAATTCTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGTTTTATAA-ATTACATTTAAAACCAAC
Gonioctena_holdausi             GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATATTTCCCAATTTTAA-TTATTGTAACCCATTTCTACTTTCATATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATTATAATAAATTTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGACTGTCAATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAACTTTCAAGAACATAACTAATACTAACTTAGCTTAAACA-AATACACTTATAACCAAC
Gonioctena_intermedia           GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAACAAATTAATTAAAATTACTCTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCTTAAATTATAT-TTATTGTAACCCATTTCTTCTTTATCATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATAAAAATTCTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAATAAACAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGCTTTTAAA-ATTACATTTAAAACCAAC
Gonioctena_interposita_1        ACATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAACAAAATAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCTTAAATTATAT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTTTCCATATACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATAAAAATTCTTGAATATTATAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAACAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTATTACTAATTTAGTTTTTAAA-ATTACACTTAAAACCAAC
Gonioctena_interposita_2        ACATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAACAAAATAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCTTAAATTATAT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTTTCCATATACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATAAAAATTCTTGAATATTATAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAACAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTATTACTAATTTAGTTTTTAAA-ATTACACTTAAAACCAAC
Gonioctena_kamikawai            GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTTATATTACTTTAAAAATAATAATCCTTAATTTTTT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTCTGTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATTATAATAAATCTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATACTCAAATTACGACGATATGTAAGCTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCAATTATAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGCATAATAA-TATACATTTAAAACCAAC
Gonioctena_linnaeana            GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAAATAATTAATCAATATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTACTTTAAAAATAATAATCCCTAATTTTAA-TTAATGTAACCCATTTCTACTTTTTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATAATAATAAATCTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCAATTATAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAACTTAG-TCAAATA-AATACATTTATAACCACC
Gonioctena_nigroplagiata        GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAAT?ATAATCCTAAATTATTTATTAATGTAACCCATTTCTTCTTTCTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATTAAAATTTTTAAATATTAAAATTCTTATAAAATATTTAAATTACGATGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCAATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGCTTAATAA-ATTACATTTATAAACAAC
Gonioctena_occidentalis         GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCACATTCATATTACTTTAAAAATAATAATCCTTAATTTTAA-TTAATGTAACCCATTTCTACTTTCTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATTATAATAAATTTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGACTGTCAATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAACTTTCAAGAACATAACTAATATTAACTCAGCTTAAATA-AATACACTTATAACCAAC
Gonioctena_olivacea             GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATTATATTTTAAAAATAAAAATCTAAAATTATAT-TTAATGTAACCCATTTCTACTTTTTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATTAAAAATCTTGAATATTATAATTCTTATAAAATATTC-AATTACGATGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGACTATCGATTACAGAACAAGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTAAAGAACATAACTATTACTAATCTAGCATTATAA-ATTACATTTATAACCCAC
Gonioctena_pallida_1            ACATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAACAAAATAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCTTAAATTATAT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTTTCCATATACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATAAAAATTCTTGAATATTATAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTATTACTAATTTAGTTTTTAAA-ATTACACTTAAAACCAAC
Gonioctena_pallida_2            ACATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAACAAAATAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCTTAAATTATAT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTTTCCATATACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATAAAAATTCTTGAATATTATAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTATTACTAATTTAGTTTTTAAA-ATTACACTTAAAACCAAC
Gonioctena_quinquepunctata      GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATAAATTAATTAAAATTACTCTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCTTAAATTATAT-TTATTGTAACCCATTTCTTCTTTCCCATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATAAAAATTCTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGCTTTTAAA-ATTACATTTAAAACCAAC
Gonioctena_rubripennis          GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCCTAAATTTTTT-TTATTGTAACCCATTTCTTCTTTTTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATTATAGTAAATTTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGATGATATGTAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGACTATCAATTATAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGTTTTTAAT-AATACATTTAGAACCAAC
Gonioctena_rufipes              ACATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCTTATTATTTTAAAAATAATAATCCCTAATTATTA-TTATTGTAACCCATTTCTACTTTTTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATGATAATAAATTTCGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGCAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTGTCAATTATAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTGATACTAAATTAGCCTAAATA-AATACGCTTATAACCAAC
Gonioctena_tredecimmaculata     GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATGAATTTATTAAAATTACCCTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCCCTAAATTTAT-TTATTGTAACCCATTTCTTCTTTTTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-CTTTATTCTAATACATCTTGAATATTTAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCAATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGCTTTAATATAATACATTTATAACCAAA
Gonioctena_variabilis           GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATCAACTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATTTTATATTACAAATAAAAATCCTAAATTATAT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTTTTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATAAAAAATCTTGAATATTATTATTCTTATAAAATATTCAAATTACGATGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTATAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGTTATTTAA-ATTACATTTATAACCAAC
Gonioctena_viminalis            GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATCAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTACTTTAAAAATAATATTTCCTAATTTTAG-TTACTGTAACCCATTTCTACTTTTGTATAAACTACACCTTGATCT?ATTTA-TTTTATTATAGTAAATTTCGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGACTGTCAATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAACTTTCAAGAACATAGCTAATACTAACTTAGTCTAAATA-AATACACTTATAACCAAC
Oreina_cacaliae                 ACATATTTTAGAGCTAAAATCAATTTAATTAATTAATTAAATTTACTCTCAAATCCAAATTCATATTATTTTATAAATAATAATCCTTAAATAATT-TTATTGTAACCCATTTCTTCTTTTTTATAAACTGCACCTTGATCTGATTTATTTTTATTATAAAAAATCTTGAATATTATTATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATACAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCAATTATAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGCATATAAA-AATACATTTAAAACAAAC
;
END;

BEGIN SETS;
	CHARSET 2ndpos (CHARACTERS = 12S) = ;
	CHARSET 12s (CHARACTERS = 12S) =  1-358;
	CHARSET sequence (CHARACTERS = 12S) =  1-352;
	CHARSET 16s (CHARACTERS = 12S) = ;
	CHARSET 3rdpos (CHARACTERS = 12S) = ;
	CHARSET gaps (CHARACTERS = 12S) =  353-358;
	CHARSET COII (CHARACTERS = 12S) = ;
	CHARSET 1stpos (CHARACTERS = 12S) = ;
END;
[ The following blocks are output data for analysis step 428 ]
BEGIN TREES;
      TITLE Tb5208;
      LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep428;
      TREE Fig._2b = [&R] ((Gonioctena_kamikawai,((((((Gonioctena_viminalis,Gonioctena_holdausi),Gonioctena_occidentalis),Gonioctena_rufipes),Gonioctena_linnaeana),Gonioctena_tredecimmaculata),((Gonioctena_variabilis,Gonioctena_olivacea),((((Gonioctena_interposita_1,Gonioctena_interposita_2),Gonioctena_pallida_1,Gonioctena_pallida_2),(Gonioctena_intermedia,Gonioctena_quinquepunctata)),(Gonioctena_fornicata_a,Gonioctena_fornicata_b)),Gonioctena_nigroplagiata,Gonioctena_rubripennis))),(Oreina_cacaliae,Chrysomela_tremula));
[!  TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr3307]


END;