#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on July 09, 2025; 22:34 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Osborn K., & Rouse G. 2008. Multiple origins of pelagicism within Flabelligeridae (Annelida). Molecular Phylogenetics and Evolution, null. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S2095] [ The following blocks are input data for analysis step 4359 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep4359; DIMENSIONS NTAX=18; TAXLABELS Brada_villosa_California Brada_villosa_Sweden Diplocirrus_glaucus_Sweden Flabelliderma_ockeri Flabelligena_sp. Flabelligera_affinis_California Flabelligera_affinis_Iceland Flabelligera_affinis_Sweden Flabelligera_infundibularis Flota_sp._specimen_1 Flota_sp._specimen_2 Ilyphagus_octobranchus Macrochaeta_clavicornis Macrochaeta_sp. Pherusa_plumosa_California Pherusa_plumosa_Massachusetts Poeobius_meseres Therochaeta_collarifera ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M3281] TITLE 28S_Osborn_Flotidae; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep4359; DIMENSIONS NCHAR=1289; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Brada_villosa_California ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Brada_villosa_Sweden ---------------AAGAAGAACTAACAAGGATTCCCTTAGTAACGGTCGAGTGAACCGGGCAGAAGCCCAGCACCGAATCCCCTCGGCTCTGCAAAGCCTTGCGGGAAATGTGGTGTTAGGGAGGGCGTGCAGGCGGCAATCTCTCGCGT----CTTAGC--GCCAG---CGACGACGCG--GGTTAACGTGGGGCACT-CTAGTTCTCCTTGATCGGGGCTTCG--TACCTTAGCGGGTGTTAGTCCTAT--CGGTGCTCCCTCGGTTGTCGTTCGCAACGATGCCCTTCCCAGGAGTCGGGTTGTGTGGGAAAGCAGCCCAAAG-TGGGTGGTAAATTCCATCTAAGGCTAAATACTGGCGTGAGACCGATAGCGAAGAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGAACTTTGAAGAGAGAGTTCAAGAGTACGTGAAACCGCTAGCAGGGAAGCGGATGGGAGCCGATGTCTCTGT-CGGCGGGCGGGATTCAGCTGGCC-----------------------------------GCGTCGCGTCGTTCGCGTAACGAG--------CTATGGT-----AGGTCGTCTTTCCTCTCTGACGACCGCCTCTCCCGACGGCGCGCGTGACCAGTGCACTTCCC-G----CTCGTTTGATGCCGTGACCGGTTCG--CGTCGTTGTCAAAAGCCGCCCCGGCGCTCTAGGGGGTCGTCGGTGT------------------------GCGCTAGCGCGCACCTTCGACTTACTCGGGGACCACGGCTGGCGACGAGCGGACCGTGTGATAA----------------------CCTACCCAACGCTGCTTGCAGCGATCGGCC------TCAATTATC----GGCCGACACTGAGGCCGGCTCGACCGGACGCGCCACGACGGGCGGACTCCATTCGTCTACGTGAGACCACCCGTCAGGTGCGTATCGCGCC---AGTGATCGGTCCAGTGGAAGTCGACGGCCGCGCCGACCTTGCGTCGTGTGTGCGGCTGCCCTCGAAGTCTGCGGCGTACTCTGTTACAGAAAGGCTTACCCATCCGGCCCCGTCTTGAAACACGGGACCAAGGAGTGCAACGTGTGCGCGAGTCAAAGGG-ACGACCGAATCCCCAGGGCGAAGTCAA-----------------CGC----------------GACGGGCGAGATCCTCTGGAGCAAGGCGTGTACTCTGCCGCCAGCTCGACCAGAG---AGGCGCATCGCCGGCCCTCCTGTACTGCACT Diplocirrus_glaucus_Sweden