#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on July 13, 2025; 5:03 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Untereiner W., & Naveaeu F. 1999. Molecular systematics of the Herpotrichiellaceae with an assessment of the phylogenetic positions of Exophiala dermatitidis and Phialophora americana. Mycologia, 91(1): 67-83. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S400] [ The following blocks are input data for analysis step 472 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep472; DIMENSIONS NTAX=40; TAXLABELS Aureobasidium_pullulans_ATCC_62 Capronia_acutiseta_ATCC_56428 Capronia_coronata_ATCC_56201 Capronia_dactylotricha_DAOM_208 Capronia_epimyces_DAOM_216386 Capronia_fungicola_ATCC_42523 Capronia_mansonii_CBS_101.67 Capronia_munkii_DAOM_216390 Capronia_nigerimma_MUCL_39954 Capronia_parasitica_CBS_123.88 Capronia_pilosella_DAOM_216387 Capronia_pulcherrima_DAOM_21638 Capronia_semiimmersa_MUCL_39979 Capronia_sp._CBS_164.92 Capronia_villosa_ATCC_56206 Cladophialophora_ajelloi Cladophialophora_carrionii_CBS Cladophialophora_hachijoensis_B Cladosporium_herbarum Cladosporium_sp._CBS_125.88 Cladosporium_sp._MUCL_39951 Cladosporium_sphaerospermum Exophiala_dermatitidis_CBS_207. Exophiala_jeanselmei_CBS_664.76 Exophiala_pisciphila_CBS_464.81 Exophiala_pisciphila_CBS_537.73 Exophiala_salmonis_UAMH_34 Exophiala_sp._DAOM_216391 Fonsecaea_compacta_MUCL_9774 Fonsecaea_pedrosoi_CBS_271.37 Phaeococcomyces_catenatus_CBS_6 Phialophora_americana_MUCL40612 Phialophora_verrucosa_MUCL_1553 Ramichloridium_anceps_CBS_181.6 Ramichloridium_anceps_MUCL_7992 Ramichloridium_cerophilum_CBS_1 Ramichloridium_epichloes_CBS_36 Ramichloridium_mackenzei_CBS_65 Rhinocladiella_atrovirens_MUCL Venturia_hanliniana_ATCC_96019 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M2043] TITLE '28S -40'; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep472; DIMENSIONS NCHAR=937; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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TTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAAGCATATCAATAAGCGGAGGAAAAGAAACCAACAGGGATTGCCTCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAAGAGCTCAAATTTGAAATCTGGCCCCTTT--GGGGTCCGAGTTGTAATTTGTAGAGGATGTTTC-GGGT-ACCGCCTCGGTTTAAATTTCTTGGAACAGAATGTCAGAGAGGGTGAGAATCCCGTCTTGGACCGG-TGGTAGGG-CCCGTGTGAAACTCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAAATGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATATTGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGAAAAGAGAGTTAAACAGTATGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAACCAGACTTGTGCGCGGTGGTTCCCCTATCCTTTTGGATGGGTTACTCCGCCGCGTCCAGGCCAACATCGGTTCTGGGGGTCGGTCAAAGGCCTTGGGAATGTATCTACCCTTC-G-GGCGTAGACTTATAGCCCTTGGTGTCATGCGACCTCCCGGGACCGAGGAACGCGCTTCGGCTCGGATGTTGGCGTAATGGTTGTCAGCGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTATGCGAGTGTTTGGGTGTCAAACCCGGAACGCGGAATGAAAGTGAACGGAGGTAGGAAGCTTC--GGCTGCACTATCGACCGATCCTGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTAAGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGTAT-AGGGGCGAAAGACTAATCGAACCA Ramichloridium_cerophilum_CBS_1 