#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 07, 2026; 9:32 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Thines M., Telle S., Ploch S., & Runge F. 2009. Identity of the downy mildew pathogens of basil, coleus, and sage with implications for quarantine measures. Mycological Research, 113(5): 532-540. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S9950] [ The following blocks are input data for analysis step 4914 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep4914; DIMENSIONS NTAX=34; TAXLABELS Peronospora_aestivalis_DQ365714 Peronospora_alpicola_DQ365715 Peronospora_alta_DQ365716 Peronospora_aparines_DQ365717 Peronospora_aquatica_DQ365718 Peronospora_arvensis_DQ365719 'Peronospora boni-henrici DQ365720' Peronospora_calotheca_DQ365721 Peronospora_conglomerata_DQ365723 Peronospora_hiemalis_DQ365724 Peronospora_lamii_DQ365725 Peronospora_manshurica_AY286222 'Peronospora potentillae-sterilis DQ365726' Peronospora_pulveracea_DQ365727 Peronospora_rumicis_DQ365728 Peronospora_sanguisorbae_DQ365729 Peronospora_sordida_DQ365730 'Peronospora sp HOH-HUH770 Basil' 'Peronospora sp HOH-HUH945 Coleus' 'Peronospora sp HOH-HUH946 Coleus' 'Peronospora sp HOH-HUH947 Coleus' 'Peronospora sp HOH-HUH948 Coleus' 'Peronospora sp HOH-HUH961 Salvia' 'Peronospora swinglei Type cox2-R D09' Peronospora_tabacina_AY286226 Peronospora_tabacina_AY286227 Peronospora_tabacina_AY286228 'Peronospora trifolii-alpestris DQ365731' 'Peronospora trifolii-repentis DQ365732' Peronospora_trifoliorum_DQ365722 Peronospora_trivialis_DQ365733 Peronospora_variabilis_DQ365734 Peronospora_verna_DQ365735 Phytophthora_megasperma_DQ365747 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M4679] TITLE COX2; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep4914; DIMENSIONS NCHAR=633; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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