ATTACTAAGCGGAGGAAAAGAAACTAACAAGGATTCCCCCAGTAACGG-CGAGTGAACGGGG-ATGAGCCCAGCACCGAATCCCCC--GCGCGGAGACGCGTGGCGGGAGCTGTGGTGTTAGGGAAGGCCT-TT----GCGGGCGATCGGTC-CGTCATCGT--CTCGG---CGGTGGCGGG-----CCTCAAGGGGTGCC-CGAGTCTCTCTTGATCGGGGCCGTCT-TCCCATTGCGGGTGTCAGGCCTCTA-CGGTGCCT-C----TGGTCGTTCGCTTCGAGCCTCTTCCCAGGAGTCGGGTTGTTTGAGAATGCAGCCCAAAG-TGGGTGGTAAACTCCATCTAAGGCTAAATACTGACGCGAGACCGATAGCGGACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGAACTTTGAAGAGAGAGTTCAAGAGTACGTGAAACCGCTTAGAGGGAAACGGATGGGACCGCAAATCGGT---CGACCCGCGGGGTTCAACTCGTTCGGCCAGGTGGCAGGGTGTGTTCG--------------TG--TTTCTG----TTCCGGGGCCCTCGGGTCTCG--GACGC---CGGCACGCCCTT---TTG----CCGCCGCCGA------------CGGGTGCACTTCCC-G----CGGGGAGAGCACCGCGACCGGTTCG--CC-GGCCGTCATAAG----CCTGGAG---GGGAAGGTAGTCAGACT--GGGTGTCGGTCCTTCGGGGCCTTTGCTCGCCTGATGTTATAGCCCTTCCGACGGTATTGGCCGGC--T-GGTGGACCGAGGAGCAAAGCGATTGAAGGCCCAGTGGTTGGT--GGAAAAGAGGTGTCTCCTCCGCCCGTC----CCGACTGGAGTT-TACTGCGCATACAGTCAGTAAGCTCCGATTGCGGGTGGTCGCACG------------GCA-------CTTCTCCTGTCTCCATAAACCGCC---CTGCCTCGTGCAGGGG---CCCAAGGTCCGCGGCGATGATAC----------------------AGTCGGC-------------------------ACCCCATCCGA-CCCGTCTTGAAACAC-GGACCAAGGAGTCTAACATGTGCGCGAGTCATTGGGTGCA-ACGAAACCTACAGGCGGAATGAAA--------G-TGAAGCGTGCCACTTGCGT-GGTGCGTTAGGCGTGATCCG--------------------GCCCCTTCGCGGT-------GGCGGGCGCAACGCCGGCCCTTCTCAGGCGCCGT Flabelliderma_ockeri ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Flabelligena_sp. --------------------------------------TCAGTAGCGG-CGAGCGAACAGGG-AGAAGCCCAGCATCGAATCCCCC--G-CCCTGGCAGGGCGGAGGGACATGTGATGTTTGGGAGGGCCT-TT----GCGA-CGGCTGTCA-GGCCGCCGTCCCTCGGGG-CGGCGGTT------------AGGGGTGCC-TAAGTCTCTCATGATTGGGGCCATC--GCCCATAGCGGGTGTCAGGCCTTTG-TGGCGCCC-C----CGGCCGTGTGCTCTGCGTCC-CTCCTCGGAGTCGGGTTGTTTGTGAATGCAGCCCAAAG-CGGGTGGTAAACTCCACCTAAGGCTAAATACTGGTGCAAGGCCGATAGCGAACAAGTACCGCGAGGGAAAGTTGAAAAGAACTTTGAAGAGAGAGTTCAAGAGTACGTGAAACCGCTTAGAGTCAAGCGGATGGGACCGCAAATCGGT---CGGCCCGTGGGATTCATCCCGCCGGT----------GA-TGT----------------------CCATTCTATAT----AGGG-TTCGGACTA-CAT-------------------------------ATCACTCGG-------------CGGGTGCACTTTCC-G----CGGGCCGAGCGCCGCAACCGGTTCG--CT-GGCAGTCAGAAG----CCTG-CGG--GGGAAGGTGGCCTGCCGTTGCCTCG---------------TGCGGCGGTGGGTG-TTATAGCCCCTGCATGT--GCCGGCCTGCC--ACGCGGACCGAGGAGAGGGCCCGTTGAAGGGTTCGGCCCACGCCGGG--------CTCCGGCTCCGGCCGCTCGTTACAACTGGGGG-GGACTGC---TTCGGCAGTGCCTTTCCGACTGCGGGCGGTCG-AGG--------GACCG-GGGTCACGCACCGGCGGGGTCCG--CCCCTCC---CGT--TCGCGGGGGGGGAAGCCCGGGTTAGCGGCGATGTGTC----------------------AGTCGGC-------------------------ACCCCATCCGA-CCCGTCTTGAAACAC-GGACCAAGGAGTCTAACGTGCGCGCGAGTCATTGGGCTTGCACGAAACCCACAGGCGCAAGGAAACT------GAAAGGGGG--ACTCGTC--CTCCAT----AGGCGAGATCCC--------------------GGCCC---TCCGG-------GTCGGGCGCACCGCCGGCCCTCCTGAGCCTA--- Flabelligera_affinis_California ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Flabelligera_affinis_Iceland ATCACTAAGCGGAGGAAAAGAAACTAACAAGGATTCCCCCAGTAACGG-CGAGTGAACAGGG-AAGAGCCCAGCACCGAATCCCCC--GCGCGGCAACGCGTGGAGGGAGCTGTGGTGTTTGGGGAGGCCT-CTGT-GGCGATCGGCTCGT-----CGTCGT--TTCGG---CGGCGGCGGG-----CCTTAGGGGGCAGTCCGAGTCTCTCTTGATTGGGGCCGTCTATCCCATTGCGGGTGTCAGGCCTCTA-CGGCGCCTAC----CGATCGTCTGCTCTGTGCCT-TTCCCAGGAGTCGGGTTGTTTGAGAATGCAGCCCAAAG-TGGGTGGTAAATTCCATCTAAGGCTAAATACTGATGCGAGACCGATAGCGGACAAGTACCGCGAGGGAAAGTT----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Flabelligera_affinis_Sweden ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Flabelligera_infundibularis ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Flota_sp._specimen_1 -------------------------------------CCTAGTAACGG-CGAGTGAACAGGG-AGAAGCCCAGCACCGAATCCCCCGGGCCCTGC-ACGCCTGGCGGGAACTGTGGTGTATGGGAGGGCCA-TT-GCGGTGATCGGTGCGCT-GCGAGCCGG--TTCGC---TGGCAAGCGG-TGTACCTCAGGGGGCGCC-CGAGTCTCTCTTGATTGGGGCCGTTCATTCCATAGCGGGTGTCAGGCCTCTA-CGGCGCTC-C----TGGTCGCTTGCTCTGCGCCC-GTCCCAGGAGTCGGGTTGTATGAGAAAGCAGCCCAAAG-TGGCGGGTAAATTCCCGCTAAGGCTAAATATTGAGGCGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGAACTTTGAAGAGAGAGTTCAAGAGTACGTGAAACCGCTTACAGGGAAGCGGATGGGACTCGAAGTTGATCTCCTGTCGCTGGGATTCAGCCTGGT----CAGGGTCAGGGGCGTGTAACCGGCATCGTGCTTGGCGGGCTGCTCGCCTTTACGGGCGTGCAGCCATCGTCGACACGTTCACGCCAACCGCGCGCCCCGCTCAGCCTCGGCCA------------GGTGCACTTTCCGG----CGGCGGGGACGCCGCGACCGGTTCG--CAGGGCTGGCAGAAGCACCTC--------GAGATGGTGGCTGCCTTGTTGGCGCGTGCGGTTCGCCGCAAGCGCTGCCTGGTGGCTTTAGCTCGAGTGGATCGGCCCACCAGCC---CGTGGACTGTGGAGCACTTGCGATCCA---TCAGCGCTCCTCTGACGTGGAGTGGCCCGGGCTGTGCATT-----CGAATTGGGTCCGCTGCGTCGCCGCAGAGCTCCCTCACTGATGCGCGGTCACCGTGGG-------------------------CTGCCCGTCGATTAGCGCCCC---CTCGCTT-----GAGGGGTTCCCGGGTCCGCGGCGCTGACGT----------------------AGTGGGC-------------------------ACCCTATCCGA-CCCGTCTTGAAACAC-GGACCAAGGAGTCCAACATGTGCGCGAGTCATCGGGCATA-ACGAAACCTAAAGGCGCAATTAACGTTTGTTGAGCGTTGCTGGCCTCGGTCGGCTTCGTTCTTGGCGAGATCCT--------------------GCCCCGTCGCACG-------GGTGGGCGCATCGCCGGCCCTTCTCTGTCGACGC Flota_sp._specimen_2 ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Ilyphagus_octobranchus ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Macrochaeta_clavicornis ATTAATAAGCGGAGGAAAAGAAACTAACCAGGATTCCCTCAGTAGCGG-CGAGCGAACAGGG-AAGAGCCCAGCACCGAATCCCCC--GTCCCTAGACGGGCGCGGGGACATGTGGTGTTTGGGAGGGCCT-CT----GCGG-CGGCTGTC--GCCCGCCGGCTCTCGTGGCCGGCGGGG------------TGGGGTGCCTTAAGTCTCTCTTGATTGGGGCCATC--GCCCATAGCGGGTGTCAGGCCTTTG-AGGCGCCC-C----TGGCCGTCTGCTCTGCGTCC-CTCCTCGGAGTCGGGTTGTTTGGGAATGCAGCCCAAAG-CGGGTGGTAAACTCCACCTAAGGCTAAATACTGGTGCGAGACCGATAGCAAACAAGTACCGCGAGGGAAAGTT----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Macrochaeta_sp. ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Pherusa_plumosa_California