TTGACCTCGGATCAGGTAGGGATACCCGCTGAACTTAAGCATATCAATAAGCGGAGGAAAAGAAACCAACAGGGATTGCCCTAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCAAATTTGAAACCTGGCGCTT-----GCGTCCGGATTGTAATTTGTAGAGGATGCTTCTGGGC-AGCG-GCCGGTCTAAGTTCCTTGGAACAGGACGTCACAGAGGGTGAGAATCCCGTATGTGATCGG-CGCGCAC--CCTCCACGTAGCTCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGAGGTAAATTTCTTCTAAAGCTAAATATTGGCCCGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTTAAAAAGCACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTCCCACCAGACTC-CGCGGCGGTGTTCCGCCGGTCTTCTGACCGGTCTACTCGCCGCCGT-GGGGCCAGCATCGTCTGGGGCCGCCGGATAAGACC-GCAGGAATGTAGCTCATT----GAG------TGTTATAGCCTGCGG-GG-ATGCGGCGCGCCCCGGGCGAGGTCCGCGCTTCGGCAAGGATGCTGGCGTAATGGTGGGCAGCGGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTATGCGAGTGTTCGGGTGTCAAACCCCTA-CGCGTAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGA-GCTTC--GGC-GCACCATCGACCGATCCTGATGTCCTCGGATGGATTTGAGTAAGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGCAT-AGGGGCGAAAGACTAATCGAACCA Ramichloridium_epichloes_CBS_36 TTGACCTCGGATCAGATAGGGATACCCGCTGAACTTAAGCATATCAATAAGCGGAGGAAAAGAAACCAACAGGGATTGCCTCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCAAATTTGAAATCTGGCGTCCTC--GACGTCCGAGTTGTAATTTGCAGAGGATACTTC-GGCA-TCGGTGCCGCTCCAGGTTCTTTGGAACAGGACGCCACAGAGGGTGAGAGCCCCGTCTCTGGGCGG-TGCCAGATG-CCATGTGAAGTGCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGAGGTAAATTTCTTCCAAAGCTAAATACAGGTTGGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGTACTTTGGAAAGAGAGTCAAACAGCGCGTGAAATTGTTAAAAGGGAAGCGCTTGCAGTCAGACTTGGCCGCCCGGTTCGGCCGTCCCTCGTGGACGGTCTCCGCCGTGGCGGGCAGGCCAGCATTACCTTGGGCGGGTGGATAAAGGCTGCGGGAATGTGGCACCTCTC--G-GGG--TGTGTTATAGCCCGCGGCACAATACATCCTGCCCGGGGTAAGGAACGCGCTTCGGCTCGGATGCTGGCGTAATGGCTGCAAGCGGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTGTGCGAGTGTTTGGGTGTCAAGCCCTTA-CGCGCAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGA-GCCCTC-GGGCGCACCATCGACCGATCCTGATGTCTTCGGAAGGATTTGAGTAAGAGCACAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTAAGCAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGTAT-AGGGGCGAAAGACTAATCGAACCA Ramichloridium_mackenzei_CBS_65 TTGACCTCGGATCAGGTAGGGATACCCGCTGAACTTAAGCATATCAATAAGCGGAGGAAAAGAAACCAACAGGGATTGCCTCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCAAATTTGAAATCTGAC-TCCTT-GAGAGTCCGAGTTGTAATTTGTAGAGGATGTTTC-GGGTTCCCGCTCCGGTTTAAATTTCTTGGAACAGAATGTCAAAGAGGGTGAGAATCCCGTCTTGGACTGG-CGGTCGGGGCCCATGTGAAACTCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAAATGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATATTGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGAAAAGAGAGTCAAAAAGTATGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTGGCAACCAGACTTGCGCGCGATGGTTCCCCCTTCCTTCTGGTTGGGTTACTCCGTCGTGTCCAGGCCAACATCGGTTCTGGGGGTCGGTTAAAGGCCGTGGGAATGTATTTACCCTTTCGAGGCGTAGACTTATAGCCCACGGTGTCATGCGGCCTCCCGGGACCGAGGAACGCGCTTCGGCTCGGATGTTGGCGTAATGGTTGTCAGCGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTATGCGAGTGTTTGGGTGTCAAACCCGGAACGCGAAATGAAAGTGAACGGAGGTAGGACGCTTC--GGCTGCACTATCGACCGATCCTGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTAAGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGTAT-AGGGGCGAAAGACTAATCGAACCA Rhinocladiella_atrovirens_MUCL TTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAAGCATATCAATAAGCGGAGGAAAAGAAACCAACAGGGATTGCCTCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCAAATTTGAAATCTGGCCTCTCTC-GGGGTCCGAGTTGTAATTTGTAGAGGATGTTTC-GGGT-ACCGCCTCGGTTTAAATTTCTTGGAACAGAATGTCAGAGAGGGTGAGAATCCCGTCTTGGACCGG-CGGTAGGG-CCCATGTGAAACTCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAAATGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATATTGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGAACTTTGAAAAGAGAGTTAAACAGTATGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTACAACCAGACTTGAGCGCGGCGGTTCCCCCTTCCTTTTGGTTGGGTTACTCCGCCGTGTCCAGGCCAACATCGGTTCTGGGGGTCGGTTAAAGGCCTGGGGAATGTATCTACTCCTTCG-GGGGTAGACTTATAGCCCCGGGTGTCATGCGACCACCCGGGACCGAGGAACGCGCTTCGGCTCGGATGTTGGCGTAATGGTTGTCAGCGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTATGCGAGTGTTTGGGTGTCAAACCCGGAACGCGAAATGAAAGTGAACGGAGGTAGGAAGCCTTTAGGCTGCACTATCGACCGATCCTGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTAAGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGTAT-AGGGGCGAAAGACTAATCGAACCA Venturia_hanliniana_ATCC_96019 TTGGCCTCGGATCAGGTGGGGATACCCGCTGAACTTAAGCATATCAATAAGCGGAGGAAAAGAAACCAACAGGGATTGCCTCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCAAATTTGAAATCTGGCTC------AC-GCCCGAGTTGTAATTTGTAGAGGATGTTTC-GGGT-GAAGCCGCGGTCCAAGTCCCTTGGAACAGGACGTCATAGAGGGTGAGAACCCCGTACCTGGCCGC-CGGTGCCC-CCGCTGTGAAACTCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATTGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATACCGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGAAAAGAGAGTTAAA-AGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCGGCCAGACTTGCCTGCGGTTGCTCATCCCGCCTTTTGGCGGGTGCACTCTTCCGCAGTCAGGCCAGCATCGGTTTGGGCGGTCGGATAAAGGCGCTGGGAACGTGGCCTCCCCTC-G-GGG-AGGTGTTATAGCCCGGCGCGCAATGCGACCAGCCCGGACCGAGGTTCGCGCTTTG-CTAGGATGCTGGCGTAATGGCCGTAAGCGGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTATGCGAGTGTTTGGGTGTCAAACCCGTG-CGCGTAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAACCGCA-AGG-TGCACCATCGACCGATCCTGATGTCTTCGGAAGGATTTGAGTAAGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCGTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGCGTAT-AGGGGCGAAAGACTAATCGAACCA ; END; [ The following blocks are output data for analysis step 472 ] BEGIN TREES; TITLE Tb5252; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep472; TREE Fig._8 = [&R] (((((((((((Cladophialophora_carrionii_CBS,Cladophialophora_ajelloi),(Capronia_semiimmersa_MUCL_39979,Phialophora_verrucosa_MUCL_1553,Phialophora_americana_MUCL40612)),(Cladosporium_sp._CBS_125.88,Cladosporium_sp._MUCL_39951)),(Ramichloridium_anceps_CBS_181.6,Ramichloridium_anceps_MUCL_7992)Ramichloridium_anceps,(((Rhinocladiella_atrovirens_MUCL,Exophiala_jeanselmei_CBS_664.76),Phaeococcomyces_catenatus_CBS_6),(Capronia_acutiseta_ATCC_56428,Capronia_dactylotricha_DAOM_208)),Exophiala_pisciphila_CBS_464.81,Capronia_coronata_ATCC_56201,Fonsecaea_compacta_MUCL_9774),(((Capronia_parasitica_CBS_123.88,Capronia_nigerimma_MUCL_39954),Capronia_fungicola_ATCC_42523),(((Exophiala_sp._DAOM_216391,(Capronia_munkii_DAOM_216390,Capronia_mansonii_CBS_101.67)),Exophiala_dermatitidis_CBS_207.),Capronia_epimyces_DAOM_216386))),(Capronia_sp._CBS_164.92,Ramichloridium_mackenzei_CBS_65)),((Fonsecaea_pedrosoi_CBS_271.37,Exophiala_salmonis_UAMH_34),Exophiala_pisciphila_CBS_537.73)),(Capronia_pilosella_DAOM_216387,Capronia_pulcherrima_DAOM_21638)),Cladophialophora_hachijoensis_B),Capronia_villosa_ATCC_56206),(Venturia_hanliniana_ATCC_96019,((Ramichloridium_cerophilum_CBS_1,(Cladosporium_sphaerospermum,Cladosporium_herbarum)),Aureobasidium_pullulans_ATCC_62)),Ramichloridium_epichloes_CBS_36)Herpotrichiellaceae; [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr3262] END;