ATCATTAAGCGGCGGAGAAGAGAATAACAATGATTCCCTCAGTAACGG-CGAGTGAACCGGG-AAGAGCCCAGCACCGAATCCCCC--GTGCGGAAACGTGCGACGGGAAATGTGGTGTAATGGTCTGCATACTGGCAGCGATCGGGCGGGCGGCTCGTCGT--TTCGG---CGGCTTGCCGCTGCTCTTTGGAGGGTGCC-GAAGTC-CCCTTGACTGGGGCTGAT--TCCCACAGCGGGTGTCAGGCCTATG-CGGCCCCC--T---TGGTCGCTTGCCGTGTGTAACGGCCTAGGAGTCAGGTTGTTTGTGATTGCAACCCAAAG-TGGGAGGTATATGCCTCCTAAGGCTAAATAC-AAGGCGAGACCGATAGCAAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGAACTTTGAAGAGAGAGTTCAATAGTACGTGAAACCGTTTAGAGGGAAACGGATG----TGCAGGTAGTCCTCGAAGGCGTAGAATTCATCCTGGT---CTGGAGGGGTGGGTGTCGGTGCG---------ACGTCGGCCTCTTGCCCTTCGCGGGGTTTCGGGGTCGGT-------CTCTCGCGCCGGCGGCCAGGTTTCTTCCCACCGACAGCCA--------GGTGCATTTTCTCGTTCTCACTTCGAGCGTTGCGAGCGGTTCGTACTTGGGTGCGAAAAG----CCAGGCGATTGGGAAG--CGTTAGCGTGTCGG-------------------------------------GACTCGTCC-----CGTTCGCGCTC--TTCGTGGAC------------------------------GCCGCCTGCGAGTCGTGGCATCCGGCGGACCGCT----CGATTTCGG--------------TCGGCGCAAGCCTTCCGGCAGCGTAAGT--------------------------------------------------------------------------------GGCTTGCGTCTG--------------------------------------------------------------CACATCCGC-CCCGTCTTGAAACAC-GGGCCAAGGAGTCTGGCATGCATGCGAGTCAAAGGGCACTTGC-AACCCCCAAGGCGAATGGAAA---------CAGTGGTTTGATTT------------ACCGGGCGTGATCCA------------GAGGCCTCTCCCCCTACTGGGAGCGGTGCGATGGCGCAGCGCCGGCCTTTCTCGGTGGCCCT Pherusa_plumosa_Massachusetts ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Poeobius_meseres ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CGT--TTCGG---CGGTGGCTGG----ATCACAGGGGGCACC-CGAGTCTCACTGGAATGTGGCCGTCT-TCCCATAGCGGGTGTCAGGCCTCTA-CGGTGCCT-C----TGGTCGTCGGCTC-GAGCCT-CTCCTAAGAGTCGGGTTGCTTGGGAATGCAGCCTAAAGACGGGTGGTAAACTCCATCCAAGGCTAAATACTGACGCGAGACCGATAGCGGACAAGTACCGCAAGGGAAAGTTGAAAAGAACTTTGAAGAGAGAGTTCAAGAGTACGTGAAACCGTTTAGAGGGAAACGGATGGGACCGCAAGTTGGT---CGAACCGTGGGATTCAACCCGTTTGGTTTGGTCATGGATCGTGG-----------------TGGTGGACGGCT-ATCGGAAGGCCAGCAATGGCCGT-----ACGACGTCCGCTGCTTACAGAGAAACCTGACGCCAA------------CGGGTGCACTTTCC-A----CGGAGAGACAGCCGCGACCGGTTCA--CC-GGCCGTCAGAAG----CCGTGCG---GGGAAGGTAGTTGGCTTGAGGGCTTGTCCCGCTTGCC--------------AATGTTATAGCCCCGCCGATGGCGTTGGCCGGC--T-GGTGGACCGAGGAGAAAACAC------CGCCTCTAGCATGCCGGGGAAGACGGCGTTGCGCCGCCGCCCA-----TCGACTGGGTTTGGACTGACTCTTCTGCCAGTCCGATCCGACTGTGGGTGGTGGTACG--------------CGCGTCGCCACCCGGTGGCCTCG-----TTCC---CGAGACTGTTCGGAGAGAGG--AAGGTCAGCGGCGAAGACAC----------------------TGTCGGC-------------------------ACCCCATCCGA-CCCGTCTTGAAACAC-GGACCAAGGAGTCTAACGTGTGCGCAAGTCACTGGGCGCA-ATGAACCCCAAAGGCGCAATGAAA--------G-CAAATCTCAGCTCGTC------TGAGAGAGGCGGGATCCT--------------------GACTCCTACGCGG-------GTCGGGCGCACCGCCGGCCCCTCTCGT------- Therochaeta_collarifera ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = 28S_Osborn_Flotidae) = N: 1-1289; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = 28S_Osborn_Flotidae) = N: 1-1289; END; [ The following blocks are output data for analysis step 4359 ] BEGIN TREES; TITLE Tb9131; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep4359; TREE Fig._2_28S = [&R] (Flabelligena_sp.,Macrochaeta_clavicornis,((Brada_villosa_Sweden,Flota_sp._specimen_1),Pherusa_plumosa_California,(Poeobius_meseres,Diplocirrus_glaucus_Sweden,Flabelligera_affinis_Iceland))); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr369] END;